3MI2A

Crystal structure of human orotidine-5'-monophosphate decarboxylase complexed with pyrazofurin monophosphate
Total Genus 95
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
95
sequence length
257
structure length
256
Chain Sequence
KELSFGARAELPRIHPVASKLLRLMQKKETNLCLSADVSLARELLQLADALGPSICMLKTHVDILNDFTLDVMKELITLAKHEFLIFEDRKFADIGNTVKKQYEGGIFKIASWADLVNAHVVPGSGVVKGLQEVGLPLHRGCLLIAEMSSTGSLATGDYTRAAVRMAEEHSEFVVGFISGSRVSMKPEFLHLTPGVQLEAGGDNLGQQYNSPQEVIGKRGSDIIIVGRGIISAADRLEAAEMYRKAAWEAYLSRLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Uridine 5'-monophosphate synthase
publication title Structural determinants for the inhibitory ligands of orotidine-5'-monophosphate decarboxylase.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 95
structure length 256
sequence length 257
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.2.10: Orotate phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2010-04-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3mi2A00
1T96A 4A3UA 4ZMGA 2CZ5A 2V5LA 2KZHA 4FEZA 4FHAA 1I2RA 4UFJA 3PUDA 1EUAA 1D9EA 5EL1A 4WQ6A 1JCXA 1TPH1 5DCBA 2H90A 1FDYA 4NNCA 3NL3A 3IIZA 3I65A 3NQ2A 4ML9A 2NXIA 2NX1A 4H3DA 1OFDA 1A5BA 1FXQA 3PSVA 1F76A 2QJHA 3S0CA 2Y7GA 1U5JA 4WX2A 3W7RA 1LRQA 1AW2A 2HS6A 3P5YA 3W1LA 2QR6A 4FNPA 5HWMA 3EX1A 3N9RA 3G3MA 4OV4A 2C15A 2V5BA 3G1SA 5D2XA 1J5TA 4EVZA 3N9SA 4R34A 4FNQA 1CI1A 4HPXA 3TAOA 2G97A 4O11A 3DU0A 2H6RA 2W0UA 3BG9A 1OFQA 2FPVA 3UQNA 2GVLA 2DZXA 1VYPX 1EA0A 4JX5A 1VJIA 3DENA 2Y6ZA 4GJ1A 4DF0A 1M5WA 4N6EA 4LUJA 3MP5A 3UWYA 1RVGA 3R13A 1DOSA 4JY8A 3E49A 4RZ6A 2ZZ3A 5HR7A 2V82A 3CM4A 3NL2A 4O54A 4CNNA 3S6DA 3C56A 2C18A 3GDRA 3BG3A 4N6FA 1ML1A 4O1CA 1PCWA 1KBJA 3F4WA 3QSRA 1SO5A 5F2IA 5AYYA 3W1PA 5D04C 1UJPA 3LV5A 5CPNA 3YPIA 4TMBA 4DF1A 3N2MA 4CLMA 2ZA3A 3C6CA 5CPOA 2NUWA 4DPQA 1AL7A 2A1YA 3GXNA 3HGRA 3LXBA 1JULA 3LI0A 2X1RA 4HSOA 4N02A 4NZFA 1O5XA 3LCIA 3N14A 3GX9A 1VCGA 3KVMA 1EIXA 2Y70A 4EIVA 2P10A 2PRLA 4MZ8A 3BK0A 2Q8LA 1LOLA 2C19A 2C14A 4DBEA 2B7QA 3C52A 1SO3A 4UTUA 4IMDA 4AXKA 1VS1A 2VEKA 3W1XA 4QNWA 3E12A 4C1KA 5HR6A 3NM1A 1Q3NA 2HMCA 3KXQA 3DZ1A 3IIOA 3LCWA 4Y6GA 4H4IA 3W7MA 3LCXA 1PS9A 4Z1CA 4U28A 5C2XA 2E68A 5DLCA 1KM1A 3CB8A 1LROA 3NQ7A 5ABTA 5CZSA 1GYLA 2E77A 3KHJA 1GZGA 2QCFA 3BV4A 4DQWA 4FNSA 4O16A 1W8SA 2TRSA 2V0TA 3BPWA 4O1AA 4XTDA 3TQKA 3C2RA 2QCDA 3IVSA 4Z1BA 1JCYA 1XUUA 3FJ6A 1JCLA 3GLCA 2R8WA 4JTFA 3C2VA 1PV8A 2XN0A 1GG0A 4ZQCA 2J6XA 2FJKA 2J88A 3E0IA 4AVFA 1S5VA 3M41A 4JICA 3FIGA 5LGXA 5A8GA 2QDHA 4FXRA 1OX4B 1DL3A 5KMYA 5D09A 1QPQA 3M16A 1AL8A 1PIIA 3CQ0A 4FXSA 4AWUA 1LLWA 3N19B 5DCEA 4EF9A 2QCLA 3P74A 3QC3A 1W5OA 1S3HA 1BEUA 2Z6IA 3N2XA 3QMTA 2ZZ2A 5DY3A 5EMUA 1K7FA 4MLJA 4BWLC 3WFAA 1WYIA 1XFBA 3BG5A 1RPXA 3HGSA 3G1VA 1W56A 5K9XA 2FPTA 3EX6A 5IM51 1XBZA 4AHPA 1A50A 4E2BA 3GAKA 3MI6A 3CU2A 3W88A 1YTEA 1QDSA 1SZGA 3C8FA 3HOJA 4LC6A 5BRBA 4N9DA 3Q94A 2GVJA 4R7JA 1JR1A 4H6KA 4O1DA 3BO9A 5CG7A 1P5BA 4QIUA 4KWVA 5D33A 4FNTA 3TJXA 5D2TA 3TAKA 2HS8A 1O4UA 3BW2A 1W54A 4HNTA 3W3OA 1JVNA 4S2BA 2VFFA 4LU0A 1FCVA 2J24A 2YCEA 1VHCA 4CNOA 1SW0A 3S8HA 2XN2A 1TMHA 3OEXA 3NQMA 5F2LA 1MXSA 1VLWA 4HNVA 1EEPA 2V2HA 4UXDA 1A53A 4ZQOA 4I7UA 3DFPA 2LLEA 3HF3A 2Y89A 2R94A 3TXZA 1GVFA 2WJZA 3W7CA 4PEKA 2V81A 3HMJG 2NZLA 1ICQA 1OJXA 4RLIA 3DHDA 3O16A 4NXKA 3I6RA 1I2OA 2Z0IA 2VELA 2JKEA 3MYPA 3FYPA 8TIMA 2V9DA 4PCFA 2AGKA 3TA6A 1EWEA 4FB7A 3MJYA 1GJPA 2GJNA 1OX4A 3EWYA 3QRHA 4O50A 1CX9A 4AB4A 2CLFA 4I7VA 2QCNA 1KBIA 2QKFA 5F4SA 2VFDA 3I7SA 1QPRA 4UR7A 3R8RA 1P0NA 2VFGA 1KFKA 3ABOA 1OYBA 1LTDA 4WD0A 3B4UA 5F2GA 2WSRA 2ABBA 3BVJA 3BGJA 3N34A 4HIBA 3WK2A 4Q32A 1OF6A 3BARA 1TPC1 1BKSA 1XBYA 4JD4A 1TRDA 3MUXA 2CLEA 4R53A 3QFEA 5D03A 2Y61A 2YX0A 4QM1A 1D3GA 2CZEA 3G0UA 4FX6M 4O14A 1SW7A 1RR2A 5LKYA 1F73A 3B8DA 3W22A 5G4WA 1WBJA 2X1UA 3STEA 1M6JA 5U4NA 4U4MA 4CNPA 2UV8G 1PE1A 1G6CA 2GVGA 1LBMA 2A6LA 1QR7A 2FDSA 1TV8A 3G1XA 1FCQA 1YXDA 2GQAA 4OV9A 2RFGA 2A7PA 3W1MA 5I3GA 2VEMA 2RH9A 1H61A 1OFBA 4O1BA 1YXYA 3LERA 3HQ1A 3LHZA 1ICPA 3B04A 4I7WA 3BW3A 4JYEA 4FX7A 2TYSA 2ISWA 2VFEA 3TJLA 2GQ9A 2EF9A 4QITA 2Y88A 3HPSA 2W6RA 5AC8A 3A24A 2PCQA 2FTPA 1TCDA 4RJEA 1G67A 2E5BA 4MKNA 1R2SA 2BWGA 4DBDA 1G7VA 2NUXA 1OX6A 1MEHA 3TQ0A 4JIPA 3NQGA 2CU0A 4PL1A 1N55A 3FYOA 1OFEA 1PHQA 3ABSA 4QQ3A 3RK8A 1H63A 1KV5A 1YYAA 3UYCA 1KM3A 1A5CA 1FBAA 1HFBA 1LOSA 5CPLA 5K7JA 3TFXA 1IF2A 1WOAA 4I9AA 3NQVA 4X2RA 4CQ8A 1RD5A 2IQTA 5D37A 1IXOA 4E2DA 3HGJA 3PBUA 2GQ8A 1XDMA 1YTDA 1ALDA 4RCXA 1SZFA 3HG4A 3W1RA 1OFRA 5IBXA 4NXSA 3EKLA 1ONRA 5BMXA 3NR0A 1ADOA 3SGUA 1W3IA 3LGEA 4K7VA 2CLHA 4M7TA 4ADUA 3G1DA 1TIMA 5HMSA 5H91A 1ZALA 4KWWA 5D32A 1UUMA 4AHOA 2Y62A 1SFJA 1XM3A 3TUUA 1H7OA 2O7SA 3O6CA 2RHGA 1XL9A 2G5WA 4ADTA 3L21A 1FQ0A 3LCFA 3W76A 2OX1A 3CPRA 3W2JA 4CCEA 3M5XA 5K3VA 1R47A 4NQ1A 2QUUA 1FDJA 3KVKA 5FI8A 1KV8A 2NWRA 3SGZA 1KFJA 3B06A 3PUOA 2ISVA 1TV5A 2V2DA 1L6YA 3FS2A 3NNTA 2F7FA 2VKZG 4TU1A 4UFMA 4BWLA 1H1YA 2DZWA 4ORMA 5F1VA 1VYRA 1ZNNA 4PODA 2ZRVA 3SIZA 2QJIA 5DELA 1JUBA 1F6PA 5K2ZA 4GUIA 1DV7A 2TPSA 4PA8A 3L0NA 5FF7A 4MYAA 4JDBA 3HGOA 3HG2A 3MWAA 3UNDA 2YZRA 1Z44A 3EX3A 1H60A 4Z08A 3IVUA 5A5WA 4Y90A 1FCBA 1NFBA 4XZ9A 1Q6OA 1T8XA 1TQJA 4MZ1A 4GXMA 4RX0A 2YFOA 3HO8A 3PC0A 3NQEA 4IJBA 3W7QA 4UMCA 1X1ZA 2YDAA 4NT0A 3TK7A 4TO8A 2ZRZA 2P1FA 3GYEA 3SZ8A 1QMLA 5C5YA 1QO5A 3W72A 3NPUA 4FX8A 3QPZA 2H8XA 4LVBA 4X9SA 5LNVA 4PFMA 5KITA 3NA8A 3L66A 3W7PA 4O57A 3O06A 4IMCA 1GVOA 5D30A 4K39A 3UXAA 3JS3A 3WK0A 4OU1A 3V1PA 4Q4KA 1OFPA 4YCPA 1OABA 2QCDB 4LWWA 3W86A 4GC4A 5K9DA 2ZRUA 3NL6A 2Q3OA 3T7VA 1H7PA 3OVPA 4MY1A 1GTHA 5AYXA 1W5MA 5CZJA 1A5AA 1LZOA 1HUVA 2ZCGA 1GEQA 1WV2A 1B9BA 5TQLA 1DHPA 5I3FA 5EY5A 3EWWA 1VHNA 3S1VA 3O6YX 4XBKA 2J27A 1H5YA 3LXCA 4XQ6A 4JTUA 1NAL1 3QF0A 1TRIA 4X3ZA 3G18A 3THQA 1K7XA 2E6DA 4NJKA 1W0MA 3RLVA 3NQ8A 3C4UA 3I7QA 4M19A 4A2RA 4CQ9A 3A5VA 1MEIA 2QDGA 3P81A 1F2JA 5D2WA 2OMAA 2H3BA 3MI3A 1SSDA 1WQ5A 5HUOA 5G1YA 1LORA 4DXVA 2YR1A 3PY2A 3VE9A 3CEUA 7TIMA 1QOPA 2RDWA 1TPVA 4NVTA 1OX5A 2EGZA 2VFHA 5FESA 3G1HA 5AYZA 1Z42A 4O10A 1K8ZA 4NUWA 3IIVA 4O13A 1GTEA 3MP4A 3ZS4A 4NNAA 4M6QA 3W1NA 2QCEA 5G1TA 1RQBA 2ABAA 4O8RA 3W1QA 3EEGA 3STFA 4DEFA 1JCJA 1VPXA 3LTSA 2BTMA 3IEBA 3Q58A 1VCFA 4O17A 3A22A 3B0VC 3UPWA 2WOQA 3JRKA 5CGQA 2WNQA 1TJRA 2NUYA 1RQHA 3L2IA 2BZNA 3PAJA 1FWNA 4FO4A 3UWVA 4UTTA 1X7FA 3T44A 3S9YA 1Q6RA 3PULA 4IPIA 1LYXA 4AH7A 1BWLA 1TTPA 1RV8A 2A6NA 2JKAA 2Y7EA 5AHIA 1FCUA 3UWWA 1I2PA 3SJ3A 5EBUA 1SZEA 4AF0B 1W37A 4IQLA 5IBXC 3CWNA 1LBLA 2Y85A 2ZFAA 3UXDA 3GDKA 3GDMA 4JX6A 2QJGA 1TREA 3G1AA 2OT0A 3C3NA 3QJAA 4B5NA 3KRUA 3W73A 1QWGA 3W7KA 5KZMA 3MP3A 1AW5A 5H2ZA 5DN1A 4WXYA 4ZQMA 1CW2A 1YXCA 3DBPA 1K8XA 1FWWA 3F4NA 4O4WA 3G8EA 3E96A 4KFOA 2EAWA 4HHPA 2YYUA 2FLIA 2WKJA 5HWNA 4UTLA 1G7UA 3A5FA 4RXFA 1YTKA 1FWSA 5L6UA 3LHYA 2BLEA 3M1ZA 2FPYA 4IXXA 4Q33A 3BLFA 3MHFA 2WSQA 3SSJA 1X1OA 5FEPA 4HKPA 2PRMA 1LOQA 4OGZA 4OQVA 3NM3A 1J2WA 3G8RA 3NEVA 4ZQPA 3TMQA 4LVFA 3TFCA 4LS0A 3ZR4A 3NPXA 2Z1BA 3QZEA 3I7RA 4WY0B 3EB2A 4QISA 1EP1A 2JGQA 1G4TA 3M6YA 5D2YA 2NX9A 3P60A 3C61A 1Q6LA 4RZ5A 5HQEA 4AMAA 3GZ3A 5E0KA 3QM3A 3WJYA 1EB3A 3TKFA 5SWUA 3DGRA 3RF9A 2WV8A 3LX9A 1W5NA 3LBMA 3O15A 3EWUA 3PVFA 1V5XA 2CLLA 2Y7FA 3DI1A 3DHFA 3QW3A 3TW7A 3V75A 4UTMA 3T78A 3W07A 2GJLA 4AWSA 3NAVA 4IX2A 4EF8A 3P62A 1TV7A 3FKRA 3INPA 3MI2A 5G4EA 3CHVA 4UR8A 4ALDA 4HPJA 4UNLA 4M7SA 4WXZA 2X1TA 4EWND 1LRTA 3MO7A 2H8ZA 1GT8A 2A2IA 3UD6A 4EOUA 5U7SA 4W9TA 3M5ZA 3PG9A 3SW6A 3TW6A 2GOUA 1V7YA 6TIMA 4AF0A 2DZPA 2ZRWA 3QPYA 4LS1A 5F2MA 4UTKA 3UWUA 2ZA2A 1GG1A 1VLIA 1KFLA 1WBHA 3W71A 1O95A 1ZFJA 5C54A 2DZTA 3LCLA 2NV1A 3CEPA 2BX7A 1KLYA 1X6UA 1FX6A 1W3NA 4MJMA 3TSBA 1JUKA 3GKAA 4XBSA 4IMGA 5F1UA 4A21A 1UUOA 3GR7A 1E51A 3HG3A 1L9WA 4ZL1A 5D02A 5DBUA 3W74A 4UTWC 4Y96A 2CFFA 1W5QA 3GXTA 3P67A 4MFEA 2YW4A 3LXAA 4TX9A 1WXJA 3DKLA 4GUFA 1QAPA 3W70A 3QYQA 1YDNA 3S1UA 2ZQ0A 1KM2A 1N8FA 2E09A 3UWZA 3N3MA 4AHQA 5T26A 1GWJA 3P8IA 3UWQA 1XXXA 1JRBA 1LRNA 3KVLA 3SECA 2ZRYA 3LCGA 2A7NA 1K8YA 1KFCA 1UB3A 4JIQA 5FEXA 1LBFA 4HSNA 4ICNA 4LVDA 4WY0A 3TDFA 1L6SA 4IWWA 3OVRA 1WAUA 1HTIA 2R91A 3DFQA 3A9IA 4GBUA 1LP6A 3T40A 3W2UA 4PC8A 1G4EA 4N2YA 2V2CA 1VQTA 3PBWA 1QPOA 4MJZA 3HPZA 3LLFA 1T99A 3G24A 1J4EA 5J5DA 2VC6A 4O53A 1XKYA 3RU6A 3HIJA 3SFKA 1TPFA 4YCOA 3R2GA 2A0NA 4LV4A 5EPDA 1M7OA 3VNDA 5I3KA 1TB3A 2ISSA 4G1KA 3IGUA 2ZZ1A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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