3MUIA

Enzyme-substrate interactions of ixt6, the intracellular xylanase of g. stearothermophilus.
Total Genus 129
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
129
sequence length
330
structure length
330
Chain Sequence
NSSLPSLRDVFANDFRIGAAVNPVTIEMQKQLLIDHVNSITAENHMKFEHLQPEEGKFTFQEADRIVDFACSHRMAVRGHTLVWHNQTPDWVFQDGQGHFVSRDVLLERMKCHISTVVRRYKGKIYCWDVINEAVADEGDELLRPSKWRQIIGDDFMEQAFLYAYEADPDALLFYNDYNECFPEKREKIFALVKSLRDKGIPIHGIGMQAHWSLTRPSLDEIRAAIERYASLGVVLHITALDVSMFEFHDRRTDLAAPTSEMIERQAERYGQIFALFKEYRDVIQSVTFWGIADDHTWLDNFPVHGRKNWPLLFDEQHKPKPAFWRAVSV
Loading diagram...

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Enzyme-Substrate interactions of IXT6, the intracellular xylanase of G. stearothermophilus.
rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Geobacillus stearothermophilus
molecule keywords Xylanase
total genus 129
structure length 330
sequence length 330
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2010-05-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3muiA00
2NT1A 1JZ8A 3SUWA 3AIWA 1LG1A 4B3LA 4AW7A 1KWKA 2ZXQA 3W26A 1JIBA 5C8BB 5IFPA 3GNPA 1J0KA 2V3EA 4W8LA 4B9ZA 1V3MA 1HP5A 3AI0A 2WZEA 4PYSA 3LMYA 2IXVA 3VGFA 5LA1A 3RM4A 3VPLA 5DO8A 4D1JA 2GUYA 3ARQA 2J74A 4P7LA 1FP8A 1ISVA 3SCQA 1MFVA 1KQZA 3WIJA 1RD6A 2DH3A 1JYXA 4U31A 4W7UA 4UZSA 2DEPA 3WDHA 1HF6A 1V03A 1C92A 2E9MA 1BYDA 1CECA 4X9YA 4MJ2A 3U7VA 3UEQA 5ABHA 3ARXA 3AIBA 1R85A 4H8UA 3ZJKA 3GXIA 4AXNA 1XC6A 3U7BA 3GXFA 3SEPA 3CZJA 5KEZA 1GNXA 3J7HA 4AD2A 3SCSA 3SCNA 2CNCA 4U3AA 3CH9A 3F5LA 5BXPA 5CLWA 2CXGA 2X1IA 4TTGA 2WCAA 1HX0A 1G9HA 1W9BM 3MSDA 1D7FA 4CD8A 4UQBA 2WKGA 2W4XA 2EPLX 1D3CA 1L0PA 2J4GA 3AISA 1HXJA 4TVUA 2EJ1A 3PTMA 1PIFA 3CMJA 3K1DA 4OUEA 4AIEA 1ZBVA 1AQHA 4V2XA 5IHRA 3ARPA 4QP0A 1RP9A 2CCRA 3VDBA 3QOKA 5LA0A 3EDKA 2J8FA 3OZPA 2XFFA 3QGVA 5GQBA 5C71A 2YDSA 2J47A 4HMDA 1U33A 4U5KA 1UH2A 3WNNA 3WD1A 3QOMA 1J0ZA 1EDTA 1V3LA 4AIOA 3WBEA 2YKKA 4DUXA 3QHOA 3CZKA 2A3EA 2J7GA 3BSGA 3L2LA 1BG4A 3VX0A 2ZWZA 1KXHA 4ZXLA 4X0NA 2B31A 3GXDA 4CUCA 1UR9A 2VNCA 3TTOA 2WWCA 1CGXA 2D0GA 5GNYA 1QHOA 4TXEA 4UOQA 1M03A 4AD5A 1W2VA 1XRVA 3CLWA 2J62A 1KCKA 1JDAA 2WSKA 4F66A 3MV11 1GHRA 4QFUA 1PEZA 1E70M 2J7BA 2G41A 1UZ1A 2JALA 4MDOA 5FD0A 4BQ3A 5JIPA 4U3CA 4AZBA 3GBDA 2XM2A 3A4WA 1EIBA 3TOPA 1WO2A 3F5KA 1W9UA 4JL1A 4TTUA 4ZE4A 2EPOA 1JL8A 1GQJA 2GJXA 3WL1A 3WBAA 3CO4A 2VZSA 2WZIA 3WUFA 3I3DA 3ZJ7A 3UESA 1JG9A 3T2OA 1B3VA 3GZAA 2PC8A 3VDAA 1MQQA 4DM2A 4HOWA 2F8QA 3VD3A 1E55A 2XIBA 4N42A 1C7SA 5DT7A 2FGLA 3UG5A 1DEDA 1UKPA 4LYRA 3AHTA 3ZR5A 4HU8A 3WUBA 4AD0A 1EHAA 1J0HA 4EKJA 4CGTA 4L4PA 3RMEA 1JZ7A 3B8SA 3SUUA 1GCYA 4HA3A 4CVWA 1C90A 1WPCA 4P8XA 2Z1SA 3BAKA 2J7CA 4OZOA 2ZUTA 1UWTA 1XSJA 3AIQA 4W93A 1W3KA 4M29A 4JCMA 5D9NA 1W9DM 4PBGA 3DYMA 2OSYA 3MUZ1 4HOZA 3POCA 1ZL1A 4UFHA 3WH7A 3CZLA 3WH6A 4M82A 1XHGA 2GJRA 1ISZA 2ESCA 5AC4A 4MB1A 2W5FA 1H4PA 3FNDA 1OWQA 4D6IA 3B9AA 3SCVA 1B30A 1PZ2A 4J3XA 1BVZA 1BYBA 3OB8A 4PMUA 1ISYA 1E3XA 2YBTA 1KR0A 4PN2A 5EFDA 1VJSA 1CLVA 4PSRA 4WSJA 1PBGA 3WDRA 2RGLA 2UY3A 2JIEA 5I79A 2V5CA 1P6WA 1XCXA 2CKSA 2J77A 1FA2A 1V6UA 3GTNA 1XYZA 1MW3A 1VBRA 4CVUA 4CD5A 3ARSA 3GBEA 1UWQA 1U30A 5A3HA 4IUGA 3OLGA 4AZHA 1JI2A 5A6LA 1QVBA 3CUHA 1EA9C 1MW2A 3N9KA 4B3KA 3WF0A 2J25A 3RO8A 4UR9A 4AY1A 3N04A 1BG9A 3VGDA 5GNXA 3CIVA 4W7VA 4X0VA 1QNQA 2ZXBA 5CPTA 2YL6A 3BLKA 3A47A 3AOFA 3FHAA 5A2CA 3VD5A 2X0HA 1OIMA 1OGBA 1QNPA 1VRXA 1RPKA 1W9PA 5HPCA 2Y24A 4QAWA 2OWWA 2GJPA 4UFMA 1WAWA 2XPKA 2YDRA 5ABEA 1LLOA 1GVYA 3AYRA 1WDRA 1JYWA 2F61A 4M80A 1E72M 4PTWA 3RIKA 4UQCA 2UY2A 1KFWA 3IJ9A 4PCSA 2W92A 2G4FA 1IV8A 4LXFA 4P7NA 4D72A 4QLKA 3MV01 2VZUA 4NF7A 4AZ7A 1HJWA 4AYSA 2VL4A 1VEPA 2QPSA 2UY5A 3WENA 3AMGA 1FOBA 1GOOA 3AIEA 2DT2A 2HVMA 3ECQA 3SCTA 2EPNA 1JAKA 2OLHA 1Q6FA 3BAIA 5AYIA 1UHVA 4D71A 3BGAA 2A3AA 1XH2A 2D2OA 3RM8A 1HL9A 2G3MA 5HOSA 3W81A 4KRUA 2NW0A 5A6KA 4HMCA 3ZO9A 1QI2A 2UWFA 1F4AA 2CESA 1TMQA 3LPFA 5CGTA 5M3WA 1D2KA 4FF5A 4FLQA 4OBRA 2DSZA 3WNOA 4S3JA 2OSWA 5A6JA 1UQYA 1Q4NX 5TD4A 4B16A 2C0HA 4MTVA 4J3WA 2ZX8A 2DQXA 4JAWA 5EFFA 4MJ4A 1E0VA 3FY1A 4PMXA 3GH4A 4UZUA 2DT1A 3ALFA 3DC0A 4KGJA 4MNLA 1OD0A 1EO5A 4QCEA 3SCUA 3W0KA 2MANA 3AHXA 4LYPA 4CN4A 4U33A 5BWFA 2YLAA 1NP2A 1B3ZA 3RDKA 5D9MA 3FW6A 3AXHA 3VIIA 4FLOA 1WKYA 3NUKA 1J0YA 1BTCA 1DHKA 3GH7A 3WDIA 3CZ8A 5E0FA 3CGTA 2CYGA 3WH8A 2WMGA 3GM8A 1QI0A 4GIAA 5I77A 3VX1A 3W28A 4H7VA 4P7RA 3ZT7A 5FIPA 5CSUA 3A3HA 1GW1A 2ZUNA 1GQIA 2ZE0A 2PF0A 1WZKA 2CERA 2ZWYA 4AC1X 1UZ4A 4OJYA 1GJUA 3OGVA 5DT5A 5CGMA 4GQQA 2WHLA 1PJ9A 3TTQA 4WF7A 2VCBA 5I24A 5F7UA 1UD3A 5A2BA 4HA1A 1B3YA 3WQ5A 2G8ZA 2WMFA 2VRKA 1E4LA 1NWSA 5BXTA 1B31A 1NARA 2CITA 2DIEA 5D4YA 4K68A 5JBDA 4OOZA 3RCNA 2VOTA 1ODUA 3CBWA 1LWHA 1VF8A 1LQ0A 5LA2A 3IJ8A 2DPEA 2VMFA 1UD6A 3CZGA 4CN6A 4NSBA 1QI3A 2CBJA 1XD0A 1NQ6A 3W37A 2VZVA 2Y4SA 4HPGA 4PUDA 3N11A 3EDJA 4M56A 1ISWA 3WFZA 4MDPA 1TVNA 1FH8A 4HZ6A 3RJXA 1OB0A 1LJYA 5A8PA 2CHOA 3WD3A 4U2YA 1HP4A 1JXKA 1MW1A 1IZJA 2XYLA 2PWEA 1B2YA 4GZIA 3PZOA 1UD8A 3PTKA 1HVQA 3NSNA 4TX6A 1FHLA 2OYMA 4GI9A 4HMEA 5E6YA 2V38A 3U5UA 2XUCA 4AZGA 1UWUA 3ARWA 1KXQA 3WSUA 4J3SA 1E6QM 1OD8A 2RGMA 2IXUA 2ZOXA 2JF6A 1K9DA 3RM9A 5E0CA 1JXJA 2FH8A 1J11A 3M07A 3ZQ9A 1DWGM 4R27A 2WSPA 5A8MA 4DWSB 1ZB5A 1H3GA 1JFXA 4QLLA 1E56A 4E4PA 5CG0A 3G6LA 2YA0A 1QBBA 2DGAA 5A2AA 5HPOA 2V3DA 1MQRA 1K6AA 3QHMA 1TUXA 3O2LA 1FFRA 1TZ7A 3M46A 1TVPA 4XV0A 4DWSA 5BCAA 4JFSA 4Z2GA 3WD4A 4YHEA 3T08A 4BQ2A 5A8OA 2VQUA 3OGSA 3K4DA 1KR1A 4B9YA 3VNYA 1JNEA 2Q8XA 2NSXA 1J10A 3ARVA 4HOXA 4F8XA 3NSXA 2GSJA 4PTVA 4BA0A 1TG7A 1FH7A 5AY7A 3VILA 2QHAA 2E8ZA 3M6DA 1SFSA 3OLEA 4H8HA 1W2PA 2PWFA 1TE1A 3VMOA 2PB1A 1V3IA 3HMCA 4RE4A 4TUFA 3SUTA 3AZSA 5IXEA 3UR8A 1RH9A 5HBFA 1DWHM 4U2ZA 1E1FA 2G3JA 3WH9A 1LG2A 4DWSD 1PX3A 4E8DA 3VIJA 4XX6A 4S3KA 1U2YA 3VIMA 1JYVA 3HN3A 3VM7A 4ATDA 3O6AA 4TX8A 4LX4A 1X6NA 1BGGA 4JFWA 3VIKA 2ZX7A 3MUIA 3L4VA 1E6SM 2WHJA 1V0NA 1BAGA 2OYKA 1CGVA 1OBAA 2E40A 1V3HA 2D22A 1UYQA 3BAWA 1Q6GA 1CDGA 1V3KA 1ZBCA 1TCMA 3G6MA 5KZ6A 3IAQA 1KBKA 1CPUA 2WW5A 4JZ5A 2DH2A 2VURA 2XFYA 3GNRA 3JUGA 4CU6A 1JZ2A 1MYRA 1UKSA 4J3TA 3WFLA 1SMDA 4KRTA 3GNOA 3NSMA 5AC5A 1WZMA 1V6VA 4XZBA 4EAMA 1GZJA 1H5VA 2XVPA 4CN1A 2FHCA 1KGWA 4MNJA 3TTSA 1LF1A 2VI0A 3I3BA 1V3JA 1E4IA 1UWRA 5BRPA 3APGA 3VDCA 3WMCA 1GOKA 2QF8A 3UCQA 7A3HA 2XVGA 3OLIA 1UKOA 4M1RA 1FH9A 3ZSSA 1IZKA 1QOXA 3FAXA 1V02E 2NT0A 1BLIA 1UWIA 1RP8A 3PBGA 1WP6A 4MNKA 5FCZA 5I2UA 2XFRA 3EYPA 1JZ6A 4CU8A 1V08A 2WVVB 2VZOA 3SCRA 2W61A 4XUYA 2OYLA 3PZTA 4ML4A 3I3EA 3TONA 3T2QA 3W4RA 4ACYA 1EQCA 3FN9A 2VCAA 2FHBA 4D6DA 1UD4A 2WC3A 3AZRA 3PZ9A 2CPUA 2O92A 5I5RA 1BF2A 3EDFA 1LWJA 2BY3A 2J7EA 2BV9A 2XHYA 1ITXA 4WK9A 1QNSA 5E9AA 3VUPA 2CETA 4NZCA 4L4OA 3AYSA 1M01A 3K4AA 3AXIA 2W67A 4AEFA 1KXVA 4V27A 4Z2JA 1CENA 2OWCA 2WK2A 4P8UA 2VX5A 1JZ4A 3SIMA 3WN6A 4W84A 1BYAA 1GJWA 1OIFA 1JF5A 1X6LA 1W32A 5A6MA 2HISA 1OINA 3AMLA 3T2PA 1E1EA 1BHGA 4FK9A 3CUFA 3LPOA 1GHSA 1XH1A 3WDJA 5D9PA 3LPPA 2XSBA 4UOZA 1VJZA 4ZENA 3AHYA 4FLRA 1GORA 3L4YA 3II1A 2A3BA 3WL0A 2GK1B 4H04A 1NM9A 3WY1A 2WM0A 3CHFA 2VTFA 3L4XA 2WWDA 1E6PA 1UWSA 3N12A 4UNIA 5BRQA 4MB4A 4PMVA 1ITCA 2XVKA 5GNZA 1ODZA 2VCCA 4JKKA 1HKKA 2YA2A 3BCDA 2C8NA 4W7WA 3W6MA 1OT2A 1HJVA 4JHOA 4W8AA 1NWRA 3AFBA 4NI3A 2Y5EA 3L2MA 4HA4A 1QHZA 4ATWA 2CHNA 4C7DA 2WHMA 3VGGA 3MO4A 2ZUVA 3KL0A 4OIFA 1EDGA 2J79A 3VIOA 4ZE5A 3EBVA 3L4WA 2FHFA 1CXHA 2VR5A 2ZUUA 1H1NA 4AD4A 1CYGA 3KWXA 3DHPA 2EEXA 1J12A 1DWIM 4URIA 4J3UA 1Q6CA 5CXPA 5I78A 1QNRA 1FFQA 4B15A 5A94A 3BSHA 4P8VA 1UD5A 1B1YA 2VRQA 3KEHA 1OSEA 1SYTA 3WDQA 2JEQA 2E4TA 4KMQA 3CMGA 1C8QA 5E09A 1CXEA 5EB8A 2E0PA 4KH2A 4PEEA 3WQ8A 3VGBA 1WNOA 1CGUA 3VDHA 1M53A 3QR3A 3OA5A 1HKIA 1EDQA 3MUY1 3UERA 2WVTA 4PTMA 3ARZA 2YA1A 1GPFA 3BCFA 3AHVA 4IPNB 4EK7A 1Q6EA 1WZAA 1I1XA 1JNDA 7TAAA 4OBSA 3ZSTA 3ALGA 3SUSA 1J18A 1J0JA 2WMKA 2JFEX 3GH5A 3PZGA 2VX4A 4JIEA 2X05A 1H09A 2QMKA 3GXMA 3BLPX 1HKJA 5BXSA 1C3FA 2PBOA 3KL3A 3WEOA 1VFFA 2D3LA 3AS2A 3KL5A 3OGRA 1TR1A 3AQUA 4FLSA 5A1AA 3MMWA 1F4HA 1TA3B 5HNNA 2W63A 3O9NA 4AISA 1BGAA 1QI4A 4GXPA 4BCEA 5JUVA 1S46A 1W91A 3B9DA 5CJ5A 4GKLA 3VOCA 1WB0A 2ZX5A 5ABFB 1JAEA 4GZEA 3WUEA 1CGTA 1EQPA 4FMVA 1CXLA 1TA3A 2A3CA 4CD6A 1KBBA 1UR0A 3WEZA 4GPNA 1QNOA 4PMZA 5FL0A 2VR4A 3UETA 1EOMA 5IFTA 3ARYA 5A6AA 3WMSA 1OGGA 3AHZA 5ABFA 5EMYA 2GDUA 1ECEA 1LL4A 5ECUA 4MB3A 4PTXA 1KXTA 2BVTA 1OM0A 2WMIB 2XG9A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2NT1 A;  1JZ8 A;  3SUW A;  3AIW A;  1LG1 A;  4B3L A;  4AW7 A;  1KWK A;  2ZXQ A;  3W26 A;  1JIB A;  5C8B B;  5IFP A;  3GNP A;  1J0K A;  2V3E A;  4W8L A;  4B9Z A;  1V3M A;  1HP5 A;  3AI0 A;  2WZE A;  4PYS A;  3LMY A;  2IXV A;  3VGF A;  5LA1 A;  3RM4 A;  3VPL A;  5DO8 A;  4D1J A;  2GUY A;  3ARQ A;  2J74 A;  4P7L A;  1FP8 A;  1ISV A;  3SCQ A;  1MFV A;  1KQZ A;  3WIJ A;  1RD6 A;  2DH3 A;  1JYX A;  4U31 A;  4W7U A;  4UZS A;  2DEP A;  3WDH A;  1HF6 A;  1V03 A;  1C92 A;  2E9M A;  1BYD A;  1CEC A;  4X9Y A;  4MJ2 A;  3U7V A;  3UEQ A;  5ABH A;  3ARX A;  3AIB A;  1R85 A;  4H8U A;  3ZJK A;  3GXI A;  4AXN A;  1XC6 A;  3U7B A;  3GXF A;  3SEP A;  3CZJ A;  5KEZ A;  1GNX A;  3J7H A;  4AD2 A;  3SCS A;  3SCN A;  2CNC A;  4U3A A;  3CH9 A;  3F5L A;  5BXP A;  5CLW A;  2CXG A;  2X1I A;  4TTG A;  2WCA A;  1HX0 A;  1G9H A;  1W9B M;  3MSD A;  1D7F A;  4CD8 A;  4UQB A;  2WKG A;  2W4X A;  2EPL X;  1D3C A;  1L0P A;  2J4G A;  3AIS A;  1HXJ A;  4TVU A;  2EJ1 A;  3PTM A;  1PIF A;  3CMJ A;  3K1D A;  4OUE A;  4AIE A;  1ZBV A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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