3O1NA

1.03 angstrom crystal structure of q236a mutant type i dehydroquinate dehydratase (arod) from salmonella typhimurium
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
252
structure length
252
Chain Sequence
MKTVTVRDLVVGEGAPKIIVSLMGKTITDVKSEALAYREADFDILEWRVDHFANVTTAESVLEAAGAIREIITDKPLLFTFRSAKEGGEQALTTGQYIDLNRAAVDSGLVDMIDLELFTGDDEVKATVGYAHQHNVAVIMSNHDFHKTPAAEEIVQRLRKMQELGADIPKIAVMPQTKADVLTLLTATVEMQERYADRPIITMSMSKTGVISRLAGEVFGSAATFGAVKKASAPGAISVADLRTVLTILHQA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords 3-dehydroquinate dehydratase
publication title A conserved surface loop in type I dehydroquinate dehydratases positions an active site arginine and functions in substrate binding.
pubmed doi rcsb
source organism Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhimurium
total genus 99
structure length 252
sequence length 252
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.2.1.10: 3-dehydroquinate dehydratase.
pdb deposition date 2010-07-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01487 DHquinase_I Type I 3-dehydroquinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3o1nA00
3U8GA 1SW3A 4OQVA 4LS1A 1EUAA 3TE9A 3PC0A 4HT3A 5BOOA 1OX5A 3NQ8A 1NEYA 5FEPA 1I2NA 1UJPA 3USBA 1HG3A 2ZZ6A 3M16A 4ADUA 3M0ZA 3M1ZA 3NNTA 2ZZ7A 3W2LA 1Q6OA 4EIVA 4XBSA 4UTHA 3W1PA 1BEUA 1TRIA 2NWRA 1A5SA 4O13A 3LHTA 1WXJA 2CLEA 3HPXA 5F4SA 1U83A 3N34A 4K37A 1H5YA 3W3OA 1ALDA 2JGYA 2H6RA 4E2DA 2ZRYA 1P4CA 1S5WA 1XL9A 2TRSA 1W3IA 3GLCA 1OYCA 5CZTA 2E68A 3FEMA 2J27A 3I6RA 2NLIA 2NUWA 4LUJA 3W76A 3W7KA 1I2PA 2NX3A 2ZFAA 3C3NA 4JX4A 1S3HA 1L6YA 1EEPA 3BVJA 1D3GA 2XN1A 4A2SA 2X1RA 2NZLA 1H50A 1TV5A 3UZJA 3CEPA 1J5TA 4N9BA 4A3UA 5FEWA 3W75A 3UWVA 4UXDA 4Q32A 3HB9A 4JNMA 5BRBA 3HQ1A 1J4EA 2ALDA 3S5ZA 5D37A 2A85A 3MHUA 4LS0A 3GDKA 5DBTA 2C1HA 3OHIA 3IV3A 4H3DA 1NF7A 4TR9A 2ZRZA 1E51A 1OX4B 1VHCA 3JS3A 2O7SA 4HHPA 1TYGA 4MY8A 1MEIA 3L0NA 2I9EA 1QCWA 4Y6GA 4FXRA 7TIMA 3LCGA 1XBXA 2CLOA 5LNUA 1GPWA 3UWYA 5GVJA 3IGXA 4O57A 3F1QA 2A6LA 4YCOA 3QZEA 1FWNA 1K02A 2ZZ5A 3M43A 4LC8A 5TIMA 3G3DA 4K36A 3GX9A 3DFTA 1TIMA 1XC4A 3VE9A 1UBSA 1VLWA 2PE4A 5CSRA 1TPEA 5G2HA 1FDJA 1ICSA 1LROA 5EMUA 3KRSA 1QWGA 4N4PA 4WUIA 1OFPA 2CZFA 4K39A 3C56A 5HUPA 1JQXA 5LSMA 3FYOA 3GR8A 1WV2A 2F84A 3NDOA 3NA8A 3NGJA 3W88A 4FX8A 4LV4A 3CU2A 1I2RA 2BXVA 5AFDA 3M44A 3I7QA 4XTIA 5K7JA 3FKRA 4MZ1A 4NNCA 4BWLA 4Y9AA 4UTJA 4LUIA 2V0TA 1L6WA 2FIQA 1RPXA 1VCVA 4DBEA 2YSWA 3RFAA 4DO4A 4FNTA 1DOSA 1KM2A 4Q33A 4AVFA 4N02A 1SZFA 1DORA 2OT1A 3GKFA 1W5PA 3ATYA 5FF3A 4RZ4A 1ZALA 5G1YA 1TTPA 2VEMA 3QMRA 1S5TA 1OFOA 1TPWA 3G18A 3MI6A 1F7BA 2YR1A 3PBUA 1Z44A 2VFDA 4LVFA 2E77A 5LGZA 5L9FA 4M6PA 3DI1A 4U28A 3STGA 4UMAA 3W22A 3C8FA 2ZBTA 3O6DA 1B9BA 2JBMA 1IF2A 3G24A 1RV8A 4Y90A 3Q37A 1ZAIA 3WJXA 2QEZA 1I2OA 3S5OA 4H4IA 2C16A 1JJKA 1SO5A 1OK6A 1SO4A 3LRKA 1W8SA 3NQ6A 3NL6A 5AYXA 2CFFA 5J5RA 5HWMA 5A5WA 3BW2A 4AB4A 1FWWA 1IGSA 2YYTA 3GKAA 2WSYA 3QMTA 3QF0A 4TMBA 1OF6A 2ZTJA 4JYFA 1JUKA 3GNDA 2VFHA 3UY7A 4DQWA 1ZAHA 3W70A 4NXSA 2CZ5A 1X7FA 1KM4A 1VGAA 3E96A 3HGOA 1UASA 1Q6LA 3EXSA 1PVNA 2H90A 2V2CA 4MJZA 3IEBA 3PAJA 2YPIA 3N73A 5LKYA 3B0UX 2BZNA 4UNKA 3BG5A 2JKAA 2A6NA 3PM6A 4O54A 3O07A 4TU1A 4MYAA 2CZDA 4AH7A 3S8HA 1YTKA 1NVMA 3CWNA 5K2ZA 4CCDA 4R53A 2QF7A 1XKYA 2ZRWA 2GOUA 3GR7A 3LERA 4TIMA 3LLFA 1TRDA 3MUXA 3MW7A 4RZ6A 1UUMA 1W5OA 4MYXA 4XKYB 4UTMA 1I45A 4HNNA 1WX0A 2ISWA 3M5YA 3R5EA 1SZNA 4IGHA 4WZHA 5K9XA 4CQ9A 2TYSA 3G8RA 1GVSA 1P1XA 4IPIA 1XM3A 4I7UA 5HNRA 5CPLA 4MOZA 2J9ZA 3EWZA 2W79A 2VENA 4UTKA 4JIQA 3S5YA 1XXXA 1F2JA 1PCKA 3NL5A 4O0ZA 3EEGA 4ADTA 3LCXA 4K38A 5KSWA 3EB2A 4HIBA 4RX0A 1PHWA 4ALDA 3SFKA 5EYWA 3VI2A 4G1KA 2JKPA 4NNBA 3ZWSA 2VOMA 4O1CA 2Z0IA 4ML9A 5HJLA 4N9DA 1GYLA 3NQGA 2QR6A 3NO5A 4LT9A 2ZQ0A 4ORIA 5CPNA 1QR7A 2X30A 4IMFA 1Y0EA 2A7PA 2ZDRA 3TQKA 5FESA 2DZWA 4XQ6A 3OIXA 4MY9A 3DH7A 3BLEA 1F6PA 2Y62A 1UB3A 3W2UA 3EX6A 5K4XA 1PV8A 2RDUA 2E1DA 2ZA1A 5C2XA 3WJWA 3NM3A 3C2OA 2C0AA 2X1TA 4K7YA 3C2FA 2Y88A 4OHQA 1FDZA 2E5DA 4JIPA 4IXHA 2EAWA 3STFA 3CPRA 2QUVA 1LBFA 3W7OA 3L66A 1QAPA 2YGYA 3LXCA 1Z48A 4LY8A 1WYIA 1G4SA 3BG9A 4O4WA 1X6UA 2FDSA 5HR7A 3BLFA 1CX9A 3ABOA 3E02A 4MY1A 3G1XA 4IX2A 2CLFA 5L6UA 3W7NA 1M7OA 1WDWA 3NQDA 4DBDA 1IIHA 5D2XA 4JTLA 1SFLA 3RU6A 1FWTA 3THQA 3DFQA 1W5NA 1W3NA 4JDBA 5ABTA 4IMEA 5BMWA 1HUVA 1KM5A 2E09A 3B05A 3DBPA 4UUIA 5MHBA 1H62A 4YLWA 1LRQA 3JR2A 5HQEA 1TJPA 3B8DA 1EB3A 2AQWA 4YMZA 3MI2A 2ISVA 1G69A 1TO3A 3N3MA 2C19A 2WSQA 4LV9A 3HGJA 1QPNA 3BK0A 1BWKA 3W7RA 2GVLA 3IIZA 1YADA 1FCVA 1TCDA 3W74A 3LCHA 1YDVA 3FKKA 5AB3A 2V9DA 4O10A 4UMCA 2R14A 2GUUA 4M6QA 2A5HA 5LNRA 3W84A 1B3OA 4S1FA 5FI8A 3S9YA 4U4MA 1R2SA 1IIGA 3FJ6A 3WJZA 3R13A 5LNWA 4AHQA 4UTUA 1FQ0A 1KFCA 4O11A 2NX9A 1LLZA 3OVPA 4I7VA 2ATMA 4Z1CA 3OEXA 4TX9A 3QJAA 1NSJA 5AHEA 4JS3A 1Z42A 4WY0A 4FNQA 3W1AA 1TSIA 4ZQRA 4HSOA 5IBXC 3LI0A 3G0XA 2NX1A 3W7GA 2ZZ4A 3IIOA 3SI9A 4YCPA 4E2BA 1YXDA 2DU2A 4JD4A 3W9ZA 2CLIA 2FFCA 2J24A 4PA8A 2X2GA 3P80A 1TPUA 1GG1A 2VC6A 3HG4A 2QCMA 1TV8A 4IMCA 3W23A 2QDHA 5AN7A 3LHZA 2X16A 5FEZA 4NU7A 3EX3A 4Z08A 3T4CA 3BGJA 5D09A 4E0CA 1Q3NA 3ABSA 3EKZA 3NG3A 4MIMA 2ZA2A 1HFBA 2C15A 4C1KA 3MYPA 1H7RA 4AEOA 3LLDA 2B7OA 3FFSA 4LRSA 1IXPA 3LOTA 1KM0A 1I8JA 2Y70A 4O16A 1G6CA 1SU5A 3HPZA 2A0NA 3K30A 4JTJA 3LXAA 3BO9A 3S1WA 2XN2A 2YFNA 1VJIA 2B7PA 5HWNA 4EWND 3NEVA 3M6YA 4M5PA 1GQNA 2V30A 3BG3A 1R47A 4YL2A 5DY2A 1FWSA 2E6YA 3VCRA 1HL2A 1YDOA 2NXHA 2WPBA 3ZS4A 3EWBX 5G5IA 1QDSA 4K7VA 3TU9A 1C29A 1JR1A 1SW0A 2RDWA 4XZ9A 1RZMA 4O52A 3NAVA 1W1ZA 2OCZA 3FS2A 4JGDA 3N19B 3UQNA 3QSRA 3GIYA 1OFBA 2GQ9A 3PSVA 1YDNA 1G4PA 3FOKA 2V82A 3I7SA 4FX7A 4FNSA 3TKFA 1IXQA 1H7WA 2FPYA 2JK2A 1M5WA 3V75A 1AW2A 2FLIA 1GEQA 3DKJA 1HO1A 4HNTA 3QC3A 4H6KA 4FO4A 5CPMA 3MMTA 3KAOA 1AL7A 1VLIA 4R7JA 3TQVA 2HS6A 1GVRA 2WO5A 4LVBA 1YLVA 3W1QA 3CM4A 3U6WA 4LVAA 3B04A 5DCEA 1K8XA 1UUOA 2Z2UA 5LHFA 1XUZA 2DZXA 3KRZA 3GXNA 1ZY9A 4O19A 1F5ZA 3ANYA 2FB3A 3L5MA 1RQEA 1QFEA 3THAA 4UIOA 1KM6A 2WKJA 4WY0F 3R12A 1ZNNA 3UWQA 4XUGA 1D9EA 2RDTA 5TBOA 1ZENA 1SUXA 2ABAA 1TPDA 3TAOA 5AHMA 3WK0A 3P60A 4JTFA 4D2JA 3CHVA 3HG2A 2QCFA 5KITA 3EKLA 4AWUA 5FF0A 4DELA 4ZVJA 3DHFA 4JN6A 3DFSA 5D2VA 2A2IA 3BPWA 4N9CA 2YW3A 1O60A 1EWDA 3A22A 1H51A 1GVFA 1KTBA 4AF0A 4GWEA 3W2JA 1XFBA 3RLVA 3BW4A 1YPIA 1H61A 2FTPA 1WOAA 2ZZ1A 1GZGA 2TSYA 3LGEA 3V1PA 1BWLA 3TCEA 5CG7A 1M6JA 1FDYA 2YFOA 3OG3A 5DBUA 4MUZA 3RF9A 1W31A 3TMLA 1EA0A 2GVJA 1BKSA 3C2RA 3HOJA 3Q94A 1WOBA 3W86A 3CT7A 5DLCA 1JRBA 4QM1A 1GG0A 2AGKA 4JTEA 3STCA 3C2EA 1Z41A 2QUUA 3GZ3A 1YYAA 1PS9A 3KVMA 3L5LA 4Z1AA 6ALDA 3EXRA 1RR2A 2WSRA 4JEQA 3TXZA 3G1AA 1VRDA 4N4QA 3INPA 5C6MA 3PUOA 4PC8A 3B0VC 3P8JA 4JYEA 2Y61A 5T26A 1IXOA 3LCFA 4PL1A 3TUUA 1TJRA 4BF9A 1EP3A 1KFEA 4JTSA 1MXSA 4FB7A 4WOZA 1WBHA 5G2IA 4WQ6A 3TW7A 4DF0A 1VYRA 3ABQA 2WNQA 1JUEA 3W7QA 3D0CA 1SW7A 2VXNA 3DENA 3TV8A 1TQJA 4AAJA 3UWUA 3NQ2A 2FB2A 4RK8A 3TC7A 4YXGA 4NJKA 3FIGA 2YCEA 4JYDA 1YXYA 5HR6A 2DORA 3G1SA 3TR2A 1KFJA 4ZQPA 4ADSA 4FXSA 4O1DA 1KM1A 4OU1A 2ZZ3A 3UWZA 1GTEA 5CZJA 4IXXA 1YPFA 4UTLA 1DKWA 1ME9A 3M41A 5E0KA 3IIVA 5D33A 3I7RA 3MYOA 5F2GA 2G97A 2Y7DA 3P67A 3LRMA 3QPYA 3LV5A 1JCYA 4WXYA 1X8FA 5BMXA 3F4WA 4QISA 2DZTA 2B7QA 2V2DA 3LHWA 2KZHA 1KTCA 3QFEA 4BR1A 4HKPA 2I14A 1QPRA 2ISSA 4M6VA 4S2BA 2YDAA 3EX1A 3HG5A 4FHAA 5D05A 1O95A 3C4UA 3CB8A 1W5QA 2V2HA 1VH7A 1SO6A 4FIRA 3FJLA 3B0PA 1HTIA 2NUXA 3CWOX 3G3MA 2HSAA 3QQ0A 1Q6QA 1OFEA 3W73A 1KLYA 4DXVA 3MP5A 5HINA 3UD6A 1EPXA 2A1YA 3S5NA 1F73A 2Z6IA 2FJKA 3SGZA 3UWWA 1LORA 1GOXA 4EF8A 4P2VA 1QNVA 1DJQA 4Y96A 3W2KA 1FY6A 2B0MA 4OV9A 1B4KA 3RMJA 4O15A 2R8WA 4GFSA 3Q2DA 1P0NA 3A24A 3NM1A 4O4VA 1SZEA 4RXFA 1KTNA 2CLKA 3WK3A 2QCEA 1C9DA 1WA3A 4UTTC 3MP4A 4PCFA 2QCNA 2P10A 3TAKA 2YX0A 4P61A 4IWWA 3M47A 3HF3A 2Y7GA 4EOUA 4Z0JA 1NFBA 1JVNA 3OVQA 4RKAA 1O94A 1Q45A 3SECA 3M9YA 2LLEA 4GUFA 3GK0A 3RK8A 2QJGA 4QNWA 3SSJA 3T55A 3L9CA 3NQEA 5AC6A 3CEUA 4MVAA 4AF0B 1JUBA 3M5VA 4LOCA 4NX5A 3LTSA 3O6YX 4LRTA 5EL1A 1LZOA 5KZEA 1YTDA 4HSNA 3DZ1A 3P5YA 3TH6A 1LM1A 5I3GA 4WX2A 1VPXA 1TREA 4BK9A 4A21A 4ZMGA 1H1ZA 2V8ZA 2WJZA 2BX7A 2ZRUA 2HTMA 1F76A 2EHHA 2TMDA 4N9EA 3UNDA 3TSDA 3N14A 5KZMA 1DJNA 4JTGA 4N2YA 1DBTA 4HPXA 4BI6A 4K8EA 4NZFA 2Y7EA 3A5VA 2QCCA 1EX5A 3O16A 3UPWA 4RXGA 2Y63A 5SWUA 4CLMA 4X22A 1JCJA 5EY5A 3W07A 2PRMA 4UFHA 3GAKA 5K9CA 1YTEA 3GXPA 5DXYA 1OVDA 2Q3OA 2VEKA 3KVJA 5AC8A 2CLLA 2CLHA 1JCLA 1KW1A 1ZFJA 4WOQA 5IBXA 3EWUA 2JGQA 5D02A 3LTYA 4CCCA 3NQFA 3TJLA 1DVJA 1B4EA 3UPBA 2Z1BA 1L2UA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3U8G A;  1SW3 A;  4OQV A;  1QNR A;  5D8W A;  4B4H A;  1TA3 A;  3PC0 A;  4HT3 A;  1OX5 A;  3WLM A;  1NEY A;  1I2N A;  1UJP A;  1TWS A;  2CNC A;  2ZOX A;  3C8N A;  2ZZ6 A;  4S39 A;  4ADU A;  2ZZ7 A;  4FLR A;  3VKK A;  1CXI A;  1PIG A;  2L5H A;  3DBN A;  3ITL A;  3AIW A;  1Y65 A;  4HHL A;  3LHT A;  3N11 A;  3IV8 A;  5F4S A;  3W0K A;  3N3T A;  1FH8 A;  3W3O A;  1ALD A;  3SUR A;  4E2D A;  3S2J A;  4C7D A;  3GLC A;  4DI9 A;  2E68 A;  1PSC A;  1WXY A;  3I6R A;  4LBS A;  1OCJ A;  1ZSX A;  2H9A B;  8XIM A;  2TOD A;  2B31 A;  2D3L A;  2NX3 A;  3K13 A;  1R9X A;  4PBG A;  1D3G A;  4ATD A;  1JAE A;  4OZO A;  4A2S A;  2B81 A;  1RJQ A;  3UZJ A;  4QGC A;  3VNI A;  4L5Z A;  3ISI X;  3I3E A;  2EXO A;  1Q7Z A;  4B3L A;  5BOF A;  3HB9 A;  4JNM A;  4GLE A;  3AYV A;  3HQ1 A;  3NOY A;  4NZC A;  5B7Z A;  1J4E A;  1L2Q A;  3S5Z A;  2A85 A;  1WUE A;  3MHU A;  1KO0 A;  2C1H A;  2BDQ A;  1NF7 A;  4MB1 A;  1TYG A;  3ZT7 A;  2I9E A;  1X6N A;  1NWT A;  1KRA C;  2QJJ A;  4QAW A;  1XQK A;  2ONE A;  2PDQ A;  2XSA A;  1GPW A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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