3CUIA

Cellulomonas fimi xylanase/cellulase cex (cf xyn10a) in complex with sulfur substituted beta-1,4 xylotetraose
Total Genus 133
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
133
sequence length
314
structure length
314
Chain Sequence
ATTLKEAADGAGRDFGFALDPNRLSEAQYKAIADSEFNLVVAENAMKWDATEPSQNSFSFGAGDRVASYAADTGKELYGHTLVWHSQLPDWAKNLNGSAFESAMVNHVTKVADHFEGKVASWDVVNEAFADGGGRRQDSAFQQKLGNGYIETAFRAARAADPTAKLCINDYNVEGINAKSNSLYDLVKDFKARGVPLDCVGFQSHLIVGQVPGDFRQNLQRFADLGVDVRITELDIRMRTPSDATKLATQAADYKKVVQACMQVTRCQGVTVWGITDKYSWVPDVFPGEGAALVWDASYAKKPAYAAVMEAFGA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Exo-beta-1,4-glucanase
publication title Probing the binding sites of Family 10 and 11 Xylanases with extended Oligosaccharides
rcsb
source organism Cellulomonas fimi
total genus 133
structure length 314
sequence length 314
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2008-04-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3cuiA00
4P7NA 5LA2A 2CITA 3CZGA 3AICA 3EMCA 1J9YA 2WKLA 3DYOA 1B3VA 1GCYA 2XSAA 2WZIA 2VVSA 3DECA 1UR2A 1U33A 4GI8A 1E0XA 3NDYA 1JZ5A 1V6WA 4W85A 4BS0A 3CUIA 1JL8A 5I77A 3VX1A 3T08A 1KXQA 1HVQA 3U5YA 1UWQA 3SCNA 2XVGA 1ISZA 5FL1A 2WBGA 4Z2KA 4PRWA 2D24A 4CN1A 1HL9A 1JXKA 1XSJA 2RGLA 1GQJA 3DHPA 4H8VA 3EYPA 1CLXA 3W6MA 2QMJA 1QBBA 5E9AA 3CLWA 1MQQA 4TXEA 3NDZA 5EFFA 5A1AA 3EDDA 3PZNA 3AS3A 5DT7A 3AHYA 3THCA 3BLPX 3ALFA 4CVWA 4CKQA 1F4HA 1NOWA 4GKLA 4HMCA 2G4FA 1BTCA 5A8PA 5LA1A 3W82A 1L8NA 3VDCA 3GDBA 1UKQA 1A3HA 7CGTA 2E9MA 4ZXLA 1HJVA 2XHYA 5BCAA 1UWSA 1GUVA 1VBRA 3WQ8A 1JDDA 1XYZA 2W91A 5CJ5A 3VIPA 2X2YA 2WMHA 1E73M 2TAAA 4TVCA 1W32A 2D22A 2Y4SA 1CXIA 4NRRA 2XVLA 1MXDA 5M03A 1UUQA 1J11A 5JBFA 1W1YA 3PZOA 4X9YA 2J7BA 1UKSA 2PWGA 1RP9A 3VIMA 2ZX7A 3QOMA 4QAWA 4MB5A 2FHBA 2VC9A 3UEQA 2GFTA 3W38A 1XH0A 2YL9A 4H7VA 1JI2A 1GOOA 1CYGA 3PZVA 2Y5EA 4JCMA 3F5JA 2GDVA 4E8DA 1VJZA 4UFIA 2WVVB 2DT2A 3VGEA 1BG9A 3A4XA 2X0YA 3S2CA 1HP5A 1CWYA 4H04A 1W2PA 4QP0A 1C7TA 1E70M 5A6KA 3AMCA 1ISYA 1C7SA 3AS2A 4ZXOA 2FH8A 2EPLX 2GSJA 4NRSA 5ECUA 1VFOA 3N17A 1E9LA 1FH8A 3HMCA 3SCWA 4W7UA 2ZIDA 2F61A 3AIQA 4AZBA 5FIPA 2B31A 4GO8A 2XJ7A 1V6XA 2D0FA 1TMQA 3AMGA 4ZE5A 5AC4A 3WENA 1UR4A 4V27A 4HOXA 5ABFB 3WSUA 3WD3A 5IFTA 2E0PA 4Y7EA 4J3SA 1WZLA 3LPOA 3AXXA 4W84A 3F5LA 1ZS2A 1HIZA 3WEMA 5HDRA 1PJ9A 3GH5A 5FCZA 1CGWA 1H09A 4BF7A 3AS0A 3GBDA 1UD2A 2PI6A 4PUDA 2X1IA 3VDHA 4KWUA 3CUGA 2Z1SA 4YN5A 1WAWA 3ARTA 4HU8A 4CGTA 3ZIZA 2AAAA 4CD7A 3QR3A 4J3TA 3OLDA 1OM0A 4BQ5A 4MJ2A 1KGWA 1QI5A 6A3HA 3VTRA 3U7VA 3NUKA 3N13A 4UQ9A 3WNKA 2XIIA 2VT0A 1LWJA 4UFKA 4JFWA 3EDEA 2ZOXA 4AIEA 4W8AA 4ATLA 4AD4A 3AIRA 4J3UA 5A2AA 4D1JA 4JFTA 3WNMA 1UH3A 2CKRA 3VO0A 3WNLA 4W88A 1LF1A 1UA3A 4MADA 1BSIA 2GUYA 1OGGA 5AC5A 1IV8A 1CXFA 5BXPA 2ZICA 4ACZA 4JIEA 3O6AA 3U57A 2WKGA 4P8XA 4N42A 4M24A 1TVPA 3BGAA 3VGDA 1E6RA 1BYBA 2XYLA 1VENA 2VJXA 3POHA 5AYBA 3WDJA 4RE3A 4TOQA 2JIWA 3L4TA 1VB9A 1AQHA 1X6LA 3L2LA 4ML4A 3ALGA 1X1NA 3WBAA 4W5ZA 2MANA 1H0GA 4ATDA 5I3DA 3D5HA 5M17A 5GNYA 1TUXA 5IFPA 2CIPA 4HZ7A 4AZGA 1VEPA 1WCGA 4NF7A 1OGSA 1I1XA 1V6VA 3G6MA 4W93A 3ARQA 4PMDA 4UOQA 1H5VA 1HKMA 2UWFA 3N04A 1UKTA 2DEPA 1BHGA 1VFMA 4CD4A 3FW6A 1KCLA 5FOOA 3GM8A 4B3LA 3KL3A 4BCEA 4S3JA 3AHVA 3ZMRA 1XH1A 2C8NA 3SCRA 1E56A 1W9VA 2DPEA 1TVNA 5E0CA 5CG0A 5HPCA 1QBAA 4PN2A 3M7SA 5A2CA 1XRVA 2NT1A 1WZAA 2YLLA 1US2A 1UD3A 2WPGA 3OLGA 2YKKA 4B16A 1SMDA 2WMIA 2A3EA 3WNNA 1H1NA 2V5DA 1JFHA 5FD0A 1QNPA 3IK2A 1WZKA 5HBFA 1G0CA 4PCSA 8A3HA 4XUYA 5BROA 3WUBA 3PTKA 3AOFA 4OBRA 4GI6A 3AHXA 1E55A 4UFHA 4TTUA 2EPKX 2XM1A 1LG2A 4DUVA 1FFQA 1E3XA 2X0HA 3RJXA 1V03A 1C8YA 1CXLA 2DSUA 3B9DA 2J62A 2OWCA 3KZSA 2WVUA 3VD4A 1HX0A 2X09A 2JE8A 2XPKA 2EPNA 2XTKA 3SUUA 3WD1A 1W9PA 5M3WA 2FDMA 4OJYA 4CU6A 3MO4A 4JFVA 5M5DA 4QLJA 1B3WA 2ZUUA 3OLEA 2YL8A 4IUGA 3WD4A 2J25A 1GORA 3G6LA 1BVNP 4GQQA 2J7GA 1VRXA 1LG1A 3WQWA 2D23A 1XYFA 5I24A 4Z2LA 1A47A 1UQZA 2IXVA 2QLYA 3EMQA 2XFFA 3WQ5A 1QOXA 4UTFA 5DFAA 2ZXDA 3WMSA 1GOQA 1E1EA 2VCAA 1DWIM 1WDQA 1JNDA 3T09A 3B9AA 1US3A 1DP0A 1R8LA 3WNPA 3K46A 4D6GA 1KWKA 3N18A 1IZKA 3BAIA 2E4TA 3OGSA 2VX4A 1B1YA 2J7HA 5D8WA 2C7FA 2PWFA 1JI1A 4UQDA 4CU8A 4D6CA 2VZUA 1SFSA 3UERA 4R5EA 4WLCA 2WYSA 3VIIA 3W0KA 3L4WA 3WEZA 1OCQA 2A3BA 4Z2IA 2J7FA 5KEZA 1JZ3A 1OINA 2CHOA 3BMVA 5DO8A 2VX6A 3W6LA 1CNVA 2ZUSA 4JKMA 3UR7A 4V28A 2YDSA 4LX4A 3AMLA 3N1AA 1UWUA 2OYKA 2EPOA 2ZX5A 4GIAA 1CENA 3L4XA 1MW2A 1MFUA 3WNOA 3WL0A 1CGTA 3AMKA 4PBGA 3M46A 2GJXA 4LQ1A 2WHJA 1UR8A 2J7EA 2WVSA 4S3KA 5I78A 2WSPA 1S46A 2YA2A 2ZX6A 4UQAA 4ATWA 1Q6FA 5DT5A 5D9PA 2UY2A 1UHVA 4NSBA 4AZCB 4MAZA 2VQUA 4F8XA 1EQPA 1E4LA 1ZBKA 4AW7A 2WMJA 1AQ0A 4JKKA 3RM9A 3WH5A 1E0WA 3VKKA 1E71M 1VBUA 4HA4A 4BA0A 4RE2A 1XH2A 3VM7A 4MDOA 3FHAA 2GK1A 2OWXA 3WH7A 2VNCA 1HF6A 2WMKA 2O9RA 1KR1A 5AY7A 4YHEA 1EGZA 4QFUA 3L2MA 4LGXA 3MMDA 2G3JA 5A8OA 4MB3A 3VGFA 1XSIA 2WM0A 4R27A 2OLHA 4Q7NA 1HJQA 1BYAA 4HU0A 2BY2A 4WK9A 4WKHA 3WF4A 2DT1A 5D4YA 4U31A 3RILA 2CBIA 4K68A 3N12A 2O9TA 1WZMA 2J74A 2ZXBA 1OGBA 1R86A 3ZJ7A 4P7OA 5BWFA 3CHDA 1KR0A 4IM4A 4FLQA 3U5UA 3EDFA 4KGLA 1DWJM 4MNKA 5CQ1A 3PTQA 3CUJA 4EK7A 1D2KA 2Y24A 1OT1A 4MNLA 1EHNA 2CCRA 1PEZA 2CESA 4HOWA 1SR0A 4UFLA 3VINA 4GPNA 4UQBA 1Q6GA 3ARXA 1RPKA 3WN6A 3II1A 3SUVA 5A6BA 1UR9A 1V0MA 3D3AA 3DHUA 4URIA 4AISA 3A4AA 3UETA 5A8NA 1FH9A 4HZ8A 1FOBA 5A95A 2BV9A 4TVDA 5A8QA 2YDQA 2VTFA 2JALA 2ZUVA 2E3ZA 1CBGA 2BY3A 5A2BA 1TA3A 2VURA 5BXRA 5IDIA 4U2YA 1YHTA 1OWQA 1HNYA 4J3VA 3M6DA 1I75A 5CPSA 1CXEA 2CBUA 2QPUA 2UY4A 4WSJA 4JKLA 3GTNA 4H8UA 1B3XA 4A4AA 4QCEA 1QI4A 1NWSA 2QV4A 3UESA 3W28A 2WNWA 4M1RA 1M53A 2J8GA 2VQTA 4PSRA 2WWDA 1P6WA 4FMVA 4E2OA 1G94A 1JXJA 4UFJA 1EOMA 5D9MA 3UG5A 4UOJA 1QI2A 4GINA 1CLVA 1C8XA 4F79A 3WMCA 4DWSA 1UKPA 1E3ZA 1W9DM 1D7FA 3I3BA 4W89A 2VRKA 1M04A 4LYPA 3CZKA 1FHLA 3OZOA 1UZ4A 1QW8A 2VO5A 2Y8VA 3AZRA 3BAKA 1DWHM 3SCPA 1HJUA 3ARRA 3VIOA 3SUTA 4HA3A 3K8LA 1KBBA 4D6HA 3CUFA 4GZIA 5IHSA 1E72M 1TZ7A 2DSKA 3CHFA 2VCBA 3GNPA 4DUWA 1GONA 5JIPA 3NJ3A 4UNIA 2DH2A 3AIEA 2CETA 1ODUA 1JAEA 4MJ4A 4W7WA 1W3JA 3GYCA 1HT6A 2DGAA 1OD8A 4TVUA 1JYNA 4AIOA 4AZ5A 1E4NA 1EA9C 1EDTA 2XWDA 2XIBA 2W92A 1JD9A 1QNSA 3NSMA 3K4AA 2XFRA 5E0FA 3HN3A 3TONA 1VEMA 1M7XA 5DEZA 3I3EA 5CPTA 1CDGA 1K6AA 4E4PA 1AMYA 1ZBVA 1E6NA 2BY0A 1E6ZA 3WUEA 3UG4A 1Q6CA 1ZL1A 3T2OA 3LPFA 1EXPA 4XZWA 1FP9A 1CPUA 3KL0A 2JFEX 2WAGA 1GOIA 3GXDA 1GJUA 4AXNA 1Z32X 2DT0A 4X0NA 1C8QA 3BAJA 3N9KA 3AIUA 1SMAA 2XVPA 1MYRA 2UY3A 3WF0A 2XM2A 1VEOA 4KRTA 3VMNA 4AZ7A 1W2VA 1EDGA 3BAXA 9CGTA 3WQ6A 1CIUA 4JAWA 5IXEA 3WIJA 1GJWA 2ZUTA 5GPRA 1WDRA 1ECEA 2NSXA 1KB3A 4PMRA 1WP6A 5TD4A 5HPOA 4AD1A 1LLOA 1SYTA 2YDRA 3PZTA 2Y8KA 1G01A 3SIMA 1E5JA 4J28A 1BYDA 1EOKA 1VJSA 1UD4A 2YA0A 4PCTA 1Y7VA 4W87A 5A69A 2G3NA 1E15A 1V08A 4OIFA 4C7DA 3WDIA 3NSNA 3AZTA 4RL3A 1KFWA 1ZBWA 3BAYA 3DYMA 3VMPA 3HJEA 3VIKA 1GHSA 2J7DA 1C3FA 1W1PA 2DSWA 3NCOA 4HTYA 1VFFA 1E6XM 3I3DA 2F8QA 2YJQA 2WMGA 5CGTA 3CTTA 2V3EA 1CXHA 3AISA 1TE1A 3GXFA 3BSGA 4CCDA 2XGBA 4V2XA 4D6IA 2E40A 5E6ZA 3KL5A 3AI0A 3W37A 1H49A 3BLKA 3GXMA 4PMUA 4YHGA 1CGXA 1BLIA 2XWEA 3ZQ9A 4C7GA 1DWGM 3QHOA 3CMJA 3BAWA 2A3HA 4AD5A 1E4MM 2F2HA 2RGMA 2W62A 2EXOA 3W25A 1WDPA 4MNMA 1OB0A 4JZ5A 1E6QM 5D9OA 3PZQA 4HZ6A 1GW1A 3RJYA 4AMCA 3AIBA 3W81A 4U3AA 5CLWA 3WEOA 3TTQA 4TTGA 4PTWA 1W3LA 4BQ3A 1V3KA 3CMGA 3VGHA 3DC0A 3J7HA 1QHPA 1GOKA 5F7UA 3GXIA 2W63A 1V3MA 1WO2A 1UYQA 4PMNA 1ISVA 3AXIA 2JF6A 3A4WA 2W4XA 4Z2GA 7A3HA 3RIKA 4P8UA 3VU2A 1UWTA 4GZEA 1KXVA 1MFVA 3GZAA 3AZSA 5EFDA 2UY5A 2OSXA 1CXKA 3K1DA 3VMOA 1UOKA 3SCVA 3TA9A 2VCCA 3VD9A 2WVVA 1EO7A 4KMQA 3CZ8A 2IXUA 3UCQA 1J10A 1JF6A 2GK1B 2PBGA 5E09A 5HOSA 4PTXA 3FAWA 4GQRA 2FH6A 4AEFA 1UZ1A 5BRQA 3W26A 2EQDA 4MB4A 2VI0A 4AD0A 2VR4A 2DQXA 3AQUA 3F5KA 3OGRA 5FL0A 4MTVA 1HKJA 2VZVA 1C93A 3UG3A 3W27A 3MUZ1 1R85A 1NOFA 2DIEA 4HP5A 3VM5A 4MPKA 5ABFA 1OSEA 2YL6A 3WDRA 1W9UA 3VILA 4CU7A 4W86A 1LJYA 1FHDA 4XB3A 1HJWA 1J0KA 1UKOA 5A94A 2W66A 3AXHA 1TCMA 2Y2WA 4W8LA 4HPHA 3ARSA 2JF7A 3AFBA 1BG4A 5GNXA 3WFLA 3T0BA 1JFXA 4D72A 2A3CA 3NSXA 1GQKA 4LYRA 3W29A 1E0VA 2QPSA 4UCFA 4FK9A 4D1IA 1H2JA 4ZFMA 4H2CA 3L4VA 4WF7A 4D6EA 4CD5A 1JZ2A 4PTMA 1JYWA 1UR1A 1LQ0A 4HMDA 1B3ZA 2QHAA 5A6MA 1BGAA 1V0NA 1G1YA 3POCA 1JYVA 3N11A 3WBEA 2WANA 3CO4A 3VNZA 5I23A 2YLAA 2VZOA 4B9ZA 1GVIA 3VD3A 4AD2A 1HKIA 2NW0A 2ZXQA 4PMQA 3WF1A 3OGVA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4P7N A;  5LA2 A;  2CIT A;  3CZG A;  3AIC A;  3EMC A;  1J9Y A;  2WKL A;  3DYO A;  1B3V A;  1GCY A;  2XSA A;  2WZI A;  2VVS A;  3DEC A;  1UR2 A;  1U33 A;  4GI8 A;  1E0X A;  3NDY A;  1JZ5 A;  1V6W A;  4W85 A;  4BS0 A;  3CUI A;  1JL8 A;  5I77 A;  3VX1 A;  3T08 A;  1KXQ A;  1HVQ A;  3U5Y A;  1UWQ A;  3SCN A;  2XVG A;  1ISZ A;  5FL1 A;  2WBG A;  4Z2K A;  4PRW A;  2D24 A;  4CN1 A;  1HL9 A;  1JXK A;  1XSJ A;  2RGL A;  1GQJ A;  3DHP A;  4H8V A;  3EYP A;  1CLX A;  3W6M A;  2QMJ A;  1QBB A;  5E9A A;  3CLW A;  1MQQ A;  4TXE A;  3NDZ A;  5EFF A;  5A1A A;  3EDD A;  3PZN A;  3AS3 A;  5DT7 A;  3AHY A;  3THC A;  3BLP X;  3ALF A;  4CVW A;  4CKQ A;  1F4H A;  1NOW A;  4GKL A;  4HMC A;  2G4F A;  1BTC A;  5A8P A;  5LA1 A;  3W82 A;  1L8N A;  3VDC A;  3GDB A;  1UKQ A;  1A3H A;  7CGT A;  2E9M A;  4ZXL A;  1HJV A;  2XHY A;  5BCA A;  1UWS A;  1GUV A;  1VBR A;  3WQ8 A;  1JDD A;  1XYZ A;  2W91 A;  5CJ5 A;  3VIP A;  2X2Y A;  2WMH A;  1E73 M;  2TAA A;  4TVC A;  1W32 A;  2D22 A;  2Y4S A;  1CXI A;  4NRR A;  2XVL A;  1MXD A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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