3O2LA

Crystal structure of an inactive kemp elimination design hg-1
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
306
structure length
306
Chain Sequence
AEAAQSVDQLIKARGKVYFGVMTDQNRLTTGKNAAIIQADFGQVTPMNSMKWDATEPSQGNFNFAGADYLVNWAQQNGKLIRGHTLVGHFYLPSWVSSITDKNTLTNVMKNHITTLMTRYKGKIRAWDVVNEAFNEDGSLRQTVFLNVIGEDYIPIAFQTARAADPNAKLYINDYNLDSASYPKTQAIVNRVKQWRAAGVPIDGIGSQTHLSAGQGAGVLQALPLLASAGTPEVAITELNVAGASPTDYVNVVNACLNVQSCVGITVAGVADPDSWRASTTPLLFDGNFNPKPAYNAIVQDLQQGS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Iterative approach to computational enzyme design.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Thermoascus aurantiacus
molecule keywords Endo-1,4-beta-xylanase
total genus 118
structure length 306
sequence length 306
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2010-07-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3o2lA00
3SUUA 2E9LA 1V3JA 1MW2A 1J9YA 5I5RA 1RP8A 4NRSA 3I3DA 1JZ6A 1QOXA 1MWOA 5A6SA 3WEZA 4ATLA 4OIFA 1E4MM 3NCOA 9CGTA 3L4UA 1V3MA 2DSWA 2XGBA 4CU8A 2CESA 2DH2A 1TVNA 1WPCA 6A3HA 1K9FA 3DYMA 3OZOA 1HT6A 1JG9A 3AROA 4TTGA 2VCAA 4GINA 1CWYA 2WMGA 4AW7A 1QI4A 4MB1A 3SCUA 5GNZA 3EMQA 4QCEA 1UWTA 3MUY1 1DP0A 2BY2A 5I23A 2XGIA 5HXMA 2BY0A 1K9EA 1QI0A 3BLKA 5A2CA 4FMVA 1MW3A 2DQXA 1AQ0A 1IZJA 2VR4A 2C7FA 1BQCA 3CO4A 3AS3A 3WMBA 1G1YA 4CU7A 2J79A 1B3XA 1LQ0A 1S46A 2X0HA 5D4YA 3PTMA 4JKKA 5KZ6A 5CGTA 3EDDA 3UR7A 3LPOA 2CKSA 1E3ZA 4J28A 2VTFA 1CGVA 2DT3A 5DT7A 3OLGA 2VX4A 3HMCA 2ZOXA 4AWEA 1C91A 5HBFA 1H49A 4AY1A 2WBGA 2NT1A 4QFUA 4AD0A 4UFLA 2VRJA 3WNNA 3EDJA 3AZTA 5LYRA 2C0HA 1BPLB 2J75A 2X0YA 5D9NA 3CZGA 2YL5A 3ZT7A 1QVBA 3U7VA 3GNPA 3GXIA 1JDAA 1PX4A 1UR8A 2QLYA 1GJUA 3EBVA 4ZEPA 1UD4A 3S6TA 2E9MA 3SUTA 2CETA 3VM5A 3AFBA 5IFTA 1RPKA 2QMKA 1FP9A 4TUFA 1GORA 1OCQA 1CXKA 4LYRA 3CUHA 1EOMA 4UQCA 3WNMA 1B1YA 2G41A 2WKGA 4P8XA 1KQZA 1DWJM 4W89A 3IJ7A 4GI6A 1Q4NX 1XHGA 5AC4A 5E6ZA 4EANA 3GTNA 1W3JA 4TXEA 1F4HA 5HOSA 1XSIA 4B9YA 2BVYA 2O92A 1E5NA 3N18A 2ESCA 1CGUA 5M3WA 2BY3A 4YHEA 1GOKA 5AYIA 5BXRA 1F4AA 1J0IA 4HMEA 3THDA 2RGLA 3SUWA 1JFXA 3IANA 2JFEX 3WDRA 1CLXA 2D1ZA 1EHAA 3ZJ7A 4MTVA 1SR0A 4FLRA 2E9BA 2QMJA 5M03A 1OB0A 4BQ2A 1V03A 3ARWA 3QHMA 4Z2JA 4D6EA 1JZ2A 1XH1A 1KCLA 4WLCA 1W3LA 3MMDA 2WMIB 3EYPA 1B9ZA 3AYSA 4PTWA 3ZM8A 1CECA 2EEXA 2JIWA 3RM4A 1UA7A 2PC8A 1EO5A 1JAEA 1HIZA 4DWSA 3U7BA 3FXYA 1E15A 3ARUA 2PF0A 1KXHA 1UD2A 5FIPA 3F5JA 3ZSTA 5E6YA 2VZTA 1C8XA 1FH8A 1U2YA 1EA9C 3SCOA 1XSKA 3A6OA 1JD7A 4PTVA 1UHVA 3AOFA 3WF2A 3G6LA 3TTOA 4HU0A 1QNQA 2IXVA 2WNWA 1NOWA 4PMDA 3OGVA 5FCZA 3GM8A 4U31A 3MANA 3ALFA 4U3CA 4HZ7A 4AXNA 4E8DA 3ARYA 1ZL1A 3VMPA 3BAWA 2WKLA 4YHGA 2ZUVA 3T2QA 3WELA 1LL7A 3VDAA 4PMQA 1CENA 1HP4A 2XHYA 1V6XA 4Z2KA 3PZTA 2XVGA 3WL0A 2W4XA 1I75A 1BYBA 3CIVA 4CVUA 2D0GA 4PCTA 1QHOA 2BVDA 2D0FA 2FGLA 3WBEA 2WHJA 4U5KA 1QHPA 3ARQA 4M24A 1OBAA 3BSGA 1DHKA 1BG4A 1HJXA 3AI0A 3WFZA 4WJXA 4BF7A 5E0FA 2FDMA 1LLOA 4ZXLA 2CXGA 4GIAA 1OINA 4MJ2A 1Q6GA 1CGTA 4P7LA 3BAIA 3T2OA 4NZCA 4X0VA 4Z2IA 1C7TA 5DMYA 4W85A 1UQZA 4YPJA 5AC5A 4JFSA 1G5AA 3FY1A 4GPNA 1UR9A 5BWFA 1QBAA 1OD8A 1QI2A 1Q6FA 2CBUA 3L4VA 2QV4A 2WVVB 3WQ8A 1DWFM 1BFNA 2ZUSA 1OGBA 3N17A 2XYLA 4LQ1A 3UETA 4JL2A 4XB3A 2WZHA 1CXEA 3AISA 2A3CA 3RO8A 3E1F1 1L0PA 4W8AA 1CLVA 1X6LA 1E0XA 4P8UA 3BGAA 1CXIA 2AAAA 2E4TA 4DUWA 3VUPA 2BFGA 2WC3A 2CYGA 1V6UA 1EHNA 5M5DA 4JCLA 5HPCA 2G4FA 4ACZB 3WF0A 1W32A 4MAZA 3L4TA 1SFSA 1E4NA 2QPSA 2GSJA 4GI9A 3N13A 3VX1A 5ABGA 4UFMA 3B8SA 3VINA 1WKYA 4J7RA 4W7VA 4NF7A 1WDPA 3F5KA 2J7FA 4CCCA 1ODUA 1K9DA 4H04A 1H3GA 4M82A 4MNJA 3W82A 4Q7NA 3GXMA 1UKTA 2XSBA 4HA3A 3MUIA 3W27A 1CXFA 1I1XA 3GXDA 3MKKA 3VGGA 3AIWA 4M29A 4JFTA 4JKLA 4C7FA 1VBUA 4KWUA 3SCVA 1VAHA 5HDRA 4B9ZA 3VIGA 4Q22A 4AZBA 1DWIM 2XG9A 1CPUA 1R85A 4UZSA 3BCFA 3D5HA 3WQ6A 2W61A 3NDYA 4J27A 3CPUA 1Q6CA 1KBBA 3RM8A 1FHDA 4A3HA 1BG9A 1PPIA 1VEMA 5IFPA 1WDSA 1WDQA 1E0WA 3K1DA 2BHYA 3ZMRA 3II1A 1W9UA 1EDGA 1W9DM 2IXUA 4AD3A 1H0GA 4Z2HA 1MXDA 4LYPA 4PUEA 5CZKA 3AICA 5A8OA 2GUYA 3T0BA 1KFWA 1US2A 1UYQA 1TZ7A 1DWGM 1U30A 3W24A 1GOWA 2YA2A 4P8VA 1Z32X 3FAXA 3AZSA 4KRTA 2VX5A 4H2CA 1QPKA 4CVWA 2ZUWA 2DGAA 2OWCA 3TTYA 1H5VA 1TFVA 4WIWA 3VVGA 1MQRA 2DSUA 2C8NA 2PWDA 1MYRA 3ZIZA 5A6AA 1GONA 3VD7A 3VGFA 2GFTA 4W7WA 1YHTA 4ATDA 1UR2A 5LA0A 2YL6A 1VJSA 1E55A 4R5EA 3ZR5A 1HL8A 1E3XA 5KEZA 2XVLA 2ZX5A 1JI2A 3HU7A 4HOWA 1HXJA 2DDXA 3U5UA 3AIQA 3M07A 2DIEA 3RJYA 1C93A 4HMDA 2ZUMA 2Y2WA 3FHAA 1FHLA 3W25A 4D6HA 4DM2A 4PMNA 5JIPA 3AHZA 1J11A 4ATWA 2XM2A 2J8GA 3B9AA 3ZJKA 2YL8A 3L4YA 5CJ5A 2G3JA 1HKKA 2WZEA 3T08A 5BXSA 3EDFA 3WD1A 2IUZA 1KGXA 2ZX7A 2BVTA 4TVUA 1B90A 3HJEA 2VUYA 1RD6A 3CUIA 1KWGA 4PMYA 1W1PA 4UQEA 3GNOA 2WVUA 1WCGA 2EBNA 4XZBA 2W66A 1H1NA 3WSUA 2DH3A 2EJ1A 1M7XA 2DPEA 2ZWZA 2TAAA 3F4VA 1LG1A 4AD2A 2WHLA 5A8PA 1ISYA 2CBVA 2CBIA 3N9KA 3GH7A 4FLQA 1LJYA 2CKRA 5GPRA 3W81A 4JAWA 1KQYA 5A6LA 1DEDA 1E6ZA 3ALGA 2WB5A 4DWSB 5JBFA 1XCWA 4P7RA 4MAVA 2E40A 4HPGA 1FH9A 4WSJA 2DT1A 1FP8A 4CN6A 3T0DA 2FGZA 1OT2A 3ZR6A 1HJQA 3J7HA 3WF4A 4AISA 4AIOA 1GOQA 4ACYA 1JNEA 3KWXA 2NSXA 4J3WA 3A4WA 1GUVA 5LA2A 5JBDA 3L4XA 4GQQA 3AZRA 3RJXA 2YIHA 2X2YA 4GQRA 3PZQA 4PN2A 3DC0A 4PSRA 1UA3A 2PWGA 2DT0A 2BS9A 1PX8A 4U5IA 3CH9A 1W2VA 2EPNA 1CXLA 1B3WA 2V38A 3L2LA 3VGEA 3A4AA 2PWFA 1PAMA 5ABEA 4EAMA 2PBGA 1NM9A 3VM7A 4OBSA 3ARXA 3ZJ6A 4DM1A 4RL3A 3DYPA 1W1VA 3AMDA 1JNDA 3VIHA 4D1JA 1E0VA 4M81A 3RILA 5I79A 1JZ8A 1W1TA 5A69A 4QP0A 1I1WA 2V5CA 2WCGA 4JFUA 2YLAA 2YJQA 3VIFA 1ISXA 1FH7A 4HMCA 4QLLA 3VIKA 1WAWA 2WLZA 2WCSA 3MO4A 1NARA 1W9VA 1V3HA 2XTKA 2DSVA 3PHAA 3CTTA 3SURA 1AVAA 3ZQ9A 2AOSA 1OD0A 4AD4A 1V6VA 4NRRA 4JZ5A 1OGSA 3WMCA 3FNDA 2VI0A 1KR1A 1R86A 1GVYA 2FH6A 2OYLA 1E72M 2JF7A 2WWCA 5FD0A 5BXPA 1HNYA 1B30A 4GXPA 1YQ2A 2ZXBA 1BLIA 3AQUA 1MVYA 7A3HA 4D72A 3WDIA 3A47A 2PWEA 1XYFA 3CMGA 1BYDA 1OGGA 3LMYA 2YA0A 4MNLA 1TUXA 4IISA 1BYAA 3WD4A 3VU2A 4W8BA 1TCMA 4AYSA 5E9AA 4QAWA 2DT2A 3PZGA 1EO7A 2YDSA 3AIVA 1UWRA 5CQ1A 3RM9A 1PX3A 3ARSA 3WL1A 4AIUA 4AC1X 1ITCA 4NI3A 1E6NA 1MW1A 4TX8A 3UERA 4PYSA 4JHOA 2YL9A 4MJ4A 3QHNA 2GK1A 1DWAM 2CBJA 3L2MA 3CHFA 4BQ4A 1GQKA 2V5DA 1V0NA 4PMZA 4UNIA 4IPNB 1E6SM 3ARZA 3CZEA 4FLOA 2CEQA 1K9TA 1QI3A 1R8LA 3WENA 1QW9A 1HKJA 3EDKA 1E9LA 2WK2A 5DEZA 4S3KA 3AMLA 1E6XM 3SCPA 4DUVA 2D3NA 4PRWA 4J3VA 1E6RA 3VMNA 2BNJA 1H2JA 3VKKA 2YOCA 3WD2A 5C71A 1PZ3A 2Y24A 2HVMA 5D9PA 1JDDA 1JI1A 4BS0A 2E0PA 2W5FA 2Y4SA 2UY5A 5HNNA 1UH3A 1XSJA 5BXTA 4BQ5A 5LA1A 4PMOA 2ZE0A 1ISVA 3VIJA 1JYXA 4HZ8A 3N04A 3WH5A 3FHQA 2XFFA 1JZ5A 5IHSA 1TA3A 4P7OA 5GQBA 4ZENA 1QW8A 3WQ5A 1UWUA 1WZLA 1C7SA 1V0KA 4GI8A 3BAYA 4MADA 5A6JA 4CD4A 4GKLA 4LX4A 1JF5A 5DFAA 4OUEA 4P8WA 5A6BD 3ECQA 3TONA 3GH4A 1UKPA 2XWEA 5E70A 1LWJA 1V0LA 2VRKA 1CGYA 3PZNA 1B3VA 1HX0A 1D3CA 1R7AA 3AIBA 4D71A 3VMOA 3N15A 1VBRA 3SCSA 3MSDA 4CN1A 3WNOA 2ZIDA 2OWXA 1TE1A 1TG7A 3VX0A 1WO2A 4PTMA 5DF0A 4F9JA 4RE2A 1HVXA 4LPCA 1TVPA 3KL3A 3SCWA 4BA0A 2JEPA 1O7AA 3QGVA 5EMYA 3UG4A 4W88A 2WZIA 4M8UA 1QNOA 1ESWA 4AEFA 2WC7A 2MANA 2A3HA 4WKAA 4K68A 5A95A 3VGBA 3CUFA 1OT1A 1BSIA 5CGMA 4IM4A 4W86A 4FF5A 1SYTA 4B15A 3KEHA 1Q6EA 2XIBA 2WSPA 3DHPA 3OG2A 1VEOA 2Z1KA 3IJ9A 3WQVA 2V3EA 5D8ZA 1GOMA 3AS0A 2VMFA 5D9OA 3RDKA 3WH7A 1M53A 1J0JA 3PZMA 3WDJA 1J0ZA 1BYCA 2VVNA 3LPPA 4P7NA 2DIJA 2F2HA 2WCAA 5CSUA 2VC9A 5AY7A 5TD4A 1B2YA 3IK2A 5BROA 3PTQA 3WMSA 5I0DA 2UY2A 4QLKA 2DEPA 3KZSA 3FAWA 1QNSA 4Y7EA 4V27A 3SEPA 4HP5A 2PBOA 1K6AA 3BXWA 4FLSA 5E09A 1E40A 2WWDA 4IPLA 1JDCA 5I24A 4V2XA 3VTRA 1VRXA 2VZOA 2E8YA 1CDGA 2YLLA 3OLDA 4Z2GA 1WNOA 2XFRA 4EE9A 3K4AA 1W9PA 1UZ4A 4XZWA 1H4PA 4MNKA 5ABFA 3AMGA 3WQ4A 3QOMA 3MUZ1 3TOPA 3B9DA 1EDQA 2E3ZA 1V6WA 3BAJA 3WD3A 3DHUA 1UR0A 4AZHA 3VO0A 1GQIA 1J0YA 2W67A 3I3BA 4D6CA 4W93A 3AIUA 4HOXA 1J0KA 1XD0A 1G01A 1JFHA 3ARVA 4AZ5A 2JE8A 2YBTA 1UWQA 3PZIA 4D6FA 3MV01 1J10A 3VDCA 2RGMA 3GNRA 2WMKA 1W9XA 2EPKX 4TTUA 4W7UA 2JIEA 2OSYA 2VL4A 5DO8A 2ZXAA 2XJ7A 1CXHA 4E4PA 3VD3A 2J62A 1ZBWA 1GJWA 1LG2A 3SCTA 1LWHA 4JIEA 4KH2A 3ZT6A 2YBUA 5CSYA 4HTYA 1HKIA 4AZ7A 1JXKA 1JXJA 3WQWA 3WFLA 1E4LA 2J47A 3NSNA 3SIMA 2F61A 1LF1A 1G94A 3AJ7A 3ZO9A 2WBKA 3VD5A 4J3UA 5BYWA 1UKQA 3VILA 1UR1A 8CGTA 1E6QM 4ZE4A 2A3BA 4MB3A 4CD8A 1E43A 1FFRA 3WNPA 4KGLA 1XC6A 3AIEA 4PMXA 2XVPA 3WEMA 3W6LA 1EQPA 1W3KA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3SUU A;  2E9L A;  1V3J A;  1MW2 A;  1J9Y A;  5I5R A;  1RP8 A;  4NRS A;  3I3D A;  1JZ6 A;  1QOX A;  1MWO A;  5A6S A;  3WEZ A;  4ATL A;  4OIF A;  1E4M M;  3NCO A;  9CGT A;  3L4U A;  1V3M A;  2DSW A;  2XGB A;  4CU8 A;  2CES A;  2DH2 A;  1TVN A;  1WPC A;  6A3H A;  1K9F A;  3DYM A;  3OZO A;  1HT6 A;  1JG9 A;  3ARO A;  4TTG A;  2VCA A;  4GIN A;  1CWY A;  2WMG A;  4AW7 A;  1QI4 A;  4MB1 A;  3SCU A;  5GNZ A;  3EMQ A;  4QCE A;  1UWT A;  3MUY 1;  1DP0 A;  2BY2 A;  5I23 A;  2XGI A;  5HXM A;  2BY0 A;  1K9E A;  1QI0 A;  3BLK A;  5A2C A;  4FMV A;  1MW3 A;  2DQX A;  1AQ0 A;  1IZJ A;  2VR4 A;  2C7F A;  1BQC A;  3CO4 A;  3AS3 A;  3WMB A;  1G1Y A;  4CU7 A;  2J79 A;  1B3X A;  1LQ0 A;  1S46 A;  2X0H A;  5D4Y A;  3PTM A;  4JKK A;  5KZ6 A;  5CGT A;  3EDD A;  3UR7 A;  3LPO A;  2CKS A;  1E3Z A;  4J28 A;  2VTF A;  1CGV A;  2DT3 A;  5DT7 A;  3OLG A;  2VX4 A;  3HMC A;  2ZOX A;  4AWE A;  1C91 A;  5HBF A;  1H49 A;  4AY1 A;  2WBG A;  2NT1 A;  4QFU A;  4AD0 A;  4UFL A;  2VRJ A;  3WNN A;  3EDJ A;  3AZT A;  5LYR A;  2C0H A;  1BPL B;  2J75 A;  2X0Y A;  5D9N A;  3CZG A;  2YL5 A;  3ZT7 A;  1QVB A;  3U7V A;  3GNP A;  3GXI A;  1JDA A;  1PX4 A;  1UR8 A;  2QLY A;  1GJU A;  3EBV A;  4ZEP A;  1UD4 A;  3S6T A;  2E9M A;  3SUT A;  2CET A;  3VM5 A;  3AFB A;  5IFT A;  1RPK A;  2QMK A;  1FP9 A;  4TUF A;  1GOR A;  1OCQ A;  1CXK A;  4LYR A;  3CUH A;  1EOM A;  4UQC A;  3WNM A;  1B1Y A;  2G41 A;  2WKG A;  4P8X A;  1KQZ A;  1DWJ M;  4W89 A;  3IJ7 A;  4GI6 A;  1Q4N X;  1XHG A;  5AC4 A;  5E6Z A;  4EAN A;  3GTN A;  1W3J A;  4TXE A;  1F4H A;  5HOS A;  1XSI A;  4B9Y A;  2BVY A;  2O92 A;  1E5N A;  3N18 A;  2ESC A;  1CGU A;  5M3W A;  2BY3 A;  4YHE A;  1GOK A;  5AYI A;  5BXR A;  1F4A A;  1J0I A;  4HME A;  3THD A;  2RGL A;  3SUW A;  1JFX A;  3IAN A;  2JFE X;  3WDR A;  1CLX A;  2D1Z A;  1EHA A;  3ZJ7 A;  4MTV A;  1SR0 A;  4FLR A;  2E9B A;  2QMJ A;  5M03 A;  1OB0 A;  4BQ2 A;  1V03 A;  3ARW A;  3QHM A;  4Z2J A;  4D6E A;  1JZ2 A;  1XH1 A;  1KCL A;  4WLC A;  1W3L A;  3MMD A;  2WMI B;  3EYP A;  1B9Z A;  3AYS A;  4PTW A;  3ZM8 A;  1CEC A;  2EEX A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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