3M7WA

Crystal structure of type i 3-dehydroquinate dehydratase (arod) from salmonella typhimurium lt2 in covalent complex with dehydroquinate
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
251
structure length
251
Chain Sequence
KTVTVRDLVVGEGAPKIIVSLMGKTITDVKSEALAYREADFDILEWRVDHFANVTTAESVLEAAGAIREIITDKPLLFTFRSAKEGGEQALTTGQYIDLNRAAVDSGLVDMIDLELFTGDDEVKATVGYAHQHNVAVIMSNHDFHKTPAAEEIVQRLRKMQELGADIPKIAVMPQTKADVLTLLTATVEMQERYADRPIITMSMSKTGVISRLAGEVFGSAATFGAVKKASAPGQISVADLRTVLTILHQA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords 3-dehydroquinate dehydratase
publication title Insights into the mechanism of type I dehydroquinate dehydratases from structures of reaction intermediates.
pubmed doi rcsb
source organism Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhimurium
total genus 92
structure length 251
sequence length 251
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature ec 4.2.1.10: 3-dehydroquinate dehydratase.
pdb deposition date 2010-03-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01487 DHquinase_I Type I 3-dehydroquinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3m7wA00
3GAKA 1IXPA 4LS1A 4RV8A 3W1RA 3EWYA 4BK9A 8TIMA 2VC6A 2ZZ5A 4MLJA 1T0OA 5L9FA 5HUOA 3NZ1A 1FDJA 1E51A 2J24A 3HOJA 3TW7A 5E93A 4JXCA 1LORA 3MI2A 3PG9A 3T44A 1OVDA 2A1YA 1XDMA 3PWAA 1QCWA 4MZ8A 1QR7A 2YGYA 1TTQA 3GNNA 3A21A 2BXVA 3FJ6A 2XFWA 5K4XA 4JYDA 4TU1A 4RZ6A 3I6RA 4MJZA 3W6YA 1J5TA 3MI6A 1PIIA 4CCEA 1SZFA 3S1XA 2YZRA 2VOMA 3KVJA 4UFKA 3ABOA 3LV5A 2VEMA 4LS2A 4ZQNA 3KAOA 3NM1A 2V9DA 1VCFA 1KFKA 4WD0A 3WK3A 3TC6A 3UZ5A 2ZRUA 4WY0A 2H6RA 2XN1A 2DZXA 2BLEA 4ADSA 4RXGA 1PL9A 3DI0A 2X1RA 4GRSA 3SECA 4LOCA 4O14A 3OEXA 6TIMA 2A85A 5HR6A 1FY6A 1FWSA 1I2PA 3IVUA 5EPDA 3NQEA 1C9DA 2FPTA 1FXPA 3W2MA 2QCEA 2ZRVA 5LNUA 4DELA 4W9TA 1KLYA 2FIQA 1ZNNA 4E2DA 3S6DA 3BLIA 1H7OA 3ATYA 2YXGA 5DN1A 1TRDA 1ICPA 4M7SA 3TAKA 5K9CA 2EGZA 5CPOA 3I7RA 3DHDA 5CSRA 1W3IA 1OX5A 3R89A 1XBVA 3LHYA 1KTCA 1F74A 4IJBA 1WX0A 1JRBA 1LDCA 1XM3A 5K9XA 4JDBA 5KINA 1EWDA 1QO2A 1HO4A 6ALDA 4C1LA 4ADUA 1W8SA 4HNVA 1TYGA 4MFEA 1SR9A 2V0TA 3FKRA 4NXKA 3W7HA 1HFBA 1YXDA 3F1QA 2VFIA 3F4NA 3S9YA 5AHIA 2Z6IA 2WOQA 2CLLA 4PFMA 3VNDA 3W7IA 3SFKA 3EKLA 1WOAA 1UASA 2NUXA 3EXTA 4OE7A 4FXSA 4FB7A 4O19A 3NG3A 1VCGA 4FNUA 3HG4A 5F1VA 2DZTA 1VLIA 3I68A 1UUMA 3E49A 4TX9A 3G1YA 1PHQA 5FI8A 1SUXA 1GVSA 1R2SA 1JUEA 4IMGA 3W1TA 2ZRWA 2VFEA 2J27A 2E6AA 3E0IA 2GVGA 5EKYA 3W83A 3GDTA 1W5PA 1I2OA 1KBJA 3V75A 2RHGA 1ICSA 3THQA 3LV6A 3Q2DA 3TXZA 4HNNA 3LHTA 3W7DA 1IF2A 4JY8A 4ZQCA 5AC6A 1Q45A 1FBAA 4N6EA 3E02A 3VI2A 3MYOA 4U4MA 1JVNA 3CC1A 4H4IA 5G5IA 5AYYA 3DFQA 3SI9A 3CU2A 4L4LA 4MY9A 3N2MA 3LCLA 4PA8A 1FWRA 1YLVA 3F03K 2O7SA 3W2KA 4Y6GA 4NJGA 4YCPA 1FQ0A 4QNEA 4JX5A 4QNWA 1JUKA 3RK8A 4QSHA 1OX4A 4KFNA 2YCEA 2A4AA 3C2VA 2ZYFA 1OYBA 3LBCA 3W1NA 3L68A 4ZQPA 5DELA 5CGQA 1TIMA 4Y90A 3E96A 4AB4A 1VRDA 5DBUA 3GDMA 3WJWA 1TV5A 4M6PA 4G1KA 3TSMA 3TQ0A 3KRZA 5LGXA 1LBLA 2QUTA 2X30A 2Y85A 4QIUA 3G1SA 4BR1A 3G0XA 1FWWA 1TV7A 1LM1A 3MJYA 5LSMA 1G69A 2GPTA 4LV9A 1A50A 3IGXA 3Q58A 3QM3A 4WUIA 3TU9A 1G67A 5TIMA 2C16A 4DPPA 5I3GA 4NNAA 3LRLA 2WJZA 2XN0A 5FF0A 1VYPX 3LLFA 3QZEA 3C2RA 2WPBA 3MHUA 1W5QA 1D9EA 3U2OA 3SJ3A 1BKSA 3G1HA 3R5EA 4JYEA 4X9SA 2G95A 3VFLA 1UCWA 4NT0A 3KVKA 4GC4A 1LOSA 2TRSA 4Z08A 4MVAA 4LVAA 5F2IA 4WY0F 4O1BA 2QF7A 3U8GA 3LCHA 3IVSA 3SY5A 4LW7A 2R14A 5ABTA 1G7VA 3OVPA 5CSSA 1I2RA 1SO6A 3Q94A 3G0UA 3CEPA 1OG0A 3BG5A 3S5NA 1ML1A 1H51A 3NQFA 3OBKA 3BK0A 4HHPA 3NQ7A 5CKSA 1LBFA 4R7JA 4EOUA 3QW3A 3PBVA 3DXIA 3NAVA 1KM2A 5AB3A 3FIGA 3KXQA 4AAJA 4GNJA 1RZMA 2FLIA 4Q33A 3C0JA 3HG3A 2QKFA 4Z1DA 4M5PA 2OJPA 1HG3A 1IGSA 2ZZ7A 3HO8A 1GPWA 4RK8A 5BRBA 3NL2A 1O60A 3W2JA 2I14A 4M19A 5EBUA 2VFDA 1ZY9A 3UD6A 1SSGA 3TW6A 3I7QA 5LNWA 1LOLA 1TTJA 4M6QA 4JR5A 1R47A 1LCOA 2W6RA 2X1TA 3GR8A 1OK4A 1XDLA 4RX0A 3G8RA 1GYNA 3RMJA 3QPYA 3DGRA 3B06A 1YTDA 1OFOA 2R94A 4IMCA 1G4SA 2OT1A 2YFOA 3A5VA 4HNTA 5DXXA 3C56A 3NDOA 1PVNA 4XTDA 4DEFA 1OFPA 1K8XA 2ISWA 4EF8A 1TPWA 3MUXA 1W54A 2C18A 3G1AA 3LLDA 2YYUA 2VELA 4MUZA 2E68A 5C54A 1B57A 3W85A 4P61A 3S0CA 4DO5A 4I7VA 4NUWA 1R46A 2CW6A 4JX6A 3S1UA 3LERA 1HO1A 1Z44A 2CLMA 4N6FA 1U83A 1TMHA 2ZA3A 3SSJA 1SZNA 1UJPA 3GKAA 5EY5A 1K7EA 3UY8A 2RH9A 4GJ1A 1SO4A 4NJHA 5D2TA 1C8VA 2CLFA 3O07A 3EX1A 1DKWA 1VZWA 4YL2A 5KZEA 1T99A 1GVRA 4QISA 1G4EA 3EKZA 3M47A 4Z0JA 5LKYA 3RNDA 3VE9A 4UFJA 3WJZA 4UTIA 1ZFJA 2WNNA 4AF0A 4CQ8A 3HBLA 3S42A 4ZQRA 3W2UA 2FPYA 2JGYA 2Y89A 4CNPA 5GVJA 5F2GA 2ZZ2A 4QITA 2HTMA 1FWNA 3N9SA 4O1CA 3HF3A 2RDTA 3P8JA 4LUJA 1JRCA 1RQEA 4CQ9A 1ZAIA 2EPHA 3DU0A 3LTSA 2YSWA 1K8YA 1TPEA 4XBKA 3O16A 3DI1A 4OGZA 3LM7A 4BI5A 4ZZ9A 2E6DA 4O4WA 5D32A 3OA3A 4JTSA 5F4SA 1MZHA 2WNQA 1GVOA 4UTHA 2G96A 4LVDA 3HIJA 2V82A 2C1HA 1YDOA 5D2YA 3LXBA 3FYOA 4WOQA 4UTWA 3M5ZA 3HG5A 3BLEA 1WBJA 4XBSA 3UNDA 5F4XA 2A7PA 2QCMA 4Z1AA 1EEPA 1SSDA 2TPSA 4BF9A 1VQTA 5G2IA 4K39A 2GJNA 1V5XA 5AYXA 3MI3A 1RV8A 1YADA 1YTEA 2ZZ4A 3KVLA 4I7UA 1EA0A 3UWZA 1D3HA 1VHNA 1Z42A 3HGRA 1TPC1 4UFLA 2ABBA 3MHFA 2QCNA 4MIMA 3NA8A 5CZSA 3W72A 4N02A 3P5ZA 3IGSA 3L21A 3NPXA 4YXGA 3GDLA 3HPXA 1AL7A 1KM0A 5D03A 1XBZA 2NXHA 5A8GA 3W7RA 1OJXA 1K03A 5F2MA 2H8ZA 3MBDA 1ICQA 3NQ8A 3STGA 2B7OA 3PS7A 2J9ZA 3B4UA 2H3DA 5C6MA 2ZBTA 2Y62A 1BWLA 1JCXA 3M0ZA 1WBHA 3W7LA 1GOXA 3G0SA 3MHGA 3NOEA 1N7KA 1VS1A 4LS0A 3QQ0A 4FIRA 1F73A 2DJXA 2A0NA 4AVFA 1M7PA 3ELFA 3PSWA 4WX2A 5D33A 3Q37A 1I4NA 3EWWA 4FXRA 2A5HA 1QFEA 4LC8A 3TJLA 3DHFA 3DH7A 5EL1A 1WV2A 2Y7DA 2Z1BA 4FX8A 1IIHA 3GX9A 2FJKA 1XBXA 4LVFA 3N2XA 5FEPA 2PRHA 2W79A 3UPWA 4A21A 1NSJA 4K8EA 1F6PA 4JS3A 4I7WA 2C3ZA 1DORA 1O94A 4UTTA 3H54A 3KRUA 1NEYA 3QH2A 2PC4A 4QJ1A 3TJXA 4ZL1A 2QUVA 5DCDA 4MLRA 5EMUA 2ZTJA 2GQAA 3S1WA 3W7JA 5D05A 1FX6A 3HB9A 3B0VC 1B3OA 1H61A 3M5VA 3P67A 1NF0A 4KWVA 3OG3A 2BTMA 1D3GA 4POCA 4CCCA 1SU5A 3HG2A 4FHAA 2G5WA 3D0CA 4CNNA 3I7SA 2DZUA 2X1SA 3O05A 3P80A 3GIYA 3UY7A 1T96A 3DKJA 2ZA1A 1L6YA 3LRMA 1AK5A 3SIZA 4UFHA 1GQNA 4O16A 4MZ1A 3S1VA 1YTKA 1RD5A 4O17A 3UPBA 4PL2A 1DQXA 4H6KA 1W5NA 1FDYA 3NGJA 4ZMGA 3W07A 1FCBA 3VKJA 2J9YA 2FDSA 2ZDRA 3M9YA 4N9CA 2TYSA 1SW7A 3FJLA 3KVMA 1TQJA 3DFSA 1PV8A 2W0UA 4IMDA 4LU0A 4O8RA 5HWJA 3STEA 4JYFA 3EEGA 3S5ZA 4A2SA 2QAPA 5IBXA 4AXKA 2BWGA 1SFJA 4K7YA 4XKYB 1ZAHA 5FEWA 3DFTA 4GXMA 3PB0A 5C5YA 3WJXA 3W84A 1P0KA 4N9DA 2P10A 4WZHA 3WFAA 4UTLA 3P61A 4K36A 2NX9A 3TR2A 4X3ZA 3GK0A 4XTIA 1K8ZA 5AHFA 3NPVA 1THFD 1X1ZA 2LLEA 3L67A 4DF2A 1QO5A 1R2RA 2GOUA 3KX6A 3O6YX 2Z0IA 4NZJA 1W3TA 4M7TA 4NQ1A 4JY9A 1P4CA 4JN6A 4O10A 4YMZA 4AHPA 1JR1A 1N55A 3MO7A 3EWXA 2BZNA 2NZLA 2GJLA 1H7RA 4JICA 1XUUA 4O1DA 4Z0SA 5LZLA 3DBPA 4HNUA 3W7KA 3NQ6A 5AOUA 5E1QA 3DAQA 3QYQA 2CZ5A 2JKEA 1K7XA 1LRNA 2G97A 1TPVA 4JNMA 5G1TA 4O54A 3N9RA 2QJHA 4ZVJA 5KITA 3BARA 1TO3A 1QOPA 3P62A 3A24A 1RPXA 2E6FA 3UYCA 4MFDA 4MJMA 3TFCA 4DQWA 1OF8A 4LT9A 5LNSA 4NX0A 3TH6A 3LHUA 4Y96A 1H7XA 1LLZA 2A7NA 4BWLA 4LY8A 3EX6A 4UTJA 1QPOA 3NNTA 2V8ZA 2VKZG 2EKCA 2A6NA 4ALDA 1H62A 1FDZA 3KOFA 2YYTA 3MWAA 4UMCA 2CLHA 2OX1A 3NXFA 2C19A 2OCZA 2H90A 3W7OA 1KM6A 3P82A 1VPXA 4FEZA 1JCYA 1KBIA 3E12A 4IX2A 4OV9A 1G7UA 5TQLA 4JTKA 1EPXA 3TC7A 5G4EA 4IMFA 2AGKA 2HS8A 4UMAA 4GUFA 2GVJA 1CW2A 3IVTA 1TV8A 3W1UA 5D30A 3DZ1A 4M6VA 3S8HA 1I8JA 1GG1A 1Q6LA 2CZEA 3QJAA 5CZ0A 3A9IA 3M44A 1YYAA 5I3JA 3M5XA 1OK6A 1TPUA 3TFXA 3W73A 2QR6A 3GKFA 1FUYA 3W7EA 3C61A 1A53A 3C3NA 4KKXA 4QQ3A 4IX0A 1TREA 3W1QA 4JGDA 2VENA 1Z48A 4N4QA 1H7NA 3UWVA 1WAUA 1X7FA 3GVGA 3NL6A 2DZVA 4EIVA 3MMTA 4RCXA 4MPQA 1KFBA 5LNVA 5MHBA 1EP3A 3OHIA 5H2ZA 1LYXA 4LWWA 5EYWA 2ZCGA 3UZJA 3KHJA 1TPB1 3G1DA 3EX4A 3LOTA 4ZQOA 3EWBX 2YFNA 1OF6A 2I1OA 2FPVA 4FF7A 3LHWA 3TK7A 3W70A 3AJXA 1H7WA 3GDKA 1J4EA 1KFEA 3H53A 5AHNA 7TIMA 1AG1O 1VYRA 1DOSA 1O5XA 2A7RA 2DZWA 2QDHA 2ZZ1A 2QCCA 1QDSA 2NUYA 3FYPA 4GWEA 1ZALA 2CLEA 2JK2A 5CG7A 2CLKA 2GQ9A 1DQWA 1OYCA 2NXGA 1OABA 3TA6A 2CU0A 4UIOA 3C52A 1W37A 4NNCA 4UFIA 4EWND 3B0UX 2E5DA 3GXTA 3KFTA 4Z1CA 1PCKA 3EXRA 3LI1A 2A21A 3CWOX 1F05A 4JTTA 1ALDA 2C14A 1M6JA 1RQHA 5J5RA 3W1XA 1WQ5A 4Y9AA 1ME8A 3LB0A 5E0KA 4WXYA 2CFFA 1BWKA 3P5YA 3UXAA 3PB2A 3IIPA 4IXXA 3G18A 4WXZA 4CCDA 2B7QA 4UXDA 3LCFA 3F4WA 1TB3A 3A23A 3W7CA 3RU6A 2V2DA 2QCDB 2V2CA 4RZ5A 1R2TA 4TO8A 1YDVA 3FKKA 3T55A 1MEIA 4MYAA 3W7GA 5FF2A 3O06A 2QCHA 3G1VA 4AMAA 2DZPA 5TBOA 2FFCA 4OV4A 1OFAA 1GTHA 3BG9A 4K37A 3TIMA 4EVZA 5KSWA 4DPQA 4QAIA 5K4ZA 1MSSA 3NQCA 4O13A 3STFA 3EWZA 5CZJA 5C2XA 1VH7A 3THAA 3R12A 2WKJA 4LC6A 3V1PA 2C6QA 3B04A 1TTPA 3MW7A 4KWWA 4O4VA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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