3L0NA

Human orotidyl-5'-monophosphate decarboxylase in complex with 6-mercapto-ump
Total Genus 93
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
93
sequence length
255
structure length
255
Chain Sequence
ELSFGARAELPRIHPVASKLLRLMQKKETNLCLSADVSLARELLQLADALGPSICMLKTHVDILNDFTLDVMKELITLAKCHEFLIFEDRKFADIGNTVKKQYEGGIFKIASWADLVNAHVVPGSGVVKGLQEVGLPLHRGCLLIAEMSSTGSLATGDYTRAAVRMAEEHSEFVVGFISGSRVSMKPEFLHLTPGVQLEAGGDNLGQQYNSPQEVIGKRGSDIIIVGRGIISAADRLEAAEMYRKAAWEAYLSRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Uridine 5'-monophosphate synthase
publication title Lys314 is a nucleophile in non-classical reactions of orotidine-5'-monophosphate decarboxylase
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 93
structure length 255
sequence length 255
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.2.10: Orotate phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2009-12-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3l0nA00
4UMCA 1N7KA 1A50A 2DZXA 1Q3NA 1QOPA 2P10A 2QAPA 4O28A 4WD0A 1LRTA 3GX9A 2GQ9A 3W72A 1FWWA 4KWVA 5TQLA 4K6AA 4CNPA 1TPH1 1VHNA 3LHWA 2VEKA 3GVGA 3KOFA 4N9BA 1KV8A 3GKAA 1LRQA 2B7PA 1TREA 2E6YA 3NXFA 1KTNA 3PUOA 4H3DA 1BWLA 1JCLA 4UMBA 5F2IA 4LU0A 4DF2A 3C56A 2ZYFA 2QCMA 4MOZA 3NAVA 4QSHA 1FY6A 3SW6A 3G1FA 1W54A 4UTWA 3IVSA 1UBSA 3GDMA 2PRLA 4IXXA 2GQ8A 1RPXA 3S5NA 3L5AA 1SZGA 1FDJA 3W76A 4A2RA 3GDTA 5E0KA 1EEPA 4O52A 5FF4A 1KFEA 2PCQA 1DHPA 4IQLA 3SR7A 5AHIA 3TAOA 3UWWA 3NZ1A 3TMLA 3M5ZA 3HGRA 1TCDA 2Y62A 3P60A 5I3KA 5D2XA 4MFDA 2YYUA 3M5VA 3SIZA 3HGJA 4LV4A 3SGUA 2JGYA 4UUIA 3IIPA 1QOQA 1TPC1 2C6QA 3NPUA 5D05A 2OT1A 1ADOA 3LB0A 3N73A 4RZ4A 3G1AA 4OE7A 4CCCA 1EA0A 5LNSA 5EPDA 3W87A 4CCDA 1JRCA 4JYEA 2B7NA 3B03A 4FIQA 1XC4A 3BLEA 3UZ5A 1TSIA 3PUEA 1LP6A 1OFRA 1Z48A 1CI1A 1TTIA 1OYAA 1TJRA 2ABAA 3U2OA 1EWDA 2RKXA 3TAKA 1NF7A 2HS6A 3FS2A 4JX4A 4JTFA 1W0MA 3L2IA 1YDNA 5F4WA 4MVAA 2CZEA 4UTJA 1AK5A 4NJIA 2QEZA 2Q8LA 3O8AA 1JUEA 3LHZA 2QCNA 3R12A 2VEIA 2QCDB 2HS8A 2V0TA 4CQ8A 3NL2A 3BVJA 1OX6A 4O16A 4XKYB 3MHGA 5G5IA 4ZL1A 1AL7A 1FCBA 1EB3A 4HSOA 4CLMA 1ZFJA 2J27A 1KBIA 4TMCA 4WXYA 2E5CA 2G5WA 5CPLA 2JK2A 4HPXA 3TQVA 1GVQA 3L68A 4O10A 2B7OA 3QYQA 2EAWA 1M6JA 2ABBA 1VH7A 3EWBX 1RQBA 5L9FA 3U6WA 4LVFA 4RLIA 2OZ0A 2DZWA 3EX1A 5EL1A 3CM4A 3LHVA 2E6FA 3DXIA 3DZ1A 2Q3OA 4JICA 3UD6A 4LY8A 1TPUA 1LBMA 1BEUA 1FX6A 4WY0B 3T44A 2DZPA 3LHUA 3O63A 3FIGA 1SFLA 1X7FA 5G2HA 4CCEA 1R46A 3WJWA 3PB0A 4WOQA 4DO6A 4L4LA 5G2IA 3RLUA 3TMQA 3DBPA 2Y7DA 4O18A 4FNTA 5I3FA 1M7OA 4QNEA 3HIJA 3W1RA 1ICSA 1WXJA 3F1QA 4HHPA 1MSSA 2YFNA 1H5YA 4EF9A 2ZQ0A 3S5YA 3NQMA 5DLCA 2VC6A 3D0CA 4BI5A 3FOKA 2H8ZA 1N55A 3M0ZA 2GVLA 2X2GA 3EXTA 2DU2A 1VQTA 4NX0A 4CQAA 3DKLA 1YXYA 1VHCA 1P0KA 1XXXA 3DHDA 4RZ6A 2GQAA 3BARA 5EA9A 4UFKA 4K7YA 2OT0A 4UNKA 4WZHA 5AYZA 1S5VA 2E5DA 4JNMA 1WX0A 1OF6A 3N14A 5HWNA 1T96A 4JTJA 1IXQA 2CLFA 2D73A 2V2HA 3A22A 3W2JA 2ZBTA 4AB4A 1GT8A 4BFAA 3W07A 2CZFA 2Q8ZA 1ZCOA 4QIUA 3NZRA 3PR2A 3UWQA 2ZFAA 4PODA 5J5DA 1LBLA 4CQ9A 3LLFA 3M7WA 1HUVA 3NL6A 1JJKA 1QDSA 3KX6A 3W75A 2O7SA 1SFJA 4RCXA 1XCFA 1JCXA 1Z41A 2RH9A 3M1ZA 1WYIA 3SSJA 2QCLA 1RD5A 3EWWA 3FLUA 3S0CA 3W2KA 4PA8A 4NT0A 4JDBA 5C2XA 3Q94A 4HPJA 1JQVA 1QO2A 3N9SA 4JIPA 1H61A 1W5OA 3O6DA 4HSNA 3GIYA 4NNAA 5DBUA 3QMSA 4PH6A 3NQVA 4Z0JA 3ABRA 5D30A 4QJ1A 1XDMA 4GBUA 4I7WA 4EWND 1H51A 4FO4A 1M7PA 4LV9A 2E09A 4JEQA 2R94A 3NQ8A 4E38A 3MI6A 1LOQA 3NPWA 3MI3A 1DVJA 4EVZA 2RHGA 3W7HA 1L2UA 4A2SA 1GTEA 1FWSA 2AQWA 4O12A 1K8XA 4JN6A 2DP3A 5LGXA 1EPXA 1XI3A 4UMAA 3HB9A 5CZTA 2C13A 4O1AA 3USBA 1D3HA 2YW4A 4AMAA 3S9YA 5AN7A 3P84A 1R30A 5KINA 2EPHA 3NA8A 4X3ZA 3TQ0A 3ZFHA 4EF8A 4IOTA 4D2JA 2X1RA 3R13A 1JCNA 1ZNNA 2WV8A 5D2TA 5SWUA 2O7QA 3GNDA 3G0UA 1JCMP 3MHFA 1TRIA 2YSWA 3PBUA 1OVDA 2Y63A 2QCFA 1VS1A 3O6YX 3THQA 1LROA 1FWRA 3NGJA 3W74A 2ZTKA 4AWSA 2JKEA 4NJHA 2W79A 3PSVA 1B4EA 1W5MA 3PG9A 4ORIA 3LTPA 1OFEA 2JKPA 3DI1A 3G22A 5K7JA 3W88A 1SZEA 4QNWA 3BG5A 5AHMA 3KVLA 3I65A 4ZQCA 3DFQA 5CGQA 4GUJA 4UTTC 1P0NA 5KMYA 1PV8A 2WNQA 3DFSA 3DH7A 1SW3A 2ZZ2A 3TV8A 4GUGA 2VEMA 3YPIA 4IPIA 3IGSA 4CNOA 3L65A 3QFEA 5HR7A 4HNVA 2NV2A 2QJIA 1KM2A 3LRMA 3UPBA 3W2UA 3OBKA 2TPSA 2ZRVA 5FEXA 1JULA 3ATZA 3GDRA 3MP3A 2FLIA 2VFDA 3EB2A 3UWYA 2Z6JA 2H3BA 3TU9A 2YCEA 4E0CA 3DFNA 2Y70A 2TYSA 5AC7A 4MKNA 2CU0A 4YXGA 1I2PA 2A7NA 1W8SA 1H63A 1GJPA 3O16A 3B0VC 3CHVA 2NUWA 2V5BA 1RR2A 4ZQNA 3UWUA 1EP1A 3PBWA 3ABQA 3GAKA 2FTPA 4FX8A 3VE7A 3MWAA 2X30A 3EX3A 4N02A 4BF9A 5HJLA 2QDGA 3P62A 2Y88A 3NG3A 3B8DA 3IIZA 3WK3A 3H55A 1TTJA 3EXRA 2I9EA 1H62A 2Y7EA 2YX0A 2CFFA 5D04C 1PS9A 1JUKA 4HT3A 1VCGA 4S2BA 3M5XA 5EYWA 3F4NA 4Y6GA 1YYAA 4RXFA 4DELA 1HG3A 4O1DA 3ELFA 3G1HA 5HWJA 2JKAA 4TO8A 4OV4A 3BV4A 3BW2A 3C6CA 1QNVA 1IXOA 4ML9A 3CQ0A 4FNRA 2YW3A 3PVFA 4FXSA 1SW7A 1SO4A 1ZENA 5AC6A 2J9XA 4MIMA 2QCDA 3GYEA 2CLEA 4DQWA 3CIXA 5HUPA 4FNUA 4MY1A 4XKYA 4Z1DA 3UXAA 3PC0A 3OEXA 4GUFA 4O53A 1JQXA 1QAPA 1GPWA 2NXGA 2VENA 3C4UA 3INPA 1M5WA 3S6DA 3HMJG 1W3NA 2NX1A 3W7EA 4MLRA 3TA6A 3G1DA 2DJLA 3FYOA 1D9EA 5DCBA 4O4VA 1FCVA 1GQNA 3IGUA 2J9ZA 1SZNA 2VFHA 4JY8A 4IMEA 2KZHA 3H54A 3SGZA 3VI2A 2ZA3A 1Q6QA 3EX2A 3C8FA 1EP2A 1KFJA 1TQXA 2Z2UA 1KLYA 4A21A 1LRNA 3LXAA 3CEPA 2CZDA 3VNDA 4R7JA 4ZQMA 2GOUA 3W2LA 4WY0A 4IGHA 2ALDA 3QF0A 2R8WA 1KBJA 2HSAA 2QUTA 3V1PA 1TTQA 5FEPA 1KM3A 1GVSA 2EGZA 2CLOA 2A5HA 4N2YA 5D02A 5HWMA 1W5NA 1TPDA 1A53A 1VC4A 4I7VA 4XBSA 3LCGA 5IM51 2FIQA 5DBTA 2A21A 1LLZA 2ZZ7A 4O17A 4IMGA 1OK6A 2VEPA 3VCRA 3ABSA 3CU2A 4AAJA 1VGAA 4QISA 4Q32A 5I3GA 3C2RA 1MO0A 2C3ZA 5FF2A 1AL8A 3MHUA 2R14A 4O19A 3STFA 4AHQA 1TQJA 1K7EA 4O50A 3N34A 5HUOA 1VCVA 2FB2A 4KKXA 2ZRZA 4IPJA 4MZ8A 4LS0A 2W0UA 5FF0A 3N2MA 4TIMA 4YMZA 4EOUA 2XN2A 1KFBA 3L0GA 1FCUA 1GYNA 1KM4A 4QITA 4WXZA 4IX0A 2ZZ3A 1ML1A 4QQ3A 3UWZA 3C52A 3G8RA 3HGOA 2FPYA 5BRBA 3NQ2A 4NXSA 2YDAA 3TROA 1YPFA 4YLWA 2C19A 4UR7A 5HNRA 1C29A 1KLZA 1PHQA 4A29A 1Y0EA 3E12A 2JBMA 2QUUA 3HQ1A 1A5CA 3KRZA 4LT9A 4JTLA 3ZWSA 3S1UA 4LUIA 3SI9A 1PE1A 4WOZA 1W31A 3NYZA 2A6LA 1FDYA 2FQIA 3CIWA 3GXNA 1NF0A 2WNNA 4ADSA 1EUAA 5D2VA 5F1UA 1L9WA 1QR7A 2A2IA 3HPSA 3C2VA 4IMCA 4JS3A 2IQTA 3PUDA 1H7NA 3L9CA 2B4GA 3UY7A 3W84A 5AFDA 5DXYA 1VYPX 3M43A 4O0KA 1XFBA 2C15A 1QO5A 3QEZA 3LBCA 2C1HA 1VYRA 1GVOA 5K3VA 4GE8A 5DCEA 3KAOA 4N6EA 4UTUA 3LCXA 4X2RA 2GVJA 5KZMA 3SY5A 1OHLA 3W2NA 1RZMA 4B5NA 4C1LA 2YZRA 1CX9A 1VCFA 3W23A 1IXNA 4IXHA 2GJNA 1BWKA 3PBYA 3GZ3A 3OHIA 3P74A 1F6KA 4RR4A 3W7DA 4GUHA 1K8YA 4UC5A 3S42A 1AW2A 2FB3A 3MYPA 3A5VA 5F1VA 3BLFA 1K8ZA 3MYOA 5GVJA 4E2DA 5KZEA 3THAA 3DFOA 4Y90A 1L6WA 2BLEA 4UIOA 3CWOX 5CZ0A 3GNNA 1A5BA 2WSYA 4BWLC 4TMBA 3F03K 4A3UA 1I2RA 1WDWA 1X8FA 4O4WA 1RV8A 4FHAA 1B4KA 1G4TA 1UUMA 2FDSA 3AJXA 1LCOA 2PRHA 3TSDA 5LSMA 4RX0A 1KM5A 3P7YA 2WKJA 5BW6A 1F5ZA 1DOSA 1A5SA 3TFCA 1G69A 3TJXA 3WK1A 3BGJA 1OABA 2J9YA 2FPVA 1WOBA 3W1XA 1I2OA 1K7XA 2QJGA 5CPNA 1FUYA 2AGKA 5L6UA 1OX4B 2XFWA 3GDLA 1JRBA 2QJHA 1XBXA 3FKRA 2GVGA 1FQ0A 1B9BA 2E68A 2X1UA 1LLWA 3W85A 1F73A 1AG1O 1OFOA 1F74A 1G67A 3WJYA 1SSDA 3DFPA 5AC8A 2OJPA 1GOXA 4OV9A 1I2QA 2DZVA 5EMUA 4ADTA 3G0SA 3EWYA 3LRKA 4UFJA 4UTMA 1OFQA 3CC1A 4JYFA 5AB3A 1G7UA 1QCWA 4Z1CA 4JGDA 2WNZA 3DHFA 1H7XA 4GWEA 3IEBA 1WQ5A 4Q33A 5D38A 3W70A 2CW6A 3DENA 4O57A 2I14A 1W5QA 3PSWA 3S1WA 2VFIA 3OVPA 1YXCA 1TPEA 3BG9A 4GUIA 5DELA 4NVTA 2G97A 1Q6LA 4AWUA 3W7OA 4AF0A 3GXPA 3NVTA 3SJ3A 1VYSX 1O60A 4DBDA 1FXPA 4IWWA 4AXKA 3WK0A 3WJSA 4BWLA 2HTMA 2V30A 5BMXA 4W9TA 3PULA 3PM6A 1K02A 1JCYA 3L0NA 3NOEA 4JR5A 5KITA 2RFGA 3N3MA 1LM1A 4K37A 3MW7A 1F2JA 1RVGA 3L0KA 3ABOA 5LNWA 3NQAA 3ZR4A 1X6UA 1HL2A 1MEWA 2QCGA 3NM3A 2BSLA 4A22A 1THFD 1J2WA 3L66A 3NDOA 4LVBA 1UB3A 5KSWA 3O07A 4DO5A 3P61A 1PCKA 3TK7A 3A5FA 1O5XA 1OFDA 2BTMA 3MJYA 3BGGA 1UASA 3R89A 2V5LA 3MI2A 3IVUA 4UFMA 4R33A 5D2WA 3VFLA 4CNNA 1IGSA 4K38A 2ZDRA 5LNRA 3DGRA 3G18A 1LTDA 1ME9A 3M41A 5K4ZA 3E49A 3GDKA 3JS3A 2BWGA 3DI0A 1SO5A 3W2MA 5D03A 4YL2A 3AO0A 1XBVA 3T40A 1O5KA 3PB2A 3STGA 3UPWA 4XWUA 3DFTA 3QM3A 1WBJA 4JD4A 3N19B 5E93A 2CLHA 3I7QA 3QJAA 2C14A 4PCFA 2CZ5A 4OHQA 4MFEA 3W1NA 5ABTA 4ZQPA 1W56A 2E5BA 1N8FA 3HF3A 3CTLA 2TMDA 1SUXA 5KZDA 3BK0A 5FESA 2G96A 3I7RA 3E9AA 2X16A 2J24A 4JTIA 1AMKA 5H2ZA 3EKZA 4QM1A 1H7RA 4WX2A 3W7JA 1A5AA 3H53A 4NJJA 1U83A 4S2CA 4UR8A 3PF3A 2I1OA 3PG8A 2H6RA 3EWXA 1XL9A 4RZ5A 5FEWA 3FFSA 8TIMA 5CZSA 1GG1A 5H91A 4FB7A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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