3CUF | Genus

Total Genus 132

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	132
sequence length	314
structure length	314
Chain Sequence	ATTLKEAADGAGRDFGFALDPNRLSEAQYKAIADSEFNLVVAENAMKWDATEPSQNSFSFGAGDRVASYAADTGKELYGHTLVWHSQLPDWAKNLNGSAFESAMVNHVTKVADHFEGKVASWDVVNEAFADGGGRRQDSAFQQKLGNGYIETAFRAARAADPTAKLCINDYNVEGINAKSNSLYDLVKDFKARGVPLDCVGFQSHLIVGQVPGDFRQNLQRFADLGVDVRITELDIRMRTPSDATKLATQAADYKKVVQACMQVTRCQGVTVWGITDKYSWVPDVFPGEGAALVWDASYAKKPAYAAVMEAFGA

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Hydrolase
molecule keywords	Exo-beta-1,4-glucanase
publication title	Probing the binding sites of Family 10 and 11 Xylanases with extended Oligosaccharides rcsb
source organism	Cellulomonas fimi
total genus	132
structure length	314
sequence length	314
ec nomenclature	ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date	2008-04-16

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00331	Glyco_hydro_10	Glycosyl hydrolase family 10

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	3cufA00

2Z1SA 3KEHA 1CEOA 3KE0A 4H8VA 2WKLA 2GJPA 3CHEA 3NCOA 3AZTA 1QI4A 1XCXA 5HDRA 3WY1A 4TVDA 1GVYA 4B15A 5LA1A 3KL5A 4A3YA 1F4HA 1MFVA 3K8KA 1BVNP 3ALGA 1ITCA 4JFWA 2C0HA 1TFVA 4HZ7A 1UR0A 2EPNA 5A69A 3BAWA 2UY2A 4W8LA 1G01A 1MQRA 3WFLA 3B8SA 2EPOA 4UNIA 1J0YA 4PCSA 2G3MA 4J28A 4EE9A 3SCOA 1ISVA 5ABGA 1OM0A 4LYRA 3VM5A 2CITA 3NSXA 5I6SA 2WC3A 3OIHA 2WM0A 2RGMA 1UH4A 3K1DA 1E4LA 4M8UA 2DH2A 1VENA 4PMXA 1UD5A 1J01A 5CQ1A 1BYAA 5LA2A 3VDCA 3QR3A 2OWXA 3AIBA 3DHPA 5LA0A 1ESWA 1H5VA 1R7AA 3T08A 4DWSA 3TTSA 3QHOA 3AMCA 1LWHA 1B31A 5BRQA 1LG2A 2WVVB 1C92A 2XPKA 3T0DA 1LWJA 2WB5A 3W27A 3PZQA 3RILA 1NM9A 4PCTA 1KWGA 1WDQA 1ISZA 1KQZA 4ACYA 1EOKA 4ZE5A 4AWEA 2JIWA 4PUEA 4AEEA 1VBUA 1QW8A 2BV9A 4D6JA 1DTUA 3VIHA 2DT3A 2XIIA 1V3LA 1GORA 1V08A 3PTKA 1E3ZA 4LYPA 4PTXA 1GNXA 3WEMA 1BVZA 4JFSA 4B3KA 1GZJA 3BLPX 3QOMA 1UR9A 3AS0A 2PI6A 1W1VA 3POHA 2AAAA 1GOQA 4ZEPA 2GFTA 4S3KA 1C8QA 1CPUA 5EFFA 1W3KA 4JZ5A 7A3HA 5HPCA 5KEZA 1Q4NX 1YHTA 1QI0A 1Q6GA 1OINA 3A6OA 3M6DA 2CYGA 4QCEA 2D3LA 3M46A 2DIEA 5D8ZA 1WZKA 1KCLA 4DM2A 1E55A 4M81A 4HOXA 3DYOA 2XFFA 3W81A 2D3NA 4PMYA 4DUWA 4GI9A 1CXEA 3U5UA 3IJ7A 2WBGA 3RDKA 3ZJ8A 1NOFA 2XFRA 3WF1A 4PUDA 1UKSA 3WFZA 1BFNA 2J77A 1DP0A 3AIRA 1KXTA 2XIBA 1HKJA 1JDCA 3OB8A 1U33A 5DO8A 1C7TA 4UTFA 2YIHA 1QHZA 2VT0A 3DYMA 2J4GA 3TA9A 2BXYA 2QPSA 2ZE0A 1E15A 2E40A 2OYLA 3KWXA 2UY3A 2DSZA 4AZIA 1H2JA 1XH0A 5JIPA 3VIMA 3PZTA 1TA3A 2BY0A 1JI1A 1XC6A 4W7UA 4HTYA 1CGYA 3CLWA 4GKLA 8CGTA 4OJYA 1ZBWA 4J3XA 4U3AA 4WSKA 3L4UA 2VRJA 3UR7A 1VEOA 2ZX7A 4OBSA 2PF0A 1FH9A 2PBOA 3HMCA 1TG7A 4PMVA 2DSKA 1XD0A 2JF6A 3ARUA 3VMNA 1CBGA 3OA5A 2ZWZA 1KXQA 4HU0A 2ZXQA 3FHAA 4ATLA 1J0JA 4MAZA 3ZT7A 2PWHA 2E8YA 3CPUA 1JDDA 2ZXAA 5A8PA 3PZIA 3SUUA 4BF7A 2Q8XA 4BCEA 3ARRA 3VO0A 3CO4A 2Y5EA 1UZ1A 4AIEA 1EHAA 4LXFA 4MNLA 5E9AA 4CD4A 1FOBA 1JIBA 1L0PA 1JYXA 5BXSA 4W5ZA 4CD8A 4HOWA 3CZGA 1VFUA 1LL6A 1FA2A 2XJ7A 4XB3A 1UQYA 4CKQA 1H1NA 4CCEA 2EPLX 3VDAA 3AMLA 2XM1A 1C8YA 1FHDA 1DWIM 3WF4A 1FFQA 2F61A 1UYQA 2J7HA 2ZUWA 2VCBA 3BGAA 4J3VA 4C7FA 1ZL1A 2FH8A 3WBAA 2WWCA 1B0IA 4JIEA 3AHXA 2Y8KA 1IZKA 1VBRA 3MU7A 5CZKA 5CLTA 4EKJA 3VNYA 3AQUA 2ZUNA 1K9TA 2D0HA 1CGVA 2MANA 2PB1A 5A6BD 1M03A 4RE2A 1GQKA 1QNQA 1UWQA 4Z2GA 1HVXA 5HXMA 2BXZA 4M56A 5E6YA 3VINA 4W93A 3ZT5A 4JL2A 6CGTA 1TCMA 1ODUA 5DT5A 4QFUA 4MDOA 3HJEA 1CXFA 3PTQA 1WDSA 3THDA 5A8QA 1E3XA 2DSWA 3CMGA 2D2OA 1W2PA 3EMZA 4W88A 2E8ZA 4F66A 3VM7A 3SCSA 2G4FA 3VDBA 2ESCA 2OLHA 5CSYA 1U30A 1LLOA 1V0NA 5JBFA 1CXLA 5I79A 1UR4A 4ZFMA 1ECEA 4U2ZA 1MQPA 2XWDA 3ZR6A 5JUVA 5EB8A 1LF1A 1Z32X 3SCTA 4JHOA 2BFGA 2VZVA 1ZB5A 3N04A 4UFHA 4UQAA 2VI0A 2VR5A 2XFYA 2ZX9A 2J8GA 4HA1A 4PMUA 1HJSA 3AROA 2YA2A 1HP4A 3AISA 1WAWA 3BSHA 4AC1X 3BLKA 4QLJA 1CYGA 3NYDA 4IISA 3VU2A 4OKDA 1CENA 2DDXA 3WEOA 4FF5A 1C90A 1EQPA 1I1WA 5BCAA 5HBFA 5IDIA 2VZOA 1JXJA 2O92A 4ZE4A 3CZJA 2DEPA 2WVVA 2YJQA 4OZOA 2YLLA 4D1JA 3PZGA 4FLQA 3GXIA 4J3UA 4GI6A 3VVGA 5E0FA 1HKIA 5A1AA 1TMQA 5EFDA 1OGSA 3ARPA 3RO8A 3B9DA 2YA1A 4LX4A 1IT0A 4NRSA 1E6PA 4NF7A 1JNEA 3WD2A 2GJXB 1V0KA 4OBRA 1MW2A 2BHUA 2YA0A 1XSKA 4GIAA 3ZJKA 4A4AA 4AD4A 4AW7A 2X1IA 1BAGA 5AY7A 3EMQA 1OD0A 2XTKA 4AZCB 1W1PA 5ABHA 1JL8A 1ITXA 3VGHA 2D20A 4PMNA 1PEZA 5E09A 2ZXBA 1E0XA 3HN3A 2G3IA 2EXOA 1SYTA 3PHAA 4KRUA 3SCQA 2D1ZA 2WKGA 1G5AA 1WKYA 1W1YA 2CESA 5BROA 3A4WA 1GQIA 1AMYA 4K68A 1HL8A 3F5LA 3WNKA 4B3LA 1VF8A 2ZUTA 3L4ZA 3T2QA 2F8QA 1J0HA 4GI8A 1MYRA 2IXUA 2DGAA 2FH6A 3AHVA 1O7AA 2ZUMA 1K9DA 1H4PA 3AMDA 4MAVA 1W1TA 2CIPA 1OSEA 1GHSA 2GDUA 2X2YA 1R86A 4KGJA 3ARYA 3EDKA 4XZBA 1KR1A 3W28A 5A6LA 3G6LA 3OGRA 3UEQA 1H09A 3ZIZA 6TAAA 3IK2A 5LYRA 4UCFA 3WNNA 1M01A 4X0VA 5CGTA 2VNCA 3WUEA 1E0VA 1V6WA 2UY4A 1O6IA 1EXPA 3MMWA 4HMEA 4E8DA 2EQDA 1EHNA 3LMYA 4AD5A 1M53A 2WHKA 2PWDA 1GOOA 5EMYA 1XRVA 2PWEA 4NSBA 3VD4A 2WMKA 2PWFA 1HNYA 2JEPA 4CN1A 4GPNA 4WK9A 5KZ6A 2WMFA 2ZXDA 1K9EA 1MFUA 1H11A 1EDGA 4JAWA 4PMOA 1NOUA 3OLEA 2WVTA 3K4DA 5JBDA 3BSGA 1VEMA 3VTRA 2XVNA 5ABEA 3VIOA 3RPMA 1JNDA 1V02E 2CXGA 3N9KA 2V3FA 2OWWA 5TD4A 1UD6A 1WO2A 3N1AA 2HISA 5M03A 2XVGA 2FGLA 4PMZA 3VIGA 4TTUA 3FAWA 4R5EA 1ZS2A 4ATWA 1FHLA 3OLGA 1I1XA 1J0IA 3FW6A 3WMSA 4D6CA 5IFTA 3AS3A 2GDVA 3EDFA 1B3XA 2CKRA 3CBWA 3W29A 1E6NA 1QVBA 3WD4A 3BAIA 4KMQA 3CZEA 3SCUA 4S3JA 1BTCA 1QHPA 4AXNA 3AI0A 2WC7A 4HA3A 1SMDA 5DFAA 1UHVA 2QMKA 3N12A 1V0MA 2VCCA 2IUZA 4HZ6A 2CHNA 2JF7A 1WDRA 1HJWA 2ZOXA 3VX0A 1VB9A 1EIBA 2WMIA 3EMCA 1KR0A 3BH4A 1CTNA 2WC4A 4PEEA 5FCZA 2BY2A 4UQEA 3WQ4A 2VZUA 3L4YA 3WELA 3O2LA 1CGXA 1GOMA 3WF0A 1PAMA 4UOQA 1RP9A 4L4PA 2A3HA 4AZ6A 1QNSA 3I3BA 3O9NA 3GBDA 5D9MA 3BAKA 4TOQA 1GOKA 2WHJA 4PSPA 2XUCA 1FH8A 3GH5A 2D0GA 3AFBA 3NDYA 1UWRA 5I23A 2Z1KA 4U5KA 2Y24A 3MKKA 5A8OA 3WBEA 1UKQA 5I5RA 2E0PA 4JCMA 1KCKA 2W61A 4TXEA 2TAAA 4TX8A 2EO7A 2GVYA 5E0CA 5DMYA 1ZBCA 3ARVA 1C91A 2V5CA 3VD5A 1D2KA 1WNOA 4RL3A 5C71A 4CUCA 3W6LA 1ISXA 1GW1A 2WXDM 1QNRA 1VJZA 5BRPA 2VVNA 4D1IA 3RM8A 3GXMA 3GNOA 3L4TA 1JD7A 1G9HA 2HVMA 1GOWA 2FHCA 1HJQA 1L8NA 1JFHA 4PMDA 4F79A 3VKKA 4RE4A 5FIPA 3AOFA 4AYSA 3UG5A 3GH7A 2WPGA 2VJXA 4DWSD 2J75A 3II1A 4AMCA 1I75A 2X8RA 1LL4A 5A6MA 4JKLA 5D4YA 4KGLA 5ECUA 1VEPA 1JYNA 3BCDA 3F5KA 3QHNA 2D23A 4D6GA 5F7UA 1NWUA 1US2A 3WD0A 3WSUA 1TE1A 3TP4A 3MMUA 1HKMA 3WNMA 4C7GA 1E6XM 1Q6CA 4PMQA 1WZAA 3AMKA 3CTTA 3VIIA 3IJ9A 3W26A 1W9UA 3ZJ6A 2C8NA 5M3WA 2GJRA 2BHZA 5A8MA 2QLYA 1JAEA 1SFSA 5HNNA 1S46A 1W2VA 4LQ1A 3ZOAA 4U33A 1PX4A 2ZX5A 2OSYA 4KRTA 1JZ6A 5A95A 2J25A 7TAAA 3AIVA 5M17A 2EEXA 4UOZA 2YKKA 4XX6A 1VFMA 2A3EA 4Z2IA 1UWSA 1JG9A 1HXJA 2VC9A 1UA3A 1MWOA 5C70A 2EJ1A 4B9YA 3VIPA 3SCVA 3BMVA 1JZ8A 3F4VA 3J7HA 3SURA 2GJXA 1U2YA 3WDHA 3MS8A 3LPGA 1EDTA 3A47A 4W84A 4URIA 4C7DA 1QHOA 1W9VA 4JHZA 1QPKA 1W9DM 1DWFM 2DT0A 3WQVA 4AZCA 4HZ8A 1KGXA 4AY1A 4UFJA 4TVCA 2VRQA 3GH4A 1OIMA 4R27A 1ZJBA 2G3JA 4AZBA 3RIKA 5D8WA 2WAGA 3MSDA 3ARQA 4RE3A 3UETA 5BXTA 1M04A 3VGGA 2V3EA 4Q7NA 3AHTA 2YLAA 4MJ2A 1AVAA 1EA9C 5FL1A 2WHLA 5DT7A 3OZOA 4M29A 1HJXA 3T0BA 2XSBA 5E6ZA 4E8CA 2YBUA 1HP5A 3SCPA 1QBBA 2WMIB 3GZAA 5D9NA 4UOJA 4J3SA 3GDBA 2X0YA 4AISA 1OGGA 3A3HA 1V3IA 4LGXA 1JGIA 5FKYA 1EO5A 3PN8A 3SUWA 4GO8A 4GO9A 1OGBA 1CLXA 4P8VA 3VGFA 5BWFA 4CGTA 2DPEA 4Y7EA 1JZ7A 2D24A 1W9PA 1EOMA 1E43A 2O9OA 2VMFA 2XSAA 1SR0A 3CUHA 2YDSA 1MW0A 2NT1A 1C3FA 2BVDA 3OGSA 2WMJA 1ZU8A 3FAXA 3BCFA 9CGTA 1VJSA 1PBGA 2VX4A 1W3JA 2NT0A 1KGUA 2V5DA 2W91A 1XD1A 2XVLA 4TTGA 4J3WA 1H3GA 1PIFA 1V6UA 1EQCA 2J79A 3BXWA 3VD3A 2WMHA 3WDJA 2BVYA 4Z2HA 3AHYA 1J0KA 4PTWA 3SUTA 4J7RA 1KGWA 1BGGA 3B9AA 4WF7A 3F5JA 3W24A 2J47A 3AYSA 2OSWA 3WDQA 1VAHA 2UWFA 2WZIA 2OWCA 2D0FA 1VRXA 1NOWA 3K8MA 4AIUA 1E5NA 4PTVA 4WKAA 1UH3A 3QOKA 1KBKA 2BVTA 2WWDA 3AICA 1E4IA 1PX3A 1E6ZA 3NJ3A 1CXHA 4NRRA 4HP5A 4EANA 4M80A 3WQWA 4P7RA 1BG9A 1E71M 2YDRA 4ATDA 3WENA 1ZJAA 2XYLA 1UD8A 3KL0A 4W8AA 3W0KA 1WCGA 4JKKA 5GNYA 4CD6A 2YOCA 2WHMA 1J12A 1US3A 3OGVA 2J7BA 2WLYA 1B3VA 3WQ6A 3GXDA 1DWAM 3N17A 4MNJA 2GK1B 1WDPA 3AIWA 3AHZA 4CN4A 1OD8A 4AZGA 1BPLB 1K9FA 1RH9A 4H41A 4UFMA 1E0WA 1QOXA 4FK9A 1UQZA 1W9BM 4MB4A 3IANA 1KXHA 2VUYA 3LPPA 1OBAA 4V2XA 2ZWYA 2ZUVA 3W53A 1E9LA 2Y4SA 1E56A 1LG1A 1KQYA 1UKOA 2W4XA 4PSRA 3N18A 4YN5A 3ZR5A 1JI2A 3PTMA 4FLOA 1H49A 3GNRA 1UH2A 2XGBA 3VD9A 4D6EA 4MB3A 1DWJM 3U57A 3WNOA 3AJ7A 2CEQA 1E5JA 4W8BA 2QF8A 3RJYA 3TTQA 2WCSA 4UQCA 4IPNB 4U2YA 1B3WA 3WN6A 5CJ5A 2BNJA 4MDPA 3MUY1 2CBIA 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1XSJA 3ZQ9A 1VFOA 5A2BA 3N13A 4OOZA 4PTMA 2GUYA 1D3CA 3ARSA 3A4AA 2YL8A 1MXDA 4CD5A 1JZ5A 1UG6A 4Z2JA 3FY1A 2VX5A 3VIJA 1JZ4A 3NSNA 3WD3A 3CUFA 2JFEX 4BQ5A 1E70M 1BYDA 3MV11 3AIQA 4P7NA 1KXVA 4P8WA 4AD3A 1JD9A 3QHMA 3SCRA 3CZ8A 2E9BA 3CHCA 3WMCA 2X05A 5A6AA 3WQ5A 1JYWA 2WZHA 4HMCA 5IFPA 1IV8A 1B3YA 2G41A 1Q6FA 3CGTA 3AXIA 4DUVA 1PPIA 1RP8A 1W32A 4A3HA 3APGA 1H0IA 1QNPA 3TTOA 3ARXA 3UCQA 3W25A 3CZLA 1XV8A 4MNKA 3TOPA 4AD0A 2OSXA 1H41A 3VOCA 4JCLA 2VZTA 4H8UA 5GNZA 1HJUA 2WZEA 1CXIA 1CXKA 1LL7A 2EBNA 4ACZB 2XVPA 7CGTA 1J10A 1PJ9A 4BQ4A 5A94A 2G3NA 1R7OA 1EGZA 5DEZA 2J7DA 4P7QA 3EYPA 2Y2WA 4EK7A 3WL0A 3WH9A 2BY1A 4J3TA 5CPTA 1WE5A 1UR1A 3IJ8A 1NWSA 3VIFA 1ZBKA 2J8FA 3GM8A 3WDIA 5GPRA 3LPOA 2QMJA 3POCA 3CIVA 1VFFA 2WVUA 2V3GA 2WYSA 4LYQA 2JALA 1D7FA 3NUKA 1DWHM 3WUFA 4HOZA 2X09A 4UQ9A 1G1YA 4W5UA 5A6SA 4IM4A 1JAKA 4KWUA 4CU6A 1X1NA 1WZLA 2VO5A 2D22A 2DSUA 4LPCA 3OLDA 4X0NA 2GK1A 2GSJA 2VZSA 1N82A 4Z2LA 3FN9A 2YL5A 2NSXA 1WB0A 3VPLA 4D72A 1UA7A 3BC9A 1CGTA 5A2AA 5BXPA 3CHFA 4JFVA 3SCWA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3CUFA

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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