3KRSA

Structure of triosephosphate isomerase from cryptosporidium parvum at 1.55a resolution
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
249
structure length
249
Chain Sequence
SRKYFVGGNFKCNGTKESLKTLIDSFKQVESSNSEVYVFPTSLHISLVKEFFGNDHPGVFKIGSQNISCTGNGAFTGEVSCEMLKDMDVDCSLVGHSERRQYYSETDQIVNNKVKKGLENGLKIVLCIGESLSERETGKTNDVIQKQLTEALKDVSDLSNLVIAYEPIWAIGTGVVATPGQAQEAHAFIREYVTRMYNPQVSSNLRIIYGGSVTPDNCNELIKCADIDGFLVGGASLKPTFAKIIESAQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
molecule keywords Triosephosphate isomerase
publication title Structure of triosephosphate isomerase from Cryptosporidium parvum.
pubmed doi rcsb
source organism Cryptosporidium parvum iowa ii
total genus 99
structure length 249
sequence length 249
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 2009-11-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3krsA00
4IMDA 1C8VA 5AHMA 3P80A 4UR7A 5DCBA 4AWTA 5T26A 3LRMA 2J6XA 3O63A 3NL5A 5E0KA 3TIMA 3GDRA 3NPVA 1JJKA 5A8GA 2QJGA 3ELFA 2ZA2A 3IV3A 4GUFA 4LU0A 4O4VA 5FF4A 2G97A 2QCCA 4K36A 5CPNA 1K8YA 1Y0EA 1OFBA 2PURA 4OWGA 3HB9A 5FF7A 1XL9A 1YTEA 2Y88A 4Z1DA 5DBUA 3WJYA 2GVJA 1X1ZA 1J5TA 2AAMA 2E5BA 2G5WA 3IGUA 4JDBA 3IIVA 3BG9A 1BTMA 3W7JA 4UTTA 4LTSA 5FF3A 1TTPA 3LCIA 3HBLA 1F2JA 1RQHA 1G4PA 3MBDA 1DHPA 5D38A 1D9EA 3F4WA 1DQWA 4RXGA 4GJ1A 3TW7A 4UFHA 2XFWA 3O1NA 4BWLA 4O1CA 1LRQA 3TFCA 4Y9AA 2HSAA 1VJIA 3LXCA 5E93A 5D03A 1OFPA 3S42A 3BW3A 3LLDA 1GOXA 3W7PA 1WAUA 3V75A 1O94A 4JY9A 4KFPA 4N9DA 4TO8A 4QITA 3EXRA 2J88A 3NQAA 1F73A 4DF2A 5EYWA 1FY6A 2YPIA 5K9CA 4WD0A 4WXYA 4MZYA 1FWNA 5LNRA 3W7OA 1FDYA 5CZJA 3GXTA 5K2ZA 4C1LA 3N2XA 1TMHA 4H6KA 1H7RA 5L9FA 5EBUA 1R46A 2A0NA 3W74A 1MSSA 3MW7A 3SI9A 3C52A 1KM2A 4NZJA 3B0UX 3KVMA 4N02A 4X3ZA 3FJLA 2E5DA 3A5FA 2YR1A 3IIXA 2E6FA 4UR8A 1JCJA 4JY8A 3PSVA 3C3NA 4R7JA 5KSWA 1VPXA 4UTWA 4Q33A 3HQ1A 3LCGA 1I2OA 1G7UA 1VQTA 1BWLA 3W22A 3WJSA 3WK1A 1FCQA 1GT8A 3W76A 1FCVA 4UFJA 1TPEA 1AW5A 1EP3A 5CZSA 1I4NA 3QW3A 3W7GA 1TTJA 5H2ZA 2RHGA 1I45A 3C4UA 4NX5A 3TQKA 4Z1AA 2Q3OA 3VE9A 3LGEA 2FJKA 2ABAA 1TTIA 3EX6A 3JS3A 5LSMA 3B4UA 3PBWA 1I8JA 3LDVA 4LS1A 4LVAA 3WFAA 2QCMA 3DU0A 1SU5A 4E2BA 4WZHA 1W5MA 3UZJA 1S5WA 1ME8A 1QPOA 4QNWA 3W2LA 4HKPA 2JKAA 1X6UA 2CLKA 2BZNA 4UMBA 4ONVA 3MHGA 3W1PA 2C19A 3LHYA 4O12A 2O7QA 3R13A 5HR7A 1TJRA 3EX3A 1OF6A 1H1YA 3NQ6A 3EX4A 2QCHA 2VFFA 5K4XA 2BTMA 1MEWA 5AOUA 1EWEA 1F76A 4RZ4A 4BI5A 1P0KA 3QMRA 3STFA 3GXPA 2NV2A 3LBCA 3KAOA 5KZDA 4DO6A 1H7PA 3VCRA 4GXMA 3NZ1A 2PRMA 4DELA 4Q4KA 2D73A 3THAA 3W2JA 3C61A 4OT7A 2J27A 2YYTA 1H7NA 5LNUA 1QR7A 4FXSA 1LRTA 1O95A 4HIBA 3L65A 4IMGA 4JTSA 3L0NA 3L0KA 3N9RA 5AYYA 3HGJA 3NQMA 3S5ZA 1GG1A 2Y7GA 1TIMA 2H3DA 3R89A 2J9YA 4UTMA 3A9IA 2RDUA 1PHQA 3NL2A 3W75A 2JGYA 3UWVA 5BMWA 2V0TA 1K7FA 1SFJA 3FFSA 3LXBA 3T4CA 4AF0B 2DJXA 5F4WA 3SGUA 3P5YA 4XUGA 2GOUA 2Q3RA 1KFLA 3P60A 3GDLA 2X2GA 4POCA 4WX2A 1OG0A 1G4EA 5FF2A 4IQLA 2PCQA 1XBYA 2YFNA 2BSLA 3LV5A 4ADUA 2ZTJA 4GBUA 4LVDA 1LCOA 3W7HA 5DY3A 1ZY9A 3NL3A 1M7PA 4KKXA 3QQ0A 2E5CA 1D3HA 3UY7A 4DXVA 1HUVA 3W1NA 1EX5A 1ZJIA 4IMCA 1QOPA 3I6RA 2Z6JA 5K3VA 1LZOA 2HMCA 1XDMA 4P2VA 8TIMA 2VENA 2E6DA 2B4GA 3EWWA 4GRSA 1KBIA 4M7TA 4ZZ9A 4C1KA 3PR2A 1FWRA 4M6PA 3L68A 1ZAJA 3LHVA 4I7VA 3IVUA 2RFGA 3B0PA 1B4KA 2ZRUA 1VHCA 1W5QA 4I7WA 3FKKA 4Z0JA 4RX0A 1FCUA 3W1TA 1FXPA 1YYAA 1UUOA 4EIVA 1EA0A 4O17A 3OG3A 2QUVA 1GVSA 1ICQA 2QKFA 3W07A 3P5ZA 1THFD 3L66A 3TV8A 5I3KA 4GC4A 4MFDA 4UC5A 2X1RA 4LOCA 1SZNA 2DJLA 4CNNA 1SSDA 4K39A 1AMKA 1VZWA 1JUKA 1SW7A 1TPH1 2ZRYA 4WUIA 2ZZ5A 1TJPA 4CLMA 1I2PA 2GPTA 5AFDA 2JKEA 1JQVA 1TPDA 3GR7A 3MHUA 5A5WA 3VNDA 1D3GA 3DENA 4NNCA 5G1YA 3NQCA 3HJZA 4O15A 1VRDA 2B7OA 2ZZ1A 2YDAA 3G0UA 2CZDA 1K8ZA 5HNRA 3BW4A 4MZ1A 2VC6A 2GQ9A 3W7CA 3NGJA 5D37A 5G2IA 1YADA 4P61A 1SW3A 3GNNA 4ZL1A 1ICSA 2CFFA 1HO4A 3IIPA 1Q45A 4NZFA 3GR8A 5D32A 1DV7A 1IXOA 2QJHA 3GIYA 4UNLA 3WK2A 1FWTA 4MVAA 3UQNA 4TR9A 5I3IA 1HTIA 1SPQA 3BARA 3NQFA 1Z48A 5HJLA 3BPWA 4RCXA 1LORA 1TPB1 4NU7A 5AHNA 5F4SA 4H4IA 3DGRA 1SZEA 2XN2A 3MYPA 4FO4A 1W31A 4DBEA 4JICA 3FLUA 3ZWTA 2FPVA 1TTQA 2F84A 3DFNA 3M5ZA 2C1HA 3S1WA 1PCKA 1DJNA 1GVOA 2JK2A 5D05A 5IBXA 5ABTA 1KA9F 5C2XA 1UB3A 3HOJA 4DO5A 3FOKA 4MYXA 2WKJA 2OZ0A 2R94A 2OX1A 3PM6A 2ZZ4A 2HS8A 2YYUA 1FDJA 4AVFA 4O1AA 1XI3A 1QOQA 1PHWA 3UPBA 3W1AA 5LZLA 4NXSA 1W54A 3NQGA 3CTLA 3GYEA 3P7YA 2QEZA 5FEWA 3W3OA 1W56A 1N7KA 1H63A 2CLHA 1QO2A 4K8EA 5CG7A 3DXIA 5L6UA 5D2XA 3CIXA 3R8RA 2V9DA 3FEMA 3JR2A 3IEBA 1KM4A 5TIMA 1MZHA 1OFDA 2CLOA 2C3ZA 4UTTC 1I2NA 3N19B 3IRDA 2Z2UA 4RR4A 4UFKA 1W5OA 1H60A 3HGOA 4CCCA 3W7IA 3GVGA 4TIMA 4K8HA 1K02A 1Q6LA 4AHPA 3KOFA 4BFAA 3C56A 2YW3A 4HNNA 4BWLC 4DF1A 3TJLA 2ISVA 1TB3A 4CCEA 3EWYA 3UNDA 2NX3A 5CZTA 3BLIA 3L21A 3KHJA 1A5CA 4M19A 1OFAA 5AYXA 5D04C 2J9XA 1NF0A 4GWEA 1A53A 4O14A 3C8FA 5AC8A 3NQVA 3PB0A 3SGZA 1AL8A 4JN6A 1W1ZA 3KVLA 3BK0A 3HG4A 3RF9A 4K37A 3MBFA 1T96A 4ICNA 4PFMA 3GK0A 3PUOA 2C14A 4AMAA 1MEIA 2I1OA 3E96A 2YX0A 3S5OA 1ME7A 1Q6OA 1W37A 4WQ6A 1KLYA 2A1YA 3LV6A 3G1AA 1YPFA 2E09A 4MY1A 1WV2A 3WJZA 4PC8A 4A21A 3L5MA 3O6YX 4MZ8A 4UTWC 1VYSX 2QCLA 1ZAHA 2DZPA 1VLWA 4JX5A 2VFHA 2IQTA 5EMUA 3G1HA 3LRKA 4S1FA 3NQ8A 4Z0SA 1LDCA 3ZS4A 3S8HA 1VCFA 1XM3A 1LBLA 4FB7A 3W87A 3W9ZA 4JYFA 5LGZA 3P67A 3CPRA 1VC4A 1F6PA 3GX9A 2ISWA 3L9CA 3STEA 1GTHA 4FHAA 2RKXA 1L9WA 4ORMA 3MP4A 1F5ZA 1OK4A 2A2IA 1XC4A 2W0UA 7TIMA 4IX2A 4NJHA 1KFCA 2A21A 1IF2A 3GDKA 1GJPA 4WY0F 3IGXA 3M5XA 2P1FA 3T78A 5G2WA 5DXXA 4HNUA 3Q58A 3UY8A 1DVJA 3FA5A 3STGA 5CGQA 4UMCA 1YXCA 3PBVA 1DQXA 1T8XA 1KTNA 1K8XA 1FX6A 2JKPA 2NXGA 3DHDA 4S2BA 4H3DA 3CLMA 3CEPA 2WSQA 4M6VA 3CEUA 3VKJA 4FX8A 3ABQA 3TC6A 3QH2A 3MWAA 1W0MA 1J2WA 2ZRZA 4FNSA 1GVFA 2EAWA 1S5TA 1LROA 3ANYA 1OJXA 3W7RA 4OV9A 3NPWA 4A3UA 1OABA 3M5YA 2DORA 3UWUA 5AC6A 5CZ0A 3THQA 2ZQ0A 2Y89A 1N55A 2GQ8A 5BOOA 3O6DA 5BRBA 1ML1A 2H8ZA 2R91A 4MPQA 3RLVA 5CSSA 3NL6A 3W7QA 4GUIA 5MHBA 1VCGA 3BW2A 5D2VA 2YCEA 4UTKA 1OX4A 3DKLA 4O53A 3PB2A 3TROA 2BX7A 3S1XA 4LS0A 2GJNA 3PG8A 5DLCA 5U7SA 1B9BA 1G7VA 1JUBA 5KTLA 1T0OA 5DN1A 3CU2A 3W88A 4YCOA 4O8RA 1W3IA 5LKYA 4NJIA 3P74A 3W84A 3G1FA 2JGQA 1OFOA 5E1QA 1W3TA 2WSYA 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4ZQRA 3W83A 1LRNA 1A50A 3RU6A 1G4SA 4X9SA 1TPUA 5CPMA 2Z0IA 4YXGA 1GG0A 3M16A 1DOSA 5G2HA 5IBXC 2QUTA 2V82A 5I3HA 1XBVA 3R2GA 4UTLA 1DL3A 4NJGA 2XN0A 4YL2A 1XUUA 3P8IA 1TPVA 3G1SA 3E9AA 5AHIA 4JEQA 3QW4B 4KFNA 4ORIA 3LERA 2WSRA 1JQXA 5F2LA 4FIQA 2VFEA 3QF0A 4RKAA 3CWNA 4OBTA 1TSIA 3LTYA 3E49A 3TE9A 1H1ZA 1B57A 1TYGA 1R2SA 2FTPA 1SFLA 1AG1O 4LS2A 4XTIA 4QNEA 1F7BA 1GQNA 4OU1A 1U83A 4YMZA 4DEFA 1R2RA 1TRIA 3G1DA 4JTEA 1W5NA 3DH7A 2ZDRA 3P8JA 4OGZA 4Y96A 3UPWA 4EVZA 4HSOA 5G5IA 3HGRA 3G18A 3F4NA 3HMJG 4MKNA 1LM1A 3MJYA 3OEXA 1QWGA 5C55A 5DBTA 4O0KA 3LCXA 4PL2A 2TRSA 4MLRA 3S9YA 1KM6A 3M1ZA 4GUJA 4BI7A 1VYPX 3Q2DA 4BI6A 3UXAA 1JCMP 3EX2A 3LX9A 3N2MA 4QAIA 1DBTA 2QAPA 3LOTA 1EPXA 4FIRA 2ZRWA 2X30A 2Y85A 3CQ0A 2B7PA 3B05A 2G96A 3W7EA 1QPQA 4MIMA 2DP3A 2FLIA 4ZQMA 2F7FA 1TPWA 3A23A 5C54A 2NX9A 3C2VA 3N73A 2NXIA 3T44A 1FBAA 3WJWA 4EF8A 1SSGA 4CNOA 3B0VC 1TV7A 2QR6A 4K7VA 3LCLA 1OYBA 3O07A 2DZXA 1K03A 3PBYA 3QSTA 2O7SA 2YZRA 4DQWA 2C16A 3M41A 5LNWA 1B4EA 3NZRA 3AJXA 3NQEA 5F2GA 1TRDA 4JXCA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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