3N9S | Genus

Total Genus 115

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	115
sequence length	307
structure length	307
Chain Sequence	MLVKGNEILLKAHKEGYGVGAFNFVNFEMLNAIFEAGNEENSPLFIQASEGAIKYMGIDMAVGMVKIMCERYPHIPVALHLDHGTTFESCEKAVKAGFTSVMIDASHHAFEENLELTSKVVKMAHNAGVSVEAELGRLMGIEDNISVDEKDAVLVNPKEAEQFVKESQVDYLAPAIGTSHGAFKFKGEPKLDFERLQEVKRLTNIPLVLHGASAIPDNVRKSYLDAGGDLKGSKGVPFEFLQESVKGGINKVNTDTDLRIAFIAEVRKVANEDKSQFDLRKFFSPAQLALKNVVKERMKLLGSANKI

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Lyase/lyase inhibitor
molecule keywords	Fructose-bisphosphate aldolase
publication title	Rational Design, Synthesis, and Evaluation of New Selective Inhibitors of Microbial Class II (Zinc Dependent) Fructose Bis-phosphate Aldolases. pubmed doi rcsb
source organism	Helicobacter pylori
total genus	115
structure length	307
sequence length	307
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date	2010-05-31

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01116	F_bP_aldolase	Fructose-bisphosphate aldolase class-II

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3n9sA00

3TCEA 4XUGA 4UTHA 2B4GA 3GIYA 3W7LA 4FXSA 2VFHA 3E12A 3NQ2A 4IXXA 3CWNA 1DORA 5LNWA 3LHTA 2V5BA 2VEMA 3QMSA 4JD4A 4A29A 1Q6QA 2H8XA 3G1FA 1BWLA 1A53A 4JICA 2NX9A 5F1UA 1DQXA 4DO5A 5LNVA 2J24A 3D0CA 1OFRA 5LGZA 4OU1A 2W6RA 2NX3A 3TV8A 2FPYA 2QJHA 1SZGA 4XKYA 4ZQNA 3C2RA 4NU7A 3NQCA 1I2PA 5BNKA 3HG4A 4WUIA 1ZAJA 3KXQA 2LLEA 3QPYA 3RK8A 1XFBA 2GJNA 2FTPA 1YDOA 3C56A 2ZRZA 3C6CA 2RDWA 3GDRA 2NV2A 1EA0A 5HINA 5I3GA 3C2OA 4IMFA 4PC8A 4WZHA 2WJZA 4K8HA 4MY1A 4N4QA 2J27A 3M5YA 5F4SA 2Y6ZA 4ZQOA 3FJLA 2X30A 1VH7A 3NYZA 1YXCA 3KAOA 3W76A 4CCDA 4AEOA 3G22A 4LWWA 3AO0A 3NM1A 3IGSA 2H3BA 1V7YA 5AOUA 5KZEA 2G96A 1GVSA 2CZ5A 3NQMA 3SY5A 2PRHA 3JRKA 3W7KA 4ZMGA 3R89A 3B05A 5FF4A 1LROA 2ZZ2A 1W31A 3FKRA 3EXRA 3MP5A 2WSYA 5BRBA 3NQFA 1SO4A 1ME9A 4NXKA 3RMJA 3P67A 3BLEA 2QAPA 4FNQA 4Z08A 5AHLA 3UXAA 1D3GA 4NQ1A 2YCEA 3NG3A 4JXCA 5EY5A 3NAVA 4JX6A 4C1LA 1XKYA 3HGSA 4HNNA 1EX5A 4N9BA 3PM6A 4S2CA 1P0KA 1OFBA 2HS6A 3I6RA 3W1PA 3P80A 4WY0F 4IMDA 3TNOA 5CG7A 3DH7A 3FJ6A 4R33A 2CW6A 3LV6A 3N73A 3W7HA 4UMCA 2Z6JA 3CEPA 5G2WA 2FJKA 2KZHA 1R2RA 1JCXA 3L67A 4YXGA 4YCPA 2ZCGA 4CCEA 1ADOA 1F76A 4JTUA 2PC4A 4O4VA 2EKCA 4P2VA 3IIOA 3WK3A 1JUEA 1I4NA 3QMRA 5E93A 1HTIA 4LVGA 1OK6A 2Y85A 3UQNA 2C14A 1XDMA 3SW6A 2DZWA 5FEXA 3UPBA 2V2DA 4IUOA 1LBFA 1JVNA 4MLRA 3PVFA 1QOPA 1OF8A 5D33A 2X1UA 5D2VA 5KMYA 3A5FA 3NQEA 2EAWA 3S6DA 3G3DA 2DZXA 4FNTA 5E1QA 3W88A 4FIRA 4XBSA 5KSWA 3LERA 1DBTA 4XTDA 4AB4A 3LCLA 4KFNA 1KLZA 4JX4A 1QPRA 4GRSA 2ZZ1A 2WQPA 4PTNA 3GXTA 1P4CA 2TRSA 1Y0EA 3OIXA 5EPDA 1MEHA 1HG3A 3LHVA 2BTMA 2WSRA 3LRLA 4LU0A 1HO1A 4RCXA 4OBTA 1OABA 2XN0A 4FNSA 4UTTC 4QNWA 5DCBA 3GVGA 2GJLA 3LB0A 3M41A 3TQVA 4RZ5A 4UCGA 1QNVA 4HN4A 2ZTKA 2FQIA 4TMCA 1YTEA 1BKSA 2QCFA 3LCGA 1WA3A 2TMDA 5BMWA 1SSDA 1H7XA 2O7SA 3HBLA 1G6CA 4AWTA 4BF9A 4NNBA 3INPA 1DV7A 3OVQA 1JCMP 3H55A 4N2YA 4M6VA 3SZ8A 3M0ZA 1K03A 4MKNA 1XM3A 3GXNA 3W1TA 1OX4B 3F4WA 1KFJA 3CT7A 3M7WA 3W23A 2EHHA 1AW5A 1O95A 5C5YA 2WNNA 1IXPA 1XL9A 2TPSA 4JTJA 4ZQCA 3BLIA 5LHFA 4L4LA 4JIQA 3W7OA 5D2TA 1EIXA 3C8FA 3C3NA 3R5EA 1KFLA 1SSGA 4OE7A 1LBMA 3KFTA 4JTSA 3OEXA 1WX0A 4ADSA 4TO8A 3MI3A 3W1MA 1GT8A 4DBEA 3GDLA 1WAUA 1GG0A 4DPPA 2QJGA 1FUYA 3PBWA 3S5OA 3N2XA 4G1KA 3QQ1A 5TQLA 6TIMA 1IXQA 2P1FA 1N8FA 4O14A 4POCA 3W7EA 5HR6A 2A7NA 4UMAA 5G4EA 4RXFA 2EGZA 1PS9A 5LSMA 4DEFA 1P0NA 2QCEA 4M7SA 4UFIA 4WY0B 2OX1A 4CNOA 1FXQA 1OFDA 5U7SA 1GVRA 1KFBA 2WPBA 4XWUA 5I3IA 4ZQPA 2PRLA 2C13A 2FDSA 3UWWA 1GG1A 3W86A 3RFAA 3ZWTA 2QUTA 4HKPA 3CIWA 3HMJG 3I65A 3NL3A 3W7QA 2JK2A 1JR1A 2YGYA 1VPXA 1LP6A 1Z48A 4NX0A 4GNJA 2V8ZA 2Y88A 3EKLA 1LOSA 1Z44A 3LLDA 3C4UA 4RJEA 3TKFA 4Y9AA 1IGSA 1LYXA 4JTLA 3W7NA 4HT3A 1GVOA 2Q3RA 3NM3A 1I45A 2W79A 3KVKA 2I14A 4JDBA 3GXPA 4UNLA 5I3KA 1SPQA 1SFJA 1UB3A 3VE7A 4AF0B 4O17A 1P5BA 3PUDA 2Q8ZA 1R30A 5CZ0A 2Y63A 3QQ0A 1F2JA 4FHAA 4A2SA 3UY7A 2BSLA 4UC5A 4KFPA 3K30A 1LTDA 3NPVA 3SECA 5AB3A 4U28A 1VGAA 3N14A 1TQXA 4WX2A 4WXZA 2YR1A 1GTHA 4FF7A 1WDWA 3THQA 2WV8A 3BGJA 1A5SA 4O54A 2AGKA 4B5NA 4ZVJA 3BVJA 5DCDA 2Y62A 3PC0A 3HB9A 3TSBA 4ORMA 3NQ7A 1TTIA 3FA5A 2OCZA 1NAL1 2TYSA 4AWSA 1D9EA 2OZ0A 2YFOA 4JTGA 5D04C 1OFQA 4JDYA 1LRNA 1LM1A 5AHFA 4FX6M 4AHPA 1SO3A 2YW4A 1NFBA 5K3VA 3UZJA 2FPVA 3IIXA 1K3UA 5F2GA 1X1OA 2CLOA 4A2RA 4NNAA 2DP3A 1Q6OA 3KVJA 5ABTA 3CB8A 1TO3A 4R34A 1W8SA 4O57A 5CKSA 3TAOA 1I2QA 3UY8A 3EWBX 5D09A 5HUPA 3TAKA 3NPUA 4O50A 4HSOA 1OK4A 1SR9A 2FLIA 3UZ5A 1KM5A 1XUZA 2QCDB 5G2IA 2A21A 3E9AA 3T7VA 3C0JA 5HUOA 3IIPA 2D73A 1ML1A 3G1VA 1PL9A 2YYUA 3ZFHA 1HO4A 4LS2A 3T4CA 1OF6A 3LCFA 3NPWA 2DZUA 5AC7A 4Y6GA 1W3NA 4K36A 1UJPA 4NJJA 3ZS4A 3MHGA 1FDZA 3S1XA 3LHUA 4ADTA 1VYPX 3R2GA 3W70A 4OV9A 1EPXA 2CLIA 2PE4A 4OQVA 1ZY9A 2V9DA 3LXCA 4HPXA 3GAKA 5AN7A 4ZZ9A 1G4PA 1KTNA 4UTTA 3QZEA 4IPIA 1SZNA 5CZSA 1KM4A 2ZRWA 4MJMA 4LNYA 2GQAA 3MBDA 1A5AA 3P5ZA 1O60A 3NPXA 1I2OA 3TC7A 5AC8A 1V5XA 3SGZA 1YDVA 2BX7A 2O7QA 1FBAA 4K38A 1ZFJA 4AVFA 1JCNA 2ZTJA 1VC4A 2VXNA 1LLZA 3C61A 3P60A 3TUUA 4E0CA 3QF0A 4AAJA 5AYZA 3W2MA 2RDUA 3ATYA 1OX4A 4JTTA 1SZFA 4WXYA 3S5ZA 1TPVA 1L6WA 3M1ZA 3DI0A 4AHQA 3STCA 4DQWA 3HJZA 1F74A 2B0MA 3DFNA 1IIGA 3LX9A 3TXZA 1HFBA 2C0AA 3M9YA 1C29A 1TPH1 2YX0A 3CTLA 2E5DA 4ORIA 4MJZA 3L9CA 5DN1A 3PB0A 5L9FA 3SR7A 1W5PA 4FX8A 5FEPA 3CPRA 3W85A 3Q58A 2TSYA 2DORA 3ZR4A 1FWTA 2G5WA 3O6YX 4UFKA 1B3OA 1QDSA 3MHUA 2PCQA 3HQ1A 1L6SA 1WYIA 1AK5A 1PHWA 3TU9A 5I3HA 3NDOA 1VHNA 3P8JA 3UXDA 3DHDA 1PHQA 1TV5A 4N4PA 3EX4A 3EWXA 4H4IA 4IPJA 3DFPA 3I68A 4BWLC 4RXGA 1RZMA 3TC6A 2DZVA 1PCWA 3TROA 4N9CA 3T44A 1H1YA 1W37A 3EWUA 4IMCA 1CW2A 2W0UA 4H6KA 3BG9A 3NQGA 3P81A 3I7SA 3LTSA 1ICSA 3MBFA 3PF3A 4WY0A 3AJXA 4DPQA 1W5MA 3B06A 5EBUA 1VHCA 4EVZA 2Q8LA 3QFEA 4A22A 1FX6A 1SW7A 4NZJA 1MEWA 1N7KA 2UV8G 4UUIA 1J4EA 3ZWSA 1ZNNA 1S5WA 3TFXA 4K6AA 3GKFA 5KINA 1LOLA 1VCFA 2C15A 1H7OA 1XUUA 3TH6A 2YDAA 1IXOA 3TMQA 4JN6A 4I7WA 2CLLA 4IQLA 3NEVA 3R12A 4OT7A 1KV8A 1OX5A 2C16A 3SIZA 2ZDRA 4EF9A 3NGJA 1L2UA 2ZZ6A 2NV1A 3GX9A 2V30A 4GUJA 4K37A 5MHBA 1NVMA 4DF1A 4QAIA 3S0CA 3DI1A 3W2JA 3THAA 4HSNA 4TMBA 2QCGA 4AF0A 2VOMA 4MVAA 4UXDA 5TIMA 1WBHA 4S1FA 1Z42A 2AQWA 2B7QA 3GYEA 1S5VA 1H7RA 4MUZA 3E96A 5D02A 5DCEA 3VCRA 3STEA 1KTCA 3LHZA 4XTIA 1UBSA 1KV5A 8TIMA 4UTWC 2CWNA 2Z6IA 3IGUA 1XCFA 3M16A 4LT9A 4NJKA 3W3OA 4AWUA 3STGA 4FO4A 2X16A 4MY8A 3N34A 3P5YA 4K8EA 5C55A 1VZWA 4E2DA 1DVJA 2ZZ5A 2IQTA 1GZGA 5D03A 1UUMA 1OFOA 4N9DA 1CI1A 3G1HA 4LUJA 4Z1DA 1WV2A 4E38A 2GOUA 3O07A 3WJXA 3W1RA 1E51A 3UD6A 1EWDA 3QC3A 3KRZA 1U5JA 3FYOA 4IWWA 1MXSA 2Z2UA 3NQAA 1JCYA 3PR2A 4O1AA 1KW1A 3GR8A 1WQ5A 2NXHA 1JUBA 5HNRA 3KVMA 3CU2A 3ATZA 5CPMA 1W3IA 1GOXA 4EOUA 2ALDA 3HG3A 1OHLA 2ISSA 1HL2A 3GDKA 3GDMA 2R8WA 1R2SA 3PBVA 4ZQMA 1B9BA 4WOQA 3TJXA 1S3HA 3GZ3A 4QNEA 1A5CA 3W72A 4LS0A 2VC6A 4ZQRA 1GJPA 4GUIA 3HOJA 1T0OA 2QCDA 1LOQA 1VCGA 4BI6A 1M7PA 3S1WA 3YPIA 2VFEA 5DY2A 3QW3A 4S2BA 2QCMA 2CU0A 1ZAHA 3Q94A 4OHQA 4QSHA 5CSRA 4CCCA 3HPZA 1DJNA 4DO6A 3V1PA 5DBUA 3RNDA 4O12A 1TJPA 5CZJA 4RZ6A 1YTDA 1AG1O 3W1LA 1H63A 5A8GA 5DLCA 3MYPA 1CX9A 1OFEA 3VE9A 1K8XA 3MMTA 3BARA 3PULA 3S8HA 2B7NA 1YYAA 1QFEA 2WNQA 2ZYFA 3OBKA 3CC1A 3UWUA 1OFAA 3KHJA 3UPWA 1RV8A 1PVNA 1EWEA 4W9TA 2JBMA 2E6FA 3L0GA 3O15A 1LDCA 3GNNA 1WBJA 4N9EA 4PA8A 2GPTA 3TFCA 1WOAA 3P84A 4Y96A 3QW4B 4MZ1A 5G1TA 2DZPA 3LCXA 5LHEA 1L9WA 3B4UA 3USBA 1J5TA 2A7RA 2E68A 1FQ0A 4ONVA 2JKAA 1JRCA 3BK0A 5C54A 2VKZG 4FIQA 2Z1BA 3I7QA 4GE8A 2ZA2A 4X2RA 4DF0A 2A0NA 3VI2A 3TDFA 3DKJA 3T55A 2Z0IA 4O16A 2QAFA 3WJSA 3QSRA 2EPHA 5G1YA 3CEUA 4YWIA 4CQAA 5EYWA 2VELA 4AH7A 2C3ZA 3DZ1A 3GDTA 1KA9F 4H3DA 1F6KA 1H60A 5G2HA 4OWGA 2R91A 1GVFA 4GFSA 4BK9A 5D38A 3R8RA 3TW6A 1X8FA 2DZSA 2X1TA 1P1XA 3M43A 2QDGA 3DFQA 5D32A 1W54A 3M47A 5D37A 5IM51 1F73A 2NX1A 1ALDA 2YZRA 4M5PA 2V0TA 1OYAA 1FCBA 1T99A 4ICNA 3HGOA 1OG0A 4TR9A 3WFAA 3G0XA 1GTEA 1KM6A 1XBXA 1UCWA 4R7JA 1FXPA 4GC4A 1W56A 1Q3NA 1H51A 4I9AA 4QIUA 4PODA 3C2EA 3HO8A 3W87A 5D2YA 4PL2A 1AMKA 3W7GA 4O10A 2NUYA 4DELA 4NJIA 3GLCA 5AYXA 4EF8A 1NEYA 5C2XA 2RFGA 5DY3A 3EEGA 3UNDA 2V5LA 1MEIA 1B4KA 4P61A 5D05A 3UWVA 1FWNA 4M6PA 3TQKA 4GUGA 3G1SA 2VENA 4DXVA 1EEPA 4UFHA 1O5KA 1VLWA 4L4MA 4CQ9A 3EWZA 3KVLA 4RKAA 4UTIA 2GQ8A 2R94A 3MJYA 4JY9A 3M5XA 3O1NA 2H6RA 3S1VA 3W1XA 3PBUA 3L5LA 3N9SA 3W2LA 3UWQA 1DOSA 2QEZA 1L6YA 3LBMA 2B7OA 4TX9A 2DJXA 4A3UA 1S5TA 1KBJA 1ZENA 3GKAA 3M5ZA 5TBOA 3LOTA 1ONRA 1F05A 4GJ1A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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3N9SA

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