3NQ7A

Crystal structure of the mutant f71a of orotidine 5'-monophosphate decarboxylase from methanobacterium thermoautotrophicum complexed with inhibitor bmp
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
219
structure length
219
Chain Sequence
VMDVMNRLILAMDLMNRDDALRVTGEVREYIDTVKIGYPLVLSEGMDIIAEFRKRFGCRIIADAKVADIPETNEKICRATFKAGADAIIVHGFPGADSVRACLNVAEEMGREVFLLTEMSHPGAEMFIQGAADEIARMGVDLGVKNYVGPSTRPERLSRLREIIGQDSFLISPGVGAQGGDPGETLRFADAIIVGRSIYLADNPAAAAAGIIESIKDLL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of the mutant F71A of orotidine 5'-monophosphate decarboxylase from Methanobacterium thermoautotrophicum complexed with inhibitor BMP
rcsb
molecule tags Lyase/lyase inhibitor
source organism Methanothermobacter thermautotrophicus
molecule keywords Orotidine 5'-phosphate decarboxylase
total genus 87
structure length 219
sequence length 219
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.1.23: Orotidine-5'-phosphate decarboxylase.
pdb deposition date 2010-06-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3nq7A00
3E02A 1KW1A 1QPRA 3QW3A 5SWUA 5H2ZA 2PURA 3MWAA 1KFEA 3FKRA 3VE9A 3OHIA 2HS6A 3DXIA 1M5WA 4JGDA 3MHUA 3EXTA 3M5XA 3L2IA 1FBAA 3GR7A 3W7IA 3C0JA 1N8FA 4FXRA 1I45A 3WJZA 4JTFA 5DY2A 1TSIA 4JD4A 3CTLA 3W1NA 3KVMA 4MIMA 5FEXA 2V0TA 2QCMA 3QYQA 2AGKA 4HHPA 1ICSA 4AXKA 4YXGA 2QCEA 1DJNA 2VEIA 1SSDA 5CGQA 1MEHA 3LTPA 4MY1A 1EWEA 1TPWA 3SGZA 2WO5A 2Q8ZA 4TMBA 4M6QA 4FNRA 2E5CA 4A29A 5D09A 1ZJIA 3B06A 3UWWA 6TIMA 2A85A 3RMJA 3STGA 4JTLA 3N19B 1LORA 4D2JA 4N9EA 3GDKA 3UWQA 3DFTA 1Z48A 3TJLA 3PWAA 3DHDA 1LZOA 1LCOA 3N2MA 4JTTA 4Z1BA 3DGRA 1KFBA 4K7VA 1FWNA 3GYEA 3STCA 7TIMA 2A5HA 1GVSA 3M16A 1W8SA 3W7RA 3W2KA 4RR4A 3G1HA 2VFEA 2YSWA 2C3ZA 2ZRYA 4HNUA 4GNJA 1MO0A 3P5ZA 4WXZA 4OHQA 5LNSA 1G4TA 3IIOA 3NQMA 2HSAA 1K8XA 1O94A 4NNBA 5HUOA 1H7XA 4JX5A 3V75A 3NGJA 3DBPA 3EKZA 1GPWA 1UUOA 5EYWA 4IPJA 1OK4A 5CPOA 3UXAA 2D73A 5EBUA 3Q94A 4A22A 4MPQA 1E51A 2OX1A 4IOTA 5F4WA 3BG9A 1L6YA 3M6YA 2CW6A 3IRDA 4LY8A 5C5YA 4Z1AA 3LHWA 1AW2A 2PRHA 4MJZA 2PC4A 4WOQA 1Q6QA 3QH2A 3W1LA 2BLEA 2B7OA 3BGGA 4BFAA 4LRTA 2RDWA 5IBXC 1AW5A 2W79A 3PBYA 1TPH1 5FI8A 4BWLA 2WJZA 4A21A 4BF9A 4BR1A 5AHLA 1RPXA 1KFKA 4UFIA 4MOZA 2HS8A 2Z0IA 3DKJA 3KXQA 3L5AA 4N9DA 3N14A 4WY0A 1GEQA 4RX0A 1BEUA 1G4SA 1H63A 1W3TA 5G2HA 3MI3A 4IXHA 4K8HA 2WNNA 2ZA3A 1LRTA 3UWVA 1W5QA 4O19A 1ZNNA 4M6VA 2JGYA 1GVQA 3AJXA 4UIOA 3TUUA 3CEPA 2X16A 3IIPA 3BK0A 3MBDA 2FFCA 3P80A 5K4XA 2BXVA 2RKXA 2VFFA 3L5LA 3I68A 4O17A 2Y61A 1JJKA 1JVNA 1L6WA 4MZ8A 1HO4A 2NX3A 3FS2A 3FKKA 3W7CA 3QMRA 3EXSA 1SZFA 5LNUA 3YPIA 2F7FA 2CLOA 3P82A 3F03K 3VKJA 5FF4A 2VOMA 4NJKA 4GUFA 2UV8G 4DF1A 3EB2A 3L66A 4DXVA 2EAWA 1YXCA 1EP2A 3IVSA 5A8GA 3MYOA 2Y7DA 1W3NA 4Y9AA 2FQIA 3P8IA 1QPNA 1QCWA 3PBWA 3CWNA 4UTHA 1VC4A 1ME9A 3W7LA 3KX6A 3O63A 2YZRA 2P0OA 4XKYB 2E6YA 3A9IA 5K9XA 3TXVA 2WSYA 3LHUA 2YDAA 2O7SA 4E38A 3O07A 2X30A 3P67A 4I9AA 1ZFJA 4KWVA 4LUJA 4MY8A 4RXGA 1YDVA 1AMKA 1TJPA 3TC7A 1TV7A 4O0KA 1KFLA 4MYAA 4N6EA 4S2CA 3CLMA 3IIVA 4O52A 1S5WA 1JQXA 1N55A 4BK9A 1H61A 5F2MA 1GG1A 3DU0A 4LS0A 3BW3A 3GR8A 1F6KA 4S2BA 3W85A 1LOQA 3N3MA 5KSWA 3W71A 1VS1A 1QPQA 2Y62A 5DBUA 1GTHA 1ZAJA 3LERA 4O54A 3A21A 3LCWA 1BWKA 4FHAA 4IMGA 3USBA 1G67A 3PVFA 2QJHA 1SO5A 3K30A 1OHLA 3HG2A 4O1AA 4N6FA 1HTIA 2F84A 3S9YA 4G1KA 1W1ZA 1PHQA 1JCXA 4QAIA 3L0NA 4UC5A 5KZDA 3S8HA 2H8XA 4K7YA 1AK5A 4JTSA 4UUIA 2DZPA 2ZBTA 3LLFA 4I7WA 3SZ8A 1OYBA 4DELA 3TW6A 5K9CA 3QEZA 5KZMA 3CIXA 1XL9A 2Y88A 1NF7A 3V1PA 3WJSA 3G18A 8TIMA 5LHEA 4ZQOA 2QCDB 3NQ7A 1LROA 4Z1CA 3W2LA 2QDGA 4AF0A 1BTMA 2NXHA 2X1RA 3NEVA 1KLZA 2TMDA 3B8DA 1OX5A 4NT0A 4AVFA 1W56A 4K37A 4ZQPA 5CKSA 2DJLA 3W87A 1QNVA 2ZZ7A 4XQ6A 5AC6A 2QCLA 4JTKA 3C6CA 2GVJA 4O1BA 2Q3OA 3I6RA 4Q4KA 1OFQA 4TU1A 1DL3A 1JQVA 3L68A 1ALDA 1ZAHA 3THAA 4MLJA 3RLVA 4EF9A 3MI6A 3QPYA 1GVFA 3CM4A 3G8EA 2C18A 1DKWA 1XM3A 2ATMA 1OABA 2EHHA 4JTUA 1H7OA 1M7OA 1THFD 3FIGA 4FX8A 4HN4A 1XBYA 1JULA 1YDNA 4IMCA 4E0CA 3R5EA 3UZJA 5LGXA 1PS9A 3VFLA 3VNDA 4K39A 4GBUA 3HJZA 3QJAA 3P60A 4A2SA 1W31A 3OIXA 3RFAA 5HULA 3DI1A 4OE7A 4DO6A 4EWND 5BOOA 4XUGA 3Q58A 2VC6A 4JNMA 5F1VA 4UFHA 1I2NA 5FF0A 4LU0A 1G7UA 2A2IA 2Y85A 3GDMA 3G1XA 1TYGA 3M5VA 3M5ZA 4CQ9A 1TCDA 3M0ZA 3FYPA 1W54A 3C61A 1OF8A 3PF3A 1LM1A 1P5BA 1ZHAA 5FEZA 4RCXA 1F6PA 2ZFAA 4IMFA 1H7NA 1G7VA 4JTHA 3NXFA 1DORA 5C2XA 3PB2A 2C14A 3OEXA 4JTJA 2H90A 3NM1A 1EP1A 1SU5A 2FPYA 3FYOA 1XBXA 3KHJA 5AHFA 3THQA 3UQNA 4WUIA 1PV8A 3IV3A 3IVTA 5DCEA 3MP4A 4JIPA 3IGSA 1X7FA 3BO9A 3KVLA 1EUNA 3HPSA 2VFHA 1TV5A 2QJIA 3HGJA 2V2CA 3TK7A 4LS1A 1YTEA 2WNZA 1XC4A 4UFJA 3M41A 4X2RA 3HG4A 4AB4A 2R91A 4OT7A 2X2GA 4QQ3A 1RQBA 3Q37A 2QUVA 1J2WA 4LC6A 3O16A 2ZRVA 2TSYA 4WXYA 5CG7A 1XDMA 3BV4A 5G5IA 5L9FA 1KTCA 4O1CA 1FXQA 4R34A 4LOCA 3OG3A 4YL2A 1XUUA 1GTEA 1LLWA 1JUKA 1O60A 4LVBA 3NG3A 4BI6A 1FX6A 4CLMA 1KTBA 1TPUA 4WQ6A 3P74A 1NSJA 2O7QA 3L21A 1TRIA 2XFWA 2PRMA 2ZRUA 1H51A 3R89A 1YYAA 4IXXA 2VXNA 3NZRA 1VZWA 2GUUA 3LV5A 1F73A 1JCYA 1G69A 3M5YA 1P0NA 1F7BA 4JEQA 2C1HA 3H54A 2DZVA 1SSGA 2CZ5A 4CNPA 2C16A 4N4PA 4FNSA 5LHFA 5C55A 2VEPA 3LCLA 4UR7A 3GXTA 4U4MA 5LNRA 1JRBA 3TX9A 4QNEA 3NOEA 3W1RA 1RV8A 5CPMA 1YTKA 1T99A 3WK0A 4FNPA 4O0ZA 2A1YA 4YMZA 3E9AA 4PFMA 3QRHA 4JYEA 2J27A 4WOZA 3NR0A 3MHGA 3C2FA 3CQ0A 1N7KA 2QCNA 1SZNA 3KRSA 2FTPA 3ANYA 4RV8A 3ZFHA 1R2TA 3ATZA 2FDSA 3TMQA 2YGYA 4PEKA 2OT0A 1QOQA 1YPFA 2YFNA 3OA3A 4LVAA 5LKYA 4CCCA 5HWJA 2KZHA 1OX6A 4IMEA 1XDLA 1O5XA 1QDSA 3A22A 1K7FA 4UTWA 2YX0A 2Z6IA 3LI1A 4JDYA 2Y89A 2ZRXA 1J4EA 1DBTA 4GXMA 4JTIA 1NEYA 2GQAA 1XBZA 2V30A 4P2VA 5BW6A 4DBDA 5HR6A 4XBSA 2CLLA 3HOJA 2WNQA 1O5KA 5U4NA 5CPNA 3FEMA 4W9TA 4UXDA 2GVGA 1VPXA 3PUDA 5E0KA 3SFKA 3GXNA 1TPVA 2X1UA 2ZDRA 5AFDA 2QCGA 2ZYFA 4HKPA 4Y8FA 4UTKA 1F76A 3R13A 3EWYA 2ZTJA 4Y6GA 1QO2A 3NQDA 5K3VA 1MEIA 1PHWA 1WX0A 3EX2A 1F74A 5J5RA 3PM6A 1Z42A 1TTPA 1TPDA 3HG5A 4FO4A 3G3MA 3LX9A 2G97A 4ZQRA 2H3BA 3CB8A 1EEPA 3NDOA 3NQFA 4CNNA 3TSDA 3HGRA 3F4NA 1YPIA 2DZTA 2EF9A 4LUIA 1WAUA 3LHZA 3CPRA 5FF7A 4JYFA 5HJLA 4IUOA 3L65A 1ZENA 1LRQA 3QQ0A 3W7MA 4JIQA 3DKLA 2FB3A 1QMLA 1LP6A 1OVDA 2ISWA 3B0UX 1FXPA 4HPJA 4ADTA 2WSQA 1TPFA 2A21A 3M44A 1VH7A 3ABSA 3GKFA 1ML1A 5TIMA 2NV2A 1ONRA 3G0SA 3SR7A 3M43A 2W0UA 1IIGA 5AYXA 2E5DA 4PC8A 1DJQA 3O6CA 2E6AA 2QR6A 1S5VA 1B4EA 3IGXA 4B5NA 2CZFA 3NPUA 4NXKA 2C0AA 3LCIA 5D2XA 3CU2A 3MUXA 5EPDA 3S6DA 4NXSA 1LOLA 1VHNA 3S42A 4UR8A 1WV2A 4IJBA 2E09A 3BPWA 3LDVA 1OG0A 3FLUA 5G2IA 1FUYA 2QDHA 4ZL1A 5HWMA 5I3FA 2H6RA 1W5OA 1A5BA 1EA0A 3W73A 3EEGA 3PBUA 5I3HA 2E1DA 5ABTA 5CZSA 1K8ZA 3QMTA 1XCFA 3O15A 2CLEA 3WJYA 4IX2A 5AYYA 3W7PA 3LXBA 2ISSA 3ELFA 3TIMA 5AC7A 5IM51 4HNVA 2TRSA 1VQTA 2OT1A 1XKYA 1DQWA 3WK1A 1RQEA 5AC8A 4DO5A 1JCMP 1PVNA 4FEZA 2NUYA 1FWSA 2J9XA 3G1YA 3KVJA 2YYUA 5C54A 3LBCA 3TCEA 2DU2A 4AMAA 4UTUA 3NZ1A 1SZEA 3E96A 3NPWA 1A5CA 1YXYA 3U8GA 4IPIA 2J6XA 4UTIA 1C9DA 2Q3RA 4AEOA 4TIMA 5D05A 3TAKA 4X22A 1NF0A 1SR9A 3ZWTA 1FDJA 1QFEA 3L67A 4XZ9A 1DOSA 3W1TA 2A6LA 3VE7A 4RZ6A 4DPPA 3TSMA 5FF2A 4NVTA 1TPC1 1F05A 2E77A 3BW4A 3P7YA 3C52A 3HPXA 3HO8A 1K03A 5CZJA 3B03A 3W7HA 4LC8A 2OJPA 3KVKA 2CZDA 2BTMA 4MJMA 2TPSA 4K36A 4O12A 3O8AA 3O06A 3E0IA 3C2OA 4ZQMA 2DZSA 5MHBA 3P8JA 3ABQA 3LXCA 4ZQCA 3OVPA 3I7QA 5KZEA 4JX4A 1KM5A 4PODA 4NX0A 3CWOX 3WJWA 5IBXA 2J88A 4FF7A 3PUOA 3B4UA 1AG1O 4PCFA 1H7PA 4M6PA 3NL5A 4AHQA 3SJ3A 1ADOA 3W1UA 2RDUA 4AWUA 5F1UA 1R47A 3UXDA 4TR9A 4NZJA 3N73A 4UTTC 4QITA 1O95A 1OFAA 1YXDA 3FFSA 3QPZA 4E2BA 3T40A 3TMLA 3JS3A 4FX7A 5D33A 2A4AA 4AAJA 3Q2DA 3O05A 3PG8A 3FOKA 1OFPA 1LBMA 1AW1A 4KKXA 1I8JA 1C29A 3NQ2A 4O1DA 4UMAA 2Z1BA 3MP5A 4RK8A 3UY7A 1W5PA 1TQXA 3IVUA 3LCFA 1S3HA 2QEZA 2RFGA 2CLHA 3MHFA 5EY5A 4GUGA 3UWUA 1KLYA 4LVDA 1OF6A 3CEUA 4EOUA 1JR1A 5DN1A 3H53A 2V82A 4R7JA 2V2HA 4Y96A 4QIUA 4AHOA 2ISVA 5F4XA 2GJNA 3EX4A 1OX4A 4FNTA 3I7RA 1GG0A 1OYAA 5EMUA 5EA9A 2WSRA 1ZALA 2A0NA 2I1OA 3ABOA 4CCEA 1ZCOA 3LB0A 5F4SA 4NJHA 1J5TA 2ZRWA 2CFFA 2X1SA 5D2WA 5TQLA 1SQ7A 1LTDA 4CQAA 1QR7A 2G95A 4NU7A 3T4CA 4WY0B 3CC1A 1FWTA 2HTMA 2NX1A 5KTLA 4MFEA 1KV5A 4HSOA 1WQ5A 4FX6M 1FDZA 5E93A 3SIZA 3BGJA 3ZWSA 1L6SA 1QAPA 4AWTA 2QAPA 1GWJA 1JUEA 4O8RA 4HNTA 3S5YA 1KA9F 4OU1A 1I2PA 3W9ZA 1XBVA 4R53A 3TE9A 1HFBA 4IMDA 4TMCA 3BG5A 1JCNA 1OJXA 1V5XA 3S5ZA 3W7QA 1I2OA 3IEBA 3NAVA 4UNLA 3A5FA 1GQNA 3W7GA 4TO8A 3SW6A 3HGOA 3TA6A 5K7JA 3M47A 3W72A 1A50A 1KM0A 1VYPX 4A3UA 2CLIA 3LCHA 4DO4A 3QQ1A 4WX2A 4DBEA 2QCHA 3F4WA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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