3CUG | Genus

Total Genus 132

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	132
sequence length	314
structure length	314
Chain Sequence	ATTLKEAADGAGRDFGFALDPNRLSEAQYKAIADSEFNLVVAENAMKWDATEPSQNSFSFGAGDRVASYAADTGKELYGHTLVWHSQLPDWAKNLNGSAFESAMVNHVTKVADHFEGKVASWDVVNEAFADGGGRRQDSAFQQKLGNGYIETAFRAARAADPTAKLCINDYNVEGINAKSNSLYDLVKDFKARGVPLDCVGFQSHLIVGQVPGDFRQNLQRFADLGVDVRITELDIRMRTPSDATKLATQAADYKKVVQACMQVTRCQGVTVWGITDKYSWVPDVFPGEGAALVWDASYAKKPAYAAVMEAFGA

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Hydrolase
molecule keywords	Exo-beta-1,4-glucanase
publication title	Probing the binding sites of Family 10 and 11 Xylanases with extended Oligosaccharides rcsb
source organism	Cellulomonas fimi
total genus	132
structure length	314
sequence length	314
ec nomenclature	ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date	2008-04-16

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00331	Glyco_hydro_10	Glycosyl hydrolase family 10

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	3cugA00

3VDAA 1PZ3A 3ARZA 1AVAA 1XYFA 4BCEA 3ZJ7A 1XSIA 1H41A 1XSJA 3WUGA 4Y7EA 3TONA 4S3KA 4HZ7A 4H8HA 1MQRA 3O9NA 1XCWA 2J78A 2YLLA 3MUAA 3DYPA 3M46A 3O2LA 3AXXA 1JZ2A 1EH9A 4FK9A 1US2A 3ARRA 4DM1A 2ZX8A 1GOQA 4FLSA 5E9AA 3SCNA 1UD3A 3WQWA 5E6ZA 1J10A 1VEPA 3VDCA 1VIWA 2WVSA 3RM8A 3D5HA 2WXDM 2G3IA 1BHGA 1K6AA 1MVYA 4AIUA 5JBEA 1MWOA 1AQHA 3AISA 2VUYA 2YL6A 4GKLA 1KWKA 1PIFA 2D1ZA 1KB3A 1E5JA 3KZSA 4LXFA 3IAQA 1R87A 1G01A 4J3VA 5FL0A 3GNOA 3AI0A 3MUY1 2OYKA 3WEMA 3EDDA 3PZNA 4HA1A 5M3WA 3BC9A 3ZT5A 1ZBCA 3OGRA 1HJXA 2FGLA 2PF0A 2JF6A 4WKFA 2YBUA 1IV8A 1EOKA 1LWJA 1U33A 5E6YA 2JEPA 5I2UA 2ZUTA 1GHSA 4GINA 4H41A 4LYRA 4PMDA 2WMHA 4KGJA 3SCRA 3IANA 4DUXA 1CXKA 1JAEA 2CEQA 4UOJA 1N82A 2JFEX 3WH5A 3VGEA 4PTMA 3SCUA 3L2LA 1FH8A 2J25A 5KZ6A 1OSEA 1CGTA 3WUEA 4AD3A 3KE0A 3VIGA 2XFYA 4CKQA 2CPUA 3W24A 1XRVA 3W0KA 1MFUA 1DWFM 4W7VA 2V3FA 4W8LA 4URIA 2VRQA 2JIEA 2DT0A 1LG2A 1EO5A 2FHCA 2AOSA 4AD1A 1VENA 4HOXA 2RGLA 5FD0A 1OBAA 5AY7A 2YA0A 4KRUA 3ARXA 3LMYA 2XVGA 4UFHA 1EQCA 2Z1KA 2W4XA 4P8UA 1G0CA 1E40A 5FKYA 4F9JA 2QF8A 2O9PA 4D6IA 3UERA 1XHGA 1ODZA 3ARSA 1MYRA 3RILA 3PHAA 5A2CA 5TD4A 2IXUA 3L4UA 3VNZA 1EDTA 1GJUA 2JIWA 2Y5EA 3N11A 4H8VA 3F5LA 2V3EA 4Z2JA 2J77A 1W1VA 5CPSA 1OWQA 2WAGA 4WSJA 5A3HA 2G41A 3CGTA 3RJYA 3SEPA 1IZKA 1J0ZA 5A1AA 3CMGA 1UYQA 4ZFMA 2WVVB 3KL0A 2WW5A 3VMNA 1ZJAA 3WDJA 1PZ2A 1HKMA 2WVTA 3VO0A 4EK7A 4MB1A 1BAGA 1GONA 4MTVA 3A4XA 6CGTA 3PZOA 1W1YA 1PX3A 2XYLA 4HMDA 4WJXA 1M01A 1E6SM 2C0HA 1BG4A 2CIPA 2DEPA 4C7DA 2A3AA 4AW7A 2XM2A 4E8DA 1QI0A 1GW1A 3OLGA 2GVYA 4AZGA 3OZOA 1GQLA 4AD0A 4DWSD 1JG9A 1JXJA 1X1NA 2GK1B 5ECUA 3EDEA 5F7UA 1XCXA 1VBUA 4ATDA 1NWRA 4WKAA 2WSKA 1V0KA 1W9DM 5LA2A 3L4YA 1BYBA 2VC9A 3TP4A 1BGAA 1OIFA 1V6WA 3AHVA 3ARYA 3AZRA 4OKDA 4OJYA 1PEZA 1QI2A 1JI1A 1JFXA 3N18A 4PMRA 2WC4A 5BXRA 1E9LA 2BXYA 3OGSA 1M7XA 4J27A 2ZXBA 3OIHA 3WD2A 1UKSA 2WBGA 4HA3A 1JDCA 5GQBA 4OUEA 3L4ZA 4ACYA 2CBUA 3WEOA 5A2AA 3ZIZA 4HZ8A 5D4YA 3S6TA 4M1RA 1V3HA 1Z32X 1OCQA 3AIRA 3VTRA 3OLEA 5D9OA 1J0HA 1F4HA 4H8UA 3VX0A 2WBKA 4JFTA 3AZSA 2OYMA 1E0VA 4CU7A 2ZIDA 4FMVA 2AAAA 2EBNA 1HJSA 1EHNA 1MQQA 1JDDA 5HBFA 3GH7A 2O9RA 3M6DA 3GM8A 4W7UA 1NQ6A 2PWHA 1NWTA 3MV11 5ABGA 1J11A 1OINA 4BQ5A 3AFBA 4AISA 2WMFA 4CN6A 3W28A 3WY1A 2WNWA 1VAHA 5FCZA 1EIBA 3RDKA 2YL5A 1A47A 3AYRA 4AZCA 2JALA 1J12A 3WSUA 5A6LA 2QV4A 1EA9C 1WDPA 2XHYA 4UFKA 3WH7A 1D3CA 1QHOA 3CHFA 2XFFA 2EPKX 4GO8A 2CXGA 3EMZA 4N0RA 1C90A 4M81A 1XV8A 3EDJA 1CGUA 3BLPX 4GO9A 2UWFA 4HU8A 1G94A 1QNSA 4MB5A 4XZWA 5A8MA 2XTKA 2D2OA 4DUWA 1K9DA 1OD8A 1H0IA 5C8BB 4WSKA 1XD1A 3CUFA 4TXEA 2FGZA 4F8XA 4ZXOA 1C7TA 3PZMA 5A8OA 1CGVA 2BNJA 1QPKA 2E3ZA 1NH6A 1E55A 1DWGM 2OSWA 1VEOA 2UY4A 2ZXAA 3CHCA 4E4PA 4UZSA 5M03A 3IJ9A 1VFMA 5I5RA 5FOOA 2JE8A 3RO8A 3BAJA 4W84A 2IUZA 5CPQA 3FN9A 1E72M 5AYBA 3OA5A 1X6LA 4FLQA 1W3LA 3DHUA 2GJXB 1HJUA 1BVZA 5A94A 1C7SA 3B9DA 1JYNA 2QPUA 3VNYA 3K1DA 1VRXA 3CZGA 2WLZA 3BH4A 4HA4A 2ZOXA 4QFUA 3NDZA 1BYCA 1E4IA 2CKSA 3CH9A 3WF0A 3WH6A 4K68A 3AIQA 3N12A 4BS0A 4GXPA 2QLYA 2WCGA 2PWGA 2XJ7A 4V2XA 1BSIA 1W2VA 5C70A 2BVDA 3APGA 1CNVA 1CXEA 1KBBA 1KGWA 3EMQA 3NIYA 1RP9A 2ZX7A 1LJYA 1ITCA 3WQ8A 1PIGA 3ZOAA 1H0GA 2WVUA 3N04A 1QI4A 2D23A 3ARQA 1IT0A 2IXVA 4MAZA 4UFJA 3PZIA 3VIJA 2WCAA 4JCMA 2DH3A 1D7FA 4UQ9A 1JAKA 3K8LA 2FH6A 5LA1A 4OBRA 1ZBVA 1E56A 3QGVA 1EXPA 1BF2A 3HN3A 3PZVA 3WL1A 4Z2HA 1E71M 1J0YA 2HVMA 1QW9A 4ZE4A 5A8QA 4PEEA 3GXIA 5IHSA 4F66A 3CLWA 2WC7A 2O9OA 1WPCA 5IHRA 3AHTA 4P7LA 1H3GA 1W3JA 2VR5A 4ZE5A 4BQ3A 1V0LA 3T2QA 3WUBA 1W3HA 1BLIA 2X0YA 3ARPA 2E9BA 2VMFA 5DF0A 4OOUA 1ZU8A 2W92A 4RL3A 4P7NA 2O9TA 2BHUA 4RE2A 2VX7A 1L8NA 4EAMA 1DWAM 3N9KA 1XYZA 2FHFA 2DSUA 2WPGA 1OGSA 3UG5A 4U2ZA 3FNDA 4S3JA 1I1WA 4JAWA 1UOKA 1JZ4A 1CENA 4IPLA 2X2YA 3VU2A 3WNOA 2DT2A 1CGYA 1U30A 2UY2A 5IXEA 2VVNA 1C8QA 1ISWA 4QDMA 3OZPA 3II1A 2ZE0A 2ZUNA 2A3CA 2QPSA 1PBGA 4JKLA 4M82A 4MAVA 3KEHA 4WLCA 4HOWA 3EBVA 3VKKA 4J3UA 4NF7A 3MUZ1 3ALGA 1UD8A 2QMJA 1J9YA 4MJ4A 1KFWA 4JFWA 5IFTA 2WVVA 3RIKA 3RM9A 5BWFA 3VIHA 2J7FA 3CUJA 3TTOA 5CG0A 1JNEA 2E0PA 4P7RA 1KBKA 2BY0A 5BYWA 2YDQA 4UFLA 4RE4A 4D6CA 1R7AA 4H7VA 1LQ0A 3AMLA 4AZ6A 5I6SA 2W61A 1JNDA 3VD7A 3VINA 4TUFA 1V3KA 2E9LA 1MQPA 1SMAA 4D6DA 3I3EA 2Y2WA 1J0IA 2WHLA 1VF8A 4M56A 4JHOA 3BMWA 4KGLA 4UQBA 4WK9A 5CSUA 3MUIA 2DQXA 2WB5A 2GK1A 4B3LA 2WHJA 3AQUA 1CXIA 1W3KA 4MB4A 1E4MM 1ESWA 1E0XA 3W82A 5I24A 1VJZA 1DWHM 4AC1X 3FY1A 9CGTA 5DT5A 3PTMA 2VL4A 1W9PA 4W5UA 1ISXA 4Z2KA 3WNLA 1E6QM 3TTSA 2VNCA 1J0KA 3MU7A 3L4XA 2WM0A 1WO2A 2F2HA 4MPKA 3RMEA 2VJXA 1BGGA 3BAWA 2EPMX 3VILA 1FP9A 2V3DA 1UH3A 4LPCA 4U5IA 1EDGA 1FHDA 8A3HA 2OSXA 2GFTA 2YOCA 2XVNA 3ARTA 1DEDA 1DTUA 1R7OA 3WFLA 3WF4A 1XC6A 3WQ4A 2G3MA 5BXTA 3W25A 3A6OA 1UA7A 2BHYA 4LYQA 4UQAA 1B1YA 3W53A 3CUGA 1KXQA 2G8ZA 3AMDA 3WMSA 5CLTA 2W67A 1JZ8A 1Q4NX 3AIWA 2YDRA 4JFSA 3VIIA 1PPIA 4HMEA 4P7OA 5HPOA 3L4TA 3GH4A 3TOPA 1V3JA 2XVLA 3NDYA 3BLKA 1TR1A 1VFOA 3PBGA 3BSGA 4CD8A 1E3ZA 2CBIA 1E4NA 4EE9A 4XUYA 3CTTA 3WDRA 5BROA 1UUQA 6A3HA 2WMJA 5GPRA 3VOCA 2BY2A 1VFUA 4BZYA 2D24A 3NYDA 1QNPA 2J79A 1C91A 2DIJA 1QW8A 1SR0A 5EFFA 4UQEA 3FXYA 4JL1A 7A3HA 4X0NA 1NWUA 5HXMA 3SCPA 5D8ZA 2WCSA 1ZJBA 1HVQA 2VX6A 4JFUA 1PX4A 4CN4A 4BF7A 4WKHA 5I78A 3T0AA 2PB1A 3WMCA 1W9VA 5EMYA 1DWJM 2VQTA 1KCLA 4B9ZA 2WZEA 5AYIA 3UCQA 2YKKA 1QHZA 3CZKA 1JZ6A 4PUDA 4U31A 1ECEA 3GYCA 2XUCA 2WWCA 1PJ9A 3MO4A 1LL7A 3MMWA 2CESA 1CXFA 1FOBA 1GOOA 2BY1A 2VZOA 4DM2A 4TOQA 3WD4A 4HU0A 5BCAA 3WL0A 3WDPP 4QP0A 2E40A 2DSWA 4GI8A 1QI5A 1OD0A 3UG4A 1R85A 2GJXA 3CO4A 4JFVA 3GZAA 4MNMA 5A6BA 4PTXA 2PWFA 3DC0A 3WF1A 3QOKA 3VIPA 3I3BA 1C93A 1JYVA 3A4AA 4LQ1A 1CLXA 5CSYA 3BMVA 1UHVA 3ARVA 3WNMA 1KXVA 1NP2A 4V27A 4D6GA 5CGTA 4D6HA 1CLVA 3SCTA 1B0IA 1JD7A 4CCEA 2ZICA 1UWTA 5E09A 4Z2LA 3T09A 3VVGA 2YL8A 1V02E 5DO8A 1VBRA 1UR2A 2OWXA 2FH8A 3SIMA 2WC3A 4W8AA 1UR9A 4AZHA 2EPLX 3W4RA 1MXGA 2XM1A 2X09A 4OZOA 4TTUA 1E1EA 1XD0A 2YLAA 3WD0A 3LPFA 3CIVA 3NCOA 1VB9A 3BAXA 3NSNA 1GPFA 1HJQA 3BAYA 3AS0A 3FHQA 4QAWA 3SUVA 2W91A 1CDGA 2CERA 1LWHA 1ODUA 2C8NA 6TAAA 2HISA 3THDA 2WLYA 1FP8A 5GNXA 1B3XA 5A6JA 4PYSA 2AMGA 3VIMA 4ACZB 1B2YA 4Z2IA 1L0PA 3WF3A 2EEXA 4UQCA 1HJVA 1CXLA 1B30A 3D3AA 5E0CA 5JIPA 1JIBA 4QLKA 2J7GA 1UH2A 1ZBKA 2G3JA 2VCAA 2W66A 2CHOA 4L4PA 4NRSA 5M17A 2WK2A 1LL6A 4HMCA 1BVNP 2WMIB 3WDHA 5ABFB 3W26A 4NRRA 1TVPA 3AIUA 4UFMA 2ESCA 2JF7A 2CBJA 4QLLA 4FLOA 4CD7A 2Y4SA 3K46A 1A3HA 2VCCA 1ISZA 5I77A 1M04A 3VGBA 2CHNA 4QLJA 1WDRA 5EB8A 1E15A 1E43A 1V6UA 4ATWA 3UESA 1WB0A 2D22A 3WF2A 3VM7A 1EHAA 4MDOA 2CBVA 2D0GA 3PTKA 3M7SA 1UZ4A 3W29A 1KGUA 2VX4A 4CU8A 1UWIA 1UWSA 1EOMA 1Q6CA 2J74A 1JGIA 1CGWA 3AS2A 2XPKA 5I0DA 4TX6A 4D6JA 1H49A 4JL2A 2G3NA 1GUVA 1ZS2A 2VRKA 4NI3A 2C7FA 4W86A 1XH1A 3QOMA 2J7BA 1BPLB 3ALFA 3ZSSA 1E5NA 1B3WA 1AQ0A 3EMCA 3FW6A 1H5VA 3JUGA 1J0JA 1LG1A 2WYSA 4UZUA 1MW1A 2ZUUA 2VRJA 1KXTA 4IPNB 2WWDA 2E8ZA 1E6PA 3AMKA 4AMCA 2J62A 4JZ5A 4MNLA 1TA3B 1DWIM 1HVXA 1FH9A 1EGZA 3VGGA 1WE5A 1K9EA 1LLOA 1TG7A 1NOWA 1KQZA 4GPNA 1MW2A 5IDIA 2BV9A 1FH7A 3OBAA 1F4AA 1US3A 4UCFA 1E0WA 2V5DA 2W5FA 4IUGA 1IZJA 1UKTA 4UTFA 4C7FA 4CD5A 5IFPA 3QHOA 1HN1A 1AQMA 3VMPA 3FAXA 3MV01 2G4FA 4BQ2A 2VCBA 3WQ6A 1NP0A 4W5ZA 5JBFA 1JXKA 1QNQA 4LX4A 1MW3A 4CUCA 5CPTA 4E2OA 5A6AA 5JUVA 3WNPA 2VR4A 1QVBA 3SURA 4RE3A 3WNKA 3G6LA 3THCA 2FDMA 3SCQA 1HKIA 3BCDA 5E70A 1O7AA 1W91A 2DH2A 1J01A 1CWYA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2GJR A;  1Q6F A;  3MSG A;  3GXM A;  1E6R A;  2A3H A;  3AMC A;  1VFF A;  3NUK A;  3A3H A;  4GIA A;  1UA3 A;  2DSK A;  1FFQ A;  3AZT A;  4AXN A;  1G9H A;  4D1J A;  2EPO A;  3T08 A;  5A6S A;  1OT1 A;  1FFR A;  4PTW A;  3W37 A;  4P8W A;  1GJW A;  1E70 M;  2WMG A;  1WP6 A;  7TAA A;  4JHZ A;  4F79 A;  1S46 A;  1V3I A;  3BXW A;  2BVT A;  3ARO A;  3VGF A;  3OG2 A;  1FA2 A;  2VUR A;  4AZ5 A;  3NSX A;  2YA2 A;  1TUX A;  1E6N A;  1RD6 A;  2Q8X A;  1BYD A;  3MSD A;  3SCS A;  2OSY A;  1HJW A;  3IK2 A;  4J3T A;  3U57 A;  5CGM A;  1ISV A;  2XII A;  4X9Y A;  1V03 A;  3AOF A;  4GQR A;  2ZX5 A;  2DT1 A;  3VD5 A;  3N15 A;  4W87 A;  3BAK A;  3NSM A;  5A8P A;  4AZC B;  1GQK A;  3A4W A;  1JL8 A;  1QOX A;  3K8M A;  1CEC A;  3U5U A;  3VGD A;  1Q6D A;  3W6L A;  4D6E A;  4TVU A;  4ML4 A;  2YIH A;  4R27 A;  3WH9 A;  5BRQ A;  1OB0 A;  2VQU A;  2BHZ A;  1CYG A;  3VIF A;  3AS3 A;  1TZ7 A;  3MS8 A;  4BQ4 A;  3F5J A;  3EDK A;  3FHA A;  1H2J A;  1W9X A;  4UR9 A;  1G1Y A;  4HP5 A;  5GNY A;  1UR0 A;  3GBE A;  4YHE A;  2VT0 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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