3CUH | Genus

Total Genus 132

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	132
sequence length	314
structure length	314
Chain Sequence	ATTLKEAADGAGRDFGFALDPNRLSEAQYKAIADSEFNLVVAENAMKWDATEPSQNSFSFGAGDRVASYAADTGKELYGHTLVWHSQLPDWAKNLNGSAFESAMVNHVTKVADHFEGKVASWDVVNEAFADGGGRRQDSAFQQKLGNGYIETAFRAARAADPTAKLCINDYNVEGINAKSNSLYDLVKDFKARGVPLDCVGFQSHLIVGQVPGDFRQNLQRFADLGVDVRITELDIRMRTPSDATKLATQAADYKKVVQACMQVTRCQGVTVWGITDKYSWVPDVFPGEGAALVWDASYAKKPAYAAVMEAFGA

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Hydrolase
molecule keywords	Exo-beta-1,4-glucanase
publication title	Probing the binding sites of Family 10 and 11 Xylanases with extended Oligosaccharides rcsb
source organism	Cellulomonas fimi
total genus	132
structure length	314
sequence length	314
ec nomenclature	ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date	2008-04-16

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00331	Glyco_hydro_10	Glycosyl hydrolase family 10

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	3cuhA00

3SCVA 2OSYA 2BFGA 1LL6A 3W28A 5A8PA 4AYSA 4BQ3A 9CGTA 4AZCB 1GW1A 2BVTA 3ECQA 5BXPA 3VD3A 3MUY1 4JL2A 1UWQA 1XCXA 2YA1A 1JYXA 4H2CA 5AYBA 1CYGA 4BQ2A 3AQUA 4ML4A 3WD2A 1Z32X 2VR5A 3FHQA 3F5JA 1NWTA 2WC4A 4M1RA 2EPMX 3ARRA 1MQRA 1IT0A 1CLVA 4TX6A 5IHRA 8CGTA 1XH1A 1LWJA 4QP0A 2NT1A 4PEEA 2E0PA 5M03A 4XB3A 5A6LA 4AD0A 2YDRA 4H04A 5I2UA 1NP0A 1KGUA 1ZB5A 2QPSA 1QNQA 2GJPA 4D71A 3QHOA 4YHEA 4XUYA 1GQIA 5C70A 1UWRA 4U2YA 4OBSA 1GHRA 3ZSTA 3OGRA 1KGWA 3VGFA 3T0BA 2XWEA 3WNOA 2D22A 2WKGA 3VIMA 4CD6A 1H5VA 1UR4A 4JAWA 3ZT7A 5ABFB 1RPKA 4HZ8A 3TTYA 2GJXA 1JNEA 1V3IA 5M17A 1J11A 5I78A 4ACYA 5A3HA 1UWSA 5E0CA 1GQJA 3CO4A 5A2BA 3ARTA 2VZTA 3MUZ1 3TOPA 4MAVA 3A4WA 2QV4A 5C8BB 3AYSA 3PZGA 1WPCA 4W7UA 1CXFA 3ZQ9A 1C8QA 3BLKA 3ALGA 1OD8A 3O2LA 1VJSA 2J25A 3VPLA 2ZICA 1JF6A 1V6WA 1XD0A 3VKKA 1L8NA 3VIKA 5CLTA 4W86A 2YA0A 3BAWA 1DTUA 1HKJA 4MPKA 3CMGA 3APGA 3L4WA 3LPOA 3OZOA 2UY5A 3WENA 3MUAA 3HMCA 1DWFM 1E72M 3W6LA 3NCOA 4B3KA 2OLHA 4W85A 4AZ5A 4M56A 3WNNA 1E73M 1DWJM 4W7WA 4YN5A 3AHTA 4Z2GA 2Z1KA 4CCEA 1BYCA 4JKKA 2OYKA 1XCWA 4U33A 2DSUA 4J3SA 1KR0A 2A3BA 3WN6A 1LL7A 2ZUMA 4AXNA 2FH6A 3W26A 3PN8A 1GOOA 1KXHA 2FH8A 3CHDA 1JYNA 1E0VA 4J3VA 3L2LA 4QLJA 4TUFA 5GNYA 1JZ3A 2ZUWA 3VGEA 3T2QA 2W4XA 3OLIA 2WVVA 1BYAA 1GOMA 4PMXA 4CVUA 3K46A 1JZ4A 4EE9A 4GPNA 1J10A 4AISA 1C8XA 3L4XA 2DT0A 4ACZB 3BC9A 1E3XA 3WQWA 3AISA 3CUJA 2VRJA 2PWHA 2BS9A 5LA2A 1ZBKA 2J7EA 3VNYA 1XC6A 1SMAA 1ISVA 1JL8A 3SUSA 4PN2A 4WKHA 4ZEPA 3WQ4A 2BY0A 1UD4A 3BH4A 4HP5A 4W84A 3DHPA 1BYBA 4GQRA 5GQBA 3ZMRA 1TZ7A 4X0NA 1JIBA 2YDQA 4BQ5A 1KXTA 3AXXA 1V0KA 1HL9A 3EBVA 4CD4A 4OKDA 4PCTA 1GCYA 1JYWA 1E55A 2OSXA 2ZXBA 1ODUA 3VMOA 1B3YA 2DSWA 1CLXA 1PIFA 3WF4A 4MNJA 4P7OA 1PZ2A 4CU8A 1AMYA 4UCFA 4EAMA 3W82A 5BXTA 1FFRA 1DWGM 3OLDA 4GXPA 4P7LA 1QHZA 5F7UA 2VZUA 1PBGA 4HA3A 1ZBWA 3QHMA 4V27A 2J7DA 3UG5A 3ARPA 2ZWYA 2V3DA 5EFFA 5CPSA 3AHYA 2XG9A 5CJ5A 3WD0A 5IXEA 1JZ7A 2A3AA 3QR3A 1W3LA 2WVUA 1HX0A 3WH9A 2XGIA 4AWEA 5D9NA 4U2ZA 1NH6A 2V3GA 2VVNA 3UESA 3MMDA 1EA9C 3S2CA 3PZNA 1UZ4A 3NDZA 1KGXA 1R8LA 2QPUA 3OIHA 4JZ5A 5C71A 1V0NA 1B1YA 4ZENA 5FKYA 4JFUA 5A8OA 3MANA 3MMWA 3VM7A 3W37A 2WLYA 1DHKA 2WM0A 1UWIA 3IJ7A 4XZWA 2DT2A 1HVXA 4K68A 2W92A 2YLLA 4IPNB 1KQYA 3EDKA 1EIBA 2VL4A 4AD1A 1CDGA 4OBRA 3POHA 4CU7A 4NF7A 2BY3A 3I3DA 1MW0A 2BXYA 3WBAA 4C7FA 1V3KA 4BQ4A 1C8YA 3ZJ6A 3GH7A 4MDOA 4TVDA 4Z2HA 1ESWA 1CGXA 1GQLA 4W93A 4AIOA 3L4ZA 4D6FA 2GJRA 5BROA 1CENA 2YL5A 2D20A 2AAAA 3GM8A 3K4AA 4ZFMA 2ZX9A 1E71M 3WL1A 1J0IA 2CHNA 2ZX7A 3AMCA 2V5CA 5CSYA 3F4VA 5I3DA 3WQ8A 1N82A 4TVCA 3WDRA 2JALA 5CG0A 4AIUA 4GQQA 4D6IA 1WCGA 5IHSA 1WB0A 3K1DA 1V08A 2G4FA 4MAZA 4J7RA 1HVQA 3FW6A 3VIJA 4X9YA 3AMLA 4DWSB 1UG6A 4P7QA 2WMHA 1CXIA 3MMUA 2CNCA 1GOIA 3WH7A 3HJEA 2BNJA 5DO8A 1A47A 1TA3A 4LYRA 4GIAA 2Z1SA 1LF1A 1PX4A 1V0LA 2PWEA 1UKSA 3CHCA 2CKSA 1H3GA 1E9LA 2EJ1A 1W3JA 4UQ9A 4W8LA 2WVTA 2Y8VA 1BHGA 1HJSA 2FDMA 1LG1A 2AOSA 3E1F1 3AOFA 4W89A 3UETA 1UR0A 5BXRA 2VZSA 2ZWZA 5A6KA 3WL0A 2XTKA 4PMRA 3EDFA 2OYMA 1OIFA 4DM2A 2CETA 3WD1A 3MV11 4JKMA 4AZ7A 3WEOA 2EPLX 2GDVA 3CTTA 1MVYA 1W32A 1VB9A 3CZKA 4URIA 1E4NA 1JZ6A 3AFBA 2J78A 3O9NA 5IDIA 1LQ0A 2EPNA 5JUVA 4WKFA 5EB8A 2VRKA 3BCFA 2E8ZA 3VILA 1BG9A 2CIPA 1J0JA 1EH9A 1VRXA 1NP2A 1ITCA 1K9DA 5A94A 4P8UA 5IFPA 1S46A 3VGBA 1UD6A 4AMCA 3DHUA 5JBDA 5D9MA 1UHVA 1CWYA 2WWDA 3VD7A 4UOJA 1V3LA 1QI3A 2J62A 5A6MA 4B9YA 4UQCA 1GVYA 4WKAA 4D6CA 2W66A 1JZ8A 1X1NA 1JAEA 1E70M 4HOXA 1R7AA 3GBDA 3GNPA 5TD4A 5JIWA 4OUEA 1FFQA 3CUFA 2YOCA 2DH3A 1VEMA 5A6BA 3L4VA 3NUKA 3VIOA 2J8FA 4NSBA 1E15A 1W9BM 1KQZA 1MQQA 4S3KA 1H0GA 2B31A 3A3HA 3SIMA 5EBAA 3WNMA 3WQ5A 1HNYA 4V2XA 3VIGA 3PBGA 3AXHA 4JHZA 2JEQA 1E4MM 3WDQA 1BAGA 4XZBA 1UD5A 3GH5A 2GJXB 3CZLA 4MB4A 1C7TA 2GK1B 3OA5A 1R86A 4AW7A 3WNLA 1V0MA 1JD7A 3ARYA 1E1FA 2XWDA 3MKKA 2E9BA 1ISWA 4D1JA 3II1A 2CBVA 1DP0A 5BWFA 3RPMA 4UFMA 3A6OA 4KRTA 3U7BA 2PBOA 1PAMA 2YJQA 1WO2A 1E0XA 1FP8A 1R7OA 4OOZA 3VX0A 2JEPA 5CLWA 1UWUA 3BAIA 3RCNA 1W9XA 1QHPA 1UD8A 1QW8A 3NYDA 3N12A 2WSPA 1F4HA 2NSXA 1JYVA 1PX3A 3A4XA 3HN3A 5CXPA 4FK9A 2W5FA 2DT3A 3BCDA 3S6TA 3SCOA 2JIWA 1BVZA 5JBFA 4PTVA 3KWXA 2O9RA 4YPJA 4TVUA 2WWCA 1E3ZA 1W3KA 4Q7NA 4U5IA 6TAAA 3RM9A 5BRPA 2WBKA 4OZOA 3WSUA 1G5AA 1H2JA 5A95A 2F2HA 4MNMA 2XM1A 3VDAA 4D1IA 2DT1A 2ZX8A 2WVVB 1WP6A 1W9UA 1GJWA 3GNOA 2WMGA 3MUIA 2D0GA 2OYLA 3QOKA 1UD3A 2VJXA 1LLOA 1WDRA 4OJYA 2J7FA 2E4TA 1NWUA 1GOKA 1H0IA 1OCQA 1V6YA 3WDPP 3CZ8A 2V3EA 2TAAA 5CZKA 3ZM8A 1NWRA 1C93A 2VI0A 1TG7A 2VNCA 4RE2A 1L0PA 1Q6GA 2BY1A 2WCAA 2G3NA 1UA3A 5A6AA 3FNDA 5A8MA 4D6HA 2AMGA 3WUFA 2A3HA 2BY2A 5A6BD 4NRSA 1NARA 1E5NA 4D72A 3VDBA 4PSPA 2Y2WA 1M03A 1FHDA 4NZCA 4BCEA 2D3LA 1CXKA 3WMSA 1EDTA 3K4DA 3WD4A 3CUIA 2OWXA 3TA9A 5E0FA 5ABGA 2MANA 3FN9A 2WZIA 1WNOA 4GZEA 4MDPA 3GH4A 1EQPA 2VUYA 1H49A 1EOKA 4QLLA 3VGDA 4L4OA 1HF6A 3ARSA 3VTRA 1J18A 4MJ4A 1IZJA 4QAWA 3PHAA 4P8VA 7CGTA 2CESA 1PZ3A 1O6IA 3N13A 4LX4A 3VD5A 1JDCA 3PZ9A 3QOMA 3WF1A 1PX8A 2XVKA 2E9LA 2XFRA 4W5UA 1SMDA 4J3UA 1AQHA 2A3CA 1JDAA 3BXWA 1FHLA 4W87A 1TMQA 4E2OA 2J4GA 4ATWA 1A3HA 2NW0A 3KL5A 1BG4A 3OB8A 1DWHM 1JG9A 2EEXA 1ISZA 1OT1A 3BAJA 1GVIA 3OGVA 4C7DA 3RJXA 1D2KA 2YL6A 1FH7A 5LA0A 2CBUA 3U5UA 1ECEA 3VOCA 4MADA 3NSMA 1BTCA 1CXLA 1V3JA 1HJXA 1I75A 3M46A 4PMYA 2DH2A 4LYPA 1VENA 1E4IA 3VDCA 3LMYA 4GI6A 4W5ZA 3VNZA 2ZUNA 5E9AA 1X6LA 4ATDA 1H09A 2X05A 1W9VA 2J8GA 2J47A 5M5DA 5HOSA 4U3AA 1B0IA 4ZXOA 3AJ7A 3TTSA 3AS3A 1MW1A 2VC9A 4P8WA 3OLEA 2XPKA 3MU7A 3BAYA 4MB1A 2UWFA 2HVMA 1UR2A 3ARZA 3HU7A 3WUGA 1ITXA 2BXZA 3IAPA 4UQBA 1B3WA 4HA4A 4AZIA 1VEPA 5I79A 1GQKA 3DYOA 4MNKA 4UFJA 3WEMA 2J7CA 4GI8A 2Y5EA 3AIUA 4HZ7A 1GHSA 1E43A 4IPLA 2V38A 1GUVA 2XM2A 1US3A 2WMJA 1HJWA 1LWHA 1HKKA 3AXIA 4J3XA 5HBFA 2CKRA 2C7FA 5KEZA 3ARQA 5FOOA 1E6ZA 3PZUA 2E9MA 4IUGA 2PC8A 3VMNA 1EO5A 1KB3A 1JNDA 2WK2A 1MFUA 1WDQA 1X6NA 4W8BA 2VX7A 4MNLA 3VDHA 3UG3A 2F8QA 1ZL1A 2F61A 1E6SM 4PMVA 1OINA 4PUEA 3L4UA 1WE5A 2XJ7A 5BXSA 4C7GA 5A8QA 1LJYA 1RH9A 1G9HA 5CGTA 3VUPA 1ZS2A 5ABFA 2XIBA 1U30A 1MFVA 1VIWA 1RD6A 1V6UA 5E70A 4JFTA 2XVLA 4DUVA 1EO7A 3N18A 3LPGA 4ZXLA 3ZSSA 4CN6A 1E6QM 4HZ6A 4KMQA 2Y4SA 4Z2IA 1G94A 3J7HA 3GBEA 4MJ2A 1W1TA 3PTKA 3A47A 2D2OA 3AIWA 3WNKA 1QI4A 2VR4A 5AYIA 4NI3A 4WSKA 1HT6A 4N42A 4Z2LA 2D3NA 1VJZA 4DUWA 3W38A 1O7AA 4F9DA 3NSNA 1XRVA 4X0VA 4CCDA 5GNZA 3CGTA 2XSAA 1SYTA 3KL3A 1HL8A 1XV8A 4N0RA 6CGTA 4CCCA 1J9YA 2BVDA 5DT5A 3ARWA 3SUTA 4M29A 2EBNA 2GVYA 3T0DA 3VIHA 3B8SA 5AY7A 3W0KA 1XSIA 1JXKA 1V02A 1MWOA 2BHUA 4CUCA 3WUEA 4BF7A 1B90A 1EQCA 1RP8A 3BAKA 1XGZA 4Z2KA 2XGBA 1B3ZA 2JF7A 2ZUTA 3B9DA 5HPOA 1E6NA 3EDEA 6A3HA 3UG4A 1JDDA 1UH3A 2XSBA 3T2PA 1FP9A 3SCPA 1BSIA 2W61A 1DEDA 1CGWA 3ZJKA 2A3EA 5D9PA 3WELA 3CUHA 3BAXA 5CGMA 3CBWA 5ABEA 1XYZA 1UKQA 3VIPA 1OIMA 5A69A 1UR9A 5I6SA 2J75A 4HOZA 8A3HA 2ZX5A 1JD9A 2ZIDA 3CMJA 4PMNA 2D1ZA 4KWUA 4M24A 2BV9A 2YDSA 4U31A 2WHMA 3WEZA 2RGLA 1F4AA 2E40A 1EXPA 2DIJA 2FHBA 5AC5A 3CIVA 4CKQA 1QW9A 3WH8A 3FXYA 3L2MA 2V5DA 3CHFA 1H11A 2G41A 1JI2A 2DGAA 4PTMA 1XYFA 1NM9A 3VD4A 1K9TA 3SUVA 3OZPA 4AD3A 2X0YA 3O6AA 1CBGA 5A6SA 1OWQA 4AC1X 5CPQA 1U33A 3BMVA 1XSKA 1V3MA 3K8MA 3SUUA 4TX8A 4QCFA 1K6AA 5CQ1A 1TVPA 4CD8A 4JFWA 5DFAA 3RIKA 3AYRA 2WSKA 2VZVA 5A8NA 2FHCA 3VO0A 4HU8A 1E6RA 3KEHA 4AZ6A 3N15A 1E0WA 4A3YA 4J3WA 1C92A 2X09A 1M04A 3WFZA 4RE3A 3WDHA 2WHKA 2XVGA 1CTNA 4XV0A 2WZHA 3AMDA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3CUHA

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations