3EKZA

Structural characterization of tetrameric mycobacterium tuberculosis fructose 1,6-bisphosphate aldolase - substrate binding and catalysis mechanism of a class iia bacterial aldolase
Total Genus 130
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
130
sequence length
345
structure length
334
Chain Sequence
PIATPEVYAEMLGQAKQNSYAFPAINCTSSETVNAAIKGFADAGSDGIIQFSTGGAEFGSGLGVKDMVTGAVALAEFTHVIAAKYPVNVALHTDHCPKDKLDSYVRPLLAISAQRVSKGGNPLFQSHMWDGSAVPIDENLAIAQELLKAAAAAKIILEIEIGVVGGKLYTSPEDFEKTIEALGAGEHGKYLLAATFGNVHGVYKPGNVKLRPDILAQGQQVAAAKLGLPADAKPFDFVFHGGSGSLKSEIEEALRYGVVKMNVDTDTQYAFTRPIAGHMFTNYDGVLKVDGEVGVKKVYDPRSYLKKAEASMSQRVVQACNDLHCAGKSLTHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Fructose-bisphosphate aldolase
publication title Structural basis for catalysis of a tetrameric class IIa fructose 1,6-bisphosphate aldolase from Mycobacterium tuberculosis
pubmed doi rcsb
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 130
structure length 334
sequence length 345
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2008-09-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01116 F_bP_aldolase Fructose-bisphosphate aldolase class-II
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3ekzA00
1SUXA 3KVKA 1V7YA 1VHNA 2B7NA 2VXNA 5G4EA 4NZJA 3PS7A 5GVJA 3DKJA 1BEUA 2A4AA 2I14A 4TIMA 4UTTC 1EP2A 3W7LA 4RLIA 1H1YA 5K7JA 3DGRA 1EIXA 3KVLA 3C2FA 2ATMA 3A5VA 2VEMA 1WAUA 1J4EA 4O1DA 1Q6OA 4A29A 3G3MA 3IIZA 3L21A 3W2JA 1UUMA 2QDHA 2GVJA 2PCQA 3EX6A 3TMQA 3W1LA 3W71A 3WK2A 1JCJA 2FB3A 3HPSA 3TQ0A 1SZGA 2ZZ7A 4GWEA 4DO4A 1EX5A 4FF7A 5LNWA 2YPIA 1KTCA 3R13A 4TX9A 4XKYA 1T8XA 3EWWA 3WFAA 2WNNA 2ZTKA 4AWTA 1VGAA 2A2IA 2C6QA 1VH7A 4MJMA 2FTPA 2ZRWA 3TROA 3PB0A 1VRDA 3W7DA 3NQVA 1R2RA 1L9WA 1KW1A 4BR1A 1H7WA 4E2DA 4Z1DA 2J88A 2H8ZA 4DPPA 2FDSA 1LLZA 1LTDA 4LUIA 4FNUA 1TQXA 2V30A 4ZQOA 1GG1A 3A21A 4DF2A 1EWEA 2VELA 3FEMA 3W85A 3O15A 3LBCA 2CLKA 3BG3A 4HSNA 1F2JA 3W1PA 4UTIA 5LNSA 1GPWA 4IPIA 3QW4B 2OMAA 3UY8A 4JS3A 2Q8LA 3GR7A 1I4NA 1JCXA 4R53A 2R8WA 4JTTA 1FDJA 4FXRA 1OFAA 1GJPA 2C3ZA 2WNZA 5F4XA 4A2RA 5TBOA 3GAYA 4OU1A 1H1ZA 4NX0A 4Y6GA 3GXNA 5FF0A 4Z1CA 3DHFA 4NVTA 3PULA 5F1VA 2QUTA 5DXYA 4MKNA 4O28A 5DBTA 5FEPA 5HUPA 4ZQPA 3MWAA 3NR0A 2A1YA 3P84A 2F84A 3LTYA 1FDZA 4NT0A 1J2WA 2VFGA 2GVGA 3G8EA 4A2SA 3R5EA 3UWZA 4UXDA 1GYNA 1DL3A 2NWSA 5AHMA 3NQ7A 1JVNA 1G4EA 1W37A 4JX5A 4CNOA 5IBXA 1TSIA 5EKYA 3L9CA 3MBDA 5D33A 4MIMA 4MLJA 5CSRA 3W74A 1SSGA 3EWBX 4UTJA 5AN7A 5DELA 1T96A 3C8FA 3HB9A 4RZ6A 1IXPA 2X16A 1K8ZA 3TW7A 3S1UA 3LB0A 5I3JA 2EKCA 3DZ1A 3LM7A 1KM6A 2CLLA 4LTSA 3W70A 4MYXA 3C3NA 3W6YA 3N2XA 1KTNA 3ABOA 4HHPA 5FEZA 1ZHAA 3PG9A 1YYAA 4ONVA 5AHFA 4OV9A 3EWUA 2GJNA 1GEQA 3PUDA 4L4LA 4JNMA 4KWVA 5KMYA 1SR9A 3FOKA 4I7VA 1R46A 3NL5A 3QPYA 2V9DA 4YCPA 3DI1A 3CHVA 3S0CA 4LVAA 1TPDA 3NPVA 1XXXA 2LLEA 3M41A 3WK0A 4NUWA 3T7VA 3DFQA 3W73A 3C2RA 3H55A 2A7NA 2ZZ3A 4IQLA 5AHNA 3CT7A 4BI7A 4UTTA 3NAVA 3TK7A 1M7PA 2NX3A 2VC6A 4H3DA 1QNVA 3FFSA 2CZFA 4QSHA 3W2KA 1JCLA 4LVFA 1TIMA 3TA6A 1C8VA 1X1OA 4FEZA 2GPTA 3O6DA 3DFSA 4CNNA 2QCGA 3G1SA 2OT1A 4XUGA 5AFDA 4CCCA 3NL6A 1LLWA 3DKLA 4LC6A 1TPVA 2AQWA 3BW2A 3FKRA 4N9EA 1THFD 1VYRA 1XUUA 1X8FA 1LOQA 3I7SA 4D2JA 5HQEA 1IF2A 2WJZA 1PIIA 3R12A 2NUXA 3P5YA 1R30A 2BWGA 3CPRA 4XZ9A 3O6YX 1O60A 5LZLA 2PE4A 1LBLA 3V1PA 2QUVA 4EF9A 4LV4A 3B0VC 3W1UA 2VOMA 2E77A 2RDWA 3EXRA 5DN1A 5D03A 4O19A 5C5YA 4FIQA 3GK0A 3I65A 2FIQA 1XUZA 4N9BA 2GOUA 1DQWA 1WYIA 1QO5A 1GG0A 2QCCA 1NAL1 1G4SA 3DI0A 3NQFA 5CG7A 4UFJA 3S5NA 5J5RA 2HS6A 4NJJA 5EPDA 1LZOA 4HIBA 4JDBA 2NX1A 3W07A 4BI6A 3LCLA 1S5WA 1C29A 4GJ1A 3W1AA 1TPUA 2P1FA 1QCWA 4UUIA 2Q3RA 4ZQCA 2B4GA 2QEZA 2H6RA 4PL1A 3E96A 3N19B 2ZZ6A 3H53A 3TU9A 1TB3A 3CWOX 3M5VA 4GC4A 3TSMA 3FLUA 1OX6A 2DZPA 3IIXA 4UTLA 1LORA 3W1QA 3OVQA 2XN0A 2RDUA 2EPHA 3LHWA 1SW3A 1YLVA 2Z6JA 3MP3A 4HNNA 5G2HA 3Q58A 3W7JA 3LXCA 4FNQA 5KZMA 1W5OA 1WV2A 4FX8A 3MHFA 3HGOA 3RF9A 2Z2UA 3PBUA 2PURA 4PH6A 1I2PA 1TRDA 4BFAA 5HJLA 2BTMA 2ZA1A 1Q3NA 3QQ1A 1DQXA 1I8JA 4I7UA 3C52A 4AF0A 1VQTA 3I68A 3NQCA 1DJNA 1JRBA 4EIVA 3P8JA 2QKFA 3E12A 1OG0A 3SGUA 3BO9A 1F6KA 3P81A 4MY8A 4TMCA 1F76A 3MI2A 4AHPA 2B0MA 1CW2A 4ORMA 1W5NA 2GQAA 2CLIA 5FI8A 2EGZA 5E93A 1QPNA 4UR8A 4CQAA 1KM4A 1YTDA 3C2OA 4HN4A 1H7NA 1QPQA 2W0UA 5C6MA 1WDWA 1AW2A 4HT3A 5D05A 3EWXA 3FIGA 1TRIA 4IJBA 2P0OA 1F74A 2Q3OA 2H8XA 4JYFA 1QOPA 1G4PA 1Z48A 4LVBA 4BK9A 1ZENA 6TIMA 4O0KA 3RNDA 4O17A 1WQ5A 3PY2A 3W7QA 1FWNA 4UFIA 1EUNA 3GVGA 3SIZA 1IXNA 3M5YA 4M19A 3Q94A 1ZJIA 2TRSA 3DENA 4YL2A 4E2BA 1PHWA 5FEWA 1YXCA 3MI3A 2QCMA 1QPRA 2ISVA 5LSMA 1LP6A 3MJYA 3HGRA 4MUZA 5G2IA 3WJZA 3L5MA 1O4UA 1GVQA 5D38A 5G4WA 4NU7A 2A85A 3QJAA 4BWLC 5BMXA 2H90A 4PL2A 3NA8A 1P0KA 3EXSA 1GVSA 1NF0A 1BTMA 2V8ZA 2CLEA 1SO6A 2Z1BA 5K2ZA 4Y8FA 4N4PA 1OX4A 3MP4A 2QCDA 4DEFA 3KRUA 3W7MA 3QZEA 1W5PA 3LV5A 1K8XA 1ME8A 1I2NA 3W75A 2NZLA 3LCHA 4WJEA 5AHEA 5C2XA 1IXOA 4UIOA 3G8RA 5DLCA 1VZWA 2RHGA 4Q32A 3VE7A 3I7RA 4Y96A 1RR2A 1ME9A 2C14A 1UCWA 3G18A 1N7KA 1FXQA 3NPUA 3P82A 4UR7A 4XTDA 3KRZA 1P0NA 4FX6M 5I3GA 5HWMA 4UNLA 3DH7A 1EPXA 4K8HA 1VLWA 1W54A 3P60A 3UYCA 3QFEA 3KX6A 3TR2A 2A21A 4NJIA 5AHLA 3STGA 4DF0A 3NQMA 5D09A 4MZ1A 1SZEA 4O18A 3FKKA 4FXSA 1PE1A 1OF6A 2FB2A 2ZZ4A 4YLWA 5HULA 3GNDA 3U6WA 3SSJA 2Y62A 3RFAA 4YXGA 2V82A 3B8DA 3QPZA 3W22A 1FCBA 4XKYB 3CTLA 5KINA 8TIMA 1AMKA 2QAFA 5D37A 4IX2A 1P5BA 1OFDA 3G1DA 4OBTA 4LV9A 4ZQMA 3ZWSA 2X1TA 3BGJA 4IPJA 4LVDA 4QISA 5D30A 4GUHA 3RLVA 3QSTA 4A21A 3C2EA 3ATYA 3P5ZA 3CQ0A 4Z1AA 1VCVA 3OG3A 3NQGA 3A22A 1QWGA 4M7TA 1AW5A 1UJPA 2G97A 1XCFA 4P2VA 3TDFA 3TSBA 3E9AA 1LYXA 2RFGA 1G69A 2X1RA 1A5AA 1W3TA 2J9YA 3W2MA 5D2TA 1SO4A 4O8RA 5CZSA 4DELA 2PRLA 1G67A 4LS2A 4DO5A 2ZCGA 4JTLA 1FCUA 1H63A 1KLZA 1IIHA 4UTMA 4W9TA 4N9DA 2YGYA 4N6EA 3CIWA 5BMWA 1H7XA 1GTHA 2E09A 3CWNA 1MO0A 1H7OA 2QJIA 3RK8A 1O94A 3F4WA 2Y7DA 4O1BA 2C0AA 4O4VA 2CLOA 1OYBA 3WJSA 5G5IA 1F6PA 2YFNA 2ZYFA 3HGSA 4CCEA 1B3OA 5AC6A 4IMGA 4R7JA 3GDLA 3B06A 5LGXA 4O1CA 4IWWA 4QNEA 4UTWC 2QCEA 4WD0A 1KA9F 3TXVA 1UUOA 4AAJA 1ZNNA 3PUEA 2WV8A 5DCEA 1WXJA 5LNUA 3PB2A 3QQ0A 1FDYA 5HWNA 1AW1A 2J6XA 3S5ZA 4JR5A 4JGDA 4OQVA 2Y6ZA 3LDVA 4DBDA 3UWUA 1KFCA 1KM3A 4IXHA 3PG8A 2OZ0A 4S2CA 3W7GA 3LCWA 1OHLA 3KHJA 1H60A 1OFQA 3G3DA 3G1HA 1MEIA 4RV8A 1TJRA 1W1ZA 2QR6A 3LLDA 4EVZA 2DP3A 1LCOA 1LM1A 2Y89A 3S6DA 3R8RA 4BWLA 3BW3A 4IMEA 1W5MA 1M6JA 4JY8A 4K7YA 3NM1A 1Z44A 4QM1A 3ABRA 3CEPA 3NGJA 3BLEA 5AYYA 4QAIA 4WXZA 4XWUA 3OVPA 2YYTA 2EF9A 4JTFA 5TQLA 1QOQA 1V5XA 3C0JA 4L4MA 1B4EA 3BG5A 4FNRA 5K4XA 1ZAIA 3IIPA 3NZRA 3PAJA 3W7OA 1KV5A 4AB4A 2ZRZA 5T26A 1OFRA 1YDVA 2DZTA 1LOSA 4K39A 1TTJA 1XDMA 2X2GA 1YXDA 5AYZA 3TIMA 4A22A 2W6RA 1W56A 1XI3A 1QMLA 5EL1A 3M1ZA 4WZHA 1FCQA 3O8AA 2Y85A 1S3HA 1SW0A 3BG9A 3C4UA 3Q37A 4I9AA 3IIVA 3QMSA 5DCDA 1OK6A 5AYXA 3S8HA 4ZZ9A 6ALDA 1QDSA 1FWRA 3GYEA 1VLIA 3R2GA 4MJZA 3G1AA 1HO1A 3LV6A 4K6AA 1XBYA 3W84A 1KM5A 3P62A 2WPBA 1OJXA 5CZTA 2A7PA 3VKJA 4JX6A 4JTKA 4AVFA 1KM1A 1TMHA 4O13A 1TTQA 3UWVA 1FQ0A 4O15A 4WY0B 1GQNA 2V81A 5BOOA 1Q6LA 1ICQA 3TW6A 1KBJA 1F7BA 1TPWA 5F2IA 4M6QA 3E49A 3GIYA 4MVAA 3T4CA 1OK4A 4UMBA 3GR8A 3N9RA 1H5YA 3FYOA 3GDRA 4QITA 4O4WA 1W3NA 3BARA 3QH2A 1JQVA 3CB8A 5LGZA 5EMUA 1MSSA 2JKAA 3ZWTA 5BNKA 3EXTA 4AWSA 3MO7A 4RKAA 5HUOA 3TUUA 2A0NA 3TE9A 1O95A 2PRMA 3N9SA 3W7IA 2FFCA 3PR2A 3ZFHA 3RMJA 1CX9A 3YPIA 1GVRA 4JN6A 3IIOA 2E6AA 3EX3A 2HTMA 2QJGA 3WJXA 4HNTA 1F05A 2E1DA 5J5DA 1W0MA 2I9EA 3W1MA 3EWZA 2NV1A 2O7QA 3F1QA 1KV8A 2YDAA 3LCIA 3S5YA 4EF8A 1B57A 4MLRA 1I2OA 3G0XA 1FUYA 2YW3A 1VYSX 5DY3A 2CZ5A 2OJPA 3GZ3A 4OT7A 1D9EA 3W9ZA 1JCNA 4KWWA 4Q33A 5LNRA 5LHEA 1JR1A 3QRHA 2C15A 3KVJA 2Z0IA 3FS2A 1L6YA 4UTWA 1HUVA 4Z1BA 1ZAJA 3JS3A 1W5QA 3BK0A 4DXVA 2WKJA 5F4SA 2D73A 3M0ZA 4RXFA 1EP3A 4AMAA 2PC4A 4C1KA 3ABSA 2JKPA 3LOTA 3EWYA 4UNKA 2QDGA 5I3HA 1N55A 4EOUA 1QR7A 4LY8A 4PTNA 4RJEA 1HO4A 3HPZA 3TFXA 2ZQ0A 3HJZA 7TIMA 3S1VA 4A3UA 3L67A 1FWSA 4UC5A 3UNDA 1ICSA 3NQAA 1OVDA 4O11A 5LNVA 2FPYA 2DORA 3O16A 3IVTA 3W7PA 1XKYA 2DZWA 3F03K 1JCYA 1Q6QA 2NXHA 3N14A 2Z6IA 4RXGA 3O06A 4JDYA 4CCDA 4JTJA 1PHQA 2ZRXA 3I6RA 3EX4A 1OFPA 1SZNA 4E38A 4UFKA 4NNCA 2WQPA 3PC0A 3UWWA 4IUOA 3PUOA 1SSDA 1KBIA 4GNJA 4WOQA 2NWRA 1U83A 4IMFA 4K8EA 3PSWA 3GXTA 3M9YA 1A53A 1SO5A 4LWWA 2E6FA 4UCGA 2GJLA 4MOZA 4JICA 1ICPA 3P74A 3N34A 3S5OA 2DZUA 4JTHA 3CLMA 1U5JA 3C6CA 3UZ5A 1TPC1 1X1ZA 4LVGA 2FPVA 5CPLA 5DBUA 4FHAA 2QCNA 1F73A 4Q4KA 4NJKA 3L0GA 2X1SA 2E5DA 4UMCA 1ML1A 1DBTA 3L2IA 2V5BA 3N3MA 2RH9A 5I3KA 3W87A 2WO5A 3W88A 1G6CA 1DOSA 2C16A 5IM51 5CPMA 4QQ3A 1JQXA 3LXAA 1A50A 4IOTA 4NJHA 4Z08A 4FNSA 3GDTA 3JRKA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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