3MBFA

Crystal structure of fructose bisphosphate aldolase from encephalitozoon cuniculi, bound to fructose 1,6-bisphosphate
Total Genus 134
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
134
sequence length
337
structure length
337
Chain Sequence
MDCDHLLRLGMTAKKILENGKGILAADETPKTLGRRFEKLGITNTEENRRKFREILFSTKGIERYIGGVILNQETFEQTSGSGVPLTELLKKKGIEIGIKLDKGLIDYKEKEKISVGLEDLDLRCKSSAFKDATFAKWRSLFYFYDGIPSEDCINENCSILAKYAIICQKNGLVPIVEPEVFLEGDYSMKRSYEVTRQILSTLMKYLNYELVYIPGVLIKASYVTSGQLSNEKYTPKKVATFTLRALLSTIPCGIPGIVFLSGGHGSEDAIGFLNAINMERGCRTWSLSFSFARALTDGVLETWRGDDSNIEEAQKILLETSFKACRGAEGKLWDQE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Fructose-bisphosphate aldolase
publication title Structure of fructose bisphosphate aldolase from Encephalitozoon cuniculi.
pubmed doi rcsb
source organism Encephalitozoon cuniculi
total genus 134
structure length 337
sequence length 337
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2010-03-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00274 Glycolytic Fructose-bisphosphate aldolase class-I
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3mbfA00
2WV8A 3B4UA 3ABSA 4XBSA 4JYEA 5AB3A 2CLEA 5HMSA 1YTKA 4EF9A 1L9WA 1N55A 2RH9A 3NQAA 2QUUA 3NQDA 4JTFA 1FDZA 3VFLA 1G69A 4UFLA 3VCRA 3NZRA 3W7QA 5DN1A 1KM1A 4X9SA 1TPWA 3FKKA 3ATZA 4IXHA 2QJGA 4WY0A 2NZLA 1PHWA 4DXVA 1SZGA 1DBTA 1SFJA 3C56A 5G5IA 2NWRA 1O94A 2QJHA 3KAOA 2ZZ7A 4OU1A 2NV1A 1G7UA 3NPWA 3NQVA 3EX2A 1RV8A 1W5QA 3S1VA 5KTLA 3C2EA 4LT9A 4O13A 3O1NA 2YSWA 5F2IA 5EMUA 4O19A 3PULA 4NT0A 1O95A 3IIZA 4A2RA 2DZTA 2QR6A 3ABQA 2NXIA 2Y88A 3FJLA 4UMCA 4PODA 2OT0A 2R14A 3QQ1A 4LVDA 3S1UA 4XWUA 1JQXA 3HQ1A 1TTQA 2ISWA 1FCVA 4OGZA 5CPOA 1K7EA 1YTEA 1FXPA 4KFPA 3G24A 2CW6A 1S5WA 4EF8A 2YFOA 3LV6A 2CLMA 2H3BA 1G4PA 1SPQA 2WSYA 2A6LA 2E6YA 3BVJA 3HBLA 4GUFA 5T26A 4HKPA 3HMJG 4XTIA 1QNVA 2CZ5A 4DF1A 1WBJA 5GVJA 2XFWA 1HO4A 3HO8A 3MI6A 1Z42A 4O54A 4UTTC 2QCGA 4O18A 4XKYB 2FQIA 2Y63A 3DGRA 1KM5A 3MYOA 4IMFA 5AOUA 2B7OA 4BWLA 3HOJA 4RV8A 5D03A 1KLZA 5FEXA 2EF9A 5C2XA 2Z6IA 4IMEA 5HNRA 3PF3A 3TFCA 4M6PA 2JK2A 3FIGA 5FI8A 3NL2A 2X30A 3WK2A 1QFEA 3PR2A 1LTDA 4LRTA 4K7VA 1H7OA 1KM4A 3RMJA 3HG2A 1AG1O 1I2OA 1TV8A 3CTLA 2XN1A 4UCGA 2OMAA 2BLEA 1M6JA 3S1XA 2ZRVA 1JJKA 1L2UA 3KVJA 1K7FA 5D02A 3IIVA 4ZQPA 5KZMA 4MOZA 1IF2A 1FY6A 3CC1A 3EB2A 4YCOA 3BW2A 2H6RA 2R91A 1S5VA 2CLIA 2Y6ZA 5I3HA 3NEVA 3O6YX 3BW3A 4XKYA 3QM3A 2YXGA 3PWAA 3O15A 4O1DA 4WZHA 1GJPA 4LC8A 3W7MA 3B0PA 2A7RA 3GDTA 2QDHA 4KKXA 1C8VA 4N02A 5LKYA 2VEPA 1GVRA 5AHNA 3PSWA 4LVBA 3NQ6A 4X22A 3GLCA 2P10A 3UZ5A 3TNOA 2X1SA 3UZJA 3GZ3A 3S5YA 3P81A 1ZAJA 2C15A 3LRLA 5FEWA 2ALDA 4FIQA 1OHLA 5K9CA 4M6VA 2F84A 5DY3A 2VFDA 5LGXA 1DKWA 4LVFA 1KM2A 4ZMGA 1HFBA 2VFGA 1GOXA 2W6RA 4ICNA 3G1XA 3P80A 2ZZ6A 3EEGA 4O12A 1DV7A 2A6NA 5LNVA 3S5ZA 4R33A 4IUOA 4FF7A 2EGZA 1XKYA 5AHLA 1TRDA 4EWND 3W22A 2DJXA 3Q94A 3DH7A 5CSSA 3A21A 1A5BA 4M7SA 3G0XA 1OFOA 5K9DA 3CU2A 5CZ0A 4K6AA 1YDOA 2QCDA 5HINA 5CPMA 2QCHA 4POCA 4WOZA 4K8EA 3M47A 4WX2A 3VNDA 1GVFA 1SO5A 1ZAHA 1JVNA 1PIIA 5E93A 1ZJIA 1G7VA 1L6YA 4K39A 1RR2A 3G8EA 2OJPA 5BMWA 3M5XA 4GWEA 1TJPA 5F4WA 1H62A 5FF7A 1D9EA 3LLFA 1L6WA 4E38A 1F2JA 3OBKA 3PBWA 3SECA 2D73A 4CCDA 2ATSA 1I2PA 4ZZ9A 3LRKA 3L2IA 1RQEA 4ADSA 2X1RA 1A5CA 3G3DA 5SWUA 4TR9A 4GUJA 3SGUA 3W85A 1K02A 4NJIA 1VLWA 3HG3A 4OQVA 3R89A 3KHJA 3P8JA 2ZRUA 3NPVA 3BG3A 2V2CA 1H7NA 3BK0A 1GTHA 4JTSA 2FTPA 1TQXA 3W1RA 2OCZA 1E51A 4GJ1A 4JNMA 1OYAA 1LBFA 2E09A 1OFQA 3KXQA 4ADUA 2WNNA 1TQJA 4RKAA 3GX9A 3MP3A 2Q3OA 5F2LA 4AHPA 3TXVA 5K7JA 1WQ5A 3NQ7A 4E2BA 1VQTA 2ATMA 4AEOA 5D37A 3W7KA 3I7SA 4MYAA 2EPHA 1UCWA 1ME7A 4AB4A 3HJZA 1F5ZA 3W2KA 4UFJA 5G1YA 1GYNA 4NX5A 3P82A 4IX2A 5H2ZA 1FCUA 1Z48A 1GEQA 2RFGA 1YPFA 3W87A 3R2GA 4UTUA 6ALDA 3H55A 4N9EA 5G2HA 1KFBA 4CLMA 1K8ZA 2Z0IA 1JCLA 1RPXA 4XQ6A 4IQLA 5U7SA 2A4AA 1TTPA 5CGQA 1EP3A 1A5SA 5TIMA 3NQGA 4HNTA 1IIHA 1PVNA 3W1MA 2YPIA 1JCYA 3HG4A 3SIZA 1NAL1 5H91A 3GKAA 1KFKA 3WK3A 2AQWA 4UUIA 1QWGA 1FWWA 2VFIA 3GDKA 5LNWA 3KOFA 3WJSA 3QW3A 2E77A 5KZEA 2A7PA 3MMTA 1P0NA 4K38A 2NX9A 4FNPA 1DJNA 1TRIA 5AC8A 3NR0A 2V0TA 4QSHA 3W75A 1V5XA 5DCDA 1TB3A 5AYXA 1QCWA 2TPSA 3EWWA 3P60A 2CFFA 1VYRA 4MFDA 2Y70A 4QAIA 5LNRA 3G1SA 3W7PA 1H7WA 1LBLA 1EUNA 5G4WA 3FKRA 5CPLA 4FO4A 1HO1A 2QCLA 4W9TA 2RKXA 2DZUA 3D0CA 1MO0A 4R7JA 4IOTA 4Q32A 1ZFJA 2ZRYA 3L67A 5I3JA 3B0UX 4GBUA 5DELA 1X1ZA 1XXXA 4GUHA 4LW7A 5K4ZA 1KM3A 1W31A 4N4PA 1B9BA 3W7NA 4JD4A 1H7XA 4Y8FA 3G3MA 4WXYA 3B06A 3NL6A 5MHBA 4OV9A 5D04C 4DQWA 3DFTA 3P5YA 5ABTA 4H3DA 3EX4A 4UR8A 2I1OA 2WSQA 4CQAA 2GQ8A 2J88A 3NZ1A 3M0ZA 2G5WA 4HT3A 1M7PA 4YCPA 3SR7A 4Y9AA 4G1KA 2B7PA 4LNYA 2V82A 2BXVA 5F1VA 1SUXA 3W2LA 2O7QA 4NNBA 2VOMA 1F73A 1XBYA 2ZBTA 3QFEA 4IPJA 2ZZ2A 1FDYA 4TX9A 1VYPX 3P7YA 2QEZA 3P67A 3DZ1A 2OX1A 1TPC1 4UTMA 3WK0A 1VH7A 2G97A 3W23A 5KSWA 1IXOA 2Q3RA 1QPQA 1H60A 2WO5A 3GDRA 3NPUA 3B05A 4UTIA 3UWUA 2H8XA 4TMCA 1I2RA 1SSDA 1P4CA 3M6YA 3C8FA 3PC0A 3UPBA 1DVJA 3EXSA 4JTHA 3TAKA 5G2IA 3LHUA 1OF8A 2JGQA 2FB2A 1FWSA 5HQEA 2E6FA 3MUXA 3FA5A 4JICA 3GXTA 4UTJA 3DHFA 3OHIA 4M5PA 1K7XA 4OHQA 4QITA 1OFEA 4I7WA 4HNUA 3O05A 4WY0F 3PY2A 4FX6M 5C5YA 2YDAA 4O15A 4ALDA 1VLIA 2PE4A 1CI1A 4UTKA 3W84A 3H54A 3U2OA 2QJIA 1UJPA 1H63A 3KRSA 3NQ2A 4O0KA 2ZFAA 2QCFA 3L65A 1QDSA 3I68A 5KINA 4MZ1A 3W7EA 4NXSA 4EVZA 1OX4A 5CZSA 4UFMA 3W1UA 4JR5A 1DHPA 4UR7A 2OT1A 2ZZ3A 3DFPA 3GK0A 5EA9A 3G1DA 3LCFA 2Y89A 3LM7A 3CWNA 3O06A 1LRQA 5AHEA 5L9FA 1OG0A 1YPIA 1K03A 3LCHA 4ADTA 4NNCA 3W7HA 3W7OA 1KV5A 3P61A 1FQ0A 5J5RA 4LRSA 5CZJA 3LX9A 2DJLA 2TSYA 2QCNA 1Z41A 2YYUA 4O50A 1B3OA 3B03A 4GUGA 3W7LA 2QUTA 1W5NA 3QYQA 5AYYA 4DELA 2B7NA 3N73A 1U83A 5TBOA 3HIJA 4S2BA 2A2IA 5CKSA 3ANYA 3JR2A 3UD6A 4WXZA 3CPRA 3W2MA 2V9DA 3DHDA 2VC6A 1GVOA 1RQHA 1S3HA 3WFAA 4DO4A 4XUGA 4PC8A 3M5VA 1LRTA 2AAMA 4IMCA 1P5BA 8TIMA 2NX3A 4QNWA 1EWEA 3N3MA 3TJXA 2HSAA 2W79A 4WOQA 3HGRA 1AL8A 4HNVA 1H7RA 3HB9A 5DXYA 5LZLA 2XN0A 3W7RA 1Q6RA 3G0SA 3BO9A 3GB6A 2C14A 1W1ZA 4MPQA 1QAPA 1O5KA 4FNQA 1TPUA 4A3UA 4RJEA 3UY7A 3LBMA 5IBXC 3JS3A 4FNUA 4AVFA 3IGUA 3W86A 4NVTA 3O8AA 1KV8A 4PA8A 1GTEA 2VXNA 5AYZA 5FEZA 3CIXA 1BTMA 2QUVA 4MZYA 3F4WA 3W1NA 3C2FA 2XN2A 4FNRA 4HSNA 1TPVA 4PCFA 1KW1A 1JULA 1B57A 3C0JA 3NOEA 1IXQA 4S1FA 3QMTA 3GNNA 5CG7A 3S9YA 4QNEA 1DORA 2X1TA 2C16A 3EWXA 3QSRA 1TCDA 4YL2A 2PRLA 3U6WA 2A21A 4JYFA 5HWNA 2YZRA 4N2YA 1TSIA 2GJLA 3R12A 4PL2A 4M19A 1N8FA 4UFKA 3TXZA 1KTNA 1UASA 1Q6OA 3HPXA 5KMYA 3LHYA 4Y90A 4UMBA 4JDYA 4JTEA 4EOUA 2FDSA 4IMDA 5U4NA 5AC6A 1W3NA 4FB7A 3W71A 1VC4A 3M16A 1XC4A 5D30A 4UFHA 3NM3A 3S6DA 2DZXA 4JIQA 3FJ6A 1OFDA 1SR9A 5L6UA 1OK4A 4LTSA 1W37A 5EYWA 3B8DA 3GXPA 3S42A 3LOTA 1ZALA 3PVFA 4RZ4A 3CT7A 3STCA 4MFEA 1JUBA 1M5WA 1EIXA 1SU5A 2TRSA 1DJQA 3SZ8A 2Y7GA 4O11A 3LXCA 3CIWA 1VYSX 2H90A 5AFDA 3LCIA 4IXXA 4DPPA 4N6FA 3N9RA 3PBYA 3UWVA 3HGSA 4LV4A 1DL3A 2O7SA 1NF7A 4UTLA 1SO3A 4KFNA 2X2GA 4O8RA 2Y62A 3W3OA 4RK8A 3EKLA 1EWDA 3LTPA 4RXGA 3GVGA 1D3HA 4BK9A 2ZZ1A 5DBTA 3W72A 1HTIA 4GC4A 4O1CA 1OX5A 2UV8G 2PRMA 2C3ZA 3O63A 4EIVA 1S5TA 3T7VA 1YXCA 3TDFA 1R46A 1ZCOA 3RU6A 4UC5A 1ALDA 3LHVA 1OJXA 3M5YA 4BI5A 3KVLA 4Z1BA 1YADA 1QPRA 1EPXA 5DBUA 2QCMA 2NUYA 4LS1A 2JBMA 1C9DA 3T55A 1AW5A 3MHGA 1AW2A 2VFFA 3C4UA 1OVDA 1FXQA 1TV7A 2R94A 3IV3A 4UTHA 1OK6A 3EKZA 4HPJA 1KM6A 1AW1A 3BARA 2OZ0A 3TSBA 1WXJA 4AF0B 1QR7A 3W70A 1EA0A 4NZJA 3GNDA 4PTNA 4BWLC 4DF2A 3WJZA 5K4XA 1B4EA 5A8GA 5CPNA 3MHUA 1W3IA 3YPIA 2Y61A 4RCXA 3RFAA 1VZWA 4BI7A 3WK1A 4K8HA 3T4CA 3LRMA 2WSRA 3TQVA 3SJ3A 3NG3A 3O6DA 2FPTA 1R2SA 2Q8LA 5D33A 3W76A 3RLVA 1QO2A 4TMBA 4ZL1A 5KITA 1X7FA 2FFCA 3F03K 3S8HA 1ZY9A 1OFBA 2LLEA 1HG3A 4AHQA 5DCBA 5LGZA 4MIMA 1ZENA 4LVGA 4MJZA 2DZSA 1F05A 2ZTKA 4U28A 5FF3A 3EXTA 1THFD 3W7JA 1XFBA 3FOKA 4UXDA 3MWAA 3OVRA 1PCKA 2NUXA 1QO5A 2CZEA 1G67A 1Y0EA 1ICSA 1SZEA 2Y7EA 4N4QA 3H53A 2V81A 4AF0A 2JKAA 3IVTA 4IX0A 1LOLA 3BV4A 4MUZA 1WX0A 4IMGA 2WPBA 3F1QA 1LP6A 5C55A 2BWGA 3PG9A 4MZ8A 5D2WA 4FEZA 1RVGA 2KZHA 3NAVA 5AHFA 3TSDA 3W74A 2V2DA 1R2TA 3TKFA 3W88A 3C52A 1U5JA 3I65A 4NXKA 3TROA 3LI1A 3KVKA 5HJLA 1Z44A 2PCQA 4QM1A 4RX0A 3R8RA 3TR2A 4E2DA 1T96A 3LTYA 1VJIA 3G1VA 4O57A 4HNNA 1BWLA 3HF3A 1FCQA 3LI0A 4ZQOA 3UNDA 1J5TA 2EHHA 5FEPA 1G4EA 1EP1A 2FB3A 1YDNA 1XDMA 4MY8A 4A21A 2E5BA 2NX1A 2VEKA 2QAFA 3O16A 5LNUA 1KM0A 3Q2DA 2C18A 2J9XA 3BG9A 3C2VA 1X6UA 2HS6A 2BTMA 4DF0A 3UY8A 2JKPA 3RNDA 1TO3A 1ADOA 4E0CA 1FWNA 3CLMA 4KFOA 4HHPA 3BGJA 4JX5A 4CNPA 1KFCA 2CLHA 3SGZA 5CSRA 1GG0A 2B0MA 2YGYA 3LERA 1LZOA 5DLCA 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 2V8Z A;  1PHQ A;  1RZM A;  1W54 A;  3O6C A;  2GPT A;  2Z1B A;  1K8Y A;  2E5C A;  2ABA A;  3JRK A;  4GFS A;  5AC7 A;  2ZZ4 A;  1GG1 A;  1YLV A;  3NVT A;  1SZF A;  1WDW A;  4JTL A;  1G4T A;  2JGY A;  1PE1 A;  3EWU A;  3TQK A;  1J2W A;  1ONR A;  2HS8 A;  3CHV A;  3V75 A;  5K3V A;  2GQA A;  3NL5 A;  3DKL A;  5LNS A;  1UUO A;  4LS2 A;  2V2H A;  3BLI A;  2VEI A;  3HGJ A;  2NV2 A;  3L0K A;  3G8R A;  4B5N A;  3W73 A;  5FES A;  4NJK A;  4JTU A;  3GYE A;  3PS7 A;  3F4N A;  5DXX A;  4WY0 B;  2CZF A;  1SQ7 A;  4JN6 A;  4LOC A;  3QQ0 A;  4C1L A;  4HN4 A;  5F4S A;  4UTW C;  1GVQ A;  1XUU A;  3PUO A;  4FNS A;  3DFN A;  4Y96 A;  3UWZ A;  2DP3 A;  4K37 A;  4UFI A;  3MI2 A;  1YXD A;  3LCL A;  5D2X A;  1OF6 A;  4RZ5 A;  1LBM A;  4UIO A;  3L5A A;  3ABR A;  3QPY A;  5LSM A;  5E1Q A;  4LY8 A;  4N9D A;  3LXB A;  3NQE A;  2WKJ A;  1NVM A;  5D2V A;  4JY9 A;  1L6S A;  1TRE A;  3DI0 A;  1KA9 F;  3G1H A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 3S2N A;  4FOU A;  4XBS A;  1GGO A;  2CLE A;  1PEZ A;  5HMS A;  1Q8J A;  3LS9 A;  5E9X A;  4DJF D;  2RH9 A;  3D3A A;  3K4W A;  2DT3 A;  4UFL A;  3W25 A;  1TPW A;  1J0K A;  3T8Q A;  4G7E A;  1B9Z A;  1DTU A;  4GBD A;  2DH3 A;  3BAY A;  3PAN A;  1XYZ A;  3C56 A;  4QJ4 B;  1N8W A;  3JZU A;  2Y0F A;  5BU6 A;  1G7U A;  3NPW A;  3EX2 A;  3P0X A;  5KTL A;  3C2E A;  1ZJH A;  3E2S A;  2YSW A;  4DM2 A;  4Q3M A;  4M29 A;  1D8W A;  3PUL A;  4GIN A;  1O95 A;  5BXT A;  3POC A;  1K70 A;  3QZA A;  4KGL A;  3W01 A;  4GH3 A;  3MUA A;  3QQ1 A;  3S1U A;  4XWU A;  1FCV A;  5J8L A;  4H83 A;  5M2F X;  1K7E A;  4A6G A;  1YTE A;  4KFP A;  2CW6 A;  1S5W A;  3SN4 A;  1PKN A;  4RE3 A;  3LV6 A;  1S1R A;  4CCZ A;  3QR0 A;  4CU6 A;  2E6Y A;  3RRX A;  2REQ B;  1WDQ A;  4GI4 A;  1DWF M;  1M68 A;  1W3H A;  3HMJ G;  3FVD A;  1HJU A;  3BAX A;  1QNV A;  4Q8W A;  1KXH A;  1PIG A;  5CC5 A;  4HYW A;  1R3Q A;  3TOP A;  3H6O A;  4O54 A;  2B7O A;  5CXP A;  2GLK A;  2VGB A;  4HZ8 A;  2BVD A;  5DMM A;  1VFM A;  3L12 A;  2CHO A;  3PF3 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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