3AHZA

Crystal structure of beta-glucosidase from termite neotermes koshunensis in complex with tris
Total Genus 196
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
196
sequence length
472
structure length
472
Chain Sequence
TVYTFPDEFKLGAATASYQIEGAWDENGKGPNIWDTLTHEHPDYVVDGATGDIADDSYHLYKEDVKILKELGAQVYRFSISWARVLPEGHDNIVNQDGIDYYNNLINELLANGIEPMVTMYHWDLPQALQDLGGWPNLVLAKYSENYARVLFKNFGDRVKLWLTFNEPLTFMDGYASEIGMAPSINTPGIGDYLAAHTVIHAHARIYHLYDQEFRAEQGGKVGISLNINWCEPATNSAEDRASCENYQQFNLGLYAHPIFTEEGDYPAVLKDRVSRNSADEGYTDSRLPQFTAEEVEYIRGTHDFLGINFYTALLGKSGVEGYEPSRYRDSGVILTQDAAWPISASSWLKVVPWGFRKELNWIKNEYNNPPVFITENGFSDYGGLNDTGRVHYYTEHLKEMLKAIHEDGVNVIGYTAWSLMDNFEWLRGYSEKFGIYAVDFEDPARPRIPKESAKVLAEIMNTRKIPERFRD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural and functional analysis of three beta-glucosidases from bacterium Clostridium cellulovorans, fungus Trichoderma reesei and termite Neotermes koshunensis
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Neotermes koshunensis
molecule keywords Beta-glucosidase
total genus 196
structure length 472
sequence length 472
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 2010-05-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3ahzA00
1GUVA 1MW0A 4JFVA 3K4DA 2DSZA 4AZBA 1OWQA 3I3EA 4EANA 3UETA 4M82A 1Z32X 3II1A 2GJXA 5E6ZA 2VZSA 3BC9A 3VINA 1QI2A 2AMGA 2WBKA 3VIIA 5FCZA 3HMCA 1X6LA 3PZNA 1U2YA 3HN3A 3AHYA 4GO9A 1C3FA 3SUVA 4GIAA 5DT7A 4W5UA 3WH6A 1CXLA 1VB9A 1PIGA 1FA2A 1FFQA 1XSKA 1UKOA 2G3MA 3IAQA 2W5FA 3VIOA 4PUEA 4GPNA 2V3DA 3CH9A 1P6WA 1LLOA 2BY2A 2JEPA 1W9UA 2YL8A 1ISZA 4WSKA 2CBVA 3FAWA 4OBSA 3VD5A 1EO5A 1XCWA 5A69A 1RH9A 3GXDA 4DUWA 4UZSA 5I23A 2W91A 1NM9A 5C8BB 1NH6A 2OWCA 3GH4A 4Z2GA 4M1RA 1E4MM 4TTGA 4QAWA 1FP9A 1UR4A 3AYSA 3F5LA 1C8YA 1OSEA 4P8VA 3SURA 1NOWA 1UA3A 3WQWA 2W66A 1H09A 2D3LA 2XVLA 1ZBKA 1H5VA 4CVWA 3JUGA 3DYPA 3FNDA 1MFVA 3L2LA 2Y2WA 3J7HA 5A2AA 2E9BA 4S3KA 1J0HA 1W9DM 2FDMA 1BPLB 1HT6A 4ATDA 5C70A 1QI3A 3CTTA 1H0IA 2GUYA 1E6ZA 1UOKA 1W1PA 5C71A 4CCEA 3ARXA 2XM1A 1PX4A 3SCVA 1CWYA 1XYFA 4LQ1A 4AY1A 3NUKA 3BAWA 2ZX7A 2VZVA 1BAGA 4A3HA 1J0JA 3QOKA 1ODUA 1Q6EA 1EIBA 1R7AA 4P8UA 1PIFA 1W9PA 1BSIA 4D6HA 3L4XA 3RMEA 4UZUA 4J3VA 1HN1A 1CLVA 1UR2A 4NI3A 1XH0A 4AZGA 4WSJA 1JAKA 4JCLA 4UOJA 1XH1A 3A4XA 1DWJM 2WLYA 4ATWA 3HJEA 3VDHA 3WH5A 3ARWA 5A6BA 1BGGA 4PMYA 4CD8A 5AYIA 3UESA 4JL2A 2VX5A 2TAAA 1CIUA 3MUZ1 2YKKA 2UY3A 3OLDA 1ISWA 1CEOA 3KL0A 3IAPA 3LPGA 2VI0A 4DUVA 4Q7NA 2YL5A 1RD6A 1RPKA 2XVPA 4WJXA 3NSMA 4EKJA 1K9EA 3CUGA 3ZO9A 4QDMA 3T2OA 3WBEA 4H2CA 5A1AA 5BRQA 2V3FA 3QHOA 1C90A 1KFWA 1E1FA 1DWFM 1CNVA 5FOOA 2EBNA 1G01A 4J28A 1OD0A 4AZCA 2BNJA 2WMGA 2QF8A 3GXIA 3ARZA 3IANA 3CZLA 2PWDA 1BF2A 1UH2A 4JKKA 5GPRA 2CIPA 4HMCA 4YHEA 4HOWA 2E8YA 4B9YA 4AW7A 2C0HA 1UWSA 4MDOA 1XC6A 1QNRA 5LA1A 3VNZA 4HP5A 1QW8A 2C8NA 5E70A 1HF6A 4HA3A 1ISXA 2PI6A 3PTQA 4MB3A 4W8BA 1KGUA 4U33A 2GK1B 4PMVA 2WMJA 1UKSA 5A8QA 5I5RA 1MW3A 2D0GA 1SMAA 1CXHA 4AYSA 1UG6A 4XV0A 1GW1A 2ZXQA 2ESCA 1GJWA 4HTYA 3M07A 5A6KA 2D0HA 4Q22A 4ATLA 1E6NA 3VD7A 1HP4A 3GBDA 3ZSTA 4RE2A 3KEHA 1W3JA 2FHFA 1EQPA 2X1IA 3VTRA 1A47A 4F79A 4AD0A 1IZJA 2EPLX 1QNOA 4U3AA 4P7QA 2VZUA 3VNYA 3FHQA 4WF7A 2D0FA 9CGTA 5BXTA 4H04A 2ZXBA 3KZSA 1C91A 4D6JA 4JFSA 1GVIA 1JNEA 2ZUMA 3W27A 4S3JA 4TXEA 2ZUWA 3WENA 4HU8A 4DWSA 2QLYA 4GI9A 2XUCA 1MWOA 1K9FA 1KB3A 1UUQA 1OGSA 4QCFA 1H4PA 2BVTA 2OYMA 4AZIA 2V3EA 1SFSA 2VCAA 4E2OA 2YBTA 4UNIA 1V3HA 3WEMA 3BLPX 3GNRA 3KL5A 1J10A 2Y8KA 1LJYA 1V3KA 1DWIM 3EDDA 4D71A 3K4AA 3VD9A 2EPOA 2YLAA 4FLRA 1CENA 4F66A 1GORA 1JL8A 1EHNA 1EDTA 4B16A 2VC9A 3WF3A 4DWSB 2WHLA 3F5KA 3VGDA 1H0GA 4B9ZA 1OB0A 4L4PA 3UERA 2CESA 1JG9A 2GJRA 4XZWA 1UD6A 3ZM8A 2O9TA 4WKFA 4DUXA 1E5NA 3WMBA 3W0KA 1NARA 1TVNA 2X0HA 4AZHA 5GNYA 4PCSA 4C7FA 3WDJA 2QPUA 4J3SA 2CERA 5A6LA 5ABEA 3ZT7A 3SEPA 2XTKA 1I1XA 4D6GA 4MJ4A 4CCDA 3FW6A 1US2A 1GOMA 1WO2A 5A8PA 1KQYA 5D9NA 1F4AA 1VAHA 4CCCA 3B9AA 2J7HA 4PMDA 4CD6A 3BAIA 3WUBA 1L8NA 4KMQA 2DQXA 1M04A 1NP0A 2YLLA 3AZSA 2WMIB 3UG5A 5CSUA 3EBVA 3SCSA 2WVVB 1KCLA 2RGLA 4MAZA 1KR1A 1VIWA 2BXYA 1LG1A 2J79A 4JFTA 1JFXA 1EH9A 2FGZA 2WWDA 4KRUA 3VIGA 3CMGA 5E09A 5D9MA 3OIHA 1B3VA 3CO4A 4UFLA 3PN8A 4AWEA 3AXXA 2G3NA 1CLXA 3UR8A 2WB5A 1UHVA 2YA1A 1B3XA 3A47A 4UQDA 1WB0A 3BGAA 1GOWA 1BLIA 2EPNA 3AMLA 5BYWA 4CUCA 1E56A 3W53A 1QNPA 3MANA 2XGIA 1J11A 1UKQA 4TVUA 3QGVA 2QMKA 7CGTA 2VX7A 2ZIDA 1VJSA 1CGYA 2X09A 1OCQA 3EMQA 1M53A 4MADA 3WFLA 5A3HA 3IK2A 4OZOA 2F8QA 1BGAA 2D22A 3MMWA 3EDJA 5GNZA 1BTCA 1E71M 1BYBA 1HVQA 4CD7A 2DGAA 3ARVA 3AZTA 1XYZA 2J7DA 2Y4SA 4HA4A 1GZJA 1A3HA 1J12A 4FLOA 1V6UA 3SCTA 3VD3A 1UR1A 1I75A 5GQBA 1JGIA 1NWUA 1Q6GA 3AMKA 3QOMA 1EQCA 3UG4A 2VZTA 1J9YA 3CMJA 5IHRA 2IUZA 1QW9A 3W81A 2DT3A 4QCEA 4PTWA 4AD3A 1CBGA 1NWTA 1UD5A 3BMVA 4PMRA 1B3YA 4BCEA 1R8LA 1G0CA 1H2JA 1XH2A 2XHYA 5FKYA 2ZX9A 1TE1A 1UZ4A 2VMFA 7A3HA 2V3GA 4GI8A 1ZU8A 4WKHA 1EO7A 1LWHA 4KGJA 2CKSA 4AD5A 3WNMA 2X8RA 1QBAA 4GI6A 3SUUA 3M6DA 2CKRA 3EDEA 1S46A 1WE5A 2BXZA 1WPCA 1WP6A 3NYDA 3RCNA 3A4AA 3ARYA 2UY2A 3LMYA 4W88A 4ML4A 3PZUA 2XFFA 2F61A 3CHCA 1C8QA 3WDIA 3T2QA 3W37A 4OUEA 3T08A 2E0PA 2CHOA 2ZX5A 4TX8A 1TFVA 3ZSSA 1V08A 3RM8A 2ZWZA 1BG9A 2GSJA 2QV4A 1V3MA 4ZE4A 4FMVA 4NRRA 3KWXA 2EJ1A 1GOQA 4MB4A 4HMEA 1GQJA 6TAAA 3BAYA 5EMYA 1CECA 5CSYA 1DTUA 1CGVA 3WQ8A 1W91A 3UEQA 3ZR5A 3GNOA 4EE9A 1UR8A 3D3AA 1GOIA 2CCRA 4FF5A 3OGRA 1V0MA 2PWEA 1K9TA 4PCTA 5I78A 1BVNP 4W8AA 3ZT5A 1KWGA 3VMOA 5A95A 4YHGA 4WIWA 2XSBA 3TP4A 5I2UA 1DWAM 1E0WA 4RE3A 4MTVA 1RP8A 8A3HA 1B9ZA 2CEQA 3QHNA 3MSGA 4H7VA 2Y8VA 3L4TA 2BY3A 1V0NA 2VRQA 2GJXB 2JFEX 1JDCA 2XJ7A 1E0VA 1GQKA 1E5JA 2GJPA 4W7VA 1W9VA 2GVYA 1UR9A 1TUXA 3K8MA 5CXPA 1FH8A 1VFMA 2WXDM 5A2BA 5A8OA 1BQCA 3TOPA 4Y7EA 3A4WA 1EA9C 2DPEA 4P7LA 3N1AA 1PX8A 3WNNA 4EK7A 1L0PA 5ABFA 4BQ3A 4BF7A 4NZCA 4YN5A 3WSUA 3WF0A 5BROA 5D8WA 3BAJA 1M7XA 4URIA 4ZENA 1PZ3A 2VRKA 4PMUA 1FP8A 1VJZA 2X2YA 3O2LA 4LYQA 1XCXA 2WHMA 2WHKA 3CUIA 1GPFA 4JZ5A 4HZ8A 1ESWA 4UFIA 4C7GA 5D9PA 1HJWA 3CUFA 5KEZA 5M17A 1KGWA 2XYLA 1CDGA 4AIEA 4UOQA 4D6CA 2CBIA 1VEPA 1DHKA 4DWSD 2XM2A 3SCRA 2JF6A 2DDXA 3WH7A 2W67A 4W89A 3WUEA 2FHBA 1PZ2A 4J3WA 3AZRA 3SCUA 3WFZA 1CYGA 2VQTA 1HIZA 2O9PA 2CETA 5JBDA 1C7TA 2PBOA 5CPTA 1LL7A 4M24A 1E43A 3AICA 2OYKA 4PMNA 1H49A 3VMNA 3CHFA 4KRTA 2XVNA 4K68A 3AYRA 4PN2A 1WDQA 1JF5A 3BXWA 2AAAA 1G5AA 4JKMA 5E0CA 4AD4A 1ISYA 1N82A 1NOUA 4W7UA 5IXEA 3MV01 4MB5A 1E4NA 1GJUA 1VFUA 2WZIA 1CGTA 3PZIA 4OOZA 3KL3A 1Q4NX 3N9KA 3TONA 3ARPA 1TZ7A 2JIWA 1UH4A 3CPUA 3CZGA 4MNKA 3K46A 1EDQA 4J7RA 1UD3A 1OD8A 1W2PA 4U2ZA 1TMQA 1WDPA 4GQRA 1CGWA 1GVYA 1DP0A 4X9YA 1V0KA 4HPGA 4XUYA 2W63A 3KE0A 1J0IA 3VIJA 4OJYA 4PMOA 3WQVA 3NIYA 2BV9A 4RE4A 3PHAA 1IZKA 2CXGA 1TA3A 2BHZA 3I3BA 1EXPA 3SCNA 1F4HA 2BVDA 1J0ZA 1E6QM 1W2VA 2BY1A 1SMDA 2WCGA 3EYPA 3L2MA 4ZFMA 1E3ZA 4BQ4A 3W26A 4MDPA 5CLTA 1I1WA 4MAVA 3POHA 1JF6A 2XWDA 4AEFA 1WDSA 4R27A 4E8CA 1TG7A 3L4VA 1UWTA 2YL6A 4AZCB 3M46A 2O9RA 4P7OA 2WSPA 4IPNB 1ZS2A 3MS8A 1JYWA 3VDCA 3AS1A 3M7SA 1CGXA 2Z1KA 2BS9A 3DHUA 3A3HA 4W8LA 1UD2A 3OG2A 2Q8XA 3CIVA 2J25A 1WDRA 3K1DA 3W29A 1QNQA 2D23A 1KWKA 5BXPA 1E15A 5A8NA 3PBGA 5I0DA 3ZJ7A 1BYDA 4ACYA 1TVPA 2FH8A 2PB1A 3AXIA 1W3LA 4AZ5A 3AIBA 2CBJA 2XFRA 2PWFA 2XVGA 2WMKA 4XX6A 2AOSA 5CLWA 2VCCA 1R7OA 4IPLA 4TTUA 3WEZA 1WZAA 3DYOA 3AIEA 3AIQA 4UQBA 5LA0A 3UR7A 1V02E 1E6XM 2ZUUA 3GZAA 1J18A 1OGBA 3RM4A 3VO0A 3AJ7A 3L4ZA 3UG3A 1U33A 1HJVA 2BVYA 2J75A 1VRXA 2J7GA 1WZKA 1QI4A 1YHTA 2G3JA 3MKKA 4GXPA 1W32A 3WBAA 1Q6CA 5DO8A 3TA9A 4UFMA 4PBGA 1UWIA 3FN9A 1FFRA 1JZ5A 1C8XA 2XPKA 5I79A 2EQDA 1U30A 1QPKA 4ZXOA 1VBRA 4R5EA 4M81A 4D6IA 3VX0A 2WYSA 2DSUA 4Z2JA 3RJXA 3F5JA 1KGXA 4X0VA 5A94A 3OGSA 3RIKA 5CJ5A 2XWEA 3PZQA 5ECUA 1M01A 1LQ0A 3WD0A 4P7NA 4HU0A 1ZJBA 1ZBVA 3EMCA 4ZXLA 3GXFA 3OB8A 1ODZA 1ZL1A 1EOKA 1UA7A 5D9OA 3DYMA 1ZBWA 3WNLA 2VURA 2J77A 3WNPA 4HZ7A 3T0DA 3AISA 5I6SA 5M03A 3W6MA 4LX4A 1EDGA 2YDQA 1X1NA 4UCFA 2CPUA 4A3YA 3CGTA 7TAAA 4UFJA 4CD5A 3L4YA 3EDFA 2WC3A 1EHAA 1XD1A 3WEOA 3WL1A 2D1ZA 3CUHA 3U5YA 2OLHA 2VL4A 4E8DA 4LXFA 2ZX6A 1JD9A 1HXJA 1HJSA 2A3EA 4PSRA 4QLJA 1O7AA 5DF0A 1ZB5A 1QHZA 4UQCA 3D5HA 4UFHA 4F9JA 5JBEA 3SCOA 3CZ8A 3GTNA 1KXHA 2HISA 3OA5A 4AZ6A 2XSAA 3VU2A 5M5DA 3BMWA 3PZMA 4UOZA 4ACZA 2DIEA 3ZQ9A 3O9NA 2VX6A 1NQ6A 3WH9A 4IUGA 4HZ6A 4OOUA 3VMPA 1H41A 2J78A 1CXEA 1XHGA 2W92A 3FAXA 1KXTA 2WPGA 4X0NA 1FH9A 1PJ9A 2NT0A 3SUSA 3BAXA 3ECQA 4CU6A 3RDKA 5CPSA 1UKPA 3PZOA 3GH5A 6A3HA 1MW1A 3BCFA 1E6RA 3MUAA 4TUFA 4AD2A 3A6OA 1BYCA 2ZUVA 2ZUSA 4V2XA 3W6LA 1HKKA 3DHPA 4AZ7A 1H11A 2WNWA 2WZHA 2XIIA 3ZJKA 3N13A 2ZE0A 3L4WA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1GUV A;  1MW0 A;  4JFV A;  3K4D A;  2DSZ A;  4AZB A;  1OWQ A;  3I3E A;  4EAN A;  3UET A;  4M82 A;  1Z32 X;  3II1 A;  2GJX A;  5E6Z A;  2VZS A;  3BC9 A;  3VIN A;  1QI2 A;  2AMG A;  2WBK A;  3VII A;  5FCZ A;  3HMC A;  1X6L A;  3PZN A;  1U2Y A;  3HN3 A;  3AHY A;  4GO9 A;  1C3F A;  3SUV A;  4GIA A;  5DT7 A;  4W5U A;  3WH6 A;  1CXL A;  1VB9 A;  1PIG A;  1FA2 A;  1FFQ A;  1XSK A;  1UKO A;  2G3M A;  3IAQ A;  2W5F A;  3VIO A;  4PUE A;  4GPN A;  2V3D A;  3CH9 A;  1P6W A;  1LLO A;  2BY2 A;  2JEP A;  1W9U A;  2YL8 A;  1ISZ A;  4WSK A;  2CBV A;  3FAW A;  4OBS A;  3VD5 A;  1EO5 A;  1XCW A;  5A69 A;  1RH9 A;  3GXD A;  4DUW A;  4UZS A;  5I23 A;  2W91 A;  1NM9 A;  5C8B B;  1NH6 A;  2OWC A;  3GH4 A;  4Z2G A;  4M1R A;  1E4M M;  4TTG A;  4QAW A;  1FP9 A;  1UR4 A;  3AYS A;  3F5L A;  1C8Y A;  1OSE A;  4P8V A;  3SUR A;  1NOW A;  1UA3 A;  3WQW A;  2W66 A;  1H09 A;  2D3L A;  2XVL A;  1ZBK A;  1H5V A;  4CVW A;  3JUG A;  3DYP A;  3FND A;  1MFV A;  3L2L A;  2Y2W A;  3J7H A;  5A2A A;  2E9B A;  4S3K A;  1J0H A;  1W9D M; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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