3MUAA

Enzyme-substrate interactions of ixt6, the intracellular xylanase of g. stearothermophilus.
Total Genus 132
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
132
sequence length
330
structure length
330
Chain Sequence
NSSLPSLRDVFANDFRIGAAVNPVTIEMQKQLLIDHVNSITAENHMKFEHLQPEEGKFTFQEADRIVDFACSHRMAVRGHTLVWHNQTPDWVFQDGQGHFVSRDVLLERMKCHISTVVRRYKGKIYCWDVINEAVADEGDELLRPSKWRQIIGDDFMEQAFLYAYEADPDALLFYNDYNECFPEKREKIFALVKSLRDKGIPIHGIGMQAHWSLTRPSLDEIRAAIERYASLGVVLHITELDVSMFEFHDRRTDLAAPTSEMIERQAERYGQIFALFKEYRDVIQSVTFWGIADDHTWLDNFPVHGRKNWPLLFDEQHKPKPAFWRAVSV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Enzyme-Substrate interactions of IXT6, the intracellular xylanase of G. stearothermophilus.
rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Geobacillus stearothermophilus
molecule keywords Xylanase
total genus 132
structure length 330
sequence length 330
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2010-05-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3muaA00
5HNNA 1ISWA 2G3JA 3AMCA 4CU8A 2EPKX 3W37A 2BY1A 4FMVA 1XYFA 4UZUA 1W2VA 3RCNA 4AD3A 3QHNA 1TR1A 3ARWA 4F8XA 4GINA 3GM8A 3PZ9A 3QR3A 2XWEA 2WKGA 3N11A 4HMCA 1J0JA 2V38A 5A1AA 1V0MA 1UWTA 1V0NA 5BRQA 3IANA 2BHYA 3PZOA 4GQRA 1C8YA 4LYQA 1JF5A 1W9UA 4BQ3A 4HOZA 2PF0A 1J01A 4CN4A 5E6YA 3T2QA 3A6OA 1JZ6A 1QNOA 1CZ1A 4BS0A 1X1NA 4MNLA 4W5UA 4CKQA 3MUZ1 1UD3A 5ABHA 3IAPA 1H49A 3VM7A 2D22A 1IZKA 1WZKA 2ZE0A 4GI8A 1US3A 2IUZA 3A3HA 2OSYA 3QHOA 4UOJA 5BXSA 1PBGA 2VQUA 2YKKA 3T09A 1J10A 2E9BA 3U7VA 3WNKA 2CKRA 1GW1A 1UG6A 2FH6A 3IAQA 4QAWA 3SUTA 3VD3A 1IT0A 2J62A 3WQWA 5M17A 1D2KA 1WAWA 1C8XA 3N17A 5C71A 2Z1SA 3MUY1 4AYSA 1BYAA 1U33A 3EMQA 5CSUA 4AZCA 2BXYA 3ZT5A 1JFHA 3SCRA 1CXHA 1WCGA 1UWRA 1WZLA 3O6AA 4H8HA 4WLCA 3IJ9A 1X6NA 1EGZA 5EB8A 5IHSA 3LPFA 4UQDA 4P7RA 2VZOA 5HOSA 1OWQA 4UQAA 2DIEA 1W1TA 4RE2A 1HKMA 1KXQA 4PMUA 4TVCA 1QNRA 4AZ6A 1OGSA 2D2OA 1JD9A 2PWGA 2Y8KA 4N0RA 2CCRA 2DT3A 4GZJA 1UH3A 2JIEA 5A2BA 1MW1A 2DPEA 4FLRA 2V5DA 1EHAA 1KB3A 5IFTA 4S3JA 2V3FA 3CHCA 1HVXA 3OLGA 2JFEX 1HJXA 3VD4A 4ML4A 1US2A 2UY2A 3WUBA 3WUFA 3NSMA 2OYKA 4PMXA 2X2YA 4DWSA 2D23A 1JZ2A 2WZIA 1ZU8A 1B31A 3L4VA 1VENA 4E4PA 3GYCA 4UFLA 1MWOA 1YQ2A 3F4VA 2A3HA 4CD8A 3UETA 1XYZA 3VIGA 3OLEA 2XYLA 4UFIA 5DT5A 3AIUA 3WUEA 1J9YA 4GI9A 3UG5A 1H11A 1ISZA 2W61A 4PSPA 3WEZA 3ARXA 1UKPA 2OWWA 3WNNA 1KWGA 2MANA 2V3EA 3AICA 3OIHA 1CGUA 1GUVA 2GK1B 1PZ2A 3U57A 3WNMA 1BGGA 1G9HA 3B9AA 4KH2A 4AZBA 4AZ7A 5IDIA 1EOKA 1V08A 1W1YA 1JZ3A 2XWDA 4PMDA 4WKHA 1G1YA 4U3AA 1XH2A 3AOFA 3THDA 4D6GA 3MUAA 1W3JA 4OIFA 4IISA 1EHNA 2ZXAA 3LPOA 4J7RA 2WCGA 4MB4A 4H41A 2PWFA 1EXPA 2DIJA 3WD2A 4U5KA 1V0LA 3W4RA 4DM2A 1HKIA 3WEMA 1OT1A 1LL7A 2EBNA 3A4AA 4HU8A 3CZLA 3WF1A 4CD6A 2J7BA 4CU6A 3DYOA 3GH4A 3VMPA 4AWEA 3MSGA 3AXXA 1E0XA 1W3HA 2YIHA 4H7VA 1UZ4A 1V02A 1BGAA 3OGRA 3GXFA 4D1JA 2DT2A 2ZUWA 2F8QA 3AS0A 3A47A 4W87A 1E6PA 3B9DA 3VDCA 1NARA 4WSJA 5AYIA 4ATDA 2ZIDA 5CPQA 3WDRA 1UA7A 5FL0A 1EO7A 1DWHM 1C93A 3T08A 3GTNA 4HPHA 4DUXA 3SCWA 1QI0A 3WD3A 2VURA 4DUVA 4GO8A 2OYMA 1UR9A 1FOBA 3NUKA 4W84A 3NIYA 4PTWA 1XC6A 1W9VA 1XHGA 2BXZA 4PUDA 1QI5A 1WDPA 4W86A 3KL3A 3B8SA 2WSPA 9CGTA 1ZJAA 5LA0A 1O7AA 4HZ8A 3WY1A 4D1IA 2XIBA 3AYSA 4W7WA 4AD5A 5A6AA 1PEZA 4M24A 4NRRA 2BV9A 4TX6A 1BLIA 2XM2A 3RM9A 2PBOA 1CENA 3WQ5A 2NW0A 2V3DA 3WNPA 2J4GA 4B9YA 4C7DA 2YL6A 4W8BA 3G6MA 3NCOA 2JF6A 1BYCA 1NM9A 1CGXA 3J7HA 4RE4A 1UD8A 4KMQA 2W4XA 4NSBA 2Z1KA 1UD5A 4GZIA 4UQ9A 2WW5A 2WC7A 1KBBA 3VGHA 3ZJ8A 2FGLA 4AZIA 4GXPA 1JNDA 3W53A 3VIPA 1V6YA 5DT7A 1CNVA 1VFFA 3VX1A 1EO5A 3VKKA 1JF6A 1BF2A 1Q6EA 1V03A 4GZEA 2J77A 4PMZA 4HMDA 4EAMA 1H41A 1ZJBA 1E9LA 2Y24A 1E3XA 4H2CA 1CTNA 1I75A 4HA4A 1TVPA 4NRSA 1J18A 1UHVA 4LYRA 4HOWA 1E5JA 3D5HA 1UKOA 3I3EA 3L4ZA 4B9ZA 4MJ4A 4PMRA 1QVBA 4V28A 1O6IA 3K4AA 2GUYA 4DWSB 1JAEA 2XSBA 5E6ZA 3OA5A 1E72M 3A4WA 4PCTA 1W1VA 2ESCA 1KXTA 4AXNA 2VZUA 3FAWA 1FH7A 3PZMA 4AISA 4QLKA 1M7XA 4JFUA 2HVMA 1G0CA 2EQDA 1XSKA 3AJ7A 3ZSSA 3SCOA 3PZNA 3WNLA 2YA2A 2J7DA 5F7UA 3WQ4A 2G41A 1MXDA 3AXIA 4UTFA 3T0AA 3RIKA 4WKFA 1JL8A 4UFKA 1HJQA 1JG9A 2DSKA 1B3ZA 2IXUA 2VCAA 1J11A 1PPIA 1AQHA 4JIEA 3PZTA 1E56A 3DYMA 2O9PA 1CEOA 3WF4A 1UWSA 4HU0A 1FFRA 3CZJA 4DM1A 5A8NA 1SMAA 2XHYA 4AY1A 1DP0A 4K68A 4UFMA 4BQ4A 2ZWZA 2CETA 1NOFA 2TAAA 4AD0A 4FLSA 4OOZA 1WPCA 4U31A 3VD5A 2WMHA 1PIFA 1KQZA 5M5DA 3VD9A 3MKKA 3UR7A 1BG4A 3SUUA 2J8FA 2WMKA 1ITXA 4MNMA 3ZT7A 5LYRA 4L4OA 2CBIA 3UG3A 1XSJA 5HDRA 5A8PA 5BWFA 1V6WA 1NP0A 1WNOA 4D71A 3U5UA 3WKZA 2ZX7A 1KGWA 2XFRA 3K4DA 3ZM8A 3ALFA 3TTQA 2UY5A 4IUGA 3BAIA 2E4TA 2VT0A 4CD7A 2GFTA 3O9NA 1PAMA 2DT1A 4PMNA 1JXKA 5I78A 1QNSA 5HPCA 2O9OA 1W9XA 3EMZA 5KZ6A 1YHTA 1B0IA 1ZBVA 1UR8A 5LA1A 4Z2IA 1U30A 2DT0A 4AZGA 1A3HA 2BNJA 2WAGA 3PHAA 2Q8XA 2XFFA 1M04A 1R7AA 1UWIA 3FAXA 4JKLA 2YOCA 5I79A 1C8QA 1TVNA 5I6SA 3KEHA 1C90A 2BVTA 5CG0A 4P8VA 3IJ8A 3ARYA 4YHEA 3MMUA 2XJ7A 1WDQA 1WE5A 1CXLA 2WYSA 3TP4A 3L4TA 1CGVA 4WK9A 1G5AA 4M56A 5CGMA 3AIQA 3K46A 2CNCA 3OGVA 2VC9A 4NZCA 2OLHA 3GNPA 3PZGA 1K9DA 2W67A 5D4YA 2WM0A 3RO8A 1BTCA 3QHMA 1E55A 4HMEA 1W3LA 3BAJA 1MVYA 1Q4NX 1HL9A 1ZBWA 3ZQ9A 1W9PA 2DSZA 2VVNA 2E3ZA 3MUIA 4P8WA 4QLLA 4S3KA 1QHPA 2W5FA 3AZRA 1ISYA 4BCEA 2VZTA 3WH7A 3VVGA 4YN5A 3WF0A 5C70A 4KGJA 4PMOA 3VO0A 1TCMA 1UYQA 2WSKA 4CUCA 4UOQA 4CN1A 1PX8A 4D6CA 3DYPA 1DWIM 1W91A 3RDKA 1UZ1A 1BHGA 1OT2A 3I3BA 2CITA 1CGWA 1ZS2A 1E1EA 2NT1A 1VF8A 4UZSA 1J0KA 1RH9A 1NP2A 1H09A 1E40A 3VMOA 4EE9A 1R86A 3K1DA 2J25A 3FY1A 3T2OA 3HU7A 4BQ2A 2WB5A 4WSKA 3CHEA 3MO4A 5M3WA 1RP8A 2Y8VA 1HJSA 4PSRA 3E1F1 3ZR5A 5ABFA 1B3VA 3TOPA 3WD0A 5KEZA 4CU7A 1QNQA 2YL9A 1OB0A 2X8RA 2PBGA 1RP9A 1JXJA 1E71M 2C0HA 4Y7EA 4ZFMA 5A94A 6A3HA 2V5CA 4YPJA 1WO2A 2AMGA 4QCEA 2FHCA 1FHDA 5DMYA 3BAXA 5D8WA 3CPUA 3PBGA 4XZWA 2FH8A 1E4IA 2WHKA 2YL5A 2QV4A 1JZ4A 2J7EA 1LG1A 3THCA 1QI2A 1EDQA 4MTVA 1TUXA 4AD4A 1E6XM 3MSDA 1BYDA 3AHZA 3L2LA 1VFUA 2WZEA 3AHVA 4UCFA 3MU7A 1C7TA 3EDFA 3QOKA 1BPLB 2J75A 3CZGA 4UNIA 1VAHA 5A6JA 3ARZA 2EPOA 2G3MA 1UKQA 1K9TA 1E0WA 1KCLA 1R8LA 4M29A 4F9DA 4HPGA 4EANA 1HL8A 4W7VA 4UR9A 1HJVA 1J0YA 3CHDA 1E73M 3NYDA 1HVQA 4TVDA 2WVVA 2ZUMA 4NI3A 3VMNA 1NOUA 1C92A 4HZ7A 4U5IA 2F2HA 4TXEA 3JUGA 4CD4A 3T0BA 1OCQA 1JNEA 2WKLA 5LA2A 2NT0A 2EO7A 1R85A 1XCXA 1NWRA 1VJZA 1MW3A 1VEPA 4J28A 5E70A 4BA0A 1UQZA 4P8XA 3VGFA 3WMCA 2BY3A 3MMDA 5GPRA 1J12A 4IPNB 2XFYA 1SMDA 3WBEA 1S46A 5M03A 1Q6GA 1JD7A 1KXHA 3MV11 1GCYA 4CD5A 4AMCA 4Z2HA 3G6LA 3TTSA 3WSUA 1I1XA 4IPLA 2QPUA 1WDSA 1VJSA 2IXVA 1LL6A 3VOCA 2B31A 3GXMA 4TTGA 3OLDA 5IFPA 1G01A 1G94A 3WDPP 2XGIA 1OD0A 1EDTA 4U33A 4PCSA 1GJUA 1GQLA 2VCBA 3WMBA 2XVKA 2W63A 1HP4A 2D1ZA 3MANA 1QPKA 1UA3A 1MQQA 2CHOA 3EMCA 5AYBA 2YA1A 3WH5A 1M03A 2VX5A 4OZOA 5JIPA 3WEOA 2EXOA 4FK9A 4HA3A 2E0PA 1VFOA 3GZAA 5D9MA 2CESA 1V3IA 1X6LA 1OIFA 1HJUA 1B2YA 3PZQA 3VILA 3QOMA 1FHLA 1XH1A 4W8LA 1E5NA 5DF0A 1UUQA 5GNXA 1OINA 1GOKA 1E70M 5I77A 1JYWA 4LYPA 3FW6A 1DWGM 3OBAA 2WHLA 2D0FA 3K8KA 1LL4A 1TA3A 5D9PA 1J0ZA 1E4NA 1HF6A 4ZE4A 3HJEA 1JDDA 4TOQA 2O9TA 5A6LA 5GNYA 5HPOA 5JIWA 2GDUA 2JEQA 4W5ZA 3BAWA 2CYGA 1OM0A 2JIWA 2W91A 3ARUA 1CXKA 4HTYA 3CHFA 2WHMA 3HN3A 3M7SA 1KGXA 5ABFB 3VIKA 6CGTA 1W9DM 2UY3A 2ZXDA 1UKSA 2EPLX 3CUJA 4X0VA 2XGBA 5A2CA 1DWFM 4PRWA 3SCPA 2GDVA 4X9YA 5E0CA 2VNCA 3AMKA 3GXDA 1Z32X 1BVNP 3AXHA 4UQCA 4W8AA 2VX6A 1GQKA 2NSXA 3TTYA 5A6SA 2QLYA 5D9NA 1GORA 3UESA 3DECA 3ZSTA 1WZAA 3PN8A 1JI2A 3CGTA 1V3HA 4OBSA 3VGDA 5I23A 1LWJA 5I2UA 5JBEA 4MPKA 3CZEA 3GH5A 2E40A 1H0IA 1V6VA 1PJ9A 3NDYA 3VD7A 1GVYA 1FH8A 3RJXA 4AIUA 2J74A 1D3CA 1CLXA 3WH8A 2X09A 4ZEPA 4J3XA 4PMQA 1GOQA 4H8UA 1WB0A 4E8DA 4FLQA 1ISVA 2YDSA 3CO4A 2AOSA 1LF1A 1DWAM 5FOOA 3AMGA 4ATWA 3PTMA 2X0YA 1LG2A 4PUEA 2WVVB 2ZXQA 3AQUA 2D20A 2GJPA 1L8NA 1XRVA 2QF8A 3ZJ7A 3OZPA 2GJRA 2WCSA 1E43A 3T0DA 1B1YA 1E6QM 4RE3A 4AIOA 1TG7A 1VRXA 3UERA 4QCFA 1HNYA 1MQRA 4GO9A 3WF3A 5A6MA 1HT6A 8A3HA 4P7QA 3VM5A 1H5VA 4C7FA 2HISA 2O9RA 3RPMA 3N9KA 5JBDA 3W38A 2BVYA 2DDXA 4JCLA 5E09A 2F61A 1FP8A 2C8NA 3AROA 4MJ2A 1E3ZA 4PTVA 3DC0A 3BSGA 2ZUSA 2W62A 4E2OA 1QHOA 4B3LA 3BAKA 3WELA 1RPKA 1PZ3A 2VL4A 2YLLA 1E15A 1JZ7A 3K8MA 4XZBA 1HKKA 1PIGA 4A3HA 4CCCA 3WH9A 4JZ5A 2X05A 3WQVA 4W93A 1GNXA 4LGXA 1CGTA 5A8QA 3FHAA 3W27A 4J3VA 2CBUA 2YDQA 3N12A 2XVLA 4PEEA 3QGVA 3CZKA 2QHAA 2A3CA 3DHUA 4P8UA 2ZWYA 3W25A 3ARQA 4ACYA 1XSIA 3AS2A 4UQEA 1B3WA 1U2YA 3FXYA 2CXGA 3W0KA 4W88A 2JF7A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5HNN A;  1ISW A;  2G3J A;  3AMC A;  4CU8 A;  2EPK X;  3W37 A;  2BY1 A;  4FMV A;  1XYF A;  4UZU A;  1W2V A;  3RCN A;  4AD3 A;  3QHN A;  1TR1 A;  3ARW A;  4F8X A;  4GIN A;  3GM8 A;  3PZ9 A;  3QR3 A;  2XWE A;  2WKG A;  3N11 A;  4HMC A;  1J0J A;  2V38 A;  5A1A A;  1V0M A;  1UWT A;  1V0N A;  5BRQ A;  3IAN A;  2BHY A;  3PZO A;  4GQR A;  1C8Y A;  4LYQ A;  1JF5 A;  1W9U A;  4BQ3 A;  4HOZ A;  2PF0 A;  1J01 A;  4CN4 A;  5E6Y A;  3T2Q A;  3A6O A;  1JZ6 A;  1QNO A;  1CZ1 A;  4BS0 A;  1X1N A;  4MNL A;  4W5U A;  4CKQ A;  3MUZ 1;  1UD3 A;  5ABH A;  3IAP A;  1H49 A;  3VM7 A;  2D22 A;  1IZK A;  1WZK A;  2ZE0 A;  4GI8 A;  1US3 A;  2IUZ A;  3A3H A;  2OSY A;  3QHO A;  4UOJ A;  5BXS A;  1PBG A;  2VQU A;  2YKK A;  3T09 A;  1J10 A;  2E9B A;  3U7V A;  3WNK A;  2CKR A;  1GW1 A;  1UG6 A;  2FH6 A;  3IAQ A;  4QAW A;  3SUT A;  3VD3 A;  1IT0 A;  2J62 A;  3WQW A;  5M17 A;  1D2K A;  1WAW A;  1C8X A;  3N17 A;  5C71 A;  2Z1S A;  3MUY 1;  4AYS A;  1BYA A;  1U33 A;  3EMQ A;  5CSU A;  4AZC A;  2BXY A;  3ZT5 A;  1JFH A;  3SCR A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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