3AIWA

Crystal structure of beta-glucosidase in rye complexed with 2-deoxy-2-fluoroglucoside and dinitrophenol
Total Genus 188
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
188
sequence length
486
structure length
486
Chain Sequence
VFTKLKPWQIPKRDWFSKDFLFGASTSAYQIEGAWNEDGKGPSTWDHFCHTYPERISDGTNGDVAANSYHMYEEDVKALKDMGMKVYRFSISWSRILPNGTGKPNQKGIDYYNNLINSLIRHGIVPYVTIWHWDTPQALEDKYGGFLDKQIVNDYKYFAELCFQSFGDRVKNWFTFNEPHTYCCFSYGEGIHAPGRCSPGLDCAVPEGDSLREPYTAGHHILLAHAEAVELFKAHYNKHGDSKIGMAFDVMGYEPYQDSFLDDQARERSIDYNMGWFLEPVVRGDYPFSMRSLIGDRLPMFTKEEQEKLASSCDIMGLNYYTSRFSKHVDISSDYTPTLNTDDAYASSETTGSDGNEIGPITGTYWIYMYPKGLTDLLLIMKEKYGNPPIFITENGIADVEGDPEMPDPLDDWKRLDYLQRHISAVKDAIDQGADVRGHFTWGLIDNFEWGSGYSSRFGLVYIDKEDGNKRKLKKSAKWFAKFNSV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Active-site architecture of benzoxazinone-glucoside beta-D-glucosidases in Triticeae
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Secale cereale
molecule keywords Beta-glucosidase
total genus 188
structure length 486
sequence length 486
ec nomenclature ec 3.2.1.182: 4-hydroxy-7-methoxy-3-oxo-3,4-dihydro-2H-1,4-benzoxazin-2-yl glucoside
pdb deposition date 2010-05-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3aiwA00
3MUIA 4H2CA 3CPUA 3ARTA 3CZLA 1W3LA 3VNZA 2Y4SA 4HMCA 2WCAA 5I78A 4UFLA 2J8GA 1JI1A 3WDPP 2D20A 5FKYA 1KR1A 3D5HA 4D1IA 1WZAA 3A4XA 1ISYA 5ABFB 3WBAA 2WMHA 1PIGA 3WF1A 4DWSB 1MWOA 2J7CA 3UG5A 1TG7A 1EA9C 1U2YA 2VCBA 3O9NA 3ARXA 3I3DA 3WNNA 3VOCA 1UZ4A 1EDTA 1EIBA 1UYQA 1QVBA 2A3EA 3O6AA 3W4RA 2TAAA 1DWJM 1OD0A 1EHNA 2BNJA 1B3ZA 2J74A 3SCUA 3VGEA 3THDA 1LG2A 2VOTA 4M82A 1E5NA 5HNNA 5BROA 3T0BA 1BYAA 4MB5A 1QI3A 2ZX9A 1IV8A 1BGGA 1BF2A 3VDAA 1OGSA 4HMDA 3DHUA 1GORA 1FHLA 1O7AA 2F8QA 4J7RA 3AMLA 1HJXA 5FL0A 1ZBWA 2ZOXA 4HA1A 4CU7A 4IISA 4N42A 3OIHA 1H0GA 4HOZA 1W2PA 3BMVA 2O9PA 1JAKA 4B3KA 4LYRA 1G94A 4KRTA 1EH9A 4D6DA 2XVKA 2V5CA 4JKMA 5C8BB 1VBRA 1V0MA 1WPCA 1DWGM 1J11A 5A95A 2WVTA 4RE4A 1E6QM 4W88A 1B9ZA 1QNRA 1OB0A 1RP8A 3GBEA 2W91A 3SUTA 3U5UA 3VKKA 3N13A 1X6NA 4Z2JA 2ZWYA 3W38A 4HA3A 3D3AA 4GQRA 1HXJA 1J0IA 3VIMA 2VQUA 3WEZA 3RJXA 3T08A 3WNLA 1E3ZA 3RO8A 1WNOA 4URIA 1QPKA 3MKKA 1ITCA 3L4TA 4F9JA 3WD3A 3FXYA 3ZOAA 4AIEA 4UQCA 3FAXA 3W81A 1FOBA 1K9EA 5ABEA 3WUEA 1E6ZA 2VO5A 4AWEA 3EMQA 1XV8A 5DMYA 5BRPA 3AHYA 3U7VA 5EFDA 2GJRA 3TTQA 1E5JA 4CU6A 1UZ1A 1WP6A 4AZBA 3AICA 1JZ2A 4AD3A 3F5LA 2FH8A 1TZ7A 3FNDA 1OD8A 3IJ8A 3UG4A 5I3DA 2WZEA 1NM9A 2D23A 3GXIA 4AIUA 3SCVA 4DUWA 1MXDA 4JL1A 5HDRA 4WKHA 2GJXB 3AROA 4J3XA 4F66A 2XVPA 3AI0A 4P7RA 3B9AA 3W27A 5CXPA 5HPOA 4BA0A 2CPUA 3BSHA 1N82A 3CZ8A 3L4UA 5E70A 5D8WA 1EOKA 3GNRA 1GOMA 1ZBVA 1NOFA 3PZMA 2OSXA 4JCMA 1CXEA 4HOXA 1QI2A 3KL5A 5EMYA 1KFWA 1FH9A 1CGTA 4TTUA 5M17A 1CECA 2CERA 1C8YA 1NP0A 5LA2A 5LYRA 2F61A 2PWFA 2OWCA 1R7OA 4CVUA 4JZ5A 2WANA 3PZNA 1R8LA 2XTKA 3BAIA 4J3TA 3DYOA 4MB3A 1BYCA 2V3DA 2XWEA 5A6LA 2DIEA 4HZ7A 1JG9A 1NWUA 1NWSA 1I75A 2BV9A 2WBKA 4CCCA 5JIPA 3TA9A 3AIWA 5LA0A 1GVYA 3U57A 1ESWA 4AW7A 3RM8A 4E8DA 1MQQA 5IXEA 1ITXA 3WL1A 1UQYA 3WEMA 1E1FA 4ZXLA 3T2OA 3A47A 1VRXA 4M80A 2WM0A 1WDQA 1V6XA 1E6SM 3VPLA 5FOOA 1IZJA 1VEOA 3UETA 1J0YA 1MFUA 4JFVA 3LPGA 3VIKA 3UR8A 5A6AA 4HA4A 1V0LA 3W0KA 5E0FA 3VO0A 1G01A 1LF1A 1KGUA 1BLIA 5CGMA 1HKJA 2Z1KA 2ZWZA 4ML4A 3CUGA 1OIMA 4HPGA 1HJWA 2VRKA 3HN3A 3CHEA 4JFTA 3WFZA 4AIOA 1CDGA 1TUXA 1CYGA 1M7XA 2FH6A 1GQJA 2CKSA 3VGDA 2PWHA 4PCTA 4JFWA 4BQ5A 1ODZA 2Q8XA 2BVTA 2VUYA 4PMVA 2WWDA 2V3EA 4UOZA 1KCKA 2GK1A 2W4XA 5AC4A 1UKPA 1H2JA 4E4PA 1V3JA 3W82A 1HKMA 1W1YA 1G1YA 3CZGA 4CD7A 1MW0A 4OKDA 1R87A 5IFPA 3VGFA 1C8XA 1P6WA 1JNEA 3UERA 1CLVA 3ARPA 5JBEA 4JL2A 3RCNA 4TVDA 2DDXA 1E73M 4DM2A 1LG1A 3WD2A 1OSEA 4FLRA 2CBVA 2BVDA 3N12A 3SEPA 5A6JA 1X1NA 2VC9A 3WD4A 4PMOA 2NT1A 5A94A 3PZTA 3MSGA 1EHAA 2JIWA 3GBDA 2VNCA 5D9OA 3IAPA 3WDQA 2FHBA 3ARZA 1DHKA 2J7HA 3K8LA 4MJ2A 3M46A 2XVNA 1JDCA 4P8XA 1HKIA 4AXNA 1KR0A 3VD5A 2YLAA 1UWRA 2WPGA 4BCEA 4FLQA 1M04A 1A47A 2DH2A 2XIBA 2IXUA 5GPRA 1XD1A 2VZOA 5CPSA 1E9LA 2WVSA 1J12A 2E9LA 3OA5A 2PC8A 3CZJA 3EMCA 2CYGA 2CESA 5DFAA 1UR2A 4C7DA 3SCNA 2DSKA 1B3WA 1DTUA 3CO4A 4JKKA 2X1IA 4MJ4A 2FGLA 4H41A 3VILA 1W1TA 1J0ZA 5DO8A 3WUBA 2YKKA 1KXVA 5BXPA 1FA2A 2YIHA 1QHZA 5DT7A 3VDHA 1XYFA 3W25A 1E6PA 4QAWA 3IAQA 3ZJ7A 2FDMA 5KZ6A 3G6LA 3U5YA 1UH3A 3W29A 1VB9A 3A3HA 2XFFA 3BAXA 3WF0A 4AZ7A 3ARUA 3EDDA 1V3MA 4WKAA 4PMUA 2YA2A 1QHPA 4MAZA 1E0VA 1UWSA 2OYLA 1JL8A 4OZOA 3DECA 1W9DM 4UZSA 1FFRA 4FF5A 3MUZ1 1UA3A 3CBWA 4U3CA 4DUXA 4W93A 5CSUA 2WVUA 4PSRA 5BXRA 1WAWA 2CHOA 4ATDA 2DT0A 4YPJA 7A3HA 4J27A 4CD5A 4GZIA 6A3HA 4QP0A 3IJ7A 1EDGA 3DHPA 3WSUA 3WF3A 1IT0A 3QHOA 4NRRA 1GHRA 2WMJA 1NOUA 2ZX8A 1UD8A 3MUY1 1J0JA 2JIEA 5ABFA 1LL4A 3VTRA 3BC9A 4D71A 2WMIB 4DWSA 1U33A 4JCLA 3OGSA 4MNLA 4UQAA 1J10A 1LQ0A 5CSYA 1ZJAA 4AZ5A 3SUVA 4KWUA 1QI5A 2V3FA 3VIHA 2E40A 3VMOA 3GXDA 4AEEA 9CGTA 3AYRA 4S3JA 2WVVB 2ZUVA 3B9DA 3KL0A 2XHYA 1ZS2A 2PWDA 2VX5A 2NSXA 1XHGA 1Q6EA 1ISVA 1K6AA 4UNIA 4U5KA 1UHVA 1U30A 5ABGA 2A3BA 1PX8A 1CZ1A 4BQ2A 1QHOA 1ISXA 4W5ZA 3K1DA 4OOZA 1YHTA 2WC4A 3BXWA 4PYSA 1GOWA 4U3AA 4DM1A 5FCZA 1JF6A 3A6OA 1QNPA 3VDCA 2PF0A 3F4VA 1W91A 1JXJA 2EJ1A 4GPNA 3WUFA 5CPQA 1AMYA 3KZSA 3WF2A 5HOSA 1E56A 2WSKA 3PZUA 1EOMA 4UQDA 4U2YA 1OCQA 5DF0A 3NUKA 4GINA 1ZL1A 4E2OA 5GNXA 3RPMA 4PMXA 4HOWA 4DWSC 5DEZA 5FL1A 3AS2A 1CXFA 4H8VA 2QLYA 1BHGA 3K46A 1WB0A 2CBUA 2VX4A 3GH5A 4W5UA 3PZIA 3W6LA 2ZXQA 2UWFA 3K8MA 4GO9A 3CMGA 4OBRA 4PTVA 2G41A 2UY5A 5AC5A 1BTCA 4K68A 1TFVA 1GUVA 3QHMA 4FLOA 1CGYA 1LJYA 2J7BA 1E72M 2QMKA 2EPLX 4H8UA 2X09A 1WDRA 4UQ9A 3ZT6A 2X05A 5BCAA 3N18A 3PTQA 1JZ3A 1EDQA 2WCSA 4GO8A 4TX6A 2BFGA 2J7DA 1JYVA 4W86A 4W7VA 3EDEA 2JEQA 2XSAA 2PBGA 1V6YA 2E9MA 5A3HA 4P7LA 2XPKA 2JF6A 3AXXA 2J7FA 2CKRA 2DSVA 4PMZA 3WUGA 3CGTA 2UY2A 6CGTA 3WIJA 1WE5A 3VIOA 4AZCB 3WMSA 3EDKA 1GW1A 2XYLA 1FH8A 4IUGA 1JDAA 5CGTA 4PMRA 2CBIA 3UCQA 1B0IA 5CQ1A 3WH5A 2A3HA 4PRWA 1KWKA 2VR5A 2AOSA 2D3LA 2HVMA 5BWFA 3ZT5A 1CBGA 2Y8VA 3SUWA 2J25A 1W3JA 2W61A 4CCDA 3T2QA 1HKKA 3W24A 5E6ZA 4PSPA 1KXQA 1KCLA 4XV0A 3BAWA 4X0NA 4RE3A 1M01A 1UKOA 2GSJA 4B3LA 3RDKA 2A3AA 2WC3A 5E09A 1GCYA 1GHSA 1WCGA 1E70M 3AS0A 5CPTA 3GXMA 3E1F1 4NSBA 1V3KA 3L4YA 3ZSTA 4XUYA 5M5DA 1V08A 4V28A 4UFMA 4UR9A 1GQIA 2Y8KA 3FY1A 5M3WA 3ARRA 1TVNA 1NH6A 1V0KA 3EBVA 3SCOA 4EK7A 1UR8A 3L2MA 3UEQA 1HL8A 1CGWA 4B15A 3OZOA 1AQMA 2XUCA 3TOPA 1C92A 2XJ7A 4WLCA 3WQ8A 3O2LA 1VIWA 1GQLA 3ZJ8A 3BAYA 4J28A 1KXHA 1DWHM 3ECQA 1V3LA 4PMNA 1CIUA 3CH9A 1V02E 4V2XA 3VU2A 1SR0A 3OG2A 3MV11 5A1AA 3BLKA 3N11A 3OLDA 4YN5A 2DSWA 4HP5A 4Z2GA 2W66A 1VFUA 3AISA 1V03A 2BY2A 2ZUWA 5TD4A 1S46A 1D2KA 1OIFA 2CETA 2QF8A 1GPFA 5A6BA 4YHEA 3RILA 1BAGA 4JKLA 1W32A 3EYPA 1XSKA 1W2VA 3G6MA 3AHTA 1MW3A 1OINA 2DIJA 1E6NA 4PUDA 3ARSA 5I2UA 4IPNB 3LPPA 1XC6A 3ZJ6A 1CWYA 3DYMA 2VX6A 5DT5A 1JZ7A 4XB3A 2JF7A 2CEQA 5FD0A 1VFOA 3POHA 4U2ZA 3VNYA 4Q7NA 1R86A 2G8ZA 5GNZA 5CJ5A 1QNOA 2PBOA 3NJ3A 2VQTA 1MFVA 1ISZA 2D22A 2VURA 1WZMA 1JNDA 4GI8A 3UG3A 2ZICA 5D9PA 2EPOA 1JD7A 4J3WA 5HPCA 3N9KA 2JEPA 2ZUNA 2DPEA 2ZX5A 2V3GA 1KQYA 1QW9A 4W8LA 1DEDA 1JFXA 3LPOA 3F5JA 1UWTA 4Y7EA 3WY1A 3VGGA 3QOKA 4AD4A 4WK9A 1Z32X 3WF4A 1TVPA 5ABHA 2AAAA 1CGVA 4OUEA 2DEPA 2WC7A 3RJYA 1UD3A 3AHVA 3PZQA 1QBAA 3GH7A 3WD0A 3AXHA 4TTGA 1VEMA 2X0YA 4D6HA 4C7GA 2XFRA 4M1RA 3TONA 2O9RA 1WDPA 2O9TA 1FP8A 5JIWA 4ACZB 1B30A 4WSJA 1AQHA 3I3EA 3AMKA 1PZ2A 3MU7A 4AYSA 1CXLA 1C7TA 4UFIA 5JBDA 3VM7A 4PTMA 3ZO9A 1SFSA 1KWGA 5HBFA 3PTKA 5KEZA 3AIRA 3PHAA 5I5RA 2XWDA 4WIWA 5A6MA 4XZBA 1XH0A 4QDMA 3GM8A 1MQRA 1UR9A 6TAAA 1VF8A 1PEZA 4UZUA 5D4YA 5E6YA 3WH6A 4Z2KA 2QHAA 3IANA 4JHOA 1TA3B 3BAKA 1UOKA 3FN9A 5GNYA 3VDBA 2VRJA 2WHLA 1EO7A 1H5VA 2G3IA 3ZIZA 2ZXDA 3QHNA 5HXMA 4R5EA 1F4AA 1JDDA 3LMYA 4CD6A 1TCMA 3K4DA 1BGAA 2ZUMA 3PBGA 1VFMA 1KGWA 4M24A 2E9BA 2WXDM 2YLLA 3QR3A 4NRSA 3W37A 3AZTA 7CGTA 1BG4A 2D24A 3SCRA 3PZ9A 3SCWA 3SIMA 3CLWA 1ZBCA 1UH2A 1HJSA 5AY7A 2OYKA 2Y5EA 1H09A 1PAMA 4HTYA 3EMZA 3WQVA 2EO7A 1G9HA 1HL9A 1O6IA 4QLLA 1UWIA 3WDIA 1J0KA 2VTFA 1UD5A 3UESA 5ECUA 1JZ8A 2ZUSA 4BQ3A 4WSKA 5F7UA 2YL6A 4EANA 4W8AA 3W26A 3BGAA 3L4VA 3HMCA 1W9VA 2PI6A 3OLEA 2ZE0A 1GVIA 3WDRA 4Z2LA 2XM2A 4IM4A 1JD9A 1UWQA 2Y24A 5A6KA 2WMIA 1PX3A 3F5KA 2DSUA 2J7EA 4D1JA 3ALGA 3WKZA 3CHCA 1TE1A 2D2OA 3GYCA 2WLZA 4MB4A 5BRQA 3HJEA 4BS0A 4QLKA 4W84A 1JYWA 2WVVA 4HU8A 1MYRA 2YDSA 3VX1A 2OSWA 4W7UA 1HVXA 3GXFA 4X9YA 3PZOA 2C0HA 2J47A 5I79A 4D6IA 3DYPA 2AMGA 2X8RA 4TUFA 2ZUTA 5A2BA 4AD2A 2WYSA 1WO2A 4P8WA 4M8UA 2YBUA 5I6SA 3VMPA 1EQPA 4Z2IA 5E0CA 3AHZA 4OIFA 4PMDA 4D6JA 2QPUA 1QNQA 3VINA 3CZKA 1J0HA 2G4FA 3MMUA 1H0IA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3MUI A;  4H2C A;  3CPU A;  3ART A;  3CZL A;  1W3L A;  3VNZ A;  2Y4S A;  4HMC A;  2WCA A;  5I78 A;  4UFL A;  2J8G A;  1JI1 A;  3WDP P;  2D20 A;  5FKY A;  1KR1 A;  3D5H A;  4D1I A;  1WZA A;  3A4X A;  1ISY A;  5ABF B;  3WBA A;  2WMH A;  1PIG A;  3WF1 A;  4DWS B;  1MWO A;  2J7C A;  3UG5 A;  1TG7 A;  1EA9 C;  1U2Y A;  2VCB A;  3O9N A;  3ARX A;  3I3D A;  3WNN A;  3VOC A;  1UZ4 A;  1EDT A;  1EIB A;  1UYQ A;  1QVB A;  2A3E A;  3O6A A;  3W4R A;  2TAA A;  1DWJ M;  1OD0 A;  1EHN A;  2BNJ A;  1B3Z A;  2J74 A;  3SCU A;  3VGE A;  3THD A;  1LG2 A;  2VOT A;  4M82 A;  1E5N A;  5HNN A;  5BRO A;  3T0B A;  1BYA A;  4MB5 A;  1QI3 A;  2ZX9 A;  1IV8 A;  1BGG A;  1BF2 A;  3VDA A;  1OGS A;  4HMD A;  3DHU A;  1GOR A;  1FHL A;  1O7A A;  2F8Q A;  4J7R A;  3AML A;  1HJX A;  5FL0 A;  1ZBW A;  2ZOX A;  4HA1 A;  4CU7 A;  4IIS A;  4N42 A;  3OIH A;  1H0G A;  4HOZ A;  1W2P A;  3BMV A;  2O9P A;  1JAK A;  4B3K A;  4LYR A;  1G94 A;  4KRT A;  1EH9 A;  4D6D A;  2XVK A;  2V5C A;  4JKM A;  5C8B B;  1VBR A;  1V0M A;  1WPC A;  1DWG M; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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