3CUG | Genus

Total Genus 132

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	132
sequence length	314
structure length	314
Chain Sequence	ATTLKEAADGAGRDFGFALDPNRLSEAQYKAIADSEFNLVVAENAMKWDATEPSQNSFSFGAGDRVASYAADTGKELYGHTLVWHSQLPDWAKNLNGSAFESAMVNHVTKVADHFEGKVASWDVVNEAFADGGGRRQDSAFQQKLGNGYIETAFRAARAADPTAKLCINDYNVEGINAKSNSLYDLVKDFKARGVPLDCVGFQSHLIVGQVPGDFRQNLQRFADLGVDVRITELDIRMRTPSDATKLATQAADYKKVVQACMQVTRCQGVTVWGITDKYSWVPDVFPGEGAALVWDASYAKKPAYAAVMEAFGA

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Probing the binding sites of Family 10 and 11 Xylanases with extended Oligosaccharides rcsb
molecule tags	Hydrolase
source organism	Cellulomonas fimi
molecule keywords	Exo-beta-1,4-glucanase
total genus	132
structure length	314
sequence length	314
ec nomenclature	ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date	2008-04-16

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00331	Glyco_hydro_10	Glycosyl hydrolase family 10

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	3cugA00

5I77A 2D0HA 2RGMA 1OB0A 1JAKA 3PZTA 4Q7NA 1VFUA 4PEEA 2G41A 3BAIA 2ZX7A 2WSPA 3VIMA 5IFTA 4ZENA 3AIRA 2IXUA 5DMYA 4UFKA 3UG3A 5D4YA 4DWSC 1K9TA 2WZEA 5AC4A 1ODZA 1C7SA 4KGJA 4WKAA 1CTNA 2WZIA 4MDOA 3NDYA 3T2PA 3UERA 3WD1A 4B15A 2O9PA 3W6MA 1J0ZA 2D2OA 4XV0A 5KEZA 1FP9A 2WAGA 9CGTA 1NH6A 1G9HA 3UG4A 3VINA 2D22A 2JALA 3PZQA 3WD0A 4TVDA 2VVSA 1UD5A 2FGLA 4CVWA 4B9ZA 4EAMA 1F4AA 2BVTA 4JL1A 4F8XA 1K9DA 3N12A 2WYSA 2F2HA 3N1AA 5E6YA 5KZ6A 1SYTA 5D8WA 3UR7A 4FLOA 1GOOA 1WDPA 3ZJ6A 3AHYA 2VZOA 1VEOA 5ABFA 2VRQA 3WL1A 4AMCA 2DSZA 5EB8A 4QP0A 2XM2A 1W9DM 3UESA 5A6SA 1WDSA 3ZR6A 3N15A 1S46A 1UR4A 3VD3A 3DHUA 3AROA 1QHPA 3MS8A 1KFWA 3A4XA 1VB9A 1J0HA 1CEOA 2A3CA 3MV01 3CMJA 2VCAA 5I0DA 1UD2A 1E15A 3ZR5A 3WQ8A 3CHFA 1JF5A 4KMQA 2BFGA 4D1JA 3SCVA 1B30A 3WQ6A 3VIIA 3WUBA 3SUTA 3VX0A 2PF0A 5E70A 3ZIZA 3PN8A 4BF7A 1WAWA 3AHZA 4W7VA 1KXHA 4MB3A 4XZWA 1U33A 1XD0A 2Z1KA 3AMGA 4M29A 2CIPA 1KXTA 4PYSA 3MSDA 3CUJA 4OZOA 1JZ3A 2UWFA 3ARTA 2OWWA 3AMKA 4Z2LA 3BCDA 2JE8A 2WANA 4GQQA 1JNEA 2YLLA 4F9JA 2VCBA 1HP4A 2ZX8A 5CLWA 3CZEA 1DP0A 5CZKA 4M81A 1CXFA 1GOMA 1UKOA 1C8QA 3PTQA 4GIAA 3WENA 1JDDA 2BHYA 2W63A 2E3ZA 1ZBVA 4HZ7A 3OBAA 3WH6A 4U2ZA 4Z2GA 4CD4A 1XSKA 4W8LA 2XHYA 3OB8A 1JZ6A 4PSPA 1VFMA 5BXRA 1QBAA 1E6ZA 4UZSA 3L4UA 3MUZ1 4P7LA 3APGA 5BWFA 1XYZA 3M6DA 4LYQA 2WLZA 1I1XA 3MUIA 4R27A 5IHRA 2EPMX 5AC5A 1KR0A 2JIWA 3OLDA 2YA0A 4L4OA 3O9NA 2DPEA 3VIKA 2V38A 2EPNA 1CLXA 1XH2A 4AW7A 3PZ9A 1NWUA 2DEPA 5A2AA 4D6JA 1R8LA 2GK1A 5AY7A 4AYSA 1B2YA 1ZB5A 2JFEX 4WKHA 2A3EA 3CZLA 4W8AA 3U57A 1Y7VA 1H11A 2BHZA 4FLQA 1WP6A 4H7VA 8A3HA 2HVMA 3BC9A 1SFSA 2ZX6A 1VFOA 4NF7A 1BGGA 5F7UA 1WZLA 3OIHA 2AOSA 1V6VA 1HKIA 4AZCA 2EPLX 1G0CA 4MAZA 4M1RA 4R5EA 4B16A 3WUEA 2WKGA 3VM5A 1JNDA 1ITXA 2FH8A 2Z1SA 4ZFMA 3KZSA 2ZXDA 1QI0A 2E9MA 4CN6A 4JKMA 5EFFA 4QLJA 1PJ9A 3OA5A 2V3DA 3CHCA 1HJWA 2WMGA 1D7FA 4YHGA 2QF8A 3AIVA 1I75A 2ZX5A 4AY1A 3FY1A 2J47A 4MDPA 1OGGA 3GNPA 2XVKA 1FH7A 2ZX9A 3EMQA 1J10A 1MW2A 3AIWA 2J7BA 5JBEA 4GZJA 4RE3A 1HXJA 1US3A 1BHGA 1WB0A 1QNQA 3N04A 3DC0A 1IZKA 4HOWA 3EDKA 2XVPA 2Q8XA 1XH0A 4F66A 3BAKA 3WDHA 1E4LA 2VZVA 3AXXA 4BS0A 3VX1A 3BLPX 1C8YA 5I5RA 4W87A 5DT7A 1GNXA 2VCCA 2GJXA 4OBRA 4JAWA 1E9LA 2XUCA 1HKJA 5D9MA 4UQBA 3WH5A 1BF2A 1MFUA 3K8LA 5ABGA 4L4PA 4W86A 1BSIA 1KGWA 4OKDA 2GDVA 1J12A 3VMNA 4A3YA 2YL8A 1BVZA 3AS0A 1M04A 2FH6A 1NWRA 3B8SA 3WL0A 1VEMA 3W82A 5C70A 3VGEA 3ALGA 4UQ9A 2GFTA 1Q6FA 5LA1A 1B3VA 3G6LA 1E5NA 3SCPA 3T0AA 1KBBA 3AS1A 3WD3A 1XV8A 1UA7A 2DT2A 3BXWA 1A47A 2YDQA 3WUFA 3AIEA 3ARZA 3W37A 1ZU8A 1E0WA 2CPUA 4JCMA 1EO7A 1YQ2A 3VGBA 1N82A 1HJXA 1X6NA 2YBTA 2D0FA 3VDCA 2AMGA 1DWFM 3RM4A 2J7EA 1E40A 1SMDA 4JKKA 4HOZA 1L8NA 3GH4A 1E4MM 4ACZB 3N13A 1E6XM 2DT0A 4D6DA 2O9TA 4WSKA 4UR9A 2CEQA 5CJ5A 2EPOA 2VQTA 3E1F1 3AZTA 1HX0A 2ESCA 2CHNA 4UZUA 1XH1A 3ARRA 5CQ1A 1E72M 7TAAA 1KGUA 4CD6A 3W53A 4H2CA 2PWEA 1JDCA 4P8WA 3HMCA 1C93A 3B9EA 4J27A 4BQ3A 1KXQA 3ZT5A 5A69A 1V3MA 3AOFA 1KWGA 7CGTA 1H49A 4PMQA 1UWUA 1Z32X 3ZJ8A 1W3LA 4UCFA 2NW0A 1VF8A 3T0BA 2VUYA 3HU7A 3EDFA 4QFUA 3MO4A 4P7OA 3GBEA 1BG4A 2VRJA 1G5AA 3LMYA 1E1FA 3PBGA 2FHCA 1M53A 3AS2A 2E9LA 4LYRA 5A8NA 1QI2A 4Z2JA 4N42A 2BXYA 1GVIA 3BAWA 2J79A 4URIA 5BROA 4HMDA 2MANA 1IV8A 2FHBA 2AAAA 1UKSA 1UWRA 3N17A 4FMVA 3AIBA 5JUVA 1V6YA 2XVGA 1TVPA 4W93A 1OT2A 1EHAA 3AYSA 4BCEA 1JYVA 1IZJA 2DSVA 1XCXA 3WN6A 1QI3A 5IFPA 2G8ZA 3WH8A 1NP2A 3MU7A 2ZUVA 4MAVA 4W85A 1XSJA 1LG1A 4PMUA 4HA4A 4HU8A 1O7AA 4AZHA 3VTRA 2HISA 1XHGA 4HZ8A 2W61A 2B31A 3AHXA 3GZAA 2V3EA 4AZ7A 4ZE5A 2WVSA 1EHNA 3WELA 1CENA 3WSUA 3D3AA 4BZYA 4V2XA 2WPGA 3W27A 3WF4A 3SIMA 2VX7A 1H09A 3VKKA 4JFVA 4DUVA 1V6UA 4AD2A 3K1DA 4U3CA 4X0VA 4KWUA 1K9EA 6A3HA 1EA9C 1UR1A 4C7FA 3LPOA 3CHDA 1G01A 2CBIA 4QAWA 4FF5A 2WVVA 1UQZA 5TD4A 1D2KA 2J74A 2GUYA 1CXEA 4GI9A 1W9VA 2WMIB 3ZQ9A 1KCKA 4AWEA 2YDSA 2WHLA 4D6FA 5JBFA 1MW0A 1UYQA 2Y24A 4JHOA 1BPLB 2ZUMA 3UCQA 2ZXQA 3CZ8A 2VQUA 2BNJA 1SMAA 3K4DA 1DEDA 1UD8A 5FL0A 5FKYA 2BXZA 1JI1A 1F4HA 3RM8A 2WC4A 1AQ0A 2J25A 3MUAA 4W5UA 3ARQA 1TUXA 4UFJA 1UG6A 1W3HA 3L2LA 1W1VA 3LPPA 1KB3A 1D3CA 2CNCA 1QHZA 3PZNA 1H0GA 3I3EA 1CGUA 2EQDA 1M03A 4E8CA 4DWSD 3NJ3A 4E4PA 1RH9A 2D3NA 5JBDA 4MB1A 1DWIM 1UH3A 4CD7A 2VI0A 3FW6A 1V3IA 3BAXA 1GQIA 2XYLA 2DGAA 1GCYA 5A6MA 2CCRA 2QHAA 5FD0A 3UR8A 2JEQA 3WDRA 2J75A 3SEPA 2UY2A 1EH9A 3VIPA 5EBAA 3W28A 3TOPA 2CBUA 2BVYA 1CIUA 1JAEA 2WVTA 1QNSA 5GNYA 2J77A 3TP4A 3WEMA 3VVGA 3HN3A 3S6TA 4D6HA 3NDZA 2XG9A 1HKMA 4JHZA 3THDA 2JEPA 5LA2A 3MANA 3QOKA 1EGZA 3F5LA 5BXPA 1PX8A 2VR4A 4W88A 5CSYA 3GXMA 4B9YA 1E0VA 1E6NA 4RL3A 2C0HA 2VURA 2VRKA 2FHFA 1KXVA 3WD4A 4BQ4A 2CITA 2D24A 3N9KA 1Q6DA 1UWIA 2PBGA 1EOMA 3GYCA 3WF0A 1WDQA 3OGVA 4WLCA 1AQHA 1XYFA 3AISA 4RE2A 4TX8A 3CHEA 2G3NA 5HPCA 2NT1A 5HPOA 3L4XA 1W1PA 1JL8A 5JIWA 3VU2A 1V03A 4UFMA 5A8PA 1CGXA 2XSAA 3U5YA 1PX4A 1ZJBA 1E6PA 4AD1A 5I2UA 1J9YA 2YBUA 4PMRA 4D6CA 5ABFB 1EXPA 1TG7A 4HTYA 1ESWA 1GOQA 2X0HA 1V3KA 2X09A 1LG2A 1OM0A 2BS9A 8CGTA 5AYBA 1E3ZA 3II1A 4GI6A 3WEZA 3VIOA 1UKPA 4CU6A 5A94A 5BXSA 4D72A 2YLAA 1U2YA 1UWQA 3EMCA 3F5JA 2IUZA 3ZOAA 1JG9A 3VO0A 4MTVA 2V5CA 3L4ZA 1ITCA 4M56A 3KE0A 4RE4A 4QDMA 2DIJA 4GXPA 2D3LA 4U2YA 3AXIA 3VD9A 3POHA 2ZUWA 3PZVA 3QHMA 1V0LA 4P7NA 1PZ3A 4Z2HA 1CNVA 4PSRA 1BYDA 4CCDA 1JZ8A 4IPNB 4Z2IA 2WHMA 4H41A 1H41A 1K6AA 4KRTA 1DWGM 3BAYA 4ML4A 3DYPA 1VBUA 1LL7A 2Y4SA 4BA0A 1JXKA 1V0MA 2ZWYA 3IJ9A 1E3XA 4GKLA 2J78A 4TVCA 1UZ4A 1TZ7A 3OG2A 4F9DA 5FL1A 4AZ5A 3PZMA 3CPUA 5I24A 3IK2A 5A8MA 3CUIA 1CXIA 3SURA 1JZ7A 4CUCA 3KWXA 5BRPA 1ISXA 1VEPA 2WVUA 2IXVA 3PTKA 1I1WA 1CBGA 4HMCA 2DT3A 3WKZA 2VX4A 2WHJA 3EDJA 1QNOA 5CSUA 4AD5A 3A3HA 4GINA 3ZT7A 2A3HA 5A6BA 1JFXA 3AZRA 5FOOA 3WQ5A 1CYGA 1E73M 3WIJA 1HF6A 3SCUA 2WB5A 1NM9A 4UQAA 2WBKA 4AIEA 2OWXA 2VNCA 2WMJA 2X1IA 4HPHA 2V3FA 2PWGA 1XCWA 5D9NA 4H8HA 4X0NA 3CGTA 4IUGA 5I78A 3IJ8A 1BQCA 4WSJA 4UFIA 4Z2KA 1ISVA 1JXJA 3K8KA 3VDHA 4CD5A 1TE1A 3A4WA 2WCGA 4X9YA 5LA0A 3ZO9A 3IANA 5FCZA 1ZS2A 1VFFA 3EYPA 4UOQA 1W3JA 1ISYA 3WF1A 1J0JA 1MXGA 2WSKA 4TXEA 5IXEA 3K4AA 1B3WA 2GK1B 2OYLA 4GZIA 1OD8A 3RMEA 3RIKA 5ABEA 1WZAA 3RILA 4W5ZA 2DH2A 2W5FA 1VJZA 2QPUA 1GJWA 2CETA 3PZIA 2VTFA 3M46A 4KRUA 1JI2A 2XIIA 1C3FA 4DUWA 2VZSA 2DSUA 4OJYA 3FHAA 2OSYA 2GDUA 1UR8A 1VJSA 2WMKA 1OT1A 4J3XA 2DT1A 1LJYA 4FLSA 4XB3A 3T09A 3WBAA 1ZBKA 3M7SA 1HJQA 3GXDA 4GZEA 3ALFA 2TAAA 4AZCB 4GO8A 4Y7EA 3B9AA 4PMXA 3AXHA 3ARYA 2WC7A 1U30A 4HPGA 1UKTA 1Q4NX 2QLYA 1UZ1A 5CXPA 1PEZA 4CU8A 3VIGA 2YL9A 1ZBWA 4W7UA 4CU7A 3AIQA 3O6AA 2PWFA 2XWDA 3IAQA 5CG0A 4JFUA 3WNLA 1GPFA 3PZGA 1VIWA 2WMHA 3NSNA 1MWOA 1PX3A 1B31A 2ZUNA 3SCQA 4A4AA 1W2PA 4H04A 4OOZA 2XGIA 3GNOA 3RPMA 2DH3A 2XPKA 2NSXA 5HBFA 3MMWA 1CXLA 1O6IA 4AZIA 3W29A 3RM9A 1CWYA 1PAMA 1V08A 4C7DA 4AD0A 1AMYA 1PIGA 1UHVA 2YOCA 4ZE4A 3QR3A 1V02E 2ZXBA 1CXHA 3SCRA 1OWQA 4NI3A 4MNLA 5CPSA 1JYNA 1E1EA 1JD9A 2GVYA 2X8RA 1B1YA 1NWTA 3GXIA 1OIFA 2J8GA 1BYCA 1AQMA 4IISA 3VGHA 5A6BD 1JZ2A 4CKQA 1OGBA 2Y2WA 4CCCA 3ARSA 1V3LA 5A6KA 2GJXB 2WBGA 1B90A 1C91A 4UNIA 3VILA 4OUEA 2PI6A 1PZ2A 3CIVA 3A4AA 4JZ5A 4BQ5A 4P7QA 3L2MA 2F61A 1HT6A 5HNNA 3WMBA 4CCEA 3N11A 1CXKA 1EOKA 5I79A 2V5DA 2DSWA 4XX6A 4TX6A 1ZL1A 4AEFA 3ARXA 3NYDA 2ZUSA 1NP0A 4HZ6A 6TAAA 3KEHA 1Q6CA 3VMPA 3ZJ7A 2BHUA 3K46A 3WQVA 3T2OA 2CYGA 4DM1A 4GPNA 5FIPA 1OIMA 4M8UA 3WFZA 1K9FA 5GQBA 2XTKA 4J3VA 4YN5A 3VDAA 4MJ4A 3CMGA 1C92A 4MNMA 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2WWDA 1W32A 3BGAA 1MQPA 2WNWA 3L4YA 6CGTA 4J7RA 4UQDA 3W24A 4M24A 4CGTA 1GOKA 5BYWA 3AHTA 4GO9A 1LL6A 4MB4A 2VO5A 1E55A 1AVAA 5A2CA 1RP8A 3U7BA 4ATWA 2Y5EA 3AYRA 2F8QA 3AI0A 1RPKA 2CESA 1CGVA 2WVVB 1QI4A 3WF2A 4J3UA 4LXFA 1HIZA 2JIEA 1E56A 2YJQA 4ATDA 3TTOA 3VD7A 1FOBA 4D71A 4F79A 2YA1A 2ZXAA 4PTVA 3VOCA 1LWHA 2FDMA 1QOXA 1H3GA 4J3TA 4XZBA 1C7TA 1OBAA 3BCFA 3VM7A 4EE9A 3VD4A 1GVYA 4PTMA 3WNNA 1RD6A 2EEXA 5CGTA 3B9DA 3TA9A 1E6RA 5DO8A 1KCLA 1FFRA 1LL4A 2UY5A 3UETA 3CZGA 1BGAA 4PCTA 4JFTA 2VX6A 3D5HA 3GDBA 3F4VA 3PTMA 3LPFA 2O9OA 2BV9A 3AIUA 3FN9A 1GONA 4J3WA 4CVUA 4P7RA 1E70M 4UFLA 2WXDM 5ECUA 4LX4A 1NARA 1XSIA 3VIFA 2VZUA 3EMZA 1H0IA 3ARVA 4LYPA 1LWJA 2GJRA 1R86A 3W81A 2PC8A 3UEQA 1R7AA 5C71A 3RJXA 4KH2A 5EMYA 2VR5A 4ZXLA 1FHDA 2GJPA 5A2BA 3W6LA 4AIOA 1B3ZA 1W9XA 5DT5A 1CDGA 3KL0A 1P6WA 2DIEA 3EBVA 2WCAA 1JIBA 5JIPA 3I3DA 1TR1A 3VDBA 4NRRA 3OGSA 1JF6A 1PBGA 4PMOA 3WUGA 4M80A 3ZSTA 1HVQA 1M01A 1WZKA 3T08A 1J0YA 1WNOA 2E4TA 1B0IA 3HJEA 1XD1A 1UH2A 2XIBA 3OZPA 4HA1A 1GOIA 1JZ5A 3SCOA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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3CUGA

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