3GB6A

Structure of giardia fructose-1,6-biphosphate aldolase d83a mutant in complex with fructose-1,6-bisphosphate
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
322
structure length
318
Chain Sequence
PLCTLRQMLGEARKHKYGVGAFNVNNMEQIQGIMKAVVQLKSPVILQCSRGALKYSDMIYLKKLCEAALEKHPDIPICIHLAHGDTLESVKMAIDLGFSSVMIDASHHPFDENVRITKEVVAYAHARGVSVEAELGTLGGIENTVQLTEPQDAKKFVELTGVDALAVAIGTSHGAYKFKSESDIRLAIDRVKTISDLTGIPLVMHGSSSVPKDVKDMINKYGGKMPDAVGVPIESIVHAIGEGVCKINVDSDSRMAMTGAIRKVFVEHPEKFDPRDYLGPGRDAITEMLIPKIKAFGSAGHAGDYKVVSLEEAKAWYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Fructose-bisphosphate aldolase
publication title Structural insights into the substrate binding and stereoselectivity of giardia fructose-1,6-bisphosphate aldolase.
pubmed doi rcsb
source organism Giardia intestinalis
total genus 110
structure length 318
sequence length 322
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2009-02-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01116 F_bP_aldolase Fructose-bisphosphate aldolase class-II
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3gb6A00
1HFBA 1GTHA 4JY8A 3MI3A 5A8GA 1YDVA 1LZOA 3KHJA 5BNKA 3PG8A 2TSYA 3R13A 1CI1A 4M6PA 1R2TA 2A7NA 2TMDA 1L9WA 4UIOA 2WPBA 4OWGA 1FCBA 3G3MA 5AN7A 3NPVA 3TSMA 1G4PA 3DU0A 3T44A 3EXRA 5CZTA 5EBUA 2Y6ZA 3TSDA 4EF9A 1HUVA 3W7DA 2OT1A 1M7OA 1SZFA 3A22A 4UR8A 3NQDA 5DCDA 3MBDA 3W1LA 2ZRUA 2ZYFA 3O16A 5CKSA 3LXBA 3I65A 4W9TA 3NM3A 4K8EA 3G8EA 3LHYA 3RNDA 4LS1A 4NNAA 2I1OA 1QPNA 1ZFJA 5DY2A 3LTYA 5KTLA 4O1BA 1H63A 2YYTA 1H7RA 3G1DA 1SSGA 4RLIA 3B8DA 2V5BA 3EX3A 3ZFHA 2CZFA 2AGKA 3U2OA 4E0CA 3GDTA 3MWAA 2ZFAA 4WY0A 4RCXA 3GZ3A 4JTJA 4FXRA 1J2WA 4N9BA 2JKEA 4LU0A 3W7GA 1T99A 3TFCA 4NU7A 5D30A 3W83A 5G2IA 5H91A 1KTCA 1X1ZA 2HS6A 4O8RA 2A7RA 4K7YA 3B05A 4O1DA 1THFD 4KWWA 3HO8A 5D2WA 1D3HA 3BG3A 1VC4A 1XBYA 3TIMA 3QQ0A 5K9DA 5HR6A 1OFQA 1LBFA 1XXXA 2Y63A 2Y88A 2CLKA 3T55A 1MO0A 3IVSA 1L6YA 3MW7A 2CLLA 3T78A 1PS9A 4UTTA 3GDLA 4EVZA 3O6CA 3TE9A 5E93A 4EOUA 1OFDA 1GJPA 2CLHA 4PEKA 2ZZ3A 4HNVA 3USBA 5C55A 3A5VA 1R2RA 3L68A 4LOCA 2JK2A 1LDCA 5C6MA 3W2KA 1UBSA 3QFEA 5D2TA 3W1NA 3PC0A 1LORA 4LNYA 2YSWA 3MJYA 1SPQA 3LHTA 1G4EA 2VFDA 1FWNA 3NL3A 4I9AA 1QPRA 4UTUA 4QNWA 4HNTA 4MKNA 3WK0A 2DU2A 2A4AA 2I9EA 4FX7A 4O15A 5KMYA 2FPYA 2C0AA 2Y7GA 1PCKA 2V81A 4JTHA 1T96A 8TIMA 3GR8A 4GUIA 2A5HA 3QMSA 4HPJA 4FIRA 3IIZA 1P0NA 4O11A 4A2RA 1ICQA 4MLJA 5LGXA 3I6RA 3LV6A 2CWNA 5KZEA 5FEXA 1EP2A 2J27A 4MZ1A 4GUJA 1K3UA 4CNOA 3P82A 1OX4A 4JTIA 3W70A 2DORA 2O7SA 4LY8A 5CZ0A 2WNZA 2IQTA 1JUEA 3T7VA 3NM1A 2QDGA 3F4NA 1I45A 1LBLA 2WV8A 7TIMA 3S9YA 2ZA2A 1YPIA 3TW6A 3GKAA 3HGOA 4NQ1A 4CQ9A 3DKLA 4FXSA 1KFLA 1QFEA 5F1UA 3G1XA 4AH7A 2CW6A 1QO2A 4LVBA 2BLEA 1J5TA 3PVFA 3PBUA 2CZEA 3SGUA 3TAOA 1QOPA 2BZNA 3PM6A 5KZMA 3GNNA 5EMUA 3IGSA 4QJ1A 3W07A 3WJZA 4HHPA 4XTDA 2ZQ0A 3MYPA 1EB3A 5D2YA 1TPFA 1KW1A 1U5JA 1G7UA 4GC4A 3ABOA 1MEHA 3TQVA 1SZNA 3BV4A 1O5XA 3MYOA 3IGUA 1JCXA 4XZ9A 1IXNA 4JS3A 2E09A 2W79A 1B4KA 4JY9A 5FF0A 1K03A 1DORA 1OX6A 3TC6A 3QW4B 3N2MA 1IF2A 4KWVA 1IXOA 4PODA 3G0XA 4KFPA 2CLIA 1JCMP 3P62A 2Y7DA 4ZMGA 4XBSA 2V2DA 4UCGA 5AFDA 1VHNA 1RV8A 1TPWA 1SU5A 4Z1AA 3HMJG 3TK7A 2E6YA 1GPWA 1JVNA 2GPTA 1TPEA 1GZGA 3TQKA 1FUYA 5G2HA 3TAKA 4RJEA 4WXZA 4MJZA 3W88A 3RLUA 3MBFA 3UPWA 3PUDA 5CSRA 1DQXA 1UUMA 4K7VA 3P7YA 4N9CA 4ADUA 1FBAA 3W1PA 4QQ3A 2AAMA 1Z42A 2V9DA 1YTKA 2QAPA 3C6CA 1EX5A 3DFNA 1OHLA 1I4NA 1Z41A 3EWXA 3OIXA 4DQWA 1ZAJA 4A21A 3EX1A 1H62A 3GAKA 1XKYA 4NNBA 3DFQA 4Z0JA 3G1SA 4G1KA 1YADA 3ELFA 1H7PA 3W22A 3QEZA 2CZ5A 4FO4A 1OFEA 4YCOA 3BARA 4BWLC 1TCDA 3FYPA 1VH7A 4NJJA 4UTTC 1OF8A 3STFA 1TTQA 4QITA 4S2BA 1DBTA 4XBKA 1DJNA 5DLCA 4O18A 2Q8LA 4L4LA 5BMWA 1KFKA 3LDVA 3GAYA 3M47A 4GFSA 3OG3A 3M0ZA 3BVJA 1ZALA 2CLFA 3SIZA 2DJLA 1KV5A 1BWLA 4GUFA 3GB6A 5CZJA 1KTNA 3VFLA 3M9YA 3LGEA 1TV5A 1TPVA 1L2UA 4QAIA 1BTMA 4WUIA 4JX6A 3TMQA 5D02A 4M5PA 1H61A 1OYAA 1QNVA 3SI9A 3QYQA 3NPWA 2EF9A 3G22A 3DHDA 3W2NA 2DZVA 6ALDA 3A23A 1T8XA 1KTBA 5HWMA 4A3UA 5G4EA 4UMBA 3H53A 4LRSA 4Y8FA 4DXVA 3NDOA 4O52A 4UNLA 4DEFA 4AF0A 2C6QA 3VKJA 3SFKA 3MP3A 3QSTA 5LHFA 4JGDA 1UASA 2E77A 1YDNA 1SQ7A 3SY5A 3IIOA 2OCZA 2OT0A 1I2NA 1XL9A 2GQ9A 4N2YA 1VYPX 5HQEA 5MHBA 1B9BA 3QMTA 1I2RA 1VR6A 1A5BA 3LHUA 3L5MA 3NQFA 4DPQA 2YGYA 1M5WA 3LCHA 5TIMA 2VEPA 3SJ3A 1NF7A 1LLWA 3UY7A 2NUXA 3R89A 2ZDRA 5LZLA 2NXIA 1GQNA 4GWEA 3LOTA 1QMLA 2ZZ2A 3A24A 3L2IA 3L21A 1VCGA 3LXCA 4UFLA 2R94A 4H6KA 5AOUA 4C1LA 2ISSA 2P1FA 4O0KA 4O28A 1SR9A 4FNQA 3EWBX 1SFJA 2C19A 3FJ6A 1VPXA 3O07A 2WSQA 1FXPA 2X16A 1VZWA 3ANYA 3E02A 1QPOA 1DKWA 1TTIA 2W0UA 5AYYA 1ME9A 4RXFA 3GXPA 4U28A 4CCDA 1FDYA 4NNCA 3TROA 3P5YA 3A5FA 3W3OA 1A50A 2DP3A 1F74A 3C8FA 3CC1A 3YPIA 2Z2UA 2YW4A 1O5KA 4R7JA 1A5SA 1G4SA 2YPIA 5AHLA 3B03A 4FIQA 3W1TA 1ZAHA 1XFBA 5F2MA 4IQLA 5D05A 2WSRA 4I7WA 5LNSA 4HSOA 3W7CA 4WJEA 5D03A 4JYFA 1O95A 2I14A 3P84A 4YCPA 4H4IA 1XM3A 3PB2A 3M41A 3THQA 1VLWA 1SZEA 4RK8A 1EP3A 2QUUA 3OHIA 2E5DA 2Y61A 3HB9A 3ZR4A 4BI5A 2VOMA 1C9DA 1ADOA 1KM6A 3TC7A 1F76A 3M5VA 5CPNA 3CWOX 4UXDA 1TYGA 3TH6A 3UZJA 3QC3A 3NQAA 2NX3A 1TRDA 1RPXA 4AXKA 4POCA 1P0KA 3VI2A 2QCHA 3TSBA 1IXQA 4JTLA 5DELA 5D38A 3WJYA 4X9SA 5DCBA 2HS8A 4WZHA 4FHAA 2DZTA 1K8YA 1OYCA 3DFSA 2B0MA 2G97A 3PUEA 2ZA3A 4LWWA 4CQ8A 3TUUA 3N14A 1EP1A 1I2QA 4E2BA 3QJAA 4DO6A 1RZMA 4IMGA 3DI0A 5DBTA 3M5ZA 1OX4B 3OVQA 3BLEA 1S5TA 2TPSA 3W7MA 4AHPA 3L0NA 1QOQA 4UFKA 1TMHA 3N2XA 3IEBA 4FEZA 5EL1A 3OEXA 2DZXA 4XTIA 4OV9A 4YXGA 4HSNA 1SUXA 2ABBA 3LBCA 3LCWA 5DY3A 1WBJA 2J9YA 3IVUA 4YWIA 5BRBA 1P5BA 3L9CA 3BGJA 2QCFA 1KA9F 2AQWA 2X1TA 1HL2A 3NPXA 1SFLA 2Y7FA 1F6KA 4N9DA 4AMAA 2R8WA 4JDYA 2H90A 3PB0A 4EWND 3BLFA 1Z48A 2WNQA 4O13A 2VELA 1TO3A 3UNDA 3W2LA 3Q37A 2NX1A 3W71A 1G67A 4OHQA 4LW7A 3R12A 3IRDA 4WY0F 4LC6A 1OF6A 3EB2A 4RV8A 2Y70A 1W3IA 2Y89A 1DHPA 5KSWA 3UWVA 4IUOA 3LB0A 1LOSA 3W2MA 4QISA 3TFXA 5U7SA 2W6RA 3BGGA 2ZA1A 1XCFA 1GTEA 1SZGA 1TV7A 1TB3A 3H54A 1X7FA 1I8JA 2OMAA 3GLCA 3Q58A 4AVFA 3CPRA 4XKYA 4OBTA 1X8FA 2G96A 5HWNA 3WJXA 2H8ZA 1JQXA 3L5LA 4LT9A 4ZL1A 5SWUA 1TSIA 3EXSA 1HTIA 1SSDA 1ME8A 2ZRZA 3PR2A 4NUWA 3W7QA 3NEVA 3ATYA 3DH7A 2HTMA 4TMCA 1L6SA 1IGSA 3WK3A 4NX0A 3O6DA 3DAQA 3NQCA 2E5BA 3TNOA 3WJWA 2G5WA 2JKAA 4TIMA 4WX2A 4HIBA 2FFCA 3PULA 2GOUA 3C2VA 5FF2A 5EPDA 1KM5A 1FWTA 1L6WA 1OABA 2RDTA 2XFWA 4CNNA 4FNTA 4JTGA 3HPSA 4N6EA 3N9SA 4UFHA 3SGZA 4RZ4A 4AHOA 3NAVA 3B06A 2NV1A 5I3HA 2JGYA 3QRHA 5I3JA 2A6LA 2A85A 1BWKA 4YL2A 3QSRA 3M5XA 3GXTA 1H1ZA 4K39A 1JJKA 3S1UA 1OVDA 1EWEA 3CQ0A 4IPIA 2QJIA 1WYIA 5HR7A 1IIGA 4PH6A 2B7PA 1RR2A 4AWUA 3TJLA 2QJHA 3TDFA 4MZYA 3LTPA 2B4GA 1A5AA 4K38A 3THAA 3W74A 2CZDA 2F84A 3DFTA 1TIMA 2P10A 5EKYA 3UWWA 2YCEA 1H60A 4ORIA 3BG5A 2ZZ5A 5T26A 5AHIA 2QCEA 3MUXA 3S1VA 3LLFA 4OT7A 1MZHA 5IBXA 1O60A 1JR1A 3CEPA 4UFIA 4O1AA 1XBVA 3W73A 1TTPA 3CIWA 1BEUA 3HG2A 3P74A 2BSLA 1M7PA 3FKRA 3RFAA 2EGZA 3TCEA 1YPFA 3NOEA 3D0CA 2QCDA 1YTDA 3DZ1A 1XDLA 4MOZA 1XUZA 2X30A 2QJGA 1DOSA 4AEOA 2O7QA 4BR1A 1WOAA 5BMXA 1KLZA 3LRKA 1W5OA 4LV4A 1OK6A 3QQ1A 1W56A 5K4ZA 5EY5A 1LCOA 1LYXA 3S5OA 4C1KA 4K8HA 5CGQA 2WSYA 5TBOA 5DBUA 5ABTA 2DZUA 1JCYA 1ICPA 3MI2A 1CW2A 2RFGA 1Q6LA 3G24A 4IOTA 2H8XA 4JDBA 3KVMA 5AB3A 3I7RA 3PAJA 4H3DA 4K6AA 1GT8A 1DQWA 4GBUA 1UCWA 2A1YA 3HOJA 5AC6A 1C8VA 3O6YX 2ZRWA 4K36A 4UTKA 2NV2A 3WK1A 1TTJA 3ZWTA 1Q45A 1GVOA 5EA9A 3LCXA 3NNTA 4FF7A 1FWRA 3DENA 4LRTA 3SW6A 3W1MA 3PG9A 2VXNA 4BF9A 4DO5A 3EX6A 3P8JA 5K7JA 2ZTJA 4DO4A 5LNRA 1R47A 3QPZA 4O10A 1JRBA 1QDSA 2QR6A 1FXQA 1I2OA 5D2VA 3ZWSA 2QCLA 1OFBA 5AC7A 1XDMA 2RHGA 1LP6A 1JRCA 1TPUA 4O12A 1GOXA 3BW3A 4NX5A 4ZQPA 3BO9A 3TX9A 3QMRA 4E38A 1DVJA 1TPC1 1KFEA 2PRMA 1WV2A 3PF3A 1XC4A 2VEMA 2FDSA 1ZENA 1LBMA 3BW4A 1KM2A 3F4WA 3FFSA 1ML1A 2E5CA 2ZZ6A 4LVGA 4MZ8A 3TW7A 2VEIA 4N4PA 1VHCA 3QM3A 5K4XA 3GYEA 2CFFA 4NJIA 5CPOA 3MHUA 3KVJA 3KAOA 4NXKA 2ZZ4A 2WO5A 5A5WA 4FX8A 3FA5A 1TPDA 4OQVA 4AWTA 4RZ6A 1H50A 3NQGA 3OVRA 3LXAA 5HJLA 3JS3A 1W5NA 3A9IA 1W1ZA 4TR9A 2VENA 1VRDA 4WXYA 2GJLA 4ZQRA 3DGRA 4QNEA 1KFJA 1FCVA 1KV8A 3KRSA 2X1SA 3GXNA 3TU9A 1VLIA 1EEPA 1RQEA 1ALDA 4RXGA 4TO8A 5HUOA 2YZRA 1TREA 3BLIA 3AO0A 3BK0A 3MP5A 3GKFA 1H7XA 4L4MA 3LX9A 3EWUA 2DZSA 3UXAA 4LUIA 3PBYA 4E2DA 4PL1A 4K37A 1VQTA 4YLWA 2VFEA 4JTKA 2JBMA 3L0GA 1YLVA 2ISWA 3MP4A 3O05A 1NFBA 1PE1A 5HUPA 1GWJA 3PBWA 4IMCA 2WQPA 3C2OA 4OV4A 1OX5A 5K9CA 3NGJA 1W31A 4CLMA 2UV8G 1GEQA 1VJIA 1H7WA 3PSVA 3P8IA 1UUOA 3GNDA 3LCGA 4ADTA 3FEMA 4IX0A 3KXQA 3M7WA 4XWUA 2JGQA 3KVLA 2VFIA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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