3LGEA

Crystal structure of rabbit muscle aldolase-snx9 lc4 complex
Total Genus 140
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
140
sequence length
363
structure length
349
Chain Sequence
PHSHPALTPEQKKELSDIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKRCQYVTEKVLAAVYKALSDHHIYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKYSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGVTFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSNHAY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Lyase/protein binding
molecule keywords Fructose-bisphosphate aldolase A
publication title Mechanism of aldolase control of sorting nexin 9 function in endocytosis.
pubmed doi rcsb
source organism Oryctolagus cuniculus
total genus 140
structure length 349
sequence length 363
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2010-01-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00274 Glycolytic Fructose-bisphosphate aldolase class-I
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3lgeA00
2QJGA 1O4UA 3ATYA 3DI0A 2Y85A 1DVJA 4W9TA 5G4WA 1YXCA 5DCBA 4UC5A 4QSHA 1YTDA 4JXCA 3HPZA 4LVAA 4J9JA 4JDBA 4N2YA 4K38A 3E9AA 1L6SA 3B03A 4WOZA 2FPYA 1S5TA 3GAYA 4IMDA 3UNDA 3W73A 3MI2A 2CFFA 3O6CA 1OF8A 3WK3A 1H7RA 2ZRWA 3NQAA 4O4WA 1J5TA 4H3DA 4YLWA 1W5NA 3LCXA 3NDOA 1K8YA 3PBWA 4FB7A 1ZAIA 5F4SA 2O7QA 2Y89A 1O94A 3EX3A 4OV9A 4FIQA 2A7RA 4LC6A 1ZNNA 3CIWA 4FXSA 1A50A 4XZ9A 3TKFA 1VHCA 5G4EA 3I6RA 1O60A 2Y88A 3QRHA 2GQ8A 4PTNA 3R13A 3L0NA 1H60A 4OV4A 4K6AA 4XUGA 2TMDA 1EB3A 3SFKA 1NAL1 5EMUA 2QUTA 5F2IA 5LNWA 5LZLA 4M7TA 4BWLA 3QMRA 4RZ6A 3W7LA 1ME7A 1TPEA 1GVFA 3WK1A 1KW1A 3EWBX 1WYIA 1A5CA 5AC8A 1HUVA 2ZA3A 5AHFA 4PH6A 3M9YA 1TPFA 4ZQRA 4IOTA 4MY1A 5F4XA 5EY5A 1VS1A 1LOLA 1YYAA 3LRKA 3RU6A 4WY0F 3BW3A 2YR1A 3WJXA 4A2SA 4B5NA 5I3FA 3W7HA 3M6YA 1AL7A 3FIGA 3PF3A 1Q45A 3E96A 1UUMA 2DZXA 3N14A 2V0TA 2CLIA 3KOFA 2OX1A 3GZ3A 3U6WA 3NQMA 3M0ZA 4Y6GA 5KZDA 4LY8A 4AHPA 3R5EA 1OFEA 1ZY9A 3GDMA 5FEPA 1BEUA 4E0CA 2OT0A 1ICPA 2FPTA 1Q6QA 2QEZA 3F1QA 1J2WA 2BX7A 1KFBA 1KTBA 1OFAA 3T44A 4IMGA 2CLEA 3G18A 1P1XA 3L65A 3W75A 4CQAA 3UPBA 1WQ5A 2F84A 3N34A 2ZZ4A 2E5DA 5D2YA 3W1AA 4AB4A 4O10A 4DPQA 1VLWA 4UXDA 1K8XA 1LBFA 1NSJA 1QO5A 2A7NA 4RJEA 3NO5A 5C2XA 4AHOA 2VXNA 4FNPA 1SZGA 3NQVA 1B3OA 4FNUA 3W7PA 3TXZA 3GXPA 1R2TA 1EEPA 2J9XA 1QPRA 3LHTA 4WXZA 1YXYA 4ALDA 1HO1A 3C61A 4PEKA 2NX9A 1JVNA 4YWIA 1LRQA 3PUOA 3ZS4A 4CQ9A 3JS3A 4NJIA 1EWEA 4RLIA 5C5YA 1DL3A 3CC1A 3NQEA 4ZQPA 1I8JA 4TIMA 2PURA 3S5YA 1Q6OA 4LVGA 3YPIA 1VCGA 4JTIA 1KTNA 3DGRA 2B7NA 2F7FA 3TMLA 3W1NA 1OX6A 1WAUA 3W1QA 3G0UA 4N02A 4ZZ9A 1EUAA 2WSYA 3GDLA 4JX5A 2V2HA 1AG1O 4FEZA 2J88A 1H1YA 1WOAA 3G1SA 3PY2A 3PB2A 4POCA 4YCPA 2YDAA 3UPWA 4NJGA 4MFEA 3B0UX 2R8WA 3W71A 3HIJA 4WZHA 4Q33A 1UUOA 1OF6A 4IX2A 1X1ZA 2QCCA 4IWWA 3FLUA 1TPDA 3W7KA 2NUYA 3L0KA 3DZ1A 1SW0A 2Q8LA 1H7PA 5KINA 4NVTA 4O16A 1FBAA 2WSRA 1G69A 4PC8A 3S1UA 2CZDA 5D2WA 4C1KA 1NEYA 5K2ZA 2P0OA 3UXDA 3UXAA 1F6KA 1L2UA 2W79A 1HG3A 3NOEA 2R14A 3M7WA 4GRSA 2C6QA 1XDLA 1GWJA 1H61A 2ISSA 4HNTA 5CZTA 4RR4A 5KSWA 3V75A 1H7NA 3MYPA 4N9EA 3RNDA 5D09A 1SO6A 3FFSA 4HT3A 3FJ6A 5EKYA 3H54A 1FX6A 1Q3NA 1VQTA 3G3MA 4GUGA 4NNCA 1LLZA 1VYSX 3UWYA 1YTKA 4LV9A 3TU9A 2GQAA 1GQNA 3OG3A 4RXGA 2E6AA 4JYEA 3P81A 5K9DA 4OT7A 3Q58A 3CTLA 4Q4KA 2C15A 4UIOA 5TQLA 5D2XA 1GOXA 1I2PA 1FCVA 4JGDA 2O7SA 2RHGA 3PBYA 1XM3A 3SIZA 4KFNA 3UWUA 2BXVA 3ABRA 1OFDA 5CPLA 3NZRA 3H55A 2QF7A 3HG3A 4Z1AA 4XKYA 4PL1A 4XKYB 2TYSA 6TIMA 4TMBA 4O57A 4FNTA 3QSRA 3W7QA 1JCMP 1Y0EA 4QITA 4UTLA 1KM2A 3PUEA 5AB3A 2BSLA 2ZRVA 2EPHA 4UUIA 5BMXA 4K7YA 3MP3A 2DZWA 3L66A 1TTQA 1QWGA 1W5QA 1XC4A 4CCDA 1EP3A 5FF7A 3L5MA 3W22A 3ELFA 3P8JA 3L21A 4I7WA 2A5HA 2QAPA 4UR8A 4AAJA 2X2GA 1XBYA 4PCFA 4UFIA 1G6CA 3KX6A 4RKAA 4OE7A 4DBDA 1WA3A 2A7PA 2ZZ7A 3BG3A 1ADOA 4NX5A 3LCGA 3IIZA 3P5ZA 4JNMA 4JDYA 1DORA 3MBFA 4UTKA 2LLEA 5FF0A 4EF9A 4JICA 3GYEA 3GAKA 1PV8A 2E6DA 3B06A 1JCLA 2EAWA 3G0XA 1B9BA 4WJEA 3W7EA 1V5XA 1W5PA 5AHIA 3WJZA 2NUXA 2ABBA 3SY5A 4LVFA 1VH7A 4WXYA 2JBMA 1H7XA 3OVPA 1PIIA 4NZJA 1LZOA 4LRSA 4CCCA 2I14A 1OFQA 2CZ5A 5HWMA 1QPQA 4O4VA 4HPXA 3N2XA 1BWLA 1KBJA 3TA6A 2WNZA 1T8XA 1TSIA 3W7GA 4ADUA 4DPPA 2E6YA 2GOUA 3GNDA 3HG4A 3BARA 3EB2A 3P61A 4JTEA 3PB0A 4JN6A 2NX3A 2Y7GA 3W72A 4R53A 2JKPA 3QQ0A 1HTIA 5HMSA 3TJLA 1GVQA 2HS8A 3WJYA 1FCQA 2CLKA 3Q2DA 3AJXA 3EWZA 1OJXA 3KVMA 2JKAA 3IIXA 4O0KA 4TMCA 1X7FA 4AEOA 3KRZA 4S2CA 1GVRA 3LBCA 3T78A 2DZSA 3DFPA 1TTJA 3B05A 3QJAA 3C2RA 3W1UA 3TMQA 4FX6M 4MZ1A 4ZQMA 4JIQA 4JTHA 5CPOA 3IV3A 5HNRA 4O19A 3KAOA 1JCJA 4LS1A 1GVOA 1LLWA 2B4GA 2YYTA 5AHEA 5HQEA 3GR7A 3BW4A 5HR6A 3G1YA 3GDKA 2UV8G 4K36A 1YDVA 4UCGA 1MZHA 4Z08A 4QM1A 3A9IA 1UCWA 2E5BA 3OEXA 1TTIA 3WJWA 2GVLA 3H53A 4DF2A 3DFOA 2Q3RA 3TUUA 2A21A 3TH6A 2OMAA 3KRSA 3INPA 2PC4A 3F4WA 3QF0A 3L9CA 3DFTA 4LWWA 2C13A 5LKYA 4O15A 5LHFA 3W2MA 2NV2A 4BWLC 2ZRYA 4XWUA 3NL5A 3U2OA 3OHIA 2EF9A 3QFEA 1F7BA 2X1TA 1DJQA 2WQPA 2J24A 2WSQA 3NQ8A 1O95A 3G1HA 3G1AA 5CPMA 2I9EA 1Q6RA 4FO4A 4DO6A 3KHJA 5HUOA 4O0ZA 2P10A 2XN1A 3O63A 4X9SA 5HR7A 1B57A 1ME8A 1VPXA 1P4CA 5TIMA 1I2QA 4JTUA 1GTHA 5DLCA 3KXQA 2Z6JA 3VCRA 3G0SA 4N4QA 3A23A 3PUDA 3K30A 5EBUA 1TMHA 4YL2A 3HBLA 1W54A 3IVTA 2CZFA 5I3IA 1X6UA 5CPNA 5AYYA 4I9AA 3LI0A 4M6VA 2A85A 1SFLA 2V81A 4R34A 3N3MA 2CLFA 3UWQA 3DI1A 1VRDA 3TIMA 3JRKA 1B4KA 2QCLA 1G4PA 3W86A 1F6PA 2HS6A 4MIMA 1DQWA 2Z6IA 4N6EA 3G1DA 5FESA 1ALDA 2QCDA 2QCDB 1ME9A 1JCXA 5DY3A 3CM4A 3QZEA 1FDZA 4UTIA 5AHNA 5K3VA 4CCEA 2RDUA 4E2BA 4O8RA 1G4TA 3FKRA 3W2UA 3P62A 1KM6A 1ZFJA 4JTFA 3W7DA 1KFJA 4NT0A 3MWAA 3LHUA 3BK0A 3PSVA 2X16A 3QQ1A 4JIPA 3IIOA 1AL8A 1OX4A 1OX4B 4L4LA 1QOPA 3LRLA 5AC6A 2QJIA 1QAPA 1AW5A 1S3HA 3IIVA 3NXFA 1TO3A 1M7OA 1N55A 1I45A 1OFRA 4K8HA 2GPTA 3BG9A 2P1FA 3L5LA 2E09A 3WK2A 4A29A 1HO4A 3NVTA 3T55A 2FIQA 3MW7A 1XKYA 3USBA 3TAOA 4JTSA 1XBZA 4XTDA 1QR7A 3LXCA 4LT9A 3U8GA 2WNQA 4DELA 3A21A 5D38A 5I3KA 3BPWA 1JRCA 3TQ0A 3IGUA 2V5BA 4Y9AA 4ZVJA 4ZQOA 4NX0A 3C52A 3FYPA 3DFSA 2EGZA 3NAVA 4G1KA 1MEIA 5DXXA 1M7PA 3A5FA 3CB8A 3HGJA 2CW6A 2RKXA 1N7KA 4DF1A 1H7OA 4O11A 3T4CA 2A6NA 4HPJA 5DBUA 3O16A 3PC0A 1KA9F 2ZRXA 4MY9A 2BTMA 2PRLA 3W23A 4MUZA 2ZFAA 2YFOA 3M41A 3N2MA 1VYPX 1TPH1 3EXTA 2Q3OA 3NQ7A 5D02A 2DZUA 1K03A 4LW7A 2YCEA 3SGUA 2CU0A 3MYOA 2CLOA 3SW6A 3EX1A 2ZZ3A 2CLLA 1EUNA 3STCA 1QPNA 3A22A 1TQXA 2VFGA 3LTPA 2RDTA 1P5BA 2A1YA 4ADTA 4MLJA 4NXKA 1FWWA 3C0JA 1JCYA 3GVGA 3O05A 3GIYA 3TQKA 4IQLA 3TFXA 1KFLA 2C1HA 2CLMA 1K02A 4PODA 2KZHA 3BVJA 5F1UA 1W5MA 1XCFA 2YPIA 1PE1A 3OBKA 2Y7EA 3S0CA 4P2VA 1LCOA 3FS2A 3SJ3A 4MJZA 2ATSA 3S5OA 1AW2A 1VC4A 3S1VA 3TSMA 5L9FA 3TAKA 3OA3A 3C3NA 5J5RA 1J4EA 1C9DA 1A53A 3TR2A 1D9EA 4QIUA 1LM1A 2YXGA 3GXTA 3W2NA 4HSNA 1I4NA 2Y70A 1WXJA 1K7FA 4UFMA 5CZ0A 4HSOA 2ZDRA 2V2DA 4JYDA 2ABAA 3W88A 2DZVA 5F1VA 1LRTA 4HNUA 3THQA 1X1OA 4O54A 1G7UA 3OVRA 1W3NA 1H50A 2J9ZA 4M7SA 3W85A 2NZLA 3S5NA 3D0CA 4ORMA 1XFBA 3FYOA 1K7EA 4ZMGA 3B4UA 2TSYA 2ISVA 3N9RA 3EX4A 4FIRA 3F03K 2X1SA 4K7VA 1TV5A 2Z2UA 5KITA 5BW6A 1DHPA 3MUXA 4YCOA 4L4MA 1DKWA 1F74A 1TJRA 2GJLA 3I7SA 2JKEA 1FDYA 4Z1BA 5HULA 1U83A 2FTPA 3O8AA 1GYLA 1IXQA 3UWWA 2V9DA 3HJZA 3I7RA 1O5XA 3S1XA 1D3GA 1KV5A 2ZCGA 5DELA 4PFMA 5EYWA 3NR0A 4HNNA 4EWND 1H5YA 1TPUA 3LBMA 2E1DA 4FNQA 1FUYA 3L2IA 3NM3A 1GT8A 3PAJA 3TSDA 2G96A 1LRNA 3I68A 4HHPA 2XFWA 3TXVA 4UTWA 4WX2A 3STFA 3W1PA 3PVFA 3KRUA 4FXRA 3FEMA 2X30A 3M43A 3MHFA 3O15A 4RXFA 3R2GA 1UJPA 3LB0A 4AWUA 3GKFA 4M19A 1FXPA 5CKSA 3HG5A 4I7VA 1FXQA 2DORA 3N19B 1B4EA 2H6RA 5LNRA 4JY8A 2ZTKA 1EA0A 2FB2A 1OFBA 3E12A 1ZALA 4FNSA 1EWDA 3NPXA 2GQ9A 4DO4A 4CNOA 2YW4A 4UTMA 4RZ4A 2WPBA 3G1FA 3W7CA 3G22A 3TFCA 4KWVA 1LDCA 3W84A 3RF9A 5HJLA 4O17A 1GZGA 2C14A 2NXHA 1VCVA 2NXGA 1FCUA 3JR2A 1W5OA 3W07A 3DBPA 3SR7A 3UD6A 3V1PA 1XBVA 1Q6LA 1R2RA 3DXIA 3ZWTA 5FEZA 3S9YA 1AMKA 3W83A 5AHLA 3QPZA 5I3HA 3MHUA 5FI8A 5KZEA 4MLRA 3S5ZA 3NQCA 1KLYA 3IIPA 2PRHA 3BG5A 3LV6A 4JS3A 1E51A 1PCWA 3P5YA 3NPWA 3BW2A 4BK9A 5CZJA 1Z48A 4UMCA 1OX5A 4E2DA 1K7XA 1ZAHA 4OGZA 3P82A 1FWNA 3DFQA 3PR2A 2QCEA 2XN0A 1WV2A 3LTYA 1SFJA 5CSRA 2E68A 2VFFA 5D2TA 5K4ZA 1LOSA 1SQ7A 3MP5A 5GVJA 4O28A 3WK0A 3DHDA 2R91A 3TROA 4O52A 3LRMA 4MYXA 4IUOA 1TRIA 3RLVA 3GXNA 4XBKA 1H7WA 5DCEA 2ISWA 1P0KA 2C3ZA 1F5ZA 2RFGA 3G8EA 4WY0A 1YDNA 4WY0B 3IVUA 3QH2A 3S8HA 3IGXA 3Q94A 4YMZA 3EWUA 1F05A 5FF3A 3NQDA 1MSSA 4NNAA 2BLEA 5AN7A 1LROA 1DBTA 2YGYA 3NPUA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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