3CUJA

Cellulomonas fimi xylanase/cellulase cex (cf xyn10a) in complex with sulfur substituted beta-1,4 xylopentaose.
Total Genus 131
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
131
sequence length
314
structure length
314
Chain Sequence
ATTLKEAADGAGRDFGFALDPNRLSEAQYKAIADSEFNLVVAENAMKWDATEPSQNSFSFGAGDRVASYAADTGKELYGHTLVWHSQLPDWAKNLNGSAFESAMVNHVTKVADHFEGKVASWDVVNEAFADGGGRRQDSAFQQKLGNGYIETAFRAARAADPTAKLCINDYNVEGINAKSNSLYDLVKDFKARGVPLDCVGFQSHLIVGQVPGDFRQNLQRFADLGVDVRITELDIRMRTPSDATKLATQAADYKKVVQACMQVTRCQGVTVWGITDKYSWVPDVFPGEGAALVWDASYAKKPAYAAVMEAFGA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Exo-beta-1,4-glucanase
publication title Probing the binding sites of Family 10 and 11 Xylanases with extended Oligosaccharides
rcsb
source organism Cellulomonas fimi
total genus 131
structure length 314
sequence length 314
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2008-04-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3cujA00
4ACZA 2QHAA 1GONA 3CH9A 1UD8A 2OWWA 3WF2A 5HBFA 1DWGM 4UZUA 1PX3A 2CEQA 4GO8A 1I75A 4XUYA 1V08A 1HT6A 4AD3A 2WYSA 3VUPA 4CN4A 1OCQA 4ACZB 5FOOA 2G4FA 2G3MA 1ZB5A 2WBGA 4EAMA 5A6MA 2OYMA 4MB4A 2GDUA 5D4YA 1MXDA 1UR4A 2CHOA 3PZOA 1LWHA 2VCBA 4M24A 3AZTA 4PMQA 4XZWA 2D22A 3AHVA 4H7VA 3AMDA 3GDBA 3L4TA 1OGSA 1E70M 4PMVA 2W92A 4AC1X 2VZVA 5CPTA 4Z2IA 2WPGA 1CXHA 5ABFB 5BYWA 4AEFA 4QLJA 8A3HA 1R87A 1XYFA 3D3AA 1LL4A 5I24A 1H09A 2ZX5A 4LQ1A 1KXQA 4J3TA 5LA1A 2WK2A 3VNZA 3GXFA 4PYSA 2BY3A 4CU8A 1JYNA 1V6WA 5HNNA 1R86A 3UG3A 1RH9A 3L4UA 4KWUA 5A6SA 4J28A 1XRVA 5FD0A 2YA2A 1KWGA 4H41A 1JDDA 4AIEA 3CUIA 1Q6FA 2XM1A 2NT1A 4UOJA 2NSXA 1J0IA 3WMSA 1GPFA 3GXIA 2VC9A 3CUJA 4MJ4A 3DC0A 1J0HA 3FW6A 2GUYA 1CXIA 3ARSA 4X0VA 1WZKA 5C71A 4QP0A 1QI5A 3FHQA 1VBUA 1PBGA 1D3CA 5CPQA 3WQ4A 3EDDA 1GVYA 2ZX8A 3WL1A 3RDKA 3N9KA 4H04A 1KXVA 1H49A 3WDIA 2VT0A 1H2JA 1M04A 3WQWA 1B3WA 1U30A 1FHLA 1UH3A 5CLWA 1B3VA 2QMKA 1HX0A 3VIFA 1UR9A 1V3IA 4GKLA 4DUWA 2GVYA 1UKOA 3CBWA 3W28A 3SURA 1V6YA 2CITA 3W0KA 2BY0A 1O7AA 2ZUUA 3UERA 2CYGA 5A3HA 1X1NA 3CO4A 1E73M 2D24A 4IPNB 3VGHA 2Y4SA 2CETA 3A6OA 5A8NA 1SFSA 5HPCA 3KZSA 3D5HA 1CZ1A 1QW9A 2XSAA 4U2ZA 1ZBKA 2Y8KA 4UQEA 4AW7A 1UD6A 1QW8A 1QPKA 2WHKA 4OBSA 5A2AA 3IJ8A 1ZJAA 4S3KA 4F9DA 4W84A 2PWFA 5I0DA 1JD9A 3EDFA 4UR9A 4JFUA 4MADA 1MW2A 4E8DA 2GK1A 1KGUA 2X0YA 3ZMRA 2W91A 4U5KA 2DH2A 5JUVA 1E15A 4P8XA 2J8FA 3F5JA 1CWYA 1KR1A 3MANA 4BS0A 3DHUA 4QLKA 1PX4A 4K68A 3WY1A 4F66A 3TOPA 1EIBA 2VVNA 1DTUA 3SCQA 4OBRA 4CU6A 1VFOA 4GQRA 3CTTA 2PWHA 3APGA 3BAXA 1K9TA 1US2A 5E0CA 1E1EA 4XV0A 4D6CA 4HPHA 4Z2GA 5CSYA 3QR3A 3K1DA 2WVUA 2XWDA 4IISA 3T2QA 1W9PA 4D6HA 1R8LA 5CXPA 2QV4A 2C8NA 1ZS2A 4HA3A 1E6XM 4NRSA 2JIEA 1D2KA 1SYTA 3NUKA 4NF7A 2XGBA 3AMLA 3VU2A 4TTGA 2DT2A 4W7VA 4YHGA 2WSPA 4ATLA 1XSJA 4FMVA 2PBGA 4W5ZA 2D0FA 3NSNA 4HOZA 4HZ6A 1E43A 1ITXA 1JNDA 2UY5A 4M29A 4LYPA 3AHTA 1MXGA 1BYDA 1XGZA 3VGFA 5A6JA 1GOOA 4HPGA 3SCRA 1VBRA 3OLGA 3BAKA 3AQUA 2VO5A 4UOQA 5A6BD 2CKRA 2WVSA 2GJXA 4EK7A 4F79A 1U2YA 3THCA 1K9DA 3T0DA 2WC4A 4YHEA 2FHCA 3VIKA 2YOCA 3AHYA 2DSKA 1C8XA 4WLCA 4GZJA 5DT5A 4OUEA 1GORA 4MAZA 3QGVA 2VZUA 4P7QA 1EO5A 2CBUA 4E2OA 2WMIB 4FK9A 1KQYA 5I78A 3WF4A 4GPNA 2XM2A 1ESWA 2F8QA 5E0FA 1WE5A 1B0IA 5CLTA 4ZE5A 3T0AA 3ARVA 3B9AA 3M7SA 3OLEA 1A3HA 4FLOA 3VM5A 4UNIA 3AI0A 1G1YA 4M81A 5A8QA 2GSJA 2J79A 5DFAA 1JZ8A 3ZOAA 3MMUA 3PZNA 3MMWA 3WUGA 2VMFA 2WC3A 1AQMA 1Q6DA 1QBAA 1W3KA 3IANA 3WEOA 4MAVA 3AFBA 3TP4A 2W67A 2NT0A 3AS3A 3CGTA 3OA5A 3CIVA 2WBKA 3RO8A 4JKKA 3VIJA 2D3LA 2FHBA 5AY7A 2GFTA 2Y8VA 4HOWA 5CG0A 4AZBA 1TFVA 2DPEA 2VVSA 2J7DA 2CXGA 2DT0A 3VD5A 1DHKA 4B9YA 4RL3A 3TTOA 2CHNA 1E71M 4XB3A 3N12A 2E3ZA 2WB5A 3AIEA 2E9LA 3AIVA 2A3CA 1V0NA 3AS1A 3HMCA 4J3UA 2WMFA 2FDMA 3CHEA 3OIHA 5CPSA 3BC9A 3T2PA 4PCSA 2BFGA 4B9ZA 1UG6A 2VX7A 1U33A 2EPOA 1NOUA 2FH6A 5A1AA 2G3JA 3MKKA 5ABGA 4D71A 1HKIA 1Z32X 3PTMA 1ZBVA 4HMCA 4DWSB 4BQ5A 4IM4A 1OB0A 4NRRA 1ECEA 1KCKA 3J7HA 4GIAA 2VI0A 1CENA 5I2UA 1FP9A 1LJYA 2XWEA 1MW0A 1ODUA 1CGTA 5M3WA 3AXIA 2EPMX 4XX6A 1J11A 3WD3A 4J3VA 1FH9A 5I77A 1UUQA 2D2OA 1J12A 1HP5A 1M01A 3LPGA 1UR2A 3KL5A 2PWDA 3KWXA 1R85A 1W2PA 2ZE0A 1B30A 2DIJA 5FIPA 1E56A 4WIWA 1VAHA 3BAYA 3WFZA 1UZ1A 3AJ7A 3WEMA 3I3BA 1C8YA 2EJ1A 3UESA 3VX1A 1DWAM 4M82A 2UY3A 4PMXA 4AEEA 4C7FA 4W89A 1CEOA 3IJ9A 1GVIA 3OBAA 4MNJA 5AC4A 1WDQA 5JIWA 4B15A 1DWFM 1WNOA 3GNRA 1HVXA 4ZFMA 4H8VA 3G6MA 1D7FA 2J7FA 1JFXA 2IUZA 3JUGA 4XZBA 1AQHA 2J75A 3BLPX 1RP8A 2XVGA 3AS2A 3RJYA 1UD2A 5M17A 3WFLA 2DSZA 1JF6A 3OLDA 5KZ6A 2BY2A 4U33A 1JZ2A 4Q22A 2AOSA 1GQJA 3EDJA 4CCDA 3TONA 2JEQA 3IK2A 2EPKX 4CCCA 1GHRA 4PRWA 3VILA 2VX4A 2X09A 1WZAA 4CD7A 2ZUWA 1EXPA 1M03A 3WNOA 3WIJA 3SCPA 2D20A 2WANA 4QDMA 2J7HA 3KE0A 5BRQA 2CBJA 4Y7EA 1EQCA 2VOTA 3WH9A 4CCEA 3S2CA 2EXOA 2CBIA 4FLRA 3K4DA 4B3KA 2WHJA 3B9DA 2YDQA 4DUVA 5M5DA 1GOIA 2E40A 1WO2A 1W3HA 2WW5A 3RIKA 3IAQA 3N13A 4P7LA 2XVLA 4PTXA 3KL3A 2HVMA 1UR0A 4X9YA 1BSIA 2DDXA 1KXHA 4JIEA 4D1JA 2VCAA 1UD5A 2WC7A 2CNCA 3W81A 5I79A 2ESCA 4UZSA 1IZJA 3SCOA 1VB9A 4GI6A 3WENA 3AHXA 2VRJA 4JFVA 2J7BA 4MB1A 2O9TA 3W26A 1R7OA 2ZUVA 2WLYA 1JIBA 3SCNA 3DYPA 2OYLA 2ZUSA 1HJSA 1WP6A 3CZJA 1RPKA 2BVDA 1J01A 3FHAA 4N42A 4C7DA 1E6SM 5BWFA 1HJUA 1XH2A 1KB3A 4P7OA 4P7RA 3LPOA 3VGBA 2BXYA 3ZJ8A 4AZCA 5AC5A 3HJEA 5A69A 4NI3A 1NOWA 4DWSC 1TA3A 3WF1A 4J3WA 4GQQA 1J10A 4D6DA 3B9EA 4NSBA 3MO4A 3AXXA 3N18A 2JALA 1BYAA 1KGWA 4GI8A 4AMCA 2DH3A 5E09A 2BVTA 1PJ9A 2E0PA 1UWIA 1GOWA 4BCEA 4D72A 1TZ7A 4GXPA 3MV11 5DEZA 4GZIA 3WF3A 2WZHA 4QCFA 4BQ3A 3BCFA 2ZXQA 1XYZA 4V27A 1HVQA 1BAGA 1OGGA 2JF7A 1UHVA 1EDTA 1B3XA 4AD2A 1KBKA 1PX8A 1NQ6A 2DEPA 2X1IA 1H0IA 3I3EA 2XFYA 2O9OA 5LA2A 3I3DA 1US3A 1E3ZA 2Y24A 3AROA 1KXTA 2E8ZA 3BMVA 2YLLA 2ZX9A 1YHTA 3CUHA 4DWSD 6A3HA 4MDOA 5A2CA 1LG2A 2WWCA 2YKKA 5FL0A 3VOCA 4UCFA 3SUTA 2OWCA 3NIYA 1ZBWA 4J3SA 2OSWA 5LA0A 3M46A 1CGWA 3L4WA 4W88A 1B90A 3RM9A 4CUCA 5IFTA 1PZ3A 1MW3A 4AIOA 4WKHA 1NM9A 2F61A 1JZ5A 3B8SA 2QMJA 1H41A 4HMEA 5TD4A 1EO7A 1GQKA 3II1A 2X2YA 4D1IA 3A47A 1BFNA 4KH2A 5HXMA 4EKJA 1V3JA 2VZTA 2ZUNA 1JZ7A 5E70A 4EANA 3VDAA 1SMDA 5HPOA 1CYGA 3ARPA 1XHGA 4URIA 2BS9A 3PZGA 1UWQA 2V5DA 3WDRA 1PEZA 3ZM8A 4PMNA 3VDCA 3WH6A 4HP5A 1XC6A 1GOQA 3AIQA 4AIUA 4PN2A 3VMOA 2JFEX 2WAGA 1GCYA 3WN6A 4KGJA 4OOZA 2VCCA 3DHPA 3SCTA 1KWKA 2XPKA 1OBAA 5BXRA 1XV8A 2G3NA 3O6AA 3VGEA 3AIRA 5AYIA 5D9NA 1Y7VA 3WNMA 4CN6A 4W8AA 2G8ZA 3FAWA 2A3BA 4WKAA 5FL1A 1ISYA 1CLVA 2XGIA 3SCVA 1W1TA 2FH8A 1Q6EA 3T09A 1CGUA 5A8MA 4ZE4A 5JBFA 4ZENA 3L4XA 1G5AA 6TAAA 2WMJA 2WHMA 1CNVA 1ITCA 2TAAA 3VD3A 2W61A 3FAXA 5GQBA 4HU8A 4E8CA 3AICA 4TUFA 4BF7A 4PBGA 1PIGA 1NH6A 1E6RA 1DEDA 1VFFA 5EMYA 1UH2A 4MDPA 4WJXA 1JZ6A 2ZX7A 3QHNA 1W1PA 4PMUA 3ALGA 1UKPA 2OSXA 1DWHM 4AZGA 1BG9A 3QHMA 4QCEA 1GJUA 2GK1B 1RD6A 1V6XA 2PWGA 3BAWA 3U7BA 1G9HA 1O6IA 1AVAA 2ZIDA 2YBUA 1V6UA 1YQ2A 4NZCA 2OYKA 2VJXA 1GQIA 2ZWZA 3EMQA 4WSKA 3ZT7A 2J47A 1I1XA 4HMDA 3DYMA 1WAWA 5A8PA 3VPLA 1CTNA 1MQQA 2WVTA 9CGTA 4J7RA 1HNYA 2WWDA 1HKKA 1LF1A 4R27A 5ABEA 1VENA 4HA1A 3ZO9A 4TVUA 1H1NA 2Z1SA 2YA0A 3ARXA 1VIWA 3LPPA 2DSWA 2A3EA 3SUVA 5EBAA 5C8BB 5CZKA 4ZXOA 1MQPA 3LPFA 1E5NA 2FHFA 2JIWA 3ZSTA 4WK9A 1F4HA 1CXLA 2EO7A 3EDEA 4RE2A 1HKMA 2C7FA 3GH7A 1QHOA 3QHOA 3W6MA 1UH4A 1J18A 3ARTA 1BTCA 1JI1A 3POCA 2OSYA 1JAKA 1C91A 2WM0A 1XD1A 4Z2LA 1OT2A 3AYSA 4GO9A 3SUWA 2E9MA 1EGZA 2GJXB 1ZJBA 1E3XA 3OGVA 1HKJA 4PSRA 4HOXA 2VRQA 1E0XA 1TR1A 2D1ZA 4Q7NA 5IHRA 1BG4A 1HN1A 2DQXA 3VIHA 1HJWA 5A2BA 4M56A 5HDRA 4JCMA 1KQZA 4AY1A 1QVBA 2YL8A 3SUUA 2WKLA 1C3FA 5CJ5A 2QLYA 1BGAA 3GTNA 1E4NA 1GOMA 2ZWYA 1A47A 3FXYA 1UWUA 3MSDA 1B9ZA 1W3LA 4WKFA 3WELA 2ZOXA 2XTKA 3NCOA 1WCGA 3BAJA 3RM4A 3W6LA 1LG1A 1CPUA 1DWJM 3IAPA 3MUAA 5IDIA 1QNOA 1OM0A 4UOZA 3QOMA 2X8RA 3U7VA 5CQ1A 3VD7A 1CGYA 2DT1A 4PMDA 1CECA 4UFHA 3WNLA 3BH4A 3MV01 2PI6A 1QNQA 4W86A 1HJQA 1NOFA 1BVNP 5A6AA 1CXFA 4CU7A 1B1YA 1HL9A 4OOUA 4Z2KA 1FP8A 1H5VA 4MNKA 3AZRA 4PTVA 2BNJA 1X6LA 5D9PA 1DP0A 3ZJKA 4N0RA 4S3JA 4WSJA 1UR8A 4AZ6A 5I3DA 4GI9A 1HIZA 5FKYA 3M07A 3VIPA 5EFDA 1CBGA 1V02A 2J78A 1J0JA 1E40A 1GZJA 4TX8A 4QLLA 1V0MA 3N11A 2O9RA 4AZ5A 5A94A 1J9YA 3VGGA 3WDHA 3PZMA 1M7XA 4FLSA 3TTQA 1UQYA 1VEPA 2J77A 2VQTA 3FN9A 4U5IA 5LYRA 1JYWA 5BXTA 1ZU8A 4P7NA 1W91A 1W9DM 3BSGA 2RGMA 4U3CA 3VTRA 1R7AA 2BHZA 3F5LA 1UZ4A 1X6NA 3MSGA 2XG9A 3VDBA 1CXEA 1EHNA 4DM2A 3BCDA 4A3HA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4ACZ A;  2QHA A;  1GON A;  3CH9 A;  1UD8 A;  2OWW A;  3WF2 A;  5HBF A;  1DWG M;  4UZU A;  1PX3 A;  2CEQ A;  4GO8 A;  1I75 A;  4XUY A;  1V08 A;  1HT6 A;  4AD3 A;  2WYS A;  3VUP A;  4CN4 A;  1OCQ A;  4ACZ B;  5FOO A;  2G4F A;  2G3M A;  1ZB5 A;  2WBG A;  4EAM A;  5A6M A;  2OYM A;  4MB4 A;  2GDU A;  5D4Y A;  1MXD A;  1UR4 A;  2CHO A;  3PZO A;  1LWH A;  2VCB A;  4M24 A;  3AZT A;  4PMQ A;  4XZW A;  2D22 A;  3AHV A;  4H7V A;  3AMD A;  3GDB A;  3L4T A;  1OGS A;  1E70 M;  4PMV A;  2W92 A;  4AC1 X;  2VZV A;  5CPT A;  4Z2I A;  2WPG A;  1CXH A;  5ABF B;  5BYW A;  4AEF A;  4QLJ A;  8A3H A;  1R87 A;  1XYF A;  3D3A A;  1LL4 A;  5I24 A;  1H09 A;  2ZX5 A;  4LQ1 A;  1KXQ A;  4J3T A;  5LA1 A;  2WK2 A;  3VNZ A;  3GXF A;  4PYS A;  2BY3 A;  4CU8 A;  1JYN A;  1V6W A;  5HNN A;  1R86 A;  3UG3 A;  1RH9 A;  3L4U A;  4KWU A;  5A6S A;  4J28 A;  1XRV A;  5FD0 A;  2YA2 A;  1KWG A;  4H41 A;  1JDD A;  4AIE A;  3CUI A;  1Q6F A;  2XM1 A;  2NT1 A;  4UOJ A;  2NSX A;  1J0I A;  3WMS A;  1GPF A;  3GXI A;  2VC9 A;  3CUJ A;  4MJ4 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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