3A9B | Genus

Total Genus 138

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	138
sequence length	374
structure length	374
Chain Sequence	SVNPYIGRSPLVIKSYAEKLEETIAYFEAQGDELNAARTRTVQGIPTFAWISDSATIDTIQPLIADAVAHQEASGEQVLVQLVIYNLPDRDCAAKASDGEFHLDDDGANKYRAYVDRIVAELSTADADKLHFSIVLEPDSLGNMVTNMHVPKCQGAATAYKEGIAYTIASLQKPNIDLYIDAAHGGWLGWNDNLRPSAEIFKETLDLARQITPNATVRGLAINVSNYNPYKTRAREDYTEWNNAYDEWNYVKTLTPHLQAVGFPAQFIVDQGRSGREGIRTEWGQWCNIRNAGFGIRPTTDQAIVDSANVDAIVWVKPGGESDGTSDVNAVRFDENCRSPASHVPAPEAGEWFNEFVVNLVINANPPLEPTYAA

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

molecule tags	Hydrolase
molecule keywords	Cellobiohydrolase
publication title	Crystal structure of a glycoside hydrolase family 6 enzyme, CcCel6C, a cellulase constitutively produced by Coprinopsis cinerea pubmed doi rcsb
source organism	Coprinopsis cinerea
total genus	138
structure length	374
sequence length	374
ec nomenclature	ec 3.2.1.91: Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase (non-reducing end).
pdb deposition date	2009-10-22

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01341	Glyco_hydro_6	Glycosyl hydrolases family 6

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.40	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	1, 4-beta cellobiohydrolase	3a9bA00

1BVWA 1QJWA 1CB2A 3A64A 3VOFA 4AX6A 4AVNA 3RU8X 1UP0A 1UOZA 3VOGA 3VOJA 1OCNA 3ABXA 1OC5A 1QK2A 1UP2A 4AX7A 1GZ1A 2BVWA 1QK0A 4AU0A 4B4HA 2BOGX 3RPTA 4I5UA 1HGWA 1OC7A 1TMLA 4B4FA 2BOFX 1HGYA 1DYSA 3VOIA 3VOHA 4AVOA 1OC6A 1OCBA 1UP3A 4I5RA 4A05A 2BOEX 2BODX 1OCJA 3A9BA
chains in the Genus database with same CATH superfamily

4LNYA 3IIPA 1OX6A 1UKOA 3LBCA 4MOZA 2W3ZA 6PTDA 1PCKA 1U33A 3FA5A 2I1OA 3LXCA 3O6CA 5H8PA 2NXGA 2XFWA 3IUIA 1V3LA 3GD6A 3L65A 1MDLA 5FL0A 4X9SA 3WNNA 4QISA 2Y88A 3STCA 2PDJA 4NZCA 2VEKA 3P0XA 2X2GA 3VD4A 1KFEA 1U5JA 2OOGA 2J7CA 3SCVA 3GDLA 3TN5A 1FHLA 5K2ZA 3U57A 1TE6A 4QP0A 1CXIA 3P8JA 2DUAA 1DYSA 3L21A 2PFHA 2W6RA 1TPUA 5FF4A 4LVAA 4M29A 5K3VA 1W2VA 3TTEA 1TV3A 4O15A 5C9XA 4A29A 4US6A 4O12A 3EMQA 3MQTA 3H55A 4RR4A 1A5AA 4ZO8A 4W88A 1GPWA 2OLSA 1V0KA 2PWEA 3PNUA 1DHPA 3P93A 4XK2A 2C3ZA 1CXKA 4A22A 3VFLA 2X1UA 3PG9A 4HU3A 3ZVHA 4O28A 5I77A 5BCAA 1SU5A 4AZCB 2Z25A 3KZSA 1ZGDA 2QCMA 5C2XA 4TMBA 1SJAA 4OV4A 3KL0A 3PWGA 2WHKA 3UCQA 1RY8A 3UVIA 3RX4A 1NDYA 4B5WA 3R89A 1Y5VA 3GFZA 1E71M 4ZOCA 2HWGA 1O5XA 3HURA 3NQBA 4UWMA 1KRCC 4ZB0A 2PE4A 4W4QA 3AXHA 3TYUA 3GG1A 3O6AA 4TVDA 1HP5A 4AZ6A 3TXVA 1LOLA 3BZGA 3PK7A 3H54A 4A3RA 1ZP4A 1W56A 3WQCA 1G9HA 4H9XA 4HHMA 1DJWA 3MS8A 5C9RA 1K8YA 3LGDA 5CPQA 3NYZA 3N13A 2JF6A 2NT1A 1M7XA 4GOAA 2FPYA 1ZHAA 1QI3A 2CLOA 2L5HA 1KR0A 3M16A 1KR1A 4JFUA 4O4WA 1U2YA 1WDWA 2QCDB 3ZLHA 4OVXA 4QNWA 5I7GA 4PMXA 4AZ5A 4PUNA 1FCQA 2NQJA 1YBQB 4KEZA 1MNZA 4M7TA 3DKLA 4N9EA 5FJPA 2C0AA 1TWZA 1TSIA 5HULA 1TWDA 4WGXA 3QF0A 1NQ6A 2VZTA 4OWGA 3SIMA 5J5DA 4O8RA 4TIMA 4LS0A 3GC4A 5U7SA 3PHAA 5KZEA 2GDQA 2ZUTA 1ONWA 1ZB5A 2VVNA 4ATLA 1TELA 4ZEPA 1PKNA 4Z08A 3E0IA 1XRSA 4C5YA 3ICJA 3CK5A 3VC6A 5A3HA 3KBNA 2O92A 1YIXA 3GTNA 2HSAA 5AHEA 3LPOA 4KETA 4RDWA 5I78A 3TONA 2X09A 4AU0A 1TPWA 3RLGA 1VPXA 4JTFA 4Q32A 1ZAJA 4MJMA 3IJ9A 2B7QA 3AS3A 5D2YA 4MWAB 4YPJA 3FYYA 4Q8MA 4R7WA 4AVOA 2YA2A 5HMFA 2F2KA 4Q7NA 4RNHA 2WZTA 1NWUA 1VC4A 4WY0B 7REQB 1AJZA 3VM5A 1JEZA 1R5YA 2BTMA 5JIPA 3VMNA 4JIIX 2Z29A 1HKMA 1W1A1 1JZ6A 3LCWA 2HEJA 3URAA 3H7VA 2FGZA 3ZWSA 2C0HA 1TPH1 3UGVA 4UTFA 1C3FA 4TVCA 1XYFA 1NWSA 4ES4A 1GORA 2Y6ZA 4UR9A 3CJPA 3UYCA 3G3DA 3LHWA 4XV0A 3GWQA 4WIWA 2WQDA 2H3DA 4DZAA 4RV3A 3IIZA 3SRFA 3NVTA 4AX6A 5HR6A 1P1XA 3VKBA 3SUSA 4C6PA 3NPVA 1S2AA 4GISA 4XD4A 4ZQRA 4U5IA 3IGUA 4GZ7A 1J96A 5LHEA 1TCMA 4MKNA 4JTIA 4CU7A 2YDRA 1FVPA 1E0WA 5SWUA 3QYSA 3DG7A 3RFAA 5HQMA 2VFGA 2JE8A 2XVGA 2FHCA 3CAKA 4PRTA 2XSXA 1EGMA 3A9IA 2BXZA 1VCFA 1MVYA 3KTSA 3GDKA 4NI8A 4W84A 4JCMA 4HMEA 1XBYA 3H2CA 3I68A 2D0FA 5G4HC 1UR8A 1PKYA 4MPKA 3THQA 5DN1A 4JIHA 4L56A 3C2EA 3OVGA 2XFYA 4O0QA 2PGRA 4Y6GA 3QM3A 5HWJA 4UB9A 4PUMA 3M9YA 3SY8A 2A3HA 3CZKA 2WXDM 4LALA 4HPJA 2WANA 3NQCA 1XS2A 3ARXA 6A3HA 4PTWA 5CBBA 1OBAA 3G1SA 2VHLA 2A3EA 3BGJA 1ZUAX 4BF9A 3EA1A 4FO4A 1FFQA 1RSCA 1V3KA 3EPMA 3PSWA 1V6VA 4MNKA 5AHLA 1EDQA 4XZWA 1OCQA 1R3YA 9XIMA 4HOWA 4BQ3A 4D6EA 4F40A 3CUZA 2O7SA 4R9OA 3TSDA 4IMAA 2IXVA 3SCWA 4PMOA 4GX8A 2V5BA 3MSDA 2PTYA 3BLOA 3GXDA 3NTYA 1E4IA 1Q6DA 1CI1A 3DDMA 2J78A 5IBXA 4EAYA 4H19A 1OCJA 3OB8A 3MP3A 4O1FA 2Y63A 1ISYA 2VQUA 1VIZA 4FPSA 4LEFA 1EDGA 2IKIA 4EF9A 4JIPA 4AZHA 2Y7DA 3CZGA 4A4AA 3U2EA 4B3KA 4F4RA 1TUFA 4UTKA 1QPRA 3Q65A 1EIXA 4M6PA 1JZ8A 2ZVIA 2ZXQA 5HMDA 5CSYA 2ZUUA 3V1HA 2ZRUA 3VD9A 2V2HA 4DXVA 3VAVA 3WDIA 3G1DA 5KZ6A 2DGAA 3QYQA 2HISA 2NQ9A 2VEFA 3WO8A 1NJJA 1TZ7A 5I3FA 3AJ7A 2X1SA 4JN7A 1ESWA 5FA5A 1ME9A 3B0PA 1OWQA 2ZKMX 5HBFA 6XIMA 3EPNA 4MY8A 3W76A 3DG3A 1F74A 5F2GA 1HJXA 2D1ZA 3W24A 5FOOA 3QY8A 3VVGA 2WVSA 3KL3A 5FIPA 1ODZA 2P53A 3OPSA 3NO5A 1Q8AA 2E40A 3MMTA 4XD6A 4YU1A 3K2GA 1GOQA 5K9XA 2YL6A 1R2SA 4U4MA 3UEQA 5AC7A 3ONCA 3EKLA 4YTQA 3QR1A 2CZDA 1DIDA 1Z69A 4FLRA 3CAWA 3PG8A 1JD7A 3TE9A 4LRSA 4OJYA 4CD5A 3IWPA 1RCQA 4IL2A 1EJRC 1XYLA 5HUOA 1FFRA 3OO2A 3W7QA 1RJRA 4TVUA 1MMFA 1RJQA 2RJGA 2J7BA 2OWXA 4UCGA 5FAGA 5FEXA 4FX7A 7CGTA 3M4HA 1DQXA 2OQLA 2FIQA 3EB2A 4NHVA 3TJ4A 1R86A 2YL8A 2INFA 4XZIA 4LJ3A 4QITA 4X22A 1UJQA 3GTIA 4UTIA 1IIGA 1GGOA 2V2CA 3VDBA 2NT0A 1BTCA 1ZCOA 1T41A 3QGKC 5CSRA 3UU0A 2QUVA 1OYBA 4LQ1A 3SBFA 4C6KA 3CT7A 4R85A 2BX7A 4NZ5A 1BYDA 1LDCA 1XLIA 4BEUA 3W88A 1JPHA 3CPGA 1OF8A 5E0KA 2Y8KA 3G1RA 5LNRA 2OGJA 1JXKA 2QJGA 1H62A 4IX0A 1TR1A 1FKXA 5I3GA 2NVDA 1GYLA 1BHGA 2IKGA 3BAIA 2UWFA 2VDHA 5G2WA 4B4FA 1JF5A 3VX0A 4YYFA 2FZDA 2WCAA 1CPUA 2V9DA 1XBVA 4CNPA 4LUTA 1JI1A 4P8WA 1ZRQA 4K1WA 2BGNE 4CCDA 3LMZA 3EWDA 5HJLA 3EDDA 1RXOB 4XBJA 3NL3A 3P61A 3LEPA 1KGXA 1RJPA 1H5VA 2OZ3A 4LUYA 3TH6A 4IGMA 4LUSB 4GIRA 4DUXA 2ISFA 1GVSA 4PL2A 4AY1A 4C91A 1RD5A 3KVLA 1F3WA 2NXHA 4DY1A 4IHCA 4MB1A 1WAUA 4UTTC 1QTWA 3IRSA 1JPIA 3L5AA 2ZWZA 4O17A 1TKKA 1B90A 2GQ3A 5KEZA 2IQTA 2VX6A 3TC7A 1KXQA 3GDRA 4IG2A 2Q6ZA 1CLKA 1PKLA 2YLLA 5FF7A 3SCNA 2HTMA 1E6QM 2JIEA 1BXCA 3UG3A 3AMDA 1CGYA 1IGWA 2Z00A 3U5UA 2XG9A 3RUBL 2PEVA 1EHAA 3RYSA 1FY6A 1Z42A 1TIWA 1XRVA 2OR2A 4RUBA 5C2GA 1YKWA 3SCOA 5DMLA 3VKDA 4ZOAA 3DI1A 2GVLA 1OX4A 4AIEA 3E74A 5LGXA 1JCMP 4U5KA 5DX7A 1CW2A 3BJFA 5JH2A 2HCVA 5FD0A 4PUWA 5JXQA 2ZICA 1UP2A 3WFAA 4KIEA 1YPIA 3KRUA 3L4UA 1QO5A 1IGSA 2PDCA 5CPTA 5AVHA 2GJXB 3BURA 4AXNA 3HPXA 3WL0A 1L2QA 1VLWA 3CL7A 5LSMA 1W1ZA 4PFHA 4Z1BA 1HZYA 1FWCC 4BFAA 5A1AA 1TWIA 1HJUA 4WDTA 1UWSA 5TNVA 1O1ZA 2ZZ6A 2VELA 3KZPA 2VP8A 1TVPA 4UTJA 1VAHA 3DH7A 3UQNA 1N8FA 4GO8A 1QI0A 2NUWA 4IJRA 4ENLA 1KFWA 1VFHA 2R94A 3M6YA 4PMQA 3VDAA 3R12A 2D22A 1XLHA 2P5NA 1DVJA 4KMQA 3OODA 1HN1A 1FP9A 1NWTA 1KV8A 3W86A 4BI5A 4XD3A 2C16A 4L6HA 4HJWA 3RF9A 3RU8X 1UMLA 3KM8A 1GQNA 1BXNA 4ERIA 3O07A 4PN2A 3PR2A 3QV8A 3C2VA 1O4UA 2E6FA 3PB2A 1UWQA 1MQRA 3HJZA 2WW5A 3WZ0E 3N73A 2NQLA 3S6TA 2PDGA 3MP5A 3MYOA 2VM8A 1BVNP 4A3UA 4DZHA 1MQQA 3EX6A 4HZ6A 3AU6A 4H2CA 3SB0A 2D2JA 4UBPC 3C5QA 3VTRA 1PYFA 3BV7A 3G0UA 3DERA 4AB4A 1R6WA 1PEZA 4RCXA 1G4TA 3GB6A 1BQCA 3WQOA 1U22A 3ABOA 4QEHA 3A22A 3AIWA 1PHQA 1H50A 3CZEA 4JN8A 4PL1A 2ANUA 5D2WA 3QHNA 2WZHA 4DWSC 3M5VA 2BNJA 1TPDA 4QJ1A 3OLDA 3W6MA 5IRPA 2ACSA 4MLRA 4Q8VA 1C7TA 4RZ6A 3RX3A 1QW9A 3C2RA 1TG7A 4S3GA 3KAOA 5E0CA 4DO6A 3S9IA 4LPCA 1FWAC 1NP0A 1ZBVA 4B91A 2ZUNA 6XIAA 1S2WA 1AW2A 4JTLA 2WMKA 2ZUSA 3UJSA 3VZZA 3FJNA 3TZFA 1XX1A 4QLKA 1KRBC 4DJDD 3GTXA 3ABQA 3FW6A 2WKLA 4XZHA 4LH8A 3W7EA 1CGTA 4HK6A 3W2UA 2ZX8A 3UZYA 2CHNA 4OUIA 2NV1A 3N2MA 1I9CB 3VABA 2ODOA 3PF3A 3H70A 2AQOA 3WIJA 2ZA3A 2BASA 4ZENA 3W6YA 4I9JA 3R0KA 1DJZA 3QPYA 2F7FA 1OC6A 5MKGB 1VHNA 1PWMA 3PJWA 5EGRA 2A0NA 1DIKA 4DI8A 2OODA 5FAJA 3BGGA 4NZ1A 3ANVA 4HHHA 4IQLA 1ZL1A 1SM9A 2A79A 1DE5A 4JFTA 3J7HA 1VEMA 3AZRA 3N34A 4XKMA 3MCMA 1TVLA 4GO9A 1J8VA 3BMWA 3W7GA 4D6FA 2Y2WA 3MJYA 3ZT7A 3PZTA 5BRBA 2Z1XA 4GYJA 4Z2KA 5BOOA 1J93A 2NQHA 2V3DA 4JL2A 3E1F1 1F6PA 1WZAA 2UZ9A 4ZSUA 5A2BA 3SEPA 1A3WA 3MHUA 3BW2A 1EOKA 3CUIA 4ML4A 1DTUA 2X7VA 3G24A 3MMDA 3DAQA 4K7YA 3P6LA 1GYNA 2FDMA 2MANA 4X63A 5AZ1A 3BVJA 3Q4DA 3SN4A 4RL3A 2OCZA 1TPVA 4MAVA 3UZZA 3DFHA 5C6MA 3AUJA 4IISA 2V38A 4C65A 2WPGA 3VCNA 2J62A 4XB3A 1QHOA 4BQ2A 4B2DA 3IUHA 4C6FA 4L6OA 3LZ5A 1I45A 3GHRA 3SW6A 4QQ3A 1NWRA 7ENLA 1PSCA 2YW4A 3HQNA 2IPWA 2PDHA 2DZVA 1CXHA 3VZYA 1WQ5A 1T6MA 1GOXA 1PVNA 4E4PA 4B5XA 3EXRA 3CEPA 5TAOA 4PE8A 3OIXA 3R25A 3O6DA 4ZA0A 1XDLA 5BYWA 3VNZA 1ODUA 2J88A 1H4PA 3E49A 2WKJA 4KW2A 3N1AA 4GKTA 1FWNA 2IQDA 1QK0A 4MB4A 4G5DA 3NPWA 2VI0A 1VIWA 3D3AA 4PZVA 1RPXA 2RUSA 3VNLA 1MW0A 5D33A 3SADA 2GDVA 4LAKA 3LU2A 3N17A 4M0XA 2ISWA 1YE4A 2QT3A 1IEQA 9CGTA 3KE0A 2QLYA 2DQWA 2E5DA 4DF0A 5J8LA 3BOLA 1F73A 5D9OA 4AZCA 4IIHA 2XZ7A 2VVSA 2PDBA 3WQGA 2CLFA 2VD8A 3MHGA 4GINA 1OQFA 1TREA 5DT5A 2HNEA 3TYAA 1O5RA 1PKMA 1ZNNA 3MUCA 3CL6A 3EEZA 1XIJA 1XP3A 2YFNA 4XTDA 1EFZA 5LIKX 1B1YA 3GLCA 1F3TA 1QWGA 3NYDA 2E28A 3WUEA 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 1P0E A;  1U1H A;  4EPE C;  3T8Q A;  2D2G A;  2C7F A;  4BF7 A;  1URO A;  3GHT A;  2JGQ A;  2QJI A;  1JPM A;  1YAD A;  2YCL A;  1W3T A;  3U8G A;  2WM1 A;  3THU A;  1KBJ A;  4O8A A;  2RDU A;  2W5F A;  2P8C A;  2R1P A;  4IGS A;  2Z2B A;  1DWH M;  1W1V A;  5A6S A;  1XLK A;  3A6O A;  7ODC A;  4YVP A;  1GTH A;  1Z3N A;  3L4Y A;  3NXF A;  1ZZM A;  3UY8 A;  2ZQ0 A;  4PTM A;  1H7W A;  2WNN A;  5A6K A;  1X1Z A;  4HQV A;  3NPU A;  4BKN A;  2AQW A;  2CXE A;  3A5F A;  2QCC A;  1DWA M;  3UF9 A;  3MMU A;  3I4K A;  1PIG A;  3RK8 A;  4KT2 A;  1OX5 A; 
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 1BVW A;  1QJW A;  1CB2 A;  3A64 A;  3VOF A;  4AX6 A;  4AVN A;  3RU8 X;  1UP0 A;  1UOZ A;  3VOG A;  3VOJ A;  1OCN A;  3ABX A;  1OC5 A;  1QK2 A;  1UP2 A;  4AX7 A;  1GZ1 A;  2BVW A;  1QK0 A;  4AU0 A;  4B4H A;  2BOG X;  3RPT A;  4I5U A;  1HGW A;  1OC7 A;  1TML A;  4B4F A;  2BOF X;  1HGY A;  1DYS A;  3VOI A;  3VOH A;  4AVO A;  1OC6 A;  1OCB A;  1UP3 A;  4I5R A;  4A05 A;  2BOE X;  2BOD X;  1OCJ A;  3A9B A;

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3A9BA

Total Genus

sequence length

structure length

Chain Sequence

Structure visualization

pfam database annotations