3AHXA

Crystal structure of beta-glucosidase a from bacterium clostridium cellulovorans
Total Genus 183
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
183
sequence length
444
structure length
444
Chain Sequence
MEKLRFPKDFIFGTATAAYQIEGAYKEDEKGESIWDRFSHIPGNVAKMHNGDIACDHYHRYKEDVQLLKSLGIKSYRFSIAWPRIFPKGFGEINQKGIQFYRDLIDELIKNDIEPAITIYHWDLPQKLQDIGGWANPQVADYYVDYANLLFREFGDRVKTWITHNEPWVASYLGYALGVHAPGIKDMKMALLAAHNILLSHFKAVKAYRELEQDGQIGITLNLSTCYSNSADEEDIAAAHRSDGWNNRWFLDAALKGTYPEDMIKIFSDTNIMPELPKELFTEVFETSDFLGINYYTRQVVKNNSEAFIGAESVAMDNPKTEMGWEIYPQGLYDLLTRIHRDYGNIDLYITENGAAFNDMVNRDGKVEDENRLDYLYTHFAAALSAIEAGVPLKGYYIWSFMDNFEWAEGYEKRFGIVHVNYKTQERTIKKSAYWYKELIERSN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Beta-glucosidase A
publication title Structural and functional analysis of three beta-glucosidases from bacterium Clostridium cellulovorans, fungus Trichoderma reesei and termite Neotermes koshunensis
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium cellulovorans
total genus 183
structure length 444
sequence length 444
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 2010-05-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3ahxA00
3BGAA 3WD4A 5A8OA 2VI0A 2E9MA 1UWIA 3CUGA 4QFUA 2VNCA 3WH9A 2ZXBA 1R8LA 4AC1X 4J3XA 1E4NA 1VIWA 2WVVB 1E40A 3L4ZA 1V0LA 3IJ9A 1E6NA 2VL4A 4MAZA 1KFWA 2WSKA 1LG1A 3FNDA 3NIYA 3ARRA 2DT2A 1BGAA 3OG2A 4NF7A 4TUFA 7TAAA 4W89A 2JEPA 2UWFA 2YDSA 5ABFA 2XM2A 1IZJA 1W1PA 1MWOA 1V08A 3VDAA 2VX7A 1ISYA 3PTKA 1FP9A 4RL3A 2BXZA 1XV8A 3W6MA 1W3HA 3AXXA 2XFYA 1GHRA 1FP8A 4CD5A 4P7LA 1H2JA 2F2HA 4PCTA 2D22A 2J25A 1Q6CA 2WMGA 1UUQA 4YHGA 3AS3A 1XSKA 1W1VA 2J7EA 4IPLA 3ARVA 2XYLA 1B31A 3DYMA 4WJXA 2JFEX 3AI0A 1QNRA 3QOKA 2CBJA 3MUIA 2CESA 1PAMA 1ZBWA 3N04A 4PYSA 4B15A 4OIFA 3M46A 1GOOA 2V5CA 1W3JA 3L4XA 3FAWA 1UKSA 3VO0A 5D8WA 3K4DA 1W1TA 4V27A 1V02A 3VD9A 1DEDA 3UR7A 4J3UA 3NUKA 1J18A 4JHOA 1G01A 3F5KA 2WNWA 5JBFA 3VKKA 3SUUA 1KQZA 1DWGM 5HOSA 5M3WA 3BAXA 3EDJA 1M04A 4XZWA 1Y7VA 4GI6A 1JF6A 5CLTA 3TTQA 2X2YA 1E15A 4QLKA 3CIVA 3EYPA 1DWHM 1E71M 3CUFA 2WPGA 4OOUA 3ZJ6A 1ZB5A 1M03A 2BHZA 3VNZA 4ACZA 1NWRA 2WM0A 3CHFA 3GTNA 4QLLA 3SUSA 2J47A 4KRUA 4TX8A 3WNLA 1CLXA 1IZKA 1HKJA 2O9TA 3CZEA 3RCNA 1GOMA 4CU6A 4ZE4A 1E43A 2CITA 1C8XA 1TR1A 3OBAA 3WQ5A 3UESA 4PMZA 4J3TA 1MW0A 1XCXA 1HVXA 3ZSTA 5AYBA 3TOPA 5A6LA 2OWCA 3MSDA 5GNZA 1QHPA 4WSKA 2D0FA 2WZIA 5CQ1A 3W81A 4TTGA 1QI3A 3IAPA 2V3GA 2BY2A 1VEMA 4JAWA 1J0JA 4B9YA 1J11A 3THDA 4CU7A 2VZTA 5A1AA 4QDMA 3PZOA 4WK9A 3RM8A 2FH8A 5CPQA 1UH3A 1E1FA 2WAGA 1KWKA 4BQ5A 1D3CA 3CUHA 2DH3A 1W9PA 2GUYA 2CCRA 3AHVA 2XIIA 1QNPA 4J28A 4TVCA 3T2OA 4U5KA 3ZIZA 4PSPA 1FHLA 2WCSA 2Y8VA 4M8UA 1BLIA 3OLEA 4X0VA 1ZJBA 3BCDA 4S3JA 3ARZA 2WANA 5ABGA 3AQUA 4B16A 1LL6A 4FMVA 4M1RA 5JBDA 4D6JA 1E4IA 4UFLA 1K9DA 1QBAA 4AD5A 2CHOA 6CGTA 3NDYA 2CBUA 4CU8A 3ARYA 5GPRA 3BAKA 2QV4A 1Q4NX 3AIWA 2VURA 3IAQA 2E9BA 4KGLA 2RGMA 4FF5A 1BQCA 1UR9A 1MFUA 1C90A 1DWFM 2J7FA 1E72M 2YKKA 2BY0A 4GQRA 3CZGA 1WP6A 1PJ9A 1QNSA 2FHBA 3VGFA 1EOKA 3OLGA 5IFTA 4WKAA 3LPOA 1ZBVA 3RMEA 5D4YA 3W82A 2WMIB 1J0KA 5CZKA 2IXUA 5FKYA 1EHAA 2EPMX 3B8SA 3S6TA 1OT2A 2VQUA 3W29A 3L4YA 3LMYA 2J7CA 4F66A 3OGVA 4ML4A 2VCAA 1B1YA 3PZMA 2O9PA 1V02E 3WL0A 1US3A 4LYPA 4PTMA 3WDQA 3IJ8A 1XHGA 1E3XA 5KZ6A 1UD5A 3ECQA 1OCQA 3VIIA 1E6ZA 2VQTA 2DSWA 4D6GA 4Z2KA 1B0IA 2X05A 2DDXA 2JF6A 3AIEA 3EDFA 2YA1A 2WCAA 4Q22A 5FD0A 2XFFA 2CETA 1VJSA 2EPLX 2XHYA 5C70A 2G8ZA 1G94A 3M07A 4NRSA 2VMFA 2QF8A 3GXMA 4CUCA 1RH9A 1VBRA 3RILA 4DM1A 2EBNA 3GXDA 3RO8A 1QW9A 3WD0A 1V3HA 5HXMA 1OGBA 2W63A 4IM4A 2XM1A 3L2LA 4IPNB 3L4VA 2A3HA 4C7GA 4P8XA 1W2VA 5A6MA 4B3LA 2CHNA 1CEOA 2WVUA 2YLLA 1QVBA 1NWUA 3KWXA 4JZ5A 1HL9A 3NCOA 2O92A 3EDEA 1VRXA 5IHSA 3T2PA 3GH7A 5E9AA 4MB1A 4NI3A 5BXSA 3ZO9A 1W3LA 3FY1A 2VRQA 1CNVA 2IXVA 5I77A 2WHMA 2Z1KA 2YDQA 3GH5A 4PCSA 3WNMA 2AOSA 4CKQA 4W7UA 3VPLA 2VX4A 2XGIA 5BROA 3ARXA 3BAJA 1HKMA 4BQ4A 4HPHA 3KL0A 4AD1A 3UG5A 9CGTA 2BHYA 1V3KA 3AZSA 4MJ4A 2BY1A 3VIKA 4CGTA 1OM0A 1W9XA 1QPKA 3DC0A 3VD5A 2UY3A 5JIWA 2A3EA 1NWSA 1UD2A 4UOQA 1QI5A 3SIMA 3HN3A 1V0MA 1DWJM 3WFLA 3K1DA 1UR1A 2FGZA 1L8NA 2UY5A 2D0GA 1XH1A 1V03A 3AFBA 3ZT7A 2V38A 3T08A 3D3AA 3ZT5A 3L4WA 5ABHA 1CGVA 2VR5A 1BYCA 1NOFA 4MNKA 4UFKA 3PZUA 3WH5A 5IFPA 3APGA 1UG6A 2Y24A 1I75A 1WCGA 5CJ5A 5A8NA 1JNEA 4HZ6A 2X0YA 3VMOA 1I1WA 2YL9A 2DGAA 3VM5A 3WBAA 1PIGA 3ZR6A 3WDRA 1WZLA 1MVYA 2W5FA 2WC4A 1W9DM 3CTTA 4Z2GA 4BF7A 1B2YA 2OYMA 2J8FA 3MKKA 1J0ZA 1GORA 1WAWA 1W9BM 3WY1A 5M17A 1E0XA 1UWRA 5CG0A 1U2YA 3QHNA 4X9YA 5DO8A 3A6OA 1Q6DA 2CEQA 1JZ3A 5EFFA 2XJ7A 3BAWA 1WZAA 3LPPA 1KR1A 1E6PA 3WUFA 1A3HA 4M29A 4J3VA 3W24A 1A47A 3UCQA 1HJQA 2OWXA 3IANA 1EOMA 4M56A 1JAEA 1O6IA 1NP2A 4UQAA 1JL8A 2IUZA 1TCMA 3WF2A 1UD8A 2XSBA 4QCEA 3NSXA 4RE3A 2CBIA 5HBFA 5JUVA 1UD6A 4W7VA 2WLZA 4GZEA 3FXYA 4HMDA 1E6XM 1KGXA 3VMPA 4UZUA 3W25A 3DHUA 2E4TA 3HU7A 1W9VA 2DSZA 2ZXAA 4BCEA 4UQDA 1TUXA 2PWGA 4HTYA 3WBEA 2GK1B 4M81A 4QLJA 1V6WA 1J0HA 1QHOA 4GPNA 2XVNA 2ZX9A 3UEQA 1MYRA 1WO2A 4PTWA 5C8BB 4W93A 2PWDA 3W26A 2X8RA 4UOJA 2G3NA 3VIPA 4E8DA 3SURA 1ITXA 1QHZA 2J4GA 2CKSA 4JCLA 3OZPA 3O9NA 4ZXOA 3CMJA 1CXIA 4JHZA 1BF2A 5AC5A 4IUGA 3AOFA 2DSVA 2EPNA 4YPJA 2WVVA 1BG9A 4DM2A 4MPKA 2D0HA 2VC9A 1LWJA 4GO9A 1CGWA 4AD3A 1J01A 3QGVA 4AZCA 1UZ1A 2Q8XA 4CN6A 1E6SM 4M82A 3WEMA 4B3KA 1OD8A 2BVDA 1NOWA 5E6ZA 3BMVA 3SCNA 5A6BA 1EDTA 3WUBA 1SYTA 3K8LA 3MU7A 4Q7NA 1KCLA 4XZBA 3WF3A 3UR8A 4CD4A 3WSUA 5LA0A 4H7VA 3VIHA 5E09A 1BSIA 1CXLA 1WNOA 2X1IA 3AZTA 1S46A 5IDIA 4PTXA 1W9UA 1NOUA 2OSXA 3OA5A 1KB3A 1GVIA 2EJ1A 2WZEA 5M03A 1GOIA 4QP0A 4GXPA 4BZYA 4MADA 4R5EA 1BYBA 2ZUSA 5E6YA 2ZXDA 3JUGA 2DIEA 3AIBA 1JZ4A 3DHPA 5HPCA 4AZ5A 3RM4A 3DYPA 1Q6FA 2WKLA 4B9ZA 1QOXA 3F5JA 4AZBA 4AZCB 4W5ZA 1K9TA 1WB0A 2VVNA 1M7XA 1XH0A 1KXHA 1BAGA 2CERA 1KQYA 5LYRA 3WEZA 1ODUA 3NSNA 4CD6A 2WMJA 2ZX5A 3AMLA 1JYWA 1E5JA 3WMCA 1ZBCA 2ZX8A 1GCYA 4FLRA 4W84A 3SEPA 4AIEA 4JFUA 4YN5A 4A4AA 3OZOA 3WFZA 1ZBKA 3N13A 3MANA 3T0DA 1OINA 1XD1A 1VEOA 3W53A 3WQ8A 2CPUA 5ABEA 1F4HA 3CHDA 1KXQA 3BXWA 1HT6A 3MO4A 1V3MA 8CGTA 2OLHA 1VFFA 3SCTA 3PZQA 1V3LA 2V5DA 3VMNA 3ARQA 1C8YA 3A4AA 3F5LA 1CGXA 1GPFA 4KGJA 3FAXA 3BCFA 1CBGA 3OGRA 3ZQ9A 5CGTA 2E8ZA 2D3NA 3CMGA 3BSGA 1C7SA 3RJYA 1UR8A 3AISA 3VOCA 2WW5A 4AD4A 1V3JA 4TXEA 3GXIA 2EO7A 1H5VA 4P7NA 4BS0A 3ZJ7A 1J10A 2ZUUA 4J3SA 5LA1A 4UNIA 1K9FA 3VD4A 2J7DA 4P7OA 1V6VA 4DWSC 2W61A 1OD0A 3WH7A 3TTOA 1B3VA 1NARA 2YBUA 3HJEA 7CGTA 4AXNA 1WDPA 4WF7A 3KEHA 4L4OA 1DWAM 3KL3A 3OGSA 2GFTA 2Y8KA 1E5NA 1ISVA 1EO5A 4PEEA 5BXPA 4LXFA 5HDRA 3GYCA 4GQQA 1IV8A 1V0KA 5A6BD 4W87A 3CHEA 4HU0A 1VFOA 4GI8A 4AEFA 4H04A 3POCA 3AMKA 4U2YA 2G3MA 2E9LA 1UKTA 1XC6A 1FHDA 1RP8A 1Q6GA 2O9OA 2ZX6A 3CBWA 3SCVA 4UQBA 3VDCA 3DECA 4UOZA 2VTFA 4LPCA 2V3FA 3PBGA 4GI9A 5CSUA 2YIHA 3WF0A 2GVYA 3AS2A 1J0IA 2BXYA 4OZOA 4UFJA 2DPEA 5AYIA 1GJUA 1CENA 4U31A 1DTUA 2WMKA 5BRPA 1JGIA 3VIOA 3ZJ8A 5EFDA 1PEZA 2XUCA 3D5HA 3LPGA 5A94A 2G41A 3AMCA 1AQ0A 4H41A 3VGBA 4D6DA 3AHTA 4U3CA 4CD7A 1HF6A 3SCPA 3N17A 3MV11 3AS1A 1KBKA 2WC3A 2WMIA 2DH2A 4MAVA 1E70M 2XVPA 3AIQA 3WDIA 5A2AA 2PI6A 4JCMA 3TTSA 1VENA 1UR4A 1CGYA 4D72A 4D6FA 3ALGA 4N0RA 1JDDA 4PBGA 3K46A 4JL1A 5BRQA 1EHNA 5I78A 1X1NA 4GZIA 4U2ZA 3ALFA 1V6XA 4TOQA 3AJ7A 4MJ2A 2D2OA 3RDKA 5GNXA 2ZX7A 1DHKA 2WLYA 2XG9A 4FLOA 4FLSA 1WDRA 2D20A 5BXRA 1JAKA 4HA1A 5F7UA 2QMJA 5FCZA 2FH6A 5I79A 4ZFMA 4R27A 2VRJA 4KWUA 2W92A 3PZGA 1ISZA 1CXHA 1MFVA 3PZVA 4UFMA 3VGHA 3WNNA 1V6YA 1TA3B 5A2BA 4S3KA 5A3HA 2ZUTA 1O7AA 4DUWA 4HMEA 4HPGA 5IHRA 1PX8A 2J75A 1LQ0A 2QPUA 2XSAA 2J79A 3PN8A 1EDQA 2XVKA 4CCCA 4CN1A 3VIJA 3WD3A 1DP0A 3AYRA 4HA3A 4AZ7A 3AXHA 2YL6A 3AIVA 3N1AA 4PMQA 3J7HA 3TA9A 1RD6A 1OGSA 1EA9C 2E40A 4ZENA 2JF7A 3KZSA 1UWSA 1UWUA 2D24A 1TVNA 3FHAA 4HP5A 3VNYA 1JFXA 1JIBA 1GQIA 1HIZA 2PB1A 2WSPA 5CLWA 2RGLA 5A8QA 1MQQA 1VBUA 4ATDA 3QOMA 3AIRA 2XTKA 3O6AA 1ZJAA 3EDDA 4PMYA 3UG3A 3I3BA 4MB4A 1EIBA 3ZJKA 3EMZA 4WKHA 2QHAA 5A69A 4MDPA 4JFVA 1RP9A 3II1A 3TP4A 3AZRA 2WMFA 1BVZA 1N82A 1R7OA 2Y4SA 2EPOA 2DEPA 3BLKA 2VX5A 1D2KA 1IT0A 4NSBA 1R85A 1CXFA 4P7QA 1SFSA 4U3AA 1V0NA 2BS9A 2B31A 3VILA 1W2PA 3WF1A 2DQXA 2JALA 1GOKA 1BG4A 4D71A 4PTVA 4LQ1A 2YOCA 3VDBA 5D9PA 1H3GA 2ZUNA 1C8QA 4DWSA 5D9MA 1EDGA 3CHCA 1MQRA 1EXPA 3SCUA 4OBRA 4TX6A 1GZJA 1H49A 5I0DA 2J62A 4W7WA 4MNJA 3FHQA 1LL7A 1PX3A 4FLQA 1H41A 5EBAA 4Z2HA 3T09A 1WZMA 3K8MA 1XD0A 1VAHA 1VEPA 2OWWA 2A3AA 4A3YA 1V3IA 4MB3A 1E55A 1SMAA 1NQ6A 3WF4A 1JF5A 4UQCA 4CCDA 1EQCA 4ATLA 3MV01 2W62A 3AS0A 1KGUA 1FH8A 1ZS2A 1E0WA 4WLCA 3AICA 3VINA 2GDUA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3BGA A;  3WD4 A;  5A8O A;  2VI0 A;  2E9M A;  1UWI A;  3CUG A;  4QFU A;  2VNC A;  3WH9 A;  2ZXB A;  1R8L A;  4AC1 X;  4J3X A;  1E4N A;  1VIW A;  2WVV B;  1E40 A;  3L4Z A;  1V0L A;  3IJ9 A;  1E6N A;  2VL4 A;  4MAZ A;  1KFW A;  2WSK A;  1LG1 A;  3FND A;  3NIY A;  3ARR A;  2DT2 A;  1BGA A;  3OG2 A;  4NF7 A;  4TUF A;  7TAA A;  4W89 A;  2JEP A;  2UWF A;  2YDS A;  5ABF A;  2XM2 A;  1IZJ A;  1W1P A;  1MWO A;  1V08 A;  3VDA A;  2VX7 A;  1ISY A;  3PTK A;  1FP9 A;  4RL3 A;  2BXZ A;  1XV8 A;  3W6M A;  1W3H A;  3AXX A;  2XFY A;  1GHR A;  1FP8 A;  4CD5 A;  4P7L A;  1H2J A;  2F2H A;  4PCT A;  2D22 A;  2J25 A;  1Q6C A;  2WMG A;  1UUQ A;  4YHG A;  3AS3 A;  1XSK A;  1W1V A;  2J7E A;  4IPL A;  3ARV A;  2XYL A;  1B31 A;  3DYM A;  4WJX A;  2JFE X;  3AI0 A;  1QNR A;  3QOK A;  2CBJ A;  3MUI A;  2CES A;  1PAM A;  1ZBW A;  3N04 A;  4PYS A;  4B15 A;  4OIF A;  3M46 A;  1GOO A;  2V5C A;  1W3J A;  3L4X A;  3FAW A;  1UKS A;  3VO0 A;  5D8W A;  3K4D A;  1W1T A;  4V27 A;  1V02 A;  3VD9 A;  1DED A;  3UR7 A;  4J3U A;  3NUK A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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