3NSMA

Crystal structure of insect beta-n-acetyl-d-hexosaminidase ofhex1 from ostrinia furnacalis
Total Genus 185

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
185
sequence length
572
structure length
572
Chain Sequence
EDVVWRWSCDNGKCVKLKNDPRSSEPALSLEACKMFCNEYGLLWPRPTGEADLGNFLSKINLNSIEVKILKKGATDDLMEAAAKRFKEQVSLAIPRGSTPKLTGKAVDVYLVNENPNEKAFSLEMDESYGLRVSPSGADRVNATITANSFFGMRHGLETLSQLFVFDDIRDHLLMVRDVNISDKPVYPYRGILLDTARNYYSIESIKRTIEAMAAVKLNTFHWHITDSQSFPFVTTKRPNLYKFGALSPQKVYTKAAIREVVRFGLERGVRVLPEFDAPAHVGEGWQDTDLTVCFKAEPWKSYCVEPPCGQLNPTKDELYQYLEDIYSDMAEVFDTTDIFHMGGDEVSEACWNSSDSIQNFMMQNRWDLDKESFLKLWNYFQQKAQDKAYKAFGKKLPLILWTSTLTNYKHIDDYLNKDDYIIQVWTTGVDPQIKGLLEKGYRLIMSNYDALYFDCGYGAWVGAGNNWCSPYIGWQKVYDNSPAVIALEHRDQVLGGEAALWSEQSDTSTLDGRLWPRAAALAERLWAEPATSWQDAEYRMLHIRERLVRMGIQAESLQPEWCYQNEGYCYS

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
source organism Ostrinia furnacalis
publication title Structural Determinants of an Insect {beta}-N-Acetyl-D-hexosaminidase Specialized as a Chitinolytic Enzyme
pubmed doi rcsb
molecule keywords N-acetylglucosaminidase
total genus 185
structure length 572
sequence length 572
ec nomenclature ec 3.2.1.52: Beta-N-acetylhexosaminidase.
pdb deposition date 2010-07-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00728 Glyco_hydro_20 Glycosyl hydrolase family 20, catalytic domain
A PF14845 Glycohydro_20b2 beta-acetyl hexosaminidase like
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3nsmA02
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 3nsmA01
3ALGA 1NM9A 2YA0A 2CPUA 1HJUA 3JUGA 3RM4A 1QI0A 2BS9A 1GNXA 1V3HA 1V6XA 4H7VA 1C91A 1JF6A 4UFMA 3ZMRA 3QOMA 2WZEA 2BY2A 2X8RA 1WZMA 3BSGA 1H3GA 1KGUA 2DDXA 2J74A 1V02E 2QMJA 1FH8A 1SFSA 4HMDA 3MUY1 1CLXA 1XYZA 4N0RA 5FL1A 1CXHA 3UG4A 2VZSA 4AEEA 1PZ3A 3O9NA 4OUEA 2V3FA 1CGVA 3L4VA 4TTGA 2A3EA 3THDA 3ZSSA 3LPGA 4PMNA 1SMAA 4MNLA 1EO7A 2YL9A 3KE0A 4W5UA 4PMDA 2W61A 4U3AA 5JBEA 3G6LA 3QGVA 4AW7A 2PB1A 2D24A 5IDIA 2E9LA 1JZ7A 4GZJA 2XVKA 1BYBA 3WL0A 1V03A 2QF8A 1H5VA 1C92A 1QNSA 5A6MA 1UWSA 3MSGA 1HIZA 1W9DM 2BVDA 1Q6FA 2YOCA 1KR0A 4JFUA 4NI3A 1C8YA 1C7TA 3AISA 1UH2A 1E15A 2VCCA 1B30A 4AZCB 3VIGA 3W27A 4W84A 4D6EA 1UR1A 3AXHA 3ARVA 4UQCA 3TTYA 2VX6A 1ISVA 2JEQA 1ZS2A 4PMYA 2BHUA 3PHAA 4ACZB 2XM1A 2PWGA 2W5FA 2D0GA 3SUSA 4UQ9A 2BXZA 1G1YA 1ISYA 1MW0A 2WC3A 3WDHA 2ZXBA 1ZJBA 2XIIA 5LA1A 2ZUTA 3AIQA 2G3NA 1VEOA 3AICA 1UD6A 1BGAA 1W2VA 4GI6A 4PTWA 4PN2A 3OLIA 1BG4A 3WD3A 2AOSA 4LYQA 2J47A 2WM0A 1J0JA 4P7OA 4F79A 1GW1A 1CGXA 4Z2KA 4QCEA 3ZT6A 1K6AA 1W9XA 4X9YA 2ESCA 1GVIA 4LXFA 1JDDA 1NOFA 1FFQA 2J62A 4XZWA 2DSWA 4PSRA 1UH3A 1TUXA 4FLQA 1US3A 1Q4NX 3WMSA 4K68A 3VUPA 1US2A 4MJ4A 3VDHA 1MXDA 5CPTA 1HT6A 2D22A 3AHYA 3KZSA 1V08A 5M3WA 2WHKA 3PTKA 3D3AA 1C93A 1E3XA 4W8BA 4EE9A 4WKFA 3CTTA 3EMZA 5ABGA 1W32A 3PZMA 3AMGA 1KGWA 2JIWA 5I77A 2D3NA 1HVQA 1BF2A 1G94A 1J11A 4NZCA 3K8KA 2CNCA 3CZ8A 3M07A 2WSKA 3PZ9A 1K9EA 1B0IA 5A6JA 2J7HA 3N1AA 4ATDA 1HL8A 3ZIZA 4FF5A 2VC9A 3VPLA 1D3CA 3TTSA 4H8VA 4HZ6A 1VF8A 2YA2A 5LA2A 3APGA 3FN9A 3GXFA 5DFAA 4H41A 2O9PA 3AMLA 1D2KA 2CBVA 1IZJA 1EDTA 3T0BA 2YIHA 5CGMA 5M03A 3MS8A 5C71A 3BMVA 1OIMA 3CPUA 1GOKA 3AZSA 3CHDA 5CLTA 1MW3A 3ZSTA 2X1IA 2YLLA 1UD2A 4GZEA 1C8XA 1EOMA 4E8CA 2DIJA 1OCQA 2VX5A 4M8UA 4W8AA 3WDIA 2CHOA 2X05A 3OBAA 4UNIA 3WQWA 3AHZA 4HTYA 5HPCA 4DM1A 1HL9A 3BMWA 4FLRA 4C91A 3WQ8A 4LPCA 3J7HA 1TVNA 4BA0A 2WBKA 4OBSA 5DF0A 3K4DA 4ATLA 1NWTA 3AHTA 4UQEA 5EMYA 2X0YA 4KH2A 1CTNA 4J28A 2J7BA 2G3IA 5E70A 2OSXA 3SURA 2Y2WA 1UD8A 3AOFA 5BROA 1ECEA 2GJPA 4JFTA 2C0HA 2MANA 2XVGA 3A4WA 1QI3A 4B9YA 2IUZA 1H09A 5HXMA 2GVYA 4XUYA 1Q6EA 4AZGA 4CD5A 4UOZA 5D9MA 1XC6A 4Z2LA 4JCLA 5JBFA 3CO4A 3F5JA 3NDZA 1FA2A 4HOWA 3WQVA 3WBAA 2XVLA 2E0PA 1OINA 1E9LA 2YL5A 2CYGA 3SCUA 3N11A 5GPRA 5A1AA 5A69A 4HU0A 1EQCA 1V3JA 2XYLA 3WSUA 3AIBA 4HMEA 3CMGA 4L4OA 2CERA 2E4TA 4OZOA 3IAPA 3AIWA 3PN8A 1BYAA 1R87A 2CXGA 2ZX7A 4TUFA 2W66A 4D6IA 2EBNA 3DC0A 1GOOA 3VD3A 2VNCA 4CD6A 4PCSA 3VIIA 1QI2A 1UQZA 3ZQ9A 2JIEA 1E5NA 1UHVA 1ITCA 3HMCA 3VVGA 1RH9A 3SUWA 5A6KA 3K8LA 3PZNA 1W9PA 3KL5A 2UY5A 5GQBA 4C7FA 2CHNA 3FNDA 3VDAA 1XD0A 4MB4A 3OLEA 1UZ4A 2J78A 4ZENA 4PUDA 2J7EA 3BC9A 1ZJAA 3OB8A 4CU7A 5D8ZA 2WC7A 2W92A 3ARXA 4QFUA 1E0VA 3EMQA 4R5EA 1C3FA 2DSVA 4WIWA 4JZ5A 4W88A 3VD7A 2Y8VA 2YKKA 1HVXA 1ZBKA 2ZICA 1WDPA 1GHSA 1CZ1A 2CESA 4KGJA 1SR0A 3BSHA 3MMUA 4AZIA 4GQQA 1KXTA 2DH2A 1FFRA 1UYQA 1VFMA 3VTRA 1VIWA 1LQ0A 3ZR6A 1B90A 1GOIA 3AZTA 1YHTA 3L4WA 4PMUA 1E1EA 3N15A 4D71A 1K9TA 2BFGA 4CCDA 4UCFA 1XSJA 4MAVA 5CPQA 1CWYA 3WDRA 3POCA 3GTNA 1JI1A 1WAWA 2OWXA 2ZUUA 5AC5A 1J0YA 3WFLA 3GH5A 2PC8A 2EQDA 2WC4A 5D8WA 2CBIA 1EH9A 1PX3A 2EPLX 3IJ7A 3O2LA 1PZ2A 5C8BB 5M5DA 1VFFA 5CG0A 1BG9A 1OGGA 2NT1A 1CENA 4QCFA 3VIOA 4UFLA 6A3HA 4BQ3A 1V6YA 3THCA 2GDUA 4MDOA 2WBGA 4C90A 1VFOA 1ZU8A 1ZL1A 2Y24A 1IZKA 3IANA 1I75A 1QI4A 3CLWA 1KFWA 1KXQA 3SUVA 3OLDA 5TD4A 1EXPA 4WF7A 2VRKA 4GZIA 3VM7A 1JZ3A 3AYRA 3IK2A 1HP5A 1WO2A 4JCMA 2XVNA 1UWQA 4TXEA 4LGXA 2QHAA 4AZ5A 1X1NA 1KCKA 1EQPA 3FHQA 4CD4A 3T0AA 5EFFA 1KBKA 4TVCA 5I78A 1L0PA 1LJYA 2TAAA 3VM5A 3RM8A 5HOSA 4C7GA 1R7AA 1R7OA 5DT5A 3CGTA 4LYPA 3W38A 1HJSA 3UG5A 1GORA 2VZTA 2XGIA 2ZXDA 2G3MA 5ABHA 4UOQA 2JE8A 4JHZA 2F2HA 1QNRA 5IFPA 4FMVA 4JFSA 1TE1A 3WUFA 2XWDA 4WK9A 4D6FA 4F9DA 1LL6A 4FK9A 3ARUA 4AD5A 1C7SA 1UA3A 1VB9A 2V5CA 2EO7A 1M03A 3VX0A 3GM8A 3DYOA 1JD7A 3CBWA 3WDQA 3BLKA 1JG9A 4HOZA 4Z2HA 3MV11 2E8ZA 5LA0A 4UFHA 1E70M 1V02A 4PTMA 3FY1A 2VZUA 3AYSA 1BPLB 3WH8A 3MO4A 4OBRA 2D20A 1TA3A 1DP0A 2Q8XA 3AI0A 3QHNA 3L4UA 1MW1A 4P8UA 4V28A 5GNZA 3T0DA 1NH6A 2YDRA 4MNKA 3VGFA 3WD2A 1QBAA 2NW0A 2J7CA 3MSDA 1B3XA 2WMGA 9CGTA 4FLOA 2WMFA 3GNRA 1XH1A 2XWEA 2XPKA 5CSYA 3GNOA 3T2OA 7CGTA 1GOWA 3EDJA 2G3JA 3B8SA 2A3HA 2CITA 1UWRA 3FAWA 4U3CA 3WQ5A 3M6DA 4JAWA 1QW8A 3WNNA 1E6PA 3CMJA 1K9FA 3WFZA 1BYCA 3LPPA 4F9JA 4W7WA 2VR5A 1UWIA 4W93A 3SCNA 5AYIA 1G0CA 2OWWA 1G01A 2DIEA 4XX6A 4OOUA 2G4FA 2EPNA 5I79A 3CUGA 1UWUA 1UZ1A 3FXYA 4GO9A 1B3ZA 3EDEA 5A94A 1WDQA 2XUCA 1CXLA 4MTVA 2VI0A 1JAKA 3DYPA 2WKLA 2O9TA 2OWCA 1LL4A 3MMWA 3VGDA 2ZE0A 3PBGA 3WY1A 2QMKA 1JF5A 4PCTA 5A2BA 4HU8A 3WNPA 1OBAA 4TX8A 1WZAA 1W1PA 3K8MA 4ATWA 3RM9A 4LX4A 1QW9A 5E0FA 5D4YA 1FHLA 1UD4A 4QDMA 2ZWYA 1XRVA 1OT2A 1S46A 3KL3A 1W2PA 3TTOA 1LG1A 1GQIA 1R86A 4D1IA 1H41A 1FH9A 3UR8A 3A6OA 1XCWA 4U31A 1BFNA 1MQQA 5I5RA 3W25A 1XSIA 3MKKA 3QOKA 5JIPA 5I24A 1OD8A 4DUWA 1ISWA 2HISA 2DSZA 1E71M 4S3KA 2QLYA 3WF0A 2J7FA 3DHPA 1JZ8A 1UR2A 1MFVA 1GPFA 2WZHA 2ZXAA 1B9ZA 1EHAA 3W53A 1CYGA 2VUYA 1H11A 1BVNP 2X0HA 5AYBA 3WUGA 4Z2IA 4EK7A 1U2YA 5HNNA 1J18A 3WEOA 3WF4A 4GIAA 1Q6CA 1B3WA 3ZJ8A 1HJXA 4JIEA 3VU2A 2J7GA 1X6NA 2DT3A 1U30A 4PMZA 3MUIA 3PTQA 1QHZA 3SCQA 5CLWA 5CSUA 5ABFA 1GZJA 2F61A 2VR4A 3RPMA 4UTFA 3AS2A 4M29A 1JYWA 1UKOA 4AD4A 1JL8A 1IV8A 2PF0A 2YL8A 3VDCA 1KCLA 1KXHA 1WKYA 3OA5A 1JXKA 3CZGA 4AYSA 4WSKA 5BYWA 1R85A 2D0HA 1TFVA 1LL7A 3SEPA 1F4AA 3VIPA 1M01A 1SMDA 4WKHA 1MQPA 3VNYA 3VNZA 3BXWA 4ZE4A 1VAHA 1XCXA 1W3KA 4B3LA 1DWAM 2UY4A 1EOKA 3ARZA 4AD1A 5FIPA 4MB5A 2WHMA 1WCGA 4D6CA 1ITXA 1CGUA 2YDSA 1QOXA 4PSPA 3NUKA 4C7DA 3QHMA 2FGLA 3F4VA 2W4XA 2ZWZA 5ABEA 1VJSA 1E43A 3U5YA 3W28A 3CUIA 1M53A 2DT0A 2JEPA 1X6LA 1PX8A 3FW6A 4B9ZA 4D72A 2PBOA 5EB8A 4UFIA 3ZT5A 3CZKA 4BQ5A 3WQ4A 4ZE5A 1BHGA 1ZBVA 8CGTA 1VENA 2BY0A 1NP0A 3WH5A 4PUEA 1TA3B 1JNDA 3AS1A 3W6MA 2J7DA 1Y7VA 3SCRA 1KXVA 2E9BA 3EYPA 3E1F1 4CN6A 1KGXA 4J3TA 3NJ3A 4GKLA 1DWJM 3GYCA 2ZUNA 1W9VA 2PWDA 2BHZA 4J3VA 2D1ZA 2Z1SA 1BGGA 1K9DA 3OZOA 4W8LA 4MJ2A 1JDCA 4PRWA 1FHDA 4M1RA 4D6GA 1EHNA 4B3KA 4BS0A 1V3IA 3BAKA 2PWHA 5A3HA 1H0GA 1UG6A 3UG3A 3W29A 1AQ0A 3L4TA 3VGEA 2OSYA 4Q7NA 2DT2A 1U33A 1QNOA 2VX4A 3AHVA 1EO5A 4URIA 2JF7A 4AWEA 4HA1A 3CIVA 1E73M 1HF6A 3IJ9A 3UERA 1BLIA 1ZB5A 1GQKA 5BRQA 1W9UA 2WCSA 4JKMA 4XZBA 1JNEA 4IISA 2VCBA 3TONA 3N9KA 4F66A 2V5DA 1J01A 3U5UA 1JFXA 2ZUWA 1FP8A 2ZOXA 1W3JA 1NWSA 1WP6A 5JIWA 3VMPA 1V3MA 1OIFA 5CZKA 3D5HA 3AHXA 3WH7A 3A4XA 4ACYA 1VJZA 4D6DA 5M17A 1WNOA 3VD5A 3TA9A 3IJ8A 5FKYA 4E4PA 3WF3A 4AIEA 3OGSA 2OLHA 3II1A 1NARA 4WJXA 3WH6A 3ZO9A 2WMJA 2WVUA 2FH6A 2E3ZA 4GPNA 3AQUA 3OGRA 3RCNA 1OGSA 1WZKA 2QPUA 1W3LA 1MVYA 5E09A 4AIOA 1VFUA 4AEFA 3N13A 3VIFA 1HXJA 4J7RA 4PEEA 4MNMA 3GXMA 3L4YA 2G41A 2VQTA 1WPCA 1KQYA 2WMIA 3U57A 1TVPA 3WF2A 3GH4A 1CXKA 2WNWA 3B9DA 3WD0A 2VURA 2PBGA 4AD2A 1JAEA 1PEZA 3ZJ7A 2AAAA 3ARWA 2EPMX 1UWTA 2YLAA 3WD1A 4NRSA 2WANA 3WD4A 2WSPA 1O6IA 5A6LA 1UR0A 4OKDA 5ABFB 5C70A 1RP9A 3I3DA 4OJYA 3ARYA 2VJXA 2FGZA 3T09A 4AZBA 1JZ6A 3BCFA 4Z2JA 1DTUA 3L4XA 5FOOA 4D6JA 2YBUA 4V2XA 5HBFA 4U33A 4YHGA 5AC4A 2Y4SA 3PZOA 3AJ7A 2A3AA 1AMYA 2XHYA 5FCZA 4IPLA 3VILA 2JALA 2UWFA 4QAWA 4UQDA 3WMCA 3UETA 1W9BM 2GK1A 4BCEA 4BF7A 3F5KA 2ZIDA 3RMEA 4PMQA 1HP4A 4U2YA 2WCGA 5HDRA 1F4HA 3LMYA 1CGYA 2DT1A 3U7BA 4NSBA 1UD3A 2XTKA 3K46A 1HKIA 3VIJA 2BHYA 5FL0A 2D2OA 1B31A 1Z32X 2DGAA 4CCEA 3AS0A 4GINA 3WBEA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3ALG A;  1NM9 A;  2YA0 A;  2CPU A;  1HJU A;  3JUG A;  3RM4 A;  1QI0 A;  2BS9 A;  1GNX A;  1V3H A;  1V6X A;  4H7V A;  1C91 A;  1JF6 A;  4UFM A;  3ZMR A;  3QOM A;  2WZE A;  2BY2 A;  2X8R A;  1WZM A;  3BSG A;  1H3G A;  1KGU A;  2DDX A;  2J74 A;  1V02 E;  2QMJ A;  1FH8 A;  1SFS A;  4HMD A;  3MUY 1;  1CLX A;  1XYZ A;  4N0R A;  5FL1 A;  1CXH A;  3UG4 A;  2VZS A;  4AEE A;  1PZ3 A;  3O9N A;  4OUE A;  2V3F A;  1CGV A;  3L4V A;  4TTG A;  2A3E A;  3THD A;  3ZSS A;  3LPG A;  4PMN A;  1SMA A;  4MNL A;  1EO7 A;  2YL9 A;  3KE0 A;  4W5U A;  4PMD A;  2W61 A;  4U3A A;  5JBE A;  3G6L A;  3QGV A;  4AW7 A;  2PB1 A;  2D24 A;  5IDI A;  2E9L A;  1JZ7 A;  4GZJ A;  2XVK A;  1BYB A;  3WL0 A;  1V03 A;  2QF8 A;  1H5V A;  1C92 A;  1QNS A;  5A6M A;  1UWS A;  3MSG A;  1HIZ A;  1W9D M;  2BVD A;  1Q6F A;  2YOC A;  1KR0 A;  4JFU A;  4NI3 A;  1C8Y A;  1C7T A;  3AIS A;  1UH2 A;  1E15 A;  2VCC A;  1B30 A;  4AZC B;  3VIG A;  3W27 A;  4W84 A;  4D6E A;  1UR1 A;  3AXH A;  3ARV A;  4UQC A;  3TTY A;  2VX6 A;  1ISV A;  2JEQ A;  1ZS2 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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