3AIQA

Crystal structure of beta-glucosidase in wheat complexed with an aglycone dimboa
Total Genus 185
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
185
sequence length
491
structure length
491
Chain Sequence
GPVFTKLKPWQIPKRDWFDKDFLFGASTSAYQIEGAWNEDGKGPSTWDHFCHTYPERISDMTNGDVAANSYHLYEEDVKALKDMGMKVYRFSISWSRILPDGTGKVNQAGIDYYNKLINSLIDNDIVPYVTIWHWDTPQALEDKYGGFLNRQIVDDYKQFAEVCFKNFGDRVKNWFTFNEPHTYCCFSYGEGIHAPGRCSPGMDCAVPEGDSLREPYTAGHHILLAHAEAVQLFKARYNMHGDSKIGMAFDVMGYEPYQDSFLDDQARERSIDYNMGWFLEPVVRGDYPFSMRSLIGDRLPMFTKEEQEKLASSCDIMGLNYYTSRFSKHVDMSPDFTPTLNTDDAYASSETTGSDGNDIGPITGTYWIYMYPKGLTDLLLIMKEKYGNPPVFITENGIADVEGDESMPDPLDDWKRLDYLQRHISAVKDAIDQGADVRGHFTWGLIDNFEWSLGYSSRFGLVYIDKNDGNKRKLKKSAKWFSKFNSVPKP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Active-site architecture of benzoxazinone-glucoside beta-D-glucosidases in Triticeae
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Triticum aestivum
molecule keywords Beta-glucosidase
total genus 185
structure length 491
sequence length 491
ec nomenclature ec 3.2.1.182: 4-hydroxy-7-methoxy-3-oxo-3,4-dihydro-2H-1,4-benzoxazin-2-yl glucoside
pdb deposition date 2010-05-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3aiqA00
4MNLA 4KGJA 1CGYA 4FF5A 3KEHA 1JAEA 5IFTA 3EMCA 2WMKA 2JFEX 3SUVA 4CU8A 2VJXA 3RILA 1PX4A 4HA4A 1ITXA 4GZIA 3FY1A 4D6IA 1VEOA 3L4YA 2WMFA 4H8HA 4TTUA 1XD1A 4H41A 1OSEA 2OYKA 1E6SM 4HOZA 3TTSA 2BY1A 4UQBA 2XM1A 4E8DA 4W5ZA 2XGBA 3L4TA 3WEOA 1QHPA 1JFXA 2PB1A 1XSKA 1CGTA 3B9DA 3O9NA 4MTVA 5C71A 5EFDA 1NM9A 1E70M 3AIBA 1QNOA 5EFFA 4XV0A 2VL4A 4P8UA 1GNXA 2A3EA 2BS9A 2XG9A 3OLGA 3U57A 1J0JA 5BROA 1WNOA 3K8KA 1SFSA 3N9KA 1CXKA 5I0DA 1L8NA 3ARWA 2J8GA 3ZR6A 4BZYA 2J62A 3AJ7A 3AYRA 4MB3A 2FGZA 3K46A 3K1DA 2ZUVA 1FHDA 3MS8A 2ZUTA 5ABHA 4KWUA 3ZR5A 4MPKA 4W7UA 3VD7A 4IPNB 2IXUA 3A4WA 5JIWA 1TA3A 5CSYA 3ZIZA 4DWSB 2WAGA 1CGVA 5M03A 3SCRA 1MWOA 2CITA 2NT0A 2WMGA 3CGTA 2YBTA 2J7CA 3WBAA 1ISXA 1CPUA 2IUZA 2QMKA 4HA1A 1WDSA 2WHJA 3VIFA 3WH9A 4WIWA 3WL1A 4PMZA 5A1AA 3IK2A 1W1PA 5A6MA 1NQ6A 4H8VA 3U5YA 1MFVA 4JFTA 1L0PA 3CUIA 5AY7A 1LQ0A 4HU0A 1Y7VA 4HTYA 2D23A 1E5JA 1U30A 3WMBA 2D1ZA 4FLRA 2VX7A 1BFNA 5D8WA 4TTGA 3NDYA 3SURA 1FFRA 5E70A 3OG2A 3NCOA 3HU7A 2GJXB 4D1JA 1JYNA 4J3VA 1GJUA 1AQMA 2DH3A 3ZJ7A 1R7AA 4TVDA 4IM4A 2OWCA 3M46A 5E9AA 4MAVA 1NOFA 2FHBA 5BXRA 4CD5A 1WDRA 3BSHA 5A6SA 3MUY1 1CXEA 3VMNA 1HJUA 2Z1SA 1DWGM 3UEQA 3AROA 3QGVA 4XUYA 5DEZA 4CUCA 5ABGA 4AISA 2E8YA 3F5KA 5A2BA 3BC9A 2XPKA 4M81A 1OB0A 2FHCA 4WF7A 1PZ3A 2WCGA 2WKLA 3SUWA 4D6EA 1B30A 3VIPA 4N42A 2WPGA 4UOZA 1P6WA 1M03A 4UCFA 1E1FA 4MNKA 2CPUA 4JZ5A 4MNJA 1GW1A 2Z1KA 1GOOA 4GPNA 5AC5A 1FP9A 3PBGA 1E55A 5CG0A 1UUQA 3GBDA 5FOOA 3GNRA 1CXFA 2C0HA 2EQDA 1VJSA 1GOKA 4XZBA 2J78A 2YKKA 1OIFA 4PUEA 2XVLA 1HX0A 4ZE5A 1HT6A 1V3KA 4PMUA 2YL6A 1VBRA 1C91A 2D20A 1AMYA 2DT1A 4UR9A 5I77A 1KWGA 5BWFA 2W92A 4UZUA 3OIHA 4QLKA 1JZ8A 1FH9A 2XVNA 2WVVB 4W7VA 3F5JA 2XGIA 4Z2HA 2ZUMA 1XH0A 2VX6A 2VZOA 5D4YA 2F2HA 3ZSSA 4P8XA 3IJ8A 5D9PA 1XD0A 3WF0A 1V02E 3VIHA 4LXFA 4Z2KA 2TAAA 1PIFA 3ZO9A 1E73M 1G01A 1QW8A 4KH2A 4V2XA 3SCOA 3WF3A 1CTNA 1KR1A 3VDAA 1BGGA 3WD1A 4CGTA 4JKLA 2WZHA 4AD4A 1FH7A 1QBAA 1PX3A 2DIJA 3DYMA 3VMOA 3FHQA 5EBAA 2NSXA 3W6LA 3PZMA 2VNCA 4AIEA 3BLPX 3AMDA 3GXIA 2W91A 5CLWA 1KFWA 3VGFA 1A47A 1U33A 3AHVA 1LL4A 1XH1A 1OGGA 3L2MA 3POHA 2J7HA 4KGLA 1GHSA 3WH5A 3VOCA 1V08A 4FK9A 1W3LA 3SCPA 3AMGA 5AYBA 3L4VA 2YBUA 2G41A 4W88A 1UWQA 3PZNA 1UD6A 2B31A 3WFLA 1VEPA 2VZTA 1QNQA 1H2JA 1ZL1A 2ZWYA 3GYCA 3VKKA 4ZXLA 3QOKA 4F9JA 4R27A 5JUVA 5I23A 3BGAA 2EPMX 2CBUA 4AC1X 2XSBA 4E2OA 4QAWA 4EK7A 1CZ1A 4YPJA 2JE8A 2WB5A 3M07A 4NRSA 9CGTA 1UR8A 4OJYA 2DEPA 2PWEA 1WZAA 5BXTA 1MYRA 2E3ZA 4W8BA 3WDPP 4CKQA 2RGLA 1E9LA 4AEEA 1UR2A 1UOKA 3A6OA 1F4AA 1UKOA 5LA2A 4M24A 4LYPA 2XM2A 3CUFA 1OCQA 2PWDA 3UR7A 5A6BA 2A3CA 1PZ2A 2X8RA 4MB5A 2JF7A 1HJXA 4ZEPA 4PSRA 1V0LA 1ODUA 2ZX5A 2CETA 4HMCA 3AI0A 1LL6A 3HN3A 1GQIA 4C7GA 2EPNA 2O9OA 3WQVA 1H1NA 5C70A 1B3YA 5KEZA 4J27A 1RP8A 4B3KA 5DT7A 3N18A 3WUFA 1K9DA 5CLTA 2CHOA 3PZUA 2V38A 2PC8A 4BQ5A 1ZBCA 3DECA 5AC4A 2WMHA 1M01A 1YHTA 1W9UA 2J4GA 3OB8A 1HJQA 4J3SA 3KL3A 2J7DA 1RH9A 1LLOA 4PRWA 5D9OA 2X0HA 1M04A 4TXEA 4CD8A 1CXHA 3AMCA 1QHOA 3NYDA 2OLHA 4J3UA 2F61A 4TOQA 4F8XA 2EXOA 4PMQA 1HKJA 1E6NA 3GNPA 3VD4A 1XCWA 1O6IA 3W37A 3RCNA 4U5KA 4KMQA 3GXFA 4RE4A 3VX0A 2D24A 4M82A 3ZQ9A 4UQDA 2YA1A 4J3TA 1CGWA 3MMUA 5I2UA 3DHPA 5ABFB 4ATLA 4YHEA 2X1IA 2D3LA 2W4XA 4PEEA 2CEQA 3F4VA 1CIUA 2BXYA 3WDIA 1HL9A 3ZJ6A 4S3JA 3WNKA 1UZ4A 3WNOA 1C8XA 1N82A 2HVMA 3AQUA 1AQHA 3CHEA 2NT1A 2MANA 3MO4A 1J10A 3KZSA 1VRXA 4QLLA 4PTVA 1QI5A 3NSMA 3CUGA 2VRQA 3MSDA 2BVDA 2WANA 4R5EA 1GOMA 1MW0A 4RE2A 5A8OA 5M5DA 2QMJA 3EDJA 3CPUA 5CQ1A 4WKHA 3PTQA 3CZGA 2YA0A 1B31A 1CLVA 1VFFA 1IZKA 3AS0A 3QOMA 4EANA 1NH6A 4UFIA 2X0YA 5D9MA 1MXDA 1G9HA 2UY4A 3ZMRA 1JZ3A 3KL5A 3O6AA 5FD0A 1JIBA 1G1YA 1TG7A 1NOUA 2XFFA 5C8BB 1B2YA 3VGHA 2WVTA 2YDQA 2FGLA 5BRPA 2YIHA 4UTFA 3AISA 4ZENA 1S46A 1K6AA 2ZX7A 2XJ7A 5A8MA 1NP2A 2GFTA 3VIJA 2WHMA 1CLXA 7A3HA 2E9MA 4GZEA 1UHVA 3WD0A 5TD4A 5ABEA 4Q22A 1ZJAA 1GOQA 3N15A 1X6NA 4P8WA 5BXSA 2O9TA 4Q7NA 1B3ZA 4A3HA 5FCZA 3D5HA 1JDCA 1HJSA 3EDFA 3WQWA 1J01A 3CBWA 1TVPA 3T09A 1ZU8A 1XCXA 1XHGA 3SCNA 3CZJA 4GXPA 1K9TA 1KXVA 1C7SA 2DH2A 3I3BA 4PMVA 2BHUA 3SCUA 2PWGA 5E0CA 4DWSD 4E8CA 1XGZA 1BQCA 1HN1A 3WF1A 1HP5A 4ZFMA 3ARVA 5IHSA 3BAJA 4C7FA 3WELA 2V3GA 3ARXA 3I3EA 4CD7A 2PBGA 4GQRA 3PZQA 1US3A 1PBGA 3ARRA 1HJWA 2VZVA 3M7SA 1PX8A 4U5IA 4DUWA 2BY0A 1B1YA 1BAGA 4FMVA 4JHOA 3MMWA 1IZJA 2ZUUA 1OD8A 5BRQA 1JI2A 4IPLA 1E71M 3S2CA 1I1WA 2BVTA 2ZXBA 1KGWA 4ZXOA 1D3CA 3GH4A 3EDEA 2J7GA 3K8LA 2FH8A 3VM7A 4AZ6A 4D72A 3WENA 3UG3A 4M8UA 1MXGA 1Q4NX 1TMQA 3NJ3A 1BPLB 3RJXA 3B9AA 1UR4A 5JBDA 1UZ1A 1BG9A 4GO8A 5A94A 3ALGA 5GPRA 1HJVA 3VNYA 1A3HA 3BAKA 1QI2A 3I3DA 1RP9A 4MJ4A 2YL9A 4TVCA 3OLEA 4PCSA 3K4DA 2VQUA 3PZOA 4BQ2A 3U7VA 4AD0A 4J7RA 3N17A 2BNJA 2D0FA 3AS2A 1OWQA 3MV11 2VC9A 1BYCA 2PI6A 2IXVA 5I5RA 3L4WA 3W6MA 4BS0A 3NDZA 3U5UA 4MJ2A 2BHYA 3W28A 1VENA 1E0WA 4HZ7A 1GJWA 3FXYA 1J0ZA 1EOKA 2ZOXA 3VD3A 3WQ5A 1KBKA 1GONA 4AZIA 4XX6A 2ZXAA 3CLWA 4TX8A 1VB9A 4UQAA 2ZX9A 4H04A 4H2CA 1W9PA 3VD5A 3VNZA 1SR0A 2E8ZA 2J7BA 3ECQA 4OIFA 4AZBA 1TA3B 1GQJA 2CXGA 1BYDA 2ZX8A 1H09A 1V0MA 4CVWA 3SCVA 1W32A 4M1RA 1W3HA 3RPMA 4AYSA 4N0RA 4PMXA 1ZS2A 4QFUA 2OWWA 4B9YA 4MNMA 4CVUA 1R7OA 2VVSA 1VF8A 1W3KA 2CNCA 3WD3A 1V3MA 3WUBA 1UKQA 1JNDA 4UQCA 1V0NA 1JXKA 5I6SA 3D3AA 1K9FA 1M53A 1C93A 5JIPA 3CUHA 2Y4SA 1DTUA 1UA3A 3UG5A 1WKYA 3RIKA 4M80A 1JYWA 1BLIA 4OUEA 3SCSA 5GNZA 1CNVA 2Y5EA 5A6JA 1KXQA 4IUGA 4UFJA 3SCWA 3W0KA 2EPOA 4LGXA 5HPCA 4OBSA 1FH8A 3LPPA 1OM0A 3IANA 4Z2IA 4NZCA 3MANA 2G3IA 3A3HA 3W81A 3ZT7A 4BQ4A 5A8NA 4JFWA 3W38A 4DUXA 3GZAA 5FL0A 1UD5A 4QCEA 4EE9A 1CEOA 5LA1A 1GVYA 5CGMA 2VCCA 3VIOA 1UD8A 1WDQA 3VGEA 3EDDA 1UWIA 1BVZA 1UKTA 1OGBA 2PBOA 4U33A 5I3DA 2YLAA 1JG9A 2WHLA 2ZUNA 3RDKA 1NWTA 4S3KA 1MW2A 3GDBA 4D6DA 2CYGA 3AIQA 3VIMA 1PEZA 2VT0A 5CZKA 1LG2A 1HNYA 4GI8A 1ISVA 4BCEA 2YDSA 4UFMA 3WH8A 3N13A 1PJ9A 1HKKA 3AIRA 2YDRA 3FW6A 4HZ6A 1TFVA 2J77A 4CCDA 2WZEA 2XTKA 2J47A 1AQ0A 4FLSA 2XWDA 1RD6A 1OD0A 4W8AA 2VURA 2WBGA 3WF2A 4CCEA 5DFAA 2WM0A 1BGAA 5HOSA 1SYTA 1UWTA 3ARSA 1LJYA 4AIUA 2YOCA 2XFYA 2BFGA 3VGDA 1E6ZA 2OYMA 3AMKA 1EA9C 1UYQA 3OLDA 1MW3A 4P7OA 5CGTA 3UESA 5A8PA 3ZOAA 2O92A 3AICA 2X09A 2D0GA 1G94A 3J7HA 1R86A 2WKGA 1D7FA 3UG4A 2YL5A 4UNIA 1GCYA 4Z2JA 2E0PA 1KBBA 2GJRA 4HOXA 2DQXA 2V5CA 3NUKA 4U3AA 4UZSA 4P7LA 3NSXA 3OGRA 5ECUA 2V5DA 5HNNA 3CZKA 4ATWA 4W85A 5A6BD 4PTXA 3GH5A 2J7EA 2VVNA 2HISA 3U7BA 2WSKA 3T2PA 3OLIA 5LYRA 1B90A 1JZ5A 1J0HA 1MFUA 3W25A 4YHGA 1EH9A 3BH4A 2D2OA 5LA0A 1Q6CA 1E6PA 2EEXA 1C92A 3T0AA 1TUXA 3L4XA 4WJXA 4ACZA 2WLZA 1E3ZA 1H11A 4Z2GA 3BCFA 4U3CA 2J7FA 5HDRA 3PTMA 3MU7A 2DT3A 2WMIA 1LWHA 1W9DM 4W5UA 2JEPA 2ZE0A 1NWSA 4HU8A 4NI3A 1W9VA 3WNNA 4AEFA 1GQKA 4CN4A 3SCTA 1H4PA 3BLKA 3GH7A 2BY2A 2DDXA 7CGTA 4PTMA 3BAXA 1C8QA 1J0KA 2ZUWA 3WH6A 1DWFM 1K9EA 1UQYA 3GXMA 4PMNA 1VFOA 3AZTA 4P7NA 3WMSA 4HMEA 2VRKA 4JKMA 4AZCA 5DF0A 1DWIM 1VEMA 1UWSA 1NOWA 1XYZA 4CN1A 3GBEA 3K4AA 3ARYA 4CD4A 3MV01 3L4ZA 2Y8KA 2QPSA 3QHOA 3RM9A 1PIGA 3UR8A 4NRRA 1E4NA 2WLYA 1JAKA 4D6HA 2J75A 5DMYA 2C8NA 2Y24A 1KB3A 3WQ4A 3EYPA 4TX6A 3IJ9A 4XB3A 3MUIA 2BVYA 3CO4A 3WMCA 1CDGA 1D2KA 2UY3A 1EQPA 3VTRA 2J8FA 4FLOA 3ZT6A 4JCMA 1VAHA 4AZCB 1E5NA 2GK1A 3VGBA 3TOPA 2VX5A 1JYVA 2WHKA 2WC3A 3WDQA 3QHNA 4ML4A 4B15A 1FHLA 4QCFA 1TZ7A 4DM1A 5CXPA 3EBVA 1R8LA 3PZ9A 1HKIA 2VZSA 2A3BA 1W1TA 3WDJA 1B9ZA 2FH6A 4OKDA 1EOMA 4U2ZA 2JEQA 3AYSA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4MNL A;  4KGJ A;  1CGY A;  4FF5 A;  3KEH A;  1JAE A;  5IFT A;  3EMC A;  2WMK A;  2JFE X;  3SUV A;  4CU8 A;  2VJX A;  3RIL A;  1PX4 A;  4HA4 A;  1ITX A;  4GZI A;  3FY1 A;  4D6I A;  1VEO A;  3L4Y A;  2WMF A;  4H8H A;  4TTU A;  1XD1 A;  4H41 A;  1OSE A;  2OYK A;  1E6S M;  4HOZ A;  3TTS A;  2BY1 A;  4UQB A;  2XM1 A;  4E8D A;  4W5Z A;  2XGB A;  3L4T A;  3WEO A;  1QHP A;  1JFX A;  2PB1 A;  1XSK A;  1CGT A;  3B9D A;  3O9N A;  4MTV A;  5C71 A;  5EFD A;  1NM9 A;  1E70 M;  3AIB A;  1QNO A;  5EFF A;  4XV0 A;  2VL4 A;  4P8U A;  1GNX A;  2A3E A;  2BS9 A;  2XG9 A;  3OLG A;  3U57 A;  1J0J A;  5BRO A;  1WNO A;  3K8K A;  1SFS A;  3N9K A;  1CXK A;  5I0D A;  1L8N A;  3ARW A;  2J8G A;  3ZR6 A;  4BZY A;  2J62 A;  3AJ7 A;  3AYR A;  4MB3 A;  2FGZ A;  3K46 A;  3K1D A;  2ZUV A;  1FHD A;  3MS8 A;  2ZUT A;  5ABH A;  4KWU A;  3ZR5 A;  4MPK A;  4W7U A;  3VD7 A;  4IPN B;  2IXU A;  3A4W A;  5JIW A;  1TA3 A;  5CSY A;  3ZIZ A;  4DWS B;  2WAG A;  1CGV A;  5M03 A;  3SCR A;  1MWO A;  2CIT A;  2NT0 A;  2WMG A;  3CGT A;  2YBT A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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