3AIUA

Crystal structure of beta-glucosidase in rye
Total Genus 184
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
184
sequence length
486
structure length
486
Chain Sequence
VFTKLKPWQIPKRDWFSKDFLFGASTSAYQIEGAWNEDGKGPSTWDHFCHTYPERISDGTNGDVAANSYHMYEEDVKALKDMGMKVYRFSISWSRILPNGTGKPNQKGIDYYNNLINSLIRHGIVPYVTIWHWDTPQALEDKYGGFLDKQIVNDYKYFAELCFQSFGDRVKNWFTFNEPHTYCCFSYGEGIHAPGRCSPGLDCAVPEGDSLREPYTAGHHILLAHAEAVELFKAHYNKHGDSKIGMAFDVMGYEPYQDSFLDDQARERSIDYNMGWFLEPVVRGDYPFSMRSLIGDRLPMFTKEEQEKLASSCDIMGLNYYTSRFSKHVDISSDYTPTLNTDDAYASSETTGSDGNEIGPITGTYWIYMYPKGLTDLLLIMKEKYGNPPIFITENGIADVEGDPEMPDPLDDWKRLDYLQRHISAVKDAIDQGADVRGHFTWGLIDNFEWGSGYSSRFGLVYIDKEDGNKRKLKKSAKWFAKFNSV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Beta-glucosidase
publication title Active-site architecture of benzoxazinone-glucoside beta-D-glucosidases in Triticeae
pubmed doi rcsb
source organism Secale cereale
total genus 184
structure length 486
sequence length 486
ec nomenclature ec 3.2.1.182: 4-hydroxy-7-methoxy-3-oxo-3,4-dihydro-2H-1,4-benzoxazin-2-yl glucoside
pdb deposition date 2010-05-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3aiuA00
1EO7A 2QF8A 2E9LA 5FCZA 3IANA 2EPKX 1GNXA 3GNOA 3AHTA 3N12A 3B9AA 3A4AA 3WL0A 1U2YA 4Z2IA 2CKSA 3W28A 3CZJA 2UY4A 4NI3A 1XSKA 4U5IA 1FH7A 2W66A 2ZXDA 3CLWA 2YLAA 1UH4A 2GJXA 2C0HA 2X09A 6TAAA 3EMQA 5A8OA 5A95A 1QHOA 3GZAA 3MSDA 5GQBA 4ZENA 1QBAA 1WO2A 2WWDA 4A4AA 3WKZA 1HJSA 1R7OA 2JALA 4Z2GA 1UKPA 1BGGA 1JG9A 1W9DM 2XFRA 5M5DA 3WF1A 2DGAA 1HJUA 1CGYA 2ZICA 5CSYA 3ZIZA 3GM8A 4XZBA 2EEXA 3OLEA 3SUVA 2E0PA 2Y24A 4W8BA 1EXPA 4D6EA 2XM2A 2PB1A 3NUKA 3WDJA 1XH0A 1WDPA 1PX8A 2GUYA 3S2CA 4RL3A 3VUPA 3ZJ6A 3F5KA 1I1XA 3WUGA 1ISVA 4ZEPA 2JF6A 1WZLA 1ISXA 3ZT7A 1OB0A 1VF8A 3WMCA 5BXRA 4HMCA 1ZL1A 1ZBCA 5HNNA 3BAYA 4MNJA 1QNRA 1HVQA 1EDTA 2DH3A 2WHMA 5CPQA 2YIHA 4AW7A 3LPFA 3MMWA 4CCDA 4HZ8A 2DEPA 1PJ9A 3VD5A 1CXEA 3VGDA 3AIUA 1WKYA 4AD3A 5BROA 3VPLA 4U2ZA 1KR1A 4AZCB 5A6BD 1YQ2A 2D20A 3M07A 1Q6FA 1QI5A 1MWOA 5FOOA 2WHJA 3UG3A 1C93A 1J0IA 1XCWA 3ZT6A 4Z2JA 4M1RA 4NSBA 2CHOA 1V08A 4PUDA 5CGMA 1J0YA 4LQ1A 5LA1A 4YHGA 1US2A 3UG5A 2NW0A 1OGGA 3PTQA 3GTNA 3VX1A 2JEPA 4A3HA 5GPRA 5A2BA 2WVTA 4W5ZA 1B2YA 1JI2A 5CXPA 1W32A 3IK2A 4YPJA 1OT1A 1VFMA 3W81A 1V6YA 1UG6A 2G3MA 1DWFM 2VURA 4P7NA 4ML4A 1MFVA 2WMIB 4DWSB 1H2JA 4UQ9A 2ZX7A 1HL8A 4CU8A 4LYRA 3M7SA 4BQ2A 2GJRA 4D6JA 3ARWA 1RPKA 4CUCA 4JKMA 1H0IA 3K1DA 2X0YA 4W86A 3ZOAA 4HPHA 3OB8A 1LWHA 3L4TA 3WH5A 4F9DA 4WF7A 3KE0A 4MB3A 1GONA 3VDBA 4ATLA 1QNSA 4B9ZA 3POCA 2CETA 2W61A 2RGLA 2JFEX 5E9AA 3W24A 3AS0A 2E9BA 3L2LA 3B9EA 2YL8A 3WQ8A 2ZX9A 2E8YA 4RE2A 3VMNA 3ZR6A 3MO4A 2GDUA 3OGSA 4J3XA 1W2VA 1VIWA 1KXTA 1LG2A 3B8SA 3PZNA 1C90A 2B31A 1XCXA 2CYGA 1UD3A 4AEFA 4MPKA 1MXGA 2AAAA 1HL9A 1MVYA 4XUYA 1HX0A 1EIBA 3OBAA 4LX4A 3BCDA 5HOSA 3WNPA 1WDSA 4WKFA 2CNCA 3EDDA 1G01A 2VNCA 3GH7A 4H2CA 4JFUA 5BXSA 5A6BA 1F4HA 1OT2A 2DSVA 4KGJA 1KFWA 5ABFA 1CGVA 2VTFA 1J0ZA 1UWRA 3DHUA 1Q6EA 3SCPA 3KL0A 5AC5A 1JZ2A 5ECUA 1FA2A 3BAJA 1VEOA 2WZHA 3A4XA 2VZVA 4HOWA 1BYDA 4U3CA 4CVWA 3WFZA 2J7FA 5EMYA 1OGBA 3BXWA 1BHGA 1X6NA 3W53A 4H8UA 2XFYA 3MU7A 1V3MA 3ARSA 2FHBA 3RO8A 3GBDA 2CBUA 1GQKA 1YHTA 2G3IA 3WF4A 1JYWA 2PWHA 1CYGA 1V3LA 4TOQA 2DT0A 2BHZA 5I23A 1W9VA 1A47A 2CITA 2GK1A 2VZSA 4OUEA 2YA1A 4ZE5A 2J78A 4PMZA 3PZGA 5E0FA 3VX0A 4UQCA 1DEDA 2PWDA 2A3BA 1O6IA 2YL5A 1UWUA 3UESA 4HZ7A 4AZGA 5FL1A 4PMYA 3M46A 4DUXA 5A3HA 1TZ7A 3WUEA 5ABEA 1IV8A 4JCLA 3CHEA 1E5NA 2ZUTA 3WQWA 3EBVA 3ZT5A 2YKKA 2PWFA 1CENA 3SUUA 1J11A 4DUVA 3KL5A 5C70A 3SCNA 1TA3A 2NT1A 4W88A 4CD7A 4HOXA 2J75A 4F66A 2CXGA 4JFTA 3MSGA 3SCTA 1J0KA 2OYLA 1KCKA 4PBGA 3VGBA 2YBTA 2J62A 1V6VA 2J4GA 3K8LA 4Z2HA 1E3ZA 4HMEA 4JHOA 3AXHA 3W37A 2WZIA 3AHYA 1E71M 4XX6A 7TAAA 2D3NA 3ECQA 3AQUA 3TTQA 2NSXA 2W92A 3RIKA 2QLYA 5A8QA 1ITCA 4OIFA 4J3TA 4B3KA 2WMHA 1HJWA 2BFGA 2D3LA 1W3KA 3AHZA 3FNDA 1KCLA 3S6TA 1E6PA 2WWCA 4EKJA 3VDCA 1JZ4A 1CGTA 5FIPA 4C7DA 5FKYA 1HT6A 4AZHA 1VEPA 4IM4A 5ABHA 2O9TA 3ZJ7A 1XD0A 2XWDA 1M53A 2VX5A 1AMYA 2BY0A 3L4WA 3AHVA 3SUTA 4HOZA 2A3CA 3TTYA 3WD3A 3AS1A 3AI0A 2UY5A 1TUXA 2WNWA 1VB9A 1H0GA 2VR5A 2V3DA 4TVUA 1US3A 2VRQA 2CEQA 4GZEA 2BVDA 1CZ1A 4QDMA 2J7EA 4WJXA 2WW5A 3W26A 3M6DA 4LXFA 5IHRA 2D22A 2WK2A 3N11A 3CUIA 5BYWA 4B16A 1PZ3A 1E6ZA 5IXEA 1RP9A 5I5RA 1VRXA 1UQYA 1LL4A 3I3BA 3VO0A 2MANA 4FMVA 3CZ8A 3LPPA 2YJQA 3OZPA 3L4UA 4YN5A 1JDDA 1TFVA 2YLLA 2FHFA 1ZU8A 1MQRA 2J7BA 3PZ9A 2XGIA 3TTOA 4AD5A 4UFIA 3RCNA 4CCCA 2WCSA 1QI2A 1X1NA 3WEOA 5FL0A 1CLXA 5A6SA 3IJ7A 1W3HA 5C8BB 4GXPA 1B30A 2D0FA 4MJ4A 1WB0A 4OKDA 5D9OA 1E56A 5JIWA 3DYOA 3G6MA 5I3DA 3SEPA 1UUQA 2BY2A 2WCAA 3VGFA 1JNDA 2OYKA 4X0NA 1L8NA 1UHVA 5JBEA 1EGZA 4BZYA 2FDMA 5DFAA 4KWUA 1XHGA 4U3AA 2V3EA 4CN1A 3N9KA 1G0CA 4UCFA 3CUGA 1GQLA 3II1A 5JIPA 1PAMA 1MQPA 2WYSA 1B90A 4X9YA 3CO4A 1M7XA 2OSWA 2D1ZA 4F79A 2Z1SA 2J7HA 3DYPA 4GI6A 1CECA 4GZJA 3AXIA 1BFNA 3CPUA 3WNOA 4AD0A 1XH1A 3OGVA 4RE3A 4IUGA 3FY1A 1GOKA 3ARTA 1CDGA 5CSUA 2GSJA 4D1IA 2Y4SA 4W85A 4M81A 1CEOA 5DO8A 3ZM8A 1XH2A 4QLJA 3SCQA 1R86A 4HPGA 3MUY1 2XPKA 4QP0A 4JAWA 4MJ2A 3WDRA 1NWTA 4NRSA 1JYVA 3DHPA 1TG7A 2BVTA 4M8UA 1K9DA 3WFLA 3K4AA 1C7TA 1UZ4A 1OD0A 3SCSA 3W0KA 2ZXAA 3G6LA 1UWQA 1XV8A 1E70M 4PN2A 2VCBA 2UWFA 2VX7A 3HJEA 1VFFA 4D1JA 5IFPA 4EE9A 1D7FA 4WSKA 2ZUNA 4KRTA 2XVKA 1E1EA 3K46A 4N0RA 2V38A 1E3XA 1B0IA 4HA4A 4U33A 4H8VA 6A3HA 1QHPA 2A3HA 3WUFA 1Q4NX 1CGWA 3L4ZA 4MTVA 1K9EA 4OBRA 4BCEA 1VBUA 3EMCA 5C71A 1GJUA 1ECEA 4W5UA 1RH9A 5JUVA 1CWYA 2WAGA 2YBUA 2BXZA 1BYCA 5A69A 1AVAA 4HU8A 2D24A 4UFHA 4MNLA 1GCYA 4XZWA 2OWCA 1KB3A 3AYSA 3AMCA 3HMCA 1OM0A 1HKJA 1UQZA 1GPFA 4QLKA 4UZSA 4PTVA 1V3JA 5F7UA 2PBOA 4WLCA 1ZJAA 3A47A 1UR2A 3WH6A 3PHAA 2WLZA 1UZ1A 4P7QA 2YA2A 2DSZA 3SCRA 3FHQA 2J25A 4EK7A 2J8FA 1W3LA 4H41A 2OLHA 1DWGM 1UH3A 3CUHA 1UWSA 2W67A 4P7OA 1HF6A 2EXOA 3D5HA 1WDQA 1MW2A 1VBRA 3GXMA 1CXHA 4E8CA 4LGXA 3K8MA 1JIBA 2J74A 2WC7A 1JYNA 4OZOA 7CGTA 3VIHA 3QHOA 2YL6A 1Q6CA 2C8NA 4RE4A 4R5EA 3AISA 3MUAA 1V0MA 1E4IA 1EQPA 3MKKA 1HJXA 3U7BA 1JYXA 3CMGA 1EOKA 2IXVA 2O9RA 1UKOA 3WEMA 3KEHA 4PYSA 4UQDA 4ATWA 3AICA 3GXDA 5IDIA 3NIYA 1GOOA 4L4PA 2WMJA 2X2YA 1V6UA 4AZ5A 1QHZA 3DC0A 4TTGA 2BY3A 2J7GA 4OOZA 3RILA 1JL8A 2VRJA 3IJ9A 3JUGA 1W1YA 4TVDA 1V02E 4ACZB 1GQJA 4URIA 3VIJA 4KRUA 3UG4A 5FD0A 2EPMX 1UKTA 4D6CA 1R85A 1FH9A 1F4AA 4TX6A 4AIEA 3N13A 1HXJA 3VKKA 3VU2A 1WZMA 1W9UA 1CIUA 2A3AA 4ZFMA 5M03A 1HJVA 4MB5A 1PX4A 2CKRA 1U30A 3OLGA 2FGZA 3D3AA 2TAAA 3OGRA 3ALFA 1C92A 2O92A 2PWEA 3WF2A 2ZUWA 1QBBA 5BXPA 3AIBA 4UQAA 4P8UA 2JIEA 3CH9A 3W4RA 1H4PA 5E0CA 4PEEA 2XHYA 3EDKA 3AIWA 2V3FA 1DWAM 1KWKA 3RJXA 4QLLA 3W38A 2PBGA 5M3WA 3I3DA 5A1AA 4NF7A 1VENA 4PRWA 1LL6A 2VI0A 3POHA 3ZMRA 2CERA 3BAIA 4UFJA 3VIMA 1C8YA 2RGMA 2ZUUA 4L4OA 2DSWA 2WVSA 2D0HA 4AZBA 4PMXA 3OG2A 1H1NA 1E43A 1SYTA 3I3EA 2ESCA 2J77A 1LLOA 2VX6A 2BHYA 3AZSA 5CZKA 2YDSA 1UR8A 4HTYA 2XIIA 3AMKA 3QHMA 1H3GA 1DWHM 1UA7A 1PZ2A 4FLOA 3ARYA 3RM8A 5M17A 1W9XA 1OGSA 3ARZA 1R8LA 3WL1A 3GXFA 4B3LA 4Y7EA 3IAPA 4M82A 2VL4A 2WVVB 5LYRA 1EO5A 4UOZA 1R7AA 3WBEA 1NH6A 1PIFA 1WAWA 4W89A 3WNKA 2J79A 4UZUA 4JFVA 3BMVA 1GJWA 4P8VA 4UOQA 4CU7A 5A94A 4AY1A 3T2OA 4V2XA 1IZJA 2V5CA 1B3VA 6CGTA 4JL1A 1C3FA 4AWEA 3K4DA 1ITXA 5CGTA 2Y2WA 5I77A 1OSEA 3CUFA 1BYBA 2XUCA 3PZIA 4D6HA 4LYQA 1EDQA 3W27A 3VTRA 3L4VA 2YL9A 3WD0A 2J7CA 4BQ4A 1EDGA 1Q6GA 1LF1A 1W9BM 3UCQA 2G41A 4DWSD 1J0JA 1NARA 1K9FA 1TCMA 2XVPA 1VFOA 1KBKA 1VJSA 1BSIA 5I78A 3THCA 5KZ6A 1PEZA 4TTUA 1XD1A 4WIWA 4GO9A 1BG9A 4ATDA 3VM7A 1QW8A 1UKQA 2BVYA 1UD4A 2DSUA 1GOWA 2VZUA 1UD2A 3HN3A 1UYQA 1UD6A 4E8DA 1NOWA 1QI3A 3ZSTA 5GNZA 1FP8A 2X0HA 3CIVA 4PMQA 4XB3A 4CN4A 1M03A 4OBSA 5BRPA 3BAXA 5CLTA 1FOBA 1GOMA 2BV9A 1NM9A 3VIKA 2EBNA 4PMVA 3CGTA 5AYBA 3T0BA 4H7VA 2W5FA 3VD4A 3FXYA 3WNNA 1I1WA 4QCEA 1KGXA 5I6SA 2WC3A 2FHCA 1HKKA 3U5YA 3MUIA 1W2PA 1I75A 3AIVA 3RM4A 4W7WA 4UOJA 1EHAA 3CTTA 1GW1A 1H09A 3VINA 3APGA 2XVLA 4W7VA 3RMEA 5BWFA 1J10A 3TONA 4BA0A 1NOFA 5D4YA 4AZCA 1JFHA 1AQHA 5D9PA 5EFDA 2EO7A 4CGTA 2VMFA 1K6AA 2DT2A 3UERA 1V02A 4W93A 3BLPX 3F5JA 4PMDA 5A6KA 2WANA 3VGGA 1QNPA 1TVNA 4H04A 4AZIA 4AYSA 3BAKA 1HNYA 1VAHA 1WCGA 3NDZA 3NSMA 1G5AA 2CBJA 3A4WA 2GJXB 4D72A 3CHCA 2F61A 3WH9A 3ARXA 3WQ4A 1LL7A 4PMNA 3VIFA 4C7GA 1KWGA 2JEQA 2AMGA 1W91A 2XYLA 3VMOA 3GDBA 2BNJA 3VMPA 2DIJA 2WMIA 4DWSA 3AJ7A 2AOSA 1V0NA 2BHUA 2DDXA 2GFTA 2UY3A 1CXFA 2YA0A 2CPUA 3W6MA 5JBDA 2CESA 4MAZA 1TE1A 4KMQA 4FF5A 4TUFA 1JDCA 2GDVA 4J3WA 4CU6A 2W62A 3BMWA 2VVSA 1JZ7A 1UR4A 1B3YA 3BC9A 5CG0A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1EO7 A;  2QF8 A;  2E9L A;  5FCZ A;  3IAN A;  2EPK X;  1GNX A;  3GNO A;  3AHT A;  3N12 A;  3B9A A;  3A4A A;  3WL0 A;  1U2Y A;  4Z2I A;  2CKS A;  3W28 A;  3CZJ A;  2UY4 A;  4NI3 A;  1XSK A;  4U5I A;  1FH7 A;  2W66 A;  2ZXD A;  3CLW A;  2YLA A;  1UH4 A;  2GJX A;  2C0H A;  2X09 A;  6TAA A;  3EMQ A;  5A8O A;  5A95 A;  1QHO A;  3GZA A;  3MSD A;  5GQB A;  4ZEN A;  1QBA A;  1WO2 A;  2WWD A;  4A4A A;  3WKZ A;  1HJS A;  1R7O A;  2JAL A;  4Z2G A;  1UKP A;  1BGG A;  1JG9 A;  1W9D M;  2XFR A;  5M5D A;  3WF1 A;  2DGA A;  1HJU A;  1CGY A;  2ZIC A;  5CSY A;  3ZIZ A;  3GM8 A;  4XZB A;  2EEX A;  3OLE A;  3SUV A;  2E0P A;  2Y24 A;  4W8B A;  1EXP A;  4D6E A;  2XM2 A;  2PB1 A;  3NUK A;  3WDJ A;  1XH0 A;  1WDP A;  1PX8 A;  2GUY A;  3S2C A;  4RL3 A;  3VUP A;  3ZJ6 A;  3F5K A;  1I1X A;  3WUG A;  1ISV A;  4ZEP A;  2JF6 A;  1WZL A;  1ISX A;  3ZT7 A;  1OB0 A;  1VF8 A;  3WMC A;  5BXR A;  4HMC A;  1ZL1 A;  1ZBC A;  5HNN A;  3BAY A;  4MNJ A;  1QNR A;  1HVQ A;  1EDT A;  2DH3 A;  2WHM A;  5CPQ A;  2YIH A;  4AW7 A;  3LPF A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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