3BO9 | Genus

Total Genus 100

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	100
sequence length	314
structure length	314
Chain Sequence	HMTVRTRVTDLLEIEHPILMGGMAWAGTPTLAAAVSEAGGLGIIGSGAMKPDDLRKAISELRQKTDKPFGVNIILVSPWADDLVKVCIEEKVPVVTFGAGNPTKYIRELKENGTKVIPVVASDSLARMVERAGADAVIAEGMESGGHIGEVTTFVLVNKVSRSVNIPVIAAGGIADGRGMAAAFALGAEAVQMGTRFVASVESDVHPVYKEKIVKASIRDTVVTGAKLGHPARVLRTPFARKIQEMEFENPMQAEEMLVGSLRRAVVEGDLERGSFMVGQSAGLIDEIKPVKQIIEDILKEFKETVEKLRGYIE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase
molecule keywords	Putative nitroalkan dioxygenase
publication title	Crystal structure of putative nitroalkan dioxygenase (TM0800) from Thermotoga maritima at 2.71 A resolution rcsb
source organism	Thermotoga maritima msb8
total genus	100
structure length	314
sequence length	314
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 1.3.1.9: Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase (NADH).
pdb deposition date	2007-12-17

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF03060	NMO	Nitronate monooxygenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3bo9A00

5F1VA 4S2BA 1VCFA 2E5BA 4O11A 4GUFA 4LNYA 5G2WA 3FYOA 3KVMA 1F05A 4Y6GA 4NZFA 3QSRA 1A5SA 5E93A 1KLZA 1VR6A 2FPTA 3SW6A 3USBA 5L6UA 5LNVA 1X1ZA 1GPWA 5J5DA 3QW4B 5HQEA 2CLLA 1DJNA 2BX7A 2DZXA 3KVJA 3RFAA 5D04C 3P5YA 3EX2A 3IEBA 4I7WA 3NM3A 1EB3A 3G24A 3W88A 1ICQA 5U7SA 1KBJA 1LORA 5D30A 4X22A 3I7SA 1JUEA 1FQ0A 1ML1A 5FI8A 1F2JA 3EEGA 2GUUA 5D09A 1F76A 2YW4A 2P0OA 4K8EA 3CIWA 1ZAJA 1RD5A 1FWRA 4N2YA 5EKYA 1Q6LA 4M6VA 3TW6A 2AAMA 1WA3A 1U83A 5DXXA 3GNNA 4JTIA 3UY7A 1Q3NA 1ME8A 3NQCA 4Q32A 3NQVA 4K36A 2OCZA 2BLEA 3BW3A 1TV8A 3F03K 1KFEA 2Q8LA 4ADTA 4M7SA 2A6LA 1I2PA 4RZ4A 2RDWA 2Y61A 4CCDA 5G1YA 4M7TA 4O13A 1V5XA 2GVGA 1NAL1 2ZA2A 2BTMA 1H7NA 3W6YA 2NUYA 4TIMA 5F2GA 2QF7A 3DHDA 3HMJG 4KWWA 5KINA 3LBCA 1UUOA 2TSYA 3HBLA 4O8RA 4Z1DA 2R94A 3BG5A 3O06A 3TROA 5BRBA 3RU6A 5CZTA 2V0TA 4FX6M 4IX2A 4MIMA 3NVTA 4GRSA 3U2OA 3F4NA 2QCDA 3M7WA 3STEA 2IQTA 3HG3A 1TJRA 5G1TA 2NXIA 2W0UA 2WOQA 4ORIA 2VFHA 3P67A 1IGSA 3G3DA 4AF0A 3WJYA 5KZEA 3NR0A 1KFBA 3EKLA 4O4VA 1YPIA 2YYTA 3M5XA 4FF7A 1ZCOA 3P8IA 3W7LA 3IRDA 4ALDA 3S42A 3LHWA 4BFAA 3EWUA 3LV5A 3TSDA 1R2TA 4K37A 4TX9A 4IJBA 4BK9A 4YCPA 4DO4A 4TR9A 1C8VA 3C2EA 2YPIA 5LZLA 3NQ2A 1SUXA 5F2MA 3SIZA 1WV2A 4YWIA 2TYSA 2Y63A 2JGQA 2RH9A 1VJIA 3I68A 4ORMA 2V82A 3P80A 4LS0A 3WJSA 1HO1A 1EWEA 2C18A 2VFGA 2Y62A 3P8JA 1M6JA 3FYPA 2YCEA 3BW2A 2QCGA 4EWND 1H7RA 4UTWA 4QNWA 4N9CA 4PL1A 1W5QA 3LCXA 4R7JA 7TIMA 3CM4A 4GUJA 3SZ8A 2CZEA 2OT1A 3VI2A 1KTNA 2B7PA 1WBJA 3ABQA 1L9WA 5G2IA 2V30A 4UTMA 3SGZA 3LTSA 3NYZA 3PBWA 3P74A 2H8XA 1G4EA 1SO6A 1BWKA 4NNBA 3A21A 2EAWA 1UASA 4X3ZA 2AQWA 3UD6A 1FX6A 4UFIA 4U4MA 1W3IA 3W7IA 4MYAA 4POCA 2P10A 3TU9A 4JR5A 4Y96A 1OF6A 2GJLA 2QCEA 4IX0A 5BNKA 1VC4A 1JULA 4E2DA 1KTBA 4UTTC 3M16A 4QIUA 4AAJA 3ABSA 4RZ5A 2PCQA 3N34A 3M9YA 4P61A 1PIIA 5D2WA 3TUUA 5K4ZA 4Y8FA 1TTQA 4YLWA 3CU2A 1VYPX 4LC6A 3EX1A 4OHQA 3PG8A 3C2FA 4H4IA 4IMEA 1OYCA 1TPC1 4NUWA 5AHEA 1YXYA 1OFDA 4K7VA 4C1LA 3FKRA 1OFAA 4ZQPA 3G1HA 3Q94A 1ME7A 1ZAHA 1WXJA 3IVUA 1UB3A 4HT3A 1XDMA 5AFDA 4O1DA 2NWRA 5E1QA 1OYBA 2NXGA 3RLUA 4CNPA 3UZJA 2G97A 1YTKA 3LERA 4QQ3A 4RV8A 4K39A 3LHUA 1RQEA 5LHFA 4IMDA 4LVBA 3W1AA 1DOSA 3TQ0A 4D2JA 2ATSA 3CPRA 3QF0A 3TSBA 4FNUA 2CLFA 4NJKA 2FTPA 4HNVA 2O7QA 3NZ1A 3W85A 4IUOA 3NOEA 3G8EA 1HTIA 1KFCA 4ZQRA 3LRKA 2NLIA 1GVRA 1RV8A 1KLYA 2ZQ0A 4KFPA 1O60A 2E1DA 3BLFA 3HB9A 4O17A 3P5ZA 1ICSA 1KM2A 1P0KA 5EL1A 4QAIA 3TCEA 3PM6A 4RJEA 3LRMA 2BSLA 3FJLA 4CLMA 3KOFA 3O6YX 3M47A 3A5FA 5DCDA 4A3UA 1ADOA 1TTIA 4I9AA 2PRMA 5MHBA 4N9DA 2Z6JA 2DJXA 5K4XA 5C2XA 3UWWA 2ZRWA 3LCWA 1VLWA 3DKJA 5HR6A 4JTUA 3W76A 1TSIA 4JIQA 5FEWA 1XDLA 4MZ1A 4JIPA 4N9EA 3C8FA 1K8XA 3K30A 3KRUA 3NL6A 3S0CA 4AHPA 1OABA 5HULA 1K03A 5DY2A 2QUVA 2B7QA 3B04A 1LOLA 3S1UA 1MEWA 1AMKA 3SI9A 3R12A 1VYSX 3EKZA 1KM6A 4XWUA 4XBSA 3QYQA 1O95A 2NV2A 5L9FA 3M0ZA 1X1OA 1JR1A 4DQWA 1KM4A 2KZHA 1G67A 2CZ5A 5LSMA 4XQ6A 4O50A 3DZ1A 3GXPA 4LW7A 2QDGA 5U4NA 2X1RA 3E12A 3UWUA 2E6AA 4HNTA 1XL9A 4Y90A 5ABTA 2H3DA 3G0XA 4AF0B 3FKKA 3FOKA 5F1UA 5I3KA 4DF1A 3MWAA 1AL7A 1M7OA 3N2XA 2ISWA 3P62A 3JRKA 1K7FA 3PULA 4JX4A 2CU0A 3LCFA 1M5WA 1QR7A 2DZUA 2V81A 4A29A 2X1TA 3MI3A 4GUGA 2ABBA 4FNQA 4UC5A 2WSRA 1SW0A 3O6DA 3RF9A 2DZTA 5HMSA 3TFXA 1OX6A 3MUXA 4Z1BA 2QCCA 4XTIA 2GQAA 2A6NA 3W7CA 4UFJA 2I14A 1TPDA 3HGRA 1JVNA 4O52A 1NSJA 1Q45A 2RDUA 4LVDA 3FLUA 1LROA 2ZA3A 2ZYFA 3CIXA 4K38A 5LNWA 1T96A 4LY8A 2QEZA 1YTDA 2QJIA 2C19A 3W2MA 4M5PA 3LI1A 3NQDA 4ZL1A 5G4EA 4WOZA 3JS3A 4FNSA 5K9DA 2Y89A 1W31A 3SFKA 3LHZA 3UWVA 1XXXA 2ZZ6A 1JCNA 3LTPA 4RCXA 3T78A 1HO4A 2HMCA 3NO5A 1IXOA 3NQ6A 3FA5A 3GVGA 4NXKA 3W75A 1I2NA 3BLEA 1DQXA 2BWGA 2J6XA 3W7GA 2ATMA 5DELA 1H61A 2EPHA 5HUOA 1XCFA 4L4LA 1YXCA 1EP2A 3EXSA 1OFBA 3NG3A 3KHJA 2X30A 3CLMA 3IIZA 4ZQMA 3NQ8A 3OIXA 4DPQA 2ZDRA 1L2UA 3DGRA 3TDFA 1Z42A 3S6DA 3CT7A 1AW5A 3TIMA 1B57A 2NX9A 5E0KA 3BGGA 4UTWC 3MHUA 1GVOA 3W1UA 4S1FA 4MJMA 4XKYA 4DELA 3PSWA 4FEZA 4GJ1A 4IXXA 1Q6QA 3IIOA 1SFJA 3TH6A 5EPDA 3LGEA 4KFOA 3MI2A 3TNOA 3H53A 3L67A 4NNAA 4S2CA 2YDAA 2C13A 3S1XA 3PG9A 3T7VA 4AXKA 1TREA 2YFNA 4LV9A 4R34A 1K3UA 3W1XA 1H63A 3QPZA 2QUUA 3TXVA 5C5YA 2VEIA 1GYLA 4UR8A 5D02A 5KMYA 2FB3A 1TIMA 1C9DA 4YL2A 1H1ZA 1Q6RA 1FBAA 5AYZA 4CQ8A 5IM51 4UTKA 3TMQA 2WKJA 4JTSA 3GAYA 3GDKA 1GQNA 1GTHA 2PC4A 4MFDA 4IMCA 2ZBTA 4UFMA 1QPNA 2ZFAA 3DENA 4IPIA 3HGSA 3HO8A 1W0MA 3ZWSA 4DBDA 3VKJA 2I1OA 4MOZA 2QCFA 3ZFHA 3A22A 2VFIA 2A7RA 4GUHA 1J2WA 2Z0IA 2O7SA 4HN4A 4EOUA 4AWTA 3MJYA 4W9TA 1RQBA 2WNQA 2RDTA 3TXZA 5KTLA 5AOUA 4J9JA 4FXRA 5HJLA 3W86A 5KITA 1N7KA 4LOCA 1SO3A 3UZ5A 1GWJA 3N2MA 3PWAA 4AEOA 5C55A 1VPXA 2OJPA 1F6KA 4LVGA 1SZFA 3LHVA 3W2KA 4CCEA 4OE7A 4X2RA 1S5TA 2WQPA 1G4TA 1QPQA 1JRBA 3P81A 1CW2A 3N73A 3V1PA 4ZZ9A 1MXSA 3GDRA 4NJJA 2QCMA 1OHLA 2C1HA 4HPXA 3R89A 2DZSA 4QM1A 5CZSA 3QMRA 2Y70A 5LNUA 3IV3A 1R2RA 2HTMA 2JKEA 1W1ZA 3R13A 3C6CA 3BARA 1KM5A 1ICPA 3LI0A 3MBFA 3TA6A 3O6CA 1B9BA 3NPXA 3QFEA 3HGJA 3C3NA 3KRSA 5TIMA 1QPRA 2VC6A 3O07A 3RK8A 2ALDA 3JR2A 2HS8A 2OX1A 1VQTA 4Z1AA 3W7NA 3LOTA 2RKXA 3S9YA 5G2HA 2PE4A 3O1NA 4KKXA 4U28A 5AN7A 4K7YA 4O53A 2R8WA 3OVPA 4GNJA 1R2SA 1W5OA 2R14A 4LV4A 5F2LA 3VE9A 4A2SA 1LLWA 4HSNA 2DU2A 3QZEA 4O18A 3VFLA 3QQ1A 4NX0A 1A53A 1TPB1 1P1XA 3NQMA 1F73A 2NZLA 2ZRXA 2YYUA 1DL3A 2C14A 2V2HA 3L5AA 3VNDA 2ZA1A 3TQKA 3B8DA 3S1VA 1O4UA 5K2ZA 3T40A 4LS2A 3HG2A 4IMFA 5CPOA 3KAOA 5D33A 3G1FA 3STCA 2ZZ1A 3PF3A 1P0NA 2H3BA 1R46A 3W2NA 4M6QA 4OQVA 3EX4A 3C4UA 3HOJA 3L0NA 4YXGA 2YZRA 4WOQA 1B3OA 3IIVA 1Z41A 1VHNA 2H6RA 4Z08A 1NFBA 1SSGA 2X1SA 1A5AA 3QM3A 3WJWA 4NZJA 1CI1A 5KZDA 4AHOA 1FCQA 1XBYA 3TX9A 1D3HA 4JTLA 5K9XA 1AW1A 5HWJA 4EVZA 5LGZA 1RQHA 1KV5A 3DXIA 1KBIA 3DFQA 4AMAA 3W70A 1ONRA 2CLHA 3E96A 4DPPA 2DJLA 3W7EA 3PY2A 5DBUA 5FEPA 2OT0A 1LYXA 3BPWA 3GXTA 3W2JA 5LGXA 2GPTA 4WZHA 2Y7DA 3QQ0A 3DU0A 1W5NA 4G1KA 5F4SA 2ISVA 1OX4B 1I2QA 3NL5A 4KWVA 2D73A 4R33A 3HG5A 3OVRA 3W72A 2X16A 4A2RA 2JKPA 1NF7A 1WX0A 3CB8A 5DXYA 4EF9A 5GVJA 1OG0A 1DBTA 3OVQA 3DFPA 3S5OA 5FF4A 2WV8A 3W2UA 4UFHA 3TMLA 1I4NA 4FNRA 1YDNA 4O16A 4AVFA 2BXVA 2FPYA 3GR7A 4O1BA 3CEUA 5CSSA 1YLVA 3LDVA 3SY5A 1SZGA 4LUJA 3QMSA 3DHFA 3B06A 3A5VA 4BF9A 1KM3A 2VFDA 3VCRA 1JCMP 1IF2A 1XFBA 3PS7A 4XKYB 5HUPA 4N9BA 3MYPA 3EWZA 4PTNA 4HIBA 4WY0A 2NX1A 3A23A 4HHPA 5G5IA 4JXCA 3NQEA 1MO0A 4PA8A 3OBKA 2DZVA 5F2IA 3E49A 1TRDA 4Y9AA 2JGYA 2ZZ3A 4Q33A 4O0ZA 1H7OA 3BLIA 3MP4A 3UY8A 3HF3A 4Z0SA 4ICNA 2PRHA 2V8ZA 2QKFA 3BK0A 2NXHA 4HPJA 2Q8ZA 1LZOA 1AG1O 3QC3A 3OG3A 3C2OA 3DI0A 2I9EA 4UMBA 1PL9A 3WJXA 3PBUA 4O15A 4JTTA 3PB0A 1SQ7A 3PUDA 2GJNA 2ZZ5A 2E5CA 4IQLA 4DO6A 1PCWA 4K6AA 1SZEA 1X7FA 4WY0F 1A50A 1BWLA 1IXNA 4DBEA 1UBSA 4YCOA 2CLOA 4UMAA 1VCVA 1FWSA 1M7PA 4BI5A 1TQJA 1ZNNA 1FUYA 3FFSA 3L5LA 5D38A 4PC8A 4QJ1A 3EXTA 1C29A 3N9SA 3LXBA 1LRNA 4H6KA 1HFBA 3NDOA 4MY9A 1FDYA 8TIMA 3I7QA 5D05A 2C16A 2ZTKA 3OA3A 5LHEA 1LCOA 3QRHA 2F84A 3B0PA 4FHAA 1VGAA 2Y7GA 5A5WA 4LRTA 3MHGA 3Q58A 3QH2A 1OJXA 1Z48A 2XN1A 1VRDA 4JS3A 4MZ8A 4DF0A 3CQ0A 1H60A 1W37A 4EF8A 3M1ZA 1JQVA 1QPOA 3NPWA 1GZGA 2GQ9A 3GB6A 3OEXA 5KZMA 1VHCA 4JDBA 3IGXA 1TPUA 2J27A 1JUBA 1KFKA 2V9DA 4K8HA 2NUWA 3G0SA 3EWYA 5CPNA 1D3GA 3KFTA 3NQFA 1SW3A 1H5YA 4JGDA 4DF2A 2ZTJA 1OK4A 4M19A 2QJHA 4UIOA 4JY8A 2FDSA 3B03A 3P61A 3MW7A 4N4QA 6ALDA 1RPXA 3QJAA 1AK5A 4NNCA 2PURA 3BG3A 2CLIA 1W5MA 4MYXA 5J5RA 3GK0A 2X2GA 2HSAA 1GVSA 4JYEA 2QR6A 1K8YA 4E38A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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