3AHVA

Semi-active e176q mutant of rice bglu1 covalent complex with 2-deoxy-2-fluoroglucoside
Total Genus 197
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
197
sequence length
472
structure length
472
Chain Sequence
NWLGGLSRAAFPKRFVFGTVTSAYQVEGMAASGGRGPSIWDAFAHTPGNVAGNQNGDVATDQYHRYKEDVNLMKSLNFDAYRFSISWSRIFPDGEGRVNQEGVAYYNNLINYLLQKGITPYVNLYHYDLPLALEKKYGGWLNAKMADLFTEYADFCFKTFGNRVKHWFTFNQPRIVALLGYDQGTNPPKRCTKCAAGGNSATEPYIVAHNFLLSHAAAVARYRTKYQAAQQGKVGIVLDFNWYEALSNSTEDQAAAQRARDFHIGWYLDPLINGHYPQIMQDLVKDRLPKFTPEQARLVKGSADYIGINQYTASYMKGQQLMQQTPTSYSADWQVTYVFAKNGKPIGPQANSNWLYIVPWGMYGCVNYIKQKYGNPTVVITENGMDQPANLSRDQYLRDTTRVHFYRSYLTQLKKAIDEGANVAGYFAWSLLDNFEWLSGYTSKFGIVYVDFNTLERHPKASAYWFRDMLKH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Beta-glucosidase 7
publication title The structural basis of oligosaccharide binding by rice BGlu1 beta-glucosidase
pubmed doi rcsb
source organism Oryza sativa japonica group
total genus 197
structure length 472
sequence length 472
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 2010-04-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3ahvA00
3SCSA 2EJ1A 2Z1KA 2XGBA 3GNRA 4AD3A 1LJYA 1UWUA 2EQDA 1GQLA 3AIRA 4E2OA 3WNOA 2QMJA 1CGWA 2JIEA 5DO8A 4HTYA 2GSJA 4TUFA 2AMGA 2CBUA 1LG1A 1PEZA 1UWSA 2JALA 2J79A 2BFGA 1JZ8A 1OIFA 3UR8A 3W81A 1QI0A 1Q4NX 4GZJA 2IXVA 1QOXA 1UR2A 3BAXA 1UH4A 4P8XA 1CXEA 4C7DA 3B9EA 3VUPA 3LPFA 1BVZA 1J9YA 2WHMA 2V5CA 3VGHA 3BMWA 1E6XM 2GJRA 1BGAA 3NJ3A 1WPCA 5FCZA 5A69A 1MQPA 4RL3A 3ZJ6A 3ZSSA 1OIMA 1WDSA 3A3HA 1F4HA 3MUZ1 4J3UA 3BLPX 3VOCA 3IJ8A 1C7SA 1JNEA 5AYIA 1VEMA 3PZOA 1H11A 4PMVA 2DPEA 2YJQA 4AW7A 2WCGA 3I3BA 4W7WA 4ZFMA 1A3HA 1R7AA 4D6HA 1BYCA 1XD1A 1BG4A 1CBGA 3VMNA 2PC8A 4IPLA 1FA2A 2IXUA 1NARA 1QW9A 4KH2A 4AD0A 1UD3A 2QMKA 1VEOA 2XIIA 2X0HA 3ALFA 3ZM8A 4XV0A 2V3GA 1SYTA 5BRQA 1B90A 1H2JA 1NP0A 5A6KA 2VVSA 2ZE0A 2CETA 4URIA 3DECA 3F5JA 4AD5A 2G3JA 3VIIA 1KWKA 3EDJA 1C8QA 1BHGA 1EDGA 3EDFA 1CTNA 1CEOA 3VGDA 1ISYA 3AIVA 3W6LA 2XWEA 5C71A 4TTGA 3PBGA 1MVYA 3NYDA 3O6AA 3PZMA 1QBBA 2JF7A 3AZSA 2YDRA 1GNXA 3BXWA 4A3YA 2WVTA 1CLXA 4P8VA 3W4RA 1NWUA 1UUQA 5M3WA 1NOFA 4BS0A 1ZB5A 4Q22A 3KL0A 4PYSA 5A6MA 1GOQA 3VPLA 1W1YA 4F66A 2ZWYA 5A6BA 5F7UA 1E1EA 5HNNA 1I1XA 4CUCA 3PZUA 3T0DA 4DUXA 2F8QA 4UR9A 1V3JA 1LG2A 1JZ6A 1FHLA 4OBSA 1FOBA 3WH7A 3FHQA 3OGRA 2A3AA 4PMOA 1XYFA 1EH9A 1EGZA 2VOTA 4ZEPA 1G5AA 5CLTA 1TG7A 4MADA 4AIUA 1N82A 2BVTA 2W61A 3OZPA 3ZJ7A 1DTUA 5DFAA 3GXMA 4UFIA 1DWHM 2D2OA 5IDIA 3SIMA 3VM7A 4FLSA 2O9PA 4LX4A 1W1PA 5A6JA 2NSXA 1PZ3A 3RILA 3ZQ9A 3A47A 2ZUMA 5FIPA 4PUEA 4OIFA 1CGUA 1QI4A 3AISA 3KL5A 1SMDA 3BGAA 4NRRA 3BH4A 4XB3A 1J12A 1D7FA 1W3LA 4UQCA 1MFUA 2RGLA 2WMJA 1VBUA 5EFFA 1JL8A 4HZ8A 3QHMA 3N12A 3NSXA 1UZ4A 1JAKA 2E9MA 2YOCA 1XD0A 1VF8A 3AIQA 3AMKA 3BAYA 1TCMA 1WZKA 4ZXLA 1FFRA 2WW5A 1X1NA 4EANA 4WF7A 1QNSA 1H3GA 3L4UA 4OBRA 4JCLA 4WSKA 1UKOA 1CGXA 1UZ1A 3WSUA 2VJXA 1XHGA 3WDRA 2G3IA 2CNCA 3AIWA 3FXYA 1GCYA 4DWSB 1TMQA 3MSDA 4CN4A 4PN2A 2CXGA 3UG3A 2XIBA 2WYSA 4W8LA 2FH6A 4ZXOA 4RE4A 4WIWA 3WUBA 2XYLA 1TUXA 4WK9A 1PX4A 3AXXA 1V3IA 5I0DA 2VZTA 4PSRA 5CG0A 1WDQA 3RPMA 5KZ6A 4N0RA 1E5JA 2Y8KA 4UOZA 1FHDA 3EDKA 3GM8A 1PZ2A 2WAGA 1JD9A 5I78A 1V08A 3SUUA 2XGIA 2YA0A 4CCDA 1KWGA 3TTSA 1B30A 2Y4SA 1KBBA 1EDQA 1YHTA 3BLKA 4V28A 1MYRA 3TTYA 3GXIA 3T08A 3WQ5A 3CZKA 1FP8A 2WPGA 3J7HA 1M53A 1HXJA 3L4TA 5IFPA 2CBIA 3VGGA 4CN1A 4TX8A 3WF1A 4EK7A 4WKHA 1UD4A 3NDYA 1XC6A 5E9AA 3MUY1 3PTQA 3VD5A 1HNYA 3GBEA 1JG9A 1HN1A 2FHCA 4C7FA 2PBOA 2AAAA 3D5HA 5D9MA 1OGGA 3EMCA 3PTKA 4JHOA 4RE2A 4PRWA 5A2BA 3CZLA 3ZMRA 1WDRA 5A6SA 2WLZA 1J01A 1DHKA 3WNKA 2DEPA 1E0WA 1W2PA 2CHOA 3MUAA 2WMKA 3AHZA 1XSKA 4HA3A 3WFLA 1FP9A 1OGSA 4CU6A 4F8XA 1CGVA 4PMRA 3VIFA 5D8WA 3PZNA 1E4LA 2JIWA 1ITCA 3VD7A 1C93A 3K1DA 1K9FA 4AZIA 3PN8A 1KGXA 1H0GA 3ZSTA 5AY7A 4X9YA 4GQQA 4R5EA 1UD2A 3WQVA 4MB4A 1XCXA 3B9AA 1TA3B 2GUYA 1BGGA 3CZGA 5JIWA 4UZUA 1RPKA 3CUGA 5LA1A 4HPHA 4PBGA 2WHJA 2E9BA 2WCAA 5M03A 4EAMA 3WDHA 2YA2A 3G6MA 4H04A 5EB8A 2EO7A 1UQYA 3WQWA 4JFTA 3QOKA 1ODZA 3KE0A 4HZ7A 4H8HA 4QLKA 1U2YA 2Y8VA 3CZEA 1JGIA 1UD8A 3RCNA 3WN6A 1JDDA 4PUDA 2DIJA 1UQZA 2WANA 2VURA 4A3HA 4TOQA 1OINA 1GORA 4IPNB 4GZEA 1VRXA 3UESA 3FAWA 3AIEA 3BAWA 2Y24A 3WNMA 4W93A 3AYSA 3WNLA 3KEHA 1W3HA 1UR0A 4W87A 4FMVA 1PJ9A 1BYDA 2E3ZA 3FW6A 4KMQA 4AZ6A 1OWQA 4KGJA 3WF3A 2ZX5A 1HKIA 1GJUA 4FLOA 3AMLA 4MTVA 3APGA 1H49A 3W53A 1JNDA 3L4VA 3CHEA 4IISA 8A3HA 1CZ1A 1B31A 4TVCA 1DWGM 1ODUA 2J7BA 5CXPA 4PCTA 3RM9A 1VBRA 2WM0A 3VIMA 5IHRA 1GOOA 3POCA 1GW1A 1AQMA 4UQBA 1BFNA 1IT0A 3WEZA 1UR1A 1DEDA 3CLWA 3L4ZA 2WLYA 2YL8A 4KGLA 2CERA 1R86A 4BZYA 4UQEA 3TTOA 1V6UA 4ZE4A 2WHKA 3QR3A 1G01A 1TZ7A 1V0KA 1TE1A 1JYNA 2C7FA 3NDZA 5FD0A 5BYWA 3BSGA 1E56A 3M7SA 4LXFA 1VFMA 2CPUA 4NSBA 3IAPA 2BY0A 4QFUA 3VINA 3IANA 1W9DM 1QBAA 2XVLA 1WKYA 1OD8A 2PBGA 3RJXA 3UG5A 4UFLA 4F9JA 3VIKA 1VEPA 3OB8A 1HVQA 4M82A 3FAXA 3N9KA 4FLRA 4QLLA 1JDCA 2VO5A 1TR1A 4B16A 1BF2A 3QOMA 2DIEA 1H0IA 5E6YA 2DSVA 5IXEA 1LF1A 1VFFA 3EMZA 4WJXA 4MNJA 5LYRA 1QNOA 1QPKA 3VIGA 5GNZA 4LPCA 2QPSA 1ZU8A 2ZX8A 5IHSA 4LYQA 3IJ7A 4D6EA 2J74A 3N1AA 2BY2A 1UH2A 1CXLA 4Z2KA 1D3CA 4OOZA 5AC4A 2JEQA 1ZJBA 1E43A 1L8NA 1J11A 1KCLA 3AFBA 1KCKA 3ECQA 5A3HA 4HP5A 2NT0A 3SUSA 5CQ1A 1HF6A 2ZX9A 5BRPA 4AY1A 4PMQA 3HJEA 3OGVA 1W3KA 1Q6EA 1CDGA 1J0YA 3GNPA 4OOUA 3AHXA 1NH6A 2VX7A 3WH5A 1MW3A 3WD1A 4MNKA 3N11A 1CPUA 3BAJA 3VX0A 3RM4A 3U5YA 1CIUA 1NM9A 4CD7A 4U5KA 4Z2LA 4MB3A 1I75A 5I6SA 4TTUA 3ARRA 2D3NA 2ZUTA 2J4GA 3N13A 3AIUA 1X6NA 2J7GA 3VNZA 3CBWA 1CXHA 1R87A 3W82A 4D6IA 2E8YA 4PMXA 1MW0A 3VX1A 3VMPA 3OIHA 2ZICA 5A6BD 3MMUA 4HOWA 3VDHA 2EPOA 4J3SA 2WC7A 4JCMA 2D24A 1E40A 1ZBCA 1JF5A 4PTMA 1VJZA 2X8RA 3AROA 5FOOA 3CTTA 2W91A 3AMCA 3QHOA 2DH2A 2QF8A 2BHZA 3WUFA 4AIEA 1JFXA 1MW1A 1EO7A 3EYPA 3GYCA 2Q8XA 5GQBA 4RE3A 1BVNP 3K46A 1BLIA 2V3DA 4ZENA 3MS8A 4PTVA 2BVDA 1XSJA 1RH9A 3GH7A 1W9VA 1WAWA 2J25A 1I1WA 2WZIA 4CN6A 3MMDA 4OUEA 4B15A 2RGMA 4IM4A 4D6CA 2J7EA 3OLEA 2EPNA 2J62A 2WMFA 3UERA 1E6RA 4Z2IA 1WZLA 1FH8A 2DGAA 4D71A 1UR8A 1LL6A 1PAMA 1W9BM 2OSXA 2VZVA 5E0CA 5CPQA 4H41A 1KR1A 5JBFA 4CD6A 4GIAA 5EMYA 2GK1B 1F4AA 9CGTA 5JBEA 2HVMA 1VJSA 3ZOAA 2A3BA 3WIJA 3PZIA 1QHPA 2YDQA 5CJ5A 1Q6GA 2XFFA 2VVNA 2WMGA 2OWXA 1WCGA 1CENA 3VU2A 3U7VA 2WZEA 3LPOA 3WD3A 1ISXA 3WL0A 2W63A 3KZSA 3SUWA 2OWCA 3CUFA 4MAVA 4U31A 1E71M 4UFKA 4GPNA 5EFDA 2VL4A 3GXFA 4M24A 4OKDA 3WBAA 3AOFA 3AJ7A 1GVYA 3OZOA 1DP0A 3HMCA 4P7OA 2WHLA 3VMOA 2FH8A 4JFUA 4DWSA 3PZ9A 5A6LA 3AQUA 2CKRA 4TVUA 1EHNA 2WWCA 4BQ2A 3CIVA 1ZBKA 3NCOA 2CEQA 1HJXA 4MAZA 1WZMA 2D0GA 4AD4A 1UWIA 2FGZA 2VNCA 1C92A 4ATLA 5BXRA 4HMEA 1DWFM 3ARUA 4PTWA 1SMAA 1O7AA 7TAAA 4MJ2A 5I5RA 1E15A 1M7XA 2VMFA 3OLGA 4PSPA 1H4PA 2W67A 5EBAA 2A3CA 3KL3A 3AHVA 4M8UA 4W7VA 1HKJA 1X6LA 2XJ7A 1IV8A 4AEFA 3ZT7A 5E0FA 1B3ZA 1Z32X 3ZIZA 1PPIA 3T2PA 1ISVA 1KXVA 5JBDA 2D3LA 2AOSA 1HJSA 1E6PA 3GBDA 3A4AA 2B31A 1HKMA 1Y7VA 4XZWA 4W5UA 1D2KA 1NQ6A 4D1JA 3AIBA 3VDCA 2QLYA 1OD0A 4X0NA 1EA9C 3ARYA 4L4OA 1U30A 1TVPA 6CGTA 1E3ZA 3N18A 2ZXDA 2VI0A 3NSMA 1XRVA 4U3CA 1OCQA 2F2HA 3NIYA 3ZT6A 1CGYA 1J10A 5D9PA 1JIBA 1KGWA 1V3KA 4M1RA 3UETA 4NI3A 1GHSA 4ACYA 2VQTA 2DSZA 3LPGA 1VAHA 3PZVA 2CESA 2BXYA 1WDPA 4ACZA 2EPKX 3FHAA 1HJWA 5DT7A 3M6DA 2OWWA 4IUGA 4YHGA 4CGTA 4AD1A 1C91A 3W37A 2PI6A 1TA3A 1O6IA 3S2CA 4W89A 1JF6A 1OGBA 3B9DA 4XZBA 4J3TA 3WY1A 1OBAA 2V38A 3BAIA 1E6NA 2YA1A 3FN9A 3K4DA 1ESWA 2BNJA 2EPLX 2JE8A 4D6DA 1JZ2A 4D72A 3SCWA 1NP2A 2BHYA 1ISZA 1PIGA 1W9PA 3CUHA 1UH3A 4U33A 2J78A 3F5LA 3UR7A 1M04A 2XFYA 5ECUA 5A2AA 3ALGA 4PMDA 4E4PA 1HKKA 2UY5A 1B1YA 2E9LA 1LWHA 3D3AA 5ABEA 1ZBVA 1NWSA 1J0KA 3OLDA 4AWEA 2VTFA 5TD4A 4FF5A 2WVUA 2DT3A 2J7CA 4W5ZA 3I3EA 1UKSA 2PWFA 3DYMA 4J27A 2ZWZA 2DT2A 1QVBA 4PMYA 4B9ZA 3VM5A 2WMIA 5HPOA 3GNOA 1WZAA 2CCRA 1E0XA 1JZ7A 3MO4A 1IZKA 4PMZA 5HBFA 1UWTA 4CVUA 4N42A 3SCNA 2TAAA 4ATWA 1K9DA 4DUVA 1L0PA 4M56A 2OYKA 3WQ8A 5A8QA 3WUGA 2YBTA 4Z2HA 4JKKA 3SCPA 3TONA 3EDDA 4BQ3A 4PMNA 1QNRA 1YQ2A 3MMWA 1CXFA 4DM2A 1E55A 3BMVA 4U3AA 4E8CA 4XUYA 4ACZB 1E6QM 1ZJAA 3WEOA 4KRUA 2OSYA 1KR0A 3QHNA 1PBGA 5DF0A 2GDVA 4A4AA 2J8FA 4M81A 2J7DA 1UWRA 3EDEA 3W27A 3DC0A 1FH9A 2EEXA 3PZTA 3WDJA 1MXDA 2C8NA 4BQ4A 1NOUA 4WKAA 1QI2A 3BAKA 2CIPA 2OLHA 2GFTA 1W3JA 1PX8A 1A47A 2XTKA 1EQPA 1CWYA 1JI2A 1FFQA 2W5FA 4UNIA 2D1ZA 3POHA 1OM0A 1E4NA 4MB1A 2VR5A 4QAWA 1SR0A 2YLAA 2BXZA 2WWDA 4JZ5A 1OT2A 1UKQA 2VCBA 3IJ9A 4F9DA 1KB3A 3SCQA 3OLIA 1E6ZA 4HU0A 4MNLA 5I77A 3G6LA 2WKGA 3E1F1 1E73M 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3SCS A;  2EJ1 A;  2Z1K A;  2XGB A;  3GNR A;  4AD3 A;  1LJY A;  1UWU A;  2EQD A;  1GQL A;  3AIR A;  4E2O A;  3WNO A;  2QMJ A;  1CGW A;  2JIE A;  5DO8 A;  4HTY A;  2GSJ A;  4TUF A;  2AMG A;  2CBU A;  1LG1 A;  1PEZ A;  1UWS A;  2JAL A;  2J79 A;  2BFG A;  1JZ8 A;  1OIF A;  3UR8 A;  3W81 A;  1QI0 A;  1Q4N X;  4GZJ A;  2IXV A;  1QOX A;  1UR2 A;  3BAX A;  1UH4 A;  4P8X A;  1CXE A;  4C7D A;  3B9E A;  3VUP A;  3LPF A;  1BVZ A;  1J9Y A;  2WHM A;  2V5C A;  3VGH A;  3BMW A;  1E6X M;  2GJR A;  1BGA A;  3NJ3 A;  1WPC A;  5FCZ A;  5A69 A;  1MQP A;  4RL3 A;  3ZJ6 A;  3ZSS A;  1OIM A;  1WDS A;  3A3H A;  1F4H A;  3MUZ 1;  4J3U A;  3BLP X;  3VOC A;  3IJ8 A;  1C7S A;  1JNE A;  5AYI A;  1VEM A;  3PZO A;  1H11 A;  4PMV A;  2DPE A;  2YJQ A;  4AW7 A;  2WCG A;  3I3B A;  4W7W A;  4ZFM A;  1A3H A;  1R7A A;  4D6H A;  1BYC A;  1XD1 A;  1BG4 A;  1CBG A;  3VMN A;  2PC8 A;  4IPL A;  1FA2 A;  2IXU A;  1NAR A;  1QW9 A;  4KH2 A;  4AD0 A;  1UD3 A;  2QMK A;  1VEO A;  2XII A;  2X0H A;  3ALF A;  3ZM8 A;  4XV0 A;  2V3G A;  1SYT A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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