3AISA

Crystal structure of a mutant beta-glucosidase in wheat complexed with dimboa-glc
Total Genus 186
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
186
sequence length
491
structure length
491
Chain Sequence
GPVFTKLKPWQIPKRDWFDKDFLFGASTSAYQIEGAWNEDGKGPSTWDHFCHTYPERISDMTNGDVAANSYHLYEEDVKALKDMGMKVYRFSISWSRILPDGTGKVNQAGIDYYNKLINSLIDNDIVPYVTIWHWDTPQALEDKYGGFLNRQIVDDYKQFAEVCFKNFGDRVKNWFTFNAPHTYCCFSYGEGIHAPGRCSPGMDCAVPEGDSLREPYTAGHHILLAHAEAVQLFKARYNMHGDSKIGMAFDVMGYEPYQDSFLDDQARERSIDYNMGWFLEPVVRGDYPFSMRSLIGDRLPMFTKEEQEKLASSCDIMGLNYYTSRFSKHVDMSPDFTPTLNTDDAYASSETTGSDGNDIGPITGTYWIYMYPKGLTDLLLIMKEKYGNPPVFITENGIADVEGDESMPDPLDDWKRLDYLQRHISAVKDAIDQGADVRGHFTWGLIDNFEWSLGYSSRFGLVYIDKNDGNKRKLKKSAKWFSKFNSVPKP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Beta-glucosidase
publication title Active-site architecture of benzoxazinone-glucoside beta-D-glucosidases in Triticeae
pubmed doi rcsb
source organism Triticum aestivum
total genus 186
structure length 491
sequence length 491
ec nomenclature ec 3.2.1.182: 4-hydroxy-7-methoxy-3-oxo-3,4-dihydro-2H-1,4-benzoxazin-2-yl glucoside
pdb deposition date 2010-05-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3aisA00
2YL5A 2VX6A 1UQZA 2XPKA 3WMSA 2QLYA 2WMGA 3QOKA 2WVVB 3T09A 1TVPA 1ZB5A 1U2YA 3PZUA 1DTUA 3AI0A 3IJ7A 1E15A 2G3IA 2FDMA 3OLGA 2O9OA 4Z2HA 4FMVA 1CTNA 3F4VA 4V27A 5I79A 5E9AA 2GJXB 2WMFA 2VRQA 3RM8A 4XB3A 3WH6A 4U2ZA 1OINA 3AIUA 2W92A 1CXKA 1G94A 1EHAA 4AD5A 4AZBA 4JFVA 1MXGA 2YDSA 3CH9A 1G0CA 3T2PA 3W37A 1TCMA 3BAWA 4CN1A 1WZKA 1EXPA 1QHOA 4AXNA 1J0YA 1G5AA 3VKKA 3O2LA 3CHCA 3CIVA 1EA9C 4F9DA 1QNSA 2XM2A 3MKKA 5CXPA 1W3JA 4H8HA 1UD6A 3MV11 3RILA 3DYPA 5D9NA 1QNQA 1WZLA 1GUVA 1CYGA 3PBGA 2C7FA 1PIFA 3MMUA 3FW6A 4OOZA 3SCTA 5A6SA 5BXTA 6CGTA 1JZ4A 2D23A 4JKKA 1UUQA 1JL8A 5ECUA 3ARSA 1LWHA 3KE0A 3VM5A 4B9YA 3WF0A 2DIJA 3VD4A 1OWQA 3GBDA 3CZKA 2J74A 4ZE4A 5DEZA 2C8NA 4XZBA 2XTKA 3PZGA 2YA0A 3PTMA 1LWJA 2EPNA 1GOMA 4W93A 2WWCA 3VIOA 3T0AA 1CDGA 5CPQA 1FOBA 2WZIA 4MAZA 5FKYA 4U33A 4ACYA 4ATWA 2DSWA 1ZL1A 4HA3A 3EDDA 3KEHA 1UKPA 1HJWA 1N82A 4JFTA 3WQ4A 2QPSA 5E70A 4NI3A 4A3HA 2CETA 5FIPA 4CD7A 3W27A 2CERA 4B3KA 2FHCA 2Y5EA 3T0DA 2CBJA 2J47A 3W4RA 5I2UA 5I24A 2V3EA 2ZXAA 3L4UA 3PN8A 2J62A 3G6MA 3A4AA 1HT6A 1D3CA 4MB1A 1J18A 1WCGA 5AY7A 3VIFA 2OYKA 3CHFA 5GQBA 3WUFA 1B2YA 2XVGA 1KR1A 4CVUA 4QLKA 5E09A 3WD1A 4MNKA 4PMUA 2VL4A 3NDYA 5ABFA 2V5DA 3UG5A 5AYBA 3U7BA 2RGLA 3J7HA 4GKLA 4JFSA 1UWIA 1V3MA 1QW9A 1YQ2A 3D5HA 3PZVA 4XX6A 4W87A 1WDRA 5C70A 1HKJA 4FLQA 5A3HA 4JHZA 1U33A 4CD5A 1TMQA 2BVDA 5CLTA 1DWFM 4KGJA 3KL0A 4CU7A 1BYAA 1V0LA 3POCA 1BF2A 2A3HA 2DSUA 1UD8A 3WNPA 1B31A 1GHRA 5IFTA 2G3NA 3WUEA 1O7AA 5HNNA 3BC9A 3THCA 1DWIM 3WH5A 2PWEA 4MJ2A 3CUJA 4P7QA 3BAYA 3WSUA 1ISXA 3BCDA 1ITXA 2WSKA 2UWFA 5A2AA 1UWQA 2A3BA 2J8GA 5C71A 1V3HA 2WMJA 4F8XA 3CHEA 4PN2A 1OB0A 1JZ7A 5D9OA 1AQHA 3ALFA 4P7LA 2WVSA 3NIYA 2OWWA 4YPJA 4AD3A 5AC5A 1G01A 2VOTA 4GQRA 2E40A 5HPCA 4HMDA 4MJ4A 2ZUMA 3OLDA 5IDIA 3M46A 2XUCA 3ZR6A 1HVQA 4AISA 5CQ1A 2G4FA 2YJQA 4Z2JA 1JNDA 2E9MA 3SURA 3T08A 2YIHA 2OSWA 4MNJA 1H2JA 3KZSA 1NWTA 1HNYA 4AD2A 2ZUSA 1GW1A 1GJWA 1ITCA 1CZ1A 2FGZA 2UY4A 4BS0A 1E1EA 2E9BA 2X1IA 5CZKA 1CGYA 2BHUA 3B9DA 5BYWA 5GNZA 2J7EA 5HXMA 3HU7A 4YHEA 3VGEA 2WCSA 3WUGA 3S6TA 3SCSA 2WCGA 4C7FA 1CXIA 2WC7A 4BCEA 4W5ZA 3OIHA 4NF7A 1Q4NX 4N0RA 1K9FA 1PX3A 3ECQA 4U3AA 4ACZB 1P6WA 3AMKA 4ZEPA 5A8QA 2OWXA 1XH2A 1BFNA 3ARVA 1XSJA 2W63A 3U5UA 5E6YA 4RE4A 3CTTA 2GK1B 3TTSA 3AIWA 3EMQA 1VB9A 3F5LA 2ZXBA 4JHOA 1C93A 3K8MA 3AS0A 2E8YA 2FGLA 5JUVA 1HP4A 4RE3A 3VGDA 1JDAA 4PMXA 3WQ6A 4X9YA 3IJ8A 4NRSA 5JIWA 1MFUA 4P8UA 1M01A 1GORA 1KGWA 1ISYA 3GDBA 4WSJA 1HKMA 3L2MA 4UOZA 5A94A 1V03A 1O6IA 1X1NA 3WIJA 4B9ZA 2OYLA 1DP0A 1BGGA 2G41A 2VX7A 1HX0A 3E1F1 3RO8A 5AC4A 4UFIA 1NARA 2DT1A 3VTRA 1H09A 3SCUA 2YLAA 1V6WA 1ISZA 2XVPA 4PSPA 3ARUA 2V3GA 2W5FA 1E71M 1H49A 2BY3A 4OKDA 2VZTA 3UETA 2CYGA 2XWDA 2CKRA 4D6HA 2DGAA 3L4VA 1JI2A 1SMAA 1VEMA 2EJ1A 3WNLA 2W61A 1UR2A 2YL6A 5KZ6A 4UNIA 4A3YA 3WF4A 1H41A 4IUGA 3WF2A 1B3ZA 2JF6A 5TD4A 1W9VA 3GNPA 1G9HA 4GINA 3GBEA 2ESCA 1I1WA 3BAJA 4D1IA 1ODZA 4UFJA 3K4AA 3I3EA 1E40A 3II1A 4QLJA 2YA2A 1WB0A 4MB3A 3ZT7A 1KQZA 2VUYA 2DPEA 2G3MA 1V6XA 3CUGA 3AIBA 3N12A 4F9JA 5DFAA 2E3ZA 1JNEA 1NP2A 4UQ9A 3EMZA 4Z2LA 1QI3A 1JZ2A 1R87A 2VMFA 1CGUA 3TTYA 3N15A 4L4PA 1WZMA 2O9RA 4DWSB 2VNCA 3VU2A 3DHUA 1HJXA 4CD4A 2YDQA 1H3GA 3QHMA 3WEMA 5GNYA 1JYNA 4LX4A 3OGVA 5I23A 2EPMX 3OLEA 3W25A 2V3DA 2WAGA 4DUWA 1M7XA 2ZUWA 3CMGA 4UQBA 2D0FA 1NOFA 3ZM8A 2JALA 1NP0A 1K9EA 2WBKA 1KXTA 1QI0A 5ABHA 3CZGA 3L4TA 1JD9A 3W29A 5EBAA 2J7FA 4H7VA 1V6UA 4R27A 4DUVA 1UG6A 2EBNA 4JFUA 1UD4A 1SYTA 5A6MA 5A6JA 1F4AA 3VIMA 4P7OA 3OGRA 1HJUA 2WVVA 5FOOA 4YHGA 1IV8A 3BLKA 3WEOA 3UR8A 4WLCA 4HOZA 2NSXA 2VTFA 3LMYA 1V3KA 4JAWA 4GI6A 1XH0A 3UERA 3T2OA 3VX0A 1OT2A 2XM1A 1VFUA 3AYRA 2VRJA 2GJXA 3GZAA 1GQKA 3KL3A 4RL3A 3W82A 3UG3A 1RD6A 3GYCA 1W9DM 3AIEA 2CEQA 2W66A 3A47A 1UKOA 1SFSA 2XVNA 1C3FA 4U31A 3W28A 4W7UA 3DECA 3AS1A 3AHTA 1J01A 1HL8A 4BQ2A 3BMVA 2XGBA 1GHSA 3WH8A 3VO0A 1NOWA 4HU8A 4AIOA 1IZKA 2XG9A 4GO9A 1VFMA 3WY1A 2IXVA 1KQYA 4DM1A 5A2CA 4V2XA 1CXEA 2Z1SA 4KRTA 1KBKA 2WCAA 3DC0A 1YHTA 4KH2A 1QNPA 3F5JA 1OT1A 2V38A 3ZSSA 3GXMA 4E4PA 1W1VA 3GXDA 2TAAA 1KBBA 1BVNP 2EPKX 4CU8A 4DWSD 1C8QA 2DT3A 3VINA 3NJ3A 1BHGA 3PZIA 1D7FA 2F8QA 2ZXDA 3I3BA 4GZJA 5AYIA 4M24A 1E70M 5ABGA 1W9UA 3AXXA 2CBIA 2YBUA 4BA0A 3POHA 3VGHA 3WL0A 4QLLA 5IHRA 3CZ8A 1M53A 3MU7A 3GXFA 3N18A 4H04A 1TFVA 1UD2A 2WWDA 3W6MA 4BQ5A 3CUIA 3GH7A 1GVYA 4J3UA 5LYRA 2XFYA 1GVIA 4PBGA 3TTQA 1VF8A 5A1AA 2ZIDA 3MSDA 3VDHA 5DMYA 3AICA 1EDQA 1V0MA 3CUHA 1E0VA 1CENA 1HF6A 4XZWA 4CD8A 2DT2A 3F5KA 1E73M 3W38A 4UCFA 3CZLA 1DHKA 3B8SA 1CGTA 4HZ6A 4W7VA 4W88A 4Q7NA 2AMGA 1UKSA 4H8UA 4AZCA 2VCBA 1UR1A 3L2LA 1JFXA 3WF3A 4Y7EA 2ZWYA 1Q6FA 3VNYA 4J3WA 3SCVA 3M07A 4D6DA 1BPLB 2A3CA 4M1RA 1E56A 5CPTA 1JZ6A 4ZXOA 5DF0A 3BH4A 3DYOA 2GSJA 5C8BB 3ARYA 3D3AA 5IHSA 4M8UA 1FHDA 2VURA 3KL5A 4LYRA 1W3HA 4UZUA 4Q22A 3VDCA 3K46A 2QMJA 1K6AA 2D3NA 4DM2A 4EANA 1K9TA 2W91A 5CGMA 4J3VA 3OLIA 1TA3A 3AMCA 3BSHA 4ZENA 2WHKA 5A8OA 4LQ1A 2VX5A 5FL0A 6TAAA 1KB3A 2VVSA 2WMHA 2GFTA 3MANA 3MUAA 4PEEA 3M6DA 3TTOA 2XWEA 1W9BM 3PTKA 2EPOA 3HJEA 4LGXA 5EB8A 3QGVA 2JIEA 2VX4A 3RIKA 1BAGA 3FNDA 3BAKA 3T0BA 1WDQA 3AZRA 4PCSA 2XHYA 3WMCA 5LA1A 1GJUA 2BHYA 1OSEA 7TAAA 1NWUA 2ZX7A 1E1FA 5BWFA 4LYPA 4ZE5A 1E4MM 4PTWA 2XFFA 3WFLA 2WZEA 5F7UA 1UOKA 3CLWA 1NH6A 4PMVA 1V0KA 5LA2A 3APGA 3WDIA 4TVCA 1UR8A 3AZTA 1GZJA 3IANA 3IAQA 1BQCA 2QV4A 2WBGA 1BG4A 2EXOA 2DQXA 2GDVA 1HIZA 3NSXA 4CN4A 3AIQA 4ZXLA 4CGTA 1V0NA 2PF0A 1XD0A 1NWRA 4MADA 1BYBA 1VBRA 4UFKA 1HVXA 1KXQA 4LPCA 2WANA 3RM4A 4C7DA 1WKYA 1BLIA 4X0NA 1E4NA 3AHZA 1CPUA 4GPNA 3OA5A 4ACZA 2YL9A 3EDFA 1FHLA 4D1JA 1V02A 1JXJA 1XC6A 2WHMA 1Y7VA 1BGAA 4PUDA 3WNKA 4W85A 2WMIB 4UFLA 4S3JA 3ZJ6A 1MW3A 1XYFA 1RP8A 2UY3A 3N17A 5DT7A 3PTQA 1J10A 4TVUA 1DEDA 1E43A 1MQPA 1JFHA 2XJ7A 1FH9A 1NQ6A 3VIIA 1I1XA 4OIFA 1EDGA 1B0IA 1EQCA 1W32A 4M81A 2CBUA 2DSKA 3NDZA 3WD3A 1QHZA 4NRRA 2WVTA 2D0HA 1UWSA 1XSKA 3S2CA 4UR9A 2JF7A 5D4YA 4BF7A 2QHAA 5HOSA 2J79A 4UQCA 3RM9A 2ZX5A 4QCEA 2Y2WA 5BXPA 2PWGA 2VCCA 7A3HA 2ZX8A 1JYWA 1UD5A 3JUGA 3AZSA 8A3HA 3AMLA 2VZUA 2HISA 1UHVA 2F2HA 3CGTA 3CZEA 3OZPA 2GJPA 2XVLA 1I75A 3B9EA 4LYQA 3MUZ1 1E55A 1GONA 3W6LA 4CCDA 1NM9A 3PZMA 1UQYA 2VT0A 2ZUVA 1VENA 3AOFA 2O9PA 4DWSC 4M80A 4MDOA 4TTGA 1W2PA 3A4WA 5BRQA 2D24A 3N11A 3MV01 3ZQ9A 1CEOA 3GXIA 5I5RA 4UZSA 2NT0A 3A6OA 1JYVA 2PWFA 1JIBA 2F61A 2JEPA 4J7RA 5A8PA 1W9PA 5D9PA 3WMBA 4BQ4A 4CUCA 3ZOAA 1OIFA 3WD2A 1V02E 5HBFA 1E4LA 1GQJA 1L8NA 1OCQA 4PMZA 4D72A 4J3XA 2WC4A 1HN1A 1KWGA 4AEFA 4AZ7A 1HXJA 4EK7A 1LL7A 4IPLA 3VIKA 3SUUA 4DWSA 1ISWA 3VPLA 4OJYA 1E3XA 3VVGA 1QNOA 4F66A 1QI4A 1V08A 1HKKA 2ZICA 4NSBA 3AISA 1GCYA 4HMEA 5BRPA 2Y8KA 5A6BD 4E8CA 1W91A 2EO7A 3PZNA 4AYSA 3L4ZA 4MB5A 1H4PA 1VAHA 3WF1A 1HJSA 3O6AA 4QDMA 4W89A 4JL2A 5D8WA 2J25A 3TOPA 3UESA 2BS9A 1MVYA 4WKHA 3LPOA 1E4IA 1GPFA 4AC1X 4UFMA 1ZJAA 4MNLA 3CPUA 1C8XA 1KFWA 1W1TA 3QR3A 4AZIA 1F4HA 2G8ZA 3WENA 4NZCA 1X6LA 2CITA 2VZOA 4K68A 1EHNA 2PI6A 4HOWA 4R5EA 1AQ0A 6A3HA 3AYSA 1MQQA 5KEZA 1BG9A 2W67A 1XV8A 1QBBA 1HJQA 1SMDA 4PMNA 3LPGA 4URIA 4TOQA 2BFGA 1KXVA 4OBSA 1LF1A 4MNMA 1WP6A 2J7CA 2ZXQA 4PYSA 4AY1A 2GUYA 1MQRA 3A4XA 2BVYA 2A3AA 3PZQA 2JE8A 1FFQA 4HPGA 1C91A 3GNRA 3VD5A 3N1AA 5CJ5A 4AEEA 2WLZA 1VIWA 1UZ1A 2ZX6A 1C7TA 4PTVA 3HMCA 1B1YA 1CECA 3GTNA 5HPOA 1JI1A 1LJYA 4S3KA 7CGTA 5A8NA 3PZ9A 4AD4A 1JF5A 1DWGM 2Y4SA 4QFUA 4CKQA 3PZOA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2YL5 A;  2VX6 A;  1UQZ A;  2XPK A;  3WMS A;  2QLY A;  2WMG A;  3QOK A;  2WVV B;  3T09 A;  1TVP A;  1ZB5 A;  1U2Y A;  3PZU A;  1DTU A;  3AI0 A;  3IJ7 A;  1E15 A;  2G3I A;  2FDM A;  3OLG A;  2O9O A;  4Z2H A;  4FMV A;  1CTN A;  3F4V A;  4V27 A;  5I79 A;  5E9A A;  2GJX B;  2WMF A;  2VRQ A;  3RM8 A;  4XB3 A;  3WH6 A;  4U2Z A;  1OIN A;  3AIU A;  2W92 A;  1CXK A;  1G94 A;  1EHA A;  4AD5 A;  4AZB A;  4JFV A;  1MXG A;  2YDS A;  3CH9 A;  1G0C A;  3T2P A;  3W37 A;  1TCM A;  3BAW A;  4CN1 A;  1WZK A;  1EXP A;  1QHO A;  4AXN A;  1J0Y A;  1G5A A;  3VKK A;  3O2L A;  3CHC A;  3CIV A;  1EA9 C;  4F9D A;  1QNS A;  2XM2 A;  3MKK A;  5CXP A;  1W3J A;  4H8H A;  1UD6 A;  3MV1 1;  3RIL A;  3DYP A;  5D9N A;  1QNQ A;  1WZL A;  1GUV A;  1CYG A;  3PBG A;  2C7F A;  1PIF A;  3MMU A;  3FW6 A;  4OOZ A;  3SCT A;  5A6S A;  5BXT A;  6CGT A;  1JZ4 A;  2D23 A;  4JKK A;  1UUQ A;  1JL8 A;  5ECU A;  3ARS A;  1LWH A;  3KE0 A;  3VM5 A;  4B9Y A;  3WF0 A;  2DIJ A;  3VD4 A;  1OWQ A;  3GBD A;  3CZK A;  2J74 A;  4ZE4 A;  5DEZ A;  2C8N A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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