3EKLA

Structural characterization of tetrameric mycobacterium tuberculosis fructose 1,6-bisphosphate aldolase - substrate binding and catalysis mechanism of a class iia bacterial aldolase
Total Genus 134
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
134
sequence length
345
structure length
333
Chain Sequence
PIATPEVYAEMLGQAKQNSYAFPAINCTSSETVNAAIKGFADAGSDGIIQFSTGGAEFGSGLGVKDMVTGAVALAEFTHVIAAKYPVNVALHTDHCPKDKLDSYVRPLLAISAQRVSKGGNPLFQSHMWDGSAVPIDENLAIAQELLKAAAAAKIILEIEIGVVGGLYTSPEDFEKTIEALGAGEHGKYLLAATFGNVHGVYKPGNVKLRPDILAQGQQVAAAKLGLPADAKPFDFVFHGGSGSLKSEIEEALRYGVVKMNVDTDTQYAFTRPIAGHMFTNYDGVLKVDGEVGVKKVYDPRSYLKKAEASMSQRVVQACNDLHCAGKSLTHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Fructose-bisphosphate aldolase
publication title Structural basis for catalysis of a tetrameric class IIa fructose 1,6-bisphosphate aldolase from Mycobacterium tuberculosis
pubmed doi rcsb
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 134
structure length 333
sequence length 345
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2008-09-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01116 F_bP_aldolase Fructose-bisphosphate aldolase class-II
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3eklA00
3GDRA 3NG3A 3EWWA 2WQPA 2GQ8A 3NM1A 3UWWA 5FEXA 3W07A 4O12A 1YTKA 1FCUA 2E6YA 4JTLA 3DFTA 3C56A 4OE7A 5KZEA 1IF2A 4G1KA 4PL1A 2X1SA 4PH6A 4N4PA 5FF0A 5J5RA 4AMAA 5H2ZA 1KM4A 1H1ZA 2G96A 1SR9A 1YTEA 3HJZA 2E77A 4MZYA 3B0VC 1F7BA 3N9SA 4Z08A 2A0NA 3E9AA 2FIQA 3LRMA 3NDOA 3OVPA 3TNOA 5LGZA 4UMCA 1L6SA 5HQEA 4CLMA 4NJIA 3EXRA 5EA9A 2NWRA 4UR8A 2FPYA 3PBVA 4LT9A 4BF9A 1O60A 3M16A 3A5VA 5HR6A 1RD5A 5J5DA 1PCKA 3RFAA 1NF7A 4FNQA 4LV9A 3G0SA 1GVOA 4YWIA 5EKYA 3MW7A 1FWTA 5FI8A 5LSMA 2WV8A 4XWUA 4UTTA 1TPUA 3T55A 1A50A 5KTLA 2A2IA 4FXRA 3SJ3A 2NXHA 2B7PA 1G69A 3CLMA 3S1UA 2BLEA 2QCCA 1C9DA 3INPA 1AW5A 2AGKA 1OYCA 4MY9A 1VHNA 3TFCA 4P61A 2V0TA 1GG1A 2VFIA 3NZRA 3NQDA 5HWMA 2RDTA 1OFBA 1SO6A 1OX5A 1B4KA 3N3MA 1H51A 1W1ZA 3C61A 5DBUA 5EBUA 1EWEA 5D38A 1H7RA 5I3GA 2PCQA 4PC8A 5E1QA 5FF3A 4GJ1A 3F1QA 1P4CA 1SPQA 3GDTA 2CLIA 3A22A 3LHWA 1FCBA 1ICPA 4L4MA 4K8HA 3PBUA 1Q6QA 2VOMA 3IGXA 2NX9A 4JIPA 3EX3A 3QYQA 4JICA 1WQ5A 3I7QA 4BWLC 2FDSA 3NR0A 3O6YX 3VFLA 1IIGA 3CTLA 3O63A 4HN4A 3HF3A 4FO4A 3HB9A 2CZFA 3HG2A 1YXDA 4DO5A 1XBZA 1OFEA 4CQ9A 3BV4A 3UWYA 1BTMA 3E96A 1VS1A 3C4UA 4H4IA 3LHZA 1H5YA 1L6YA 4FHAA 4K37A 3TJLA 4O13A 1ADOA 3P5YA 4AHQA 3QC3A 3LM7A 2YFOA 3QMTA 4IXHA 4Y96A 3FOKA 3ANYA 2EKCA 4WXYA 2YZRA 4FNTA 2DORA 1Y0EA 3AJXA 3G1DA 3W1QA 1EB3A 4TR9A 1H60A 4GUJA 3TKFA 2VEKA 3G0UA 3W7LA 3G1SA 4QNEA 4RCXA 1P5BA 2J6XA 4AF0B 3H53A 3KFTA 1TTIA 1KFBA 3LBMA 4J9JA 5D05A 5FF4A 3W1AA 2TPSA 1Q3NA 3H54A 3G24A 5D32A 3W1NA 5BMXA 3U6WA 4Q32A 2F7FA 5HUOA 5EYWA 3DKJA 3LHYA 1W37A 3DZ1A 1A5BA 3IVTA 4LVGA 5CPOA 4IPJA 4XTDA 3UD6A 3CIWA 4Y90A 3LV5A 1W3IA 1MEIA 3LTSA 1ZAIA 4JGDA 3KVMA 5IM51 1SW0A 3USBA 2Y7EA 3NQ8A 1KFCA 3MYPA 4WJEA 3ZR4A 5DN1A 3LOTA 2V2DA 1DVJA 1FWRA 4K7YA 3P74A 1LORA 1SO5A 2PC4A 1FX6A 3UWVA 1EA0A 1TTJA 2QCHA 1T0OA 3FS2A 2FB3A 4X22A 2F84A 2QCNA 3C52A 4TMBA 1HFBA 5D30A 3R2GA 4AWSA 5G1TA 1QMLA 4S2BA 3BGGA 4A2RA 3PUEA 1K7EA 2TYSA 3EX2A 3NNTA 4OHQA 3KRUA 3FKRA 3LDVA 3CIXA 4CNPA 3MP5A 3P60A 3LV6A 4RV8A 1A5SA 1YYAA 1TMHA 3C3NA 3SR7A 1DORA 3LCLA 3ABRA 3HGRA 1RV8A 3P61A 1ZY9A 4RK8A 2ZZ3A 3QM3A 3LHVA 2V30A 4M19A 1I2NA 1M5WA 3TQ0A 1SSGA 5EMUA 3S5YA 4AH7A 1M7PA 3NQ7A 5LZLA 4WD0A 4MUZA 4EF8A 3HQ1A 3NQ6A 2ZA2A 5I3IA 1FDJA 5AHEA 2DZUA 3DFOA 3EKZA 1W5OA 1WBJA 2O7SA 4QSHA 3G8EA 2WOQA 1Z42A 3L0NA 3BW4A 4GXMA 2ZFAA 3GZ3A 5MHBA 4DBDA 4HNUA 3L67A 2ZRVA 3M43A 1X1ZA 4NJHA 1UUOA 1D9EA 3SIZA 3N2XA 4N9DA 2A7PA 3C8FA 3L0KA 3EXTA 1S5VA 3NL3A 4JR5A 1UUMA 4EWND 1K3UA 4DELA 1Q6OA 3OA3A 2Q8LA 3S5NA 2G95A 4MYXA 2NX3A 2Y6ZA 2R94A 4JX5A 4JTKA 3EEGA 4B5NA 3I65A 2QF7A 4XKYA 3R8RA 1K8XA 2AQWA 4UNKA 3TXZA 1F73A 3V75A 3W7QA 4JTEA 4WY0A 5K7JA 3UWQA 1I2RA 4IMFA 5D33A 4OWGA 2I1OA 3FYOA 4LVDA 1KV5A 3W7EA 2P1FA 1FXQA 3FA5A 1JR1A 4LV4A 5LKYA 5I3FA 3W1TA 5F4WA 3DFPA 5K9XA 3W76A 2NUXA 4BWLA 2CLKA 4HNTA 3TSBA 3PVFA 1YADA 3W87A 1JCMP 4K39A 3M1ZA 3S1WA 5U4NA 4IXXA 2A7RA 4ADUA 2VFEA 2QJGA 2PRMA 3BG3A 1K7FA 4ORMA 1TRIA 2ZTKA 4OV9A 1RQBA 1DV7A 2Y88A 4JDBA 3PB2A 4O50A 5IBXC 4LW7A 3NAVA 3DU0A 4DF1A 3W85A 4AWUA 1TV7A 4JYEA 1M6JA 2GQ9A 3A5FA 1VRDA 3GXTA 4M6QA 4XZ9A 1YXYA 4PFMA 1TPFA 1AW2A 2DU2A 3GIYA 1VYRA 3C2EA 1IXPA 4ORIA 4QITA 4UTLA 1H63A 3ZFHA 2A6NA 1AK5A 1MO0A 1K03A 4GFSA 3ABOA 3O6CA 1GVFA 5AC7A 2Y62A 3IVUA 5CG7A 3G1VA 4O8RA 1ZFJA 2Y7DA 3QH2A 4QM1A 4FNPA 3EX4A 2ZTJA 3IIZA 3M5ZA 3BO9A 1NAL1 3TAOA 1ALDA 4TMCA 3FKKA 5HINA 2QJIA 1O4UA 1G4PA 1PE1A 1TPB1 2DZXA 4OBTA 2NV2A 1GZGA 4JEQA 3LRLA 4UMBA 2B7NA 2G5WA 1OJXA 2FB2A 1IXNA 5EY5A 5D02A 5CGQA 3GX9A 1OFDA 3QPZA 1EWDA 3L21A 1VLWA 5F2IA 4MYAA 4O16A 3MI6A 2RHGA 4O0KA 4Q4KA 5L6UA 3HO8A 2Z6IA 3W7DA 3EXSA 4O11A 4BI7A 4FNRA 3RLVA 2W0UA 3P5ZA 2Y61A 3L2IA 1OK6A 1OFRA 3MP4A 1O5KA 3A24A 3W7IA 3IGSA 5I3HA 4WY0B 4JTFA 3MYOA 4ZQOA 5LNRA 1CI1A 1I4NA 1UB3A 5LNUA 4NT0A 4KWVA 1W54A 3M0ZA 2CW6A 3CWOX 3PBYA 3QZEA 4O19A 3T7VA 3W7HA 4TIMA 1DHPA 1W3TA 1FCQA 1YDVA 2X1TA 2Y7GA 3F03K 1N8FA 3NXFA 1SO3A 3BW2A 5K4ZA 3S5ZA 3L9CA 4NZFA 2NV1A 3W75A 2ZBTA 2CU0A 3HPZA 3C2RA 2QDHA 2XFWA 3QW4B 2QAFA 3IVSA 1FUYA 2YPIA 1LBMA 3O15A 4PL2A 4YL2A 1EP2A 4UFJA 1F05A 3W2LA 5HNRA 2VFGA 1WDWA 1MXSA 5D2WA 1PHWA 3NVTA 5AC8A 4M5PA 1OFOA 3GR7A 2OX1A 4DBEA 3C0JA 1GVSA 4HSOA 4ADSA 1R2RA 4BFAA 2Y63A 1JCLA 4NX0A 4JY8A 1KTNA 3TA6A 3O16A 2H3DA 2Y70A 4N9BA 4Y8FA 3BG9A 1DQXA 1NSJA 3GAKA 3M41A 1QDSA 2Z0IA 2ZRUA 4UTIA 5FEPA 1VR6A 2A5HA 3ELFA 2V8ZA 5ABTA 4ZL1A 1Q45A 4WX2A 1X1OA 3ATYA 3NQGA 2ABBA 3PUDA 3JS3A 2X30A 1R2SA 4CCEA 5C6MA 3TW6A 2QCLA 3EKLA 2GUUA 2VFDA 5FF2A 5K9CA 4XBSA 4AAJA 3NA8A 3CT7A 4O1BA 4POCA 4RR4A 5F2MA 3U8GA 4CNNA 3MI3A 1OF8A 3TQVA 3S42A 4JX4A 1F2JA 1VQTA 3UXDA 3S0CA 1FWNA 1XM3A 2ALDA 2TSYA 2QUTA 3P8JA 2FQIA 1SFJA 2VEMA 5DCEA 2J27A 2WPBA 5DLCA 3UY7A 4NJJA 3UZJA 4MKNA 4O52A 3GAYA 4M6VA 2X1UA 1I8JA 2OJPA 1P1XA 2E6FA 1KW1A 3Q94A 2YW3A 2Y7FA 3S6DA 4I7WA 1LP6A 4FB7A 3B03A 5IBXA 3KRSA 3KHJA 4HNNA 3PG9A 1J4EA 2ISWA 4O1AA 4HIBA 3GVGA 5F1VA 2RDWA 1I2QA 3BLEA 1IIHA 1UBSA 4ONVA 4IMCA 3TDFA 3O1NA 4IGHA 3HG5A 4K36A 1MZHA 2WSQA 5DY3A 4M7TA 4LS0A 1ZAHA 2B4GA 4CCCA 1OFQA 1W56A 1TPVA 3PAJA 3R89A 1C29A 1FWSA 3VCRA 3C2FA 2JGQA 2PRLA 1GQNA 4AHPA 4HPJA 3NOEA 3P84A 1H62A 2ZA3A 3LXBA 5F4XA 1L2UA 3N2MA 2B7OA 1EEPA 3KOFA 4OV4A 1R47A 1KFLA 4RXGA 1ZENA 4MJZA 1W5NA 3L66A 5CPNA 4HKPA 4ZQCA 5AHFA 1VZWA 4UTMA 4UFIA 1LOQA 5KMYA 2QKFA 3WJYA 3TJXA 4UMAA 1FCVA 3M44A 4O57A 2PE4A 4H6KA 1YDOA 3LI1A 2X16A 1YTDA 4N02A 1SZGA 4UTUA 2ZZ4A 3GKFA 3SI9A 1C8VA 3G1HA 4LUJA 1TPDA 1CX9A 4GUIA 1D3GA 1X6UA 3CPRA 1R46A 1XUUA 2O7QA 4EVZA 3UNDA 2WJZA 4DF0A 2NWSA 1LZOA 3N9RA 1LOSA 1SFLA 3WK3A 3HPSA 3LCFA 3G3DA 3ABQA 3KAOA 4Z1AA 4LY8A 2C0AA 1FY6A 3FYPA 2E5BA 1YPFA 1Z41A 4H3DA 3RMJA 4X9SA 3DHDA 3Q2DA 2A1YA 3TAKA 1QOPA 3D0CA 3CEUA 1YXCA 1BKSA 3T44A 1J2WA 1P0KA 2Q3RA 1LROA 3NL6A 2W6RA 3QMRA 3DGRA 1LM1A 1G6CA 1OF6A 3W7RA 1RPXA 2H90A 4NNCA 3IIVA 3FFSA 3MI2A 1I45A 3G1YA 1U83A 3TC6A 1XBVA 2YFNA 1HL2A 3NPWA 4KKXA 2V82A 1TPEA 4IX2A 1G67A 3TIMA 1VJIA 4QQ3A 4UXDA 1H7NA 4FIRA 3IRDA 3PG8A 5G5IA 1UJPA 1KTBA 1Z44A 1P0NA 5KZDA 1QPOA 3F4NA 1SQ7A 3R5EA 2E6DA 3W2UA 2GJLA 1XL9A 1LRNA 1KLZA 3QPYA 1SU5A 1VCGA 2V9DA 4Z1BA 4N4QA 4E2BA 3CEPA 3DI0A 3QEZA 3HMJG 3GNDA 3L5MA 2X1RA 4UC5A 1PIIA 2FPTA 1EPXA 3TK7A 5CSSA 1K8ZA 3MJYA 4UIOA 3DXIA 5I3KA 3TW7A 4O28A 1QCWA 3B4UA 4NQ1A 2DJXA 4JYDA 3TX9A 4IMEA 2NXIA 3P82A 4O54A 2EGZA 1FDYA 4BK9A 3W1PA 4JTGA 3W83A 1O94A 1ICSA 1F6PA 3EX1A 1G4TA 1VC4A 4FIQA 2VFFA 4IWWA 4P2VA 2WNNA 4GNJA 2CLLA 1JUKA 4IJBA 1T96A 5BRBA 4KWWA 2EPHA 2ZZ5A 3IGUA 3IIOA 3S8HA 3HOJA 1XFBA 1JRBA 1W0MA 4L4LA 5CPMA 2JKPA 3G1AA 3HGJA 5FEZA 4TX9A 5HR7A 4RX0A 2VENA 4UTJA 4AVFA 4PA8A 3NPXA 1VPXA 2JKAA 3RU6A 1KFEA 2A21A 4M7SA 2QDGA 1OK4A 3UPBA 2RDUA 5C5YA 4LVAA 5C55A 3W86A 2H8XA 3TFXA 1AL8A 3VI2A 2H6RA 3TV8A 1IGSA 3LX9A 5KINA 1QR7A 4NXSA 1KFKA 1H7PA 3B8DA 2TMDA 4GBUA 1QNVA 1TREA 1XDMA 3P7YA 3NQVA 3LCXA 5KITA 4XUGA 4LU0A 3LXAA 2ZA1A 3IIXA 3BPWA 4IPIA 4EOUA 3ATZA 3KRZA 4QAIA 3UY8A 2GQAA 2HMCA 1TTQA 3PWAA 4O14A 4IQLA 3HGOA 1KM0A 4UFHA 4JTTA 3BW3A 1TPWA 4IX0A 5K3VA 2ZRXA 5L9FA 3IEBA 2ABAA 1JULA 1OVDA 3GLCA 3PULA 4LNYA 1H50A 3FIGA 2DZVA 5LHEA 5AYZA 2QCDA 4KFPA 1LBFA 1XKYA 4GC4A 5E0KA 3TSMA 1H7OA 2DP3A 4GUHA 3L0GA 5AOUA 5FEWA 2CZ5A 5TBOA 4GRSA 4N2YA 4U4MA 5FF7A 3DFSA 3C2OA 3W88A 1JCNA 3NL5A 5K4XA 4GUGA 1XCFA 4NJKA 3WFAA 3STCA 1MEHA 4Q33A 1PVNA 4IMDA 2D73A 3W1XA 4C1LA 3KVJA 1W5MA 3W7GA 1DJQA 2WSYA 1AL7A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3T81 A;  3CO4 A;  3NG3 A;  3BZJ A;  4MNJ A;  3RPM A;  3NM1 A;  1YHT A;  1BHG A;  2WVT A;  5CCZ A;  1K9T A;  2NSO A;  2VL4 A;  2QPS A;  4OE7 A;  4YTU A;  3PN8 A;  3TVA A;  3MUC A;  4G1K A;  4PL1 A;  4Z2J A;  2G3M A;  2X1S A;  3M0X A;  3VZX A;  4Q4M A;  1KM4 A;  4ZTX A;  1H1Z A;  2R9R A;  4UOQ A;  4AMC A;  1GKQ A;  2FHF A;  4JQ4 A;  3UGV A;  4GY0 A;  4EPD C;  4KES A;  4M1B A;  1IEV A;  2G3F A;  4AD1 A;  2B81 A;  4UMC A;  1L6S A;  4CLM A;  4NJI A;  2BVW A;  2ZID A;  2FPY A;  1EOM A;  3FA4 A;  1J93 A;  1RD5 A;  3WBA A;  3CHC A;  4S3J A;  1TVP A;  4W7W A;  3ZM8 A;  2IPF A;  3OBE A;  4WSJ A;  4Y8E A;  3T55 A;  1B54 A;  1I0D A;  2BMB A;  4FXR A;  2JIE A;  2NXH A;  2WM0 A;  4V1X A;  3ARV A;  3CLM A;  2GDQ A;  1DJH A;  4DBW A;  2F38 A;  2AGK A;  4IQD A;  4F0H A;  1FP8 A;  1JZ5 A;  4KCT A;  5C0Q A;  1X1N A;  2REQ B;  1GOK A;  1BF6 A;  4ERG A;  1QOX A;  3FGC B;  3VC5 A;  5I3G A;  4PC8 A;  4GJ1 A;  4QQU A;  4HJW A;  1OGB A;  3GG0 A;  2FZ9 A;  2CLI A;  3GIQ A;  3A22 A;  1FCB A;  2Z7G A;  3TWB A;  1Q2R A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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