3BV4 | Genus

Total Genus 135

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	135
sequence length	341
structure length	341
Chain Sequence	HPALTPEQKKELSDIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLVGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKRCQYVTEKVLAAVYKALSDHHIYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKYSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGVTFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTS

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Lyase
molecule keywords	Fructose-bisphosphate aldolase A
publication title	Structure of a rabbit muscle fructose-1,6-bisphosphate aldolase A dimer variant. pubmed doi rcsb
source organism	Oryctolagus cuniculus
total genus	135
structure length	341
sequence length	341
ec nomenclature	ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date	2008-01-04

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3bv4A00

1BEUA 1GZGA 2J6XA 2O7SA 4UTWC 1VCGA 2DU2A 2VOMA 3P74A 3HG5A 1TPH1 4I9AA 3STCA 2RDTA 3W7KA 3L0KA 1RPXA 3P61A 2OJPA 2QCNA 5U4NA 5LNWA 3EWYA 3INPA 1G6CA 4LU0A 5DXYA 1ZENA 1OYCA 2E5DA 2NXIA 3W1TA 1AG1O 3NOEA 4JTSA 2QKFA 5AOUA 3LTPA 1H7NA 5C6MA 2A6NA 3DZ1A 1K7EA 4PH6A 4QSHA 4K7VA 2E5CA 1ZCOA 1SO4A 4RCXA 3M41A 4ORIA 2E77A 2DZPA 1RQBA 4YCPA 3HGOA 4RZ5A 4YWIA 1SO5A 4QISA 3UPWA 3BW3A 5DY3A 1P5BA 1GYNA 4QM1A 3G1AA 3CIXA 3LTSA 4MFDA 1JRCA 1H7PA 1UASA 5D37A 3PUEA 2DJXA 4M7SA 1O5XA 1W31A 2AGKA 2WNNA 4ZQOA 3M5ZA 3S0CA 1KFCA 3WK3A 2FPTA 2J9YA 3W70A 4DPQA 5G2WA 1TRDA 5AHMA 1KLZA 2C16A 4K39A 3G1XA 4JTKA 4M6VA 1MO0A 2G95A 3E96A 1TIMA 4LRTA 4AEOA 2X16A 5C5YA 3TC7A 2BSLA 1OFDA 3UWVA 1OFEA 4ZQPA 3W71A 3E02A 3P5ZA 2Y61A 1PL9A 1NF0A 3P80A 2C18A 5D03A 2JKPA 2YW3A 3UY8A 3FKRA 3QYQA 2A6LA 1K02A 5FF2A 4HHPA 3KVLA 3CM4A 1RQHA 3MHGA 1FX6A 3MWAA 2PRMA 4K7YA 3SGZA 2QR6A 7TIMA 3W1MA 1SU5A 4QQ3A 1QO2A 5TIMA 4EOUA 1CI1A 4HIBA 1YTEA 1Y0EA 4LS1A 4Y90A 4MUZA 4IWWA 5I3HA 3PBUA 3CEUA 3NL2A 4BI5A 4X2RA 4O1DA 3TFXA 3B03A 4WOZA 1OG0A 4FNRA 1KTNA 1G4SA 2J27A 5H2ZA 1O4UA 4RXGA 4GNJA 3MBDA 3NQDA 1JCYA 1H60A 3NQEA 3W1UA 3HG2A 3S1UA 3SFKA 5D2WA 1DQWA 2FB2A 4R7JA 3W7RA 1QWGA 2DZUA 3P5YA 1JUBA 2CLMA 1W0MA 3EXTA 4HN4A 3W1NA 3QFEA 2CZ5A 4NUWA 4AHQA 2JGYA 3W7IA 2PRLA 2ZA1A 4JTHA 4LT9A 3I7SA 3DHFA 4JDYA 3NZRA 1KFJA 2RH9A 2GPTA 3W2UA 1GPWA 1GVSA 1W3IA 1I2OA 2PCQA 4LV4A 3L5LA 3L2IA 4YL2A 2I1OA 1ME8A 1X8FA 4JX6A 3PULA 4YXGA 5EMUA 6TIMA 3PG8A 3BLEA 2I14A 3SECA 3P84A 5AYYA 3FYPA 3A5FA 1XBVA 1A5SA 2GJLA 4YMZA 4K38A 3LCIA 3JS3A 4MIMA 1VHCA 5LNSA 1H7RA 2DZWA 3EEGA 2HS8A 2NWRA 2VEIA 3LTYA 1VZWA 5CPLA 1DJNA 4XTDA 5KMYA 4L4LA 1F7BA 1T0OA 1YXDA 3SSJA 3ABOA 1WOAA 3W1XA 2YYTA 4FX6M 2X30A 3KVMA 3BGGA 5F1UA 1DJQA 3U6WA 4AXKA 3GNNA 2QUUA 3W7MA 3L0NA 3LV5A 4ORMA 1AW5A 1DKWA 1SO6A 4QNWA 1W1ZA 1OFBA 3T4CA 2QCHA 1G4EA 3LI0A 1DORA 3W84A 2A21A 5E93A 4Z1BA 1GG0A 1LP6A 2H6RA 3N9RA 3NQ8A 3PG9A 4O52A 3BK0A 5LHFA 4UUIA 4LWWA 2NZLA 2FB3A 3GDMA 2PE4A 1WX0A 4DBDA 1OABA 3MBFA 4IX0A 2BX7A 4NU7A 3W1PA 5C55A 3GXNA 4TMBA 3FA5A 4HSNA 4O19A 1KBJA 3DBPA 3LBMA 2Y63A 4Z1CA 1LDCA 3H54A 1CX9A 2XN0A 1GVOA 4DF0A 4E2DA 3HBLA 4CLMA 4IUOA 5EYWA 5KTLA 3NQ2A 3QEZA 2A7RA 2Y6ZA 2CZEA 3P7YA 2V0TA 1VH7A 5MHBA 2Y7DA 3G8RA 3OA3A 3L68A 4C1LA 3UD6A 5AFDA 4QNEA 4ML9A 3HMJG 1LBFA 3W7CA 1GOXA 1VS1A 1ZAJA 1VHNA 1ZFJA 1NF7A 3VE7A 1KM0A 1OJXA 1PV8A 5LGZA 5BMXA 3YPIA 3ZWSA 4RK8A 3PWAA 3W7JA 1WV2A 3IRDA 2Q8LA 2ISWA 2QCGA 1MEIA 1H62A 2G97A 1DQXA 2F7FA 3C8FA 1JRBA 2ZA3A 3TMLA 4UTJA 3OVRA 4EIVA 1A53A 1MXSA 5KINA 1X1ZA 3TU9A 5G2HA 4I7UA 2ZZ3A 4U28A 1JQXA 1OFRA 2W79A 3P8JA 3KVJA 3EX6A 2WJZA 4ADUA 3W6YA 1R47A 4N9BA 3PR2A 1SR9A 1F74A 3S42A 1P0KA 2ALDA 4C1KA 1QAPA 1VLIA 3PY2A 1A5CA 4UC5A 4UTIA 3PSVA 2J9XA 5HJLA 1EB3A 2GUUA 3M1ZA 3LHZA 3NQGA 3RLUA 3KFTA 4YLWA 4IMCA 4LS0A 3P67A 3OEXA 2YFOA 1U83A 2HSAA 1RD5A 1OYBA 4Y9AA 2YCEA 4LRSA 3STFA 4G1KA 2C13A 1N55A 5CGQA 4DPPA 5D2TA 3FLUA 3C2RA 1B3OA 1HL2A 4RX0A 4CNNA 1OFOA 3DFSA 4QAIA 4EVZA 3BPWA 4O53A 5HWJA 3TUUA 2QF7A 5G4EA 5D30A 1RQEA 3UXDA 5F2MA 1TYGA 1TPUA 4IGHA 1UCWA 1Q3NA 1XBYA 4NJIA 5FF4A 4IQLA 2ZRZA 3BG5A 1ICPA 5DLCA 1XBXA 2WNZA 3OVQA 3S9YA 1H1YA 1T99A 3N73A 5AHEA 4BK9A 3G1FA 1W8SA 1OF6A 5BOOA 2RDUA 2NXGA 5BRBA 1IIGA 5K7JA 4X22A 2EKCA 3G1SA 4NT0A 1B4KA 3O6DA 4HNVA 4N9EA 1BWLA 3KRSA 4FIQA 2YXGA 3B0PA 4NJHA 1SW0A 1LOQA 1W54A 1AL7A 3MP5A 3W22A 2CU0A 1HUVA 1KV5A 3EX4A 4WXYA 5K9XA 3NG3A 1ML1A 3ZR4A 3MO7A 4FNPA 2EGZA 3M43A 3TR2A 3PM6A 1OYAA 1P1XA 4UTHA 5AC8A 1OX5A 4NQ1A 2CFFA 5F4XA 3Q2DA 2PC4A 3NPVA 5EY5A 3GK0A 4JXCA 3W7PA 3B04A 3W7EA 2B7PA 4TU1A 3U8GA 4GUHA 2YX0A 1FCUA 3LLDA 4FXRA 3S5ZA 1YTKA 2GQ9A 4OV9A 1H7OA 1M6JA 5A5WA 3WJSA 3GNDA 3QC3A 1ADOA 4JIQA 1LROA 4M6QA 4FNQA 2ZQ0A 5CZJA 3LCLA 3O16A 3KOFA 3FJLA 4N4QA 1VPXA 1HO4A 3NZ1A 4DEFA 1WAUA 3PC0A 1NSJA 3B8DA 3GB6A 5I3KA 1ZNNA 2QAFA 3RK8A 2P1FA 1PVNA 4X3ZA 3B06A 3QMTA 1QPOA 5HINA 1LM1A 1FUYA 4MJMA 2R94A 3N3MA 3A21A 1R2SA 3DAQA 5G1TA 4M6PA 1U5JA 2XN1A 5KZDA 1QMLA 2E09A 4CCDA 1Z48A 5AB3A 1ZAIA 2H8XA 3HGRA 3G1VA 3DH7A 4NZJA 4OE7A 1J5TA 2A1YA 5I3JA 1H61A 1SZEA 1XXXA 4GJ1A 4O8RA 4MYAA 1GQNA 4JTEA 3V1PA 5CZSA 2C15A 4MZ8A 3NO5A 3GR7A 4LVDA 3O15A 1EUAA 4WZHA 5AYXA 4CQ9A 1FDZA 4OU1A 6ALDA 1MEHA 3LB0A 1F2JA 2GQ8A 4Q4KA 3K30A 1AW2A 1ONRA 1YPFA 3GAYA 3HPSA 4JDBA 2AAMA 4LTSA 1V7YA 3W83A 5EPDA 3VI2A 1EP2A 3QRHA 5IBXA 3O07A 3R13A 2QDGA 4A2SA 1KM3A 3T7VA 1B57A 1SQ7A 1QOPA 2PRHA 2NUXA 3W73A 2ZYFA 4K36A 3M16A 3S5NA 4IMEA 1ZHAA 2ZFAA 3PS7A 3GYEA 4NX5A 1LBLA 2WSQA 2E6AA 2C0AA 1F73A 2C14A 3R12A 4IMDA 4AWUA 3MJYA 3W7GA 2VFDA 2ZZ4A 2Q3OA 3UQNA 1P4CA 2BWGA 4O14A 4ZMGA 2ATMA 2WSRA 4AWTA 2CLLA 1OFAA 2R14A 3P81A 3W75A 4JN6A 3NQ6A 4H3DA 1S5TA 3F4WA 5F2GA 3GLCA 4MJZA 2QUVA 2Z2UA 1EWEA 2ABAA 2A85A 4LOCA 3RF9A 1ICQA 2VELA 3LBCA 4WY0B 1XDLA 1DV7A 3W88A 3BGJA 5K3VA 4GFSA 2F84A 3MYPA 4D2JA 4MLRA 1YTDA 1B9BA 1ZALA 3QMSA 4M19A 5A8GA 2VEKA 4FEZA 2E1DA 2A0NA 4UFKA 3LOTA 3TQ0A 3G3MA 5F4SA 3QSRA 2NV2A 3IVTA 4O17A 3GKAA 2E6FA 3SZ8A 3TW7A 3STEA 3GVGA 2X1RA 3PVFA 1FQ0A 2A7NA 3BG9A 4Q32A 1VCVA 3B05A 5IM51 1B4EA 3C2FA 4AF0A 5K4XA 1L6WA 1TTQA 1GEQA 1WDWA 4NXKA 3R8RA 1PCWA 5G2IA 5U7SA 2TSYA 1K7FA 3Q58A 3GIYA 1M5WA 3MHUA 4ZQRA 1YXCA 2QCDA 1TPVA 1TSIA 3EB2A 1Q45A 1K03A 4NX0A 2J9ZA 3NR0A 1JUKA 4PFMA 4MKNA 1NEYA 4JYEA 3NYZA 1WOBA 4AH7A 4RLIA 1LLZA 3LHVA 2RDWA 3DFNA 1H63A 3QW3A 2VFHA 1F6KA 3T40A 4PA8A 4RZ6A 2P10A 4WD0A 4FX7A 5IBXC 3WJYA 1IGSA 3O1NA 1W5MA 5DXXA 4IMFA 3M5VA 1I2PA 4O1AA 4CNPA 1M7OA 1O5KA 2Y62A 4O18A 3DFQA 3TIMA 1PS9A 1KFEA 4ADTA 1L2UA 5AYZA 1XCFA 3BLIA 1KM4A 1OK4A 3WK2A 4CCEA 3E12A 4XUGA 2TMDA 2VEPA 3QW4B 4O57A 1QPNA 4GUIA 5DCBA 3G1DA 3GX9A 1KM2A 4MYXA 3O6YX 4UR7A 4M5PA 1UUMA 4MY9A 3SR7A 3LCHA 3EWZA 3W72A 1KV8A 2PURA 4LUJA 4W9TA 4DELA 1N7KA 2ATSA 2Y7EA 1ALDA 1GTEA 1MEWA 2V2DA 2X1SA 4MFEA 5FI8A 3T44A 5FEWA 4IXXA 1AW1A 3M0ZA 2CLIA 3DFOA 2R8WA 1VYPX 2Y88A 3PBVA 1TPFA 3LCXA 2ZRWA 1SW3A 3EKZA 1KA9F 1BWKA 3O6CA 3TSMA 4AHOA 4NJKA 1TV8A 3HGJA 1X6UA 3C2OA 1QDSA 4Y6GA 3W2JA 3L9CA 2OMAA 3RLVA 3H53A 3N34A 3UXAA 5L9FA 5FF3A 3NM1A 4ONVA 3LCFA 4UFHA 4ZVJA 4Z0JA 5TBOA 3G24A 4UTKA 2WV8A 2Q8ZA 3GDRA 2XN2A 4HNNA 5EA9A 2OT1A 2GVGA 4E2BA 5HNRA 3UNDA 4TIMA 4MVAA 4ZQNA 4DO6A 4HNUA 3OIXA 3SIZA 4GWEA 1LYXA 2Y7GA 2HTMA 3HPXA 4GXMA 3EXSA 3PAJA 2CLEA 3GXPA 4ADSA 1QPQA 4K8EA 2QJGA 2NWSA 1FBAA 5K2ZA 4FF7A 1JQVA 4AMAA 2NLIA 3FKKA 5C54A 2B4GA 3KRZA 2CW6A 4BFAA 4XKYA 3MI2A 4FNUA 5D38A 3A9IA 2CLKA 4WXZA 1W5OA 4O1CA 4JX4A 2BXVA 4H6KA 1JUEA 3TE9A 5DELA 4A21A 2ZTKA 2RHGA 1YPIA 3TK7A 1UBSA 1ME7A 3GZ3A 4DXVA 4JTUA 4KWWA 3F1QA 3BO9A 2Y85A 3LX9A 4K6AA 4MY8A 3LXCA 4JTIA 4O11A 4WJEA 3EKLA 2HMCA 2J24A 4Z08A 4UR8A 3W2MA 5CKSA 3IGXA 4UNKA 5EBUA 1OFQA 1I2NA 4UFMA 1KFBA 4IMGA 4LW7A 4DQWA 4UMBA 3T78A 4MZ1A 1S5WA 3NL5A 1IXNA 4HPXA 3TMQA 3LRMA 1G7VA 3O63A 3VE9A 3RNDA 4JX5A 5F2IA 1P0NA 1T8XA 2FTPA 4A29A 4OBTA 4LVGA 4NXSA 2VC6A 3DGRA 2QCFA 5LNRA 2OX1A 1N8FA 5J5DA 1K7XA 2FFCA 1KFLA 1OX4A 3WJZA 1Z41A 4RV8A 4K8HA 4PL2A 2V81A 3MUXA 5CZ0A 2A5HA 3L21A 4JS3A 1LRTA 5AHLA 3LDVA 1GVRA 3W7QA 3ABRA 1YDVA 3GDLA 3DU0A 1QNVA 3IIVA 1GVFA 2V2HA 2VFGA 3TXZA 4UFLA 4A22A 4GC4A 3TX9A 1OX6A 1JULA 3I6RA 1VRDA 3C4UA 3M47A 3E49A 4N6FA 3SGUA 4GUFA 1TMHA 1LTDA 4O15A 4UTLA 1D9EA 1TQJA 4LVAA 2YYUA 3NDOA 3CB8A 4NNCA 3IGUA 1GJPA 2EHHA 4POCA 3R5EA 4KKXA 3DXIA 2DORA 1SUXA 2FDSA 1THFD 3DKJA 3TDFA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3BV4A

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Chord Diagram

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