3LGEA

Crystal structure of rabbit muscle aldolase-snx9 lc4 complex
Total Genus 140
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
140
sequence length
363
structure length
349
Chain Sequence
PHSHPALTPEQKKELSDIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKRCQYVTEKVLAAVYKALSDHHIYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKYSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGVTFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSNHAY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Mechanism of aldolase control of sorting nexin 9 function in endocytosis.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase/protein binding
source organism Oryctolagus cuniculus
molecule keywords Fructose-bisphosphate aldolase A
total genus 140
structure length 349
sequence length 363
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2010-01-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00274 Glycolytic Fructose-bisphosphate aldolase class-I
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3lgeA00
1H7NA 3G1SA 3C52A 5LKYA 1GOXA 1P0NA 4LV4A 5D09A 1WXJA 2VENA 3HG4A 3S9YA 3HQ1A 6TIMA 1IGSA 1VCGA 3H54A 4AWUA 4HPJA 2CLOA 2ZZ3A 2QCDA 4PH6A 1LRNA 5MHBA 4MFDA 3HB9A 3NQMA 5BW6A 2QAFA 3SIZA 2JGQA 1EB3A 5CZSA 2QAPA 4UR7A 5DXYA 3RLVA 2ZQ0A 3G0SA 4M5PA 3UXDA 5D2YA 2GPTA 4UUIA 2GQ9A 3TAOA 1YLVA 1V5XA 3TKFA 2PRHA 1LORA 5HULA 1N55A 4MZ1A 5DCDA 2QJHA 4JN6A 3F1QA 3L21A 3B0PA 3EXSA 5I3JA 1YDOA 1NEYA 1TCDA 1ICQA 1DJNA 2OX1A 2VFIA 3E0IA 5AOUA 2FB3A 5HMSA 1VPXA 2H3BA 1TJRA 2Q3RA 3MBFA 4Z1DA 3HG3A 1G67A 1FWWA 4FX8A 2I9EA 2FPTA 3W75A 3GYEA 4Z1BA 4KFOA 3LHYA 1VCFA 3M6YA 1MEIA 3W7NA 2BTMA 4XBKA 5CG7A 3G3DA 3TC7A 1VCVA 4Z08A 3OBKA 5DCBA 3UWQA 3GR7A 2E68A 4M6VA 3WK2A 2BWGA 2NX9A 4P2VA 2EKCA 2V9DA 5EMUA 2TSYA 2NUXA 2C14A 1OFPA 4RZ5A 3W2JA 4XZ9A 4JTUA 4UC5A 4FB7A 5HR6A 4FNUA 3UZ5A 3PY2A 2GVGA 5E0KA 3LGEA 3NNTA 3MHGA 2QDGA 5KZDA 3W2MA 3L2IA 4E2DA 4LNYA 3NQAA 3S1UA 1ADOA 1SW0A 3THQA 4HSNA 2V2DA 4NZJA 3A5FA 1KTNA 5HUPA 2Z2UA 4JYFA 1Q6QA 4KKXA 3P62A 4KFNA 1OYAA 1KBJA 5D05A 3NL5A 3T78A 4AB4A 4A21A 1W37A 1P0KA 2JKPA 1UASA 4P61A 4Y96A 1TSIA 5H2ZA 5CGQA 1KBIA 3LTPA 3W3OA 4ADUA 3MHUA 1XXXA 2NXIA 1ALDA 1OFBA 1SO4A 2Y62A 2DZXA 3EWBX 1I8JA 3QJAA 5I3HA 3TR2A 1NAL1 3R13A 3LCGA 4MLJA 4Y9AA 3TFXA 4G1KA 1PCWA 3MHFA 1KM0A 4X9SA 4M19A 2Y85A 3QEZA 2FIQA 1ZENA 4JTIA 1JULA 1C9DA 4UNKA 3BO9A 3C3NA 5FF0A 3C4UA 3I7QA 1I2QA 2OT1A 2BSLA 1BKSA 2ZZ4A 3S1VA 4JGDA 3NA8A 1TJPA 2C6QA 3HOJA 4J9JA 3TQ0A 2FTPA 2QJGA 1K3UA 2B7OA 1H5YA 4O12A 5BRBA 1Z48A 4TU1A 4JICA 1AG1O 3T4CA 3R2GA 1UCWA 5G5IA 3PVFA 3R12A 3B05A 4FIRA 1ZCOA 2RDWA 4UTTA 3W07A 4HT3A 1EPXA 5F4XA 3O6YX 2PRMA 4YXGA 5A5WA 1KV8A 3WJZA 3NXFA 3LB0A 1JCLA 3RMJA 1B4KA 3M0ZA 3TX9A 1ME9A 2EGZA 1OX4B 1DKWA 2QKFA 2FPVA 3LM7A 1OFRA 1QCWA 2ATMA 3TU9A 1KTBA 1BWKA 1SZEA 3IIOA 1FCQA 3H55A 2P1FA 1VHNA 2Z1BA 4RZ6A 5SWUA 1SZGA 1OVDA 4JNMA 5KZMA 3HG2A 1ICPA 3B03A 5K7JA 4JTTA 3GR8A 3GKFA 2H8XA 8TIMA 3WK1A 4JEQA 3R89A 3G3MA 1DBTA 3E49A 4PODA 3PUDA 2Y89A 3IGUA 3FS2A 2X1UA 3BG3A 2A2IA 4Z1AA 1O60A 3EWXA 4DEFA 1HL2A 3W9ZA 2DZPA 2YFNA 3T40A 3P80A 3S8HA 1YTKA 1PS9A 5C2XA 1FBAA 1GVQA 1KLYA 3BPWA 3TQVA 2RHGA 2G96A 1IXOA 1QPOA 3S1XA 2GUUA 2QUVA 3STGA 1OFEA 1EP1A 1H51A 3NZRA 3N2MA 2YYUA 1SFJA 1F73A 5FI8A 1DQWA 1FXQA 1TB3A 1OK4A 3OEXA 3W85A 5HWNA 3EXRA 2VEIA 4X2RA 1OK6A 4Y90A 1OJXA 2CLLA 3NQFA 1LROA 3CU2A 4UFIA 4IXHA 4TX9A 3E12A 4TO8A 1ZAJA 4NJJA 3NO5A 1O94A 3PUEA 2Q8LA 1ZJIA 1LYXA 1YDNA 3HJZA 2G5WA 3TV8A 3G24A 4PEKA 3GLCA 3USBA 4GNJA 1IIHA 3G0UA 1TREA 3OG3A 3O6DA 1VC4A 2Q8ZA 1Y0EA 1P1XA 4CCEA 4LRTA 3LHVA 4BWLC 3W7PA 1LTDA 3MBDA 2ZRWA 1H7WA 3AO0A 1SPQA 4CNOA 4JR5A 3S1WA 1VYSX 3EXTA 2I14A 3CB8A 3PSVA 2HMCA 2YX0A 2H6RA 5D2VA 1VYRA 5KTLA 1T99A 1FY6A 3PBWA 2B0MA 2G95A 5EL1A 6ALDA 3W7GA 1DHPA 1M5WA 1B3OA 1I2RA 1G6CA 1SU5A 3A5VA 4ZQNA 2DZVA 3S0CA 4RZ4A 3BARA 2ZRXA 1PVNA 3TDFA 5G4WA 1W3NA 2NWRA 4R34A 4YCPA 3EWWA 4M6PA 3Q58A 3DFNA 2EHHA 3FFSA 4JXCA 1VHCA 3QF0A 4OBTA 4KWVA 4XBSA 2TPSA 4JD4A 1SUXA 4AWTA 3IGXA 2BXVA 5AHMA 1EUAA 3THAA 3LDVA 3S5YA 1PCKA 1W5MA 1A5BA 1S3HA 2GQ8A 1KW1A 1XUZA 1SQ7A 5K9DA 1R47A 4JTJA 1BTMA 4WY0B 3B8DA 3VFLA 1FCVA 4UMAA 4AF0A 4GBUA 1LBMA 2H8ZA 3UWYA 2C13A 1YADA 1DV7A 1RQHA 4TIMA 1ME7A 3OA3A 3BV4A 3DI0A 5CZTA 2AGKA 4O54A 4E38A 4AVFA 3FYOA 4XKYB 2W79A 4W9TA 1WBHA 1F2JA 2Y88A 3QZEA 2DJLA 4ICNA 1P4CA 5BNKA 5IM51 3JR2A 5DBTA 2X1SA 2J24A 3DI1A 3C6CA 3LCLA 3HO8A 3NG3A 2CU0A 4FNSA 3W7MA 3DHDA 3KVMA 1R46A 2W0UA 5AYYA 4ZMGA 3UWUA 1B9BA 3PC0A 5C55A 1SZNA 4POCA 3W2LA 3UWZA 1J2WA 2PURA 1F76A 3YPIA 2JGYA 2YDAA 3LXCA 3WFAA 1XDLA 2RKXA 2E5BA 5LNWA 1FXPA 1LLZA 4NJHA 5HNRA 3NQGA 1THFD 3HPSA 3C61A 3JS3A 4ZQRA 5EPDA 3FLUA 4ADTA 1A5CA 5FEZA 5D04C 3HG5A 3LV6A 1LOLA 1W54A 3MI3A 3P74A 4NJGA 1MZHA 2A5HA 3NM1A 3QSRA 5DBUA 2VFEA 3PM6A 3ZFHA 4O52A 1VLWA 4PFMA 4QITA 1GYLA 1R2TA 1WYIA 2YYTA 2NV1A 1RD5A 2QEZA 5LHEA 4PCFA 3B04A 5AC8A 3SW6A 3OVQA 5FF2A 1G4EA 3GZ3A 1IIGA 4AEOA 5L9FA 4ZL1A 4MY9A 3TNOA 3Q37A 1FDJA 3M5ZA 4FNRA 1XUUA 3NZ1A 2NUYA 1EP3A 3PBUA 4GXMA 1D3HA 2C18A 3P5ZA 3EX4A 3GXTA 5HR7A 1O5XA 2Y7DA 4BI5A 3BW2A 4JY8A 1PV8A 3QM3A 3VI2A 1YXCA 4N6EA 3C2RA 5D2TA 5D2XA 1TQXA 4PL1A 4PC8A 1ZY9A 4B5NA 5U4NA 2A7NA 1SZFA 2RDUA 5AHIA 2FJKA 1QO5A 4MLRA 3A21A 2VOMA 3UYCA 3FJ6A 3NL2A 2H90A 3NL6A 3GX9A 3O63A 4NVTA 3C56A 1VS1A 1OFQA 4JTEA 1X1OA 1SO5A 3LRKA 4CQ8A 4WZHA 1CX9A 4YLWA 1XBYA 4JDBA 5TQLA 1SW7A 1IXQA 1CI1A 3BG5A 4S1FA 2FQIA 3O05A 3TJXA 1LDCA 3TIMA 1Z41A 4N4QA 4UTHA 1EUNA 1AL7A 3BK0A 2B7PA 4UNLA 3RK8A 3L5AA 1TV5A 4UTTC 3M47A 1SSGA 1PHQA 4EF9A 3LBCA 2OMAA 3PR2A 4NUWA 1GWJA 1OFOA 1EIXA 2ZBTA 3ZWSA 1E51A 2CLHA 3R5EA 3LX9A 2Z0IA 2FFCA 3W76A 2OJPA 4AWSA 1A53A 4UIOA 4CQ9A 3UD6A 3W86A 2D73A 1A50A 4UMCA 4BFAA 1GVOA 3W1NA 1N7KA 1W3TA 4DPPA 4UXDA 3PBYA 4IMCA 1A5AA 2B4GA 1GYNA 1JUKA 3W1RA 1JCYA 1GJPA 3N3MA 4LVGA 3STCA 1YTDA 4LU0A 3IVSA 3KAOA 3G18A 4K7VA 5CZ0A 2QCDB 3DFPA 5HUOA 4AMAA 1TQJA 4AH7A 2FLIA 3TH6A 4IUOA 1Q6RA 4MVAA 1JCJA 3W1PA 1T0OA 1XBVA 2R8WA 3ABRA 1ZALA 4NJKA 3HIJA 2ZRYA 2DJXA 3FJLA 4NQ1A 1PIIA 1KM4A 4JTKA 2VEKA 3LBMA 4RJEA 3FEMA 3NQVA 3UQNA 3EKZA 3NQ6A 1JCMP 1O5KA 1NFBA 4NX0A 1IXNA 2ABAA 2WSYA 3S6DA 2UV8G 2E5DA 4I7UA 4RKAA 2AQWA 4CNPA 5EKYA 3GAYA 1NF0A 4H4IA 3QYQA 1KM1A 4PL2A 5FF4A 5LHFA 3BG9A 3CTLA 1KM2A 3SZ8A 5D37A 1QPNA 4XTDA 4WY0F 3TW7A 5I3GA 3DH7A 5F4WA 3W7CA 4ZQCA 3L5LA 4QM1A 1LP6A 2ZYFA 5LGZA 1GVRA 1JQXA 3W22A 4O0KA 1RR2A 3A9IA 2A0NA 1LBFA 3TAKA 1TYGA 4NNBA 5AYXA 1S5WA 4O28A 4O1CA 2ZZ5A 3DZ1A 2WNNA 4NNCA 3B0VC 4DXVA 5FF7A 4ORMA 3LTYA 3RLUA 3IIVA 1SW3A 1FDYA 3OHIA 2ZFAA 3B0UX 1VJIA 5D03A 2V0TA 3LCFA 3IIPA 1TPB1 2VFDA 2ZA1A 3DXIA 3O16A 1XKYA 3QW3A 4CCDA 3W7DA 3Q94A 3FOKA 5K9CA 3W71A 3DGRA 4N6FA 3M9YA 3L5MA 3A22A 3RF9A 1DQXA 1L9WA 3NQ2A 1K7EA 2IQTA 2V81A 3O06A 4GJ1A 4LWWA 3M16A 3LOTA 1MEWA 5LGXA 1JQVA 3S5NA 1LM1A 2EPHA 1LZOA 2VELA 3LCXA 4GRSA 1YXDA 2YXGA 5LNUA 3G1YA 2WPBA 5AHFA 4IJBA 4RXGA 4LT9A 3PG8A 3HGRA 4LS0A 4JIPA 1DJQA 1GT8A 1TMHA 1H7RA 1QAPA 5BMWA 4AAJA 2YW3A 3LI0A 1TPC1 4HIBA 3LCWA 5J5RA 4I9AA 1W8SA 4UTJA 1RQEA 3DHFA 4R53A 3GB6A 3O1NA 4ORIA 1H7PA 5J5DA 2I1OA 3NQ8A 2VFGA 5HINA 1BWLA 1TPFA 3QMTA 4ZQPA 2ZZ1A 3TFCA 4IPIA 5EBUA 4XWUA 3MMTA 4MZ8A 3NR0A 4K36A 2NX3A 1TTQA 5DCEA 3WJXA 2VEMA 3W1TA 1OHLA 5LSMA 4JTHA 3MW7A 3RU6A 2Y61A 1Q45A 2QCHA 1GZGA 2EAWA 3L0KA 3NEVA 4S2BA 4UTWA 4UFJA 3EWUA 2ZRUA 5D02A 1LLWA 5I3FA 2NUWA 1ZFJA 1H61A 3U8GA 1EWDA 1DORA 1B4EA 1YDVA 2V2CA 3G22A 3U6WA 2HSAA 1F05A 2ZRVA 3MP3A 3QQ1A 3TROA 2QCCA 5DY3A 3W7KA 3P81A 5E93A 3RFAA 2CLMA 2QCLA 3DU0A 1I45A 4IGHA 3EWYA 4QIUA 4QSHA 1OX6A 3ATZA 1YXYA 3FKKA 3FYPA 3GNNA 1TV8A 4K6AA 3TCEA 2C3ZA 4L4LA 5A8GA 1R30A 3UPWA 4NNAA 3QMRA 4GWEA 3FA5A 4O16A 3KRZA 3M7WA 4FXSA 2HS6A 4ML9A 4A2SA 4O53A 2NWSA 4IQLA 2DP3A 3ABOA 3P61A 3SR7A 4EF8A 3CIWA 4O8RA 1KM3A 1AMKA 2A6LA 3GNDA 1W5NA 2DZSA 1H60A 1JUBA 3OIXA 5IBXA 5G1TA 1N8FA 2R91A 3NQ7A 3F4WA 2ZA3A 3W1AA 3O6CA 4O10A 3T55A 2ZDRA 4LUJA 1F74A 5CPOA 1UUOA 4XTIA 1W56A 3N34A 3M44A 4OT7A 1M7OA 3CLMA 2ZA2A 4C1KA 1X6UA 4UTKA 5U7SA 2OT0A 4IWWA 1RVGA 1OABA 2WSQA 4UFKA 3D0CA 1XFBA 3V75A 4FNPA 3KVKA 3UPBA 3TE9A 3GDLA 3GDRA 4H6KA 3P5YA 4WD0A 5K9XA 3I68A 2LLEA 4JTFA 4WY0A 2ZTJA 3HGJA 4MKNA 3DFSA 3TXVA 3BW4A 4CLMA 3C2VA 1FWNA 3VNDA 2WO5A 4NX5A 3MJYA 1F5ZA 4DO4A 4K7YA 3EX3A 4BI6A 1LRQA 1O4UA 3W7LA 1T96A 3E9AA 1QPRA 3W7RA 3G0XA 1D9EA 2JK2A 2V8ZA 1SR9A 1DL3A 2PRLA 1MXSA 4MPQA 2CLKA 1ZNNA 4MYAA 4DF1A 4L4MA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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