3L0K | Genus

Total Genus 101

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	101
sequence length	257
structure length	257
Chain Sequence	MELSFGARAELPRIHPVASKLLRLMQKKETNLCLSADVSLARELLQLADALGPSICMLKTHVDILNDFTLDVMKELITLAKCHEFLIFEDRKFADIGNTVKKQYEGGIFKIASWADLVNAHVVPGSGVVKGLQEVGLPLHRGCLLIAEMSSTGSLATGDYTRAAVRMAEEHSEFVVGFISGSRVSMKPEFLHLTPGVQLEAGGDNLGQQYNSPQEVIGKRGSDIIIVGRGIISAADRLEAAEMYRKAAWEAYLSRLG

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Lys314 is a nucleophile in non-classical reactions of orotidine-5'-monophosphate decarboxylase pubmed doi rcsb
molecule keywords	Uridine 5'-monophosphate synthase
molecule tags	Lyase
source organism	Homo sapiens
total genus	101
structure length	257
sequence length	257
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 2.4.2.10: Orotate phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date	2009-12-10

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00215	OMPdecase	Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3l0kA00

4ADUA 1RD5A 2EHHA 3TMLA 4NZFA 2WQPA 3NYZA 5U7SA 4ORMA 4CCDA 1W31A 1GVOA 4U4MA 3LCXA 4JTUA 3R89A 4CQ8A 3UY8A 2QCEA 1FWSA 2CLEA 3W83A 4Y8FA 3IGSA 4LVAA 4JICA 2CLMA 2EKCA 3PF3A 3UWYA 2QAPA 1DQWA 3H55A 3QW3A 3QPYA 3N14A 3NR0A 4KFPA 2YCEA 4FNTA 1TYGA 4MOZA 1ZAIA 2Y7DA 3DKJA 4Y9AA 3QQ0A 1UUOA 3GXNA 2ISVA 1IXPA 4JNMA 5AFDA 4JTKA 5D03A 4AHPA 3OVRA 3FA5A 1TB3A 2B7NA 5AB3A 4PL1A 3UYCA 3QRHA 3PR2A 3F1QA 4O19A 2WSQA 1OFPA 3NGJA 3MHUA 5D33A 4D2JA 3E96A 4E0CA 4MLJA 5IBXC 3G1DA 3TQVA 4O8RA 3W2KA 3VKJA 4LUIA 1MEHA 1JULA 1H62A 1NF0A 2V30A 5LNRA 1TPDA 4K37A 4UFMA 1I8JA 2EPHA 4N02A 2A1YA 1GTHA 4R33A 2DZPA 2DORA 2Z6JA 4AXKA 1O94A 3NQ2A 5CZJA 3G1YA 3W2MA 3W7DA 1TO3A 4OHQA 4UXDA 3U6WA 5HWJA 3FS2A 4Z1AA 1DOSA 2WNZA 3N19B 4JTJA 1X8FA 2C18A 5F4SA 3P60A 1K8XA 2JBMA 3FIGA 3HG5A 5TBOA 4BFAA 1MXSA 3TFXA 1H61A 1VGAA 7TIMA 1KTBA 1QFEA 1H63A 3BG3A 4Q32A 3IIZA 3N9RA 4MFEA 2GUUA 1D9EA 4AEOA 3MBDA 3UPWA 3HG2A 1FCBA 3PUEA 5FEZA 3TXZA 1ICSA 2J27A 3DAQA 1C8VA 1SU5A 4HT3A 1DL3A 2VENA 1XUZA 2PRHA 2GJLA 2ZA2A 2VFFA 1SZFA 1QWGA 4MY9A 4KFNA 4LNYA 4CCEA 1JCNA 5LGZA 4ZQOA 3NQFA 5T26A 4XKYA 1PV8A 3ZFHA 3NPWA 1OX5A 3O1NA 3CEPA 3C2RA 3HOJA 3PBVA 1TTIA 4IWWA 5KSWA 3CM4A 1GZGA 1XC4A 2V81A 1S5TA 2R14A 3LBCA 2DZTA 4O1AA 2JGQA 3LCHA 1JRCA 5A5WA 3M5XA 4HNNA 3P62A 1EUNA 1LROA 5LSMA 3KRSA 4O0ZA 1GG0A 2Q8LA 3CB8A 3CPRA 3HO8A 3NVTA 2ZA3A 2V8ZA 2QCGA 4JYFA 3RFAA 2ZQ0A 3GDRA 5CKSA 3S5OA 3W1UA 3PBWA 2CLKA 4CNOA 2AGKA 4WUIA 1XKYA 3LOTA 3W2LA 1OK6A 3W1QA 3GNNA 4XUGA 4PEKA 3W85A 1TPH1 2V9DA 2Y85A 1KFJA 5KZEA 4N4PA 1F74A 1IIHA 2HSAA 4FNPA 1GEQA 5F1VA 4O12A 1SZNA 3DFTA 5G1TA 2PRMA 4O4WA 4IXXA 3KVJA 3OEXA 4O28A 1W56A 1VYPX 3NZ1A 3VE9A 3QW4B 3LX9A 3O07A 3KAOA 1QR7A 1LRNA 3HPXA 3HQ1A 5DY2A 2B7PA 2RH9A 2A4AA 2QUUA 3QMTA 3GKAA 4JIQA 2TYSA 3FFSA 1A5BA 1HUVA 4ZQCA 1GPWA 3TQ0A 3MUXA 1IF2A 4UTIA 4O18A 3THQA 2GVJA 3W1RA 3G3MA 3GLCA 4FNSA 1QO2A 1GWJA 5K4XA 4QITA 3C8FA 5AOUA 2QF7A 3B05A 4N9DA 4LRSA 3QSTA 1XM3A 1Q6LA 4LRTA 2DZXA 3UQNA 4ZQPA 3DBPA 4EVZA 1NSJA 5DCDA 4M6QA 3CEUA 1Y0EA 4Z1BA 1H1ZA 1ONRA 2V2HA 3UXDA 3W7OA 3EWBX 2NXIA 2QJGA 4JTGA 3RU6A 4EF8A 2NX3A 5KZMA 1Z42A 2Y6ZA 3LHTA 4CCCA 5K7JA 1OFBA 3NPVA 4TMCA 3TMQA 1P0NA 2ZZ5A 2FQIA 1KW1A 1KFEA 3PC0A 2ZZ6A 4CQ9A 3MMTA 1YTEA 4AH7A 4MY8A 1EB3A 2NUWA 3O6DA 1Q6OA 2J6XA 2V82A 1M7PA 4N6FA 2E5DA 1AMKA 1GVRA 2QCHA 2RDWA 1G7VA 4AVFA 2WJZA 4O52A 3GDMA 3WK0A 2YYTA 2VEMA 4N6EA 2QDGA 3TAOA 4GC4A 3S1XA 1SO3A 4JTSA 3ZWSA 4AWTA 3U2OA 3DGRA 2E5BA 1TPVA 3T4CA 3W1PA 3W72A 3W7QA 5H91A 3C61A 5BMWA 1WXJA 2FFCA 3BW3A 2X1SA 2B4GA 3GZ3A 1VYSX 3WJYA 4UFJA 2WPBA 4JXCA 4MVAA 5DBUA 2QJIA 3M44A 5LNUA 2V5BA 3UZJA 3K30A 5L9FA 1KV5A 4BWLA 2NV1A 1YPFA 1JCLA 5F1UA 5FEWA 5U4NA 1F6KA 1MO0A 3E02A 3NDOA 1S3HA 3B0PA 4LS0A 5EYWA 4U28A 3WFAA 4Z1DA 3LCIA 2I1OA 2NX9A 2WO5A 3FEMA 4POCA 5C2XA 2BZNA 3EKLA 5D2VA 3DFPA 4I9AA 3S9YA 4IQLA 3DHDA 3TSMA 3NEVA 4MZ8A 3M47A 3LCLA 1N7KA 5HWNA 1O5XA 3R5EA 3L9CA 4FNRA 1OFEA 1MEIA 3N34A 2H90A 1CI1A 3ZWTA 4UTKA 3IGUA 3EWXA 5FF2A 4DPQA 2CLLA 3TJLA 2Q8ZA 3UWVA 3LM7A 4K8EA 3ABRA 2OJPA 3P84A 5AN7A 4LW7A 4Y96A 1XDMA 3C2VA 4JN6A 4WJEA 4BI6A 1QCWA 2ATMA 5D2XA 3P74A 2AQWA 4HNTA 4TMBA 2ISWA 1WQ5A 2GQAA 1XBXA 1W3TA 3NQCA 4UTJA 2Z6IA 3O15A 3V1PA 3LB0A 1WX0A 4JIPA 5IM51 4EOUA 3O6CA 1YTDA 1L6YA 1XL9A 2ZRVA 5G4EA 4UCGA 3CWNA 4LC8A 1KM6A 1KM4A 4H4IA 3LV5A 2WNNA 4WX2A 3D0CA 4RLIA 2O7SA 4K7YA 1LP6A 1W3NA 1JVNA 2YSWA 2AAMA 1G67A 3W3OA 3UWUA 1B3OA 1A50A 4MY1A 3W1AA 3LLFA 1OFRA 5C6MA 2YX0A 2E5CA 4LTSA 4JYEA 4M5PA 1M5WA 3EX4A 3L0KA 1VCGA 1VR6A 2LLEA 4UR8A 1KM3A 4JTLA 1G4EA 3LCFA 3W1MA 4NJKA 1QDSA 4FXSA 3JR2A 4NJGA 3QFEA 1P1XA 4X2RA 2JKAA 4LVBA 3NO5A 5AYYA 2C15A 1OHLA 4N9BA 3P82A 4LV9A 4ZQMA 1YDOA 4AHOA 4GWEA 5EPDA 1XDLA 3TR2A 1EWDA 3UZ5A 2OMAA 3C2EA 1IXQA 3UPBA 5AHLA 2ZRZA 4GE8A 4BK9A 2F7FA 3GDKA 3MI6A 3PUDA 5EKYA 4MJZA 3NAVA 2NX1A 3S42A 1TPC1 3W9ZA 4GUIA 4IGHA 5KITA 3PBYA 3PG9A 4UTTA 4ZZ9A 2VFHA 3G1VA 2J9YA 5I3GA 4GBUA 3S5YA 4K38A 5LKYA 1Q45A 4EIVA 2HS8A 4P2VA 5FF3A 2JKPA 3EX2A 2RDTA 4GRSA 5AYZA 2EAWA 3DI0A 1PIIA 2ZZ7A 2FPTA 2J9ZA 4KWVA 3W2UA 3NQ7A 3B04A 1JQVA 3WK3A 3GDTA 2A0NA 3W23A 4I7WA 1JUEA 4L4LA 2DZUA 3A24A 4RXGA 3M5VA 1W5OA 1LBLA 3NQ8A 1I2RA 2Z0IA 2V2CA 3W88A 3R8RA 5HUPA 5C5YA 2X1TA 4UMCA 1RQHA 3LCWA 3NQMA 3MBFA 3GXPA 2ZCGA 1LOLA 1H7PA 2Y70A 4P61A 1DORA 2ZFAA 3LGEA 3MP3A 5G2IA 1UCWA 2QUTA 2GQ8A 3W7GA 1M7OA 1Z44A 3UWZA 4NJHA 2VXNA 5E1QA 1KM2A 1TTPA 3SFKA 3BO9A 1ICQA 4I7UA 3R2GA 4O16A 3I65A 1QMLA 1TPFA 4WXZA 4MKNA 1TRIA 4RZ6A 4UTWA 4LU0A 1FBAA 1UJPA 5ABTA 1W37A 2XN0A 2FIQA 2YW4A 1OX4A 3P67A 1DBTA 4NX5A 3W1NA 1KTNA 3G8EA 4GUJA 4GUHA 4KWWA 3MI3A 1KFKA 2X1UA 4FNUA 3SIZA 1HFBA 5G2HA 3W7HA 3P80A 4IMCA 2H8XA 1FDYA 4MFDA 3W7NA 4ONVA 3ZS4A 3TDFA 2CU0A 1DVJA 3CIWA 4UFLA 3G1FA 4JYDA 4Z08A 5DXYA 4K39A 2BTMA 4X9SA 2VC6A 2IQTA 3HG3A 3W07A 1XBZA 2WOQA 4M7SA 1W1ZA 3W7JA 5CPOA 4LS1A 1XBYA 5HR7A 2J24A 2CZFA 4UTMA 5K2ZA 2ZA1A 1A5AA 3S5NA 5HULA 3W7KA 3LBMA 4JY8A 2ALDA 1SZGA 3W1LA 2PC4A 3L0NA 4FXRA 4R34A 3L0GA 4A29A 4CNNA 1C9DA 1Q6RA 3HGJA 3P8JA 3F4NA 4O50A 1R2SA 2QKFA 4NJIA 2F84A 2VFDA 3CU2A 3MHGA 1OF8A 4JDYA 3L5MA 4JTFA 1JRBA 1TJRA 1DKWA 2WSRA 3LHWA 4MYXA 5F2GA 3G24A 5CPNA 4QAIA 5D2YA 5AHNA 3EKZA 3NQ6A 3C3NA 1EP3A 4KFOA 1TIMA 4R53A 3Q37A 2ZZ2A 4PCFA 1T0OA 1JCYA 2Q3RA 2VFIA 3B4UA 5G1YA 1L6SA 5GVJA 4UNKA 5LNSA 4YCPA 3ATZA 1TQXA 3E9AA 4LVFA 3TXVA 1U83A 1ME8A 1E51A 1OYBA 3PUOA 4HNUA 3S1WA 2X30A 2X2GA 4O14A 1KM5A 3G1AA 3OBKA 1YXDA 5BW6A 5F2LA 1W5QA 4ZQRA 5DY3A 3INPA 3PB2A 1VCVA 3C2FA 3FYOA 2E6AA 4X3ZA 1FQ0A 5D32A 3W7CA 4O13A 3TFCA 2XN2A 2QCDB 1M6JA 3S5ZA 2A5HA 2OZ0A 1IXNA 4GNJA 3NPXA 2FJKA 3NM3A 2A7NA 3PY2A 4DBDA 5J5DA 4DO6A 2A7RA 4PC8A 1WOAA 3BARA 1HL2A 3WJSA 5CGQA 1HO4A 1VZWA 5DLCA 4MZYA 3RK8A 4S2BA 4JY9A 3C4UA 1TV5A 6ALDA 2XFWA 1I2NA 4FIRA 3GIYA 4E2BA 1FWTA 4A3UA 3HGSA 2QCNA 1SZEA 2QCCA 1VLIA 5I3KA 1HTIA 3MYOA 4LS2A 4L4MA 2GOUA 3TKFA 1EIXA 5MHBA 3TC6A 3TROA 2J9XA 3NOEA 1PS9A 4M6VA 2CW6A 3W2NA 1TPUA 2RFGA 3W73A 5KMYA 4BI5A 1QNVA 3PB0A 3TNOA 1SO4A 2VKZG 1EX5A 1OFAA 3RLVA 3V75A 1KLZA 1AW2A 1JR1A 3W7PA 2QDHA 3IIPA 4XQ6A 4HPXA 1K03A 2FPYA 4NJJA 3NNTA 2R8WA 2YYUA 4UIOA 4TIMA 1JJKA 4DELA 2Y61A 3ABOA 1L6WA 4QIUA 3KHJA 1YXCA 1KFBA 2E1DA 5E0KA 3IIOA 4NNBA 4IX2A 4ZQNA 3M6YA 5DELA 3OVPA 4A21A 1FUYA 5LHFA 3B0VC 1IXOA 2TMDA 3E49A 1KBJA 3W7RA 1SO5A 1B4KA 2E6DA 5LNWA 4M19A 2QJHA 3OHIA 1L9WA 2ZRWA 4YMZA 4A22A 5C54A 2FPVA 4QSHA 3IGXA 4DO4A 3LRKA 1ICPA 4IUOA 2ZZ1A 1HO1A 5AHFA 1YLVA 2VOMA 2A85A 1WBHA 2JK2A 2NXHA 1FXPA 1Q6QA 4O57A 4UTTC 2V5LA 5IBXA 2C1HA 2DZSA 5DBTA 2VEPA 1PHWA 2C6QA 3M0ZA 4GUGA 3MW7A 1K7XA 2ISSA 4LVDA 3KX6A 1AL7A 3O63A 3ANYA 3B8DA 4RR4A 1QPOA 4HNVA 3NL2A 1K02A 3LTPA 3LV6A 3LI0A 3NPUA 1H7WA 5HWMA 4Z1CA 1S5VA 3BGJA 1J2WA 4OV9A 2ATSA 4NUWA 1W0MA 1VYRA 5AC7A 3C56A 3IRDA 4LY8A 4WD0A 4JD4A 4M6PA 5AC8A 4MPQA 3THAA 3IEBA 4IOTA 5AC6A 1AW1A 4FO4A 3VE7A 3BLIA 5G4WA 1TTJA 3L5AA 3B03A 2DJXA 4HPJA 3KRUA 1CW2A 4UTLA 3EXRA 4UFKA 1OFOA 2CZDA 5EMUA 2VFEA 2DJLA 5BRBA 4OE7A 2YFOA 3TAKA 4M7TA 2FB2A 3A23A 3N2MA 2ABAA 1AK5A 1PCWA 2CFFA 4A2RA 1QO5A 3TW7A 3DH7A 4JX5A 1ALDA 1OF6A 1JUBA 2BWGA 2ZYFA 1A53A 1QOPA 2Y7FA 1THFD 2QEZA 5FF7A 4NXSA 3RF9A 1W5NA 1D3GA 4Q33A 4O17A 3S1VA 3SZ8A 4HN4A 2CLFA 5FF0A 3GX9A 1QPRA 2DU2A 4OU1A 1EPXA 1I2OA 1DV7A 1DJNA 4FHAA 3WK1A 5C55A 1OYCA 2Y88A 3TQKA 2P1FA 3OIXA 2E6FA 4GFSA 3QF0A 4IXHA 1I4NA 3L68A 3USBA 3HB9A 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3LXAA 3PVFA 3FKKA 3FLUA 4JTHA 1R47A 1OFDA 5FEXA 4MYAA 3OG3A 3W7EA 4DF0A 1WV2A 3LTSA 2KZHA 1MZHA 1LRTA 1FCUA 2OT1A 4K6AA 3STEA 5DCEA 1ME9A 2CZEA 3CLMA 5D30A 3E0IA 3LERA 3NL6A 2YFNA 4IPIA 3T55A 2C3ZA 1H7OA 1QOQA 3GR7A 1FCVA 4LOCA 3NM1A 3BG5A 3QH2A 4OT7A 2VEIA 1P0KA 1K7EA 1BWLA 4QJ1A 2FTPA 3STFA 1W5MA 4PODA 4XBSA 2QUVA 1ZY9A 3L67A 4DEFA 4UUIA 3PWAA 1WDWA 4OV4A 3CTLA 4OGZA 4RZ4A 1R2TA 3CC1A 2E68A 3G8RA 1K8ZA 1EA0A 5AYXA 1MSSA 1GYNA 3I7SA 2TSYA 1KV8A 3N73A 5CZSA 1NAL1 3DFQA 1ZAHA 3BLEA 2TRSA 4IMDA 3GK0A 4O15A 3GDLA 3I6RA 3GVGA 5EY5A 3SGUA 3MP4A 3W70A 1F05A 3QC3A 3LRMA 4UR7A 1H7RA 1OABA 3NQEA 2VELA 3QMSA 3PG8A 2CLHA 2A7PA 3HPZA 1EUAA 3EWWA 1MEWA 3YPIA 1YADA 3OVQA 3NXFA 3O16A 2DZWA 3TX9A 3S6DA 3TSBA 2A6NA 3G1HA 3G1SA 4QNEA 3RLUA 4H3DA 1ZCOA 3IIXA 4DO5A 1KFLA 1X1OA 5HQEA 3BGGA 1OYAA 3RNDA 1ZAJA 3W1XA 3QZEA 2XN1A 3GB6A 3VFLA 1H7XA 3W71A 1TV8A 1N55A 2ZDRA 1I45A 2QAFA 1O95A 3KVLA 4EWND 3PAJA 1ZJIA 2E77A 4UFIA 3DFSA 4JX4A 2B7QA 1ZENA 2C14A 3QMRA 2CLIA 4JTTA 1OJXA 1U5JA 3EXTA 4UC5A 2FB3A 2HMCA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3L0KA

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