3AIQA

Crystal structure of beta-glucosidase in wheat complexed with an aglycone dimboa
Total Genus 185
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
185
sequence length
491
structure length
491
Chain Sequence
GPVFTKLKPWQIPKRDWFDKDFLFGASTSAYQIEGAWNEDGKGPSTWDHFCHTYPERISDMTNGDVAANSYHLYEEDVKALKDMGMKVYRFSISWSRILPDGTGKVNQAGIDYYNKLINSLIDNDIVPYVTIWHWDTPQALEDKYGGFLNRQIVDDYKQFAEVCFKNFGDRVKNWFTFNEPHTYCCFSYGEGIHAPGRCSPGMDCAVPEGDSLREPYTAGHHILLAHAEAVQLFKARYNMHGDSKIGMAFDVMGYEPYQDSFLDDQARERSIDYNMGWFLEPVVRGDYPFSMRSLIGDRLPMFTKEEQEKLASSCDIMGLNYYTSRFSKHVDMSPDFTPTLNTDDAYASSETTGSDGNDIGPITGTYWIYMYPKGLTDLLLIMKEKYGNPPVFITENGIADVEGDESMPDPLDDWKRLDYLQRHISAVKDAIDQGADVRGHFTWGLIDNFEWSLGYSSRFGLVYIDKNDGNKRKLKKSAKWFSKFNSVPKP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
molecule keywords Beta-glucosidase
publication title Active-site architecture of benzoxazinone-glucoside beta-D-glucosidases in Triticeae
pubmed doi rcsb
source organism Triticum aestivum
total genus 185
structure length 491
sequence length 491
ec nomenclature ec 3.2.1.182: 4-hydroxy-7-methoxy-3-oxo-3,4-dihydro-2H-1,4-benzoxazin-2-yl glucoside
pdb deposition date 2010-05-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3aiqA00
2V3GA 4LXFA 5ABFA 2OSWA 1C92A 2J4GA 4GZIA 3BAYA 3UCQA 1E6QM 1E3ZA 5D8ZA 1DWHM 3QHMA 4OZOA 1XGZA 1SMDA 1CEOA 4AZIA 1C90A 1E40A 1TR1A 1LLOA 2VVSA 1NOWA 5A6BD 1KFWA 5DT7A 4HMCA 1CGYA 1V6XA 2D20A 1PIGA 3SURA 5A95A 1HL8A 2DSUA 3PHAA 4H8UA 2O9RA 1MW2A 3LPFA 3W37A 3VTRA 1QVBA 4ML4A 1RH9A 2WKLA 4OOUA 4PMYA 1H2JA 1QOXA 4X0NA 4W5ZA 2YLLA 2XFRA 4HPGA 1H11A 3ZJKA 2YDSA 3WSUA 1FHLA 1GOOA 4JCMA 5A69A 1N82A 1YHTA 4JZ5A 1M53A 4V2XA 2F8QA 5C71A 4AD3A 4PSRA 4H8VA 1NP2A 2WMJA 3VUPA 3TONA 2Y8VA 4GI6A 3FN9A 1GOKA 2UWFA 3GDBA 1WDSA 3PZUA 1EO5A 2XGBA 1NM9A 1UHVA 2BFGA 2WW5A 2FHCA 1W32A 1OD0A 1LL6A 2OYMA 1MQQA 1LL4A 1PZ2A 1HL9A 2XIBA 1GPFA 2DSWA 2F2HA 4NRSA 3B9EA 2YL9A 3AZRA 1EQCA 2GK1A 1KBKA 1ITXA 4M24A 1B31A 5JBFA 3WD3A 4D72A 1J12A 3AS1A 2ZXDA 1FP8A 2DIEA 2VCAA 2FH6A 1JZ3A 5ABEA 1KXVA 1BGAA 1JD7A 4WSKA 2WLZA 2DH2A 1E4IA 1IT0A 3FXYA 4D6FA 1ZJAA 2WVVA 5HDRA 3RM4A 1UH2A 3LPPA 1E4LA 4PN2A 4AC1X 2YA0A 2WVSA 4ACZB 4JKKA 1GW1A 4X9YA 4DUXA 4AZBA 2GVYA 1DWIM 1LWHA 1OM0A 1TVNA 1FH9A 3MMDA 4AD1A 1UKQA 5JBDA 4LGXA 4N0RA 3RMEA 1W2VA 2CEQA 1BYCA 3G6MA 1V0NA 4UTFA 2ZX5A 2J8FA 1B2YA 2VCBA 3ARPA 1JNEA 3VMPA 4C7GA 7CGTA 2WWCA 1QW8A 3HU7A 2EQDA 3WBAA 5E70A 1QI3A 3FNDA 2CBVA 2EPKX 4QCEA 4F79A 3VIOA 1UD2A 1M01A 1PX3A 3I3BA 1DWGM 4W86A 1KGWA 1K9DA 2VZUA 5CG0A 4M80A 2CXGA 3VDAA 4Z2KA 1JDDA 1HT6A 2FGLA 1W9BM 2WMIA 3WFZA 5A3HA 5I77A 1C8QA 3WF1A 2D3LA 5ABFB 4DM1A 1I1WA 1PPIA 2PWGA 2GJRA 3U5YA 4JHZA 3FY1A 1CXFA 1CGVA 4U5KA 5AY7A 5AC5A 1C3FA 1M04A 4HMDA 1MW0A 2UY5A 3VDHA 3WEZA 3VIGA 3BC9A 1VB9A 1ZS2A 2WLYA 3SCTA 3ARRA 1TA3A 2XM2A 1AVAA 2OWCA 1W1VA 3GBDA 2ZX7A 3MS8A 1FP9A 4ZXLA 4WJXA 1E70M 1OT1A 1E0XA 4AZ5A 2CERA 3VIHA 1H1NA 3DHPA 4PUDA 3VVGA 4AD2A 2O9TA 2QPSA 5ECUA 2CBIA 5EB8A 4J3TA 1JDAA 1EH9A 2VRKA 3AHXA 3PZTA 4U31A 4CD7A 5I3DA 1H4PA 2BS9A 4LYPA 4NI3A 4WF7A 2VQTA 4BS0A 1V3HA 1UYQA 4QP0A 1XYZA 5D9NA 1SFSA 2E8ZA 3WD2A 5CGTA 4S3JA 1HJWA 1ZU8A 4Q22A 3ZO9A 2VOTA 2D2OA 2NW0A 2DT1A 1GUVA 1I1XA 4MDOA 4UQBA 4DUVA 1V0MA 4D6HA 1LG1A 4J3SA 3HN3A 2DIJA 1E3XA 1J0IA 2JIWA 4PMZA 4LYRA 3CZKA 3OLDA 3AIQA 4AISA 4AD4A 1HJUA 2WCSA 2XVGA 2GK1B 4PBGA 3SCQA 2JALA 4ATWA 4JCLA 5I23A 4UQDA 3ARZA 1R85A 2WM0A 3EDEA 1D3CA 2CKRA 1UH3A 3SEPA 3L2MA 4W8AA 3AMGA 3RDKA 4E2OA 1XSJA 1PAMA 3GXFA 4E8DA 4H7VA 2MANA 2WVVB 4KH2A 3CUJA 4UFLA 1EO7A 1B3YA 1EXPA 3CBWA 4D1IA 1JFXA 1KGUA 3AIWA 2WCAA 1V0KA 2O9OA 4UR9A 6CGTA 2J77A 4TVDA 1OD8A 3KZSA 1ISWA 3K8LA 4GO9A 1K9EA 5FOOA 1UH4A 1FOBA 4PMNA 1Q6DA 1XSKA 1JYNA 3VDBA 3EDFA 4GKLA 1EHAA 1GNXA 5JIPA 1KWGA 5I79A 3SCNA 3WFLA 1EA9C 3U7BA 1BG9A 3TTSA 1BHGA 4CD8A 8A3HA 2X05A 3NIYA 1CWYA 2WMIB 2EPOA 2YKKA 1KWKA 5E6ZA 1E4NA 3GH5A 3WD0A 4E8CA 1GOWA 5E6YA 3T2OA 4D6IA 4FK9A 3VD7A 3CGTA 1HJVA 4JFWA 2PC8A 4M8UA 2DT2A 1G1YA 4J3WA 2ZUTA 4GINA 3CIVA 1R86A 3CUGA 1EOMA 5BXTA 3W24A 3HJEA 2D24A 4NSBA 1XCWA 5DFAA 1TA3B 1W2PA 1JXKA 1DWJM 1UZ4A 3F4VA 3RPMA 4B15A 3TOPA 2EPLX 2GSJA 3SCPA 1JL8A 3MSDA 3W29A 4IPLA 2IXUA 1GQLA 2OSXA 4PMRA 2JF6A 4L4OA 2D3NA 2J7DA 2ZWZA 3PTQA 2J7CA 3BLKA 1ZBKA 2EPNA 3TTOA 5CPQA 2XSBA 3WDQA 4BF7A 3ZT6A 2J8GA 3I3EA 1GHRA 1KXQA 1OB0A 1OT2A 3ZSTA 5FIPA 3PN8A 3A47A 4D1JA 1MFUA 4HA4A 1V3IA 4MNMA 2PWDA 1C7SA 3VIPA 1ZL1A 3BAKA 4U3CA 1V3JA 3N15A 2BY1A 2A3AA 2DEPA 4F8XA 1UG6A 4CD6A 3UETA 4WIWA 3WDHA 3OLIA 3SCWA 1TFVA 4GQQA 1EGZA 3N04A 1WDRA 2JEQA 3M6DA 3QGVA 4YHGA 3SCRA 3THDA 3HMCA 2UY3A 3VGDA 1WCGA 2GUYA 2XUCA 5GPRA 2VR4A 3ARSA 2XVKA 3WQ5A 1B90A 2WHKA 2YDRA 4MB3A 1E6NA 5JBEA 5I24A 1J0JA 4RL3A 5CPSA 2ZICA 1CGXA 5LYRA 2DQXA 4OBSA 2ZXAA 3NDZA 4URIA 1J0YA 1JAEA 3BGAA 4WLCA 2VI0A 2JE8A 3VIKA 5CGMA 3VNYA 3AIUA 4AD0A 5CZKA 4CU8A 5E0FA 3J7HA 3NUKA 1BPLB 2WC3A 4AZ6A 2ESCA 2X1IA 1UQZA 3WNKA 1KR1A 4XX6A 1XYFA 2OYKA 5JIWA 3CHFA 2X09A 4V28A 4BZYA 2WHJA 4M1RA 2GJPA 3M07A 3K8MA 5IFTA 3AICA 1OIFA 3BAWA 4GIAA 2PBOA 5ABGA 4GI9A 3DYMA 1XSIA 2BVTA 3VKKA 2BV9A 2ZUMA 3L4ZA 2VURA 3WH5A 2WBGA 3WDPP 3NSMA 3ZJ6A 3AYRA 4JL1A 1IZKA 3VINA 4HA1A 5I78A 3WNLA 3N11A 1XD1A 3F5KA 2V3EA 2E4TA 3AS3A 1QNSA 4MNLA 4CCCA 1D2KA 1NQ6A 3N13A 4CUCA 2VC9A 3OZOA 3WNPA 2QHAA 2XVLA 2E9BA 1VFUA 9CGTA 1JZ4A 4AZHA 3PZQA 1Q6GA 1XH0A 2FDMA 1B3WA 2ZXQA 2V38A 2YJQA 1E5JA 4TX8A 3VGFA 4AZGA 2WZIA 3AHZA 4H41A 5A8PA 2FHBA 3OLEA 1M03A 1XC6A 3ALGA 1J0HA 3OZPA 3AMCA 4GI8A 1JF6A 2VZVA 2Z1KA 1W1PA 2XTKA 3EDDA 1CXHA 3WIJA 2PWFA 3AHVA 2Z1SA 3GNRA 5A6JA 3WN6A 1HKIA 2VX4A 1US2A 1WPCA 3VGEA 4KWUA 4PCTA 4A3YA 2YA2A 2J47A 4NF7A 1U33A 2WBKA 4AIOA 1CXLA 3L4UA 4W7VA 3BMWA 1V02A 1WZMA 4U2YA 4EKJA 1H0IA 4HA3A 4HMEA 4DWSA 4AXNA 4TXEA 5BROA 3WH9A 1X6NA 2W63A 1GOQA 2C8NA 2AOSA 3AOFA 4HZ8A 1XCXA 1AMYA 3EDJA 5LA1A 2TAAA 1ODZA 4P7RA 1I75A 2W91A 1MXGA 2D1ZA 5HXMA 4B16A 1V3MA 3AIVA 3I3DA 1PEZA 4P7QA 3NJ3A 1NWSA 1UZ1A 4XUYA 4KMQA 2QF8A 3L4VA 3VIIA 1JF5A 2W67A 3LPGA 1MYRA 1WNOA 3DYPA 3SUSA 1CDGA 4CGTA 4L4PA 5HOSA 4UFMA 1GQKA 2W62A 3WEMA 1QNRA 3RIKA 2WPGA 4YN5A 3FHAA 4AY1A 4IPNB 4NRRA 1OGSA 1ZBVA 2VQUA 3ZOAA 1JYVA 1ISYA 3EDKA 3IANA 5CPTA 2WNWA 4OUEA 1FH7A 1BYBA 3VD4A 5FCZA 1UD5A 1NOFA 1GOIA 3W26A 3SUUA 5HPOA 2J25A 2VRJA 4CVUA 1VRXA 1QNOA 1QBBA 1D7FA 3GM8A 1PJ9A 2DT3A 5FKYA 2JIEA 1HP4A 1SMAA 1AQHA 1X1NA 5CQ1A 1XRVA 1TE1A 2PI6A 3TTYA 1UKPA 3AMLA 3MUZ1 4WK9A 3A6OA 4U33A 4M81A 4JFVA 3WMCA 1QI2A 4IUGA 4J3UA 3VD9A 1W9XA 3ARVA 2D0GA 4F9JA 1UR8A 2YL5A 1ZB5A 3FAXA 4MAVA 5IHSA 1JZ2A 3PZMA 3MUIA 4MPKA 1CGTA 2J7HA 2RGLA 1LF1A 3W25A 2CBUA 1WE5A 3ARYA 2Y4SA 1MQPA 2CESA 4W8BA 3O6AA 4W84A 1HKJA 1MXDA 4AMCA 5IHRA 4QLJA 4Q7NA 4CN1A 2WZEA 1E55A 1KXTA 3F5LA 4M56A 1V08A 3WL0A 1NOUA 2J7BA 1WB0A 1W1YA 2YOCA 4C7DA 1BQCA 3CHCA 1Q4NX 2XHYA 2XPKA 3WDJA 3ZT7A 4MJ4A 5DF0A 3WY1A 3E1F1 2BY0A 1UWRA 3QR3A 4CD4A 2A3EA 2D22A 2EO7A 4H04A 1KQZA 4DWSB 3SUWA 4ZENA 3MSGA 3L4XA 1C7TA 4MB5A 3VX0A 3WF0A 3VM7A 5HPCA 5KZ6A 3B8SA 1TZ7A 2CKSA 7A3HA 1BFNA 1NARA 1S46A 3RJXA 4AD5A 3WELA 3GH7A 3L4TA 1MFVA 2J79A 3RJYA 1QPKA 3WUBA 3EBVA 5LA0A 1OBAA 2W92A 1JNDA 1E71M 1MWOA 3A3HA 4OBRA 2V3FA 5IFPA 1UR4A 4HTYA 1V0LA 1BG4A 3AIRA 1JAKA 1NP0A 1EQPA 3ZJ7A 4MADA 3OBAA 1JXJA 2CBJA 4UZUA 4ATLA 4J3VA 2OWWA 1MQRA 2DSZA 3ALFA 3VGHA 1J0KA 1TMQA 1H3GA 1G0CA 1CGWA 4P8VA 3PZIA 1CGUA 4EK7A 3VIMA 4QAWA 1ISVA 3MV11 2X0YA 4PRWA 4UOZA 1ECEA 1CIUA 1QI5A 1KQYA 1J10A 3GBEA 1XV8A 2WB5A 3TA9A 2QMJA 2CIPA 4S3KA 1DTUA 5EMYA 4IISA 4V27A 1UR0A 1GJWA 1VF8A 3MUAA 4TUFA 1O7AA 3ARTA 3OB8A 1Y7VA 1JIBA 4R27A 3VMOA 4WSJA 3II1A 3IJ7A 4GQRA 2WMGA 3CZGA 2E3ZA 4B9YA 4KRTA 1EHNA 1E15A 1UD8A 2A3BA 5CLWA 4B3KA 3AIBA 5BXPA 4P8XA 3OGRA 2CETA 4CU7A 3BH4A 3AMDA 3VD3A 4BQ5A 3CZJA 4GPNA 2ZUUA 5GNZA 3WF2A 3M7SA 4K68A 4QLKA 2ZXBA 1QI0A 3AS2A 2J75A 4KGLA 2VX5A 5D9PA 1W3KA 2IXVA 3BSGA 1OSEA 1V03A 5C8BB 3PTMA 1Q6EA 1W1TA 2CNCA 6TAAA 3S6TA 2E0PA 4Z2IA 2G4FA 4E4PA 2BNJA 3SCOA 4W87A 1K6AA 3VGBA 3IAQA 5AYBA 4TVUA 3F5JA 4AZ7A 5D8WA 3EYPA 3GNPA 3VILA 5GQBA 3T0BA 4EAMA 3VMNA 4TX6A 1DWFM 1O6IA 3W81A 5A6KA 4Z2JA 8CGTA 3U7VA 5D4YA 2QV4A 4FLOA 5I5RA 4WKAA 2QMKA 3CZEA 4U2ZA 1C8YA 3RILA 4LPCA 4PCSA 4DUWA 5A94A 5DT5A 1UD3A 3CH9A 5A6BA 1XH1A 4MAZA 2XGIA 4P7OA 3ARWA 3ZR6A 3CHEA 1K9TA 1QHPA 3D5HA 4TVCA 3MV01 2JFEX 3WMBA 5M17A 2WAGA 2WZHA 2WC7A 2WVTA 2G3MA 2J7GA 3AJ7A 2WHLA 3WNNA 1QHZA 4Y7EA 4XV0A 4YHEA 4B3LA 2WXDM 3AMKA 1ZBWA 2FHFA 2VZOA 4QFUA 3T09A 3CTTA 5I0DA 2DSKA 2Y5EA 2V3DA 1JZ8A 3WENA 4FF5A 1BSIA 4P8WA 1MVYA 4LYQA 3IAPA 2HISA 5E9AA 3GYCA 4ZE5A 4Z2LA 2JEPA 1GVIA 3KWXA 3KL0A 3WF3A 1WZLA 2XFYA 3CPUA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2V3G A;  4LXF A;  5ABF A;  2OSW A;  1C92 A;  2J4G A;  4GZI A;  3BAY A;  3UCQ A;  1E6Q M;  1E3Z A;  5D8Z A;  1DWH M;  3QHM A;  4OZO A;  1XGZ A;  1SMD A;  1CEO A;  4AZI A;  1C90 A;  1E40 A;  1TR1 A;  1LLO A;  2VVS A;  1NOW A;  5A6B D;  1KFW A;  5DT7 A;  4HMC A;  1CGY A;  1V6X A;  2D20 A;  1PIG A;  3SUR A;  5A95 A;  1HL8 A;  2DSU A;  3PHA A;  4H8U A;  2O9R A;  1MW2 A;  3LPF A;  3W37 A;  3VTR A;  1QVB A;  4ML4 A;  1RH9 A;  2WKL A;  4OOU A;  4PMY A;  1H2J A;  1QOX A;  4X0N A;  4W5Z A;  2YLL A;  2XFR A;  4HPG A;  1H11 A;  3ZJK A;  2YDS A;  3WSU A;  1FHL A;  1GOO A;  4JCM A;  5A69 A;  1N82 A;  1YHT A;  4JZ5 A;  1M53 A;  4V2X A;  2F8Q A;  5C71 A;  4AD3 A;  4PSR A;  4H8V A;  1NP2 A;  2WMJ A;  3VUP A;  3TON A;  2Y8V A;  4GI6 A;  3FN9 A;  1GOK A;  2UWF A;  3GDB A;  1WDS A;  3PZU A;  1EO5 A;  2XGB A;  1NM9 A;  1UHV A;  2BFG A;  2WW5 A;  2FHC A;  1W32 A;  1OD0 A;  1LL6 A;  2OYM A;  1MQQ A;  1LL4 A;  1PZ2 A;  1HL9 A;  2XIB A;  1GPF A;  2DSW A;  2F2H A;  4NRS A;  3B9E A;  2YL9 A;  3AZR A;  1EQC A;  2GK1 A;  1KBK A;  1ITX A;  4M24 A;  1B31 A;  5JBF A;  3WD3 A;  4D72 A;  1J12 A;  3AS1 A;  2ZXD A;  1FP8 A;  2DIE A;  2VCA A;  2FH6 A;  1JZ3 A;  5ABE A;  1KXV A;  1BGA A;  1JD7 A;  4WSK A;  2WLZ A;  2DH2 A;  1E4I A;  1IT0 A;  3FXY A;  4D6F A;  1ZJA A;  2WVV A;  5HDR A;  3RM4 A;  1UH2 A;  3LPP A;  1E4L A;  4PN2 A;  4AC1 X;  2YA0 A;  2WVS A;  4ACZ B;  4JKK A;  1GW1 A;  4X9Y A;  4DUX A;  4AZB A;  2GVY A;  1DWI M;  1LWH A;  1OM0 A;  1TVN A;  1FH9 A;  3MMD A;  4AD1 A;  1UKQ A;  5JBD A;  4LGX A;  4N0R A;  3RME A;  1W2V A;  2CEQ A;  1BYC A;  3G6M A;  1V0N A;  4UTF A;  2ZX5 A;  2J8F A;  1B2Y A;  2VCB A;  3ARP A;  1JNE A;  3VMP A;  4C7G A;  7CGT A;  2WWC A;  1QW8 A;  3HU7 A;  2EQD A;  3WBA A;  5E70 A;  1QI3 A;  3FND A;  2CBV A;  2EPK X;  4QCE A;  4F79 A;  3VIO A;  1UD2 A;  1M01 A;  1PX3 A;  3I3B A;  1DWG M;  4W86 A;  1KGW A;  1K9D A;  2VZU A;  5CG0 A;  4M80 A;  2CXG A;  3VDA A;  4Z2K A;  1JDD A;  1HT6 A;  2FGL A;  1W9B M;  2WMI A;  3WFZ A;  5A3H A;  5I77 A;  1C8Q A;  3WF1 A;  2D3L A;  5ABF B;  4DM1 A;  1I1W A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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