3NQ7A

Crystal structure of the mutant f71a of orotidine 5'-monophosphate decarboxylase from methanobacterium thermoautotrophicum complexed with inhibitor bmp
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
219
structure length
219
Chain Sequence
VMDVMNRLILAMDLMNRDDALRVTGEVREYIDTVKIGYPLVLSEGMDIIAEFRKRFGCRIIADAKVADIPETNEKICRATFKAGADAIIVHGFPGADSVRACLNVAEEMGREVFLLTEMSHPGAEMFIQGAADEIARMGVDLGVKNYVGPSTRPERLSRLREIIGQDSFLISPGVGAQGGDPGETLRFADAIIVGRSIYLADNPAAAAAGIIESIKDLL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of the mutant F71A of orotidine 5'-monophosphate decarboxylase from Methanobacterium thermoautotrophicum complexed with inhibitor BMP
rcsb
molecule keywords Orotidine 5'-phosphate decarboxylase
molecule tags Lyase/lyase inhibitor
source organism Methanothermobacter thermautotrophicus
total genus 87
structure length 219
sequence length 219
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.1.23: Orotidine-5'-phosphate decarboxylase.
pdb deposition date 2010-06-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3nq7A00
1TIMA 4UNLA 3P62A 3W7LA 1QPOA 3LCHA 2V2DA 3K30A 4WD0A 2A6LA 5DLCA 4PEKA 2UV8G 1TPFA 3DZ1A 1KFCA 1GG1A 3HGOA 1TV5A 5K3VA 1UBSA 4RZ6A 3PC0A 1B57A 3F4NA 1W3NA 3W73A 1RZMA 3HOJA 3CWNA 5F4WA 5HJLA 1EIXA 3VE9A 3THAA 3GDKA 3MHGA 1M7OA 1QO2A 3PR2A 3PBVA 3ABSA 5G1TA 4MZ1A 4NJIA 3NZRA 2GVGA 1S3HA 2NX9A 1H7XA 1JULA 4GJ1A 2R91A 1CI1A 3NQFA 1W56A 5LNWA 3WK1A 3GZ3A 4GWEA 3TX9A 2ZZ3A 1B3OA 4DO4A 1JQVA 1EUNA 3GLCA 5DELA 4LWWA 3G1DA 1RR2A 3M47A 3GVGA 4Q33A 4LS2A 2RFGA 1TV7A 1LM1A 3NXFA 4POCA 1A5CA 1YDNA 1OF8A 1VHNA 1O95A 1MSSA 3GDRA 1JRCA 1NVMA 1Z41A 4AVFA 3KHJA 3STGA 3PUEA 2KZHA 3L0KA 3W07A 3BARA 4DF0A 4Z1DA 2W6RA 4BFAA 1MXSA 1QNVA 5LSMA 1LORA 3LXBA 1DL3A 3M16A 1VCFA 3IGXA 1SW3A 1KA9F 3T4CA 4LV4A 4UMBA 1JUBA 1KM1A 1EPXA 3D0CA 2DP3A 1ML1A 2QAFA 3WK0A 3L5MA 3W1AA 1QR7A 2NV2A 2J9XA 3T44A 3FEMA 3UWQA 4CNNA 3S5OA 3W1NA 1EWDA 5EY5A 5HUPA 3WJSA 3PBYA 1SU5A 4CNOA 1A5BA 1XBZA 1KBJA 2ALDA 4RR4A 2Y62A 3WJZA 5ABTA 1YTEA 4RXFA 4O13A 5FEWA 3PSWA 4N6FA 3UXDA 4NQ1A 1X7FA 3W1MA 4L4MA 4ZQPA 1KM4A 5K2ZA 3Q2DA 3OG3A 3LRKA 1QOPA 5DN1A 5BOOA 4ZMGA 3NNTA 4KFOA 4I7UA 5LNUA 3CTLA 4JS3A 4WY0A 4TIMA 3CQ0A 2YFNA 2ZZ5A 2R14A 3DFPA 1XBXA 3DU0A 2C18A 4FNPA 1TCDA 2Y61A 4AWTA 3MHUA 4LUIA 1RQBA 1TTPA 2FPYA 4HHPA 3MYPA 3GKAA 2XN1A 5TBOA 1FX6A 1GTEA 3FFSA 5CZJA 3PSVA 2QCFA 2JKAA 4HNTA 2C14A 2V2CA 4NNBA 4JGDA 3O63A 1WOAA 2VELA 3N14A 5D32A 3A24A 2B7OA 1Z48A 1TB3A 3GK0A 4LV9A 4UIOA 3M6YA 2VFHA 3TSMA 2JGQA 3FOKA 2QUVA 1F6KA 3W23A 1K8ZA 4FNRA 1GVSA 1TPUA 3RU6A 3GXPA 3LI1A 2ZRZA 4O4WA 1H5YA 3W7QA 3ZWSA 1X1ZA 4UNKA 1TO3A 2A6NA 5CPOA 3LHVA 2GQAA 4HT3A 3QPZA 4XTIA 1O5XA 5DBTA 5BRBA 2EAWA 5C54A 1TTIA 3SR7A 3F03K 2YW4A 3LTSA 4ADTA 2CLOA 3FS2A 4K7YA 4NZJA 2PURA 2FFCA 4NJGA 3W83A 1SQ7A 4QISA 2CLLA 5CZSA 2CLFA 1WYIA 4LUJA 4RZ5A 4OE7A 5D02A 5FF3A 3FA5A 5H91A 2DJXA 3LXCA 4LS0A 4DXVA 2CZFA 3B03A 3EWZA 4LVFA 5HUOA 2AQWA 5F2IA 4CQ8A 1F6PA 1LRTA 4NX0A 4AMAA 4QJ1A 3QMTA 2TRSA 1VLWA 4J9JA 5DCBA 3T55A 1AW1A 5D37A 4Z0JA 5J5RA 5K4XA 1FDJA 3OHIA 4FNUA 1TTQA 2C0AA 4MFDA 5DXXA 2RH9A 1ZCOA 7TIMA 4KFNA 4MPQA 1MEWA 3M5XA 3TV8A 2WKJA 3O06A 4BI7A 1ZAIA 1JCMP 3PM6A 4AWUA 1B4KA 4IMCA 3W85A 2E5BA 1A53A 4AWSA 1ZAHA 3LERA 1EEPA 4PCFA 1XDLA 2F7FA 2QCEA 3CT7A 4M5PA 2GQ9A 1ZAJA 5DY2A 5E0KA 1YDVA 3TA6A 4CNPA 4O17A 3Q58A 5LGXA 4S1FA 1C29A 2CW6A 3G0SA 1KM3A 4ADSA 4BF9A 5AC8A 3W1PA 4G1KA 1FDZA 5CSSA 5LGZA 3H54A 2TYSA 2VEKA 1QWGA 3RMJA 2H8XA 3PVFA 4JN6A 3EX6A 1TPH1 4R53A 3S8HA 3CC1A 1X6UA 2EHHA 4IPIA 3CEUA 5G1YA 2V81A 4MY9A 2A7NA 1SFJA 4GFSA 2YX0A 5FI8A 2J24A 4E38A 1QCWA 1YXCA 2HSAA 3M44A 3SIZA 1M6JA 5HNRA 1OABA 5BW6A 2J6XA 3MP3A 4TR9A 4UTLA 4O12A 3NPUA 3PBWA 3TCEA 3EWYA 1M5WA 1VZWA 1OFDA 4O15A 1DQWA 3GDLA 3NAVA 3RNDA 4JTFA 4IXHA 1A5SA 2AGKA 1OFPA 1SZNA 4AEOA 1H1ZA 1YPIA 4B5NA 4GXMA 2Q8ZA 2E1DA 3OVRA 3HG4A 2P1FA 4DQWA 3S42A 1XC4A 3O8AA 6ALDA 3NPVA 4JY8A 3W1QA 3KRSA 3NOEA 1FQ0A 4NVTA 4U4MA 4AHQA 4CCDA 1UUMA 5FESA 2V8ZA 3LV6A 3U8GA 3EEGA 4OU1A 3WFAA 2E5DA 1RVGA 5F1UA 2Z0IA 4WQ6A 2QCLA 3TAKA 2P0OA 1RQEA 3CIWA 3A23A 3BW3A 2YCEA 5AOUA 1F73A 4UXDA 1GT8A 3KAOA 2ZA3A 5D33A 3W7JA 1K03A 4L4LA 3LM7A 3FJLA 1OYCA 3G0UA 3DI0A 3UWVA 3RK8A 4PC8A 3QSRA 2VEIA 1W5MA 3OEXA 4K6AA 5TIMA 3NQ6A 1H7RA 2C13A 2V5LA 2ZRYA 3TKFA 2BLEA 3W6YA 3M5YA 3VKJA 3MMTA 3TFCA 1F74A 3S1XA 2PRHA 5AC6A 2E68A 3CEPA 3VI2A 3A9IA 3EX2A 1ME8A 3TXVA 1SSGA 3TJXA 4M6QA 5FF7A 4MYXA 3W2UA 4UTTC 3W1RA 1W54A 3HBLA 3C52A 4UTIA 2CWNA 2DZSA 3IIVA 4JXCA 3G1YA 3IIZA 2YSWA 1W5NA 3L21A 4UR7A 3MI3A 1S5WA 1VGAA 1VCVA 3I7RA 3N34A 3KVJA 2WO5A 3HIJA 3C0JA 3UY8A 1BWLA 1P0NA 3USBA 1KM2A 2QCHA 4IUOA 2ZFAA 4ORIA 4JTHA 2RHGA 5C6MA 4JYFA 4W9TA 3Q94A 3O15A 1W1ZA 1OF6A 2ISVA 1JUKA 3DHDA 3GYEA 3S5NA 1GYLA 4R34A 3BGGA 4EVZA 1VYRA 1NF7A 4O54A 3W1XA 2QCGA 5I3KA 1K7FA 3VNDA 3W2NA 1F7BA 3A5FA 3EB2A 4N2YA 3LHUA 5F4XA 1KFJA 4R33A 3CWOX 2XFWA 5C2XA 2R94A 1TPEA 4WUIA 4NJKA 4XBKA 1XCFA 1J4EA 1XM3A 2CZ5A 4Z1AA 3LCFA 4FNTA 1GTHA 5LNRA 2WV8A 1QMLA 1VJIA 2RDUA 2YDAA 1WX0A 4O1AA 2C15A 1OG0A 1PHWA 2ZTKA 4I7WA 3S1VA 3C2EA 1JCJA 3NL6A 3GR7A 4UMCA 2CLHA 3TAOA 2ZCGA 5K7JA 3DFQA 3TFXA 3QW3A 1OK4A 3C2RA 4ZQOA 3M5VA 3QFEA 1FWSA 2WNNA 4HNUA 5HR6A 3TMLA 5CKSA 1FCUA 4K7VA 5KINA 3V75A 2C16A 2G96A 3BLIA 2QJHA 3W22A 4QSHA 2F84A 3NQEA 2ZRWA 4O52A 1SO6A 3MI6A 5E1QA 2DZUA 1XKYA 2ABBA 1H63A 3R12A 1GG0A 3TSDA 4UTTA 1KM6A 1R2SA 3G1SA 2NV1A 5A5WA 3CB8A 3QC3A 2ZZ2A 3PS7A 2BTMA 4TO8A 4FEZA 5I3JA 1VRDA 3UY7A 5F4SA 1ME7A 3NGJA 4C1LA 3L9CA 1JRBA 4YMZA 1OFAA 2VFIA 1QAPA 3C2OA 4MOZA 4QM1A 3C6CA 3PULA 4TMBA 3W7PA 3QYQA 3R13A 4UFLA 3TQVA 3P5YA 4DO5A 4BR1A 2QCDB 4UTUA 1M7PA 3LB0A 4X3ZA 4HN4A 1QPQA 1UJPA 5K4ZA 1T99A 4UFKA 4EIVA 3G0XA 3W7CA 4N02A 1G7VA 2E6AA 1VH7A 1OFQA 4JEQA 1VCGA 4UFHA 1IXNA 1WBJA 3UWYA 3TE9A 1YYAA 4O11A 3NDOA 2C19A 1OX4B 3L0GA 3LRLA 3TC6A 2ZTJA 1W37A 2NUYA 3IVUA 4JTGA 5EMUA 4K8HA 4KWWA 4S2CA 2ZRXA 1I8JA 4EF9A 4U28A 1G69A 3INPA 3L5AA 2GUUA 3W71A 1F2JA 4RCXA 2O7QA 3H55A 2VEMA 3DH7A 1BWKA 2NXGA 2QJGA 1YTDA 1XUZA 1KTCA 3WJXA 2CLEA 5KZDA 4A2SA 3HG2A 2OT0A 4KKXA 3GDMA 2VFGA 5MHBA 1QOQA 3PG9A 2B7QA 3IGUA 3TQ0A 2DZWA 3PG8A 2H3BA 3TW6A 1XBYA 1ZJIA 3EWXA 3KVMA 2V30A 4AAJA 3UQNA 2JBMA 1FCVA 1JCLA 1ZFJA 3LCGA 4LRSA 4UTMA 1OVDA 3JRKA 3UD6A 4ZQRA 1GZGA 4OQVA 1T96A 1OYBA 5G2WA 1GWJA 2X1SA 4RZ4A 3UPWA 3FYOA 4FHAA 1LBMA 1F76A 2Y7EA 4MY1A 3FYPA 3WJWA 4IX0A 2OMAA 3GAKA 3P74A 1SZGA 1UCWA 3UXAA 2ZRUA 1O5KA 4O0ZA 4S2BA 1KLYA 3R5EA 4YWIA 5KMYA 4QIUA 3N2MA 3L0NA 5CZ0A 2CU0A 4MKNA 1KW1A 5D2YA 3OBKA 5T26A 3W1LA 3MP4A 2LLEA 3B04A 4NXSA 1GEQA 4JNMA 4HNNA 1K7XA 3EWBX 3P82A 4K39A 1GYNA 4WOQA 2I1OA 2Z2UA 3IGSA 3W76A 3FKRA 3NQ7A 4EOUA 4GUHA 1IGSA 3BLEA 3S9YA 5AHLA 2NWRA 4ML9A 2RDTA 1AW2A 2RDWA 3R2GA 3NA8A 1SZEA 4GNJA 2YGYA 1DOSA 3I68A 4O19A 4DBDA 3LRMA 4M6VA 2TSYA 5CSRA 3O6CA 4XUGA 3N2XA 3NO5A 3U2OA 2WSRA 5SWUA 1L6YA 1W3IA 2CFFA 3W2KA 2A1YA 1EWEA 2QDGA 3GB6A 1B9BA 5U4NA 5FEXA 4FIQA 3BG5A 2ZZ7A 1Z44A 3DAQA 3B05A 3G1XA 3RLUA 4JIPA 4BWLC 3TU9A 5HWMA 3MBFA 3W1UA 3HJZA 3M1ZA 4A22A 3STEA 4UR8A 1H61A 3FJ6A 3PB0A 2QF7A 3EX3A 5F2MA 4OGZA 3PBUA 1NSJA 4Y90A 2DORA 2HMCA 2ZA1A 3AO0A 4A2RA 3SY5A 3QMSA 3ATYA 3DFNA 3TROA 1K8XA 2QUUA 4K36A 4RXGA 3W7DA 4H4IA 3NQVA 4XZ9A 1ME9A 1AMKA 1I4NA 1G67A 3TXZA 5FEZA 3L68A 3WJYA 2V2HA 4LTSA 3IRDA 3MUXA 2ISWA 1FWTA 3SFKA 3GAYA 4TMCA 4XTDA 3QF0A 1FUYA 4UCGA 3HPXA 2ISSA 4JIQA 4UTKA 2YPIA 2C1HA 1VLIA 3TNOA 4UUIA 1R46A 2WNZA 2Y7FA 2JK2A 5CPNA 3NM1A 4AHOA 1FXQA 5D09A 4JR5A 4O8RA 3LCLA 1I45A 3ATZA 4LRTA 5F1VA 2RKXA 3G1HA 3A22A 5EL1A 2FB2A 4JYDA 3LDVA 2B7PA 1TMHA 4RKAA 4WY0B 1WA3A 1WOBA 1XFBA 3DI1A 2WJZA 1YDOA 5CZTA 4HPXA 3E49A 4MUZA 2I14A 3DXIA 4M7SA 5CPLA 2A0NA 2DZPA 3DHFA 1H62A 2PRLA 4DEFA 3G22A 3LTPA 3B0UX 2VC6A 4LOCA 1W31A 3NM3A 4PH6A 4XKYA 2WOQA 3HB9A 3IIXA 1LRNA 3NYZA 3I6RA 4P2VA 1MEHA 3SZ8A 1B4EA 3STFA 2A5HA 3S1UA 1ZY9A 1TRIA 4AHPA 3CM4A 1QO5A 1Q3NA 1CW2A 1RD5A 2A85A 2A7RA 3GR8A 4TX9A 3SSJA 4WJEA 4A29A 4JX6A 3WK2A 5AB3A 1YXYA 4PL1A 3DKLA 4XWUA 4N9CA 1LP6A 5BMWA 4M7TA 1ZNNA 4NNAA 2QJIA 1JVNA 5G4WA 3P61A 4BWLA 4DELA 1DVJA 3THQA 3M7WA 3I65A 4QQ3A 1TJPA 1O4UA 4HPJA 5FEPA 4IMGA 2ZRVA 4D2JA 3FLUA 4RJEA 4EWND 1D9EA 1IXOA 2J88A 3QQ0A 3BGJA 2CLKA 4OWGA 2G95A 2OX1A 1HG3A 1WV2A 3ZWTA 4Y6GA 2QAPA 1OK6A 2V5BA 5HQEA 1DJNA 3W7RA 3E12A 1XXXA 3FIGA 4NU7A 5AYXA 2OJPA 1TQJA 2JGYA 1VS1A 2FIQA 3N9SA 5LZLA 1QDSA 3G24A 3HGSA 3BW4A 1G7UA 3IIPA 4OT7A 4AXKA 1UB3A 1ICQA 2JKEA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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