3MW7A

Crystal structure of human orotidine 5'-monophosphate decarboxylase complexed with 5-fluoro-ump(produced from 5-fluoro-6-amino-ump)
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
APKELSFGARAELPRIHPVASKLLRLMQKKETNLCLSADVSLARELLQLADALGPSICMLKTHVDILNDFTLDVMKELITLAKCHEFLIFEDRKFADIGNTVKKQYEGGIFKIASWADLVNAHVVPGSGVVKGLQEVGLPLHRGCLLIAEMSSTGSLATGDYTRAAVRMAEEHSEFVVGFISGSRVSMKPEFLHLTPGVQLEAGGDNLGQQYNSPQEVIGKRGSDIIIVGRGIISAADRLEAAEMYRKAAWEAYLSRLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Uridine 5'-monophosphate synthase
publication title Crystal structure of human orotidine 5'-monophosphate decarboxylase complexed with 5-fluoro-UMP(produced from 5-fluoro-6-amino-UMP)
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 87
structure length 259
sequence length 259
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.2.10: Orotate phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2010-05-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3mw7A00
1QMLA 3O15A 3NQAA 3S0CA 5MHBA 5E93A 1FBAA 3GDMA 5AHFA 4DPQA 2R91A 4Y90A 5D03A 3E49A 3STEA 3IRDA 1CX9A 5AYZA 4IX2A 2OT1A 1QR7A 3BGGA 2ZRZA 1SW3A 1GG1A 1K7EA 5GVJA 1CI1A 1Q6OA 5AOUA 2PRHA 3EX2A 3PAJA 5I3GA 2E6AA 4JIPA 4G1KA 3KVJA 3L5MA 4XKYA 4AHOA 3LERA 1KTBA 4MLJA 4QITA 1F6PA 2J9YA 2ZA3A 1G67A 4BI6A 5FEWA 2RH9A 4MYAA 4O50A 4I9AA 4YLWA 2VEIA 1ADOA 3DFSA 3E0IA 1TJRA 1ZNNA 1KM1A 4I7UA 4DQWA 4BFAA 1C29A 1OFDA 1I2OA 1IIGA 2B4GA 4FNRA 4MYXA 1KM6A 2DZSA 1EX5A 3LHUA 2Q3RA 3EWBX 3C61A 1Q3NA 3PUOA 2C13A 3NNTA 3TQVA 4DF2A 3DKJA 4MZ8A 3SR7A 1BTMA 3LDVA 1GZGA 1VS1A 2FPTA 4PTNA 4LV4A 2QAFA 3SGUA 4FNUA 4UTJA 1UCWA 2FFCA 4XBKA 1WXJA 2FIQA 4DELA 4ZQNA 3UXDA 4O17A 5K9XA 4LNYA 1W3TA 5DY3A 5KMYA 4A22A 2J6XA 2A0NA 3FYOA 3AJXA 5HWJA 4OWGA 5KITA 1HL2A 4U28A 3EKLA 1MXSA 4WQ6A 3LBCA 3A5VA 4K39A 1KFLA 4GRSA 2Z2UA 1AG1O 3CTLA 3R8RA 1Q6QA 4K7YA 4JDBA 5DY2A 1X1OA 4MFEA 1K7XA 2BWGA 4GXMA 1ALDA 2ZBTA 3W1QA 3STGA 3W7DA 1QPRA 4K8EA 4UTWC 5K4ZA 4O0ZA 2NWRA 1H63A 2W79A 4KWWA 2QCNA 3MMTA 2A5HA 1JRCA 2C18A 2PC4A 1IXQA 2YR1A 5H2ZA 2BX7A 2KZHA 3EX1A 1EEPA 3WFAA 3BPWA 3M44A 3IGUA 5K7JA 2R14A 4AWSA 2V82A 3NQ2A 1NF0A 1V7YA 2H3BA 4DBDA 1ONRA 5DCDA 2GOUA 3TCEA 4WX2A 3LI1A 3W1UA 1W3NA 3IIZA 3GDTA 3GLCA 5C6MA 1XCFA 3MWAA 4RKAA 4JTLA 2EF9A 2ATMA 1C8VA 1OABA 1OK6A 2B7QA 4LVBA 3U2OA 4AVFA 4ZMGA 4XKYB 5FI8A 3UQNA 3YPIA 3CC1A 3HPSA 1VPXA 3HQ1A 2DZVA 1NVMA 5TBOA 3I7RA 4LC8A 5C5YA 4EIVA 3QH2A 2TRSA 1LZOA 3HMJG 2ZA2A 2WSRA 2GVJA 3KAOA 1TJPA 5G1TA 2Y85A 3EWYA 4O10A 3UXAA 1O5XA 1W5OA 1JCJA 2YW3A 1TREA 4RV8A 1OG0A 3S1UA 7TIMA 2V0TA 3NQGA 3L65A 3NDOA 5AYYA 1D3HA 3MI2A 3PUDA 2QKFA 1IXOA 1OFOA 1T8XA 3PBVA 5CPMA 4AHQA 1SQ7A 5AB3A 3PC0A 3KX6A 4R34A 1LOQA 1LBLA 5KZEA 4HIBA 1ME7A 3RMJA 4BI7A 4NQ1A 3W7QA 1Z41A 2DZWA 3E9AA 2EAWA 1N55A 3MHFA 1R2RA 3DFPA 1QPOA 4UNKA 1VHCA 3GNNA 4N9EA 5BOOA 1G69A 1QFEA 1R47A 3O8AA 2VENA 3EWWA 1VYRA 3LBMA 3UPBA 3ELFA 3CT7A 5G2WA 3W7NA 2WPBA 1AMKA 2CFFA 2ZZ3A 3F1QA 4A2SA 2WNZA 4TU1A 2YDAA 1M5WA 2CW6A 1RR2A 1TTQA 1IIHA 4N9CA 4WXZA 3BO9A 4LVDA 3FEMA 4ADTA 2WKJA 3G0SA 3FJ6A 5AHLA 2P0OA 2DJXA 1WX0A 3W73A 2E1DA 3B0PA 3PSVA 4WY0B 3T7VA 5AHEA 3W72A 3QSTA 1W31A 2G96A 3GAYA 4D2JA 2W0UA 3GVGA 4WD0A 4XUGA 3ANYA 4IGHA 1LM1A 2WOQA 1ZY9A 4MLRA 2NLIA 5HR6A 3EX6A 3V75A 3QJAA 3GR8A 1LRNA 3TSBA 5I3FA 2P1FA 3B04A 3TC7A 4QIUA 1RQEA 3L0NA 2I14A 4ZVJA 5HR7A 5AHIA 3W2UA 1LP6A 4UR7A 5HUPA 4FNTA 3W23A 2QCMA 4POCA 4AB4A 4DO4A 4E2BA 3PG8A 3NQVA 1OFQA 2EPHA 1K3UA 3QMRA 5DELA 3TKFA 5FF2A 3O07A 4MJMA 4Y8FA 1VLIA 3SECA 4WOQA 3WK2A 1EP1A 3N9RA 5FESA 2XN0A 5CPNA 3JRKA 3QPZA 4OV4A 1KBJA 4S2CA 3WJZA 2E5CA 3UWWA 3STFA 3FJLA 3MI3A 3W85A 2QCEA 1OX4B 3S8HA 2YXGA 3G1XA 4BF9A 3NO5A 4K7VA 3I7QA 3BG9A 1H51A 3ABQA 1B3OA 2ZZ7A 4JY8A 1ICQA 5CZTA 2CLHA 1LYXA 3ABRA 5G4WA 1UUMA 4S2BA 3W2JA 5F4WA 5EMUA 1RZMA 2GJLA 3H53A 3N2MA 3NQEA 4NVTA 3W7HA 4CCEA 3QMTA 3N34A 3I65A 2ZTJA 3LX9A 4J9JA 2E77A 4UNLA 4K6AA 1ZJIA 1H7NA 3RU6A 4H4IA 4ALDA 3B06A 5BNKA 3MBFA 5FF4A 2YFNA 3M1ZA 4GFSA 2BLEA 2X1UA 1VCGA 1VZWA 1WOBA 4KKXA 3DFNA 4CNPA 1SO3A 1N8FA 3NQ8A 3HG5A 1TTIA 3RNDA 5D09A 4DBEA 2NXHA 2YPIA 3GKFA 3HF3A 2V30A 2Y63A 3P82A 4BI5A 1F74A 4P61A 3UWUA 3C0JA 4M6PA 1GWJA 3NQMA 3MP5A 3KHJA 4EWND 4JD4A 3G0XA 2YYUA 1GVSA 2CLFA 2V5LA 2VFEA 3CEUA 4JTIA 1BEUA 1FWNA 1T99A 1ZFJA 3ATYA 3PUEA 4DXVA 2A4AA 1IXPA 5EA9A 1H1YA 3W1XA 3F4NA 4UMBA 5HMSA 1PHWA 3PVFA 1EP2A 2RDUA 3F4WA 4X9SA 5C2XA 1B4KA 4LU0A 3A23A 3V1PA 4OE7A 1NEYA 4HKPA 3S42A 3NOEA 1W56A 4NNBA 1QO2A 1TRIA 3N2XA 1PV8A 4HNUA 5J5RA 4LWWA 2CU0A 3SZ8A 4JX6A 3DKLA 1ZHAA 1P0KA 1KFCA 4QM1A 2NUYA 1KFEA 3JR2A 4JYEA 3A21A 1MEWA 3W6YA 3MI6A 3TNOA 3C2VA 4ZQRA 4AXKA 5D2YA 2QCDB 1LORA 3L0KA 5SWUA 1OFPA 4WZHA 1LRQA 2PCQA 3I68A 1WAUA 3OVPA 4NJIA 4UIOA 5KTLA 3C2OA 3M0ZA 4O28A 3OVRA 2GQ9A 3W7OA 1QCWA 3NPVA 1FCVA 4E2DA 1YPIA 2PRLA 4JIQA 3ZR4A 2DJLA 1I2PA 3UNDA 4LRSA 3TU9A 4LOCA 5LHEA 2ZTKA 3MHUA 4YMZA 4EF9A 4MPQA 3LCHA 3RLVA 4MZ1A 3SI9A 5G1YA 3Q58A 2JK2A 3AO0A 2ZYFA 1KM2A 3HJZA 3W9ZA 5LZLA 3HGRA 3NL2A 3C52A 1OVDA 4GJ1A 3IIVA 1KBIA 5CPLA 1A5AA 1O60A 4ORIA 1XUUA 3KXQA 4K36A 3DU0A 3W2MA 2J88A 4HSNA 5DN1A 1JUEA 2HS6A 3O6CA 4H6KA 3T78A 3BV4A 4KFNA 2EHHA 1AK5A 3BW2A 4CQAA 4QJ1A 4IJBA 2X1SA 3HG3A 4O14A 3CHVA 4N6FA 3NVTA 4I7WA 1B9BA 4JTJA 1W5MA 3LXCA 4N4QA 3NZRA 1RQHA 2VFIA 1KLYA 4MJZA 1NFBA 1OFEA 2TPSA 3M43A 2DZUA 1UJPA 3L5LA 5AC7A 1H7PA 1I2NA 3GNDA 4IPIA 3LB0A 5DLCA 4O1AA 3PG9A 1K02A 5J5DA 2WJZA 1GTHA 3CLMA 4MOZA 4X22A 1TRDA 3W07A 3NQ6A 4CQ9A 4JTSA 3C2FA 3O6DA 2Y62A 5C54A 3M9YA 5HINA 3HO8A 4ML9A 4LV9A 2XN1A 4LC6A 1MEIA 2O7SA 1H7OA 1KM0A 3DI1A 4R53A 2ZRUA 4DF1A 5F2MA 3QQ1A 3WJWA 1YDNA 3M6YA 1OF6A 4UTTC 3S1VA 2E5BA 1LOLA 3LRKA 1VLWA 4YWIA 2G95A 5D2VA 3SW6A 5AHNA 3DENA 5FF3A 2YW4A 4FB7A 4NJGA 4CCDA 5CKSA 5K4XA 3L9CA 3Q94A 4O1BA 4JN6A 5CGQA 4NXKA 2RDTA 4TMCA 1AW2A 2V81A 5EYWA 1R30A 5CG7A 3EKZA 3LLDA 3W7JA 1L6SA 4QAIA 1YXYA 2Y7DA 1G4PA 2Y89A 4N6EA 4AF0B 4BWLA 4NT0A 1X8FA 2X2GA 1F76A 4ZQCA 3DXIA 1KM5A 1XFBA 1SFJA 3IIXA 4WUIA 3EXSA 4O1CA 2QR6A 3W87A 2DZXA 1W1ZA 3ATZA 1XKYA 4A29A 4JTKA 4UMCA 4LVGA 1QPQA 3LXBA 1OF8A 5K9CA 5IBXA 3W70A 4HT3A 4IMDA 1OX5A 1SU5A 3UWVA 2CLMA 2H8XA 1ZAJA 3P62A 4IMCA 3F03K 1K8YA 4QSHA 3S9YA 1SO4A 1S3HA 1A5CA 4K38A 1TPWA 3OA3A 3PB0A 1K8XA 3G3DA 2A7PA 3RFAA 4OV9A 4IMFA 4RXGA 1GQNA 1YXCA 2JGQA 3P5YA 3CWOX 3CPRA 4FXSA 5LKYA 2IQTA 4M5PA 3NPUA 2BZNA 4YXGA 1LLWA 3BG3A 5L9FA 3MJYA 3TC6A 1H7WA 5LNSA 1DL3A 1ZALA 4JYDA 4UXDA 3G3MA 4W9TA 2CZFA 3QSRA 5HULA 5I3KA 1SZEA 4NX5A 3B03A 1GPWA 4UR8A 3LCIA 3WJSA 2QCCA 1H60A 1OFRA 4EOUA 1H62A 2ZRYA 3NL5A 5F2LA 1P5BA 4QISA 4EVZA 1OYBA 3LCLA 4ADSA 2GVLA 1OK4A 1A53A 1X1ZA 4Y6GA 2JKPA 1JCMP 3G1AA 3TW7A 4N2YA 3TE9A 4FX6M 1DV7A 2HMCA 3LHTA 3W7RA 1JULA 4K37A 1G4SA 4NZJA 1A5SA 5I3JA 4KFPA 2OCZA 4QNEA 2CLOA 3O05A 1FXPA 1QDSA 2WQPA 1W5QA 4NXSA 3QYQA 2R94A 1OHLA 4N9DA 5G4EA 3T40A 2GPTA 1SUXA 4O0KA 3ABSA 3BVJA 4O54A 2W6RA 1V5XA 4Z1CA 2FTPA 2QUUA 1QWGA 2HTMA 3UPWA 2VFGA 1M7OA 3LRLA 3U6WA 3LV6A 5CZJA 1TIMA 2I9EA 3BG5A 4OU1A 3HGSA 3HIJA 2P10A 2UV8G 2JKEA 1GVQA 3DFOA 2J9XA 4UFLA 3D0CA 4CLMA 4MVAA 5KSWA 2V5BA 1TSIA 3EEGA 1X7FA 4TO8A 1BKSA 1XM3A 2E68A 4AAJA 3OBKA 1P0NA 3EX3A 1O5KA 4CNOA 2WNNA 2E6FA 3QC3A 4R7JA 2QJIA 4MY1A 2ALDA 2V2CA 3S5ZA 2FPYA 3N3MA 4MUZA 2ZRXA 3M5YA 3BLIA 4NX0A 3NG3A 2PRMA 1HG3A 5C55A 3NQCA 3TW6A 3FOKA 3USBA 5EPDA 3QFEA 3M5XA 1P4CA 4O19A 3P61A 4UCGA 5FF0A 3W22A 1N7KA 1LDCA 5K3VA 3NL3A 4H3DA 5AHMA 1QOPA 1TYGA 2ZZ4A 1WQ5A 3UWYA 1TB3A 1WBHA 4GUIA 2QJGA 4N4PA 1G4TA 2CZDA 2ISWA 1HO1A 2ABAA 2RHGA 4BK9A 1AW5A 1DQWA 1QAPA 4Q32A 4KWVA 1F2JA 5F1VA 4LUIA 2ZRVA 2C0AA 2R8WA 1HFBA 4Y96A 3JS3A 3L67A 3O6YX 5D05A 4ZQOA 1XDMA 3A24A 2V2HA 3GKAA 3LCXA 3GDKA 4JYFA 2Z6JA 4DF0A 4FX8A 4LS0A 4IMGA 3O16A 2DU2A 2B7NA 3C6CA 2B7OA 4BR1A 1K8ZA 1FY6A 4OGZA 3L66A 3EWXA 1TPVA 2H90A 4NJJA 3UWZA 1VHNA 2WO5A 2ZRWA 1PS9A 3GXTA 2Y6ZA 4PL2A 2A6LA 1Q6RA 3MBDA 1F73A 1KV5A 4RZ6A 5F4XA 4LTSA 5LNVA 1VCVA 3WJXA 1FWRA 5CZSA 1W37A 3W2KA 1JCYA 2A2IA 2ZA1A 1SPQA 3DFQA 3STCA 3W7CA 1VGAA 3U8GA 3M5ZA 3P5ZA 4N9BA 2AAMA 1F05A 1ZAHA 2VKZG 1M7PA 2GQ8A 4UFMA 5AN7A 5LSMA 3GIYA 3NQFA 1OFBA 5HQEA 2WSQA 3HG4A 2QCHA 5U7SA 4O4VA 1TQXA 3B4UA 3BLFA 1SO6A 1MZHA 4GUFA 3NA8A 1B4EA 4IMEA 2BTMA 1RV8A 5CPOA 3HGJA 3C56A 4MY9A 3BK0A 1SW0A 3RK8A 3DHDA 3KVLA 3SY5A 1DJNA 2Y7GA 2X1TA 4UFKA 3G8EA 3INPA 1JUBA 4LS1A 3UWQA 2H8ZA 2YGYA 3TH6A 2B0MA 1XC4A 4R33A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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