3GAYA

Structure of giardia fructose-1,6-biphosphate aldolase in complex with tagatose-1,6-biphosphate
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
322
structure length
319
Chain Sequence
PLCTLRQMLGEARKHKYGVGAFNVNNMEQIQGIMKAVVQLKSPVILQCSRGALKYSDMIYLKKLCEAALEKHPDIPICIHLDHGDTLESVKMAIDLGFSSVMIDASHHPFDENVRITKEVVAYAHARGVSVEAELGTLGGIEQNTVQLTEPQDAKKFVELTGVDALAVAIGTSHGAYKFKSESDIRLAIDRVKTISDLTGIPLVMHGSSSVPKDVKDMINKYGGKMPDAVGVPIESIVHAIGEGVCKINVDSDSRMAMTGAIRKVFVEHPEKFDPRDYLGPGRDAITEMLIPKIKAFGSAGHAGDYKVVSLEEAKAWYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural insights into the substrate binding and stereoselectivity of giardia fructose-1,6-bisphosphate aldolase.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Giardia intestinalis
molecule keywords Fructose-bisphosphate aldolase
total genus 115
structure length 319
sequence length 322
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2009-02-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01116 F_bP_aldolase Fructose-bisphosphate aldolase class-II
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3gayA00
2ZRWA 3WJYA 3H55A 3A5FA 1MXSA 1UUMA 5EA9A 3DGRA 4GUFA 1TPC1 1YDOA 3AJXA 3B04A 3OA3A 2DJLA 5G2HA 4KFOA 1VH7A 1UB3A 1PVNA 4GFSA 3OIXA 3HPSA 3W7OA 4AHOA 2ABBA 2ZZ2A 3GDMA 4ZQNA 3TFCA 2ABAA 2FPTA 2RHGA 3L65A 2VENA 2PRHA 1R2SA 3ZWTA 1SSDA 1TQJA 3GR8A 1Q3NA 2QUUA 4EF8A 4MUZA 4NZFA 3W72A 4E2DA 2XN2A 4AWSA 3T55A 3Q37A 4EIVA 4KFNA 2V8ZA 1LOLA 3KRSA 3UZJA 2RH9A 1H51A 1X6UA 1JUKA 2Y63A 3LV5A 1LRNA 2CLEA 2WNNA 1XM3A 2QUTA 3DI0A 1ME7A 4BWLC 5F2MA 3WJZA 3G18A 3PB0A 1TPB1 2PRMA 3DHDA 4FEZA 3I68A 3TE9A 4RR4A 3S0CA 3FS2A 1I45A 3MO7A 4I7WA 5U7SA 2TRSA 3P81A 4RK8A 3FA5A 2RKXA 3UWVA 2ZTJA 5LZLA 4MLJA 4H4IA 3TV8A 1W5PA 4MIMA 1HTIA 4IQLA 1Q45A 2E6AA 2NX1A 4RCXA 5HUPA 5F2LA 4LVAA 2TMDA 2CZDA 4AH7A 1YDNA 4R7JA 3G1VA 5D05A 1VYSX 4FNPA 2I1OA 1A5CA 4MKNA 1EB3A 4O53A 1ALDA 2DZVA 1RPXA 3LCHA 1YPFA 4TMCA 3MI2A 3L2IA 5FEWA 4YWIA 4AVFA 5BW6A 4LUJA 3W71A 2YCEA 4M7SA 1QAPA 3P8IA 3TX9A 3PBWA 2Y70A 2ZZ4A 5KSWA 3MHGA 1JVNA 1D3HA 1TV5A 3HGSA 2UV8G 3SECA 2X1UA 3O8AA 3W7HA 1H1YA 4LRTA 3LHTA 4O50A 3OEXA 4EOUA 4NVTA 1NF7A 3RLUA 3BGJA 1B4KA 1XDMA 2BX7A 2NX3A 1F76A 4UNKA 2H8XA 2ZRXA 5CZTA 3NPWA 2QCGA 1W56A 4NX0A 2Y85A 1IXOA 3F4NA 4N9EA 3GXPA 3PUEA 1AW5A 3ELFA 1FQ0A 3VCRA 3LXCA 3LCFA 4O28A 3B8DA 3MP3A 3NO5A 5DXYA 2R91A 2F84A 5C54A 3SGUA 3LLDA 1GG0A 2ZZ7A 3LX9A 2QJHA 1GVFA 1P0NA 2P0OA 5G2IA 1VR6A 1W54A 2BTMA 4KKXA 3W7CA 1K8XA 4Z0SA 4RXFA 3UNDA 1TTIA 4TO8A 1KM5A 5CKSA 3HGOA 5FEXA 1R30A 3NL6A 3RNDA 2JKAA 3E96A 4IWWA 2QCLA 2ZZ3A 2H8ZA 3CEPA 1TCDA 4U28A 3W7GA 3M5ZA 2DZPA 2TYSA 2J9XA 3DI1A 1AK5A 2Q3RA 3NG3A 1ZJIA 3N34A 5U4NA 4WXYA 1E51A 3YPIA 4YLWA 3P74A 3HO8A 3HGJA 3HG3A 1SO3A 2YX0A 3TC6A 5AHNA 1IIGA 3MBFA 4IOTA 5C55A 3QSRA 5ABTA 4IX2A 3C2VA 3NQ8A 3TXZA 1T96A 3CU2A 4BI7A 2EF9A 3KRZA 3M5XA 2ZRVA 3EB2A 4TR9A 1SSGA 5I3HA 2VEIA 4JTGA 2GOUA 4O13A 1NSJA 3P7YA 4W9TA 1MEIA 1WDWA 2CLOA 1DJNA 3LTYA 4L4LA 1I2OA 2WJZA 3WK3A 5EL1A 1QFEA 1ML1A 3TSDA 4JTIA 4J9JA 5AB3A 4JN6A 3FJLA 2X30A 4JTUA 1OFOA 1VPXA 2EAWA 3NEVA 1S5TA 3KOFA 3L5LA 1JUEA 5I3FA 1H61A 4ADSA 2ZCGA 3B0UX 1BTMA 3PB2A 2J6XA 1LDCA 5CSSA 4JXCA 5KINA 3IGSA 2X16A 3B05A 4QAIA 3LHUA 3NNTA 3IIPA 5D04C 2XN0A 1A5BA 1GTHA 4FX7A 3UPBA 3EWWA 1GOXA 2PC4A 3ZS4A 3NQCA 2NWRA 1RQBA 3FFSA 3NGJA 4GBUA 3T44A 3LCWA 4UXDA 2E6DA 3RMJA 1R2TA 1VYRA 1TV7A 3SFKA 4UTUA 2B7QA 4TMBA 1KFLA 4AMAA 4Q4KA 1F73A 5HINA 1GVOA 4JDYA 1TTJA 3WK1A 3G1DA 3NM1A 3LV6A 4RJEA 1XBVA 2ATSA 2ALDA 1LLWA 2YSWA 4RXGA 3S5YA 3MBDA 4WD0A 2QAPA 3W75A 3W7JA 4I9AA 4ZZ9A 4XTDA 5HNRA 1LP6A 1H60A 3BO9A 3L0KA 1QWGA 1W3TA 2NV2A 3W9ZA 3TNOA 2X2GA 3QPZA 4NXKA 1ADOA 5DLCA 4JTFA 5C5YA 2VEPA 4IUOA 1JCJA 3LXAA 3IIXA 4O8RA 1TV8A 3EX3A 4DO4A 3QQ1A 3WJSA 4NQ1A 1QDSA 4OHQA 4YMZA 4AEOA 5IBXA 3W7NA 1FBAA 4HPJA 2RDTA 3TK7A 2WPBA 1TRIA 3TUUA 2B7OA 3NM3A 5FF7A 4WUIA 1FWTA 4BFAA 3O16A 1TMHA 4A2RA 5TBOA 1KLZA 5HQEA 1F05A 4RV8A 1AL8A 3TMLA 4YCOA 3PF3A 4PTNA 3W7IA 1EWEA 5K2ZA 1TYGA 2G95A 2CLHA 3GR7A 1XKYA 4A29A 1YYAA 4NZJA 4Q33A 3W7DA 3W87A 4UCGA 1X7FA 2KZHA 4MFEA 3N14A 4ZMGA 3NPUA 1XBYA 4IX0A 3DXIA 4K38A 3LTPA 4K8EA 4GXMA 2JKEA 1LOSA 4JX4A 3MWAA 1QO5A 3I65A 1ZAIA 2QCCA 1SO5A 2YGYA 4FIRA 1PHQA 3A21A 4S1FA 3STGA 2E5BA 1O5KA 3B0VC 2OT0A 1KA9F 3M7WA 4HPXA 4XTIA 1WOBA 4O4VA 1S5VA 5F1VA 2YR1A 3F4WA 1TPEA 4NT0A 5LHFA 1GEQA 1OX4B 2E77A 3T4CA 1DKWA 3U2OA 2C0AA 2Y88A 5F2GA 1JCLA 3PUDA 2QCMA 3A22A 3GXNA 2H3DA 3FIGA 2LLEA 4GUGA 3QEZA 1ZCOA 2Z1BA 1YDVA 4GRSA 1SO6A 1W5MA 1YTDA 3TFXA 3C56A 3G1FA 3M6YA 1YLVA 1ZHAA 5AHFA 5F4WA 3PS7A 4LWWA 1G69A 2ISSA 1F6KA 3CIWA 2Y6ZA 2IQTA 2X1RA 1K7XA 1SZEA 3NL3A 3VKJA 4GUHA 3R13A 4MFDA 4OE7A 2YYUA 2ZA1A 5HULA 3P82A 3BW3A 4N9DA 3B03A 2OX1A 2VEMA 3NQFA 4NJGA 4Y6GA 1NEYA 3W1QA 2Y62A 1MSSA 3S5NA 3F1QA 1W5OA 2C3ZA 1C9DA 3CT7A 4MYXA 5I3IA 4BK9A 3EX4A 2ZTKA 4X2RA 3QPYA 3O07A 4CCEA 1JJKA 4D2JA 3L5MA 3M5YA 3W1NA 2WSQA 3GK0A 4JY9A 4IJBA 1SPQA 3W76A 4N4QA 4ADTA 5I3JA 3T40A 4Z1CA 4HKPA 5K9XA 4NJKA 2EPHA 1WOAA 3EWBX 3MUXA 4GC4A 1BWKA 2E1DA 1K02A 3BG9A 4EWND 3MP5A 3NQ6A 1TJPA 4ZL1A 1TIMA 5CZ0A 4CQ8A 2V30A 3KRUA 4UTWC 3A9IA 3PG9A 4MPQA 2NX9A 1V7YA 4DPQA 3TU9A 3UY8A 3IIOA 3WK2A 1H5YA 4NU7A 1EIXA 2QJGA 3R5EA 3TQVA 4MY9A 1I2NA 3HIJA 2ZDRA 1Q6LA 4FF7A 3B06A 4TU1A 5K4XA 2XFWA 3KAOA 1QPRA 5E93A 3TH6A 1TQXA 3FYOA 1JQVA 3HPXA 3SJ3A 1B4EA 2CU0A 1K03A 2TSYA 2GJLA 3CB8A 4UMBA 2FB2A 3ABOA 3N2MA 4MYAA 2NXGA 3G1AA 3W6YA 3FEMA 4HNVA 2Y7GA 1XDLA 1SUXA 1M6JA 2WQPA 1JULA 4EVZA 4Z1DA 1TO3A 3BGGA 5AHLA 4JTSA 1OX5A 1KFCA 2C16A 3B0PA 4ADUA 4N02A 1DQWA 1G4SA 3EX2A 5KMYA 1DV7A 1T8XA 1LBFA 3UXDA 3VNDA 5K3VA 3NL5A 1OABA 3DZ1A 5L9FA 1UCWA 4O1AA 2E5DA 3NQEA 1XFBA 2C19A 4QQ3A 3CHVA 3L9CA 1EP2A 2ZQ0A 3USBA 1GPWA 1MEWA 4ALDA 1GZGA 3W84A 3DBPA 3MYPA 1G7VA 2ATMA 5C2XA 2ZA2A 3SZ8A 4UIOA 1IXPA 4O52A 2YYTA 4MVAA 4GUIA 1XL9A 3W70A 2OZ0A 1GVRA 1TPUA 1FWNA 2W6RA 4PA8A 2V5BA 2VFHA 1X8FA 2R14A 1MO0A 4IMGA 1X1ZA 4KWVA 3G8RA 4FNSA 1SW0A 2X1SA 5F4XA 2YFOA 1Y0EA 2WV8A 1K8YA 1XBZA 4M6PA 6TIMA 3DFTA 1CI1A 1J2WA 2CFFA 5I3KA 2E6YA 2YDAA 5MHBA 3NQ7A 2CZFA 1J5TA 1M7OA 2DZWA 2RDUA 4LOCA 4MOZA 4OT7A 3JR2A 4GNJA 4WOZA 1FWWA 1N55A 1HFBA 4K37A 4Y90A 4WOQA 3P61A 1WBHA 3THAA 1ICQA 1LCOA 4QJ1A 4RKAA 4CCDA 3S5ZA 1WYIA 2A4AA 1K7EA 3EWZA 3W23A 1MEHA 3KVLA 5DELA 4ONVA 2VELA 2QDGA 4O57A 3GB6A 2Y89A 4XZ9A 2QCFA 3QFEA 1WAUA 4TX9A 4POCA 4BI6A 1QO2A 3M0ZA 1PHWA 4DF2A 3W88A 3MHFA 3N2XA 4FXRA 1H7WA 4FHAA 4OU1A 5DY3A 3W7EA 3LTSA 1BWLA 4X22A 1C29A 3GDKA 3L66A 2W79A 1NVMA 3HF3A 3M9YA 3UWYA 5D2WA 4DXVA 4CLMA 3S1XA 1H7RA 3HG2A 1TREA 4LU0A 2I14A 1Q6QA 4C1KA 3GNDA 2XN1A 3V75A 1LROA 2G5WA 2DJXA 2Y7EA 3NDOA 2OCZA 2P1FA 3E0IA 1YXCA 3C2FA 4X3ZA 2QAFA 3GDLA 4UTTC 1H7PA 3QM3A 2PRLA 1DORA 3Q2DA 1LYXA 4HN4A 2AAMA 3IIZA 1BKSA 1N7KA 5SWUA 3LERA 3W83A 3ABSA 4UNLA 5EYWA 2BLEA 3CQ0A 1UJPA 2FQIA 3PR2A 5HWNA 3QF0A 3L5AA 2EKCA 2WKJA 3EXRA 3NR0A 3QSTA 3WJWA 1PL9A 2ZZ1A 4IMEA 3R89A 4CNNA 3S1WA 2VFEA 4QITA 3INPA 2GQAA 5EKYA 3PY2A 1TPH1 5F1UA 3MP4A 4O16A 3OVPA 2CWNA 2G97A 3P80A 4OQVA 1ZAHA 1GTEA 5AC8A 4GJ1A 3QRHA 4O10A 5K9DA 3UWZA 3LI1A 2ZRZA 1TTQA 4LC8A 1SFLA 2ZRYA 4HNTA 3N9RA 1TPWA 3GX9A 3G22A 3FLUA 5D2TA 3LB0A 3PC0A 4LRSA 4OGZA 2GUUA 2HS6A 1P4CA 1B9BA 3QH2A 3B4UA 5DY2A 4AB4A 1FUYA 1VLWA 2NUYA 5CPLA 5FEPA 4JICA 3O6DA 1VHCA 4AWUA 2VFFA 5HJLA 5HUOA 5G4EA 1OHLA 4C1LA 1GVSA 4UC5A 3EX6A 3KFTA 3DHFA 5HMSA 4HHPA 2NUXA 1LORA 2WSRA 4NNBA 2DZUA 3GKFA 1SZFA 3NPVA 5AHIA 3A5VA 3QJAA 2V81A 1WQ5A 3M44A 3JRKA 3IRDA 1KV5A 4O1CA 1SW7A 3NL2A 4BWLA 1LOQA 3FOKA 3LHVA 1AW1A 3TR2A 4WY0F 2JKPA 4QM1A 4DEFA 2Z0IA 2ZZ6A 3W2KA 2QCEA 4TIMA 2BXVA 2Y7FA 3RK8A 4MZYA 4UMCA 2ZYFA 3NZ1A 4JYFA 4IXXA 5TQLA 2FTPA 1YXDA 5DBUA 4XBKA 1XUUA 2Y61A 3NPXA 2Z6JA 3TIMA 3RFAA 3CTLA 3O6CA 2A21A 3KVJA 3STEA 5J5DA 3W7PA 1H7XA 3LGEA 1Q6OA 3M5VA 1W3IA 5KZEA 3TQKA 4JTHA 2NWSA 4ZQOA 4YXGA 5F2IA 3W1UA 1GYLA 4ORMA 1OX6A 5CPNA 1G4EA 3W7KA 4LVBA 3WFAA 2FPYA 3LM7A 4QSHA 4KWWA 1ZALA 1GVQA 2CLIA 3BG5A 3KHJA 5LGXA 5LNRA 3H54A 3CWNA 3PBUA 3IGUA 1FCVA 2ISWA 4DF0A 1PCWA 2HTMA 3W1RA 1TRDA 1XCFA 1IXQA 3DAQA 1KTCA 3U6WA 2CZEA 3PULA 1AL7A 5DCDA 1SO4A 3GNNA 1FDJA 1KM6A 4LUIA 3S9YA 4FNRA 1BEUA 1OYCA 4WX2A 1OX4A 3W74A 4S2CA 5KZMA 3L68A 4FX8A 4ML9A 4DBEA 4R34A 4GE8A 3N9SA 3BK0A 3ANYA 1FWRA 1O60A 4DO6A 4PH6A 4BF9A 3KXQA 4DF1A 3FKKA 3EKLA 4O4WA 2W0UA 1ICSA 1GJPA 3JS3A 2FFCA 3IVSA 3CWOX 3QC3A 1KW1A 1WBJA 1LBLA 2QCDA 3RLVA 3N73A 3D0CA 1DHPA 2NZLA 3HG4A 3NQ2A 5E0KA 3QQ0A 3W1AA 1H50A 4ZQCA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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