3KX6 | Genus

Total Genus 134

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	134
sequence length	358
structure length	344
Chain Sequence	MQVKLSQERAKELAENASFIASPGKGILAADESTGTIQKRFDNVGVENTEKNRAEYRSILFTTKGLGKYISGCILFEETLFQQAPNGQNMVDLLRAEGILPGIKVDKGLVTIPNTDEEVSTTGLDGLAERCQKYYNAGARFAKWRAVLSIDVKKNKPSNLSILETAHTLARYAAICQENGLVPIVEPEILADGDHSIEVCAEVTERVLAAVFKALNDHKVLLEGALLKPNMVTQGVDCKDKPAPQTVGFLTSRALRRTVPPALPGVMFLSGGQSESMATRHLNEINKCNKHPWSLSFSYGRALQSSVLKTWNGSMSNAAAAQDVLMKLAQQNSEASLGSLKYIY

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Lyase
molecule keywords	Fructose-bisphosphate aldolase
publication title	Crystal structure of fructose-1,6-bisphosphate aldolase from Babesia bovis at 2.1A resolution rcsb
source organism	Babesia bovis
total genus	134
structure length	344
sequence length	358
chains with identical sequence	B, C, D
ec nomenclature	ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date	2009-12-02

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00274	Glycolytic	Fructose-bisphosphate aldolase class-I

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3kx6A00

2BTMA 2YW3A 2DJXA 1OFEA 3UWUA 5D02A 1JQXA 3HIJA 1YYAA 1UUMA 4DPQA 1XFBA 1THFD 2BX7A 3HO8A 1AL8A 3B0UX 3BGJA 5A8GA 3G18A 4BI6A 2Z6JA 3UZJA 1QOPA 1WYIA 2QUUA 1OFOA 5E93A 3UPWA 4NT0A 3UY7A 3E9AA 4GUIA 3P8IA 5A5WA 1Q3NA 1GZGA 2GPTA 4QJ1A 3P82A 2TRSA 2XFWA 4JIQA 4EWND 3NQFA 4HHPA 4GC4A 4LVFA 1JCYA 3TR2A 4E0CA 5G4EA 3PB0A 3V1PA 1NF7A 1PS9A 3WFAA 1W5OA 5KZEA 2A5HA 2PRHA 5BMXA 1O4UA 1S5VA 3LCFA 3N34A 2ATMA 5EPDA 3S5OA 5E1QA 1KTBA 1YLVA 1W3TA 5BNKA 3QQ1A 1GTEA 1TPUA 1L6WA 4EF9A 1TV5A 4FB7A 2Q8ZA 2OMAA 3HF3A 4JYDA 1OX4A 1UJPA 1TRIA 3BW4A 2C16A 5I3HA 2NXIA 3LCLA 3IEBA 1ML1A 3LTPA 1BTMA 4OWGA 4UFJA 4AMAA 1JRBA 1HUVA 2Y6ZA 1P4CA 3BGGA 1OVDA 3C61A 2G95A 2A6NA 4ZVJA 1Z48A 4Y90A 3C56A 3V75A 1KA9F 5LGZA 4NJGA 4EOUA 1OHLA 3QZEA 1TPC1 2ISVA 5CZ0A 5AHIA 2QCMA 1FCUA 3LXCA 2P0OA 2YCEA 1KTNA 3HG2A 1TMHA 2OT1A 3L0NA 2Y7EA 3W1NA 4NZJA 4O12A 3TNOA 1I2RA 2VFIA 1VCFA 1RQEA 3EB2A 4QAIA 2BSLA 2YX0A 5FF3A 4NNCA 5D2XA 1AMKA 2FJKA 2X30A 3GVGA 5C55A 3GK0A 4OQVA 4ZMGA 3GDLA 1JCNA 3TIMA 5D30A 1EWDA 4JTGA 4FNTA 1KM6A 2W6RA 5D38A 1OX5A 3NR0A 1AW1A 4NXSA 1ICSA 4JDBA 1N8FA 6TIMA 1QPRA 3N2XA 3ABRA 4AHOA 1LOQA 2VFGA 4OE7A 1QPQA 3EWXA 4XKYB 3L0GA 3THAA 3CIWA 1DV7A 1TPVA 4E38A 4UTJA 3W1AA 4HKPA 3UD6A 1VCGA 4N02A 5AHMA 1K7XA 4Y96A 1VRDA 3NQ8A 1XBVA 2FFCA 3KRUA 1BWKA 3W71A 4FNQA 4MKNA 3GIYA 2I14A 3G24A 3QW4B 4IPIA 3S0CA 3OEXA 1M7PA 1X1ZA 3E0IA 2ISWA 3HPSA 2X1SA 3W7IA 4ZL1A 3SZ8A 1TV7A 4UNLA 3B8DA 3G1VA 4RV8A 4M7TA 4A2SA 3TSDA 2C15A 3FYOA 4BR1A 2GJLA 5GVJA 1DJNA 4K7VA 4NJHA 4QNEA 5T26A 1OF6A 1GG1A 1GVOA 1KM5A 2Z2UA 2A7NA 2CLFA 1WBHA 2Q8LA 3NAVA 3TDFA 1R46A 3FS2A 5I3IA 3LHVA 3TUUA 3MI3A 2VFDA 2ZQ0A 2FIQA 3R2GA 2WO5A 5K9CA 3W23A 4RZ5A 4WUIA 3QJAA 4PL2A 1Y0EA 3PBUA 4HN4A 3W76A 2A2IA 3BK0A 3CTLA 2YXGA 3W83A 5D33A 1HO4A 5AYZA 2QDGA 2R94A 3VFLA 1UASA 1Z44A 3UYCA 4RX0A 5K3VA 4MYAA 4N9DA 2WSRA 1WOAA 3DH7A 3G1XA 2TMDA 3ZR4A 3HPXA 3ZWSA 4LVAA 3M47A 4WY0B 5G1YA 5FF7A 2V30A 2VFEA 3VI2A 1XI3A 3LHWA 5CKSA 3MI6A 3DFPA 5DXXA 3I68A 3IGSA 3L21A 3D0CA 3GKFA 3NPXA 5G1TA 1TO3A 4Z1AA 4UTMA 2ZZ5A 4O14A 2E6AA 2JKPA 3W7KA 3W70A 5EA9A 4O57A 3C2FA 3BV4A 2PRLA 3L67A 1W5NA 1W31A 3M5VA 3IGXA 3O15A 3DBPA 4RXFA 3EXTA 3NGJA 1SW3A 1OK4A 2DZPA 1SZNA 3STCA 4K36A 5D2WA 1SZGA 3WJWA 4X22A 2Y89A 1I2NA 3VE9A 1C29A 2F84A 6ALDA 1ZALA 2EPHA 2ZYFA 4UUIA 4A21A 3C0JA 1J4EA 1S5WA 2WNZA 3LM7A 3NL6A 3GXTA 5G2WA 2QCFA 4N9EA 4TIMA 1TREA 2LLEA 3WJZA 2YW4A 1TTQA 4OBTA 1B9BA 3PSWA 1W37A 3Q2DA 4Y8FA 4JTUA 5K2ZA 3F4WA 1MEWA 2GVLA 2H8ZA 1BEUA 2V82A 4UXDA 4O16A 3QQ0A 4O19A 3W7GA 4AB4A 4IUOA 1D3GA 3QSRA 1QFEA 1TTPA 2YSWA 5J5DA 1W3NA 4DQWA 2PE4A 5FF0A 4LUIA 1C8VA 4ICNA 4JNMA 4LWWA 2YFOA 3NL2A 4W9TA 4CNPA 3EKZA 2VENA 3MP4A 1PL9A 3T40A 1WA3A 2ZZ4A 4YCPA 5K4ZA 3EX4A 3UWWA 1DQXA 4NU7A 1VS1A 3JR2A 1OFBA 3O1NA 4ZQMA 1LP6A 1SPQA 1JCJA 3DKJA 1VPXA 2Y63A 1P0NA 3SGZA 3U8GA 4PTNA 2DZVA 3CEPA 1VLIA 2CLKA 3EX3A 4PCFA 5EY5A 4DBEA 3G1YA 3MO7A 5AN7A 4N9CA 1RQBA 4CCDA 1IIGA 4IQLA 1O5XA 2CZDA 2VFHA 4JXCA 3KFTA 4R34A 2HS8A 4HT3A 4KFNA 4M6QA 3TMQA 3F4NA 4ALDA 2V0TA 4UC5A 4PH6A 4X2RA 4ADTA 1AG1O 2C0AA 4GXMA 1WXJA 1G4EA 3A5VA 2XN0A 2W0UA 3RMJA 1J2WA 2CZFA 2NWSA 4R7JA 3P84A 1FX6A 2WV8A 2G96A 2Z1BA 1D3HA 4E2BA 1YTEA 5LGXA 3P80A 3W7DA 4JTIA 4EIVA 3T7VA 3BLIA 4R53A 3IVUA 3M5XA 2Y88A 3GR7A 3NPWA 2ABBA 5U7SA 1LM1A 5AC7A 3P61A 4IJBA 4YCOA 1KFCA 3DI0A 2X1RA 3UWVA 3HG5A 2QJHA 2OCZA 2ZZ7A 4O17A 3HG4A 1T8XA 2QJGA 1GVQA 1K7EA 2AGKA 4O28A 3W7JA 3M41A 3O05A 2ZCGA 1HFBA 1DBTA 2OZ0A 2A21A 3QPZA 3L2IA 4Q33A 3W2LA 1XDLA 3RU6A 1UB3A 3P67A 1LROA 3W73A 2A85A 4FX6M 1QPNA 3AO0A 2Y7GA 4ZZ9A 3HPZA 2ATSA 1FXPA 1PCKA 3W72A 1HO1A 4GWEA 4BK9A 4WY0F 4S1FA 1KM4A 2J6XA 3T4CA 5F1UA 3BLEA 5D04C 2DZTA 3LTSA 4YXGA 3W7OA 1ME7A 1QO5A 1TCDA 1WV2A 2VKZG 5DCEA 3TC7A 3TH6A 4DBDA 5AYXA 4GUJA 1QO2A 1RR2A 3C2EA 1JCXA 4MVAA 2VEPA 2QCEA 1W3IA 1U83A 4XUGA 2FPYA 3N9RA 3PBVA 1ZAJA 1XBXA 2FB2A 1KM3A 3M7WA 1I2QA 1MZHA 2NX9A 5KTLA 4L4LA 2NUYA 4IMDA 1OFRA 3UQNA 1L9WA 2ZTJA 3DI1A 5CPOA 2H3BA 2QCNA 2HSAA 4U4MA 5AC6A 3GLCA 5DELA 1G4PA 4Z08A 2HS6A 2QCGA 1LOSA 2NX3A 5I3GA 5K7JA 3O06A 3G1FA 1RPXA 1SR9A 3PAJA 2GUUA 2NXHA 4JTLA 1Z42A 2WSQA 3TFCA 4X3ZA 4AAJA 2E68A 3W2UA 3CEUA 2ZA3A 3BW2A 5AHLA 3IIXA 2J9XA 4ML9A 3GB6A 4J9JA 4O1BA 4RCXA 3W84A 3LXAA 3W2KA 3BVJA 4ORIA 5CSSA 4CQAA 1TPWA 3N19B 3SJ3A 2I9EA 4HPJA 1TTIA 1S5TA 3G1AA 3CQ0A 3M44A 5AC8A 1R2TA 2FLIA 1UCWA 4O0KA 5HWMA 4O8RA 4R33A 3C52A 1LBLA 4UTWA 2Y85A 4RZ4A 5I3JA 1A50A 2WPBA 4X9SA 3W1PA 3NQ6A 4M6PA 4JN6A 5DBUA 4O0ZA 2YFNA 3DAQA 5HWNA 3C8FA 3L5AA 5FEZA 1VC4A 2CLIA 4WXYA 5D37A 1H7OA 4K38A 1LORA 4JX4A 1O95A 3W1UA 3W75A 4YL2A 3QRHA 4KKXA 1DOSA 3DFSA 3G0SA 3TW7A 5BMWA 2CLLA 2Y7FA 2CZEA 3E12A 4KFOA 4UTWC 4AF0B 3KAOA 2DP3A 2QCDA 2J24A 3STFA 1R2SA 1WOBA 1QNVA 2C18A 4MOZA 1W5MA 5HWJA 3UWYA 3QSTA 2DZXA 4NZFA 1YPFA 4JX5A 2CW6A 2C3ZA 1GWJA 3CB8A 2ZZ6A 2CZ5A 3EX1A 2JGYA 4O52A 4ZQRA 2E5CA 3W1TA 4UR7A 4FIQA 1PV8A 3QF0A 1ZFJA 1BKSA 2NUWA 1EP2A 3RLVA 2CLHA 1IF2A 4O1AA 1EA0A 5G2IA 1LBFA 3LHZA 1YDOA 3MI2A 5HINA 3TV8A 1EWEA 3W1LA 3H54A 1HL2A 3TX9A 3N2MA 1UUOA 1G4SA 1WBJA 3DHFA 3LERA 3NDOA 3HG3A 5EMUA 1F7BA 5FESA 1FWSA 4RKAA 2GJNA 1A5CA 3Q94A 1Q6QA 3NL3A 1G6CA 4MZ1A 4WQ6A 5FEPA 2E6FA 4ADSA 3EWZA 5LHFA 4O53A 3PWAA 1MSSA 2VEKA 4GJ1A 4UTIA 4PFMA 2F7FA 2ZRXA 4HNUA 4GE8A 3O63A 5D32A 1KFKA 5F2MA 3EX2A 1EIXA 3W85A 1GOXA 3WK1A 1KFEA 1F76A 1GJPA 4JY9A 3DZ1A 1VLWA 2PCQA 4XBSA 1GQNA 1ICPA 2QUVA 3LCGA 4IX0A 5MHBA 3NL5A 2RHGA 1W54A 4FX7A 3EX6A 3YPIA 4N4PA 4FXSA 4AHPA 3PG9A 1W5QA 2H6RA 3NO5A 4LS1A 3W7NA 3QPYA 1FQ0A 3LCWA 3O6CA 3TQVA 2E5BA 1F6PA 1KLZA 1VYRA 2Y62A 4H3DA 3I7QA 4JEQA 1JVNA 1SQ7A 2RDUA 1JULA 3I7SA 4YWIA 3ZS4A 4AH7A 5CG7A 3QEZA 1T0OA 2X2GA 4KWWA 1PE1A 1JQVA 2WOQA 1VCVA 1I45A 1VJIA 5BW6A 4FXRA 1VHCA 5EYWA 2YGYA 1GTHA 2OT0A 1VR6A 1TYGA 3P5ZA 4OU1A 5D09A 3Q37A 3UZ5A 4DELA 2Z0IA 1YPIA 3P60A 4JYFA 3SSJA 3HOJA 3N14A 4EVZA 1T96A 4IPJA 1LLZA 3PBWA 3TCEA 3GXNA 2ZRWA 4JTSA 3MWAA 3BG3A 1YXYA 3S5ZA 3MP3A 3W86A 3DU0A 4PODA 4HIBA 3NQDA 3PULA 4IMEA 1IIHA 3CLMA 3NZ1A 3W2NA 3W22A 1FDZA 5F4WA 4QM1A 5LKYA 3G1HA 1L6YA 4AWSA 1AW5A 3FFSA 1OYAA 3O16A 3E49A 1VHNA 1R47A 5J5RA 4UFLA 4O4WA 5F4XA 1XL9A 3LBMA 1KTCA 1GYNA 5F1VA 1K7FA 2V2CA 4DXVA 5KZMA 1OFQA 4OV4A 3L68A 5HQEA 1P0KA 2HMCA 3T78A 2VELA 1ZCOA 3FKKA 1W8SA 1DJQA 5DCBA 4QISA 3HQ1A 5D2VA 1VH7A 1ALDA 2QR6A 5AYYA 1KW1A 2ABAA 5KITA 2WKJA 4FO4A 3IVTA 1JCLA 5LHEA 1R30A 2BWGA 3L5LA 2ZBTA 3U2OA 4DF0A 3TK7A 3C2OA 3W88A 3STGA 2IQTA 3O6DA 4MPQA 3W6YA 3KRSA 3QYQA 1H7WA 3BO9A 3MJYA 3M0ZA 2JKAA 3TU9A 1ZENA 3PBYA 5DY2A 4K7YA 2Z6IA 5I3FA 4UMCA 1MXSA 4JS3A 4DO6A 3NM1A 4LOCA 4EF8A 4DF1A 4MZYA 3HMJG 2NWRA 4QIUA 3M5YA 4C1LA 1FWTA 3I6RA 3EWWA 2X1UA 3RF9A 2A4AA 3DFTA 3W1QA 4MUZA 1H62A 1H63A 5AHNA 1C9DA 5D03A 4GBUA 2GQ8A 2PRMA 3DFNA 3W7MA 3LOTA 3MHUA 5EKYA 4UTHA 2X1TA 3S1XA 4TR9A 4O11A 4UR8A 3PF3A 3A24A 3GAKA 3SFKA 1SW7A 3HB9A 1XUUA 3GNNA 4DO5A 1VYSX 3G3DA 2V81A 1XKYA 4UTTA 4E2DA 3GDMA 1LRQA 1R2RA 1LOLA 4OV9A 1VQTA 3FOKA 2VC6A 1X1OA 3INPA 3HGOA 1ONRA 4GRSA 1G7VA 1SUXA 1H5YA 4UFKA 1G4TA 4Z1DA 5K9DA 2QEZA 1XDMA 3C2RA 5CPNA 5HNRA 4OT7A 4POCA 2VFFA 3MMTA 3NEVA 5C6MA 1LDCA 4N6FA 2P10A 3DXIA 1JCMP 1K8XA 1ZNNA 4O50A 1OG0A 1B4KA 3B4UA 1WDWA 3BARA 1NFBA 2C1HA 3IIVA 5DN1A 2C13A 1LYXA 4UTTC 3B04A 1RD5A 2P1FA 2QUTA 1CW2A 2H3DA 3B0PA 5K4XA 1GG0A 4JTEA 1SZEA 1SFLA 2YPIA 2ZA1A 1FWRA 3FKRA 3C2VA 3S1UA 3W87A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3KX6A

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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