3F4VA

Semi-active e176q mutant of rice bglu1, a plant exoglucanase/beta-glucosidase
Total Genus 199
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
199
sequence length
472
structure length
472
Chain Sequence
NWLGGLSRAAFPKRFVFGTVTSAYQVEGMAASGGRGPSIWDAFAHTPGNVAGNQNGDVATDQYHRYKEDVNLMKSLNFDAYRFSISWSRIFPDGEGRVNQEGVAYYNNLINYLLQKGITPYVNLYHYDLPLALEKKYGGWLNAKMADLFTEYADFCFKTFGNRVKHWFTFNQPRIVALLGYDQGTNPPKRCTKCAAGGNSATEPYIVAHNFLLSHAAAVARYRTKYQAAQQGKVGIVLDFNWYEALSNSTEDQAAAQRARDFHIGWYLDPLINGHYPQIMQDLVKDRLPKFTPEQARLVKGSADYIGINQYTASYMKGQQLMQQTPTSYSADWQVTYVFAKNGKPIGPQANSNWLYIVPWGMYGCVNYIKQKYGNPTVVITENGMDQPANLSRDQYLRDTTRVHFYRSYLTQLKKAIDEGANVAGYFAWSLLDNFEWLSGYTSKFGIVYVDFNTLERHPKASAYWFRDMLKH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Beta-glucosidase
publication title The structural basis of oligosaccharide binding by rice BGlu1 beta-glucosidase
pubmed doi rcsb
source organism Oryza sativa japonica group
total genus 199
structure length 472
sequence length 472
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 2008-11-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3f4vA00
3VKKA 3BMVA 1KB3A 1NOWA 3N11A 1KR0A 4CCCA 1J0HA 3OLGA 1J10A 2PWFA 5M17A 1AQ0A 2QF8A 1B3ZA 2YBTA 4UOJA 4CN4A 4PTWA 2XUCA 3W28A 2W67A 4GZJA 4UR9A 2DDXA 5FL1A 1LJYA 2VR5A 1GUVA 1W9PA 3VD5A 9CGTA 4UQBA 4PCTA 3GBEA 2WKLA 3S6TA 1E43A 3KEHA 3GH7A 1JDCA 4JFTA 1VFMA 6TAAA 3POHA 4NRSA 1FH7A 1UH2A 5DT7A 4JHZA 1B3XA 2FGZA 3UETA 3UR7A 3WQWA 3LPGA 3SCNA 4UOZA 1WCGA 4JKKA 1WZLA 1U30A 4PTXA 1DWAM 3VTRA 3BCFA 5E70A 1E55A 5ECUA 2VMFA 4HTYA 4UTFA 2ZOXA 7CGTA 2VRQA 1XSJA 5E0CA 5AYIA 1E5JA 3BAXA 3QHMA 3BXWA 3U5YA 3CUFA 2WCSA 2Z1KA 5D9OA 4OZOA 2WVSA 1EO7A 1UH3A 1M04A 3CHFA 5FOOA 3WQ6A 4WIWA 4B9YA 2WMFA 1JZ6A 1C92A 2O9RA 1UWUA 1C93A 3W29A 3CLWA 3GNRA 3AZRA 1UHVA 4P7OA 1QI0A 1E0XA 1WKYA 1PIGA 3OA5A 3M46A 1BFNA 1GOIA 1V3HA 1QI2A 2A3HA 3CH9A 3CZGA 1CXEA 1E4MM 1JI2A 1GVYA 1EDGA 1UR0A 1Q6GA 2X8RA 1EHNA 1V3LA 2J78A 1NQ6A 2OLHA 1L0PA 4H8HA 5I24A 2C7FA 4ZXLA 5I3DA 3VIHA 1UWIA 1HL8A 2BNJA 3BAJA 1OD8A 3ARYA 4J28A 3SIMA 1KBBA 2YA2A 1ZBKA 2C8NA 2WSKA 3PTKA 1PX3A 4PTVA 3HMCA 1HJVA 3OGVA 4KGJA 2D1ZA 4W7VA 5E6ZA 1XSKA 5AC4A 2YBUA 1QOXA 2AMGA 1HJSA 1XD0A 2X2YA 4PMYA 2UY4A 4HP5A 1W2VA 4BZYA 3AJ7A 2VQUA 3AIQA 2XWDA 1JFHA 4AW7A 2BVYA 2D24A 3AZSA 1BLIA 2BFGA 3IJ9A 3DYMA 4V27A 1CECA 1R8LA 2WMIB 1UZ4A 3VIJA 2CKSA 4S3KA 4HMCA 4GIAA 1ISXA 2TAAA 3CZLA 4D72A 1UWQA 1DWGM 4AY1A 2WSPA 4ATDA 4N42A 2G41A 4R5EA 1KGXA 1OCQA 1NOUA 2X1IA 3EMZA 3JUGA 4M8UA 3T09A 1E4NA 1MYRA 4EKJA 3CUIA 1JD9A 2CBUA 1E1FA 5A2CA 1M7XA 3ARZA 1ODZA 1CNVA 4Z2IA 4B3KA 4CN1A 2ZWYA 1QHZA 3OGRA 2OWCA 3WD4A 1JF6A 7TAAA 2EPKX 4J3TA 3K4AA 2E0PA 1BTCA 4PRWA 2GJXA 4JL1A 4QCEA 1W1PA 2D3NA 1HX0A 1ZBWA 2CKRA 3GM8A 3LPFA 1ITCA 4PMUA 3VGFA 4GI9A 3GTNA 3VIFA 5I23A 3WEMA 2GVYA 3D5HA 4P8UA 2Y8VA 3KL0A 2BVDA 1UKPA 2EEXA 1JI1A 3MMUA 3HN3A 1JYXA 5A6AA 3SUSA 1GPFA 2Y8KA 3TONA 2VTFA 1JXKA 1MW2A 1XYFA 1EOMA 1XCWA 3QOMA 1ZB5A 1H0IA 1V0MA 1J0KA 1KWGA 2J8GA 3UESA 4WLCA 5EBAA 1KFWA 3AXIA 3CUJA 4WKFA 1HNYA 2J7CA 1VBUA 3WDJA 3DC0A 1BPLB 1JF5A 1E6SM 5A8PA 4D6HA 2WBGA 2WVUA 2CIPA 3FW6A 3S2CA 3VDBA 3ZQ9A 3CMGA 3ALGA 3NSXA 1DP0A 3I3EA 2GJRA 2VX4A 3SCQA 3WNPA 3W53A 1XH0A 3GNOA 3BH4A 4LQ1A 4ZE4A 3VX1A 5I78A 5CLWA 3M07A 2EXOA 2W66A 4UZSA 1WNOA 3BAYA 4D6CA 1EDTA 2PWHA 3CHCA 4H7VA 4B9ZA 1EO5A 3PZ9A 1B3WA 3PZQA 4LX4A 4AD5A 2C0HA 4C7GA 3RM4A 2E8ZA 3GXFA 5A1AA 2WVVA 3WUGA 2VL4A 3F5JA 1DWHM 2WWDA 3MU7A 1NARA 1VEMA 4W86A 1HVXA 3AMDA 4CVUA 4Q7NA 3DHPA 1IZJA 3VD9A 2OSXA 2V5CA 1EHAA 1KXHA 2OYKA 3WQVA 4ZE5A 3SUVA 1UA3A 2GJPA 3O9NA 1FOBA 1OGGA 1JFXA 1QNPA 1W9DM 2J79A 4GO8A 4YN5A 1HKIA 4LYPA 3U5UA 2BY3A 3WENA 3MUAA 1ESWA 1PZ3A 3GDBA 4GI6A 2OYLA 1HVQA 1I75A 4W85A 1E3ZA 2ZX5A 1FP9A 4CGTA 1JGIA 4H2CA 1W9VA 1HJUA 1FFRA 1E6NA 2UY5A 4IUGA 3MV01 4KGLA 3VGHA 1ZS2A 3ZT7A 2J7EA 4ACZA 5FIPA 2OWWA 2WMHA 1E73M 3VM7A 1OWQA 2BXYA 3WMBA 1C8XA 1W3LA 3VUPA 3DECA 5BCAA 3OB8A 2JEPA 2VURA 1D7FA 4B15A 2DSWA 1CXLA 5EMYA 3VDCA 4AXNA 1TVPA 1ZJBA 1UG6A 5E09A 3U7BA 3WIJA 1JZ2A 3II1A 2J8FA 3WDHA 3PBGA 1NWTA 2ZUTA 1CXIA 1PBGA 2VUYA 4JAWA 1JNDA 1RPKA 3KL3A 4MDPA 3VIGA 1JDAA 1MXDA 1BG9A 4FLSA 2ZE0A 1JZ5A 4M56A 4Q22A 3VNZA 3L4XA 1I1XA 1QHOA 2DQXA 2EPMX 1O7AA 2CETA 3AYRA 5EFFA 2XGBA 2WMIA 5A6KA 3WBAA 1RP9A 3T2PA 1UKQA 1J0ZA 1V6XA 4ZEPA 3T2OA 4H8UA 2RGMA 4P7NA 4EAMA 4U5KA 1HT6A 3ZJ8A 4D6JA 2VCAA 2WHJA 2VZVA 3A4WA 1EXPA 4DWSB 1UA7A 2VO5A 4WJXA 5JBEA 1E40A 2XPKA 1GNXA 1TMQA 1B90A 3WUBA 2OSWA 3T08A 3K4DA 4P7LA 2XSAA 2CPUA 4W7WA 4AZCB 2PB1A 3WKZA 1K9TA 1EH9A 3RJXA 1V02A 1CWYA 1VEPA 2DT2A 3TTQA 3K1DA 3FAXA 4WSJA 2DH3A 1GOOA 2EPNA 2YDSA 2D3LA 4B3LA 1U33A 2WMGA 5A6LA 3UR8A 1HP4A 2W61A 4P8VA 2VZOA 4YPJA 2O9PA 2BY0A 1FHDA 1UR9A 1LLOA 1GOMA 3PZIA 2YL8A 1MW0A 2ZIDA 4JL2A 4AZHA 1JDDA 3QGVA 4IISA 3TTOA 2W4XA 3A47A 4TTUA 5JIPA 3PZUA 2VX6A 4W8AA 4DM2A 3W26A 4OOZA 1RH9A 1WPCA 3WD1A 1QNOA 1DHKA 1MWOA 3QHNA 4AZ5A 2DSVA 2VRKA 3AS1A 3VDHA 3WQ4A 4DUVA 4C7FA 4AZGA 2VCCA 1WE5A 3MO4A 1K9DA 2WLYA 3WF1A 1IZKA 4V28A 4H41A 5A94A 5KEZA 2WW5A 1W9UA 4OBRA 2XVKA 4U2YA 1KBKA 1UYQA 4U3CA 8A3HA 5E9AA 3AIRA 4F9DA 3L4TA 5HPOA 5BYWA 1CDGA 1OT2A 1US2A 3WN6A 4KWUA 1B3YA 3RILA 2IXVA 2PBOA 1FFQA 1RD6A 3BAKA 1E6ZA 5IXEA 1XC6A 4OJYA 4LYQA 3VNYA 3VIIA 4JKLA 3QR3A 1C8QA 5CSYA 2BS9A 4W88A 1M01A 1G01A 2D23A 1BVNP 1XCXA 2V3EA 4URIA 4RE2A 1FH9A 4F79A 3ZSSA 2WMJA 4KH2A 1NOFA 3AS2A 1MVYA 2GDVA 2D0GA 4CCEA 5C8BB 3WSUA 4DWSC 1UKTA 5DT5A 2E9BA 3PTQA 4AWEA 2E4TA 4U5IA 3AMGA 1XGZA 1W32A 1M03A 1J01A 3ARTA 2FGLA 2VZTA 5CGTA 2FHFA 3PZTA 1JIBA 2BHUA 3N15A 1LG1A 3NSMA 5A2AA 4CD5A 1BYCA 1J9YA 1UWRA 2J7GA 3F5LA 4H04A 3TTSA 1Q6CA 3OBAA 4PMQA 1JZ8A 1XD1A 3AMLA 3APGA 2WXDM 3I3DA 3W81A 1E6QM 2ZUUA 3ZJKA 2XM1A 2ZXAA 3RM8A 2JIWA 2YA0A 2WPGA 2PF0A 1H41A 1NH6A 4EK7A 4WSKA 3K8KA 1ZL1A 5CXPA 2J47A 3L4VA 2G3JA 1E3XA 3SCUA 5A6BA 1G9HA 3AHVA 5BXSA 4P8WA 4U2ZA 2YL5A 3W24A 3SCOA 3F4VA 4ZFMA 4MB1A 4FLRA 4AD0A 2J74A 2WAGA 1VFUA 3WF3A 4WF7A 3WNLA 4CD6A 1J11A 3AXXA 1E15A 3KL5A 4KRTA 3GXDA 3L4ZA 2ZUNA 4FF5A 2WC7A 1Q6EA 4W5UA 3SUTA 1FA2A 1HKMA 1DWIM 3M6DA 3WDRA 3GXIA 1V08A 3E1F1 3BC9A 2GUYA 4X9YA 3UG5A 2WYSA 2Y2WA 5GNYA 2E9MA 1B2YA 1CLVA 2GSJA 4U3AA 2XG9A 3T0DA 3FN9A 1XRVA 3WNOA 4HZ7A 3EDFA 1QNSA 4NRRA 3WFLA 5IDIA 4AD2A 2ZX7A 5ABFA 5HNNA 3WDIA 3ZR6A 3ARWA 2F2HA 2WC4A 3WD3A 1SFSA 2XIIA 3K8LA 1LF1A 4E8DA 4F8XA 4QLKA 1US3A 4JFWA 1CEOA 3RPMA 1CGXA 4BQ2A 1WDSA 2XYLA 4DWSA 1V6UA 4NI3A 4QP0A 2VX5A 1R87A 3SCWA 1VIWA 4R27A 5A2BA 1VFFA 2PWDA 1ISVA 1NWSA 3OZOA 5M3WA 1R85A 4PN2A 3MV11 2XM2A 1ISWA 4AZIA 4W93A 1HF6A 3NDZA 3UG3A 2CERA 5KZ6A 3A3HA 3WNKA 2XFFA 3FAWA 2ZXDA 4HOWA 1QI4A 2HVMA 3D3AA 3AHXA 1VEOA 3UEQA 4M1RA 4JFSA 1V0NA 5AYBA 5A6SA 4W5ZA 4Z2KA 3PZMA 1ECEA 3OLEA 4QCFA 3AIUA 2F8QA 1JYVA 1EOKA 2YA1A 3W25A 3ZIZA 1HXJA 3PN8A 4XUYA 1R86A 5A6BD 4CKQA 4TVUA 3WL0A 4AIOA 3QOKA 1OSEA 4UZUA 1LWHA 3VPLA 1KXQA 4M81A 3W82A 3ZT6A 1OB0A 4TVCA 5D4YA 1AQHA 1DWJM 2DT3A 1BYDA 2V3FA 3BAIA 3PHAA 2X09A 2OYMA 5BXTA 1E0VA 3A4XA 4A3YA 4AIUA 4MJ2A 1PZ2A 1V6VA 5I5RA 3THCA 1GOWA 3PZNA 4RE4A 2ESCA 2G4FA 3VILA 3OIHA 4FK9A 1W2PA 5DO8A 1W9XA 5LA2A 3VGBA 4LYRA 2VNCA 1V6WA 3GZAA 2XVPA 3PTMA 1OIMA 1BQCA 2DH2A 2CEQA 3W27A 5DMYA 1B9ZA 3AMCA 2XFYA 1W1VA 4F9JA 1C7SA 2D22A 4DWSD 3WF2A 4S3JA 3WNNA 1KXTA 1ZBVA 2D2OA 5BXPA 2A3AA 4DM1A 1E72M 2VCBA 3IANA 2NW0A 5IFTA 3LMYA 4BQ5A 2WWCA 5DFAA 5A69A 2VR4A 5BRQA 2B31A 1LL6A 2W63A 2XVNA 1H49A 5GNXA 5LA0A 2OWXA 2QHAA 1GHSA 3WFZA 1H1NA 3BGAA 2VQTA 3EDKA 1CTNA 3WEOA 2NT0A 4TUFA 1OINA 5A8QA 4CCDA 5HBFA 2UY3A 1GOQA 3T2QA 2PWEA 4TTGA 4J3UA 4PMOA 3KWXA 1GOKA 4Z2HA 4HZ8A 4WKHA 1SR0A 5EB8A 4UOQA 2EPOA 4PUDA 3DYOA 3O2LA 4UFIA 4AEFA 4E8CA 1JYNA 3ARSA 1YQ2A 2CITA 5ABGA 1JAEA 2DSUA 4BA0A 2WZIA 3WQ5A 4AD3A 1TE1A 4ACYA 1AQMA 4KMQA 1RP8A 1WDRA 3B8SA 1UUQA 5IHRA 4AZBA 3AROA 4LXFA 2FH6A 2A3BA 2GDUA 2DGAA 4JZ5A 1N82A 4ZXOA 2ZWZA 2G8ZA 1WZAA 2BVTA 3ALFA 3RM9A 1MFUA 1X6LA 1ZJAA 2JE8A 2IXUA 4MTVA 4UFHA 2VI0A 1GHRA 3VO0A 1B0IA 2FH8A 1U2YA 2EBNA 4GKLA 3WH9A 4AD1A 7A3HA 2DSZA 2UY2A 2VZUA 2YL6A 2VT0A 1CXHA 2XFRA 2JF6A 3PZOA 4M29A 3WUEA 4IPNB 5I0DA 2PBGA 3W6MA 5E6YA 1CYGA 3L4UA 1JXJA 5A95A 3TOPA 2CHNA 3VGGA 3W38A 4JKMA 1LWJA 3TTYA 1VB9A 3MMWA 1BG4A 1MQPA 4GZIA 1V6YA 1R7OA 4UQAA 1SMAA 1QPKA 1I1WA 1DTUA 1HP5A 3VMPA 3BSHA 4TOQA 2Z1SA 1F4AA 3CZKA 1JZ4A 3MUZ1 4PSRA 3N12A 4UCFA 2XHYA 5CPSA 2WHMA 4BCEA 4MJ4A 1GJUA 3RIKA 3AYSA 1UQYA 2ZUSA 1H5VA 2DIEA 3BAWA 4AD4A 5HDRA 1HJXA 5D9PA 4NF7A 1V3KA 5IHSA 3U7VA 1E6XM 1LL7A 1G5AA 1CIUA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3VKK A;  3BMV A;  1KB3 A;  1NOW A;  3N11 A;  1KR0 A;  4CCC A;  1J0H A;  3OLG A;  1J10 A;  2PWF A;  5M17 A;  1AQ0 A;  2QF8 A;  1B3Z A;  2YBT A;  4UOJ A;  4CN4 A;  4PTW A;  2XUC A;  3W28 A;  2W67 A;  4GZJ A;  4UR9 A;  2DDX A;  5FL1 A;  1LJY A;  2VR5 A;  1GUV A;  1W9P A;  3VD5 A;  9CGT A;  4UQB A;  4PCT A;  3GBE A;  2WKL A;  3S6T A;  1E43 A;  3KEH A;  3GH7 A;  1JDC A;  4JFT A;  1VFM A;  6TAA A;  3POH A;  4NRS A;  1FH7 A;  1UH2 A;  5DT7 A;  4JHZ A;  1B3X A;  2FGZ A;  3UET A;  3UR7 A;  3WQW A;  3LPG A;  3SCN A;  4UOZ A;  1WCG A;  4JKK A;  1WZL A;  1U30 A;  4PTX A;  1DWA M;  3VTR A;  3BCF A;  5E70 A;  1E55 A;  5ECU A;  2VMF A;  4HTY A;  4UTF A;  2ZOX A;  7CGT A;  2VRQ A;  1XSJ A;  5E0C A;  5AYI A;  1E5J A;  3BAX A;  3QHM A;  3BXW A;  3U5Y A;  3CUF A;  2WCS A;  2Z1K A;  5D9O A;  4OZO A;  2WVS A;  1EO7 A;  1UH3 A;  1M04 A;  3CHF A;  5FOO A;  3WQ6 A;  4WIW A;  4B9Y A;  2WMF A;  1JZ6 A;  1C92 A;  2O9R A;  1UWU A;  1C93 A;  3W29 A;  3CLW A;  3GNR A;  3AZR A;  1UHV A;  4P7O A;  1QI0 A;  1E0X A;  1WKY A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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