3F5JA

Semi-active e176q mutant of rice bglu1, a plant exoglucanase/beta-glucosidase
Total Genus 194
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
194
sequence length
472
structure length
472
Chain Sequence
NWLGGLSRAAFPKRFVFGTVTSAYQVEGMAASGGRGPSIWDAFAHTPGNVAGNQNGDVATDQYHRYKEDVNLMKSLNFDAYRFSISWSRIFPDGEGRVNQEGVAYYNNLINYLLQKGITPYVNLYHYDLPLALEKKYGGWLNAKMADLFTEYADFCFKTFGNRVKHWFTFNQPRIVALLGYDQGTNPPKRCTKCAAGGNSATEPYIVAHNFLLSHAAAVARYRTKYQAAQQGKVGIVLDFNWYEALSNSTEDQAAAQRARDFHIGWYLDPLINGHYPQIMQDLVKDRLPKFTPEQARLVKGSADYIGINQYTASYMKGQQLMQQTPTSYSADWQVTYVFAKNGKPIGPQANSNWLYIVPWGMYGCVNYIKQKYGNPTVVITENGMDQPANLSRDQYLRDTTRVHFYRSYLTQLKKAIDEGANVAGYFAWSLLDNFEWLSGYTSKFGIVYVDFNTLERHPKASAYWFRDMLKH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Beta-glucosidase
publication title The structural basis of oligosaccharide binding by rice BGlu1 beta-glucosidase
pubmed doi rcsb
source organism Oryza sativa japonica group
total genus 194
structure length 472
sequence length 472
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 2008-11-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3f5jA00
1HKIA 3WFZA 3W29A 3VOCA 3AMKA 3GXDA 3PZVA 3NYDA 1H0IA 3VM7A 3WBEA 4J7RA 1ZB5A 1EA9C 1OT1A 3OLGA 1KQYA 3CUIA 2XG9A 3PTMA 4EAMA 4F9DA 3VU2A 1J0JA 3DHPA 1TA3B 4HZ7A 3NJ3A 5HPCA 3ALGA 2QV4A 2VVNA 5A6BA 3L4UA 1JDDA 5A8OA 2WKGA 3ZR6A 5CXPA 2DT0A 3KE0A 1QNOA 2Y8KA 1JYXA 1N82A 4OBSA 4KH2A 4Z2GA 4MTVA 5AYIA 2CESA 2WLZA 1HF6A 5BXRA 3AHYA 3ZM8A 1AQHA 3OZPA 3ZO9A 3L2LA 1JNDA 2WK2A 4FLOA 3W81A 4W89A 1UR2A 1GQJA 3WKZA 2YL8A 2ZX6A 1K6AA 2WMJA 1BYCA 3AOFA 1B30A 3VIJA 3TTYA 3VVGA 4YPJA 4CN4A 3MV11 4U33A 5ABHA 2OWWA 4E4PA 1W9PA 2WVVB 3PZOA 5A2CA 1VFOA 1JF5A 1J11A 1OGSA 4CU7A 4MB1A 3BH4A 4JKMA 1GHRA 2YA0A 4PTXA 5JIPA 1JI2A 4CKQA 3VIMA 4X0NA 4D6GA 4HP5A 1FFRA 1MYRA 1VRXA 3IAQA 4UQDA 1VAHA 5ECUA 2JEPA 1JZ5A 5ABEA 4K68A 1HJSA 2GJXB 2BHYA 3TA9A 1DTUA 1JXKA 1XH1A 4HOZA 4GI6A 3AMLA 5JUVA 4XX6A 3VM5A 4FLRA 3QR3A 4D1IA 4AYSA 2O9RA 5IFPA 4UFIA 5M3WA 2VRQA 4WKFA 4E8DA 1UD8A 1B90A 2VJXA 1V3MA 3L2MA 4NRRA 1IV8A 1B31A 1EQCA 4P8WA 2BFGA 1NQ6A 2E3ZA 2NSXA 1GNXA 2PBOA 1QOXA 2DSWA 3W25A 1SYTA 3VGHA 1UR9A 4H8VA 1PZ2A 4FK9A 3VGGA 3MKKA 1XCWA 2ZX7A 3KEHA 4GO9A 4DWSA 2XIIA 2VMFA 2PWGA 4AD0A 3SCWA 1XH2A 3GZAA 5E70A 1W1YA 4AY1A 3SCVA 1Q6GA 2C0HA 3L4VA 3K4DA 3WSUA 3SCOA 3FAWA 4JL1A 3AIEA 3AMGA 4LX4A 4TOQA 5CSYA 4WKAA 2W62A 4AZCB 3OGRA 4OJYA 3RM4A 2W63A 3A4WA 3WF3A 1C3FA 2BY2A 4PUDA 3GNPA 1NOWA 4CVUA 3RDKA 1ZBKA 2JEQA 4C7FA 3GH7A 1A47A 3MANA 1HJQA 2DIJA 1C7SA 5FL0A 1JZ3A 3PZTA 4CD6A 3CO4A 4AZIA 3BAKA 3EDDA 2ZXQA 1GUVA 2UY5A 4P8XA 2W92A 2G41A 1Q6EA 1E6XM 3B9DA 4S3KA 2BVTA 3MV01 1KR1A 2CHOA 3NCOA 1GJWA 3OIHA 2YBTA 4W87A 1LLOA 1FH7A 2XGBA 3CUFA 4GZJA 5CZKA 4Z2IA 1BGAA 1L8NA 1HKJA 3GXIA 1UHVA 1JG9A 4JFVA 2EEXA 4UR9A 4B9ZA 2W91A 4PEEA 1HP5A 1WE5A 3FHQA 5A6MA 3EBVA 1UR1A 3DC0A 1HP4A 1J0IA 2WW5A 2J7DA 4KGLA 1JD9A 2PC8A 3N12A 1CTNA 2EPLX 1R8LA 1CXKA 1ITXA 2DPEA 2G4FA 4KRTA 1BF2A 3LPPA 4RE3A 1PX4A 5FL1A 2J7BA 1ISXA 1LL6A 3VINA 5FOOA 1UKTA 3VDBA 5CLTA 1XRVA 3N1AA 4C7GA 4AIOA 1OB0A 1JZ6A 1E6NA 3UERA 1JIBA 3THDA 4TVUA 2HISA 4TXEA 2OSWA 3N13A 4AW7A 2D3NA 4MNMA 4M24A 2DT1A 3RILA 1JZ4A 3DYMA 4GI9A 4WSJA 2WMFA 2ZUVA 1JGIA 2VRKA 4A3YA 4W8BA 3MMDA 3OLEA 2FHFA 3SIMA 4H04A 3UR7A 3VD5A 2D1ZA 3T0AA 2VZSA 3AXXA 3A4AA 5A69A 3WNMA 2NT0A 3WUGA 3EMZA 1E71M 2G3MA 4JKKA 4WSKA 1V03A 2CETA 3WD0A 1JAKA 5BYWA 5CGTA 2E9BA 4AZ7A 3AIUA 4ML4A 1G5AA 2BNJA 1H5VA 1V3IA 2HVMA 3WELA 1HVXA 2CCRA 1MFUA 1WNOA 3B9EA 1BTCA 1I1WA 3D5HA 4ATDA 3VGFA 4UQEA 2XTKA 3ALFA 1TZ7A 3WBAA 1D7FA 3G6LA 4ATLA 2WPGA 1VIWA 1E6PA 2V38A 4CD7A 2ZUTA 1XYZA 5IHSA 5C70A 3AJ7A 2XIBA 3RM9A 2O9PA 3L4ZA 3W38A 5D8WA 1O7AA 1E72M 3QOMA 2ZX8A 3VILA 1DHKA 1VFUA 4B3LA 1NWTA 1I75A 4CU6A 4AIUA 2GFTA 3CHEA 3W37A 1SR0A 2OYKA 3EDFA 5AC5A 1QI2A 4IUGA 1J0HA 3CIVA 1ISWA 3AISA 1E73M 1E5JA 1JXJA 2WSPA 2DT3A 2QMKA 3WQWA 4W8AA 5BXSA 1H41A 4BF7A 4GZIA 3MUAA 4GIAA 1E56A 1IZKA 1GOOA 1XGZA 2XVKA 5JBDA 1OIMA 2ZUUA 2FDMA 2BVDA 4MDOA 2GJPA 3KZSA 4WK9A 1UZ4A 5GNZA 2J8GA 2G8ZA 3RM8A 1XV8A 2XPKA 2E8ZA 1OGBA 1WKYA 4NF7A 4DWSB 3F5JA 3SUSA 2WLYA 1DWIM 1XHGA 1Q6CA 1EDGA 1RD6A 3U57A 1KCKA 1O6IA 3CZJA 2X1IA 1EHNA 2D0GA 3RJYA 4W85A 1CGYA 5LYRA 3SEPA 4W7VA 3T2PA 3VIPA 1RP9A 3CZKA 2VZVA 1VENA 5BWFA 2A3HA 4KGJA 4BZYA 4Y7EA 1OCQA 4LYPA 1H2JA 4OOZA 4BQ3A 3VO0A 2G3JA 3DYOA 5DEZA 3JUGA 4GO8A 4BCEA 2E8YA 1DWJM 3WENA 1BLIA 3TTSA 1EOKA 1E40A 1PIGA 2C7FA 2VX5A 3AICA 1CBGA 4D1JA 4DUXA 5D8ZA 3MSGA 4PBGA 2RGMA 2YL5A 3NUKA 4QFUA 4EK7A 4U2YA 5I78A 3NDZA 4MB4A 1J18A 1KBKA 1KXTA 2J78A 4TVDA 4L4OA 1BPLB 1CGXA 3RCNA 3WH9A 2J25A 3WDPP 5I5RA 3VIHA 4W5ZA 2D20A 4WLCA 1CGVA 1H49A 1UWRA 2XSBA 3AFBA 2WWDA 3AIWA 1DP0A 2XSAA 1US3A 3WH5A 1XH0A 3WQVA 4OOUA 4AD4A 2D0FA 3ZJ8A 3ZT7A 1U2YA 1JAEA 3OLDA 3AZRA 4XZBA 2VI0A 4R27A 1ECEA 1MWOA 1BYDA 2ZIDA 3M6DA 2RGLA 4OIFA 1EGZA 3W26A 4C7DA 3W4RA 1UH3A 3OA5A 1C90A 2PI6A 3SCQA 2UWFA 2D24A 3AHVA 3SUTA 3SCRA 2E9LA 3DECA 3L4WA 3HN3A 5LA0A 1E6ZA 5HNNA 4Z2KA 1MXDA 1WZKA 4MAZA 4AZCA 1GPFA 3ZSSA 3ZR5A 3I3EA 3CUJA 4QLKA 1MQQA 5D4YA 3VNYA 2DSKA 1TMQA 4J27A 1KB3A 1PIFA 2AMGA 4UFJA 3AIRA 2Q8XA 4UZUA 1UD6A 4MNKA 4M80A 2AOSA 1E6SM 3B8SA 2X2YA 3AS2A 1E6QM 2J4GA 4W7UA 4JCLA 1G01A 1U30A 1F4HA 5E9AA 1WDQA 3ZMRA 3RMEA 1FHDA 2E9MA 2J8FA 2QMJA 1MW3A 4TTUA 1WDRA 3T09A 1Z32X 2WZIA 2WCSA 3AIBA 1W9BM 4PCTA 5CG0A 1PX8A 4PUEA 4MJ2A 2EPOA 5TD4A 2GDUA 4FMVA 4DUVA 2D3LA 7TAAA 1XCXA 2BHZA 3AHZA 2XYLA 3L4YA 1BFNA 1E4IA 1B1YA 3S6TA 2YL9A 3BLPX 2CXGA 3AS3A 5EB8A 3VX1A 4UQ9A 2VC9A 5LA1A 3N18A 2WHMA 3UESA 1XSKA 1LJYA 4HA3A 1KGXA 4GXPA 3N9KA 4H41A 1E1FA 1CXHA 3WD2A 1ODZA 1V6XA 1V6VA 2MANA 4UFHA 3U7VA 3VD7A 1QBBA 1BQCA 5EMYA 3RPMA 1C8YA 1H1NA 4JZ5A 1BSIA 1FA2A 4AD2A 3MMWA 2ZXBA 3ARZA 1PJ9A 1H11A 4PMYA 4PTMA 4QDMA 4WJXA 2EXOA 4PMQA 1V0NA 1E3XA 1HIZA 2VCAA 2WBKA 1GQIA 4ACZA 3APGA 5DF0A 1MQPA 1UWQA 3SUUA 4M8UA 1CXLA 1ZBVA 2PWEA 5JBFA 4QP0A 4S3JA 2Y4SA 3UG4A 2XFRA 3ARTA 3WUBA 3CHDA 4PN2A 3AXIA 1C93A 3LPFA 1VEOA 3ARQA 3WD4A 1KWKA 1E0WA 4N0RA 3BSHA 2ZUWA 4MPKA 1DWFM 1JYVA 3WMBA 3WMSA 5M17A 4AEFA 3QHOA 4CGTA 1AVAA 3PZQA 2UY3A 5BRQA 5FIPA 1E4LA 2X0HA 4HZ8A 3KL0A 5I24A 3MUZ1 2A3CA 3VIKA 4HOXA 1GOIA 1UA3A 2ZWZA 1W9DM 3VD4A 5EBAA 1E6RA 2ZUMA 1NWUA 1JZ2A 2IUZA 3ZJ7A 5IHRA 1DWHM 2WMGA 4AZ6A 5A2AA 4WKHA 1X1NA 1B3VA 5KZ6A 3O6AA 4PMNA 4D72A 2ZUSA 5BXPA 3LPGA 1K9TA 1CXEA 3RJXA 3AQUA 4LPCA 2CITA 1LL7A 2XHYA 2XM2A 1EO7A 3KWXA 3T0DA 1W1VA 4CVWA 1VEPA 1M04A 2GUYA 3TTQA 1GORA 2DT2A 3BMWA 4PMRA 5GNXA 2WCGA 1HJXA 4ZENA 2B31A 4U5IA 5BRPA 2J79A 3CMJA 1HXJA 5CJ5A 1W3JA 1B3WA 2QPUA 2V5DA 5A6LA 2GK1B 1PZ3A 1W1PA 1XC6A 1GJUA 1XYFA 1VBRA 4PMOA 3VPLA 1F4AA 1K9EA 1M03A 4D6IA 1LG2A 5AY7A 1VB9A 3WH6A 2EPNA 2Y5EA 2VTFA 3SCNA 3ARXA 5IFTA 3TP4A 1V6UA 4RE2A 2WC4A 1KGUA 3PBGA 2O9OA 3IANA 3EMQA 1BGGA 4PMXA 2XVNA 2PB1A 7A3HA 3SCUA 4OZOA 1K9FA 1QI0A 2DEPA 3CLWA 1JYWA 2BVYA 1BG4A 2CBIA 3UG5A 1QW9A 2A3AA 3GH5A 4P7NA 4UFMA 2QLYA 2D2OA 1NWSA 5EFDA 2VX4A 1PBGA 1CGWA 4PMVA 3GTNA 4PTWA 1WZAA 3A4XA 4MJ4A 1UWUA 3BCDA 4F66A 3ARRA 1QHOA 1AQMA 1V02A 3VMPA 1K9DA 1VFMA 3FXYA 1C7TA 4QCEA 3ZOAA 5I77A 1WB0A 3GBDA 2DDXA 2GVYA 4BQ5A 2VZTA 1CZ1A 3VDAA 2ZX5A 3E1F1 3PZNA 1LWHA 3PZMA 3PN8A 4MNLA 1GOMA 3MUY1 3VGBA 3WIJA 5A2BA 3SURA 3GBEA 1QI4A 3U7BA 2E40A 3AYSA 3CHCA 4AD1A 1W2PA 1TFVA 4BQ2A 2O92A 5A6KA 5DT5A 3WD1A 5DT7A 6TAAA 1V6YA 4IPLA 3ZJ6A 2BHUA 3VTRA 2WANA 4F9JA 2W66A 3WNPA 4GPNA 4AISA 2JF6A 4UQBA 3N11A 1UKPA 3UEQA 2NT1A 3AZSA 2ZUNA 1W9VA 3FAXA 1ZBCA 1EDQA 2FH8A 3SCSA 2VNCA 4CCDA 1W9XA 1EO5A 4ACZB 3M07A 4J3UA 5GQBA 1L0PA 3ZIZA 1ZU8A 6A3HA 1UKQA 4D6DA 3WNNA 1CXFA 4V27A 2Y24A 2V3FA 4Z2HA 1UZ1A 4ATWA 4H8HA 2WKLA 4W5UA 4TX6A 3FY1A 4UTFA 1LG1A 3BAIA 2EBNA 2F61A 5GPRA 3ZSTA 4AXNA 1MW2A 3CUHA 3MO4A 4CUCA 4L4PA 1FP9A 1WO2A 3BLKA 5FD0A 3ARVA 1XD0A 1GHSA 1W1TA 3TONA 3VX0A 3CHFA 1UYQA 4FLSA 1HVQA 2CYGA 5D9PA 1IT0A 1UQYA 3K8LA 3SUWA 1UWTA 2WM0A 2CNCA 4BQ4A 4W7WA 4GQRA 1NH6A 3WY1A 3OLIA 5BROA 1UG6A 5CSUA 4LXFA 1QW8A 4H2CA 1BHGA 1V0MA 3BAXA 3WF1A 2EPMX 1KGWA 3BAJA 1JZ8A 1CGTA 3AROA 2NW0A 2WAGA 3CUGA 2BY1A 1HJVA 1TCMA 1V0LA 3AIQA 1HN1A 3T2QA 3NSNA 2VURA 4JFWA 3T2OA 3NDYA 3O2LA 4HTYA 4NSBA 1GQKA 3QHNA 4QLLA 1I1XA 1FH8A 3ECQA 2AAAA 3IK2A 1E4NA 4IPNB 2V5CA 3VIFA 4PSPA 1C92A 4FLQA 2YA1A 3D3AA 1V3KA 3DHUA 3HU7A 3QGVA 1GOWA 2VR4A 1PX3A 2ZXDA 1NOFA 4LGXA 3WH7A 1LF1A 1Q4NX 3NSXA 2VR5A 3CH9A 4AZHA 4KMQA 2VCCA 3WDJA 1DWGM 4GZEA 1E5NA 3SUVA 4AIEA 1YHTA 3WDQA 4CN6A 1V3LA 4W84A 2DSVA 1JZ7A 2PBGA 2E0PA 4HMEA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1HKI A;  3WFZ A;  3W29 A;  3VOC A;  3AMK A;  3GXD A;  3PZV A;  3NYD A;  1H0I A;  3VM7 A;  3WBE A;  4J7R A;  1ZB5 A;  1EA9 C;  1OT1 A;  3OLG A;  1KQY A;  3CUI A;  2XG9 A;  3PTM A;  4EAM A;  4F9D A;  3VU2 A;  1J0J A;  3DHP A;  1TA3 B;  4HZ7 A;  3NJ3 A;  5HPC A;  3ALG A;  2QV4 A;  2VVN A;  5A6B A;  3L4U A;  1JDD A;  5A8O A;  2WKG A;  3ZR6 A;  5CXP A;  2DT0 A;  3KE0 A;  1QNO A;  2Y8K A;  1JYX A;  1N82 A;  4OBS A;  4KH2 A;  4Z2G A;  4MTV A;  5AYI A;  2CES A;  2WLZ A;  1HF6 A;  5BXR A;  3AHY A;  3ZM8 A;  1AQH A;  3OZP A;  3ZO9 A;  3L2L A;  1JND A;  2WK2 A;  4FLO A;  3W81 A;  4W89 A;  1UR2 A;  1GQJ A;  3WKZ A;  2YL8 A;  2ZX6 A;  1K6A A;  2WMJ A;  1BYC A;  3AOF A;  1B30 A;  3VIJ A;  3TTY A;  3VVG A;  4YPJ A;  4CN4 A;  3MV1 1;  4U33 A;  5ABH A;  2OWW A;  4E4P A;  1W9P A;  2WVV B;  3PZO A;  5A2C A;  1VFO A;  1JF5 A;  1J11 A;  1OGS A;  4CU7 A;  4MB1 A;  3BH4 A;  4JKM A;  1GHR A;  2YA0 A;  4PTX A;  5JIP A;  1JI2 A;  4CKQ A;  3VIM A;  4X0N A;  4D6G A;  4HP5 A;  1FFR A;  1MYR A;  1VRX A;  3IAQ A;  4UQD A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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