3ZWS | Genus

Total Genus 133

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	133
sequence length	356
structure length	354
Chain Sequence	HLMPTLQGLLDPESAHRLAVRFTSLGLLARFQDSDMLEVRVLGHKFRNPVGIAAGFDKHGEAVDGLYKMGFGFVEIGSVTPKPQEGNPRPRVFRLPEDQAVINRYGFNSHGLSVVEHRLRARQQKQAKLTEDGLPLGVNLGKNKTSVDAAEDYAEGVRVLGPLADYLVVNVSSPNTAGLRSLQGKAELRRLLTKVLQERDGLRRVHRPAVLVKIAPDLTSQDKEDIASVVKELGIDGLIVTNTTVSRPAGLQGALRSETGGLSGKPLRDLSTQTIREMYALTQGRVPIIGVGGVSSGQDALEKIRAGASLVQLYTALTFWGPPVVGKVKRELEALLKEQGFGGVTDAIGADHRR

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

loadScript /static/js/j2s/core/package.js

loadScript /static/js/j2s/core/corejmol.z.js

loadScript /static/js/j2s/core/corescript.z.js

JSmol exec jmolApplet0 start applet null

Jmol JavaScript applet jmolApplet0__381478557923125__ initializing

Jmol getValue debug null

Jmol getValue logLevel null

Jmol getValue allowjavascript null

AppletRegistry.checkIn(jmolApplet0__381478557923125__)

vwrOptions:

{ "name":"jmolApplet0","applet":true,"documentBase":"https://genus.fuw.edu.pl/view/3ZWS/A/","platform":"J.awtjs2d.Platform","fullName":"jmolApplet0__381478557923125__","codePath":"https:/static/js/j2s/","display":"jmolApplet0_canvas2d","signedApplet":"true","appletReadyCallback":"Jmol._readyCallback","statusListener":"[J.appletjs.Jmol object]","syncId":"381478557923125","bgcolor":"white" }

setting document base to "https://genus.fuw.edu.pl/view/3ZWS/A/"

Jmol Version: 14.29.13 2018-04-17 17:17

java.vendor: Java2Script (HTML5)

java.version: 2018-01-28 23:38:52 (JSmol/j2s)

os.name: Mozilla/5.0 AppleWebKit/537.36 (KHTML, like Gecko; compatible; ClaudeBot/1.0; +claudebot@anthropic.com)

Access: ALL

memory: 0.0/0.0

processors available: 1

useCommandThread: false

appletId:jmolApplet0 (signed)

Jmol getValue emulate null

defaults = "Jmol"

Jmol getValue boxbgcolor null

Jmol getValue bgcolor white

backgroundColor = "white"

Jmol getValue ANIMFRAMECallback null

Jmol getValue APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback

APPLETREADYCallback = "Jmol._readyCallback"

callback set for APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback APPLETREADY

Jmol getValue ATOMMOVEDCallback null

Jmol getValue AUDIOCallback null

Jmol getValue CLICKCallback null

Jmol getValue DRAGDROPCallback null

Jmol getValue ECHOCallback null

Jmol getValue ERRORCallback null

Jmol getValue EVALCallback null

Jmol getValue HOVERCallback null

Jmol getValue IMAGECallback null

Jmol getValue LOADSTRUCTCallback null

Jmol getValue MEASURECallback null

Jmol getValue MESSAGECallback null

Jmol getValue MINIMIZATIONCallback null

Jmol getValue SERVICECallback null

Jmol getValue PICKCallback null

Jmol getValue RESIZECallback null

Jmol getValue SCRIPTCallback null

Jmol getValue SYNCCallback null

Jmol getValue STRUCTUREMODIFIEDCallback null

Jmol getValue doTranslate null

language=en_US

Jmol getValue popupMenu null

Jmol getValue script null

Jmol getValue loadInline null

Jmol getValue load null

Jmol applet jmolApplet0__381478557923125__ ready

script 1 started

platformSpeed = 8

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Homo sapiens
publication title	Factors Influencing the Specificity of Inhibitor Binding to the Human and Malaria Parasite Dihydroorotate Dehydrogenases. pubmed doi rcsb
molecule keywords	DIHYDROOROTATE DEHYDROGENASE (QUINONE), MITOCHONDRIAL
total genus	133
structure length	354
sequence length	356
ec nomenclature	ec 1.3.5.2: Dihydroorotate dehydrogenase (quinone).
pdb deposition date	2011-08-02

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01180	DHO_dh	Dihydroorotate dehydrogenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3zwsA00

3EX1A 5I3KA 3DFSA 3U2OA 1TRIA 4O12A 4O8RA 4HNNA 2YZRA 4UTIA 3PSWA 4UIOA 3S5NA 5F1UA 2F7FA 4IUOA 3K30A 1KTCA 3W1NA 3OVRA 1XBVA 3LCLA 3DFQA 1P0NA 3FJLA 3W7QA 2H8ZA 2WSQA 3NQEA 4ML9A 3KFTA 4UTUA 3D0CA 3RLVA 4WXYA 1EA0A 4WX2A 3UQNA 3NPXA 1KBIA 4OWGA 1V7YA 1THFD 1GVQA 4UTTA 4O57A 1J2WA 4LS1A 1H7NA 4DPQA 4M7TA 4JY9A 4O14A 2DZXA 2WSRA 3GAYA 5C5YA 1GWJA 1TPUA 3QYQA 3SFKA 2DU2A 1EEPA 3DFPA 3O8AA 3GDKA 4LWWA 3LCFA 5DLCA 3E96A 3KVMA 3U6WA 1LLWA 2WJZA 4AMAA 1DORA 3LXAA 1O94A 5LNWA 4K7YA 4NX0A 3R2GA 3TAOA 1I2OA 1T99A 1JUBA 4RKAA 2Y85A 3DH7A 2R8WA 4PFMA 1KM1A 1GVFA 4O50A 3TROA 2A21A 4Y96A 4CNPA 1KFLA 3W1XA 1ZNNA 1K8ZA 4I7WA 1H7XA 1EUNA 3BO9A 2ZFAA 3BG3A 2WNQA 1L6WA 1ZAHA 2CLIA 1HFBA 1XUZA 3P84A 2CLKA 4JXCA 1H61A 4JX6A 3P80A 2V82A 3FS2A 2VEMA 3HMJG 1ADOA 4MZ8A 4I7VA 3V75A 3DKLA 5HWJA 1W5OA 1LBLA 2GQAA 4Z1DA 3KOFA 2VFFA 1H51A 3PAJA 2PRLA 3EXSA 5HULA 4O18A 1UJPA 2EHHA 2P10A 3TXZA 4BF9A 4N6EA 1HO4A 5K7JA 2YW4A 1WBJA 3C2OA 1SW7A 2I14A 1H5YA 4NX5A 1V5XA 2CLOA 3B06A 1CW2A 1OX6A 5D2TA 4EOUA 5CPOA 4KFNA 4O1AA 1HUVA 2QR6A 1OF6A 1F6KA 4YWIA 5CSSA 3S5OA 5KZDA 3TSMA 4OV4A 4FNUA 3EX6A 4Q32A 1GG1A 1B4KA 3S1UA 1VGAA 3PF3A 3THAA 1SO3A 1WX0A 2YW3A 3G8EA 2A85A 7TIMA 2CLMA 3W73A 3O6YX 3TKFA 4DELA 1OYAA 3CC1A 3STGA 3MBFA 4MIMA 5CZTA 3M43A 2E6AA 5DXYA 5I3HA 1A50A 4K7VA 1LRTA 3RK8A 3OIXA 2UV8G 5LKYA 2CZ5A 3NQVA 3TC7A 4O1CA 3ATZA 1QPRA 4XTDA 1I2RA 4TU1A 1ICPA 1EWDA 3RF9A 2D73A 4WOZA 1F73A 4LVDA 2RDWA 3HG4A 4HN4A 1MEHA 5AHIA 3STFA 3PBVA 2R94A 5D33A 3LBMA 4GUHA 4M7SA 5LNSA 4JYDA 4UTJA 5FEPA 5KITA 4AHOA 4A22A 1F6PA 4POCA 2G5WA 2VC6A 5EA9A 3LERA 1Q6QA 2Y62A 5F1VA 4JS3A 2V30A 1J5TA 3P62A 2A4AA 4K37A 2Z6IA 4ADUA 4U4MA 2J24A 3W7IA 4WY0B 4UXDA 1LRNA 1JUEA 1FWWA 3DENA 4OE7A 4LTSA 3QMSA 3DHFA 1WBHA 1ME8A 4O17A 3TH6A 4MY8A 3PUDA 1FCUA 3NGJA 4C1KA 4QNEA 1EP3A 1QFEA 3Q58A 1YDNA 4M6VA 1CI1A 5AYYA 1W5QA 1EP2A 1W5NA 3W7EA 3SGUA 3UWUA 1PHWA 4ZQRA 4XBKA 3MHUA 1JCLA 5TIMA 4BWLC 2ALDA 1H62A 1M7PA 4O1BA 1GYNA 1KTBA 3PG9A 1H1ZA 3NOEA 4N4QA 1SSDA 1Z41A 4GWEA 4JTHA 3QEZA 1AK5A 1TYGA 3N2MA 3LDVA 3W72A 4KWVA 2PRHA 1W37A 1WOBA 3O16A 3HGJA 2HS6A 5BMXA 3RU6A 3CTLA 4LNYA 1WV2A 2V81A 4XUGA 1VYSX 1WDWA 3WK3A 1CX9A 3RMJA 3WK0A 1TTQA 3TC6A 4HSOA 2TPSA 3MI6A 3EWBX 5FF7A 1J4EA 2NUWA 4GXMA 1OX4B 2YGYA 3NQCA 1TPDA 3LB0A 3QSRA 1FCQA 1YTEA 3W9ZA 5FESA 3H54A 4FNPA 4UTMA 2ZRVA 4FNQA 2GVJA 4ZMGA 3N34A 1QMLA 1SO6A 2FDSA 2ZRZA 3C3NA 1TRDA 4HHPA 5EL1A 4IPIA 2QEZA 3GR8A 2PC4A 2E6FA 2EPHA 1LCOA 2CLEA 2XFWA 4DO4A 3L0GA 1YXYA 1RV8A 3C2FA 1EUAA 3IGXA 2C1HA 4K8HA 5HNRA 3A23A 4WJEA 2WSYA 4HT3A 4Y90A 1XL9A 2B4GA 5EYWA 4AWSA 2BSLA 2X2GA 1VJIA 2Z2UA 4YLWA 2Q8LA 2ZZ5A 3I7RA 4O4VA 2JKEA 4HNUA 4YCPA 3IIXA 4PA8A 1R46A 4UNLA 4WY0F 3OVQA 2A6LA 4QSHA 3B8DA 3LV5A 5LNVA 4JDBA 2W79A 2DP3A 3W2LA 2VEIA 3FIGA 1WYIA 4X9SA 5D32A 1WQ5A 1KM6A 4QIUA 4CQ9A 1ICQA 4JNMA 1R2SA 2PE4A 2YFOA 5BRBA 2PRMA 4S2BA 5D05A 2CZDA 5KZMA 4MLRA 3LBCA 4IX2A 2QKFA 1SQ7A 1XCFA 1TTPA 4O4WA 3O15A 1VR6A 2ZTJA 3H55A 2KZHA 3LLFA 3HGSA 4JTLA 3NNTA 2X1TA 2BXVA 5HUOA 3W07A 4XQ6A 3EX4A 3BVJA 3M7WA 1PCKA 1A5SA 1LOSA 3M5ZA 2J9XA 5LZLA 3A24A 5HMSA 2HSAA 4RXGA 5MHBA 3NQDA 4LY8A 3PB0A 2CU0A 1O5XA 3GDMA 3WFAA 4XKYB 2OZ0A 1AW2A 2GJNA 2ISVA 4ICNA 1KBJA 3DI1A 5G2HA 3LCIA 3G8RA 1NF7A 3NG3A 4MLJA 2ZRWA 3FYOA 1GEQA 4AWTA 1HL2A 4ZQCA 3VCRA 1FDYA 1ZJIA 1Q6OA 2VFEA 4K36A 4R34A 4JTJA 3KAOA 3NR0A 4QQ3A 1TIMA 3TMLA 2CWNA 4LC8A 3W1RA 1O95A 3L5AA 5CPNA 3WK2A 1L6SA 2YR1A 3FYPA 4UTWC 3M44A 3T40A 5KSWA 1QPOA 2YDAA 3DU0A 1F05A 1ML1A 3B4UA 1B9BA 4IXHA 1QPQA 2C13A 2ATMA 2B7PA 3MP3A 3DXIA 2PURA 4ONVA 4K8EA 1XBYA 1W31A 3OEXA 3W7JA 2QCDB 2YPIA 4NJHA 1KLZA 4OQVA 4DF0A 4K6AA 1TCDA 4UC5A 1GZGA 4Z08A 1B3OA 1FDJA 4JTUA 3QPYA 5TBOA 2ABBA 4JGDA 1LYXA 4M5PA 1OK6A 3GZ3A 4LS0A 3G1FA 3C4UA 3IRDA 3GXNA 2QJGA 3TFCA 4LV4A 3SGZA 4M19A 4D2JA 3TNOA 2ZRXA 3N73A 2NX1A 5CG7A 1PHQA 1SW0A 4FF7A 4N6FA 2QJIA 4OGZA 5F4XA 1OVDA 3TSBA 3R5EA 1EPXA 3NPWA 4U28A 1KM0A 4LVFA 1X8FA 3G1AA 3DKJA 3M47A 3W75A 4H6KA 4PH6A 5AC6A 1DKWA 5CZ0A 1W1ZA 4CCDA 3PUEA 3LHZA 3IGUA 2ZYFA 1SZEA 3NQMA 2GVGA 3PBWA 2C16A 1GVSA 4TMCA 1ZHAA 3C2EA 3KRZA 1NAL1 3S0CA 4JN6A 2C18A 4FIRA 4GNJA 5K3VA 3R12A 3ZS4A 3ABOA 1OABA 5G2WA 2VXNA 2Q3RA 3CWNA 2C14A 4LRSA 3L0KA 1I2NA 3M5XA 4E2DA 4HPXA 1LTDA 3DFTA 4N9BA 4IPJA 2JKAA 2YCEA 1W0MA 2YSWA 3GDRA 1M6JA 4ZL1A 4IMGA 1RR2A 3LRLA 3O6DA 4EF9A 5KZEA 1F74A 4O0ZA 5J5DA 5I3GA 4AF0B 3W2MA 1GG0A 4O13A 1FXPA 3NPVA 3O6CA 2XN1A 3HJZA 3O06A 3LRKA 1RQEA 2WKJA 4KKXA 2TMDA 4KFOA 1I2PA 4UFMA 4H3DA 4RK8A 1Y0EA 4DBDA 4XTIA 4L4LA 1TREA 3H53A 3MI2A 1Q3NA 1YPFA 1YTKA 3W7LA 1IXPA 5E93A 1QR7A 3HOJA 3WJWA 2OT0A 3C8FA 3TX9A 1W8SA 4FNSA 4HIBA 4O28A 4RCXA 4FNTA 4R33A 3L21A 1TQXA 4GUIA 1AW1A 3O1NA 3M16A 3CLMA 1YPIA 3MYPA 4XZ9A 3WJSA 3EXTA 2V5LA 3UWWA 1G4PA 1LLZA 1ZY9A 1VQTA 2EAWA 1SW3A 4LU0A 3BV4A 4B5NA 4RJEA 4Y8FA 2H90A 5G5IA 1TV7A 2CFFA 3CM4A 3I65A 4MY1A 4FNRA 4WZHA 2VEPA 4JTKA 4BFAA 5CSRA 4PL1A 2ISSA 5BOOA 4QAIA 4A21A 3CB8A 4UTTC 1KLYA 3VFLA 4NNBA 4MYAA 3LX9A 3LOTA 5EMUA 5J5RA 1XDLA 4LOCA 1UUOA 2Z1BA 2A7PA 2ISWA 3F4NA 4Z0JA 3F03K 3P60A 3DFNA 1OJXA 3MHFA 4MY9A 2G96A 3EEGA 3LHYA 1K8XA 2NWRA 5D04C 3LCHA 5D2XA 1XBZA 5CPLA 3LLDA 3FKKA 3UWQA 3CPRA 3W1QA 4O0KA 5K4XA 1FX6A 1JUKA 2RDUA 1A5AA 4OT7A 3L68A 3GKFA 3S42A 4HNTA 3TUUA 3FOKA 3PB2A 4WQ6A 1FWTA 3SW6A 4Z1CA 2ZRUA 1TPVA 1D3HA 4QITA 4LW7A 3NEVA 3C52A 3M1ZA 1IXNA 3G24A 1A53A 1EIXA 1K02A 3SSJA 2YX0A 3G1YA 1ZFJA 3CQ0A 1W54A 3MYOA 8TIMA 2Y70A 2V2HA 3HBLA 3KVKA 1JRBA 1VZWA 3P74A 1OFPA 1SR9A 3HG5A 4RV8A 4PCFA 4MOZA 2QCHA 4QJ1A 1W56A 1AG1O 4Y9AA 1HTIA 5K9DA 1VRDA 1SO5A 2QAPA 3A22A 1Q45A 1XKYA 4N9CA 3G1DA 1BTMA 4K39A 5U4NA 1WOAA 4BI5A 3ATYA 2TSYA 5C2XA 2B0MA 4IXXA 4A3UA 1OFEA 4PC8A 1X7FA 2AQWA 3FA5A 3IEBA 4N02A 1K7EA 3BGGA 5HJLA 5LGXA 1VCFA 4FXSA 1MXSA 3TMQA 1JULA 3USBA 3QFEA 5BNKA 2P1FA 4FIQA 4GFSA 3LI1A 3M5YA 3QJAA 3SECA 4JTEA 4Z1BA 2JGQA 3P5YA 3UPWA 3LRMA 2J6XA 3NL3A 1FQ0A 3GXTA 5AHEA 4DF2A 3BG5A 1K8YA 3GDTA 3HGOA 3IVUA 5C54A 4OV9A 2A0NA 5KTLA 3MJYA 2VEKA 1BWKA 1P1XA 4UUIA 1XI3A 1NFBA 3QMTA 4EVZA 3G0SA 3BK0A 3W2JA 1K7FA 3GAKA 2WOQA 1W3TA 3NO5A 3HQ1A 2CZFA 3G22A 3P8IA 1P4CA 3UZJA 5SWUA 4IX0A 4E38A 3LTPA 3TCEA 3MW7A 3P7YA 4EIVA 1NF0A 1IIGA 3QPZA 5BMWA 3DZ1A 1T0OA 1KW1A 4MYXA 4NXSA 3FFSA 3LXCA 1KV8A 4UCGA 2A2IA 3W86A 1UB3A 2FTPA 4BWLA 1W3IA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3ZWSA

Total Genus

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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