3AHYA

Crystal structure of beta-glucosidase 2 from fungus trichoderma reesei in complex with tris
Total Genus 187
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
187
sequence length
465
structure length
465
Chain Sequence
MLPKDFQWGFATAAYQIEGAVDQDGRGPSIWDTFCAQPGKIADGSSGVTACDSYNRTAEDIALLKSLGAKSYRFSISWSRIIPEGGRGDAVNQAGIDHYVKFVDDLLDAGITPFITLFHWDLPEGLHQRYGGLLNRTEFPLDFENYARVMFRALPKVRNWITFNEPLCSAIPGYGSGTFAPGRQSTSEPWTVGHNILVAHGRAVKAYRDDFKPASGDGQIGIVLNGDFTYPWDAADPADKEAAERRLEFFTAWFADPIYLGDYPASMRKQLGDRLPTFTPEERALVHGSNDFYGMNHYTSNYIRHRSSPASADDTVGNVDVLFTNKQGNCIGPETQSPWLRPCAAGFRDFLVWISKRYGYPPIYVTENGTSIKGESDLPKEKILEDDFRVKYYNEYIRAMVTAVELDGVNVKGYFAWSLMDNFEWADGYVTRFGVTYVDYENGQKRFPKKSAKSLKPLFDELIAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
molecule keywords Beta-glucosidase
publication title Structural and functional analysis of three beta-glucosidases from bacterium Clostridium cellulovorans, fungus Trichoderma reesei and termite Neotermes koshunensis
pubmed doi rcsb
source organism Trichoderma reesei
total genus 187
structure length 465
sequence length 465
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 2010-05-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3ahyA00
4GIAA 2C8NA 1DWFM 2XUCA 4ZXLA 2BVTA 4KH2A 3GH7A 2J79A 2UWFA 2JFEX 1OT2A 2XSAA 1I1WA 1TMQA 4DUWA 4PSPA 1E4NA 1KGXA 4CUCA 1GOMA 2X05A 3MS8A 1H5VA 2ZWYA 3WDQA 1WDRA 2WW5A 4AZCA 3WNNA 4W8LA 1XCWA 1G5AA 1UH2A 2EPKX 4OOUA 4PMOA 4PEEA 1V6UA 2WAGA 2D0GA 1BYAA 2X0YA 3WQVA 3VGHA 4P7NA 3PZMA 2J74A 1BVNP 1H3GA 1MW0A 1KXTA 3LPFA 4PMDA 3ZM8A 1M01A 1J10A 2VJXA 1K6AA 5JIPA 5C71A 5A3HA 5D9PA 2BXYA 4U2YA 3AYRA 1JDAA 3VUPA 3CHCA 4NI3A 1U30A 2IXVA 1XGZA 2VRJA 5D4YA 4MB5A 4TXEA 4UFJA 4NRRA 3AS3A 4U3CA 1J0KA 3G6LA 3K8LA 2DSZA 1H0GA 4U31A 4U3AA 4YPJA 1BLIA 4PTXA 4DUVA 5AY7A 4GZEA 2GFTA 3WMBA 1UUQA 4AWEA 1JYXA 1J0HA 1KBBA 1QI3A 1SR0A 4E8CA 3PZQA 3FXYA 3L4WA 3CZ8A 1V08A 1UR4A 3WL0A 1JI2A 5HBFA 1MQRA 2PBGA 2GK1A 3THDA 4M8UA 4PTVA 1VFOA 4UOQA 1W91A 5BRPA 1OD8A 3VD3A 1HJXA 4XB3A 1EGZA 1LLOA 4J28A 3BH4A 4MNLA 4AXNA 3T2PA 2W67A 4AC1X 1QNPA 2YL5A 2ZX8A 3VIKA 3WBEA 4BA0A 3SUTA 1GOQA 2QLYA 4B9ZA 2ZX9A 4J3VA 3UETA 3SCNA 1D2KA 4KWUA 1W9UA 2YDQA 4ATLA 1W1PA 4WSJA 1C93A 1WDPA 3F5LA 2CBUA 3VGEA 4WF7A 1V02E 1JL8A 4JCLA 3LPPA 4D71A 3ARRA 5ABFB 1WNOA 4B3LA 4ZFMA 1BVZA 3A4AA 5ABGA 1HJSA 1GOIA 2A3EA 5BRQA 3MUAA 4WSKA 1FA2A 1ISZA 4DUXA 4JIEA 2E3ZA 3B9DA 1QOXA 2BFGA 3VGFA 2WMIA 2XHYA 3O2LA 4ACZB 3SCOA 3IAPA 3WF0A 2C0HA 2WNWA 2WWCA 3WDRA 3N17A 4TX8A 1MW1A 3WNMA 1J12A 3MUIA 4XUYA 1UA3A 1QNQA 3ARSA 3AZTA 1CXKA 1GOOA 3ARYA 3OLIA 4UQDA 2VQTA 4FLOA 2DEPA 3FAXA 3RPMA 1C7TA 2WVTA 2DT2A 3CGTA 3WDHA 3QHMA 1KBKA 4KGLA 2VR5A 5FCZA 1V03A 1C3FA 3OBAA 4A3YA 1JZ6A 5LA1A 2JIEA 4GINA 4CD5A 1OIMA 1W32A 4PN2A 1EHAA 4LYPA 1EA9C 2EJ1A 3TTSA 5LA2A 1E5NA 2Y2WA 5ECUA 3SCSA 2OYLA 4KRTA 3K46A 2O92A 3VIJA 4BQ2A 4F79A 1BSIA 2XIBA 2UY5A 6A3HA 1E0WA 3AIBA 4CN6A 1JYWA 4UR9A 3K8KA 5I3DA 4MB4A 2OYKA 2OSYA 3BC9A 4AD3A 3EMQA 2X2YA 4D6JA 1UZ4A 3UR7A 5IFTA 4B9YA 1L0PA 1V6VA 3L4XA 2V3DA 3FHAA 3HMCA 2O9TA 4QCFA 3T0AA 1ZL1A 3VIHA 4M1RA 2WZHA 1JG9A 3BAKA 4NZCA 4W8AA 1B0IA 1TG7A 3W6LA 4AIEA 3WDPP 8A3HA 1J0JA 2JEQA 2J7FA 1XH0A 3ECQA 1JDCA 1WZLA 3VMNA 2VCCA 3RMEA 5M3WA 1ZU8A 3GNPA 3DHPA 1UR1A 1CECA 1H49A 1UD8A 3U57A 2J78A 1W9BM 4WLCA 1RH9A 1HKIA 4J3XA 1PIGA 7CGTA 1JZ3A 1KQYA 3GXMA 1BPLB 2WMHA 1CGYA 2J7GA 1ZBVA 1ECEA 3O6AA 4WKAA 2WBKA 1HNYA 1WZMA 3AXIA 2HVMA 2DIJA 4H8HA 1OGSA 4JL2A 5CZKA 4UQ9A 5A1AA 3UEQA 2YBTA 1OT1A 2GDUA 4ZEPA 4HTYA 3RM4A 3CH9A 2D1ZA 3KL5A 1WP6A 1CZ1A 1H0IA 4GI6A 4A3HA 1BYCA 3PZ9A 4YHEA 4EKJA 1UWTA 1JGIA 2BY2A 2O9RA 1EDQA 1VF8A 3WQ6A 4IPLA 1E1FA 3WL1A 1L8NA 3NSNA 3WBAA 5AC4A 3EDKA 1PAMA 4L4OA 1CNVA 1JXKA 5M03A 3CMJA 4MAVA 3VD5A 1P6WA 2G4FA 4P8WA 1QHOA 5JBFA 4JHZA 3GDBA 5BXRA 3CHDA 4GPNA 5HNNA 3ZSTA 1BG9A 5DF0A 3AIUA 3CUHA 2QMJA 4J3SA 5GNYA 3BAIA 3WENA 1EO7A 3EDEA 1B3ZA 1UKTA 4V2XA 2PBOA 1E6RA 1CLXA 1XCXA 4H8VA 1FHLA 1CGXA 2EEXA 3GXDA 2WHMA 1VAHA 4P7RA 2JE8A 1LF1A 1UQZA 4PYSA 1NQ6A 3VDCA 1ZJAA 5A6AA 4JL1A 5FIPA 2BHZA 4AYSA 5ABHA 2BY0A 1E1EA 4ATWA 1GVIA 1GQKA 4QLKA 3AS2A 5CPSA 3SIMA 1KXQA 1Q6FA 2O9OA 3DC0A 4OKDA 2VZTA 2D24A 5E0FA 5E09A 2YOCA 3CUFA 1E4LA 5I23A 2BS9A 4CD7A 5ABFA 3WNOA 1BGAA 2A3AA 3BCFA 4P8UA 1YHTA 4E2OA 2EPLX 2MANA 2CKSA 5A94A 1B9ZA 4HU8A 4TTGA 2WC4A 4IM4A 3AHVA 4BS0A 1C91A 1C8XA 1DHKA 4OBRA 1I1XA 1JYVA 3BXWA 2QF8A 4ACZA 1WDQA 3M7SA 4H7VA 2Y8KA 5AYIA 4D6CA 1E9LA 2JF6A 2WANA 3CZJA 1VBRA 2XPKA 2XWDA 3GH5A 1UWSA 3WF3A 1VEOA 1OINA 1E0VA 3UESA 1FH9A 2WMIB 2VR4A 1ZBWA 1W1YA 4JKKA 1RPKA 2VCAA 3WDIA 1UQYA 2UY4A 4B16A 3W4RA 4FK9A 2FDMA 4E4PA 2A3BA 1BYBA 4HPGA 1WZAA 5C70A 1ISWA 4GZJA 4X0NA 2WSPA 2FGLA 4UNIA 2E40A 1ZBCA 2PWGA 3VNZA 1J01A 3HU7A 3L4YA 1W3HA 2CCRA 3RDKA 4GQRA 1LQ0A 4UZSA 5EMYA 4WKFA 1G1YA 2DSKA 1S46A 1UR8A 2XM2A 4Z2JA 5I77A 3NIYA 3SCQA 4AD5A 2ESCA 3CUGA 1KFWA 3RO8A 3KWXA 1OIFA 5D9OA 4NF7A 1KR1A 3VPLA 4KMQA 4V28A 1DP0A 3AS1A 1DWIM 2Y4SA 2VX5A 1R87A 2GVYA 1XH2A 1V3JA 2ZUSA 1EIBA 3OGSA 2CKRA 3DHUA 4HZ6A 3VGGA 3IK2A 3AMKA 1CBGA 3VINA 1HX0A 3VD7A 4PUDA 2XFRA 1CEOA 3FAWA 3TTQA 2CPUA 4HU0A 3ARTA 3CUJA 2D23A 5FL0A 3EMCA 3VMOA 3IJ8A 5HXMA 3WQWA 5LA0A 1KGUA 4KRUA 1W2VA 2WMKA 3K1DA 1HKKA 3WH7A 1UD5A 2VX6A 3ZT7A 2ZX5A 3W38A 1V3IA 2WKGA 1GOWA 1K9EA 2WHLA 4GKLA 1CYGA 2CNCA 1FFQA 4X9YA 3AIVA 3VM7A 3K8MA 3AIQA 5A8NA 4MDOA 3ARQA 4TVCA 3T0BA 4QDMA 1CWYA 5IHSA 3SUSA 1FFRA 4AW7A 2BV9A 1X1NA 2WHJA 5CSYA 2BNJA 3ZMRA 4W84A 3W82A 2WYSA 1KXHA 1CIUA 2YA2A 3N15A 4QFUA 2DIEA 3WF1A 4ATDA 4MB3A 3VNYA 1JD9A 4M82A 2VNCA 1AQMA 1DEDA 1KXVA 3WD0A 1VEMA 4JFSA 3MUY1 3KE0A 2WC3A 2X1IA 2V5CA 1XV8A 3ZSSA 1FOBA 1SYTA 1H2JA 1GHSA 2OLHA 1WB0A 5GNZA 5CLWA 2DDXA 2E9MA 3BSHA 1XHGA 4W88A 3VM5A 2BXZA 3BCDA 1JZ2A 2DSVA 2VURA 2BY3A 4QLJA 5DFAA 2F2HA 1WPCA 4H04A 4NRSA 5A8QA 3VDHA 4BCEA 1W3KA 3PN8A 3AMLA 2V3GA 3QHNA 2VVNA 3PTMA 3AXXA 3AXHA 2ZXDA 1LG2A 1UH4A 2W61A 3WMCA 3LMYA 4MPKA 2WKLA 1B30A 1VEPA 1HP5A 3OLDA 3NUKA 4BF7A 5A95A 2D3NA 4CGTA 2G8ZA 2W66A 1C8YA 4W8BA 4D6FA 4GXPA 3B8SA 4MNMA 4AD4A 2GSJA 5A2CA 5CJ5A 5BYWA 3WD4A 4MNKA 5BCAA 2VCBA 5EBAA 5E6YA 1E6SM 2ZOXA 4W7WA 3SCPA 1TR1A 3BLPX 3ZQ9A 4XZWA 2OYMA 4AD0A 2J47A 2WPGA 3U5YA 3IAQA 1QI2A 5JIWA 4AZIA 3UG3A 1BFNA 2Z1KA 2D22A 5CXPA 2G3IA 3RCNA 3ARVA 5D8WA 3SCWA 2CERA 3TP4A 3VMPA 1CXEA 3CIVA 1SMDA 3EYPA 3CBWA 1TUXA 2XSBA 1ISVA 3SCUA 3ZR5A 4CN1A 1D7FA 1E40A 4UTFA 3KEHA 4WIWA 1J18A 3ARPA 3RIKA 2BY1A 1HJVA 5M17A 1UR2A 4FLRA 1GJUA 3OLGA 1M7XA 4CVWA 1MFUA 1E71M 3WF4A 3L4ZA 1QW9A 2ZX6A 1QNSA 2CETA 3OZPA 1GORA 2WZEA 4P7QA 2X09A 1FP8A 4DM1A 2GJRA 1V3KA 5DT5A 1CXIA 2J7CA 1H09A 4PBGA 3AS0A 1C7SA 3GBEA 4GI9A 4V27A 1W9PA 4RE2A 4TOQA 1TE1A 4ACYA 2E8ZA 5E9AA 3WUGA 3WUBA 3UERA 3DYPA 3ARXA 2Y8VA 3HJEA 3T0DA 3WKZA 2XM1A 3VOCA 4AIUA 4OOZA 5BXSA 2DT1A 4QP0A 4URIA 4R27A 4S3KA 4C7FA 5BXTA 5A8PA 3D3AA 5HDRA 1JNDA 1XRVA 4AY1A 1W3JA 1MXGA 3GBDA 3VIIA 3PZIA 4EK7A 3AISA 3VGDA 2E8YA 4NSBA 3THCA 4TX6A 3TA9A 1V6WA 1CTNA 4Q7NA 2VZSA 4Z2HA 4H8UA 5LYRA 3WH9A 3AIEA 4YHGA 2XG9A 4J3TA 3ZIZA 2DQXA 3CHFA 3ZJ7A 2VL4A 1JAEA 4UCFA 1CGWA 4CU8A 3W25A 1GQJA 1UD4A 1QBBA 3KL0A 4DWSC 3CHEA 4CD6A 2AAAA 2BHYA 1XD0A 2WVSA 3BAXA 4AIOA 5FD0A 2NSXA 1MYRA 4P7OA 2PF0A 4ZE5A 4PMZA 4D6IA 4UFMA 2ZUMA 1O7AA 1US3A 4UZUA 4AZ7A 3KZSA 3WNKA 1VIWA 2BVDA 4OUEA 3OG2A 1C90A 1Z32X 3U7VA 1G9HA 3T08A 3CLWA 4W86A 1DWHM 3A4XA 1M04A 1V6YA 2W91A 3CMGA 3W28A 3AMDA 3CUIA 3A47A 3WH8A 1V3LA 4JFUA 4TVUA 1JZ5A 3MSDA 1UA7A 1VFUA 5HOSA 2VUYA 3WQ5A 5TD4A 1QI0A 1B2YA 1ISYA 5DMYA 1RD6A 1CLVA 1UG6A 1JNEA 2DSUA 3ZJ6A 3WNLA 4U5KA 2UY2A 2J7BA 3BLKA 1LWJA 4HOZA 1HJUA 1PEZA 1R7OA 1BYDA 1B3WA 2W4XA 4MB1A 1W2PA 1MFVA 4JCMA 1AQ0A 1G01A 1UWRA 3PZUA 1UKSA 4CCDA 3N1AA 4JZ5A 2VMFA 3T2QA 4C7GA 1GNXA 2RGMA 4JKLA 4FLQA 4Z2GA 3ZJKA 1I75A 3VDAA 4CD8A 1B3YA 2YKKA 1CPUA 3ARZA 3II1A 3WUEA 4AZGA 3RJYA 1LL6A 1HP4A 3RJXA 1B31A 3BAYA 4D6DA 1W1VA 2GUYA 2J62A 3MV11 1XSKA 3BAJA 3WEMA 4LPCA 4TUFA 3NDYA 3SEPA 1LL7A 4MADA 1XYFA 1R8LA 1KR0A 4UQBA 9CGTA 1MW2A 1UD6A 1E6XM 1N82A 3N13A 4HA1A 2QPSA 2O9PA 3CTTA 3PZVA 5JBDA 3UR8A 1EDTA 4CU6A 1NOWA 3W0KA 2CEQA 5I78A 2VZUA 1V6XA 5E70A 2D2OA 3WSUA 1HVQA 3F4VA 1HKJA 1GJWA 3WFZA 3WF2A 4TTUA 4B3KA 3GXFA 4HA4A 2XWEA 3K4AA 2J8FA 3BMVA 4UOJA 5D9MA 3LPOA 4XV0A 5A8MA 1JZ8A 2FGZA 4OIFA 2VZOA 2VI0A 5CPTA 5A69A 2YL9A 4IUGA 2YLAA 4L4PA 4N42A 5F7UA 4PMNA 5A6LA 5EFFA 1PIFA 2WSKA 1QW8A 3BSGA 1UWIA 8CGTA 1NWTA 3BGAA 5GPRA 3F5JA 2GJXB 3EDDA 2WMFA 4UQAA 1GPFA 1CGVA 2YIHA 3VTRA 2DT3A 2EXOA 1HJWA 2WCSA 3WEZA 3AOFA 1Y7VA 1UOKA 1VB9A 1R86A 1QBAA 3WY1A 4QCEA 1IZKA 1VENA 3WNPA 4AZ6A 2OSXA 1VFFA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4GIA A;  2C8N A;  1DWF M;  2XUC A;  4ZXL A;  2BVT A;  4KH2 A;  3GH7 A;  2J79 A;  2UWF A;  2JFE X;  1OT2 A;  2XSA A;  1I1W A;  1TMQ A;  4DUW A;  4PSP A;  1E4N A;  1KGX A;  4CUC A;  1GOM A;  2X05 A;  3MS8 A;  1H5V A;  2ZWY A;  3WDQ A;  1WDR A;  2WW5 A;  4AZC A;  3WNN A;  4W8L A;  1XCW A;  1G5A A;  1UH2 A;  2EPK X;  4OOU A;  4PMO A;  4PEE A;  1V6U A;  2WAG A;  2D0G A;  1BYA A;  2X0Y A;  3WQV A;  3VGH A;  4P7N A;  3PZM A;  2J74 A;  1BVN P;  1H3G A;  1MW0 A;  1KXT A;  3LPF A;  4PMD A;  3ZM8 A;  1M01 A;  1J10 A;  2VJX A;  1K6A A;  5JIP A;  5C71 A;  5A3H A;  5D9P A;  2BXY A;  4U2Y A;  3AYR A;  1JDA A;  3VUP A;  3CHC A;  4NI3 A;  1U30 A;  2IXV A;  1XGZ A;  2VRJ A;  5D4Y A;  4MB5 A;  4TXE A;  4UFJ A;  4NRR A;  3AS3 A;  4U3C A;  1J0K A;  3G6L A;  3K8L A;  2DSZ A;  1H0G A;  4U31 A;  4U3A A;  4YPJ A;  1BLI A;  4PTX A;  4DUV A;  5AY7 A;  4GZE A;  2GFT A;  3WMB A;  1UUQ A;  4AWE A;  1JYX A;  1J0H A;  1KBB A;  1QI3 A;  1SR0 A;  4E8C A;  3PZQ A;  3FXY A;  3L4W A;  3CZ8 A;  1V08 A;  1UR4 A;  3WL0 A;  1JI2 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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