3AIWA

Crystal structure of beta-glucosidase in rye complexed with 2-deoxy-2-fluoroglucoside and dinitrophenol
Total Genus 188
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
188
sequence length
486
structure length
486
Chain Sequence
VFTKLKPWQIPKRDWFSKDFLFGASTSAYQIEGAWNEDGKGPSTWDHFCHTYPERISDGTNGDVAANSYHMYEEDVKALKDMGMKVYRFSISWSRILPNGTGKPNQKGIDYYNNLINSLIRHGIVPYVTIWHWDTPQALEDKYGGFLDKQIVNDYKYFAELCFQSFGDRVKNWFTFNEPHTYCCFSYGEGIHAPGRCSPGLDCAVPEGDSLREPYTAGHHILLAHAEAVELFKAHYNKHGDSKIGMAFDVMGYEPYQDSFLDDQARERSIDYNMGWFLEPVVRGDYPFSMRSLIGDRLPMFTKEEQEKLASSCDIMGLNYYTSRFSKHVDISSDYTPTLNTDDAYASSETTGSDGNEIGPITGTYWIYMYPKGLTDLLLIMKEKYGNPPIFITENGIADVEGDPEMPDPLDDWKRLDYLQRHISAVKDAIDQGADVRGHFTWGLIDNFEWGSGYSSRFGLVYIDKEDGNKRKLKKSAKWFAKFNSV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
molecule keywords Beta-glucosidase
publication title Active-site architecture of benzoxazinone-glucoside beta-D-glucosidases in Triticeae
pubmed doi rcsb
source organism Secale cereale
total genus 188
structure length 486
sequence length 486
ec nomenclature ec 3.2.1.182: 4-hydroxy-7-methoxy-3-oxo-3,4-dihydro-2H-1,4-benzoxazin-2-yl glucoside
pdb deposition date 2010-05-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3aiwA00
1V3IA 5E0FA 4U2YA 1M53A 1C8QA 2XVPA 3WF3A 3K4AA 1UG6A 2W66A 5M03A 2D22A 1E0WA 1CXEA 1V02A 3MU7A 4W8AA 4XZBA 5I2UA 1B1YA 3MV11 5FIPA 3HU7A 1ODZA 4LXFA 1NWRA 2VZVA 1Q6GA 4EANA 3FNDA 1EHNA 3AYRA 1V6WA 4B3LA 2VRKA 1E1EA 1E6RA 1E70M 1PZ2A 1QNPA 4P8VA 3ARVA 3U7BA 2RGMA 2ZX8A 2YA0A 1CXIA 1DP0A 3AIRA 1HT6A 1JD7A 3MMDA 1E9LA 2CYGA 3W38A 1TA3B 2EEXA 1KGWA 4WKHA 5IHRA 4UZUA 1RP9A 4J3UA 4IPNB 3NDZA 1UKTA 3EDKA 1VJSA 2PB1A 3ARRA 4TX8A 1VRXA 2OSYA 5EFFA 2G3IA 5C8BB 3IAQA 4BCEA 3VM5A 3MUAA 3WNPA 4JZ5A 1PX8A 1X6NA 3DHUA 7TAAA 2PWFA 1MQPA 5I3DA 4MAZA 1EH9A 2WZHA 5F7UA 1EO7A 3RM8A 1M04A 3RJYA 3OB8A 3T09A 1UD8A 3VINA 4ATDA 2XM2A 3OZPA 1W9PA 1ZBVA 1RPKA 2PWDA 4JFWA 1GQIA 2OLHA 3AQUA 2W61A 1GQJA 3T0DA 1KFWA 2WYSA 4GI8A 3ARYA 3VD9A 6A3HA 1BAGA 4MNKA 4TXEA 1V3MA 3GNOA 3VILA 3WQ8A 1VFUA 4GKLA 1HN1A 4WSKA 2NW0A 4F8XA 1J0ZA 1C8XA 1S46A 1EDTA 2VQTA 4B9ZA 3K8KA 3RO8A 1J0JA 1CPUA 5D8WA 3NSXA 4Z2LA 1CLVA 3MUY1 2JF7A 2VX7A 2GDUA 4B16A 3W37A 1GOWA 1V03A 2WMHA 2DEPA 2VZUA 4PBGA 3KE0A 1GZJA 2XFFA 1QHOA 3FY1A 2NSXA 1A3HA 2DSVA 1G9HA 5A8NA 4J7RA 1X1NA 1TA3A 1HJXA 2JE8A 2WSKA 2YA1A 3GBEA 1H49A 2ZXQA 1EO5A 5A6BA 1BTCA 3BAJA 5HPOA 2C7FA 2DH2A 1HNYA 1GOIA 4H2CA 1WZMA 2ZUUA 3PZ9A 1J0HA 4MDOA 3A4WA 2GVYA 1CTNA 5A6SA 9CGTA 4TX6A 2UY2A 1JI2A 1MYRA 3VMNA 4BQ4A 4PTXA 2WVTA 5GPRA 1BGGA 1E56A 3AFBA 1WP6A 5AC4A 4IISA 2EBNA 3ECQA 4JAWA 5CLWA 4X9YA 1B9ZA 1DWAM 1JL8A 1WZLA 1QI0A 4B3KA 2BFGA 3VNYA 1UD6A 3VVGA 1W3JA 3UG5A 3W27A 2XUCA 1B3WA 4CD6A 3PZTA 4TVCA 2WZEA 3AS0A 3PZNA 4ZE5A 3WD3A 4GIAA 3GNPA 1WDQA 3MV01 4ZFMA 1AQ0A 2ZE0A 3DECA 4UNIA 2XM1A 1OGBA 1EDQA 4UFJA 4AD0A 2WBGA 1W32A 1QI3A 1E6QM 1E71M 4HU0A 3AMGA 3S2CA 2X1IA 2CKSA 3MS8A 1CGTA 2DT1A 1CZ1A 3BSGA 1E6PA 6TAAA 3THCA 3HMCA 1ITXA 2VRQA 3IJ9A 4LX4A 1I75A 2EPNA 4A3YA 3VIFA 3WN6A 2EQDA 4GO9A 1NOWA 4F9DA 1JYWA 2CHNA 1KB3A 4E8CA 4BA0A 1XH0A 4JKKA 4WF7A 4KRUA 4AD4A 2V3DA 3AHXA 3PN8A 3TP4A 4D6GA 3WNOA 4QCFA 4W5UA 2WAGA 2J8FA 4P7OA 3PTMA 1E15A 2E9BA 4CCCA 1OT2A 1KXTA 4M1RA 4EE9A 3AIEA 3MANA 2E9LA 3VDHA 4PUDA 1W2PA 1CENA 3CZGA 1PIFA 3UESA 3WMSA 2BNJA 3A47A 3LPOA 1MQQA 1NOUA 4XB3A 1J12A 2DSZA 4L4OA 1JZ8A 8CGTA 2CEQA 1KQZA 2B31A 4U33A 1O7AA 3TTYA 1XYFA 5LA1A 1BQCA 4JIEA 5KEZA 3L2MA 3VGDA 1GOMA 2QMJA 2IXVA 4E4PA 4FLSA 3OLDA 1GVYA 1VBUA 1RP8A 4P7QA 1E72M 3NJ3A 4MNLA 3BCDA 2IXUA 3VGEA 4D6FA 3BMWA 3RJXA 2WB5A 3PTQA 4U3AA 3IJ7A 4DWSD 1R86A 1W2VA 4YPJA 1W1VA 1C8YA 2WHKA 3EDEA 3SCOA 3ZJ8A 1ECEA 5CPTA 1LQ0A 3BH4A 1LWJA 1QPKA 2YDSA 3LPFA 4JFVA 4PTMA 3WQ5A 3APGA 1W1YA 1UQZA 3SCWA 2G8ZA 3ZO9A 4EKJA 4HU8A 2WPGA 4PMYA 4EK7A 4W8LA 1BYAA 3CMGA 1XD0A 2CNCA 3CH9A 2W91A 1UQYA 1VF8A 2D24A 1XD1A 1GORA 3WIJA 1E0VA 1QBAA 4W84A 2ZWYA 1GQKA 2ZX7A 4KWUA 2EJ1A 4TVUA 3GM8A 4MNMA 5DO8A 4M81A 5DMYA 5A69A 3AOFA 2JIWA 3CO4A 3BMVA 4OOZA 4W88A 3TA9A 4UFIA 1OD0A 1B31A 3L4XA 3OG2A 1UR0A 4PTWA 3SUSA 2G4FA 3CZEA 4C7DA 2FGLA 2VR4A 1E55A 2PF0A 3NYDA 3VIKA 5A8PA 2D3LA 3ZMRA 3PZOA 2E40A 4FLOA 4R27A 2AMGA 3N17A 4S3JA 4ZENA 2WCGA 2EPOA 1ISZA 1UD4A 5I78A 4HOZA 1CXFA 1V6UA 5EMYA 1VIWA 3VKKA 4J3WA 2WC4A 5CLTA 4LYQA 1BFNA 4BF7A 1J9YA 4Z2HA 1WZKA 3U7VA 3B9DA 2ZX6A 2ZUVA 3OBAA 2WMJA 4AD5A 1WO2A 1TR1A 1JDDA 3ZSTA 4NRRA 4Z2IA 2O9PA 4D6JA 1XSKA 2WMKA 1HJQA 3WEOA 1Q6FA 4GXPA 4D6CA 1SMAA 3AROA 2PBGA 3PZUA 3AMKA 1G5AA 3ALGA 1V3LA 3AIVA 5JUVA 2MANA 4CVUA 3VDCA 1OT1A 2QF8A 2YBTA 3W82A 1US3A 3CUGA 1JFXA 4P8WA 4DUWA 4MADA 4D6DA 3AXHA 4M24A 2J75A 3WSUA 3ARQA 2UY3A 3T0BA 4LGXA 3RMEA 4YHEA 5ABEA 5FL1A 1CIUA 2FHCA 3MSDA 2XVNA 4N0RA 1VFMA 1UZ1A 3SUTA 1W3HA 3VNZA 1IZKA 2V3GA 4CCDA 1OGSA 1BYCA 2QHAA 1ZB5A 2JIEA 4KRTA 2GJPA 5DEZA 4TTGA 5BXPA 1HJWA 2PWGA 1J11A 3SEPA 3VX0A 3WENA 3A4AA 1JZ6A 4HP5A 2WW5A 4AZGA 1V0NA 2YKKA 1G01A 1HX0A 5BCAA 1E4LA 1FHDA 2ZX5A 3N1AA 4ZXOA 1JF5A 4MB5A 3SURA 2IUZA 1QHZA 2VC9A 4GO8A 1NM9A 1KR1A 3M46A 1HKKA 5E9AA 2XWEA 1PIGA 2A3HA 4W86A 2XVLA 1AMYA 2BVYA 5LA2A 3LPPA 5M17A 1CXLA 3AHTA 1JZ7A 2FHFA 3VGGA 5EFDA 4DUVA 3FAWA 2CBVA 3VO0A 1QNRA 3VMOA 2X09A 3DHPA 4N42A 1CWYA 1JXKA 1E5NA 1BYBA 4J28A 3WH7A 1FFQA 3AS2A 4QLKA 1XGZA 2XTKA 4WKAA 5A8MA 1PJ9A 3BAWA 3GBDA 1V0LA 3MMWA 1F4AA 2CHOA 4AZIA 3VUPA 2E8YA 3MSGA 3WF0A 1J18A 1MFVA 4HMDA 1H3GA 3UETA 1E40A 2DIEA 2D0GA 3VDBA 4AZ5A 3K1DA 1J0YA 1US2A 5D8ZA 2VOTA 2NT0A 1J10A 2EPLX 3EMQA 3OGVA 2D1ZA 2VZTA 2YLLA 3AIWA 1UR4A 1OSEA 1M01A 4L4PA 1K9FA 1E6ZA 2W4XA 1JYXA 2Y5EA 3ARUA 2FH8A 5LA0A 3ARWA 4H04A 1CDGA 1ZBKA 4OJYA 4NRSA 1ISXA 3QOKA 4CD4A 3BAYA 2HVMA 1AQMA 7A3HA 2AAAA 3B8SA 2J79A 2WWCA 1BLIA 2BHZA 4QDMA 1JI1A 4W7VA 4HA4A 1EOMA 1VEOA 3KL3A 1RD6A 2CIPA 1H5VA 1JXJA 3BCFA 5E6YA 2WC7A 4J3XA 4TTUA 1H41A 2OWWA 4H8UA 5A6BD 3PZQA 1GOOA 2WK2A 2C8NA 1XCXA 1CECA 4X0VA 1B0IA 3WDQA 4DM2A 1DEDA 3W0KA 5E09A 3ARZA 1MWOA 3A4XA 3AS3A 2W67A 3GH7A 2XYLA 4AZ7A 2OWXA 1NP2A 4HA3A 1XYZA 4KH2A 3AISA 2D23A 1OD8A 5D9PA 1C3FA 3WEMA 5BRQA 5A2BA 1NP0A 5FKYA 1NH6A 3AI0A 4WSJA 2GJXB 3D5HA 3NSMA 2F8QA 1TCMA 2J25A 3QR3A 5HNNA 2J4GA 2YDQA 3MKKA 1UH4A 5CG0A 1BG9A 5I5RA 3PHAA 4PMNA 1VB9A 4UTFA 3DYPA 1LG2A 2XPKA 2TAAA 1JG9A 2YA2A 2XIIA 1E3ZA 2JFEX 5E6ZA 1KXHA 1QNSA 1ZJBA 5A3HA 5JBFA 4ZEPA 4HZ7A 3O9NA 3FXYA 4TVDA 1CXHA 2JALA 2WVUA 3CIVA 2CBIA 3WD2A 1HJSA 4KMQA 2J7EA 2ZUMA 5FL0A 4AXNA 4S3KA 1KXVA 2VX6A 3W81A 1EA9C 3AZTA 3M07A 1TVNA 4HOXA 2D20A 1KQYA 5I77A 1KWKA 3GXMA 4HMEA 3BAKA 3K4DA 1KCKA 2WNWA 3CHCA 3NCOA 5A2AA 3G6LA 4J27A 1EDGA 5HOSA 3GYCA 1V0KA 4OKDA 2YBUA 3WMBA 4BZYA 5I6SA 1M7XA 1WE5A 4AZHA 3AXIA 3WUEA 3DYMA 5JBEA 2WC3A 1PAMA 5I23A 1W1TA 1PZ3A 2UY4A 2YL8A 3POHA 4IUGA 2CERA 3PZVA 4UR9A 3L2LA 3EMCA 3AYSA 1WPCA 2X0YA 2YIHA 1QI5A 1W9XA 4W7WA 1J01A 1EIBA 3SCTA 2YOCA 5A8QA 2JF6A 1UD2A 3RDKA 3CZJA 5BWFA 3KEHA 2ZXAA 3T08A 2GJXA 3UERA 4GI9A 1D7FA 1QVBA 3UG4A 5CJ5A 2G3NA 3U5YA 1HVQA 1IZJA 2CBJA 1ODUA 3OLIA 1OIMA 1V0MA 2W62A 1FH7A 3FAXA 2VZSA 1JZ4A 1JGIA 2VNCA 1B3VA 1TZ7A 1FFRA 2V3FA 3W6LA 1C91A 1E43A 4GQQA 4RE2A 3WD0A 1NQ6A 4PUEA 4RE4A 1E6NA 1GNXA 4OIFA 3ZQ9A 5HBFA 1V02E 1KGUA 2JEQA 1SMDA 1BGAA 3N11A 1ITCA 1JD9A 1UKQA 3VIMA 3G6MA 4RL3A 2ZUTA 3SCPA 5EBAA 4HZ8A 4PTVA 1VJZA 1HL8A 2O9RA 5AYBA 5M5DA 1CGUA 4CU6A 2DT0A 1E73M 2XFRA 1DWHM 1R85A 4ZXLA 2QMKA 3PTKA 3CHFA 1WZAA 4M80A 4A4AA 2DSKA 1H2JA 3ZOAA 3VIJA 3W24A 1UHVA 4WJXA 1NWUA 2A3BA 4MNJA 2WVSA 1UH3A 3CTTA 1E0XA 2VI0A 4JKMA 1C90A 1C92A 3BAIA 4JL2A 2D2OA 1MW3A 1HP5A 5BXTA 4NZCA 5A6AA 2DT2A 2J7BA 4UZSA 4XX6A 2F61A 4DUXA 1TVPA 5I24A 5CSYA 3WH6A 1XV8A 1E3XA 2BY3A 2ZUSA 3BAXA 1N82A 1HJVA 3AIUA 3K8MA 5CPSA 3EDJA 4MB3A 4NSBA 3CZKA 2BVDA 3JUGA 1UWRA 2VTFA 3VIGA 4AZBA 1MFUA 2WZIA 4GI6A 3ZR5A 1DWJM 1Q6CA 1CNVA 1UR9A 4MJ2A 5A6MA 1TMQA 1CGYA 1OWQA 1WB0A 4X0NA 5DT5A 3F5KA 2W5FA 2GJRA 3EMZA 4QLLA 4UQDA 4Q22A 1UWQA 1V3HA 4GINA 3QGVA 3BGAA 3PZGA 5D4YA 4AC1X 1LLOA 3CUIA 1KCLA 1E4NA 2DSUA 4MJ4A 3EYPA 1PEZA 5I0DA 1G94A 4UFMA 4V27A 4P8XA 2XG9A 1R7OA 2DGAA 1ISYA 4CU8A 2OYLA 2WVVB 1K9TA 1LJYA 3N15A 1E1FA 1W9DM 2VCBA 2XGIA 3VD7A 3AXXA 1JDCA 1KXQA 1OB0A 1AVAA 4W87A 2XJ7A 3T2QA 1QI2A 4PYSA 1V6XA 4J3SA 2VX4A 5FD0A 2J7HA 1B3YA 3AHZA 5D9OA 1V3JA 3LMYA 2WSPA 4P7RA 2Z1KA 3TTQA 1V3KA 1QHPA 5A1AA 2CITA 3N18A 1LL6A 1CXKA 1JIBA 3RILA 1HKIA 1PX3A 1UR1A 3MUZ1 3DYOA 3WNNA 1TG7A 3WL0A 4F79A 3ZM8A 4KGLA 2BHUA 1QNOA 4KGJA 1WAWA 3OGSA 3E1F1 2OSXA 1U33A 2ZICA 4LYRA 1M03A 3WUGA 4JFUA 3GH5A 1C7TA 5EB8A 4D72A 1XH1A 4BQ3A 1UR8A 4JFSA 5CZKA 3ARTA 5JIWA 2CESA 1VAHA 2V5CA 1HP4A 1CLXA 1PX4A 3N9KA 1QOXA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1V3I A;  5E0F A;  4U2Y A;  1M53 A;  1C8Q A;  2XVP A;  3WF3 A;  3K4A A;  1UG6 A;  2W66 A;  5M03 A;  2D22 A;  1E0W A;  1CXE A;  1V02 A;  3MU7 A;  4W8A A;  4XZB A;  5I2U A;  1B1Y A;  3MV1 1;  5FIP A;  3HU7 A;  1ODZ A;  4LXF A;  1NWR A;  2VZV A;  1Q6G A;  4EAN A;  3FND A;  1EHN A;  3AYR A;  1V6W A;  4B3L A;  2VRK A;  1E1E A;  1E6R A;  1E70 M;  1PZ2 A;  1QNP A;  4P8V A;  3ARV A;  3U7B A;  2RGM A;  2ZX8 A;  2YA0 A;  1CXI A;  1DP0 A;  3AIR A;  1HT6 A;  1JD7 A;  3MMD A;  1E9L A;  2CYG A;  3W38 A;  1TA3 B;  2EEX A;  1KGW A;  4WKH A;  5IHR A;  4UZU A;  1RP9 A;  4J3U A;  4IPN B;  3NDZ A;  1UKT A;  3EDK A;  1VJS A;  2PB1 A;  3ARR A;  4TX8 A;  1VRX A;  2OSY A;  5EFF A;  2G3I A;  5C8B B;  3IAQ A;  4BCE A;  3VM5 A;  3MUA A;  3WNP A;  4JZ5 A;  1PX8 A;  1X6N A;  3DHU A;  7TAA A;  2PWF A;  1MQP A;  5I3D A;  4MAZ A;  1EH9 A;  2WZH A;  5F7U A;  1EO7 A;  3RM8 A;  1M04 A;  3RJY A;  3OB8 A;  3T09 A;  1UD8 A;  3VIN A;  4ATD A;  2XM2 A;  3OZP A;  1W9P A;  1ZBV A;  1RPK A;  2PWD A;  4JFW A;  1GQI A;  2OLH A;  3AQU A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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