3ELFA

Structural characterization of tetrameric mycobacterium tuberculosis fructose 1,6-bisphosphate aldolase - substrate binding and catalysis mechanism of a class iia bacterial aldolase
Total Genus 132
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
132
sequence length
345
structure length
332
Chain Sequence
PIATPEVYAEMLGQAKQNSYAFPAINCTSSETVNAAIKGFADAGSDGIIQFSTGGAEFGSGLGVKDMVTGAVALAEFTHVIAAKYPVNVALHTDHCPKDKLDSYVRPLLAISAQRVSKGGNPLFQSHMWDGSAVPIDENLAIAQELLKAAAAAKIILEIEIGVVGGYTSPEDFEKTIEALGAGEHGKYLLAATFGNVHGVYKPGNVKLRPDILAQGQQVAAAKLGLPADAKPFDFVFHGGSGSLKSEIEEALRYGVVKMNVDTDTQYAFTRPIAGHMFTNYDGVLKVDGEVGVKKVYDPRSYLKKAEASMSQRVVQACNDLHCAGKSLTHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Fructose-bisphosphate aldolase
publication title Structural basis for catalysis of a tetrameric class IIa fructose 1,6-bisphosphate aldolase from Mycobacterium tuberculosis
pubmed doi rcsb
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 132
structure length 332
sequence length 345
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2008-09-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01116 F_bP_aldolase Fructose-bisphosphate aldolase class-II
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3elfA00
2OT0A 2VFFA 1CW2A 3L67A 1OK6A 1WV2A 3TQ0A 1O60A 1OJXA 5CPOA 1ICPA 3L9CA 2DZPA 4JDBA 3STFA 3WK3A 3W7PA 2CLEA 2B7NA 1M7PA 2ZTKA 2C3ZA 3UPWA 4WJEA 3M5ZA 3R2GA 4XTDA 3C2OA 4EIVA 3W1AA 2QJIA 4IWWA 1WOAA 3TCEA 3LV6A 4NJHA 4RCXA 1U83A 3W1NA 3CB8A 4O0KA 5AHNA 4BI7A 3G3DA 5HUOA 1NVMA 1VGAA 4BWLA 4NJGA 2WSRA 1R30A 4O10A 1YXCA 5BMXA 1DL3A 4AEOA 3L5LA 3DZ1A 4QAIA 4CCDA 4XWUA 4O1AA 4AB4A 3IGSA 1T8XA 1SW0A 1BKSA 1SO5A 5C6MA 3B0VC 3MJYA 4DXVA 2C16A 5AHMA 1W5QA 1YDOA 4MFDA 3M43A 1YTEA 2C15A 4RZ4A 4ORMA 1AW5A 3CT7A 3BPWA 4JY8A 3GDMA 2ZQ0A 1MZHA 3EB2A 1L6SA 2GUUA 5HNRA 1VHNA 3PBWA 1KFKA 1FDYA 2CLLA 5KSWA 4J9JA 3NL6A 4KKXA 1TV5A 3RFAA 1QWGA 2C19A 1R47A 1K7EA 2RFGA 2NXIA 3RLUA 2P10A 2FB3A 1DJQA 3G0XA 1GWJA 3NQCA 1F7BA 3MHFA 3EWWA 3M5XA 4TO8A 3FJ6A 1JVNA 4IOTA 2ZZ5A 3W72A 1XXXA 1TTQA 1FWWA 1SSDA 1THFD 3Q58A 2A2IA 1VLWA 2RDWA 3AO0A 1L9WA 4IMEA 5AYZA 2JKAA 2H90A 3ABRA 3VE7A 5E1QA 1WA3A 1LRTA 5F2LA 2ZFAA 3A5FA 3B03A 3NDOA 4I7VA 2EPHA 3WJXA 4BI6A 3WJYA 2ATSA 3EX6A 2H3DA 1K03A 3PVFA 4NNCA 1UUOA 5CZ0A 2VFHA 4S1FA 1D9EA 1JCLA 3QQ0A 1ME9A 1N8FA 4UFIA 3NM3A 3TSBA 4DPQA 3SGZA 4LVBA 4JN6A 3P7YA 4HNVA 3HQ1A 2QCGA 3RU6A 3MI6A 5AYXA 3F4WA 5DN1A 1R2SA 3MBDA 3Q94A 4K39A 5FEZA 4QM1A 5EKYA 1TPWA 3S6DA 2A85A 3NM1A 4LNYA 1BEUA 2Y85A 1GG1A 3O16A 1MEHA 1GVOA 1W37A 4L4LA 5C55A 3SJ3A 3W84A 3CIWA 4JR5A 1GG0A 2A7PA 3W1UA 5FEXA 4CCCA 4O1CA 1P0KA 1A53A 4G1KA 4JTJA 1VRDA 3TROA 3KVJA 4WOQA 1T0OA 3PS7A 2GJLA 3G22A 3W7NA 1L6WA 1IXPA 3QQ1A 2H8XA 1QOQA 3G1VA 4HNUA 4RJEA 1SW7A 3CHVA 3FJLA 3T78A 1LZOA 2ZZ7A 1KM2A 5G2IA 3TR2A 4JYFA 1QO5A 4M5PA 1HL2A 4WUIA 4WQ6A 4JS3A 2RH9A 3HGSA 4UTTC 3G8RA 3W7QA 1G7VA 3TAKA 4HPJA 5HULA 4MY1A 3TU9A 5D30A 1OFBA 1PCKA 5D2WA 2R8WA 1LBMA 3JS3A 3A9IA 4MZYA 3EXTA 3THQA 3W1XA 2TRSA 1TTPA 3K30A 1W0MA 1Q6LA 8TIMA 3A23A 4JTEA 1G4TA 3MUXA 2QUTA 2JGYA 5F2IA 1SQ7A 3QH2A 3UWYA 2CWNA 4XKYB 5FF0A 3G1SA 3LHZA 4Z0JA 3KRUA 3THAA 4N6EA 3O07A 2ZBTA 3L21A 4PL2A 4IMFA 4LV9A 4NNAA 2WO5A 1AMKA 4C1LA 1KLZA 4GUIA 4X9SA 4MZ1A 2BWGA 1SZFA 5D38A 1QFEA 4AMAA 3FYOA 5LGXA 5EY5A 2ZZ2A 3LB0A 5IBXA 1F74A 1GPWA 1JUEA 3NQMA 3UYCA 2V2CA 3MW7A 5EL1A 1VR6A 3F03K 3CEPA 3PBUA 2ZCGA 4JNMA 4UTWA 4ML9A 4Z1AA 4TX9A 4JYEA 1FY6A 2VXNA 1XKYA 2BLEA 4NNBA 3S5NA 1UASA 3DBPA 3OEXA 1VJIA 1WQ5A 3G1XA 2P1FA 4FXRA 3SY5A 2Y7DA 5D2XA 4UXDA 3W83A 3MWAA 2ZRUA 2ZRVA 4LUIA 3MI3A 4LRSA 4PA8A 4TMBA 5CZSA 1WBJA 3NZRA 5TIMA 3NXFA 4LU0A 2VFDA 4JTTA 3IEBA 2Z2UA 4LC8A 2O7QA 3SGUA 3BLIA 1KTCA 4MYAA 3UD6A 4LWWA 4YCPA 3NL2A 3P80A 4O53A 4K7YA 4RXGA 5U4NA 1QNVA 3O06A 2QCDB 3W7MA 1KM5A 2ATMA 3LHYA 5DXYA 2GVGA 3NR0A 4CCEA 2CU0A 1K8YA 3KOFA 2NV2A 5F4SA 1W1ZA 1VYRA 1Z48A 1KFJA 4K8HA 3B0PA 4M7TA 2E77A 4LS2A 3GNNA 2OCZA 2R14A 5C5YA 3G18A 3C8FA 4N2YA 3ATYA 3W2NA 4RLIA 2J6XA 4O16A 4KWVA 5AHLA 1LLWA 1UJPA 3BK0A 1C8VA 2NX1A 1PCWA 4M6VA 4GFSA 1GEQA 2VEPA 1W3IA 3C3NA 1G4EA 4IXHA 2PRLA 3NQGA 2B4GA 2PURA 3NAVA 4JDYA 1HUVA 1FWRA 3N19B 4DBEA 2YR1A 4O19A 5LZLA 4XBKA 4PFMA 4OBTA 3GIYA 2NXGA 1Q6QA 5CGQA 1H50A 1G4PA 1Q3NA 1F5ZA 1DVJA 1SO6A 4R7JA 5H91A 3TFXA 5K7JA 4UTMA 2ZRZA 4M6QA 2CLIA 1GTEA 4IQLA 3W7EA 3DFPA 2E6YA 3FLUA 3UXDA 3HG5A 1WDWA 1VYSX 2GQAA 3LRKA 3RMJA 1C9DA 3FKKA 4K7VA 1FQ0A 2WOQA 2E6DA 3BW2A 3NG3A 3PG9A 4HSOA 3I7RA 1TTIA 3UY7A 1LBLA 1K3UA 1LRQA 2QJGA 4A3UA 3ELFA 1DQXA 4UCGA 1B4EA 3NL5A 2CLMA 5LHFA 3I65A 3L0NA 1TTJA 5I3KA 3ABOA 3IRDA 3JR2A 4FNSA 4IMCA 2WV8A 3G1DA 5G1TA 1FCBA 1YDNA 4OHQA 2DZSA 4ORIA 4UFJA 2QF7A 2GVLA 5SWUA 2QCCA 4MJZA 1OF8A 4BFAA 2EAWA 4CNPA 3L66A 2DJXA 4IPIA 4UFKA 4DO4A 1AW2A 4LTSA 3QSTA 4A21A 4GBUA 4LS1A 5F1VA 1LOSA 1R46A 4EWND 1F76A 2GJNA 1GVFA 3B04A 3M1ZA 2WKJA 1TPFA 3TV8A 1NEYA 3S1UA 1XBZA 2FPVA 1IIGA 1TQJA 3V1PA 2P0OA 2I14A 3RF9A 5EA9A 5I3IA 3PF3A 1O94A 1KM1A 3B05A 4PL1A 3FS2A 3SIZA 3G0UA 2YSWA 2WNZA 1V5XA 2QUUA 1H1YA 3CTLA 4HPXA 4IPJA 3BGGA 5AC8A 4O52A 5HR6A 4DF0A 3HIJA 5LNSA 3TAOA 3BG3A 3LHWA 1CX9A 2V30A 3STCA 3LGEA 2B7PA 4M6PA 3NQEA 3W1TA 5FF2A 3SI9A 2ZTJA 3R8RA 3N34A 1DQWA 2I9EA 1KM6A 4C1KA 5F4WA 3IGUA 4ZQNA 1KV8A 1QPRA 4ZQMA 5FF3A 3LTPA 2FDSA 5GVJA 3PG8A 1ME8A 4NZJA 1O5XA 4O11A 1BWKA 1XI3A 4U4MA 3LTSA 2VFEA 3GXNA 1I2QA 3F1QA 3P8JA 4NXSA 2F7FA 2CZFA 3MHGA 2VOMA 5KZDA 3HPZA 1H62A 1WAUA 4RZ6A 4Z0SA 3KFTA 2V2DA 3LCWA 3OHIA 4CLMA 1Q45A 4ALDA 1MXSA 3NQ8A 1FCVA 2QEZA 1E51A 3DFSA 3QMSA 3QRHA 5HWMA 4WY0A 1H7RA 3S5ZA 1W5OA 4ZQRA 3CWOX 3TX9A 1SFLA 3WJZA 2JK2A 2CZEA 4LV4A 3GDRA 2DZVA 3W7RA 4CNNA 1WYIA 4GNJA 2Y63A 1U5JA 5FF4A 1P0NA 4HHPA 5J5DA 3W07A 3EWBX 5C2XA 1G67A 1G7UA 5D37A 3DI0A 1TPB1 1W5NA 4NXKA 4DF1A 4IMGA 3HO8A 3LV5A 5D33A 4DELA 5K3VA 4DBDA 4UNKA 4Y6GA 1LP6A 1TPDA 4H3DA 3NQDA 3PUEA 1S5WA 4UR7A 2PCQA 1I45A 4IMDA 1JUBA 6TIMA 2A6LA 3LHTA 3BLEA 4OT7A 1Z42A 5HUPA 3TW7A 1OHLA 1V7YA 1FDJA 3M44A 2QCLA 4B5NA 1IXOA 2JKPA 3LERA 2BX7A 4UTJA 4YXGA 3PM6A 4FEZA 1H60A 1TO3A 3C2VA 3SSJA 1YXYA 3WK1A 3PSVA 1MEWA 3I7SA 3PUOA 3W2KA 1ME7A 1KFCA 5CG7A 2KZHA 5I3JA 2YX0A 1S3HA 2YPIA 4RR4A 2G5WA 2C13A 1VHCA 2DZUA 3W6YA 3NEVA 4EF9A 4R34A 1YPFA 3RLVA 1ZY9A 2QJHA 4LC6A 4O28A 3TH6A 3KHJA 5AC7A 3T7VA 2XN0A 4RXFA 4LVDA 2J24A 4P2VA 1SPQA 4FF7A 4MJMA 3P5YA 2QR6A 3P82A 3IVUA 4LT9A 2TSYA 4LVAA 1B4KA 4MLRA 5G4EA 4CNOA 3UQNA 4I9AA 3W2UA 1W3TA 2QAFA 3S42A 3W1RA 1X6UA 3HB9A 4FX7A 4GWEA 2E6FA 5CKSA 1EA0A 3CC1A 4O54A 4QNWA 1UCWA 3TJXA 4GE8A 4R53A 1VQTA 4AWSA 3HGRA 4JGDA 4NJJA 3W71A 1OX4B 3DFNA 1N7KA 1PE1A 4IXXA 2WQPA 3M7WA 2E5BA 3VCRA 3DENA 3M0ZA 1VZWA 2V82A 3QPYA 3FOKA 1B9BA 4FIQA 4JTLA 4KFOA 4KFNA 3R13A 1HFBA 3PC0A 1X7FA 4QJ1A 2NUWA 4AF0A 3TDFA 1TJPA 4CQAA 2EHHA 2ABAA 4WY0F 3KRSA 3A22A 2C1HA 1A5AA 2ZRWA 1IF2A 1T96A 3O6DA 2EF9A 4YMZA 1XBXA 5LNUA 1PV8A 3M41A 5DBUA 1FXPA 3FFSA 1JCMP 3IVSA 4NVTA 1KFEA 3FKRA 4O15A 3KVKA 1OVDA 4K8EA 3INPA 1EEPA 3OA3A 3LCHA 2YFOA 2WSYA 3P61A 4O13A 2QKFA 4NX5A 3KVLA 4O50A 1LTDA 1ZFJA 1I2NA 4YL2A 4N4PA 3A5VA 1OK4A 4UTIA 4O14A 4E38A 4LUJA 1FWTA 1WX0A 3YPIA 2B0MA 4DO6A 5KZMA 5IBXC 3TSDA 3N14A 4IUOA 3GXTA 4S2BA 1FCQA 3LXBA 1MSSA 4ICNA 3TC7A 4RZ5A 3S8HA 3QM3A 1X1OA 4ADTA 4Z1CA 5L6UA 2A7RA 2NZLA 4UTWC 2V81A 3M16A 1XDMA 3ABSA 4GC4A 2B7OA 3ABQA 1LROA 2VELA 2WPBA 3HPSA 4JTHA 3W7HA 3PBYA 3ATZA 1LBFA 2DZWA 3DGRA 3W70A 4E0CA 2RDUA 4JIPA 4D2JA 4GRSA 2GVJA 1H63A 4EOUA 2CLHA 2X1UA 2TPSA 3W88A 3G1FA 3EX4A 4CQ8A 3EX2A 1H61A 2JGQA 4AAJA 4JTKA 4AH7A 2XN1A 4N6FA 5D03A 2QCNA 4FIRA 3MMTA 4RK8A 2CLOA 1Z44A 3W7CA 3S5OA 2C0AA 1JULA 3W2LA 3OVPA 4DEFA 1F6KA 2J9XA 1TJRA 1H7NA 1A50A 2V0TA 3W86A 5KTLA 2H3BA 3FEMA 4X2RA 1A5CA 4UTTA 4NZFA 5DBTA 4HT3A 1F73A 3LLDA 3STGA 4O57A 1VCGA 2A5HA 3L2IA 4JD4A 3VNDA 4QITA 3D0CA 2FJKA 1XBVA 3OG3A 3QF0A 3GDTA 3GB6A 3UPBA 3WK0A 1W3NA 2H8ZA 2X30A 1ZCOA 1K7XA 1LOQA 7TIMA 1SO3A 5DCBA 1NFBA 4PODA 1NSJA 3A21A 1Q6RA 3MBFA 3T4CA 5G5IA 1RD5A 1O4UA 4FX8A 2Y70A 3QZEA 2Y88A 5DLCA 5I3FA 1EIXA 5D04C 1L2UA 1EWEA 1F05A 3LOTA 4IX2A 4K36A 1RPXA 5DXXA 3DAQA 1RQBA 1SZGA 2QCFA 5LHEA 4LRTA 5CPMA 1I4NA 1EX5A 3BW3A 3GLCA 4AVFA 2QCEA 3O6CA 1FDZA 3GAKA 1TREA 3TUUA 4LVGA 1OYCA 3O63A 4WX2A 4O1BA 3G1HA 3HG2A 2VEIA 3EWUA 2GQ9A 3P67A 1EUAA 1AK5A 2ZYFA 2ZA2A 2G97A 3EKLA 4NU7A 5F1UA 3P62A 4WOZA 1DHPA 4MFEA 1QCWA 3GXPA 4Y9AA 2CW6A 3JRKA 3PSWA 2VENA 1Z41A 2X1RA 3HPXA 4AHOA 1TV7A 4TR9A 3VKJA 3O15A 4GUJA 1HO1A 4OQVA 3I68A 1J4EA 1DKWA 1QAPA 5EBUA 1OG0A 1D3HA 3QSRA 3W1QA 3U8GA 4PH6A 4K6AA 3LCXA 1KLYA 3BV4A 5U7SA 1S5TA 4O12A 5IM51 3OVQA 2LLEA 3F4NA 3KRZA 3L5AA 3W2JA 1ALDA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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