3NQAA

Crystal structure of the mutant f100a of orotidine 5'-monophosphate decarboxylase from methanobacterium thermoautotrophicum complexed with inhibitor bmp
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
219
structure length
219
Chain Sequence
VMDVMNRLILAMDLMNRDDALRVTGEVREYIDTVKIGYPLVLSEGMDIIAEFRKRFGCRIIADFKVADIPETNEKICRATFKAGADAIIVHGAPGADSVRACLNVAEEMGREVFLLTEMSHPGAEMFIQGAADEIARMGVDLGVKNYVGPSTRPERLSRLREIIGQDSFLISPGVGAQGGDPGETLRFADAIIVGRSIYLADNPAAAAAGIIESIKDLL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase/lyase inhibitor
molecule keywords Orotidine 5'-phosphate decarboxylase
publication title Crystal structure of the mutant F100A of orotidine 5'-monophosphate decarboxylase from Methanobacterium thermoautotrophicum complexed with inhibitor BMP
rcsb
source organism Methanothermobacter thermautotrophicus
total genus 87
structure length 219
sequence length 219
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.1.23: Orotidine-5'-phosphate decarboxylase.
pdb deposition date 2010-06-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3nqaA00
3LRMA 1BWLA 3NQVA 4O50A 3LRKA 2Z6JA 1Q6LA 2V2DA 3PM6A 1FY6A 2GQAA 2V30A 3I68A 1JRBA 3IIOA 1XCFA 3TNOA 4PCFA 5KSWA 2JGQA 3W1AA 1QMLA 3W1NA 2QCLA 2ABBA 4CCEA 1YDOA 3KVKA 1F5ZA 2RH9A 3L0NA 2P10A 1TRIA 1LTDA 1KM0A 4OV9A 2AGKA 4QNEA 2WSRA 1GTEA 1TPWA 2EKCA 5LNUA 3G1XA 1XBXA 2NXIA 2A6LA 4A2SA 5FF2A 1H51A 3ZS4A 4RK8A 1M6JA 1V5XA 3M47A 3GLCA 1VGAA 5TIMA 4NVTA 1I2QA 1U5JA 1H5YA 3IVUA 4UNLA 1DBTA 3WJSA 1PIIA 1M7OA 1ZY9A 1A53A 2FB3A 5LNRA 2QCEA 1G4EA 4GUHA 3W2MA 3BG5A 1K03A 1WX0A 1YYAA 4FNUA 1OF6A 4JIPA 3UWQA 4HKPA 5G2HA 1W5QA 2WPBA 3KXQA 3QSRA 2NXGA 2Z0IA 4HN4A 1KM2A 1JVNA 4BF9A 1ZALA 4JTEA 4IMFA 1R2TA 5D30A 1T99A 4Z1BA 7TIMA 2QAFA 4POCA 4Z1DA 3UWUA 4JYDA 1MEHA 1GVSA 4N9BA 1VJIA 4UTUA 2AAMA 3T7VA 3QC3A 1F2JA 1G7VA 2A85A 4OV4A 3CB8A 3CC1A 4O16A 1W54A 3TDFA 1H7NA 3NPXA 2RKXA 5D37A 1R47A 1LBLA 1TB3A 2F7FA 4TO8A 2ZA1A 2ATMA 4J9JA 1KW1A 3C2VA 5I3HA 4XTDA 1O5XA 2PE4A 3QMSA 2V0TA 3TC7A 1OFQA 4KWWA 1PHQA 4H6KA 3F1QA 3PF3A 3WJYA 3MUXA 3NM1A 3MI2A 1KM6A 1TV5A 3GNNA 3TX9A 2VFFA 2WSQA 3G1DA 4UTHA 1I4NA 3OEXA 3NQMA 3NAVA 2C19A 5CPMA 3NQ7A 1VCVA 1C9DA 3W6YA 2CLLA 3TFCA 4O11A 3U8GA 1S5WA 1K8ZA 5AYZA 5LNVA 3G0UA 3K30A 3UPBA 1H1ZA 3TMQA 1TPEA 4UFMA 4JTFA 1EWDA 1AW2A 4RKAA 4TX9A 4M7TA 1XBZA 4IJBA 2PRLA 3KRUA 3USBA 4Y96A 1FDZA 1RVGA 1RQHA 1FCBA 1GG0A 2PRHA 1QFEA 2ZRWA 5KITA 3NR0A 3DENA 3S5NA 3B0VC 3TSDA 1SR9A 2EPHA 4UTJA 3O05A 5DBUA 1OG0A 1R30A 2HTMA 4ZQNA 2J9XA 1G7UA 3HG4A 3DU0A 3W7GA 4KWVA 4FNQA 3LBCA 1QPOA 2HSAA 3MW7A 3LCIA 3ZWTA 3TR2A 1LBMA 2G95A 5HULA 5KZEA 5CZ0A 4RX0A 3CEPA 4JD4A 3C56A 5LNSA 4GUGA 3ABQA 5FF3A 1EP3A 1FWSA 4JTIA 2NWSA 1JQXA 1O4UA 1LDCA 1XXXA 3IVSA 5BW6A 3H55A 3PY2A 2YCEA 3P5YA 3LI1A 1BTMA 3NL2A 4JX6A 4XUGA 3SGUA 3W7LA 1TPFA 1VPXA 2ZCGA 4KFOA 2W79A 2B4GA 4DF0A 1KFJA 4FNRA 5DY2A 1OFRA 4W9TA 3RFAA 3GVGA 4AHQA 2E1DA 1K7FA 1Q6OA 5C2XA 1I2NA 4WD0A 1NVMA 4IOTA 4CNOA 1DJNA 4N9CA 5EKYA 4QSHA 3C2EA 1QOPA 3TSMA 3GAYA 4KFNA 1XC4A 1JCNA 1N55A 3LV5A 3G3MA 5DXXA 3R5EA 2ZBTA 4GXMA 4WY0B 1TTQA 2B7OA 1QPRA 3S5OA 3B05A 2CLMA 4O14A 5D02A 2VKZG 1H50A 1LRNA 2CZ5A 4JGDA 2VFHA 5CPNA 1D3HA 3FLUA 3UWVA 1LLWA 4FO4A 1OK6A 4BFAA 2QUVA 3TJLA 2C6QA 3PG8A 3W1RA 3ATYA 2I9EA 3ZR4A 3EX4A 3W7JA 1JUKA 1UCWA 5EL1A 2H3BA 1AW5A 1LLZA 3VE7A 2NUWA 2ZDRA 1CX9A 4MYAA 4RCXA 4TR9A 4DPQA 1M7PA 4IMCA 3IEBA 4O17A 3PSWA 1JJKA 3GB6A 1HUVA 4UMAA 3LLDA 3G8RA 1XBVA 2DU2A 4MVAA 3NQCA 1EUNA 3NQ8A 3LHTA 2GPTA 1T96A 1X1OA 4LV4A 1EUAA 2A5HA 4RJEA 3HMJG 2CZFA 3P60A 3FIGA 2HS8A 3W88A 4M7SA 2EF9A 3TW7A 1NSJA 5DELA 2H6RA 4LWWA 3OIXA 3F03K 2CLOA 4FXRA 3N73A 3PBVA 2V5LA 4OBTA 1QR7A 2B0MA 1WBJA 2ZZ6A 1YDNA 1YLVA 2NXHA 3G3DA 4JYEA 3PS7A 1O95A 4JS3A 1DJQA 2ZRZA 1IXOA 1W5PA 2QCMA 4HSOA 2GJNA 3C3NA 5LHFA 5D05A 2Y7GA 4RR4A 3NQ2A 4ADSA 4IMGA 2RDWA 4ORIA 4IGHA 4JTJA 1ZFJA 1LBFA 4O1DA 3GDTA 4NT0A 3EX1A 4O53A 4LV9A 2E09A 2JBMA 2ZQ0A 4UTMA 1X1ZA 2Y62A 2RDUA 2DZSA 1QDSA 1JQVA 1VS1A 3GAKA 4D2JA 5G2IA 1KBJA 3CHVA 3RLVA 4DF2A 4AEOA 2JK2A 3GDRA 4LTSA 2QDHA 3UPWA 1RPXA 2E5CA 2GVLA 3P61A 4N6FA 4N4PA 1LM1A 2VFIA 1Q45A 3BG3A 1FWWA 4CQ9A 1SW0A 4JTTA 1WOAA 5AYXA 5U7SA 1I8JA 2R91A 2WOQA 1UUOA 3DKLA 1AMKA 3HPXA 4N02A 4N9DA 1QPQA 1DHPA 4JTGA 3UWYA 2ZYFA 1OYCA 3W71A 3GZ3A 4EF8A 4OU1A 1LCOA 3M7WA 4NNCA 3W7RA 2WQPA 4JIQA 4O10A 5K4XA 3QYQA 4IXHA 2H8XA 4Q33A 3EXSA 3L65A 3P5ZA 4LS1A 3IVTA 4LRTA 4O18A 1DKWA 2NUYA 3LI0A 5TBOA 3RMJA 4K8EA 2Y7FA 2G96A 2RHGA 3BGJA 4JN6A 4U28A 3W07A 3UQNA 1A5AA 1ICPA 2A2IA 4IPJA 1RD5A 3EWXA 1HFBA 3MHGA 3P74A 3PULA 4UMCA 4XBSA 2I1OA 4FXSA 3A22A 2IQTA 3GR7A 5H2ZA 2QUTA 2C1HA 1KM1A 4ADTA 1D9EA 2FTPA 5G1YA 2CLEA 1PV8A 1LOSA 4UR7A 2TMDA 4CCDA 3A5FA 3MWAA 3O63A 2FQIA 2GOUA 4AVFA 4P61A 1EP2A 5FF4A 4WXYA 4UTLA 1G6CA 1YXYA 2ZA2A 3PUEA 2E5BA 1UB3A 2YR1A 1KTCA 3DHFA 1VLIA 3W7MA 1WV2A 1F7BA 4UTTC 1LOLA 4EOUA 1EP1A 1X6UA 3DKJA 2KZHA 3FYOA 1Z41A 3PAJA 4K37A 5F2GA 2B7NA 3T40A 3W7PA 4X2RA 1KA9F 4K8HA 1GVFA 4X9SA 3LXBA 3GDMA 3QSTA 4LVDA 1LP6A 2NWRA 2WV8A 2QCDB 3M44A 5IM51 1LORA 4RZ5A 3A5VA 3MP4A 4OHQA 3TXZA 1PL9A 2X1SA 3NM3A 3NQGA 1FBAA 4WQ6A 4BI6A 3V75A 3QQ0A 3BV4A 4IPIA 3S5YA 3FJLA 3IIPA 3CIXA 4O1CA 3GXPA 1ZAHA 3EWYA 3HGRA 4ZVJA 4K38A 4AWUA 3PVFA 1TQJA 2OT1A 3I7RA 4E2BA 2XN0A 2ZZ7A 2BSLA 1NEYA 5AC7A 4DBEA 1O5KA 1KM4A 2A7PA 4PEKA 5DXYA 4QJ1A 2VFEA 3L21A 3FFSA 3SI9A 2TYSA 4OT7A 3W7CA 3MI6A 4N6EA 3LHVA 3QW3A 3PB2A 5T26A 1OHLA 1JCYA 2YW3A 3W83A 4NJJA 1SZGA 4IWWA 4AAJA 3L9CA 5CZJA 1Z44A 5FEPA 5L9FA 5F2IA 4UC5A 3EB2A 3OG3A 3NPWA 3SFKA 3LHZA 2C13A 5DBTA 3EX6A 1F76A 1VHNA 3EKLA 4ONVA 1A50A 1YPFA 1YTDA 3UWZA 4YMZA 3VFLA 3W2LA 2NUXA 2A0NA 3HIJA 3HJZA 5D32A 1ML1A 1FCVA 3L67A 1S3HA 2QF7A 3P82A 3O1NA 1KFKA 2RFGA 2F84A 2QJHA 4MIMA 3IRDA 4N9EA 4KKXA 4LU0A 5LNWA 3LCLA 3MP5A 2QJIA 3QMRA 4GE8A 1MO0A 2PURA 1VRDA 1WDWA 1HG3A 2W0UA 4LC6A 3M9YA 4MYXA 2E6AA 4K6AA 4M6QA 3IIXA 3UZ5A 1ZHAA 2WNZA 3HGSA 1SZNA 3OHIA 5C6MA 4O0KA 1H62A 3STEA 5HWNA 1N7KA 2J9ZA 1UJPA 3VNDA 4FIQA 3THQA 3BARA 2FPTA 4HNUA 5KINA 2QCNA 4MJMA 2DZPA 3N2XA 4RXGA 3Q2DA 3VE9A 3JRKA 4WJEA 3SIZA 3C2OA 1KFCA 4YXGA 3NL3A 1W5OA 2VEKA 1KTNA 5BNKA 4I7VA 3S1VA 4PODA 4GBUA 3O6CA 1WBHA 4C1LA 2R14A 4M6VA 1I45A 3L5AA 3QJAA 1NF0A 4A22A 4GRSA 1CW2A 5FEXA 4EVZA 1HL2A 2E6DA 4FNSA 3NL6A 3KVMA 3PBUA 4A3UA 5C55A 4FF7A 1VYPX 1LROA 3Q58A 2ZRXA 5CPLA 1VC4A 5C5YA 5D33A 1PE1A 3QEZA 3O6YX 1H7WA 1OX5A 3GDKA 4WOQA 3W1QA 3GKFA 5LKYA 5HINA 5HJLA 4UTWC 1OX4A 3LV6A 4O1BA 3HG2A 3B03A 5K9XA 1VR6A 4NNAA 3QZEA 4UMBA 2DORA 1GT8A 3MJYA 1Q3NA 4AHPA 3W86A 1JCJA 4EF9A 1FCQA 4Z1CA 2NZLA 2ALDA 3I6RA 3NVTA 1FCUA 4GUIA 3C2FA 2G5WA 3R13A 3PUOA 5D38A 1GOXA 1P0NA 5F1UA 3W23A 1XBYA 1RR2A 3UXAA 3EWWA 2FFCA 4NQ1A 3L2IA 4PL2A 5FF0A 3DI1A 2C3ZA 2BTMA 5E93A 3ZWSA 1K8XA 1PCWA 3F4NA 2QEZA 4WOZA 1H7PA 2YX0A 1SFJA 4JTLA 3GXNA 2R94A 3EX2A 1AK5A 4MLJA 1W0MA 3PG9A 4AXKA 4S2BA 3AJXA 1SZFA 3PBYA 4NU7A 3C8FA 2VEMA 4PC8A 2FJKA 4OQVA 4MOZA 2J88A 5EA9A 4PTNA 3TJXA 1OFBA 3BO9A 5DCBA 1W5MA 1EPXA 3EWUA 3FOKA 3NQAA 5IBXC 1TPC1 1WA3A 2BXVA 3FKRA 1YADA 1OX4B 4QQ3A 2E6FA 1XKYA 5AYYA 3HGOA 4RZ6A 1SFLA 3W7IA 1JUEA 3W74A 3MYOA 4LS2A 2WJZA 3L0KA 1K3UA 4JEQA 4R53A 2FIQA 3KAOA 2NLIA 4O54A 2B7QA 1LZOA 2A7NA 4DQWA 3G24A 4FX6M 3UWWA 5LZLA 1JR1A 3UD6A 3A9IA 2YFNA 3W2JA 2X1UA 3DGRA 3EXRA 3UXDA 3S0CA 3SJ3A 2YPIA 3E49A 2OT0A 3KHJA 4QITA 1XL9A 3HO8A 2GVJA 3IIVA 4Y90A 4O12A 2HMCA 1YTKA 2VOMA 3G1VA 4CQ8A 3I7QA 2YDAA 3NEVA 5CZTA 3A21A 1MXSA 3UY7A 4RXFA 3PBWA 3BG9A 1KLYA 2OMAA 1K7XA 1IXQA 5I3IA 2A4AA 1KV5A 4CQAA 4UNKA 1LYXA 3KFTA 1BEUA 3KRSA 1P5BA 2ISSA 3MBFA 4ML9A 1MEIA 1OF8A 3LCXA 1T0OA 4O13A 1H7RA 3C52A 4ZMGA 3SZ8A 3OVRA 4XZ9A 1JCLA 1OFPA 3H53A 3C2RA 4H4IA 2DZTA 1U83A 3SR7A 2QUUA 2QJGA 2X16A 4UTTA 1VCGA 1ICQA 1MSSA 1XM3A 3A24A 3INPA 3GR8A 3MMTA 4IX0A 3RNDA 1JCMP 1QCWA 1W1ZA 3T78A 3G1FA 4UFLA 3S1UA 3N34A 5G4WA 2E6YA 1EEPA 3N9SA 4S2CA 3Q94A 4UCGA 3B0UX 5I3FA 3N14A 2FDSA 1DVJA 1YXCA 5E1QA 1SO3A 1G4PA 3M1ZA 4NZJA 3RF9A 2FLIA 3O16A 1ZNNA 2TPSA 5E0KA 4X3ZA 2V82A 3BW3A 4XBKA 3W1MA 2ATSA 2OZ0A 3TKFA 3W1PA 2ZZ2A 5F4XA 1G67A 3GK0A 4LVAA 5D03A 3W2UA 3HG5A 2QCCA 3TH6A 3L68A 4MJZA 5F2LA 3HF3A 3WJWA 5K2ZA 3AO0A 1D3GA 1GZGA 3H54A 1S5VA 3P81A 2CFFA 1SUXA 1G4TA 3WFAA 4FB7A 1KM3A 4ZQRA 2H90A 4Z08A 4Q4KA 4HIBA 1A5SA 1PVNA 5F1VA 3G22A 1E51A 4NX5A 1PHWA 1FWNA 3S5ZA 2ZTKA 5CGQA 3P8IA 4O28A 1VCFA 4NXSA 4XKYA 4XTIA 4AMAA 3G1YA 2EHHA 3W72A 1TTPA 1FDJA 2JGYA 1TQXA 1A5CA 4YCPA 3CM4A 3TE9A 4JX4A 2CZDA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4JIR A;  1BWL A;  3CMF A;  3TNO A;  3RHG A;  2EPN A;  2JGQ A;  4GXP A;  4IF2 A;  1YX1 A;  4CCE A;  1YDO A;  1EF3 A;  1ZZM A;  4W93 A;  4QNE A;  2WSR A;  3BXW A;  2VDH A;  1BXC A;  1ODU A;  1CXI A;  2A6L A;  4PTX A;  3ZS4 A;  2Q8X A;  3GNR A;  4RK8 A;  3M47 A;  5TIM A;  5AC4 A;  4NVT A;  1I2Q A;  3IVU A;  4MGG A;  4M51 A;  1M7O A;  5LIX X;  4PRR A;  1U5V A;  3LPO A;  1KXT A;  2HNE A;  4KCU A;  3KTC A;  1HX0 A;  1UD8 A;  2FB3 A;  4GUH A;  4HA1 A;  3W2M A;  2QNE A;  3GS6 A;  1WX0 A;  1YYA A;  3KHD A;  1W32 A;  3UWQ A;  1SFS A;  3KBS A;  1WDS A;  3MDU A;  3QSR A;  2Z0I A;  4F4R A;  1KM2 A;  5FIP A;  1L2Q A;  1JVN A;  4BF9 A;  1ZAL A;  4US5 D;  4IMF A;  1XHG A;  5D30 A;  3ZST A;  3M0I A;  5LIK X;  4F0R A;  3C86 A;  5B7Y A;  2INZ A;  4JYD A;  3WDJ A;  1Y5X A;  3AHZ A;  5BWA A;  1HKW A;  1A5O C;  5REQ A;  4NG3 A;  4LJ3 A;  3TDF A;  3N25 A;  3NPX A;  2OOF A;  5D37 A;  1KFW A;  2VZT A;  4LAL A;  4P7L A;  4DJF A;  3B9A A;  1XYC A;  4PMN A;  3ARS A;  1KW1 A;  2QPS A;  3S9I A;  1G0C A;  1O5X A;  2D20 A; 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 1PUD A;  2V82 A;  3SY8 A;  3VM7 A;  4WDT A;  1MUW A;  4QE4 A;  3CTT A;  1MRA A;  4IJC A;  3GK0 A;  5D03 A;  2H9A B;  1GVI A;  3BCJ A;  5IHS A;  4H2H A;  1GOW A;  4E4U A;  4DBS A;  2OLH A;  3DYP A;  2SFP A;  3AO0 A;  5AYI A;  2NVC A;  2VGI A;  1TZ9 A;  4XD3 A;  3WFA A;  2FFI A;  2H90 A;  4Z08 A;  2OQY A;  1J0J A;  4HIB A;  3IJI A;  1W1A 1;  4PUW A;  1A5S A;  1HNY A;  1UR2 A;  1E51 A;  4WF7 A;  3AI0 A;  5CGQ A;  2WHK A;  4KCV A;  3G1Y A;  5FJT A;  1A5C A;  1S2U A;  2VCA A;  3U9I A;  3VII A;  3ZVH A;  3TE9 A;  3W7Q A;  2J6V A;  4H8H A;  1GEH A;  4RLI A;  5CXP A;  4Y8F A;  1BWK A;  5DFA A;  4E38 A;  2RGM A;  1F6Y A;  3LTS A;  2HPM A;  3OGR A;  4LB4 A;  4ZQP A;  3BH4 A;  2Y1H A;  5AVH A;  3THA A;  2V5B A;  3NL5 A;  1S5T A;  2ZRY A;  1XUZ A;  3TC6 A;  1UA3 A;  1G94 A;  4AVN A;  3IJ6 A;  4LVB A;  1QAP A;  3VAV A;  4JIC A;  3CQH A;  4MB5 A;  1KB3 A;  1V51 A;  1KFB A;  4GZI A;  1AUS L;  1R2R A;  4MDO A;  3NUR A;  1CTN A;  8TIM A;  1TCD A;  2VCC A;  3V0S A;  2PFH A;  4WUI A;  1HL9 A;  1E1E A;  5HWM A; 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