3CUJA

Cellulomonas fimi xylanase/cellulase cex (cf xyn10a) in complex with sulfur substituted beta-1,4 xylopentaose.
Total Genus 131
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
131
sequence length
314
structure length
314
Chain Sequence
ATTLKEAADGAGRDFGFALDPNRLSEAQYKAIADSEFNLVVAENAMKWDATEPSQNSFSFGAGDRVASYAADTGKELYGHTLVWHSQLPDWAKNLNGSAFESAMVNHVTKVADHFEGKVASWDVVNEAFADGGGRRQDSAFQQKLGNGYIETAFRAARAADPTAKLCINDYNVEGINAKSNSLYDLVKDFKARGVPLDCVGFQSHLIVGQVPGDFRQNLQRFADLGVDVRITELDIRMRTPSDATKLATQAADYKKVVQACMQVTRCQGVTVWGITDKYSWVPDVFPGEGAALVWDASYAKKPAYAAVMEAFGA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Probing the binding sites of Family 10 and 11 Xylanases with extended Oligosaccharides
rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Cellulomonas fimi
molecule keywords Exo-beta-1,4-glucanase
total genus 131
structure length 314
sequence length 314
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2008-04-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3cujA00
3BAYA 3AXIA 4UQ9A 3AHXA 4H8VA 1ZU8A 1XD0A 1D7FA 1OD0A 2DT3A 4PTVA 4PTXA 4F66A 5CPSA 5D9MA 4GO9A 1E0WA 2VC9A 3VD5A 1VEOA 5AC5A 2EJ1A 4JCMA 1NQ6A 3SUWA 5CJ5A 2FHCA 1XSJA 2X0YA 4PN2A 4ACZB 3WDIA 1CXIA 3PZMA 1MYRA 2VCAA 2OWXA 3VTRA 2WPGA 4OBRA 2OSYA 2VL4A 3GNRA 3M6DA 1QW8A 2YA2A 4H41A 4N42A 2VZVA 3SUVA 4HOXA 1VJSA 3OLGA 3VILA 1J0JA 3SEPA 1XCXA 1CDGA 4BQ3A 1EXPA 3ARVA 1EDGA 3B9AA 1DHKA 3BCDA 1HVQA 5I23A 3GXMA 3QGVA 1V3KA 3T0AA 2DGAA 1JIBA 4PMQA 1WP6A 2E4TA 2E3ZA 3K8MA 1LF1A 1E4MM 5I5RA 3HU7A 4MADA 2OYLA 8A3HA 2DH2A 2WVVB 1HVXA 4UQDA 3WQVA 1V3MA 2WAGA 3N04A 4M29A 4FLRA 2G3IA 4JFTA 1E4IA 1GOMA 1KCKA 2GK1A 3OGRA 5GPRA 2JFEX 5FL0A 3W6LA 2XVKA 4AZHA 4W87A 2JF7A 4UQAA 1CLXA 4BA0A 2EBNA 3AMKA 5JBDA 3L4UA 4JCLA 1E4LA 1FOBA 1ZB5A 3TTQA 3VIMA 4NRRA 3ARUA 4AC1X 1CGYA 2VX4A 2TAAA 2VMFA 4WKHA 1JZ6A 3BLKA 1KGWA 3SUUA 1CWYA 2XM1A 2WLYA 4RL3A 1W9UA 5HXMA 3MUY1 2WW5A 1BQCA 2VRJA 3L4XA 5BXSA 4D6CA 2J7EA 3PZTA 1TUXA 2OSXA 3AHVA 1V6UA 1QNRA 1UHVA 1UZ1A 4UOJA 1OSEA 1BAGA 1IT0A 4B3LA 2FGLA 4HA4A 1W1YA 3B9DA 3TTSA 1EGZA 1UWRA 3TONA 2VQTA 1E3ZA 2JEQA 3QHMA 4GXPA 4AIEA 3IJ7A 2BY3A 3RDKA 3A4WA 2OYMA 5EB8A 3VX0A 3WBAA 4LX4A 4M56A 2CETA 5GNXA 1WE5A 1WDQA 3BMVA 4MNMA 2WMIA 1XSIA 2YL6A 4HMDA 3KL3A 1GQLA 2A3HA 5IXEA 1UA3A 4ATWA 2D20A 4GQRA 3PHAA 2WMKA 1F4AA 5JBFA 2J7HA 2V3EA 3VGDA 3WD3A 3ZJ7A 1HJWA 2EPLX 1MVYA 3FXYA 1PX4A 3EDEA 3NJ3A 3PTKA 3ZR5A 4AW7A 1VB9A 1JGIA 4QLKA 1V03A 1FHLA 5KZ6A 1B3VA 1NM9A 1OD8A 1UKSA 3CMJA 3GXIA 4EKJA 1SMDA 4TTUA 3OLIA 4AXNA 1XCWA 4MB5A 3IAPA 3HMCA 4HZ6A 3MUIA 2D3LA 4MJ2A 1EO7A 2VZUA 3L4YA 3WUFA 2QLYA 2ZXAA 1HJQA 2A3AA 3BGAA 3J7HA 2XVGA 3AHZA 4HU0A 2FHBA 4PMOA 1VEPA 3BAIA 4M80A 3WH8A 3VX1A 3ECQA 4AZIA 3MMWA 1EOKA 3L2LA 3RPMA 1US3A 2WSKA 1OT2A 2YBTA 1Q4NX 3A4AA 1GW1A 4LGXA 4NI3A 4W88A 1EA9C 4AZGA 4Z2LA 5AC4A 3AYRA 3CMGA 4W84A 1HL9A 1HN1A 1FFRA 1VEMA 5BROA 4GPNA 1HL8A 1BHGA 1UR1A 5CLTA 3AHYA 2ZE0A 2V3GA 1HKKA 3PZ9A 3FHAA 2B31A 1GCYA 4MNLA 3APGA 5A3HA 2XSAA 1QBAA 2XM2A 1MFUA 3IJ8A 3WL0A 1PZ2A 1EHNA 3NSNA 4QLJA 1X6NA 4OIFA 4DWSA 2QV4A 4W5UA 2G41A 1E71M 1X6LA 3A6OA 3T09A 2WVUA 4DUVA 3F4VA 1V6VA 2WBKA 1QHOA 4DUWA 4AYSA 3WKZA 2PWEA 5I3DA 1XSKA 2YDQA 1HKJA 2WWDA 3RM4A 1UWTA 4F9DA 3RM8A 1HX0A 1DWHM 2CIPA 3ARPA 1M7XA 3EMCA 4JAWA 3W26A 3SCNA 3N12A 5GNYA 1E55A 2ZWZA 4BF7A 4A3HA 5A8MA 5BXRA 1B3ZA 1JF5A 3MKKA 3WNOA 4AIUA 2XGIA 4AY1A 1EQCA 2BHUA 3VIPA 1GQIA 4QLLA 4JKLA 4AEFA 1V0NA 1ZS2A 2W92A 4AZ5A 5A2AA 4PMUA 1UD2A 4ATDA 1E40A 1B3WA 1E56A 5ABEA 3THCA 1OT1A 1BYBA 1GOWA 1V3IA 2J7GA 2WCGA 2EXOA 4HMCA 3AZSA 5FKYA 1L8NA 1G9HA 1TG7A 2WM0A 4PBGA 3OBAA 3MS8A 3PZOA 4A3YA 1BGAA 4X9YA 2JF6A 1E70M 5IDIA 3ALFA 2YA0A 2W4XA 1ODZA 3ARSA 4JZ5A 5FCZA 1QI4A 2GJXB 3ARQA 4FLOA 3F5LA 1UKOA 5E70A 4RE4A 3IK2A 3VDBA 2FH8A 5LA2A 1V0KA 3NSMA 1KBKA 1MXGA 4W86A 1E9LA 1JXJA 2IXVA 2PBGA 1UA7A 2UY4A 4MB3A 3FHQA 1R8LA 4CD5A 1EOMA 4LPCA 4FK9A 1QPKA 1GHSA 2GUYA 1BF2A 3DYOA 1QNQA 4PUEA 3MMUA 3SUSA 2VTFA 3ZJ8A 4IUGA 3QHNA 1NWRA 1SMAA 1ZJBA 2XVLA 1NH6A 1EQPA 4WKFA 1SYTA 3CH9A 1US2A 2CBUA 3CLWA 3MU7A 1FP9A 3JUGA 2O9TA 3KEHA 2V5DA 4CCEA 3AIUA 4EE9A 4U3CA 2DH3A 1GHRA 4XUYA 1H5VA 3AIVA 1S46A 1BLIA 1UWQA 5A8QA 3VGBA 1CECA 1GJUA 1CGUA 3VD7A 1B31A 5CLWA 1QI2A 1B2YA 1WCGA 3BSGA 4H8HA 4U3AA 3RIKA 2X0HA 2XWEA 3AS2A 3AIWA 4ACYA 2WB5A 1ECEA 1BSIA 2CEQA 3AS3A 1WKYA 1KQZA 2D2OA 4UFKA 4AEEA 2WC7A 4PMDA 3VKKA 3OZOA 5DF0A 3K4DA 2E8YA 4W7VA 2J74A 2ZX8A 2UY2A 4ZXLA 1DEDA 1AMYA 2BHZA 4HA3A 1TA3B 4WSJA 1R86A 1PJ9A 3WF1A 3CZLA 3TP4A 2XIIA 1JD9A 1ITCA 1HJVA 2DSKA 4CCCA 4KH2A 2EO7A 3ARXA 5I77A 2VI0A 2EQDA 2BV9A 4PSPA 5LA1A 5E0FA 2QPUA 2ZXQA 1WDSA 4TUFA 2D23A 1RP9A 2IUZA 5CG0A 1NWTA 4PTWA 1AQMA 3VGEA 4KGLA 1HKMA 2J7CA 1EIBA 4AZ7A 3UR7A 3N17A 1DWGM 3AI0A 2ZX5A 4U2ZA 1TVNA 4Z2GA 3ZOAA 4ZENA 4LYRA 5E6YA 2FH6A 3POHA 3M07A 5I2UA 4D1IA 4MB4A 1C93A 5ABGA 2XVPA 3VNZA 3AMGA 5JIPA 5C70A 3SCUA 5AYBA 4W93A 2J62A 1ISWA 2NSXA 2ZXDA 2XIBA 1JI1A 4M82A 4NSBA 1V02E 1W1PA 4AD1A 4EK7A 1HJSA 4BQ2A 4CN6A 3CBWA 2XVNA 3MMDA 3NSXA 5A95A 1QBBA 1Y7VA 3K8LA 4TXEA 2W61A 3KWXA 4PRWA 4D6EA 1TCMA 1ZL1A 3AIBA 1O6IA 3DHUA 1MXDA 2ZICA 3TTYA 2DIEA 3LPOA 3DHPA 2Y8VA 3ZT6A 2C7FA 4CVUA 2C0HA 4JFWA 3GNPA 5CXPA 2DQXA 1CBGA 2Y24A 5I79A 3LMYA 3WENA 1BVZA 1M53A 1E43A 2XWDA 1OM0A 1WB0A 1YHTA 2E40A 3I3EA 4BS0A 1W3HA 1A3HA 2JIWA 3WN6A 1CXFA 2VUYA 2GJRA 3VGHA 3EDFA 1J11A 1MQRA 2VX7A 1E0VA 4D71A 1KGXA 3QOMA 3AMDA 3KL5A 5M3WA 2CYGA 1JYXA 7A3HA 3FN9A 1M04A 3W38A 3FNDA 5I0DA 3WUBA 2E9MA 1CGVA 2GSJA 4PMNA 4R27A 1TFVA 1PEZA 4GZEA 2WZEA 3CO4A 3VU2A 1LL6A 1K9FA 1UD8A 1PX3A 3U5UA 1QNSA 1NP2A 1NARA 3GBDA 1P6WA 3VIOA 2V3FA 1GQKA 4ZEPA 3N13A 1JI2A 5E6ZA 3CUGA 3VGFA 1QI5A 2D1ZA 2WKGA 3WNMA 1BYDA 1E6ZA 5DEZA 1ITXA 4UZSA 4UTFA 3NIYA 2UWFA 4AD3A 4D6HA 1JDAA 3MUAA 3EDJA 2PI6A 2A3BA 2FHFA 1C8YA 4TVUA 5JIWA 1KXHA 5ABHA 3VIFA 2WMFA 3GNOA 2VR4A 3T08A 4B3KA 1UKPA 5IHRA 3G6LA 1K9EA 1B90A 1W32A 4PCTA 1LG1A 4D6DA 1JDCA 3N15A 2WCAA 1C91A 3GH7A 2NW0A 4UZUA 1DWJM 1PBGA 2G8ZA 1E15A 4UFJA 4L4OA 5A6KA 5C71A 6TAAA 2WMJA 4GINA 4H7VA 2ZOXA 4QFUA 5BRQA 2GK1B 3VPLA 3L2MA 4JHOA 3AS1A 1UQYA 3KZSA 4M8UA 3ZSSA 2X05A 1JG9A 3ARRA 3WFZA 2G3MA 3CHDA 3CZKA 2G3JA 1VAHA 1G01A 1OGBA 3N18A 4H8UA 3A4XA 3K8KA 3WDQA 1N82A 4IPLA 2VO5A 1SFSA 1RP8A 6A3HA 1HP4A 1J12A 1GQJA 3ARYA 1MQQA 2XG9A 1HIZA 4B15A 3RM9A 2UY5A 3AOFA 3TOPA 4FF5A 1C7TA 1JYVA 5EBAA 4P8XA 1ESWA 2EEXA 5BWFA 1XYFA 3WD1A 1XC6A 1E1EA 1JYWA 1CPUA 1WO2A 1CXEA 4ZXOA 2DPEA 3O2LA 5JUVA 4PMXA 5EFDA 1UD4A 1J01A 2RGMA 3FW6A 1WNOA 1Q6CA 1RH9A 5HBFA 3BXWA 2BY0A 5A6BA 5ECUA 1HJXA 2WZHA 4CD6A 2OWWA 4CVWA 1U33A 4PUDA 5D9PA 1OIFA 4GIAA 2CITA 1W3KA 3MUZ1 1W3JA 4QAWA 2WMIB 2Y5EA 2D22A 4EANA 4WIWA 4W5ZA 1GOKA 3EDKA 6CGTA 4AD5A 1E5JA 3W53A 3CZ8A 1NWSA 3ZT5A 4U31A 5CPQA 1ZBWA 4UFLA 1JAKA 3FY1A 3VDCA 2W63A 1V0LA 3K46A 1CENA 3E1F1 1XH0A 1GZJA 3BLPX 1CTNA 2WHLA 1JAEA 2J78A 4LXFA 2PWHA 2Q8XA 2BS9A 2WXDM 4Z2JA 1H0IA 3WMCA 4HU8A 1DP0A 3OLEA 5CPTA 4UQBA 4UFHA 3WY1A 1KQYA 1ODUA 4LYPA 2YOCA 1V3JA 3WH6A 3N1AA 1JD7A 3GXDA 1C7SA 3WFLA 2WZIA 5M5DA 4M1RA 2A3EA 1R7AA 1VFMA 2PF0A 5JBEA 4U2YA 3SURA 1UH4A 3DYMA 1VENA 1OBAA 3MSDA 3OA5A 5IFTA 3WDHA 3SCQA 3PZVA 1CYGA 1R85A 4FLSA 4ZFMA 2YLAA 4OOZA 1JFXA 1W2PA 3VINA 2DT1A 3W27A 2WMHA 1FHDA 1VFUA 5CZKA 1ISVA 4MPKA 1E6XM 4UQEA 1UH3A 1HF6A 4JHZA 1E6SM 4E4PA 4CD7A 4GKLA 5CSYA 1GOQA 1J18A 4Y7EA 1MW3A 1H3GA 3POCA 1VRXA 2XYLA 2ESCA 4Z2KA 4J3SA 2VNCA 1KB3A 3WNLA 3DC0A 2GVYA 1CXKA 4U5IA 1KXVA 2VT0A 2YDRA 3ZQ9A 4DWSC 1IZJA 2XUCA 3II1A 3WIJA 4HZ7A 3WF4A 2E8ZA 2JE8A 4TVCA 3ZJKA 3CHEA 1HT6A 1BYAA 3T2QA 3UG5A 1QNPA 4GQQA 4PMYA 1IV8A 3UCQA 2VVNA 3THDA 3AIRA 4U33A 1BFNA 5DMYA 1VJZA 3VD4A 1BGGA 4MAVA 2J75A 4OJYA 3W6MA 3U7VA 3MANA 1E6QM 1WZAA 1ISZA 3A3HA 1AVAA 3ARWA 4QDMA 3W4RA 1I1XA 4AZCA 4PSRA 1DTUA 4CD4A 4CKQA 1E3XA 1B0IA 2PBOA 4R5EA 3ZSTA 3BH4A 4D72A 3VVGA 1UUQA 4Z2IA 1V6YA 2WLZA 2D24A 4J7RA 1UYQA 3K4AA 5BYWA 1W9VA 3O6AA 3KL0A 4CU7A 1B9ZA 4UOZA 4QCFA 2VVSA 2WC4A 2ZX9A 1OCQA 1W9XA 3U7BA 2GJXA 4D6JA 2ZXBA 1UWIA 5I78A 5BXPA 2VX6A 3MSGA 3SCRA 3T2OA 1V08A 1X1NA 3S2CA 3WQ4A 4JL2A 2OLHA 3WQ8A 5A2CA 1C90A 3U5YA 3GH4A 1B3YA 1UH2A 1OIMA 1WZKA 3WDPP 3WUEA 3WH5A 2WHKA 1KCLA 1GJWA 2O9RA 4J3VA 3MV01 4MAZA 5A6BD 1GUVA 2W67A 2C8NA 3OGVA 1UD6A 3W81A 1CIUA 1DWAM 1R7OA 2E0PA 2VX5A 4CU8A 1EDTA 3VM7A 3SIMA 1B3XA 1U2YA 3PZUA 2IXUA 4KRTA 1UZ4A 2PC8A 4W7WA 3WF0A 3F5JA 4IPNB 1E0XA 1KXTA 2XFRA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3BAY A;  3AXI A;  4UQ9 A;  3AHX A;  4H8V A;  1ZU8 A;  1XD0 A;  1D7F A;  1OD0 A;  2DT3 A;  4PTV A;  4PTX A;  4F66 A;  5CPS A;  5D9M A;  4GO9 A;  1E0W A;  2VC9 A;  3VD5 A;  1VEO A;  5AC5 A;  2EJ1 A;  4JCM A;  1NQ6 A;  3SUW A;  5CJ5 A;  2FHC A;  1XSJ A;  2X0Y A;  4PN2 A;  4ACZ B;  3WDI A;  1CXI A;  3PZM A;  1MYR A;  2VCA A;  2OWX A;  3VTR A;  2WPG A;  4OBR A;  2OSY A;  2VL4 A;  3GNR A;  3M6D A;  1QW8 A;  2YA2 A;  4H41 A;  4N42 A;  2VZV A;  3SUV A;  4HOX A;  1VJS A;  3OLG A;  3VIL A;  1J0J A;  3SEP A;  1XCX A;  1CDG A;  4BQ3 A;  1EXP A;  3ARV A;  1EDG A;  3B9A A;  1DHK A;  3BCD A;  1HVQ A;  5I23 A;  3GXM A;  3QGV A;  1V3K A;  3T0A A;  2DGA A;  1JIB A;  4PMQ A;  1WP6 A;  2E4T A;  2E3Z A;  3K8M A;  1LF1 A;  1E4M M;  5I5R A;  3HU7 A;  4MAD A;  2OYL A;  8A3H A;  2DH2 A;  2WVV B;  1HVX A;  4UQD A;  3WQV A;  1V3M A;  2WAG A;  3N04 A;  4M29 A;  4FLR A;  2G3I A;  4JFT A;  1E4I A;  1GOM A;  1KCK A;  2GK1 A;  3OGR A;  5GPR A;  2JFE X;  5FL0 A;  3W6L A;  2XVK A;  4AZH A;  4W87 A;  2JF7 A;  4UQA A;  1CLX A;  4BA0 A;  2EBN A;  3AMK A;  5JBD A;  3L4U A;  4JCL A;  1E4L A;  1FOB A;  1ZB5 A;  3TTQ A;  3VIM A;  4NRR A;  3ARU A;  4AC1 X;  1CGY A;  2VX4 A;  2TAA A;  2VMF A;  4WKH A;  1JZ6 A;  3BLK A;  1KGW A;  3SUU A;  1CWY A;  2XM1 A;  2WLY A;  4RL3 A;  1W9U A;  5HXM A;  3MUY 1;  2WW5 A;  1BQC A;  2VRJ A;  3L4X A;  5BXS A;  4D6C A;  2J7E A;  3PZT A;  1TUX A;  2OSX A;  3AHV A;  1V6U A;  1QNR A;  1UHV A;  1UZ1 A;  4UOJ A;  1OSE A;  1BAG A;  1IT0 A;  4B3L A;  2FGL A;  4HA4 A;  1W1Y A;  3B9D A;  3TTS A;  1EGZ A;  1UWR A;  3TON A;  2VQT A;  1E3Z A;  2JEQ A;  3QHM A;  4GXP A;  4AIE A;  3IJ7 A;  2BY3 A;  3RDK A;  3A4W A;  2OYM A;  5EB8 A;  3VX0 A;  3WBA A;  4LX4 A;  4M56 A;  2CET A;  5GNX A;  1WE5 A;  1WDQ A;  3BMV A;  4MNM A;  2WMI A;  1XSI A;  2YL6 A;  4HMD A;  3KL3 A;  1GQL A;  2A3H A;  5IXE A;  1UA3 A;  4ATW A;  2D20 A;  4GQR A;  3PHA A;  2WMK A;  1F4A A;  5JBF A;  2J7H A;  2V3E A;  3VGD A;  3WD3 A;  3ZJ7 A;  1HJW A;  2EPL X;  1MVY A;  3FXY A;  1PX4 A;  3EDE A;  3NJ3 A;  3PTK A;  3ZR5 A;  4AW7 A;  1VB9 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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