3AIVA

Crystal structure of beta-glucosidase in rye complexed with an aglycone dimboa
Total Genus 186
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
186
sequence length
486
structure length
486
Chain Sequence
VFTKLKPWQIPKRDWFSKDFLFGASTSAYQIEGAWNEDGKGPSTWDHFCHTYPERISDGTNGDVAANSYHMYEEDVKALKDMGMKVYRFSISWSRILPNGTGKPNQKGIDYYNNLINSLIRHGIVPYVTIWHWDTPQALEDKYGGFLDKQIVNDYKYFAELCFQSFGDRVKNWFTFNEPHTYCCFSYGEGIHAPGRCSPGLDCAVPEGDSLREPYTAGHHILLAHAEAVELFKAHYNKHGDSKIGMAFDVMGYEPYQDSFLDDQARERSIDYNMGWFLEPVVRGDYPFSMRSLIGDRLPMFTKEEQEKLASSCDIMGLNYYTSRFSKHVDISSDYTPTLNTDDAYASSETTGSDGNEIGPITGTYWIYMYPKGLTDLLLIMKEKYGNPPIFITENGIADVEGDPEMPDPLDDWKRLDYLQRHISAVKDAIDQGADVRGHFTWGLIDNFEWGSGYSSRFGLVYIDKEDGNKRKLKKSAKWFAKFNSV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Beta-glucosidase
publication title Active-site architecture of benzoxazinone-glucoside beta-D-glucosidases in Triticeae
pubmed doi rcsb
source organism Secale cereale
total genus 186
structure length 486
sequence length 486
ec nomenclature ec 3.2.1.182: 4-hydroxy-7-methoxy-3-oxo-3,4-dihydro-2H-1,4-benzoxazin-2-yl glucoside
pdb deposition date 2010-05-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3aivA00
4JFVA 4R27A 5I78A 2QV4A 3BSHA 1CXEA 4MTVA 4JCLA 1O6IA 2PB1A 3CHDA 4CU7A 1E6ZA 4E8DA 3EDFA 1Y7VA 1TMQA 1SYTA 3VM5A 1NWSA 3K46A 2DT2A 1GPFA 3GBEA 5M3WA 2XGIA 2YL9A 4JHOA 4JCMA 3MSGA 3AJ7A 1V3JA 4WLCA 1DWHM 2UY2A 3EDKA 3WMSA 2D0FA 6TAAA 2G3IA 3AXIA 1HX0A 5HNNA 2G3MA 1GORA 2FHBA 1GQIA 4HP5A 3VKKA 3WEMA 4MNJA 1HJXA 2VTFA 3NUKA 4YN5A 3S2CA 1EOMA 1G9HA 4Q7NA 5CLTA 1EDGA 2WCAA 1WP6A 2ZUVA 4W85A 1W3HA 1LWHA 1XRVA 3GNOA 3WF2A 1UD2A 2WPGA 3K8KA 3UR8A 1LJYA 1W2PA 1EHNA 4CCDA 2ZUNA 5E6ZA 4FLOA 2XFRA 4J3WA 4QDMA 1E1FA 9CGTA 4UFKA 4D6IA 3BAKA 1GOWA 4JIEA 1H2JA 4WF7A 4P7OA 3WQWA 4B9YA 1D2KA 1WDSA 1C3FA 3MS8A 3A4WA 2WW5A 1LG1A 2ZXQA 1H0IA 1V0KA 5M03A 4ACZB 1VAHA 1C7SA 2WBGA 2WMGA 1BVNP 3EDEA 1UZ1A 2ZX7A 3QOKA 4HU8A 4PTXA 1E55A 1KBBA 3NCOA 2WLYA 1J0IA 1DTUA 4UQEA 2D22A 1EDQA 1HJWA 2CYGA 4RE2A 1NM9A 2V5DA 1X1NA 3IJ9A 2ZIDA 3WUBA 1V6VA 4N0RA 5FCZA 2GVYA 1XH1A 1XD1A 3G6MA 3SCRA 1R7OA 4UTFA 4D6EA 3BAYA 4CD7A 3AS1A 1QHOA 2QLYA 1E15A 1W91A 5JUVA 2ZE0A 3D5HA 1CBGA 3HJEA 2PI6A 1BPLB 1LL4A 4Z2LA 2MANA 1JGIA 3VGBA 2CHNA 4HZ8A 2ZX6A 3CUIA 3AMDA 4DUXA 5DFAA 5ABFB 2YA1A 4AD2A 2XWDA 1VJSA 2O9TA 5I3DA 4XUYA 4PMQA 1OGBA 3WNNA 2PBOA 1WCGA 3FAWA 3WDRA 1D7FA 5D4YA 3MMUA 4LQ1A 4F66A 3CZEA 3B9EA 3WNOA 1QI3A 1L0PA 2GSJA 2XJ7A 4W8LA 3F5LA 3GXMA 3VMPA 1NARA 2GK1A 1QI0A 4M8UA 3AISA 4B3LA 2Q8XA 1ECEA 3ZO9A 2WMHA 4D72A 2J7HA 2E8ZA 2ZX8A 4R5EA 2WMKA 4PTVA 3OA5A 4JZ5A 2J47A 3N12A 1C8YA 4KGJA 1FFQA 3RCNA 4JL1A 3ZR6A 1OGSA 1V3KA 3RDKA 1EHAA 3SUSA 3T2QA 2OLHA 1HNYA 1WNOA 3A3HA 4OOUA 2AMGA 1JD9A 2J7DA 1JZ8A 2VR4A 3AICA 5AC5A 3VTRA 1OWQA 1SMDA 3GDBA 1V6XA 4WKFA 1HIZA 4HMDA 4P8UA 3WUEA 2VZVA 3IANA 4P8XA 2OYKA 1V6YA 4QCEA 1K9FA 1E43A 1GW1A 1QNOA 3M6DA 2WKGA 1C8QA 1JXKA 4W7VA 2W62A 1KQZA 1OT2A 2VURA 3TONA 3POHA 1UQZA 2TAAA 3L4UA 3ZOAA 1C93A 5DEZA 3AHYA 4PUEA 3AMKA 5D8WA 1CLVA 4HMEA 4CKQA 2HISA 4UQDA 1UKTA 2BFGA 1XH0A 3SUTA 3N13A 3ARTA 4OZOA 3CMGA 4MDOA 2Y4SA 3CZJA 1AQ0A 1PJ9A 3IK2A 3F5JA 2E0PA 3WY1A 4W87A 1UUQA 4TX8A 3SCVA 1JZ4A 2V3EA 2YIHA 2X09A 5CG0A 3W27A 3W53A 4BZYA 3WQ4A 1BG9A 3FNDA 4NZCA 1NOWA 3CTTA 6A3HA 3WF3A 3B8SA 1FA2A 3NDZA 4AEEA 2WZEA 5E0FA 3NYDA 4U33A 2C8NA 1BYBA 3MO4A 1G5AA 1TFVA 4PCTA 2J7BA 2UY4A 3VD4A 1UR8A 1TE1A 2A3AA 2EBNA 2BY1A 4JFTA 1ISVA 2C7FA 3G6LA 3SCOA 1YHTA 1J18A 1W1TA 3T0BA 2ZOXA 1OIFA 2WMIA 4PYSA 1UD8A 1QVBA 4PUDA 3UG4A 5IDIA 1CDGA 1BYDA 3VIJA 3OZOA 5I23A 1V08A 1JIBA 2W67A 2QHAA 4UFMA 4EKJA 2QMJA 1K9TA 3IJ8A 2ZXBA 3QR3A 4D6JA 3N17A 4JFSA 2OWWA 2JIEA 2Y8VA 3UCQA 1JYXA 1WE5A 4XZWA 2BXYA 2A3BA 2WHKA 1MWOA 3IAQA 2ESCA 4GI9A 1E71M 2CIPA 1I75A 4E2OA 3II1A 1K9EA 2D2OA 3BH4A 2CKRA 4W5UA 1CIUA 4HZ7A 3RM8A 4P7LA 2VX4A 2Y8KA 2JALA 3VGFA 2DSKA 4CVUA 3WF1A 4E8CA 3QOMA 2E4TA 5CJ5A 3HMCA 3ARYA 1VBUA 2WYSA 4U2ZA 1NQ6A 3WDIA 1WDQA 2EPKX 5A6JA 4ZE4A 4AMCA 2EJ1A 1LF1A 3T2PA 3CZ8A 1JF5A 3BLKA 5E9AA 3APGA 4P7QA 4W84A 2UWFA 1R85A 1ODZA 1BFNA 1WZAA 4V28A 2O92A 4UZSA 1GVYA 3POCA 1BYCA 1F4HA 3AI0A 3KL5A 3WEOA 1CTNA 2FDMA 4U31A 1A47A 4PMOA 4D6DA 2Y24A 1KGWA 4J27A 5A8QA 5IXEA 2RGMA 4A3YA 3U7VA 3WH9A 3AIQA 2VL4A 3WKZA 2OSYA 1KBKA 3A4AA 1MW2A 2O9OA 4LYQA 1GOMA 7TAAA 1X6LA 4UQBA 4IISA 1E3XA 4JFUA 4MB4A 3CUJA 4DWSC 5IHRA 3BCFA 1BGGA 2WVUA 3AZSA 3ZT7A 4OOZA 3PZIA 5HOSA 1TA3A 1NOFA 1PAMA 3A4XA 4HMCA 2GDUA 2IXVA 3AIVA 1U33A 4UQAA 4A3HA 3VDHA 2DSVA 2CCRA 3TOPA 2YA2A 4KH2A 4AZIA 3ARZA 3GH7A 3PTMA 4X0NA 4AZ5A 2WVVA 5A69A 2FH8A 1ZBKA 2A3EA 4JKMA 2DPEA 2VI0A 2YJQA 1TUXA 2YLAA 3CGTA 1GOKA 2VT0A 1HT6A 3O9NA 4JKLA 1XC6A 4HU0A 2XSBA 5AY7A 8A3HA 1ZBWA 2PWDA 3MMDA 4PSRA 1VFMA 4TVUA 2BY2A 2WANA 1V6UA 2Y5EA 1BVZA 4AZCB 1E3ZA 1FH7A 4NF7A 3M46A 3CZKA 2J77A 2Y2WA 4IPNB 1QOXA 2BY3A 1KCLA 1QBBA 1XYZA 3AS3A 1B30A 3ARQA 3VVGA 5CPQA 3LPFA 3WMCA 2HVMA 2F2HA 3PHAA 1VF8A 5A6LA 3L4VA 2VVNA 1FP9A 1Q4NX 1JDCA 1OIMA 1UHVA 4NI3A 3GH5A 1RPKA 1UR0A 4PTWA 1AQMA 4JFWA 3EDJA 2E9MA 4HZ6A 4RE4A 3RMEA 1CXKA 4UFIA 1S46A 1AVAA 4PEEA 4WSJA 3WELA 1H1NA 3AIRA 1J9YA 4N42A 2NT0A 1KQYA 3CH9A 3KEHA 4Z2IA 5JIPA 1QHPA 8CGTA 1DWGM 2E3ZA 1JF6A 1MW3A 1HJQA 3W0KA 1FOBA 4ATWA 1E6PA 2XVGA 1GQJA 1VFFA 3ZSTA 1W9XA 3AHZA 2ZXDA 5FOOA 4HPGA 1IZKA 3J7HA 5GNXA 5AC4A 2E9LA 4OIFA 5FIPA 4NRSA 2EPNA 1QI4A 2GJPA 3VD3A 5A2CA 1J0KA 2OWCA 1E5NA 1OINA 1HKIA 4TX6A 3D3AA 2VX5A 1XYFA 3CHFA 4PBGA 2XVLA 4D6CA 1V6WA 3VMOA 5A95A 4HOZA 4CCCA 1E73M 3MUY1 4C7FA 1UD6A 3BSGA 1UWQA 3WF4A 1UH4A 2OSXA 1BF2A 3L4YA 1E6RA 3A6OA 4DUVA 3BC9A 1H11A 3U57A 1EO7A 2CBVA 3CZGA 3AOFA 3VDBA 4B16A 1XSKA 2J79A 5I0DA 2RGLA 3KZSA 2XFFA 1GVIA 4AIOA 3N11A 3UESA 3AYSA 1CXLA 1QNPA 4MNKA 2CXGA 4J3VA 4H41A 1B1YA 3RO8A 4XX6A 1JNDA 1X6NA 5A6BD 4MADA 1YQ2A 1HP5A 3RM4A 1NP2A 3PZUA 2CESA 1JZ5A 1VEPA 4EANA 4UFJA 4CN6A 2F61A 4AW7A 5BROA 1J0YA 2J7GA 4F8XA 5I5RA 3WH7A 4LX4A 1UG6A 2CPUA 5JBEA 4MAVA 5M5DA 2JFEX 3ARPA 4DWSB 1PEZA 3WEZA 1J10A 1CGVA 3VUPA 2D24A 3PTQA 2WM0A 4LYRA 2WC3A 2WXDM 5BXPA 3RJXA 2WLZA 1C7TA 5EFFA 3W24A 3OG2A 2ZUMA 3BAXA 2JF7A 1W3LA 4GO8A 1HF6A 4BF7A 1XD0A 1JL8A 4W8AA 4UFHA 1M7XA 5A8MA 3VM7A 2JEPA 3KL0A 3NIYA 3T0DA 1U30A 1QI2A 1BSIA 3VINA 5BCAA 1TZ7A 4D1IA 1OD0A 3GYCA 3AZTA 2V5CA 2D3NA 1VFOA 5A6MA 1P6WA 1ESWA 4HOXA 5TD4A 5A3HA 1JG9A 1B3WA 1B3XA 1E72M 1Q6GA 2GJRA 1OD8A 1TVNA 2WCGA 1W9DM 2XFYA 2PWHA 3NSNA 3K4AA 5CSYA 4PSPA 2PWFA 1PZ3A 3VD7A 3WQ6A 1JYNA 4W7UA 1V02A 4J3UA 3ZQ9A 1Z32X 1MQPA 2XVPA 3PZMA 3WD4A 1E5JA 1ZJAA 3NDYA 4M1RA 4V2XA 3VIPA 4WKHA 1BG4A 1HVQA 4MPKA 3VDAA 4ATLA 2VC9A 3AS2A 2FH6A 4AD4A 3OLIA 2QPUA 2GJXA 3N9KA 1UWUA 1U2YA 1E6QM 3I3BA 4FF5A 3W6LA 3OLDA 3ZR5A 1KB3A 1OB0A 1WB0A 4D6FA 1ZU8A 1BTCA 1CZ1A 1PBGA 3AIBA 3GNRA 2J7CA 4OBSA 1WDRA 4C7GA 3PZQA 1XCWA 2PF0A 5A8OA 1R8LA 4UOZA 1LL6A 2CETA 1E4MM 1E6SM 3WQVA 3RIKA 1E70M 1QW8A 1C92A 2UY3A 3CHEA 3SIMA 3AS0A 3VD9A 2VZTA 1Q6EA 5JBFA 1V02E 1UOKA 1V3MA 4GQRA 1B0IA 4TUFA 3AIEA 4UFLA 5GNYA 4CVWA 4RE3A 3K4DA 1V0MA 3W29A 1DWAM 4XB3A 2CNCA 2W91A 3VO0A 1JNEA 5M17A 2WHLA 1VBRA 4Q22A 1EGZA 1GOOA 5DT7A 5A1AA 1ISYA 3PZVA 1W32A 1V3IA 4W5ZA 3WDPP 1UWRA 5KZ6A 4Y7EA 3CBWA 4J3SA 2VZSA 1FHLA 5BXTA 4XZBA 3ARSA 1J12A 2CKSA 2D0HA 1QHZA 5GQBA 4AZ6A 3UEQA 3BXWA 3WMBA 3BLPX 1CYGA 1DP0A 5GPRA 4J3TA 3VX0A 3THCA 4UQ9A 3K1DA 5A2BA 3DYPA 1QPKA 1VENA 1JAKA 5KEZA 1GJWA 4ZXLA 1PX3A 5A2AA 1ZS2A 3W28A 2J8FA 3MKKA 3ZJ6A 1OT1A 4LYPA 3NSMA 1QNRA 2VX7A 3GBDA 2GDVA 5BWFA 4W86A 1XHGA 2VQUA 3WDHA 4GINA 3DHUA 4URIA 3BMWA 3SUVA 1LQ0A 2VNCA 2ZUWA 3AXXA 4OJYA 1M01A 3VGEA 1RH9A 1HP4A 1H49A 3E1F1 2ZX5A 3WH6A 3ARRA 2O9RA 4L4PA 2WMFA 3EYPA 1PX4A 3N1AA 4GZEA 2YDQA 4UNIA 3L4TA 1MVYA 3ARVA 3U5UA 1EH9A 2X05A 2V3DA 4BQ5A 3DYOA 1TVPA 2ZWYA 4ZE5A 4F79A 1VFUA 5BRPA 3SCUA 3ZJKA 2F8QA 5F7UA 2AOSA 2X1IA 1I1XA 4X9YA 1KWGA 4H8HA 2G3JA 1XCXA 2OWXA 5DMYA 3CUHA 1AQHA 3CLWA 2ZUUA 5LA2A 3VILA 3TTQA 1HJVA 2X2YA 5GNZA 3IJ7A 2XTKA 3GNPA 4ACYA 1JYVA 1MW0A 3FHQA 2XVKA 4AD3A 4HA3A 1CGTA 3DHPA 1HKMA 5I2UA 1UKPA 5A8NA 3VOCA 2OYLA 3OBAA 1CECA 2DH2A 2VRJA 2NSXA 4PN2A 5A94A 1FH8A 2VO5A 4FLQA 1W9BM 4MDPA 4MB1A 3LPOA 3VGHA 3OB8A 1FFRA 5ECUA 3AIUA 5EBAA 2G41A 1NWRA 3BAJA 5CGTA 1FH9A 3L4WA 1R87A 3VIMA 3WIJA 2Z1SA 4BQ3A 2BNJA 2E40A 1GOIA 2EO7A 4FMVA 3O6AA 4Z2JA 1CGUA 1ITCA 1JI1A 4U5KA 1DWFM 2WHMA 1JZ7A 4ACZA 3OZPA 4W93A 4QLKA 3ECQA 1R86A 3VIHA 2CHOA 3MU7A 4U3CA 4OKDA 3PBGA 4PCSA 5LYRA 2J78A 2V3GA 1LWJA 1Q6CA 5BRQA 1KXVA 1VEOA 3QHOA 3GTNA 3AYRA 3OLGA 4DM1A 1W9PA 1BLIA 1PIFA 3K8LA 1W1YA 2DSWA 2XM1A 5IFPA 3AIWA 5ABEA 1LLOA 1XGZA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4JFV A;  4R27 A;  5I78 A;  2QV4 A;  3BSH A;  1CXE A;  4MTV A;  4JCL A;  1O6I A;  2PB1 A;  3CHD A;  4CU7 A;  1E6Z A;  4E8D A;  3EDF A;  1Y7V A;  1TMQ A;  1SYT A;  3VM5 A;  1NWS A;  3K46 A;  2DT2 A;  1GPF A;  3GBE A;  5M3W A;  2XGI A;  2YL9 A;  4JHO A;  4JCM A;  3MSG A;  3AJ7 A;  1V3J A;  4WLC A;  1DWH M;  2UY2 A;  3EDK A;  3WMS A;  2D0F A;  6TAA A;  2G3I A;  3AXI A;  1HX0 A;  5HNN A;  2G3M A;  1GOR A;  2FHB A;  1GQI A;  4HP5 A;  3VKK A;  3WEM A;  4MNJ A;  1HJX A;  2VTF A;  3NUK A;  4YN5 A;  3S2C A;  1EOM A;  1G9H A;  4Q7N A;  5CLT A;  1EDG A;  2WCA A;  1WP6 A;  2ZUV A;  4W85 A;  1W3H A;  1LWH A;  1XRV A;  3GNO A;  3WF2 A;  1UD2 A;  2WPG A;  3K8K A;  3UR8 A;  1LJY A;  1W2P A;  1EHN A;  4CCD A;  2ZUN A;  5E6Z A;  4FLO A;  2XFR A;  4J3W A;  4QDM A;  1E1F A;  9CGT A;  4UFK A;  4D6I A;  3BAK A;  1GOW A;  4JIE A;  1H2J A;  4WF7 A;  4P7O A;  3WQW A;  4B9Y A;  1D2K A;  1WDS A;  1C3F A;  3MS8 A;  3A4W A;  2WW5 A;  1LG1 A;  2ZXQ A;  1H0I A;  1V0K A;  5M03 A;  4ACZ B;  1VAH A;  1C7S A;  2WBG A;  2WMG A;  1BVN P;  3EDE A;  1UZ1 A;  2ZX7 A;  3QOK A;  4HU8 A;  4PTX A;  1E55 A;  1KBB A;  3NCO A;  2WLY A;  1J0I A;  1DTU A;  4UQE A;  2D22 A;  1EDQ A;  1HJW A;  2CYG A;  4RE2 A;  1NM9 A;  2V5D A;  1X1N A;  3IJ9 A;  2ZID A;  3WUB A;  1V6V A;  4N0R A;  5FCZ A;  2GVY A;  1XH1 A;  1XD1 A;  3G6M A;  3SCR A;  1R7O A;  4UTF A;  4D6E A;  3BAY A;  4CD7 A;  3AS1 A;  1QHO A;  2QLY A;  1E15 A;  1W91 A;  5JUV A;  2ZE0 A;  3D5H A;  1CBG A;  3HJE A;  2PI6 A;  1BPL B;  1LL4 A;  4Z2L A;  2MAN A;  1JGI A;  3VGB A;  2CHN A;  4HZ8 A;  2ZX6 A;  3CUI A;  3AMD A;  4DUX A;  5DFA A;  5ABF B;  2YA1 A;  4AD2 A;  2XWD A;  1VJS A;  2O9T A;  5I3D A;  4XUY A;  4PMQ A;  1OGB A;  3WNN A;  2PBO A;  1WCG A;  3FAW A;  3WDR A;  1D7F A;  5D4Y A;  3MMU A;  4LQ1 A;  4F66 A;  3CZE A;  3B9E A;  3WNO A;  1QI3 A;  1L0P A;  2GSJ A;  2XJ7 A;  4W8L A;  3F5L A;  3GXM A;  3VMP A;  1NAR A;  2GK1 A;  1QI0 A;  4M8U A;  3AIS A;  4B3L A;  2Q8X A;  1ECE A;  3ZO9 A;  2WMH A;  4D72 A;  2J7H A;  2E8Z A;  2ZX8 A;  4R5E A;  2WMK A;  4PTV A;  3OA5 A;  4JZ5 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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