3LHYA

Crystal structure of the mutant i199a of orotidine 5'-monophosphate decarboxylase from methanobacterium thermoautotrophicum complexed with inhibitor bmp
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
218
structure length
218
Chain Sequence
VMDVMNRLILAMDLMNRDDALRVTGEVREYIDTVKIGYPLVLSEGMDIIAEFRKRFGCRIIADFKVADIPETNEKICRATFKAGADAIIVHGFPGADSVRACLNVAEEMGREVFLLTEMSHPGAEMFIQGAADEIARMGVDLGVKNYVGPSTRPERLSRLREIIGQDSFLISPGVGAQGGDPGETLRFADAAIVGRSIYLADNPAAAAAGIIESIKDL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Conformational changes in orotidine 5'-monophosphate decarboxylase: "remote" residues that stabilize the active conformation.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Methanothermobacter thermautotrophicus
molecule keywords Orotidine 5'-phosphate decarboxylase
total genus 81
structure length 218
sequence length 218
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.1.23: Orotidine-5'-phosphate decarboxylase.
pdb deposition date 2010-01-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3lhyA00
1G4SA 2QDHA 1QR7A 2H3DA 2WSRA 3W83A 1ZAJA 1KFEA 4O15A 5F1VA 2QJIA 4UMCA 3TAOA 4NZFA 3I65A 4UIOA 3PY2A 2OT0A 3INPA 2VFFA 4MLRA 4Y96A 2CFFA 4MUZA 3TSBA 4N2YA 1TQJA 2E68A 4HIBA 2FFCA 3CQ0A 4NNBA 5SWUA 3S5YA 1D3GA 1TTIA 2QCGA 1H7XA 4X22A 2BTMA 5D2TA 4WD0A 4NU7A 1H50A 4EVZA 3NM1A 4YL2A 3TH6A 1KV5A 4E38A 1ZJIA 1EP2A 4M7TA 4AVFA 1SW0A 4AXKA 4MFEA 4NVTA 3NL6A 2E6AA 5F2GA 1ICSA 5EL1A 3VKJA 3HPXA 4Y90A 1A5AA 3PSWA 1EP1A 2J6XA 3NR0A 4GXMA 4A22A 5KINA 3E49A 4H3DA 1N8FA 4NXKA 5HMSA 3W72A 1JQXA 4QM1A 4UXDA 2I14A 4R7JA 3W1PA 1TYGA 3E12A 3EXTA 4UFHA 5CZSA 1MEHA 3SECA 1K8YA 1W5PA 3NVTA 4PTNA 1L6SA 3G1YA 3OHIA 2I1OA 1G4PA 2VFHA 3QQ0A 1UJPA 1QPNA 3B0PA 1EPXA 2Y88A 3IGUA 3K30A 1QPRA 4NXSA 3WJSA 3CT7A 3QF0A 4GUGA 4LRSA 4FF7A 3ZWTA 3PB0A 1XDLA 4DO5A 4PC8A 3PB2A 1FCUA 4ZQRA 5C6MA 2ZA2A 4O1AA 4QISA 1KFKA 4LC8A 2AAMA 4JEQA 5J5DA 3HB9A 1RV8A 4BF9A 2ZZ5A 3W3OA 5D32A 1WAUA 4I7WA 4BR1A 3GDLA 4Q4KA 3M41A 2R8WA 4JY9A 5AYXA 4JYDA 4ORMA 2NUWA 5FESA 3N14A 1WA3A 1OF6A 4MZYA 3TA6A 4X3ZA 4N4PA 3TSMA 1T96A 2JK2A 4OE7A 5D03A 1NFBA 3LCIA 3VI2A 5KITA 3MYOA 2E77A 3QW4B 3OIXA 3BW2A 4MY1A 4FO4A 1OFPA 3ABQA 4MYAA 1SO5A 1W3IA 4NNAA 1JCJA 3N34A 3DZ1A 5BMXA 2C0AA 2Y7GA 1KFBA 3GKFA 5FF4A 3W9ZA 3LTSA 1R2SA 3RLVA 1I45A 4GUFA 3P8IA 2NZLA 3SGZA 5DY3A 3L9CA 1I2NA 4K6AA 3TKFA 2A85A 3NQFA 2KZHA 3DU0A 3G8RA 1W0MA 1EX5A 1L6WA 2IQTA 3EX4A 4Q33A 4OWGA 2RHGA 4JX6A 2GVJA 1TV8A 3HIJA 5HUOA 1WX0A 3HBLA 4O0KA 4RZ6A 3MI2A 4IMDA 2XN0A 3ZR4A 2CLEA 3W1AA 4AWTA 3L67A 5H2ZA 2Y63A 1A50A 3MP3A 3B0VC 3DENA 4JXCA 3DHFA 3EXRA 3C4UA 1HO1A 3C6CA 4IWWA 5L9FA 1XC4A 2ZZ1A 4O8RA 2BWGA 3FKKA 3IIZA 3GDMA 3O06A 1P1XA 2OX1A 2WQPA 2ZZ4A 1Z48A 3THAA 4DF1A 4JDYA 3UWZA 1VYPX 1LBLA 1EB3A 1EIXA 3WJYA 4NJIA 2RKXA 5CZ0A 3M5ZA 1W5OA 3EWZA 3SY5A 5D09A 3W1QA 1ME9A 4U4MA 4WX2A 3QMTA 3LV5A 2CZEA 2E09A 3NQAA 2O7SA 2E5DA 4TU1A 2C15A 5F4WA 3F1QA 4ONVA 1X1OA 4YMZA 3F4NA 3LBMA 1SO3A 1KFJA 5E1QA 3S5OA 4A3UA 2V2CA 3IRDA 4M19A 3W2MA 1G6CA 2X1TA 4FEZA 1L9WA 1DORA 1Z42A 4G1KA 3PG9A 4IXHA 5DXYA 4QITA 5AC8A 3CEPA 3T7VA 1EUAA 4L4MA 1VYSX 3TMQA 2WNQA 2ZCGA 3EWYA 3W22A 3ZS4A 1M6JA 3LTPA 3LLFA 2E5CA 2X1SA 1H7OA 3STCA 1TSIA 4GNJA 4WXZA 3GKAA 5L6UA 1G7VA 2GPTA 1QO2A 3QH2A 4FHAA 3W7IA 3NYZA 5HR6A 5AHIA 5D2YA 2B4GA 3TJXA 4NX5A 4JTTA 3YPIA 2PRLA 1DOSA 1L2UA 1OYCA 3AJXA 2TRSA 3ELFA 3NXFA 4DO4A 4JY8A 5CPNA 1SO4A 3S1WA 3HOJA 4BK9A 1GTEA 2Y62A 3WFAA 2DZPA 4UTWA 3M0ZA 1ICPA 3KRZA 4O10A 1KLZA 2HSAA 3DFTA 3EWBX 1TMHA 1DKWA 4UTTC 4ORIA 1KM6A 3NOEA 2X16A 4EIVA 3KOFA 2DJXA 3BLFA 4I7UA 4RXGA 1ZAHA 1PCWA 2Y7DA 2Y6ZA 3Q37A 1OVDA 3ABRA 3OVRA 4DF0A 2RH9A 4UNKA 4XUGA 2DP3A 3LHWA 5CZTA 2WJZA 2NWRA 2QCDB 4K39A 5AHLA 1GYLA 3HPSA 1LYXA 4MJMA 3UXAA 3LHTA 1LBFA 1ONRA 3NAVA 4Y8FA 3W2NA 1OYBA 1OFRA 3LLDA 3P7YA 1DJQA 3A24A 4UMAA 3BGJA 5TBOA 3NQVA 1BWKA 2OMAA 3I7RA 3QW3A 4MFDA 1KTCA 3W7HA 2W6RA 3W7CA 1H51A 3P74A 4LUIA 4D2JA 1XI3A 3W7GA 3BW4A 3R2GA 1DL3A 3DI1A 1XM3A 4QNEA 4ADTA 2BSLA 4M5PA 3TR2A 3TROA 1SZEA 1J4EA 1I2RA 3O16A 3CIWA 1PL9A 2FPTA 4DBEA 2LLEA 3PVFA 5AHEA 2PURA 1SW3A 1FXQA 1GT8A 2A5HA 3LHZA 4LU0A 2ZZ2A 5KZDA 1SO6A 3C2OA 2RDTA 4K38A 5K4ZA 4EWND 5G2WA 2EGZA 2V81A 1VQTA 3TXZA 1PE1A 4M6PA 3U6WA 3R13A 4XTIA 3NL5A 5IBXC 1OFQA 5U7SA 1ADOA 3GK0A 1QOQA 1KFLA 2Q8LA 2A7NA 2H8ZA 2VOMA 1LOSA 1NEYA 1SUXA 1OK6A 5U4NA 3WK2A 2VXNA 1F6KA 3DI0A 1F74A 1HUVA 2CLKA 1K02A 4Z0SA 3HGSA 1OFEA 2DZTA 4RR4A 3W70A 2VFIA 3D0CA 2E5BA 1H7RA 3W1XA 4Q32A 4BI5A 3DKLA 1GPWA 4O52A 4HPJA 4WY0B 4IOTA 3L5MA 3LDVA 4OV4A 2ZA1A 4OT7A 3NZ1A 1QMLA 1X8FA 3QPYA 3QMRA 4WXYA 3NQGA 3TC7A 2A0NA 4PL2A 1A5SA 1I4NA 1ICQA 1UBSA 1AL8A 2FJKA 2VEIA 3F03K 3TMLA 1DQWA 3N9RA 3NQ2A 2JKPA 3MW7A 3TFXA 1R47A 2WSQA 4WY0A 3PWAA 3WJXA 1H5YA 2QEZA 2VEKA 3W7PA 1NVMA 2DZUA 3DBPA 4CCDA 2YW3A 3QPZA 2A2IA 1IXOA 4JIQA 2G97A 3QMSA 1L6YA 1QDSA 3W1RA 1GVSA 3RLUA 1LDCA 3R5EA 3T4CA 1EP3A 4POCA 3LCXA 1XUZA 3S5NA 2BXVA 4FNSA 5CPLA 5HR7A 2ZRXA 1EEPA 1VCGA 3LCWA 3MBFA 1LBMA 2A4AA 1QPOA 4ADSA 5DCDA 5BW6A 5EYWA 2NV2A 1GOXA 3UPBA 2GVGA 4AEOA 5BMWA 3WK1A 3CHVA 2D73A 3MI6A 3C61A 4MLJA 4O14A 2ZTJA 2A21A 3DAQA 3SFKA 4PL1A 4O4WA 5IM51 4K7VA 4O17A 3LRMA 3MMTA 5LHFA 4MZ1A 3GAKA 3EX2A 1KFCA 1F5ZA 3E96A 3PAJA 5KZEA 3P5ZA 1W37A 3LX9A 3BLEA 3MP5A 5I3KA 1LROA 3Q58A 2EAWA 3NPVA 3N9SA 5EBUA 3C0JA 1V5XA 4AMAA 4DQWA 1FWRA 5BOOA 2JBMA 3WJWA 2C14A 2YPIA 3P80A 2FTPA 2R91A 3TSDA 1VH7A 1G4EA 3W7OA 1YXCA 3LRKA 4UTUA 3WK3A 4WOQA 3TXVA 5LNUA 3DFSA 3L5LA 3QRHA 3MYPA 4AWUA 1LOQA 1RPXA 3M44A 1VYRA 4PCFA 2YSWA 3PBWA 2Y85A 3NL2A 4S2CA 1A53A 2Z1BA 3L0NA 3SJ3A 1W5NA 2VKZG 4JTJA 1PVNA 4CQAA 5F4XA 3TJLA 2PE4A 4I7VA 3W85A 3W7KA 2J9YA 4XWUA 4O50A 3W7MA 4AB4A 3FJ6A 4UR8A 4IMEA 1G7UA 3HG5A 4LT9A 3T40A 4KFPA 3STEA 3LBCA 1S5TA 1O94A 2YCEA 4CLMA 1ZHAA 3M5YA 3UWQA 2OCZA 3L68A 1J2WA 1FBAA 4NT0A 4XKYB 1SU5A 4Z1BA 5EMUA 4IGHA 4Z0JA 5I3IA 3OVPA 1FDZA 1TREA 4MKNA 1VCVA 1BEUA 1TQXA 4LUJA 3M9YA 2CZFA 3IVSA 1KM4A 1SZFA 3O63A 5FF2A 4LV4A 5H91A 1ZENA 4FX7A 3LXAA 1WDWA 3IEBA 4GUIA 1VHCA 4GUJA 1AW5A 5HNRA 3UD6A 5AC7A 5DELA 1B4EA 2J88A 1UB3A 1ML1A 1SZNA 4HHPA 3IV3A 3PSVA 3KRUA 1MSSA 4JX4A 4XKYA 2JGQA 4E0CA 4UNLA 5DCBA 2YGYA 2YYUA 1YXYA 5D33A 3RMJA 3LCGA 4M7SA 1RVGA 2Y70A 1AG1O 4RV8A 3HPZA 3IGSA 1GVQA 4HN4A 3JRKA 3W2KA 3W2UA 4GE8A 3FIGA 4OV9A 1H7PA 1VLWA 3NL3A 3NQ6A 2B7QA 1MEWA 3MWAA 4KFNA 4Z1AA 2NXIA 3GXTA 1E51A 2J9ZA 2C6QA 5LNRA 4ZQPA 2YXGA 3T55A 5CG7A 4MY9A 1JRBA 3PUDA 3PC0A 4JIPA 1THFD 2C18A 5HWNA 4O1BA 4WUIA 3PR2A 5KTLA 4DEFA 1KM2A 4DPQA 4N02A 3NDOA 3MUXA 4XBKA 4RXFA 1GWJA 1W54A 2CLIA 3NQMA 2V0TA 2GUUA 4CCCA 3W6YA 4FIRA 1WBHA 5G2HA 5AFDA 4DPPA 4DELA 4WOZA 1RQHA 1W3NA 4RX0A 4HKPA 4KKXA 1YADA 3NO5A 1W1ZA 4JTKA 3S42A 3P61A 5D2XA 3C2EA 5J5RA 3G1SA 5D37A 1G69A 4FXRA 4ADUA 3I6RA 2NLIA 2VEMA 5AB3A 3GLCA 1K3UA 4GWEA 2C13A 3A5FA 4JN6A 2ZQ0A 1XFBA 4DF2A 3TCEA 2ALDA 3EX1A 1LRQA 1H62A 1OX4A 5AC6A 1OFBA 3KVKA 2GJLA 3HO8A 3GR8A 4OQVA 1HTIA 4JTEA 3HJZA 1WYIA 3JS3A 4H6KA 4JTGA 1VJIA 1OF8A 4UTIA 3LHYA 4E2DA 2EPHA 4O53A 1GVOA 1B9BA 2ZTKA 4L4LA 1JCMP 1WV2A 1Q6LA 3BPWA 1K03A 4XQ6A 3O6DA 1XCFA 2H8XA 1KBJA 2E6YA 5D05A 4JS3A 4Y6GA 1QPQA 3I68A 4NNCA 1OFOA 2J9XA 2P10A 2A7PA 3VFLA 4CQ9A 2C16A 1OG0A 3C2VA 1EUNA 2ISWA 3A22A 1QO5A 3LHVA 2JKEA 1O60A 2DJLA 5LZLA 4EF8A 3LCHA 4O1CA 3RF9A 2Z0IA 3IVTA 3W7LA 4EF9A 8TIMA 4IQLA 1W3TA 3SI9A 1MO0A 4RCXA 2OJPA 5DY2A 2GQ9A 4JTLA 2QKFA 2V82A 3VNDA 1SSGA 3G0XA 2ZA3A 4JD4A 1GJPA 2ABAA 1OX5A 1KW1A 1LOLA 1F6PA 1JUBA 2GVLA 3PS7A 1FX6A 2FDSA 5E93A 3HGOA 2Q3RA 3CPRA 5CGQA 5DXXA 2J24A 5AYYA 1TO3A 2VENA 3M43A 4NX0A 3H53A 1Q6QA 4GFSA 4O4VA 4UTKA 3M47A 3W2JA 1K7XA 4BWLA 3FYOA 1Q45A 4O11A 5FF3A 4C1KA 2V2HA 3A9IA 1ALDA 2HS8A 2OT1A 3T78A 1FXPA 5A5WA 4AHQA 4LOCA 1YDVA 5AYZA 4HNVA 4UTLA 1YTDA 4UC5A 4ZQCA 5G1TA 1R2TA 1RD5A 3DH7A 1BTMA 5DLCA 1IXNA 4JYEA 2TMDA 3L0GA 1GG1A 3BG5A 1QCWA 3W75A 4QIUA 4Z1DA 1AW2A 4IPJA 2J27A 3N2MA 4K36A 4UTHA 3SIZA 3UWUA 2WV8A 2R94A 2VFEA 3GNDA 3TUUA 1A5CA 1U83A 1TPFA 1IF2A 2E6DA 1T99A 3M1ZA 4AF0B 4CNOA 5F2MA 2ZRZA 4JDBA 3RU6A 2BZNA 4IJBA 3B8DA 3UZ5A 2Q3OA 3G22A 3LXCA 5CPMA 3M5XA 4K8EA 4N9DA 3FEMA 1B4KA 1TPUA 2A7RA 3FJLA 1Z44A 1M7PA 4X9SA 3L2IA 1OHLA 1TCDA 5F2IA 1TRDA 1WOAA 2X2GA 4JGDA 5DCEA 5D30A 1VRDA 3OG3A 4UTMA 5AHNA 2CLLA 4XZ9A 2V9DA 1JQVA 4TR9A 3UPWA 3UWWA 4AF0A 4NJJA 2V8ZA 4DXVA 1A5BA 2RDUA 2Q8ZA 4JR5A 4UFJA 5G4EA 5GVJA 3TFCA 1R2RA 4FNQA 2G95A 5E0KA 1GVFA 2DZVA 3GDKA 3P5YA 1F2JA 3SW6A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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