3NQ7A

Crystal structure of the mutant f71a of orotidine 5'-monophosphate decarboxylase from methanobacterium thermoautotrophicum complexed with inhibitor bmp
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
219
structure length
219
Chain Sequence
VMDVMNRLILAMDLMNRDDALRVTGEVREYIDTVKIGYPLVLSEGMDIIAEFRKRFGCRIIADAKVADIPETNEKICRATFKAGADAIIVHGFPGADSVRACLNVAEEMGREVFLLTEMSHPGAEMFIQGAADEIARMGVDLGVKNYVGPSTRPERLSRLREIIGQDSFLISPGVGAQGGDPGETLRFADAIIVGRSIYLADNPAAAAAGIIESIKDLL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase/lyase inhibitor
molecule keywords Orotidine 5'-phosphate decarboxylase
publication title Crystal structure of the mutant F71A of orotidine 5'-monophosphate decarboxylase from Methanobacterium thermoautotrophicum complexed with inhibitor BMP
rcsb
source organism Methanothermobacter thermautotrophicus
total genus 87
structure length 219
sequence length 219
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.1.23: Orotidine-5'-phosphate decarboxylase.
pdb deposition date 2010-06-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3nq7A00
4DEFA 3GDRA 4I7WA 4O17A 4WZHA 5IBXA 4CLMA 2ISVA 1UUMA 2Y89A 3MBFA 3ATYA 3F4WA 2Z6IA 4R53A 1U83A 3CEUA 1OK6A 4BI6A 3G1HA 3FA5A 3S1VA 1SW0A 3LCIA 3DI1A 1K7XA 3L0KA 1SO5A 1EP1A 3LXBA 3AJXA 1GEQA 2A2IA 1OK4A 1SZFA 2YCEA 3EXRA 3NPXA 1GG0A 2R8WA 4FNQA 4UMCA 5C54A 2QCEA 2BXVA 2YW3A 2W79A 3NA8A 4O16A 1ICPA 5K3VA 3QF0A 3QM3A 1IXOA 1NSJA 3GDKA 3CWNA 3RLVA 3U6WA 3NQDA 3VNDA 4QNWA 1DJNA 2VEPA 4DF2A 4QAIA 4YXGA 3BLIA 4FHAA 4AF0A 3JR2A 1AK5A 2C0AA 4JTGA 2ZTKA 1JCYA 3KRUA 3W1UA 4XZ9A 5HMSA 1TV7A 3T78A 1TPB1 4ONVA 5E0KA 4UTTA 4JTUA 2V5BA 4TX9A 1S3HA 4GWEA 4JTFA 3P84A 2CU0A 3M43A 1W54A 3DI0A 4OBTA 4WX2A 3HMJG 4MY9A 3NM3A 2JKAA 2E5BA 4FX7A 1HL2A 4CQ9A 1OFBA 2E5DA 5KZMA 3GDTA 1XCFA 1GT8A 1T96A 4JIQA 2GUUA 1QO2A 3BV4A 4KWWA 1GWJA 1X1OA 3QW4B 2A4AA 4O57A 4WOZA 2Y7FA 5LHEA 2EPHA 1GZGA 4FF7A 1QAPA 1H7OA 1KV5A 5AC6A 3CB8A 3MYOA 4HT3A 1VYRA 4JTTA 4MJZA 5HJLA 3UD6A 3KVLA 4OU1A 1F5ZA 3R8RA 3W2LA 3O6YX 4Q33A 3C3NA 3F1QA 4NXSA 2Q3OA 1YTKA 3G1VA 2NXIA 2V2HA 3QSRA 3W7PA 1DVJA 5MHBA 4IPJA 3BO9A 3PF3A 2CLIA 2V30A 4QSHA 1A5BA 1IIHA 1OYAA 1IXQA 3SJ3A 4Z08A 1W5NA 2G97A 5KZDA 3STGA 5GVJA 3VCRA 1A50A 2WQPA 4NUWA 1K8ZA 4EF9A 3B06A 3B0VC 2WJZA 4DELA 4UFJA 2V2CA 4RZ4A 1H62A 2WO5A 3SI9A 1XFBA 3BGJA 3R13A 3UZ5A 2ZFAA 3NO5A 2XN0A 3I7RA 2OMAA 4GE8A 2YFNA 1L6WA 1QPNA 2ZRYA 4YL2A 4AWUA 1P0NA 1PE1A 3NR0A 2Q8ZA 5L9FA 2B4GA 2TYSA 4UTJA 3TH6A 3PSVA 2ZCGA 1ZAHA 3FS2A 3IVTA 2JKEA 2ZYFA 1JULA 4JDYA 3HG4A 2BZNA 3MP5A 2FFCA 1FWRA 1KTBA 1H1ZA 4K36A 4KFPA 2C19A 4ORMA 4MZ1A 3S6DA 3LCHA 4MY8A 3NAVA 5G1TA 1HUVA 4UTWA 1KM6A 5ABTA 3TW7A 2EKCA 3LB0A 4M7TA 1FCUA 1R47A 2VEKA 1M7OA 3I68A 2JGQA 3CM4A 3E96A 1CI1A 3HGSA 2CZ5A 4DXVA 3NL3A 4AAJA 2FLIA 1S5VA 3LTSA 1SSDA 2AAMA 2O7SA 2FB2A 5BMWA 1AL7A 2VELA 1LOLA 4GJ1A 4FIQA 1KM3A 4HPJA 3DFTA 1G4PA 4N4PA 3TU9A 1TTPA 3NQGA 1O95A 1ZALA 2A21A 4QJ1A 2ZA2A 1W5OA 2ZZ3A 4K7VA 3NPUA 3TFCA 2JKPA 3HG5A 3E49A 3MYPA 3W1QA 4UTKA 2QCHA 1T99A 3W88A 2PE4A 4JX5A 3DH7A 5F2IA 1J2WA 2Y7GA 3UPWA 5EL1A 1NVMA 1XDLA 2WOQA 2Z2UA 2VOMA 1O94A 3BK0A 3N34A 3U2OA 5T26A 1YXYA 2BX7A 3TCEA 4I7UA 5KTLA 4UFLA 3M7WA 3B8DA 5TIMA 3QQ1A 2IQTA 2QUTA 3SECA 1VHNA 4JYDA 3IGUA 3G22A 4MFEA 3T7VA 4FB7A 4DF0A 4CQAA 3R89A 1SO3A 2G95A 1KFJA 1WYIA 1LM1A 3ATZA 5AB3A 3O6DA 1TPUA 2CLOA 1WBJA 3SSJA 1BWLA 1UCWA 2E6YA 3N2MA 1H50A 4DO4A 4ZMGA 4OQVA 2J9ZA 1D9EA 1OHLA 1WA3A 1W5PA 3SIZA 3UWYA 4IPIA 2WNNA 5LNSA 4O52A 4O8RA 1FDYA 3G3MA 3L5MA 2Z1BA 1BEUA 3PSWA 1RD5A 5D02A 4TIMA 4S2BA 1K3UA 3P7YA 1OFOA 1I8JA 3LCGA 1QPRA 5AOUA 3M0ZA 2G96A 5D38A 1M5WA 4RKAA 3ABQA 2VXNA 4IUOA 2YGYA 2GJLA 1JVNA 4OV9A 1GVQA 1CX9A 1K8YA 1SO6A 2OT0A 3AO0A 4TO8A 1N55A 3YPIA 4O4VA 3LRKA 1DL3A 1KFEA 4UMAA 1FX6A 1JQXA 1FUYA 3UY7A 3W7MA 1GPWA 1I45A 4LU0A 3W74A 2J27A 4PL1A 1H61A 2HS6A 2YZRA 2RDWA 2H6RA 4AHQA 3B03A 1WOBA 4EWND 2YR1A 3DFQA 1AG1O 1YPIA 1GQNA 3S1UA 3GXNA 1F7BA 5AHFA 5CZJA 5F1VA 1G4TA 4S2CA 4OT7A 4M7SA 1EP3A 3TUUA 1MEWA 2TRSA 4K37A 3GNNA 3QFEA 1TV5A 2QDGA 4IXXA 2AQWA 3KX6A 4Y90A 1VR6A 3JS3A 3LRLA 1RZMA 1XC4A 1Q45A 1TQJA 4CCCA 2E5CA 3NM1A 1OX4A 3QPZA 3VFLA 3EWUA 1EUAA 1IIGA 3EX4A 6TIMA 4IX2A 3LHWA 4PC8A 2NWRA 1FCBA 3TAKA 3TMQA 3S5OA 3TK7A 3E0IA 2I1OA 3S9YA 4AVFA 3HOJA 4YCPA 3C2OA 1ML1A 3TC7A 1C9DA 3SR7A 4RLIA 5KITA 3I6RA 4I7VA 5HINA 3TQKA 5DBTA 4JTJA 3BVJA 1C29A 3W2MA 3BLEA 1LLZA 3QRHA 3G18A 2E1DA 1FXQA 1R30A 4MZYA 3GKFA 2B7QA 3W87A 1SQ7A 1I4NA 1WXJA 2C1HA 1OYCA 4O54A 4YCOA 4M5PA 3P5YA 1NF0A 2AGKA 1P5BA 4ZZ9A 3KRZA 4HNVA 1OFDA 3EEGA 3S1XA 1KW1A 1DBTA 3NOEA 3MO7A 2PRLA 4C1KA 1YADA 2QAPA 1TSIA 5LNUA 1OX6A 4MLJA 5D30A 3G1FA 1JCLA 1XXXA 1B4EA 5LHFA 3IGSA 3PULA 4CNOA 2A7PA 4RK8A 4AF0B 2GOUA 4WY0F 1N8FA 4JTEA 1XUUA 4IJBA 2XN2A 2J6XA 5FEXA 1ZENA 5I3GA 3THAA 3EXTA 3NPWA 4JIPA 2A7NA 3C56A 3LOTA 5C6MA 4NNBA 3T40A 3FYPA 3W1TA 1T0OA 2DZPA 4JGDA 2ZTJA 3TQVA 3ABOA 5AHLA 3RLUA 4O53A 3M5XA 4IXHA 1TPWA 1Q6RA 3W6YA 3PG8A 4O19A 3MI2A 1QDSA 2H3BA 1KFLA 4MIMA 4LNYA 3B4UA 1LRQA 3W7NA 4BF9A 1XUZA 4MLRA 3UXDA 3O07A 3THQA 3HGOA 5H2ZA 3Q37A 1IXPA 2X1UA 4MJMA 5BMXA 2FB3A 3DU0A 3ANYA 3LCWA 3G8RA 1SUXA 5G2IA 1WDWA 3M6YA 5FF3A 1JRCA 5KSWA 3W07A 3FYOA 3STCA 5DCDA 1JCNA 3L67A 2EHHA 1Q6LA 1E51A 2NLIA 3W1XA 1D3HA 4NJKA 2ZZ2A 1PCKA 1JQVA 5A8GA 3GB6A 3DXIA 1MEHA 1GTEA 2R94A 1M6JA 1ADOA 1K8XA 5CG7A 2QUUA 2ZRUA 4ORIA 2ATSA 3W7GA 2ZRXA 3L0GA 3KAOA 5U7SA 1NFBA 1ME9A 1TRDA 4UTMA 5HR7A 3L9CA 3PBYA 4K8EA 4JDBA 2O7QA 4NJHA 2RKXA 4R7JA 3W7OA 1EB3A 1FWNA 1RQEA 2YYUA 3R5EA 1O5KA 3PB2A 3IIXA 2W0UA 4FX8A 4JYFA 2FQIA 3H53A 3T4CA 4DPQA 5D04C 4N2YA 1NAL1 1F2JA 4LUJA 1ONRA 5DY2A 3TXVA 1F76A 5FEWA 2B7NA 2HMCA 1JCXA 3NG3A 3P67A 4N02A 3DKLA 3MI6A 2ZZ5A 1OABA 3L5LA 3OBKA 4QIUA 4GNJA 3G1YA 5CZTA 1EWEA 3HB9A 3DHFA 3CT7A 1RQHA 1O60A 4TMBA 3N9RA 3WK1A 1KLYA 1HTIA 4WJEA 1NF7A 1J5TA 4UMBA 3M1ZA 5K7JA 5D03A 4ZQOA 3N14A 5HWNA 4ZQCA 1VYPX 4FNSA 1H7XA 1A5SA 3P8JA 3DHDA 4Y8FA 3LI1A 3W72A 4AWTA 2EGZA 2ATMA 3WJSA 5F2GA 3GAYA 3TJXA 1VH7A 2Y6ZA 4HIBA 3PR2A 3L0NA 1YDNA 2E68A 3PB0A 3TDFA 3O16A 1FCQA 3MHUA 5D2YA 4WXZA 3LCLA 4ML9A 3SGZA 3QMRA 3N2XA 5F1UA 5TBOA 3CTLA 3STFA 3CHVA 3UQNA 5CPLA 2A6NA 1G7VA 3I65A 1QPQA 4YMZA 3DGRA 5DLCA 2CLKA 4LWWA 5HR6A 3MI3A 4NT0A 3TSMA 3FKRA 3N3MA 3DBPA 3P5ZA 1VCFA 5KINA 3W7JA 3QMTA 1HFBA 1PS9A 1H5YA 3NQ6A 5K4XA 3MWAA 1PVNA 3S5ZA 4IWWA 4O11A 3KFTA 5CZSA 3PC0A 2QJGA 5EY5A 1SFJA 3LM7A 2JK2A 4B5NA 3EWBX 4KFNA 5A5WA 2X2GA 1L9WA 1ZAIA 1V5XA 3BARA 4JNMA 3DFPA 4I9AA 1TCDA 3KVKA 4JX4A 3RK8A 1OX5A 1LP6A 2J9YA 3W1LA 3W1PA 1TREA 2FIQA 4NU7A 1FQ0A 5E1QA 3LGEA 2B7PA 3I7SA 5DN1A 3OVRA 5D2WA 4WY0B 3WK0A 1WOAA 4NNCA 1OF8A 3SGUA 1SZNA 2V9DA 1WX0A 4QNEA 1HO1A 2YW4A 1VHCA 3HGRA 3W7DA 1W0MA 3W7LA 3OA3A 4TMCA 3GR8A 1ICSA 4QITA 4MZ8A 2HSAA 2WSQA 1OJXA 3LHTA 4LY8A 4X22A 3W1RA 1GYNA 1YTEA 5FI8A 2H8XA 4U28A 3UPBA 1L6YA 3DFOA 3IV3A 1LOQA 3OEXA 1GYLA 3FIGA 3NL5A 3OVPA 3W75A 1KA9F 2YX0A 2ISWA 4DF1A 3TNOA 2PCQA 1LBFA 3M5VA 4XBSA 2NV1A 3W2KA 4N6EA 3NQ2A 1BKSA 4O4WA 4PTNA 1VYSX 3L66A 3LTPA 1YXCA 2J9XA 1OF6A 1MEIA 1CW2A 1K7EA 5BW6A 3NGJA 1F74A 2NUXA 4NVTA 1XDMA 4HHPA 1YDVA 2D73A 4A2SA 3U8GA 5BOOA 2R91A 3L65A 3INPA 3O05A 2V82A 4R34A 4JTKA 1Z44A 4U4MA 5CPOA 3W7QA 3QJAA 4JY8A 1LOSA 3PUDA 1X6UA 3ZR4A 4IMEA 5FF2A 1OX4B 4JYEA 1I2PA 1UJPA 1YXDA 4XTIA 4RXFA 2PRMA 3WJZA 4E2DA 1TJRA 4UNLA 1TPH1 2DZSA 3G3DA 3A24A 3E12A 3WFAA 3W7HA 4UTTC 1LBMA 3OHIA 4MYAA 3RMJA 4POCA 1UASA 2QR6A 5EBUA 1QWGA 4FXSA 2HS8A 2A1YA 1S5WA 1XBXA 3BW2A 4J9JA 4Y9AA 3KXQA 3P81A 5G2WA 5LZLA 4P61A 3DFSA 3S8HA 3S5NA 3HG3A 3MHGA 4UTHA 4K39A 4ZVJA 1F73A 1KTCA 3T55A 1H7NA 4LV9A 2QCGA 1VPXA 1AL8A 3UWZA 1DQWA 1W56A 2GVJA 1SZGA 3TXZA 4MY1A 4JXCA 2UV8G 1RR2A 3GDMA 3E02A 1TPFA 4ADUA 3NZ1A 1KFKA 1LTDA 3BLFA 2ZRVA 3MUXA 3QYQA 1LBLA 4MOZA 4EOUA 2QDHA 2V2DA 4WY0A 1W5QA 5DELA 3QW3A 3BW3A 8TIMA 4XQ6A 4BR1A 3PS7A 2BTMA 3TV8A 1VGAA 2OJPA 3C2FA 2ZBTA 4P2VA 5FF0A 3D0CA 3PBUA 4O28A 4LRTA 4MUZA 4A21A 3VKJA 2C16A 5AHNA 3W2NA 2YYTA 2QJHA 1KBJA 1O4UA 2VC6A 2TPSA 3O63A 3O6CA 1G4EA 2RH9A 1RVGA 3WJXA 3CIXA 5AC8A 4Z0SA 4FXRA 4L4LA 1ZHAA 4O15A 4GC4A 3TC6A 4H3DA 1LROA 1TJPA 3QPYA 1LDCA 3EKLA 3O06A 3TX9A 3GDLA 4R33A 4M19A 1ZNNA 3BG5A 2CLHA 4CCDA 3GXTA 2C18A 3VE7A 2V5LA 1G4SA 1K7FA 4OV4A 3LERA 3HO8A 5HQEA 5DY3A 3IEBA 2C14A 2GVGA 4W9TA 5LGZA 3EXSA 2YSWA 2QCLA 3QC3A 1B3OA 3RU6A 3QSTA 4NQ1A 3DZ1A 2J88A 3TAOA 3WJWA 1FBAA 4HNNA 5AFDA 3W2JA 1BTMA 4WD0A 2GQ8A 3P8IA 1XBVA 1U5JA 4IQLA 5CKSA 1I2OA 4S1FA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4OUI A;  1UD5 A;  1B5T A;  4O17 A;  4WZH A;  3VD3 A;  4CLM A;  2ISV A;  1WO2 A;  3MBF A;  3ATY A;  1EJV C;  4I5R A;  4BI6 A;  3G1H A;  4DNM A;  5DAN A;  3S1V A;  3IK2 A;  1GW9 A;  4GXP A;  3FDK A;  5A8O A;  6REQ B;  3H23 A;  2A2I A;  1W1B 1;  1SZF A;  2OOD A;  1QAT A;  1RVK A;  2QW5 A;  4HQV A;  1GG0 A;  4IJR A;  2BXV A;  1MFV A;  3BH4 A;  4L64 A;  1UML A;  2GSE A;  1WNO A;  3R0U A;  2YDR A;  1IXO A;  1NSJ A;  3CV6 A;  3RLV A;  2G4F A;  4DJE C;  1RBA A;  1X7I A;  3BLI A;  3JR2 A;  1RA0 A;  1QW8 A;  3B8W A;  3QY6 A;  1L8P A;  1TR1 A;  4B16 A;  2Z29 A;  1M1B A;  1HJU A;  5BRO A;  2I57 A;  3GE7 A;  1BLI A;  1TV7 A;  4ONV A;  1R85 A;  1TV4 A;  4TX9 A;  3WQF A;  4JTF A;  1Q7Z A;  2QT3 A;  3WLM A;  1CB2 A;  3BJS A;  1O1H A;  2IQ0 A;  1DXI A;  3HMJ G;  4DI9 A;  3DOP A;  4CN6 A;  2WM1 A;  4EPK A;  2X1I A;  1HL2 A;  2Y4S A;  2QYG A;  2A3E A;  1XCF A;  4JIQ A;  3BV4 A;  2FTY A;  3CUZ A;  3QY8 A;  5RUB A;  3A4X A;  2QDD A;  1XLE A;  5I24 A;  3QW4 B;  4O57 A;  4WOZ A;  4PR4 A;  1ZSX A;  1QAP A;  4HPG A; 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