3CUIA

Cellulomonas fimi xylanase/cellulase cex (cf xyn10a) in complex with sulfur substituted beta-1,4 xylotetraose
Total Genus 133
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
133
sequence length
314
structure length
314
Chain Sequence
ATTLKEAADGAGRDFGFALDPNRLSEAQYKAIADSEFNLVVAENAMKWDATEPSQNSFSFGAGDRVASYAADTGKELYGHTLVWHSQLPDWAKNLNGSAFESAMVNHVTKVADHFEGKVASWDVVNEAFADGGGRRQDSAFQQKLGNGYIETAFRAARAADPTAKLCINDYNVEGINAKSNSLYDLVKDFKARGVPLDCVGFQSHLIVGQVPGDFRQNLQRFADLGVDVRITELDIRMRTPSDATKLATQAADYKKVVQACMQVTRCQGVTVWGITDKYSWVPDVFPGEGAALVWDASYAKKPAYAAVMEAFGA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Probing the binding sites of Family 10 and 11 Xylanases with extended Oligosaccharides
rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Cellulomonas fimi
molecule keywords Exo-beta-1,4-glucanase
total genus 133
structure length 314
sequence length 314
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2008-04-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3cuiA00
3T08A 1Q6EA 4CN6A 1QOXA 3BMWA 3TONA 3N15A 5I2UA 3A6OA 3SCNA 2VZOA 2ZXAA 2YL9A 1LL4A 1IV8A 3WNMA 1E6RA 1E0WA 3RCNA 4DM1A 1JXKA 1V0LA 1EH9A 1VRXA 2D0HA 1UR8A 4XUYA 3WNKA 1BSIA 1GPFA 1OB0A 4F9DA 4MNMA 3G6LA 4HA4A 1GJWA 1TA3B 2WVVB 3N1AA 1MXGA 5ABFA 3AQUA 3IK2A 2WMHA 5D8WA 3B9DA 4ZE4A 3WIJA 1V3JA 2GJRA 1W9UA 1VFOA 2BV9A 2PWHA 3APGA 1BYDA 2E8YA 2CKRA 1B0IA 4TTUA 3CUFA 2YDSA 1UH3A 1HJQA 1JI1A 1H2JA 2BVYA 1OD8A 1HN1A 1CIUA 3GDBA 3OIHA 2YOCA 3CZJA 3L4YA 5LA1A 2WMGA 4UQCA 2DH3A 3VD9A 1HKMA 4IUGA 1H0IA 1FOBA 1UUQA 2VZTA 5A8MA 4AD4A 1C8YA 3UR8A 3F5JA 4MNKA 4GIAA 4MNLA 5A8PA 1WKYA 1PIGA 3MSGA 4R5EA 4OBSA 3WUEA 5CXPA 1H5VA 1M01A 2G4FA 3EYPA 4PMVA 5E09A 3GXFA 3II1A 3ZSTA 3WNLA 1LL6A 3QHNA 3DHUA 3GNPA 1HP4A 1MFUA 2D24A 3ARSA 3ZOAA 4MTVA 2EQDA 3UG5A 4K68A 4CN1A 2EPOA 2AAAA 3WH5A 3F4VA 1GQLA 4URIA 4PUDA 3CMGA 1QBAA 4J3XA 4CCDA 4CVWA 3MKKA 3VIKA 2WYSA 1W91A 1FH8A 1XRVA 3BAKA 1V0KA 3O2LA 4C7FA 3SCVA 5DT7A 3VNYA 4CGTA 4W86A 2X0YA 2XSBA 1W1YA 2YDRA 1CECA 2AOSA 1ZS2A 4N0RA 3ARQA 1G9HA 2GUYA 3ZR6A 2XVKA 3N13A 6TAAA 3OLIA 1JIBA 5I3DA 1WE5A 5HPOA 2BXZA 1V3LA 2E40A 5FKYA 1JI2A 3DC0A 1UH4A 1ZBWA 3PN8A 4HMEA 1XC6A 1W1VA 2Z1KA 5LA0A 1CPUA 5BYWA 4CD6A 5A6LA 2W61A 1VEPA 2MANA 1OSEA 4HOZA 1XYZA 4V2XA 2EPMX 1V03A 2TAAA 3MMWA 4JKKA 2YL8A 2Y2WA 1GCYA 2V38A 4E8CA 4ACYA 2Z1SA 1JZ4A 1J11A 4AD1A 4UFJA 3IJ8A 1JZ8A 5KZ6A 3SIMA 2EEXA 3T0DA 4J3UA 2WM0A 1PZ3A 3ZM8A 2WCGA 5IHSA 2VO5A 1HL8A 3G6MA 3WMSA 4PMRA 1XCWA 3WQ8A 5JUVA 2BNJA 3VIGA 4X9YA 2NT1A 1CTNA 5EB8A 3U7VA 2G3JA 1PZ2A 1TE1A 1E3ZA 1J01A 1V3HA 1HVQA 5E0CA 5HOSA 1G0CA 3KZSA 3MSDA 4AYSA 3VMOA 2WKLA 1BG9A 2BY1A 5FCZA 3MUAA 1W3KA 1CWYA 4PSPA 2EPKX 2WHLA 4W8BA 2VC9A 4MB3A 1CLXA 2XIIA 4QDMA 4A3YA 3AOFA 2XM2A 4HP5A 4MJ4A 5A6BA 2GJXA 1US2A 2WMIA 4E2OA 4HU8A 3TOPA 1HKJA 5D4YA 3WSUA 2CBVA 4B3LA 2PWDA 2J7HA 3WKZA 2XG9A 3E1F1 3W24A 4KMQA 3ARZA 1CXKA 3OZOA 3I3EA 3VX1A 3ARTA 4AC1X 3PTQA 1Y7VA 1ZBVA 3AHZA 3CLWA 2Y5EA 1ZBKA 3K4DA 4AZGA 1UHVA 4W89A 4P7LA 5BXRA 1E73M 1XHGA 3AHYA 1GNXA 1KXQA 2VZSA 2BVDA 1GVYA 3EDFA 4W85A 4F66A 3OLEA 3W53A 4EE9A 2YLAA 1JAKA 3FHQA 5HNNA 3WQWA 2PF0A 2CCRA 1SYTA 1DWFM 4B15A 2C7FA 1E4IA 3OG2A 4J28A 1IT0A 3VX0A 2FHCA 1DTUA 3CHDA 4GKLA 1Q6DA 1L0PA 3GYCA 4OBRA 1FFRA 1UYQA 3POHA 3QOKA 3BCDA 3WH6A 2Y8KA 3VIIA 1BF2A 1W3HA 1DWIM 4WKFA 3AZSA 1LLOA 1B3XA 4W5ZA 1LWJA 2VL4A 1J0JA 1E6NA 4CD5A 3GM8A 1IZKA 3T0BA 4HOWA 5DFAA 3VD4A 2PBOA 3QHMA 4U3CA 1EDGA 2YJQA 2IUZA 5BXTA 3W28A 2A3AA 4OJYA 2X8RA 3THCA 3ZIZA 2WLYA 1FFQA 1V6VA 3EBVA 4JFUA 3L4TA 3WQ6A 4OOZA 4PYSA 3WN6A 3VKKA 3WD2A 1WZLA 4OIFA 5A6SA 1OGGA 1CXLA 1P6WA 3WD0A 2Y4SA 2X0HA 2GVYA 2JEQA 2YL6A 4KRTA 1J0ZA 3UR7A 4UQDA 1KGUA 1EO5A 2J7EA 1EHNA 4GZEA 1E3XA 4UZSA 2DT2A 2WZEA 4WJXA 4PMYA 2EBNA 3PZTA 3ZJ7A 4LGXA 4RE4A 4JL2A 2W4XA 3NJ3A 2IXVA 4WSJA 1SMDA 5I77A 1DWGM 1BYAA 1GOOA 4TVCA 3BXWA 2O9OA 5CGTA 2O9TA 4AMCA 3SUWA 4S3KA 3SEPA 4P7QA 2QV4A 2X1IA 1J0YA 3ARYA 3VIOA 4A3HA 4LX4A 2VVSA 3MANA 1VENA 1QI2A 4YPJA 4C7DA 1D3CA 4Z2KA 2J77A 1BFNA 5EBAA 4GI6A 1VFFA 4FMVA 1J18A 1HJXA 1OT2A 1ISWA 2O9PA 5CJ5A 4UZUA 1CGTA 2BHUA 1MW3A 1UKPA 4M24A 4N42A 2OSYA 1MQQA 2CNCA 1FH9A 2WBKA 1QW8A 4AD0A 1V02A 4M82A 4W7UA 3BAYA 4J7RA 5ABFB 4OZOA 5AY7A 4PCSA 3WEOA 1W2VA 2VR4A 2ZUMA 5DT5A 4DWSB 2UWFA 3EDEA 1OT1A 1ESWA 2ZUUA 2WCSA 2A3HA 2OWCA 1YQ2A 3T2OA 3SURA 4UTFA 4UQ9A 1VJZA 5BROA 2E8ZA 5IFPA 2WKGA 3FAWA 3S6TA 1E15A 3VNZA 5DO8A 1H09A 2WLZA 3VD5A 3TTSA 1VAHA 3KL3A 3A4AA 3K8KA 2GDUA 1WZKA 4KRUA 2ZXBA 1ISZA 4DUXA 1R85A 3NCOA 4KH2A 3MMDA 1HVXA 2DT1A 3VM7A 5A6MA 1LWHA 3WUGA 3AIBA 4AIEA 1C90A 1JYWA 4WKAA 5DF0A 3BSHA 4DUVA 5C71A 3VGGA 5FOOA 3ZO9A 1DWJM 2FHBA 2OYMA 4ML4A 2Q8XA 1KGWA 1DEDA 3AIEA 1JZ7A 3T2QA 1E5NA 5BCAA 2ZWYA 1JDDA 1E5JA 2BVTA 2QPUA 2XHYA 4Z2LA 4W84A 3FNDA 4PCTA 3WH7A 4AZHA 1QPKA 1H4PA 2PBGA 4IISA 1IZJA 4GO8A 1AVAA 4QLLA 2CIPA 1Q6GA 3W38A 2E3ZA 5I0DA 4JKLA 4FLSA 5EFDA 2CESA 1QBBA 4BQ2A 1J10A 1PEZA 2DT3A 4M1RA 3CH9A 5BRQA 4FLOA 2DSWA 4CKQA 1GZJA 4JL1A 4GI8A 3ZT5A 1W1TA 4GO9A 3U57A 1X6LA 1NOFA 4TXEA 3SCPA 3ECQA 1KB3A 1ZU8A 2EO7A 1UOKA 3L4UA 2DH2A 1J12A 1EXPA 1BAGA 4FK9A 1NQ6A 2E4TA 4YHEA 2VCBA 2ZOXA 1EDTA 2E0PA 1NP2A 1R86A 1BVNP 1MWOA 1BQCA 2D22A 2DSKA 1TFVA 1BGAA 3KWXA 1YHTA 5FL0A 3OGSA 1M04A 4HPGA 2UY5A 4UNIA 1XH1A 4D1IA 1W2PA 1VB9A 5KEZA 4ZEPA 2VZUA 1WO2A 4UOQA 4PUEA 2PWGA 1KBBA 4W93A 3FAXA 4TX8A 3AI0A 4C7GA 3UERA 3TTYA 1UZ4A 1V3KA 2VZVA 2XTKA 4Q7NA 3ZJKA 5I79A 3A4XA 4CU8A 4D6JA 1NWUA 4EAMA 1XSKA 3NUKA 3OLGA 5BXSA 4M81A 1O7AA 3POCA 3IJ9A 2XGBA 3JUGA 1MW2A 6A3HA 2XUCA 3F5KA 3RJXA 1EQPA 1KR1A 4D71A 2BXYA 3AYRA 3GTNA 1PIFA 2YBTA 4MADA 3OZPA 4H2CA 4TVDA 2W66A 3EMCA 1W1PA 3RILA 5HPCA 1JG9A 3A47A 1ZJAA 1W9XA 2W63A 1JFXA 3BSGA 1NM9A 1EQCA 1MVYA 3AMDA 3VGDA 5EMYA 1JYXA 2VVNA 4S3JA 2G8ZA 2OYLA 1ITCA 2QMKA 3O6AA 3PZVA 1Z32X 1QNOA 4MDPA 1KR0A 5A8QA 1EO7A 3AZTA 3ZSSA 4D1JA 3DHPA 3SUUA 4AY1A 2DSVA 4P7NA 3W81A 3AZRA 3RDKA 3CZEA 1Q4NX 4W8AA 1BTCA 2PWFA 3TP4A 1VEOA 3LPOA 4A4AA 1HP5A 4J3VA 1AQ0A 1GOKA 5BXPA 2ZUTA 3I3DA 1VF8A 5AYBA 4HOXA 4HU0A 4QCFA 3KE0A 1NH6A 4JZ5A 3WF4A 4AXNA 1M53A 2JF6A 4BQ3A 2XVPA 1I1WA 3WDQA 3M07A 2W67A 4IPNB 3U5YA 3CZKA 5CPQA 1KXTA 2DIJA 2HISA 2UY2A 2VR5A 5A2BA 3N12A 1SMAA 1GUVA 2FHFA 3HMCA 4BS0A 2DSUA 4EKJA 4DM2A 1W9VA 4YHGA 1HKKA 1M7XA 2V3EA 3BH4A 1CENA 4NRRA 5GNZA 4EANA 5E9AA 2VX6A 5E70A 4U2YA 1VBRA 2VRQA 1CXEA 2ZX5A 1HL9A 2Y8VA 2JE8A 1I75A 3NSXA 4KGLA 4L4OA 3WNPA 1FH7A 5M5DA 1JF5A 4LXFA 2YKKA 2ZXDA 3WF0A 1FA2A 4H8UA 4GQRA 1NARA 2WVVA 3ALGA 4JCMA 4ACZA 2VTFA 2WC3A 1RPKA 4JFVA 4W5UA 3AMLA 3VD7A 5CLWA 2CPUA 4PMNA 2J4GA 1G1YA 1XSJA 2J25A 2D23A 2RGLA 8CGTA 4AZCB 1UKTA 4D6IA 4E8DA 3MV01 3T0AA 4U33A 4B9ZA 4P8VA 1K9EA 2J8FA 2XSAA 4AIOA 4PMDA 3PZNA 4XZWA 3RM4A 2J79A 4P8XA 1WCGA 3AHVA 5I24A 5M03A 2X09A 2XJ7A 4MB5A 2ZX7A 1C93A 3N18A 1KGXA 1C8QA 2ESCA 1DHKA 1E9LA 3DYPA 4UFMA 4ZENA 1ISYA 1NWRA 4ZE5A 1B31A 1PX8A 1W3LA 3D5HA 4J3WA 4MB4A 1E6QM 4RE3A 1JFHA 5GNYA 1HT6A 2WHJA 3BC9A 1UWQA 1CBGA 2IXUA 3WBEA 4QCEA 1QNPA 4UFLA 4R27A 3VIJA 3ZMRA 2RGMA 1QVBA 4UQAA 3WDRA 3EMZA 1E72M 4NRSA 2GK1B 1UA3A 2FH6A 2G3MA 3DYOA 4IPLA 2D1ZA 4HA1A 2XM1A 1XH0A 3QGVA 1U30A 5A2CA 5I5RA 1KBKA 3HN3A 3PZ9A 4PN2A 1HJWA 1E0VA 1HX0A 3AHTA 1E0XA 2D3NA 3ARUA 5GNXA 1V02E 5BWFA 4H7VA 4F8XA 1H11A 3OB8A 1MW0A 1C3FA 1XD0A 2OLHA 4AEEA 1QHZA 3GNOA 3VIMA 3AS3A 2J7FA 3SCTA 3GBDA 4FF5A 2JF7A 2ZUWA 1L8NA 1Q6CA 3WF3A 5ABHA 2PB1A 1LG1A 3SUSA 3DECA 1CGWA 4P7OA 1LL7A 3PZQA 1KCKA 1S46A 3VIHA 4JAWA 1GQKA 1MW1A 3WENA 3CZLA 4ZXLA 3OBAA 4V27A 1HIZA 5D9MA 1C92A 4DWSD 2BHYA 2GSJA 4UR9A 3VGFA 4OKDA 1WDQA 1JNDA 1CXIA 1F4AA 3QHOA 3CUGA 1V3IA 3OGVA 1KWKA 2WK2A 2OWXA 4GZJA 1V3MA 2CKSA 4UCFA 4NSBA 5A69A 1H3GA 1UQZA 1OCQA 4TUFA 4WF7A 2CBJA 4H04A 1NOWA 3L4WA 4LYRA 2WVSA 3VDCA 1X1NA 3MUZ1 3ZR5A 2EPNA 1E56A 2CHNA 3ARVA 3WNOA 3S2CA 4U5IA 1BLIA 3KEHA 1F4HA 3WH9A 1JAEA 1E6XM 3OA5A 1E71M 1HKIA 4PMQA 3EDJA 3GBEA 5DEZA 2VX7A 3AMKA 5A2AA 3T2PA 3GXMA 4TOQA 2OSXA 4OUEA 2BY0A 1UWUA 3AS0A 4D72A 3NIYA 3GNRA 1B3WA 1UH2A 5AC5A 3WH8A 2Y24A 2VT0A 1J0IA 3U7BA 1J0KA 1RP8A 3AHXA 2JIWA 3QR3A 3W0KA 1D2KA 3CHFA 1H1NA 3EDDA 3BMVA 1U33A 4PTVA 2CXGA 5FD0A 1QHOA 1OGBA 2FDMA 1UR9A 3THDA 3WUFA 2ZX6A 2JEPA 4BZYA 3AS2A 2XWDA 3FHAA 3BAJA 3NDYA 4H8VA 3W6LA 2CYGA 2VMFA 4PTXA 2J62A 1UD4A 4AD2A 3AMGA 2X05A 2VQTA 3MUIA 8A3HA 4D6GA 1KCLA 4JHZA 1V0MA 1E4MM 4AZBA 2J7BA 4PMZA 5JBEA 4W87A 3F5LA 3AIRA 3CUIA 1OBAA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3T08 A;  1Q6E A;  4CN6 A;  1QOX A;  3BMW A;  3TON A;  3N15 A;  5I2U A;  3A6O A;  3SCN A;  2VZO A;  2ZXA A;  2YL9 A;  1LL4 A;  1IV8 A;  3WNM A;  1E6R A;  1E0W A;  3RCN A;  4DM1 A;  1JXK A;  1V0L A;  1EH9 A;  1VRX A;  2D0H A;  1UR8 A;  4XUY A;  3WNK A;  1BSI A;  1GPF A;  1OB0 A;  4F9D A;  4MNM A;  3G6L A;  4HA4 A;  1GJW A;  1TA3 B;  2WVV B;  3N1A A;  1MXG A;  5ABF A;  3AQU A;  3IK2 A;  2WMH A;  5D8W A;  3B9D A;  4ZE4 A;  3WIJ A;  1V3J A;  2GJR A;  1W9U A;  1VFO A;  2BV9 A;  2PWH A;  3APG A;  1BYD A;  2E8Y A;  2CKR A;  1B0I A;  4TTU A;  3CUF A;  2YDS A;  1UH3 A;  1HJQ A;  1JI1 A;  1H2J A;  2BVY A;  1OD8 A;  1HN1 A;  1CIU A;  3GDB A;  3OIH A;  2YOC A;  3CZJ A;  3L4Y A;  5LA1 A;  2WMG A;  4UQC A;  2DH3 A;  3VD9 A;  1HKM A;  4IUG A;  1H0I A;  1FOB A;  1UUQ A;  2VZT A;  5A8M A;  4AD4 A;  1C8Y A;  3UR8 A;  3F5J A;  4MNK A;  4GIA A;  4MNL A;  5A8P A;  1WKY A;  1PIG A;  3MSG A;  4R5E A;  4OBS A;  3WUE A;  5CXP A;  1H5V A;  1M01 A;  2G4F A;  3EYP A;  4PMV A;  5E09 A;  3GXF A;  3II1 A;  3ZST A;  3WNL A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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